综合分析和鉴定m6A RNA甲基化调节因子对前列腺癌进展及预后的影响

目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,应用生物信息学方法分析N6-甲基腺苷(m⁶A) RNA甲基化调节因子(以下简称m⁶A调节因子)在前列腺癌进展过程中的分子特征及临床意义。方法 基于13种m⁶A调节因子对前列腺癌数据进行分析,以识别不同亚群,并进行差异表达分析。基于差异基因构建LASSO Cox回归模型,并绘制Kaplan-Meier生存曲线和受试者操作特征曲线,计算曲线下面积,以判断模型预测性能。对关键因子进行免疫浸润分析。结果 基于13种m⁶A调节因子识别出与前列腺癌发生密切相关的亚群。获得由6种m⁶A调节因子(OAS3、MYOF、SMIM22、SNORD60、ROMO1、MRPL41)构建的风险模型。ROMO1在前列腺癌中表达水平较高,并与CD8⁺T细胞的免疫浸润相关性强。结论 m⁶A调节因子的表达与前列腺癌的临床病理特征高度相关。ROMO1在前列腺癌中高表达,有望作为独立预测前列腺癌预后的生物标志物,为基于m RNA的...     

环状RNA m6A甲基化修饰的生物功能研究进展

N⁶-甲基腺苷(N ⁶-methyladenosine, m⁶A)是存在于真核生物中最普遍的RNA修饰,可以调节RNA转录、出核和翻译等生理过程。环状RNA(circRNA)是一类单链共价闭合的非编码RNA分子,相对于线性RNA而言,其更稳定,并保持高度同源性。研究表明,m⁶A在circRNA的生物功能发挥中起不可或缺的作用。本文针对m⁶A修饰的相关蛋白及其对circRNA翻译及出核定位等功能的影响,以及m⁶A修饰的circRNA参与先天性免疫调节过程的机制进展作一综述。     

m6A甲基化修饰调控肿瘤免疫的研究进展

N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m⁶A)是一种调控真核细胞基因表达最常见的修饰方式,影响RNA的剪接、降解、稳定性以及蛋白翻译等过程。研究表明m⁶A甲基化修饰与肿瘤发生发展密切相关,在肿瘤免疫应答的相关过程中也发挥着重要的调控作用。m⁶A修饰参与调节免疫细胞的分化、成熟过程以及相关的抗肿瘤免疫反应。在肿瘤微环境中,m⁶A修饰也可影响免疫细胞的募集、活化和极化等,从而促进或抑制肿瘤细胞的增殖与转移,起到重塑肿瘤免疫微环境的重要作用。近年来肿瘤的免疫治疗逐渐应用于临床,如免疫检查点抑制剂治疗、过继性细胞免疫治疗等,都取得了较好的临床效果。通过靶向m⁶A修饰来干预机体免疫系统,如通过小分子抑制剂靶向失调的m⁶A调控因子、诱导免疫细胞重编程等,可提高抗肿瘤免疫反应,加强免疫细胞对肿瘤细胞的识别和杀伤能力。m⁶A修饰是肿瘤免疫治疗的一个新方向,具有潜在的临床应用价值。该文围绕m⁶A甲基化修饰对免疫细胞...     

m6A甲基化修饰在肿瘤免疫中的作用及干预策略

N⁶-甲基腺苷(N⁶-methyladenosine, m⁶A)修饰是真核生物信使RNA中最丰富的表观遗传修饰,其失调会导致mRNA异常生物学行为如翻译和降解紊乱,从而调控肿瘤发生发展。近期研究表明m⁶A在免疫调控过程中可发挥重要作用,其不仅可调节免疫细胞的活化,还在肿瘤微环境中免疫应答发挥重要调控作用,从而影响免疫治疗效果。越来越多的证据表明m⁶A修饰可能是肿瘤免疫治疗的重要潜在干预靶点。本文阐述了免疫细胞中m⁶A修饰调控及其在肿瘤免疫微环境中相关调节作用,并进一步探讨了靶向m⁶A调控蛋白在肿瘤免疫治疗中的干预策略及潜在治疗价值。     

