当归-白芍药对治疗溃疡性结肠炎的网络药理学研究

目的基于网络药理学研究当归-白芍药对治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法利用TCMSP数据库,得到当归-白芍药对化学成分的口服利用率和药物相似性等参数,并筛选药对的有效成分组。利用UniProt数据库找到当归-白芍药对有效靶点的官方基因名称,并利用CTD数据库进行靶点相关疾病注释。通过DisGeNET数据库得到溃疡性结肠炎的相关靶点,并与当归-白芍作用靶点取交集,得到其治疗溃疡性结肠炎的药效靶点。将上述靶点输入到String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用网络预测,最后利用DAVID数据库进行KEGG富集分析,揭示当归-白芍药对治疗溃疡性结肠炎的潜在信号通路。结果筛选出了当归的2个活性成分和白芍的9个活性成分以及63个抗溃疡性结肠炎的靶点。通过蛋白质互作网络分析,当归-白芍药对治疗溃疡性结肠炎可能与MAPK14、PTSG2、PPARG、TNF、IL6、NOS3、BCL2等蛋白质有关。此外,当归-白芍药对治疗溃疡性结肠炎的靶点显著富集于HIF-1、TNF、NF-κB等信号通路中。结论当归-白芍药对具有多靶点、多途径、多通路的特点,其治疗溃疡性结肠炎的潜在生物学机制可能与以HIF-1、TNF、NF-κB等信号通路有关。     

当归芍药散治疗原发性痛经作用机制探讨——基于网络药理学

目的:探讨当归芍药散治疗原发性痛经的作用机制。方法:在TCMSP平台筛选当归芍药散的活性成分与靶点,构建药物-成分-靶点网络进行分析;在OMIM、GeneCards、DrugBank数据库检索原发性痛经相关靶点;构建韦恩图得到共同靶点;在STRING数据库对共同靶点构建蛋白互作网络,用Cytoscape软件可视化处理并进行拓扑参数、cytoHubba、MCODE分析;使用Metascape数据库对共同靶点进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。结果:经筛选,当归芍药散作用靶点共144个,原发性痛经相关靶点335个,共同靶点40个;蛋白相互作用degree的平均值为17.6,cytoHubba得分较高的关键靶点共10个,如PTGS2、ESR1、TP53、IL6、CXCL8等,MCODE分析共有3个模块;富集分析共涉及1 037个生物过程、19个细胞组分、68个分子功能及98条信号通路,如花生四烯酸代谢、雌激素信号途径、胆碱能突触、T细胞受体信号通路等。结论:当归芍药散治疗原发性痛经通过激素调节、中枢镇痛、炎症、免疫及细胞存活等方面发挥作用,具有多成分、多靶点、多通路的特点,为今后临床观察与实验研究提供理论参考。     

基于指纹图谱及网络药理学的白芍质量标志物(Q-marker)预测分析

目的基于指纹图谱和网络药理学方法,分析预测当归四逆汤中单味药白芍潜在的质量标志物(Q-marker)。方法建立白芍水煎液和当归四逆汤指纹图谱,明确成分传递规律;进一步通过网络药理学方法,构建"成分-靶点-通路"网络,预测白芍的Q-marker。结果建立了15批白芍水煎液和15批当归四逆汤指纹图谱,并各指认其中5个色谱峰,分别为没食子酸、芍药内酯苷、芍药苷、1,2,3,4,6-O-五没食子酰葡萄糖和苯甲酰芍药苷;经网络药理学分析,筛选出潜在的2个活性成分、8个核心靶点、13条关键通路,表明白芍主要通过这些成分、靶点、通路发挥作用,初步预测芍药苷、芍药内酯苷为白芍潜在的Q-marker。结论研究分析预测的Q-marker,为白芍质量的全面控制提供参考,同时也为白芍功效关联物质的研究及作用机制的阐释奠定基础。     

