基于网络药理学与分子对接技术探讨开郁种玉汤治疗不孕症作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接技术探讨开郁种玉汤治疗不孕症的生物信息学基础及分子机制。方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获得开郁种玉汤组方药物的活性成分及靶点蛋白,构建“活性成分-靶点”网络,通过GeneCards数据库获取不孕症相关靶点。将开郁种玉汤与不孕症靶点绘制韦恩图取交集,通过STRING 11.0b数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选关键靶点。利用DAVID 6.8数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,将活性成分进行分子对接验证。结果 筛选出开郁种玉汤58个活性成分,共对应604个靶点,获得开郁种玉汤治疗不孕症相关靶点150个,开郁种玉汤治疗不孕症的关键成分可能为槲皮素、木犀草素、山柰酚等,关键靶点可能为AKT1、TNF、TP53等;开郁种玉汤可能影响与不孕症相关的RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎症反应、蛋白结合、酶结合过程等多条生物过程及分子功能,以及PI3K-Akt信号通路等多条信号通路。分子对接结果显示,活性成分与关键靶点对接良好。结论 开郁种玉汤治疗不孕症有多成分、多靶点、多通路的特点,通过抗生殖系统局部炎症、调节氧化应激、...     

独活-牛膝药对治疗膝骨关节炎的网络药理学机制及实验验证

【目的】应用网络药理学及分子对接技术探讨独活-牛膝药对治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制，并通过体外实验进行验证。【方法】检索TCMSP、中国药典、BATMAN-TCM数据库获取独活、牛膝的活性成分，筛选去重后应用TCMSP数据库确定作用靶点，运用GeneCards和OMIM数据库筛选KOA相关的靶点。采用Cytoscape构建药物活性成分-KOA-靶点网络模型并进行分析；运用STRING数据库构建蛋白质相互作用（PPI）网络，通过R 4.0.2软件对交集靶点进行基因本体论（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集；运用AutoDockTools对前5位的核心靶点进行分子对接。进而通过体外细胞实验验证有效成分槲皮素对核心靶点的调控作用。【结果】通过筛选得到14个有效活性成分、171个活性成分靶点、2 040个KOA靶点和99个交集靶点。GO分析结果显示独活-牛膝药对治疗KOA关键靶点的生物功能主要涉及炎症反应、细胞代谢、调节蛋白激酶及磷酸酶活性等。KEGG通路主要富集到肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路、癌症通路等。分子对接结果显示独活...     

基于网络药理学和分子对接探讨黄连治疗高脂血症的作用机制

目的 采用网络药理学方法和分子对接,研究黄连治疗高脂血症的作用机制。方法 借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索黄连主要活性成分,利用SwissTargetPrediction数据库和TargetNet数据库,获取黄连活性成分对应的作用靶点。通过GeneCards、OMIM和Drugbank数据库筛选高脂血症相关靶点。使用Venny2.1汇总化合物靶点和疾病靶点交集基因并绘制韦恩图。运用Cytoscape 3.8.2绘制“黄连-成分-靶点-高脂血症”的网络图。通过STRING构建黄连-高脂血症核心靶点的PPI网络。采用R软件与Bioconductor工具包进行关键靶基因GO与KEGG功能富集分析,通过文献分析黄连治疗高脂血症的作用机制。最终对黄连主要活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 获取黄连14个活性成分,关联138个作用靶点。黄连主要涉及脂质代谢过程的调节等生物过程,通过作用核心靶点AKT1、TNF、EGFR等并通过调节AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、AMPK信号通路、脂肪细胞中脂解的调节等信号通路来发挥降脂作用。分子对接结果证明黄连主要活性成分与核心靶点结合...     