RNA m6A甲基化修饰在脂肪细胞胰岛素抵抗中的作用机制

目的 探讨RNA m⁶A甲基化修饰在脂肪细胞胰岛素抵抗中的作用及机制。方法 收集2型糖尿病患者术中赘余皮下脂肪组织,以非2型糖尿病患者同样组织为对照,检测组间RNA m⁶A水平。高脂饮食诱导C57BL/6J小鼠构建胰岛素抵抗（insulin resistance,IR）模型（HFD组,n=5,60%高脂饲料喂养16周）,对照组10%低脂饲料喂养16周（CD组,n=5）。模型构建成功后,取附睾周围脂肪组织行表观转录组学m⁶A甲基化修饰芯片检测,并借助MeRIP-qPCR实验、RT-qPCR以及RNA结合蛋白免疫沉淀测定（RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RIP）实验验证胰岛素信号转导相关基因变化;进一步观察METTL3小分子抑制剂STM2457对高脂饮食诱导下小鼠胰岛素信号转导基因的影响。结果 2型糖尿病患者和小鼠IR模型脂肪组织中总体m⁶A修饰水平均升高（患者200 ng RNA t=-8.375,P<0.001;患者100 ng RNA t=-3.722,P=0.006;患者50 ng RNA t=-4.937;P=0.001;小鼠100 ng RNA t=-3.590,P=0.023;小鼠50 ng RNA t=-2.760,P=0.025）。表观转录组学检测证实IR的脂肪组织中1 175个基因发生高m⁶A修饰,55个基因发生低m⁶A修饰,同时有182个基因呈现高m⁶A修饰且低表达,包括AKT2、INSR、PIK3R1、ACACA、SREBF1等5个胰岛素信号转导关键基因,其中AKT2、INSR、ACACA、SREBF1等4个基因被确证并证实其与METTL3存在直接结合,其m⁶A修饰水平受METTL3正向调控。STM2457作用下,胰岛素敏感性提高,且AKT2、INSR、ACACA、SREBF1转录水平上调,提示IR表型改善明显。结论 高脂饮食通过METTL3诱导脂肪细胞胰岛素信号转导基因AKT2、INSR、ACACA、SREBF1发生m⁶A高甲基化修饰,诱导其低表达,阻滞胰岛素信号转导,进而参与诱发IR。     

m^(6)A RNA甲基化调控因子对甲状腺癌进展及预后的影响

目的探讨m^(6)A RNA甲基化调控因子在甲状腺癌中的作用。方法在TCGA数据库中获取甲状腺癌样本510例和正常对照样本58例的RNA-seq转录组数据及相应甲状腺癌患者的临床病理资料。比较13种m^(6)A RNA甲基化调控因子在甲状腺癌和正常甲状腺组织中的表达水平。基于一致性聚类分析将甲状腺癌组织分为2个聚类,并比较其总体生存率和临床病理特征的差异。进一步利用单因素COX回归分析筛选出与甲状腺癌患者预后相关因子,并将其纳入LASSO回归分析,构建患者的风险特征模型,进而评估风险特征模型的预测价值。结果除YTHDF2外,余12个m^(6)A RNA甲基化调控因子在甲状腺癌组织中的表达与正常甲状腺组织比较差异均有统计学意义。在一致性聚类分析中,聚类2的总体生存率明显低于聚类1。基于3个高风险调控因子(RBM15、KIAA1429和FTO)构建风险特征模型并用于风险评分计算。高危组和低危组的总体生存率,RBM15、KIAA1429、FTO表达和T状态比较差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线显示,风险评分可以预测甲状腺癌患者的5年生存率(AUC=0.717),多因素Cox回归分析表明,风险评分是甲状腺癌的独立预后指标(P=0.001)。结论m^(6)A RNA甲基化调控因子影响甲状腺癌的进展,其中RBM15、KIAA1429和FTO可作为临床预后标志物,在治疗决策中具有潜在价值。     

基于TCGA数据库分析m6A调节因子甲基化修饰对肺腺癌预后的影响

目的 通过生物信息学分析探究m6A甲基化调节因子在肺腺癌中的表达及预后。方法 通过TCGA数据库下载516例肺腺癌患者的转录组数据及其临床数据,使用R软件分析比较肺腺癌组织和癌旁组织中20个m6A甲基化调节因子的表达差异,并通过单变量Cox回归分析进行生存分析。通过Consensus Cluster Plus R非监督类的方法进行m6A聚类生存分析。结果 16个m6A甲基化调节因子在肺腺癌中差异表达,其中有5个m6A甲基化调节因子(IGF2BP1、IGF2BP3、HNRNPC、RBMX、YTHDC2)与肿瘤分期、7个m6A甲基化调节因子(IGF2BP1、IGF2BP3、HNRNPC、RBMX、METTL3、YTHDF2、METTL14)与T期和2个m6A甲基化调节因子(IGF2BP3、YTHDC2)与N期显著相关。Cox回归分析结果表明6个m6A甲基化调节因子(IGF2BP1、IGF2BP2、IGF2BP3、HNRNPA2B1、HNRNPC、RBM15)是影响肺腺癌患者预后的独立危险因素。结论 m6A甲基化调节因子与肺腺癌进展有关,6个m6A甲基化调节因子可以作为预测肺腺癌患者预后的潜...     