基于网络药理探讨四妙散治疗骨性关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨四妙散治疗骨性关节炎(OA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中检索四妙散中黄柏、苍术、薏苡仁、牛膝的活性成分,以口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18为条件进行筛选,通过Uniprot数据库进行靶点预测;通过TTD、Drugbank、CTD、Gencards、OMIM、PharmGKB、GAD、KEGG数据库获取OA的相关靶标,并进一步对药物和疾病靶点相映射得到四妙散治疗OA的潜在靶点,运用Cytoscape和STRING软件构建“中药-成分-靶点”与蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,筛选可能发挥治疗作用的重要成分及靶点,并对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获知其潜在的作用机制。结果:从四妙散中共筛选出活性成分67个,包括槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、汉黄芩素、非洲防己碱等,与骨关节炎相关的作用靶点524个,包括TNF、IL6、MAPK1、PTGS2、MAPK8等。四妙散主要通过调节TNF信号通路、HIF-1信号通路、NOD样受体、Toll样受体信号通路等发挥治疗骨关节炎的作用。结论:本研究运用网络药理学预测了四妙散治疗OA可能的活性成分、关键靶点及作用通路,体现了中药治疗疾病具有“多成分、多靶点、多途径”的特点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗阿尔茨海默病的作用机理

目的探讨当归芍药散治疗阿尔茨海默病的可能作用机制。方法采用网络药理学研究方法,应用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库,对当归芍药散和阿尔茨海默病进行靶标预测。采用STRING在线数据库,对二者交集的靶点蛋白构建蛋白相互作用网络,并在Cytoscape 3. 6. 1软件中进行可视化处理。在Unitprot数据库查询靶标蛋白的基因名,使用DAVID工具对查到的基因进行基因本体论(GO)富集分析以及KEGG通路富集分析,探讨潜在靶标可能具有的生物学功能及通路。结果从当归芍药散中筛选出38个化合物,涉及治疗阿尔茨海默病的9个靶点,网络分析结果表明靶点该方可能通过胆碱能突触传递、乙酰胆碱受体信号通路、神经系统发育、信号转导等生物过程,并结合G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、过氧化物酶活性、细胞外配体门控离子信号通路、淀粉样β结合蛋白等分子功能发挥作用;其作用机制主要与胆碱能突触通路、神经配体-受体相互作用通路、钙信号通路、尼古丁成瘾相关的信号通路、PI3KAkt信号通路等有关。结论当归芍药散治疗阿尔茨海默病具有多靶点、多通路的特点。     

基于网络药理学的党参增强免疫功能机制研究

目的运用网络药理学方法探究党参增强免疫功能的潜在作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)查找党参的活性成分及与活性成分相关的潜在靶点,并采用Cytoscape3.6.1软件构建党参活性成分-靶点网络。在NCBI网站下Gene数据库中以"immunosuppression"为关键词搜索免疫抑制靶点,使用装载ReactomeFIViz插件的Cytoscape3.6.1软件构建免疫抑制靶点相互作用网络,并将其与党参活性成分-靶点网络融合,获得党参活性成分的免疫作用靶点。使用DAVID数据库对党参免疫作用靶点进行KEGG通路富集分析,以探究党参增强免疫功能的作用机制。结果党参发挥免疫作用的主要靶点有肿瘤坏死因子(TNF),转录因子p65(RELA),白细胞介素10(IL10),白细胞介素6(IL6),白细胞介素2(IL2)等。其中木樨草素,芹菜素,棕榈酸甲酯,棕榈酸,白术内酯III主要作用于TNF;芹菜素,月桂酸,辣椒素,木樨草素,棕榈酸甲酯主要作用于RELA;木樨草素,棕榈酸甲酯,棕榈酸主要作用于IL-10;月桂酸,木樨草素,棕榈酸甲酯主要作用于IL-6;芹菜素,木樨草素主要作用于IL-2。KEGG分析得到与党参免疫作用有关的通路16条,主要涉及T细胞受体信号通路,NOD样受体信号通路等。结论党参中的免疫活性成分可能通过调控TNF、RELA、IL10、IL6等靶点,T细胞受体信号通路,NOD样受体信号通路等多个途径发挥增强机体免疫功能的作用。     

基于网络药理学探讨四逆散治疗桥本甲状腺炎作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接技术,分析四逆散治疗桥本甲状腺炎的作用机制.方法 通过TCMSP数据库,筛选柴胡、白芍、枳实、甘草的主要活性成分及作用靶点;通过Genecards、OMIM数据库获取桥本甲状腺炎的相关靶点;利用STRING数据库构建PPI网络;利用Metascape平台进行KEGG信号通路和GO生物富集分析,并运用Cytoscape3.6.1软件构建"方药-成分-疾病-靶点-通路"网络;利用AutoDock Vina软件进行分子对接验证.结果 四逆散治疗桥本甲状腺炎的核心活性成分包括槲皮苷、山奈酚和异鼠李素等;核心靶点包括STAT3、TNF、AKT1、TP53、JUN、IL-6、MAPK1、EGFR、MAPK14、VEGFA等;核心通路包括TNF信号通路、AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路及Th17细胞分化通路等;四逆散中槲皮苷成分与STAT3、TNF、AKT1、MAPK14靶点经分子对接验证后结合活性较好.结论 四逆散治疗桥本甲状腺炎的药理学作用机制多成分、多靶点、多通路.     