基于网络药理学和分子对接探究枸杞子治疗膝骨关节炎的潜在作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接方法获取枸杞子有效成分靶点,探究其治疗膝骨关节炎(KOA)的潜在作用机制。方法 利用TCMSP、Uniprot、Gene Cards、OMIM等数据库获取枸杞子有效成分的潜在靶点及KOA疾病相关靶点基因,在DAVID数据库进行GO富集分析与信号通路富集分析,利用微生信在线绘图软件进行可视化分析,借助String数据库及Cytoscape3.9.2软件构建枸杞子活性成分-疾病靶点网络、枸杞子治疗KOA蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,最后运用StoneMIND Collector和Discovery Studio Client 2019对有效成分及主要作用靶点进行分子对接。结果 网络药理学预测显示枸杞子治疗KOA主要活性成分可能为槲皮素、β-谷甾醇、黄豆黄素等,关键靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6 (IL-6)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1 (AKT-1),通过参与调控晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGEs-RAGE)信号通路、癌症信号通路、白细胞介素17 (IL-17)信号通路发挥治疗作用。分子对接结果提示关键活性成分与关键靶点具有较好的...     

基于网络药理学和分子对接研究喘可治注射液治疗支气管哮喘的机制

目的 应用网络药理学和分子对接,研究喘可治注射液治疗支气管哮喘的活性成分–靶点–通路及作用机制。方法 借助TCMID和TCMSP数据库、ChemicalBook平台及文献检索获取喘可治注射液中淫羊藿和巴戟天的主要活性成分,运用TCMSP、SwissTargetPrediction、PubChem、GeneCards数据库筛选活性成分靶点,从GeneCards、CTD数据库中获得支气管哮喘靶点,在STRING平台构建蛋白–蛋白相互作用网络,使用OmicShare云平台、DAVID数据库、Origin软件对靶点进行KEGG通路和GO生物过程分析,利用Cytoscape软件构建活性成分–靶点–通路网络图,采用AutoDuck Tools软件对关键活性成分和关键靶点进行分子对接。结果 从喘可治注射液中筛选出9个活性成分,作用于66个支气管哮喘相关靶点,其中18个关键靶点涉及13条主要信号通路,参与12条主要生物过程。由分子对接可知喘可治注射液中关键活性成分淫羊藿次苷I、蔗果四糖与支气管哮喘关键靶点结合度较高。结论 喘可治注射液可通过多靶点、多通路、多机制治疗支气管哮喘。     

基于网络药理学及分子对接探讨雷公藤治疗肝癌的作用机制

目的运用网络药理学方法及分子对接技术对雷公藤治疗肝癌的主要活性成分及其潜在作用机制进行探讨。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选雷公藤主要活性成分及其预测靶点；在DrugBank、GeneCards、OMIM、TTD数据库中筛选肝癌相关靶点；通过R语言软件映射得到雷公藤治疗肝癌靶点，并绘制韦恩图；在STRING网站构建治疗靶点PPI网络图；应用Cytoscape 软件构建"雷公藤-活性成分-靶点-肝癌"互作网络图；通过R语言软件对治疗靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析；应用PubChem、RCSB PDB数据库，AutoDock、PyMOL软件对药物潜在活性成分与关键靶点进行分子对接。结果 共筛选出活性成分51个和潜在治疗靶点120个，靶点主要涉及酰胺结合、肽结合、DNA结合转录因子结合等生物学过程，并主要富集于卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、乙型肝炎、流体剪切应力和动脉粥样硬化等信号通路中。分子对接验证显示对接得分大于-5kcal/mol占100%，即所有靶点与成分的结合活性较好。结论 通过网络药理学方法及分子对接技术证实了雷公藤多成分、多靶点、多途径的作用特点，预测了雷公藤治疗肝癌的潜在作用机制，为后续进一步开发和应用提供理论依据。     