RNA甲基化在非肿瘤肾脏疾病中的研究进展

RNA甲基化近年来受到越来越多的关注,甲基化能够从多方面影响RNA代谢。RNA甲基化在肿瘤及非肿瘤领域的相关研究促进了疾病的发病机制、诊断和治疗方面的进展。最近的研究发现,RNA甲基化在非肿瘤肾脏疾病中发挥关键作用,本文就mRNA甲基化在非肿瘤肾脏疾病中的作用进行综述。     

消化系统肿瘤m6A甲基化修饰对非编码RNA调控的研究进展

m6A甲基化修饰是哺乳动物中最丰富的RNA修饰方式,是表观遗传学重要的调控方法之一,通过添加、移除或者识别结合m6A位点,参与RNA合成与代谢过程,进而调控基因的表达。非编码RNA(ncRNA)是一类缺乏编码多肽或蛋白质能力的RNA,在肿瘤的发生和发展中发挥着重要作用,是癌细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭、耐药等生物学特性的调节因子。越来越多的研究表明,m6A甲基化修饰可通过调控ncRNA参与肿瘤的发生和发展。本研究就消化系统肿瘤中m6A甲基化修饰对ncRNA表达调控的研究进展作一综述。     

RNA m6A修饰及在肿瘤中的作用

6?甲基腺嘌呤（N6?methyladenosine,m6A）是真核生物RNA内部序列中最常见的一种修饰方式,该过程依赖于书写器、擦除器、阅读器等三类分子的精准调控。m6A修饰参与调控基因表达,与肿瘤、神经系统疾病、胚胎发育迟缓等多种疾病相关,近年来该领域成为表观转录组学中新的研究热点。文章详细阐述了m6A修饰在肿瘤发生发展中的作用,包括m6A修饰参与肿瘤干细胞自我更新与分化,调控肿瘤细胞增殖以及参与放化疗抵抗,讨论靶向m6A治疗可能带来的临床干预措施,以期为肿瘤精准治疗提供新手段。     

RNA m6A修饰与免疫功能调控

目前,在编码和非编码RNA中已经发现超过100种化学修饰。N6-甲基腺苷（N6-methyladenosine, m6A）是真核细胞中最常见和最丰富的转录后水平RNA修饰,m6A甲基转移酶及去甲基化酶参与m6A修饰水平的动态可逆调节,m6A修饰识别蛋白特异性识别m6A修饰并调控RNA的剪接、转运、稳定性和翻译。 m6A修饰几乎参与了从正常发育到疾病的所有主要生物过程,包括对免疫系统的调控。免疫系统的正常发育和功能行使依赖于相关基因表达的精准调控,而m6A修饰在该调控中起到关键作用。本文围绕m6A修饰的概念、功能和作用机制,特别是其在免疫系统功能调控中的作用进行综述,讨论了目前该研究领域的挑战并展望未来的研究方向,以期为m6A修饰参与免疫调控的研究提供理论依据和参考。     

m6A RNA甲基化修饰与肿瘤关系的研究进展

N6-甲基腺苷(m6 A)是动态可逆的转录后修饰,是真核信使RNA(mRNA)上最普遍的内部修饰.越来越多的证据表明,m6 A可改变基因表达,从而调节细胞的自我更新、分化、侵袭和凋亡等过程,并且m6 A甲基化失调与异常的RNA代谢直接相关,可导致肿瘤的发生和药物反应的改变.m6 A修饰主要由m6 A甲基转移酶催化,m6...     

m6A甲基化修饰与泌尿系统肿瘤关系的研究进展

RNA N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化修饰是广泛存在于真核生物中的一种动态可逆的化学修饰,受到甲基转移酶和去甲基化酶的调控,并被m6A结合蛋白识别加工,进而调节RNA的剪切、出核、稳定性以及翻译过程等。在细胞癌变的过程中,m6A修饰可以通过调控肿瘤相关基因的转录后表达来影响多种肿瘤的增殖、浸润和转移等过程,进而调控肿瘤的发生发展。本文就参与m6A甲基化修饰的3种蛋白、m6A甲基化修饰与多种泌尿系统肿瘤关系的研究进展做一综述。     

微小RNA与前列腺癌关系的研究进展

微小RNA(miRNA)是长度约为22个核苷酸的短链非编码单链RNA分子,可在转录后调节人类约60％的mRNA表达.越来越多的研究表明,miRNA作为癌基因或抑癌因子参与前列腺癌的发生和进展,miRNA相关调控基因及下游蛋白可能是前列腺癌潜在的治疗靶点.本文就miRNA和前列腺癌关系的研究进展做一综述.     