基于网络药理学的淫羊藿增强免疫功能作用机制研究

目的：通过网络药理学探讨淫羊藿增强免疫功能可能的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索淫羊藿的活性成分和靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-活性成分-靶点”网络图。通过人类基因数据库（GeneCards）检索免疫抑制的相关靶点,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,利用DAVID平台进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集通路分析。结果：筛选出淫羊藿21个有效活性成分,179个潜在靶点。GO生物过程共562条,包括信号转导、炎症反应、凋亡过程等;KEGG信号通路共120条,主要涉及癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路等。结论：淫羊藿的活性成分通过作用于AKT1、TP53、IL6、VEGFA等靶点,参与信号转导等生物过程,调控癌症途径、TNF信号通路等多个途径发挥增强免疫功能的作用。     

基于网络药理学探讨清肺化痰方改善慢性阻塞性肺疾病的作用机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术探究清肺化痰方改善慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)气道黏液高分泌的有效成分和潜在分子机制。方法:首先使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)收集清肺化痰方的活性成分和潜在靶点,利用GeneGards等多个数据库筛选AECOPD气道黏液高分泌的疾病靶点;然后将疾病靶点与药物预测靶点取交集,借助Cytoscape3.7.2软件构建交集靶点网络以及蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID进行GO和KEGG富集分析。最后,将药物活性成分与疾病靶点进行分子对接。结果:清肺化痰方中54个有效活性成分可通过67个潜在靶标改善AECOPD的气道黏液高分泌,涉及TNF信号通路、IL-17、PI3K-Akt等相关信号通路。槲皮素、木犀草苷、β-谷甾醇等成分与AKT1、IL6、EGF等靶标蛋白结合稳定。结论:初步揭示清肺化痰方可直接改善AECOPD气道黏液高分泌,以及其多靶点、多通路的潜在作用机制,为后续研究提供思路。     

佛手散治疗阿尔茨海默病分子机制的系统药理学研究

目的利用系统药理学方法和体外实验探究佛手散治疗阿尔茨海默病（Alzheimer disease,AD） 的分子 机制。方法利用TCMSP、TCM-Mesh、ETCM 和TCMID 数据库筛选佛手散的活性成分;利用TCMSP、ETCM 和PharmMapper 数据库对活性成分进行作用靶点预测。利用DisGeNet、GAD、CTD、TTD、HPO 和Orphadata 数据库筛选出AD 疾病相关靶点,并与佛手散活性成分作用靶点映射取交集,交集基因即为佛手散治疗AD 的 潜在作用靶点。通过String 数据库构建佛手散治疗AD 潜在作用靶点的蛋白互作（PPI） 网络;利用Cytoscape 3.6.1 软件构建“活性成分-潜在作用靶点”网络。通过WebSestalt 及David 分析平台对潜在作用靶点进行GO 功能及KEGG 通路富集分析,并进行体外实验验证。结果共筛选出佛手散52 个活性成分,预测得到185 个 共同靶点,最终确定31 个佛手散治疗AD 的潜在作用靶点。GO 功能富集分析结果表明,潜在作用靶点参与生 物调控、刺激反应、细胞间通讯等生物学过程;细胞膜、蛋白复合物、囊泡参与等细胞组分;蛋白结合、离子 结合、分子转导活性、水解酶活性等分子功能。KEGG 富集分析得到13 条信号通路。体外实验结果表明,佛 手散对谷氨酸钠诱导损伤的PC12 细胞有保护作用,可通过降低胞内Ca2+浓度和NO 含量达到降低细胞凋亡率 的效果。结论佛手散在治疗AD 方面具有多成分、多靶点、多途径的整体调控特点,可能与其通过豆甾醇、 Z-藁本内酯、藁本内酯、β-谷甾醇等活性成分调控5-羟色胺能突触通路、神经配体-受体交互作用通路、Ca2+ 信号通路以及cGMP-PKG 信号通路等多通路有关。     