基于网络药理学方法探讨栀豉温胆汤治疗失眠的作用机制

目的 基于网络药理学方法探究栀豉温胆汤治疗失眠的作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)分别收集栀豉温胆汤中各味中药的主要活性成分和作用靶点;通过GeneCard、OMIM、DrugbankDis、GeNET数据库获取疾病相关靶点,合并4个数据库获得并集靶点,并收集药物-疾病交集靶点,构建蛋白相互作用网络,采用Cytoscape软件作图分析。借助R语言进行GO分析和KEGG分析。应用AutoDock Tools-1.5.6软件进行分子对接。结果 共筛选出活性成分153个,成分作用靶点614个,与失眠相关共同靶点120个,关键靶点包括IL-6、INS、COMT、TNF、PTGS2等。结合GO分析及KEGG通路相关条目,主要通路包括神经活性配体-受体相互作用、5-羟色胺能突触、cGMP-PKG信号通路、色氨酸代谢、神经退行性变的途径-多种疾病、cAMP信号通路、多巴胺能突触、阿尔茨海默病等信号通路等发挥治疗失眠的作用。分子对接结果显示关键成分与关键靶点具有较好的结合能力。结论 栀豉温胆汤作用靶点涉及神经退行性疾病、炎症等多种疾病,与神经类疾病尤为相关。     

基于网络药理学和分子对接研究颐脑解郁方治疗抑郁症的作用机制

目的：采用网络药理学和分子对接的方法探讨颐脑解郁方治疗抑郁症的作用机制。方法：通过检索TCMSP、Symmap数据库获取颐脑解郁方的活性成分,利用 TCMSP、Uniport和Symmap预测活性成分的靶点,并通过GeneCards、OMIM、pharmgkb、TTD、DrugBank数据库检索抑郁症疾病靶点,将其疾病靶点取交集,进而将颐脑解郁方的活性成分靶点与抑郁症的疾病靶点取交集,利用Cytoscape构建药物成分-靶点网络,并使用STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI),进行核心基因的GO和KEGG富集分析,并使用Pymol、AutoDock Tools软件制作分子对接。结果：共获取颐脑解郁方组方中6味植物药的活性成分72个,对应1363个目标靶点;通过CytoNCA筛选出9个关键靶点;GO富集分析得到生物学过程2624条、分子功能243条以及细胞组分116条,主要与炎症反应、以及氧化应激过程相关;KEGG富集分析得出194条显著富集的通路,主要为 IL-17 信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等,其功能主要涉及免疫系统调控、信号传导、内分泌系统、细胞生长与凋亡等。结论：颐脑解郁方可通过多个化合物作用于多个分子靶点发挥其对抑郁症的治疗作用,其分子机制主要涉及抑制炎症反应,减弱氧化应激等方面。     

基于网络药理学和分子对接探讨宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术，探究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、TCMID数据库筛选宣肺润燥解毒方活性成分，利用有关数据库筛选新冠肺炎相关靶点。以Cytoscape软件构建“药物-化合物-靶点”网络，并用分子对接验证有效成分与靶点亲和力。结果 筛选出宣肺润燥解毒方有效成分3019个，潜在靶点525个。分子对接结果显示活性成分槲皮素、木犀草素、汉黄芩素与关键靶点ATK1、TNF、TP53具有良好亲和力。结论 本研究初步明确宣肺润燥解毒方通过多成分-多靶点-多通路治疗新冠肺炎的作用机制，为深入研究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制提供了前期参考。     

基于网络药理学和分子对接验证技术探讨贯叶金丝桃抗阿尔茨海默病的作用机制

目的 利用网络药理学及分子对接技术研究贯叶金丝桃治疗阿尔茨海默病（Alzheimers disease,AD）的潜在作用机制。方法 在TCMSP及TCM Database@Taiwan数据库查找贯叶金丝桃的化学成分并进行活性成分筛选;利用化源网、PubChem、SwissTargetPrediction及ChEMBL数据库获取活性成分的作用靶点,检索GeneCards、OMIM、DrugBank和DisGeNET数据库,结合文献检索获取AD的疾病靶点。取两者交集靶点,利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。采用Metascape平台对靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析,通过Cytoscape 3.10.0软件构建“化合物-靶点-通路”网络并进行拓扑学分析,并采用AutoDock Vina 1.1.2进行分子对接验证。结果 贯叶金丝桃防治痴呆的关键化合物是贯叶金丝桃素金、丝桃素及金丝桃苷等,其对应的关键靶点为APP、PIK3R1、PIK3CA、AKT1、EGFR、GSK3B等,分子对接验证结果显示其主要活性成分与核心靶点均具备潜在活性。所涉及的主要分子过程及通路为激酶活性的正调控、神经活性配体-受体相互作用及激酶活性调节等,关键通路为AD通路和PI3K-Akt信号通路。结论 贯叶金丝桃治疗AD的机制可能与减少β-淀粉样蛋白的产生及tau蛋白形成,调节神经炎症相关。     