m~6A RNA甲基化修饰在常见心血管疾病和心肌肥大中的研究进展

心血管疾病是影响全球伤残调整生命年和导致死亡的主要原因。最近研究报道,mRNA最普遍的内部修饰N6-腺苷酸甲基化(m6A)在心血管疾病中发挥重要作用。本文概述了m~6A RNA甲基化修饰的关键酶及动态调节过程,重点阐述了m~6A RNA甲基化在心肌肥大和心力衰竭、高血压、冠状动脉粥样硬化性心脏病、心律失常等常见心血管疾病中的研究进展,并对m~6A RNA甲基化新技术进行了讨论。     

m6A甲基化在鼻咽癌中的研究进展

N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化是哺乳动物最常见的mRNA修饰方式,受m6A甲基化酶、m6A去甲基化酶、m6A甲基识别蛋白等三类分子的动态调控。m6A甲基化修饰相关蛋白在鼻咽癌组织标本中表达异常,有望成为鼻咽癌诊断和治疗的潜在分子靶点。本文就m6A甲基化及其对鼻咽癌增殖、转移、多重耐药性和放疗增敏方面的影响进行综述。     

METTL3介导的m6A修饰在结直肠癌奥沙利铂耐药中的作用研究

目的 探究N⁶-甲基腺嘌呤（N⁶-methyladenosine,m⁶A）调控因子甲基转移酶样蛋白3（methyltransferase-like 3,METTL3）在结直肠癌奥沙利铂（oxaliplatin,OXA）耐药中的作用。方法 采用浓度梯度法构建OXA耐药细胞株HCT116/OXA,CCK-8分析其耐药性;采用Dot blot及m⁶A RNA甲基化定量ELISA实验检测细胞RNA m⁶A水平,RNA-seq及qRT-PCR筛选差异m⁶A调控因子,Western blot验证METTL3表达水平;利用腺病毒感染技术在HCT116细胞过表达METTL3,CCK-8检测各组细胞的增殖活性;通过对GEO数据库中HCT116细胞敲除METTL3的MeRIP-seq和RNA-seq数据与耐药细胞RNA-seq联合分析,筛选耐药相关的METTL3介导m⁶A修饰调控的下游靶基因及信号通路;TCGA数据库分析METTL3与患者预后的相关性。结果 HCT116/OXA细胞对OXA的耐药性明显高于其亲代细胞（P<0.01）;与HCT116相比,耐药细胞的RNA m⁶A水平异常上调（P<0.01）,且伴随METTL3的mRNA和蛋白水平升高;过表达METTL3明显增强HCT116细胞对OXA的耐药性（P<0.01）;多组学数据联合分析筛选的METTL3介导m⁶A修饰调控的与耐药相关的关键基因主要富集在ABC转运蛋白、干细胞多能性调节信号通路、TGF-β信号通路等;METTL3高表达与结直肠癌患者的不良预后明显相关（P<0.01）。结论 METTL3介导的m⁶A修饰可能通过调节ABC转运蛋白、调节干细胞多能性的信号通路、TGF-β信号通路等经典耐药信号通路促进结直肠癌OXA耐药。     

沉默信息调节因子1小干扰RNA抑制前列腺癌细胞DU145的迁移

目的 观察沉默信息调节因子1（silent information regulator 1,SIRT1）小干扰RNA（siRNA）对前列腺癌DU145细胞迁移和基质金属蛋白酶中MMP2和MMP9表达变化的影响.方法 体外培养DU145细胞,实验分Scramble siRNA组和SIRT1siRNA组;利用脂质体介导转染技术转染前列腺癌DU145细胞,Western blot方法检测DU145细胞中SIRT1的干涉效能;划痕实验、平板克隆实验和Transwell迁移实验研究SIRT1对其体外迁移运动能力的影响;Western blot方法检测DU145细胞中MMP2和MMP9的蛋白表达.结果 与Scramble siRNA组比较,SIRT1 siRNA组SIRT1的蛋白表达水平降低,明显抑制DU 145细胞的迁移,降低MMP2和MMP9蛋白.结论 下调SIRT1的表达可以抑制前列腺癌细胞DU145的迁移,其机制可能与改变基质金属蛋白酶中MMP2和MMP9的表达相关.     

m6A甲基化修饰与消化道恶性肿瘤关系的研究进展

N6-甲基腺嘌呤(m6 A)甲基化修饰是RNA分子上一种最普遍的表观遗传修饰,该修饰过程可逆,多种酶参与了m6 A甲基化修饰的动态过程.随着高通量检测技术的发展,目前用于检测m6 A甲基化修饰位点的方法较多,m6 A甲基化修饰可导致多种恶性肿瘤的发生、发展、侵袭,而相关调节剂或抑制剂可能为恶性肿瘤的治疗提供潜在策略.如...