基于网络药理学和分子对接研究寿胎丸治疗复发性流产的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接方法探讨寿胎丸治疗复发性流产（RSA）的主要作用机制。方法：运用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、BATMAN-TCM数据库检索寿胎丸所含主要的活性化学成分,并在TCMSP数据库中查询药物成分对应靶点,检索GeneGards数据库获得RSA相关靶点。运用R软件取药物与疾病靶点的交集制成韦恩图,再利用Cytoscape 3.7.2软件将药物-活性成分-靶点-疾病网络可视化,通过STRING数据库获得靶标蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。最后运用R软件对靶点基因进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：共得出主要活性成分21个,寿胎丸与RSA相关靶点共108个,通过GO分析得出133个功能条目,通过KEGG分析得出147条信号通路,涉及细胞因子受体结合、受体配体活动、泛素样蛋白连接酶结合等功能及AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化等通路。分子对接验证显示,寿胎丸的主要活性成分与RSA核心靶点具有较强的结合活性,为二者的相互作用提供了基础。结论：该研究利用网络药理学方法初步揭示了寿胎丸通过多成分、多靶点、多通路治疗RSA的作用机制,预测了寿胎丸可能通过TGF-β、PI3K/AKT、MAPK、JAK-STAT等通路保护妊娠,为进一步临床及实验研究提供了良好的理论依据。     

基于网络药理学研究复健片治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的：借助网络药理学平台技术探究复健片治疗缺血性脑卒中（IS）的作用机制。方法：利用中药系统药理学与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、Batman-TCM数据库筛选出复健片中何首乌、桑寄生、决明子、淫羊藿、海马的活性成分及其靶点;利用Uniprot数据库对复健片中靶点信息进行校对;运用GeneCards数据库获取IS的疾病靶点基因;通过Cytoscape 3.7.2软件及STRING 11.0数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并进行生物富集分析。结果：获取复健片治疗IS的共45个活性成分和144个靶点,关键靶点涉及IL6、IL1β、TNF、VEGFA、NOS3等;IS相关靶点1 485个;获得300条GO生物过程和84条相关信号通路,涉及PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、cGMP-PKG信号通路、cAMP信号通路、核因子κB信号通路等。结论：复健片是通过多成分、多靶点、多通路相互作用的机制来达到治疗IS的目的,通过本研究为复健片面向临床进一步推广应用提供理论支持,并为未来研究提供思路。     

基于网络药理学探讨芎芷地龙汤治疗偏头痛的作用机制

目的:分析芎芷地龙汤的活性成分,预测其治疗偏头痛的作用靶点及信号通路.方法:通过TCMSP平台收集芎芷地龙汤活性成分并进行ADME筛选,收集活性成分潜在靶点;通过GeneCards数据库收集偏头痛的相关疾病靶点,并与药物活性成分靶点取交集得到共同靶点,进行PPI分析;使用Cytoscape构建"药物-靶点-疾病"网络并进行分析,通过DAVID数据库对共同靶点进行GO富集与KEGG富集分析.结果:共筛选出芎芷地龙汤85个潜在活性成分和145个潜在治疗靶点;芎芷地龙汤治疗偏头痛关键靶点为JUN、TNF、MAPK1、AKT1、RELA等;可能参与的通路有Pathway in cancer通路、HIF-1信号、TNF信号通路、TLR信号通路、神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、T细胞受体信号通路等.结论:槲皮素、β-谷甾醇等是芎芷地龙汤中的主要活性成分;TNF、MAPK1、AKT1等基因可能在治疗偏头痛时参与调控;芎芷地龙汤主要通过调节氧化应激反应、低氧反应、炎性因子释放、神经递质传递、血管张力等机制治疗偏头痛.     

基于网络药理学分析白芍药理作用机制

目的:通过网络药理学研究白芍主要有效成分及其药理作用机制,为白芍新药研究和开发提供参考。方法:通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)收集白芍的化学成分信息,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为标准筛选活性成分,并找出活性成分对应靶点。通过UniProt数据库提取作用靶点基因,运用Cytoscape 3.6.1构建化合物-靶点网络、靶点-疾病网络图,通过蛋白相互作用(PPI)网络筛选出核心靶点,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制。结果:获得山奈酚、儿茶素、芍药苷、β-谷甾醇、苯甲酰芍药苷等18个主要活性成分及与其相关的94个靶点,关键靶点有AKT1、PTGS2、TNF、JUN、VCAM1、CASP3、ICAM1、IL-6、MAPK8、MAPK1等,GO功能富集分析表明关键基因主要参与分子功能正调节、细胞凋亡调控、程序性细胞死亡调控、细胞死亡调控、细胞增殖调控等生物过程;KEGG关键通路包括癌症通路,Toll样受体信号通路,细胞凋亡、神经活性配体-受体相互作用、NOD样受体信号通路,前列腺癌、肌萎缩侧索硬化症(ALS)、小细胞肺癌、Ⅱ型糖尿病等信号通路。结论:该研究初步揭示了白芍药效物质基础及多维药理作用机制,体现了白芍多成分-多靶点-多途径的作用特点,为白芍再开发利用提供了新思路和新方法。     