基于网络药理学及分子对接探讨"藿香-佩兰-大黄"角药治疗慢性肾衰竭的作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接探析角药"藿香-佩兰-大黄"治疗慢性肾衰竭(CRF)的核心成分、核心靶点、关键通路及其作用机制.方法 通过TCMSP数据库获取"藿香-佩兰-大黄"角药的药物活性成分和作用靶点,并进行筛选.疾病靶点通过Gencards、Drugbank和TTD数据库检索,Uniprot数据基因名称通过Uni...     

基于网络药理学结合LC-MS与分子对接探讨黄芪-莪术药对治疗卵巢癌的有效成分及作用机制

目的 采用网络药理学方法、液质联用(LC-MS)及分子对接技术分析黄芪-莪术药对治疗卵巢癌(Ovarian cancer, OC)的有效成分、关键靶点及作用机制。方法 通过TCMSP、SWISS、Drugbank、DisGeNET和GeneCards等数据库及文献研究,合并LC-MS定量分析的黄芪-莪术药对代表性成分信息,获得药对潜在活性成分并筛选其抗OC的主要作用靶点,并借助Metascape数据库对其进行GO功能富集和KEGG通路分析;运用AutoDock Vina对黄芪-莪术核心活性成分与关键作用靶点进行分子对接验证其结合活性。结果 整合网络药理学及LC-MS技术筛选得到黄芪-莪术药对治疗OC核心活性成分主要为黄芪中黄酮类化合物及莪术中姜黄素类化合物;PPI分析发现其潜在关键靶点为TP53、AKT1、VEGFA、MYC、EGFR等;GO、KEGG富集分析结果涉及调节信号通路的蛋白激酶,并与MAPK、HIF-1等信号通路密切相关;分子对接结果显示,黄芪-莪术药对治疗OC的核心成分与关键靶点具有较强的结合活性。结论 采用网络药理学方法联合LC-MS及分子对接技术,可快速分析黄芪-莪术...     

基于网络药理学和分子对接探讨瓜蒌皮注射液治疗冠心病的作用机制

[目的]通过网络药理学及分子对接的方法,探究瓜蒌皮注射液治疗冠心病的分子机制。[方法]首先通过查阅文献汇总瓜蒌皮注射液中的主要化学成分,通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、SwissADME数据库筛选其活性成分并预测其作用靶点,与在GeneCards数据库、OMIM数据库中获取的冠心病的相关靶点交集获得核心靶点;其次通过String数据库构建靶点蛋白互作网络,转换格式导入Cytoscape3.7.2软件构建蛋白互作网络和“相关活性成分-潜在作用靶点”网络并分析关键靶点蛋白与活性成分;然后通过Metascape数据库对靶点基因进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;最后通过AutoDock Vina软件将活性成分与核心靶点进行分子对接来对网络药理学预测的准确性进行虚拟验证。[结果]研究获得瓜蒌皮注射液治疗冠心病的可能相关活性成分10个,核心靶点7个。瓜蒌皮注射液的活性成分可能通过调控蛋白激酶B抗体（AKT1）、表皮生长因子受体（EGFR）、非受体酪氨酸激酶（SRC）、热休克蛋白90AA1(HSP90AA1)、半胱氨酸蛋白酶3(CA...     