基于生物信息技术的荆防颗粒治疗冠状病毒感染疾病机制探析

目的采用网络药理学及分子对接等生物信息技术研究荆防颗粒治疗冠状病毒感染性疾病的机制。方法在TCMIP、TCMSP数据库中查询荆防颗粒药材的性味归经及成分,并通过Pub Chem、Swiss Target Prediction数据库得到成分对应的靶点信息;在Gene Cards数据库中收集冠状病毒相关靶点。成分靶点和疾病靶点交集后使用DAVID数据库对共有靶点进行富集分析。利用Cytoscape 3.7.2软件绘制"药材-成分-共有靶点"网络图,筛选荆防颗粒中的主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果共获得荆防颗粒活性成分139个,与冠状病毒共同的靶点27个,GO分析和KEGG信号通路发现,荆防颗粒治疗冠状病毒感染性疾病主要涉及癌症信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路。成功构建了"药材-成分-共有靶点"网络,分子对接结果显示该网络中的关键成分如β-谷甾醇、啤酒甾醇、异鼠李素、橙皮素、木犀草素等与关键靶点VEGFA、IL6、TNF、PPARγ、APP、ACE2及SARS-Co V-2 3CL水解酶的亲和力较好。结论荆防颗粒通过多味中药配伍发挥治疗冠状病毒感染性疾病的作用,其抗冠状病毒感染机制可能是通过β-谷甾醇、啤酒甾醇、异鼠李素、橙皮素、木犀草素等成分作用于VEGFA、IL6、TNF、PPARγ、APP等靶点,调控癌症信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路实现。     

金银花治疗登革热的网络药理学分析

目的 基于网络药理学方法探讨金银花治疗登革热的活性成分及作用机制。方法 运用TCMSP、UniProt数据库筛选金银花的活性成分及其作用靶点；通过Genecards、CTD和DisGeNET数据库检索登革热疾病相关靶点；对金银花活性成分作用靶点与登革热疾病相关靶点取交集（共同靶点），即得金银花治疗登革热的潜在作用靶点；采用Cytoscape 3.8.2软件构建金银花治疗登革热的“活性成分-作用靶点”网络；对共同靶点进行蛋白互作（PPI）网络分析、MCODE及KEGG通路富集分析。结果 共得到金银花活性成分12种，活性成分作用靶点209个，登革热疾病相关靶点3 374个，共同靶点124个。关键活性成分包括槲皮素、木犀草素、山柰酚和β-胡萝卜素等；核心靶点包括ALB、AKT1、TP53、IL6、TNF、VEGFA等；主要生物学过程包括外源性刺激引发自身免疫、氧化应激反应、细胞凋亡等；关键KEGG通路包括IL-17信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、C型凝集素受体信号通路、MAPK信号通路和Toll样受体信号通路等。结论 金银花治疗登革热具有多成分、多靶点、多通路的特点，主要...     

基于网络药理学研究清脉活血方治疗肢体动脉硬化闭塞症的作用机制

目的:运用网络药理学方法研究清脉活血方治疗ASO的作用机制。方法:在中药数据库TCMSP中筛选出清脉活血方的化学成分及对应的靶点,通过Uniprot数据库将靶点名称标准化;通过OMIM、GeneCards数据库检索ASO相关靶点,取药物靶点与疾病靶点交集靶点制作韦恩图,交集靶点即为清脉活血方作用于ASO的预测靶点;使用Cytocsape3.7.2软件构建"中药活性成分-靶点-疾病"网络图,选出关键活性成分;然后在STRING数据库中构建关键蛋白相互作用网络(Protein-proteininteraction, PPI),选出关键靶点基因;利用Rstudio对交集靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果:筛选出清脉活血方有14个有效成分和273个靶点,作用于ASO的相关靶点有152个。GO分析显示,清脉活血方治疗ASO的机制可能与G蛋白偶联胺受体活性、类固醇受体活性、肾上腺素能受体活性、蛋白酶结合、RNA聚合酶II特异性等相关;KEGG通路富集显示清脉活血方治疗ASO影响的通路主要有AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路、白介素-17信号通路、内分泌抵抗、EB病毒感染通路、雌激素信号通路、乙肝病毒、钙信号通路等通路途径。结论:清脉活血方可能是通过JUN、TNF、TP53、IL6、VEGFA、CXCL8等多靶点,通过调节AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路等多条信号通路的形式治疗ASO。     

基于系统生物学和分子对接探讨益肾固胎颗粒治疗复发性流产的作用机制

目的 基于系统生物学和分子对接探讨益肾固胎颗粒治疗复发性流产(RSA)的作用机制。方法 通过TCMSP和BATMAN-TCM数据库获取益肾固胎颗粒有效成分靶基因,以GeneCards和OMIM数据库获取与RSA相关的靶基因,进行韦恩分析,获得疾病-药物交集靶点。利用Cytoscape3.8.2软件及STRING数据库分析药物和疾病相关靶点之间的关系,分别构建D-A-T网络及PPI网络图;将数据上传DAVID数据库,进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;运用AutoDockTools 1.5.6和PyMOL软件对益肾固胎颗粒主要活性成分及关键靶基因进行分子对接。结果 包含11味中药的益肾固胎颗粒,共检索到161个有效活性成分,1 101个靶点,与RSA的交集靶点346个,涉及的核心靶点10个,主要作用于AGE-RAGE、HCMV、癌症中的蛋白聚糖、PI3K-Akt、TNF、MAPK、IL-17等20条信号通路。分子对接显示,主要有效成分与核心靶点的结合能力好。结论 通过网络药理学揭示出了益肾固胎颗粒通过“多靶点、多通路”治疗RSA的特点。     

基于网络药理学探讨消痛汤治疗痛风的作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨消痛汤治疗痛风的物质基础和作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP数据库)、SwissTarget Prediction数据库和Uniprot数据库获取并筛选消痛汤活性成分及靶点。通过Genecard数据库、OMIM数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库、DrugBank数据库收集痛风的相关基因。将所得到的消痛汤的药物靶点与痛风相关靶点进行映射,得到交集基因后,通过Cytoscape 3.8.0软件构建"成分-靶点"网络,通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。通过R 4.0.2软件对消痛汤治疗痛风的交集靶点进行基因本体论(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:获得药物-疾病交集基因146个。通过拓扑分析和CytoNCA分析筛选出槲皮素、山柰酚、木樨草素等关键活性成分15个,IL1B、IL6、TNF等12个核心基因。通过GO分类富集分析确定了2319个条目,其中涉及生物过程的2 160条,涉及细胞组分的有44条,涉及分子功能的有114条。通过KEGG通路富集分析,找到了112条信号通路。结论:消痛汤中的关键成分可能为槲皮素、山柰酚、木樨草素等活性物质,主要作用于IL1B、IL6、TNF等靶点,并推断可能通过调控IL-17信号通路、TNF信号通路、JAK-STAT信号通路等发挥治疗痛风的作用。     

基于网络药理学探讨大黄黄连药对治疗高血压病的作用机制

目的基于网络药理学探讨大黄-黄连药对治疗高血压病的作用机制。方法利用TCMSP数据库,挖掘大黄、黄连的活性成分。利用UniProt数据库校正靶点的官方基因名称。通过OMIM、TTD、Pharmgkb及Disgenet-Gene数据库得到高血压病的相关靶点,并与大黄-黄连药对作用靶点取交集,得到其治疗高血压病的有效靶点。将上述靶点输入到String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络预测,最后利用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,揭示大黄-黄连药对治疗高血压病的潜在信号通路。结果共筛选出大黄-黄连药对21个药物活性成分以及67个治疗高血压病的靶点。通过PPI网络分析,大黄-黄连药对治疗高血压病可能与IL6、VEGFA、JUN、TNF、TP53、PTGS2、IL1β、EGF、EGFR、NOS3等蛋白有关。GO和KEGG分析结果显示,大黄-黄连药对治疗高血压病的靶点显著富集于HIF-1信号通路、TNF信号通路、钙信号通路、cGMP-PKG信号等通路。结论大黄-黄连药对治疗高血压病具有多靶点、多途径、多通路的特点,HIF-1信号通路、TNF信号通路、钙信号通路是其降压作用的主要通路。