基于网络药理学研究丹栀逍遥散治疗便秘的作用机制

目的基于网络药理学研究丹栀逍遥散治疗便秘的作用机制。 方法利用TCMSP、BATMAN-TCM、Uniprot、GeneCards等数据库检索筛选丹栀逍遥散关键成分及相关靶点、疾病靶点和相关通路。通过STRING数据库和Cytoscape软件绘制PPI网络图,寻找核心基因。利用Metascape和BioGPS数据库通过微生信平台进行基因富集分析。利用SwissDock平台进行分子对接分析。 结果丹栀逍遥散药物靶点746个,便秘靶点1 620个。关键靶点为VEGFA、CASP3、TNF、JUN,关键成分为槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇。关键靶点主要作用于淋巴细胞、平滑肌、结肠、结直肠腺癌、小肠,主要富集于炎性肠病、NF-κB信号通路等。分子对接结果显示活性成分与靶点蛋白结合稳定。 结论丹栀逍遥散治疗便秘的作用机制,可能是通过其4个关键成分作用于4个关键靶点,调节多通路,起到抑制炎症、保护肠黏膜屏障、调节肠道菌群等作用。     

三七花治疗阿尔兹海默病的网络药理学分析及分子对接

目的 用网络药理学及分子对接方法，研究三七花改善阿尔兹海默病(AD)的作用机制。方法 采用TCMSP数据库筛选三七花活性成分和相应靶点，利用DisGeNET数据库和GeneCards数据库查找AD的相关靶点、Cytoscape 8.0软件构建“活性成分-靶点”关联网络，并对关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析。将筛选得到的三七花活性成分和作用靶点通过分子对接验证。结果 三七花活性成分中有23个成分对应AD靶点34个。主要通过西多糖苷(Sitogluside)、 β-谷甾醇(beta-sitosterol)、 β-榄香烯等活性成分调控CHRM1、CHRM2、PTGS2等靶点改善AD，特别是西多糖苷、 β-谷甾醇与PTGS2、CHRM2等靶点有较强的结合。结论 三七花的活性成分可能通过调控CHRM1、CHRM2、PTGS2、ADRB2、SLC6A4、PTGS1、RELA、IL10等靶标，PI3K-Akt信号通路等多个途径发挥干预AD的作用。     

基于网络药理学及分子对接研究泽漆萜类成分抗非小细胞肺癌作用机制

目的基于网络药理学及分子对接研究泽漆萜类成分抗非小细胞肺癌(NSCLC)作用机制。方法通过多种文献数据库及TCMSP数据库检索并筛选泽漆萜类成分,通过Swiss Target Prediction平台预测活性成分靶点;在Gene Cards和CTD中检索筛选NSCLC的治疗靶点;利用Cytoscape软件构建泽漆萜类成分抗NSCLC的活性成分-作用靶点网络和蛋白质相互作用(PPI)网络;使用David数据库对泽漆萜类成分抗NSCLC的作用靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;应用autodock vina软件对关键活性成分和靶点进行分子对接验证。结果共得到活性成分靶点484个,NSCLC治疗靶点1071个,泽漆萜类成分抗NSCLC的107个靶点。euphohelioscopin B、euphornin K、euphornin A、euphoscopin A及euphoscopin E为关键性萜类成分;MAPK1、MAPK3、PIK3CA、CCND1及EGFR为核心靶点。GO富集分析及KEGG富集分析显示,泽漆萜类成分参与多种生物学过程及通路的调控,主要涉及Erb B信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路等;分子对接结果提示关键成分与关键靶点有较好的结合活性。结论泽漆萜类成分抗NSCLC作用具有多成分、多靶点、多途径的特点,可通过调控肿瘤细胞的增殖、生长、侵袭及凋亡等功能以发挥作用。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨脑血疏口服液治疗缺血性卒中的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术探索脑血疏口服液治疗缺血性卒中的药效物质基础与潜在作用机制。方法 基于脑血疏口服液与缺血性卒中的共同靶点构建“单味药-活性成分-作用靶点”网络;通过String数据库构建蛋白互作(PPI)网络;Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路注释与富集分析;分子对接分析预测关键的活性成分与靶点的结合互作。结果 “单味药-活性成分-作用靶点”网络中获得脑血疏口服液治疗缺血性卒中的可能活性成分29个,作用靶点67个,其中关键活性成分包括山柰酚、β-胡萝卜苷、胡萝卜苷等;PPI网络分析获得AKT1、PTGS2、EGFR、SRC等关键靶点,其中山柰酚与以上四个关键靶点均有较高的亲和力;脑血疏口服液治疗缺血性卒中的机制可能主要涉及激酶活性、炎症反应、氧化应激应答、免疫系统过程等多种分子功能和生物过程,以及EGFR酪氨酸激酶抑制剂抗性、PI3K-Akt信号通路等165个通路。结论 脑血疏口服液通过多成分、多靶点、多通路和功能的复杂网络调控炎症反应、血管损伤、神经元损伤或凋亡及脑损伤等防治缺血性卒中,为其后续深入药理学研究奠定了基础。     

基于网络药理学与分子对接技术分析活血利水方治疗前部缺血性视神经病变急性期的作用机制

目的 运用网络药理学方法,探讨活血利水方治疗前部缺血性视神经病变(Anterior ischemic optic neuropathy, AION)急性期的活性成分、潜在靶点和作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索活血利水方有效活性成分和作用靶点,根据文献报道补充未预测到的活性成分的已知靶点;采用Cytoscape 3.9.0软件进行可视化;采用GeneCards数据库、OMIM数据库获取AION急性期靶点;通过STRING数据库构建活血利水方治疗AION急性期PPI网络,并借助Cytoscape软件筛选关键靶点;DAVID数据库进行功能富集分析。利用AutoDock Vina 1.1.2对关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证。结果 共筛选出活血利水方活性成分159个,筛选的关键靶点主要涉及MAPK14、FOS、MYC、ESR1等。KEGG富集分析显示AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等信号通路可能是活血利水方治疗AION急性期的关键信号通路。分子对接结果显示活血利水方的关键活性成分可以对MA...     

基于网络药理学与分子对接研究中药乐脉颗粒治疗冠心病心绞痛的活性物质及作用机制

目的:基于网络药理学及分子对接技术探究乐脉颗粒治疗冠心病心绞痛的物质基础及作用机制。方法:通过TCMSP、ETCM等数据库及文献检索收集乐脉颗粒的化学成分信息;利用SwissTargetPrediction数据库收集活性成分靶点;疾病靶点通过GeneCards、DisGeNET等数据库收集;使用Venny获得交集靶点并绘制韦恩图;运用DAVID数据库进行生物功能注释与富集分析;使用Cytoscape软件构建乐脉颗粒活性成分-冠心病心绞痛靶标网络并进行网络拓扑学分析;通过AutoDock进行分子对接验证。结果:乐脉颗粒7味中药共有176个化学成分及975个靶点,冠心病心绞痛共有234个靶点,疾病与成分共有靶点65个;网络药理学技术分析得到乐脉颗粒通过丹酚酸A、芍药内酯苷、丹参新醌D、亚油酸、拟丹参醛、槲皮素和芍药苷等主要活性成分,参与PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路和钙信号通路等多种信号通路,作用于IL-6、MMP-9、TNF、ICAM-1等关键靶点来影响炎症反应、缺氧反应和血栓形成等病理过程。分子对接结果显示主要成分与核心靶点之间结合情况好。结论:乐脉颗粒治...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨羌活对心律失常的作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接技术探索羌活治疗心律失常的作用机制。方法 采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)筛选羌活的有效成分及作用靶点;借助Genecards、OMIM数据获得心律失常疾病相关基因;应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作网络(PPI);采用cytoscape 3.6.1软件构建药物-成分-靶点互作用网络,同时进行网络分析筛选分子对接的候选成分和靶点;通过cytoscape插件ClueGo对共同靶点进行GO(生物过程)富集分析,并应用R语言进行KEGG(京都基因与基因组百科全书)通路分析。最后,通过Autodock软件进行分子对接。结果 从TCMSP中获取羌活有效成分10种,有效靶点138个,从Genecards、OMIM数据库种获取心律失常相关基因2048个,构建共同靶点的PPI网络以及“药物-成分-靶点”网络,获得羌活治疗心律失常的关键潜在靶点26个,包含CASP、PTGS2、JUN等。这些靶点主要涉及循环系统中的血管过程、神经元死亡的正调控、磷脂C活性的正调控等生物学过程;通路富集显示,这些靶点与心律失常和其他多种疾病(如乙型肝炎、1型人体免疫缺陷病毒...