贵州苗族19个STR基因座遗传多态性研究

目的 调查19个常染色体STR基因座在贵州苗族人群中的等位基因分布,评估其在法医学中的应用价值.方法 应用GoldeneyeTM20A试剂盒对226名贵州苗族健康无关个体19个常染色体STR,用310型遗传分析仪进行毛细管电泳,GeneMapper进行基因分型.结果 得到19个常染色体STR基因座等位基因的频率分布与相关法医学参数,He值0.615 0～0.915 9,DP值0.752 1～0.982 1,PE值0.309 3～0.828 1,PIC值0.521 8～0.901 2,累计个体识别率是1-1.971 6×10-22,累计非父排除概率为0.999 999 95.结论 D19S433等19个常染色体STR基因座在贵州苗族人群中具有良好的遗传多态性,对民族群体遗传学和法医物证学研究极其有价值.     

福建汉族人群9个STR基因座遗传多态性

目的调查福建汉族人群9个短串联重复序列（short tandem repeat,STR）基因座遗传多态性分布和群体遗传学数据。方法应用毛细管电泳技术和四色荧光复合扩增的方法 ,检测309名汉族无关个体的9个STR基因座基因型。结果 9个STR基因座的基因频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡,所检测的9个STR遗传标记均具有高度多态性,杂合度（He）在0.828～0.887,个体识别力（PD）在0.923～0.971,非父排除率（PE）在0.653～0.768,多态信息量（PIC）在0.77～0.87。9个STR基因座的累积个体识别力和非父排除率分别达至0.9999999999996和0.9999912377402。结论 9个STR位点均有较高的遗传多态性,并有丰富的信息含量,适合作为福建汉族群体的遗传标记,可用于个体识别和亲权鉴定。     

江苏汉族群体15个STR基因座遗传多态性分析

目的分析15个短串联重复序列(STR)基因座在江苏汉族群体中的基因多态性和基因频率。方法取2010年-2011年来自江苏省的1000例无血缘关系的汉族个体。用Sinofiler 16荧光标记复合扩增系统15个STR位点进行扩增,自动基因分析仪片段分析并进行基因分型。结果累积STR等位基因共发现211个,其中罕见等位基因36个。基因型频率超过0.1的基因座型22个,其中D3S1358基因座的15/16等位基因型频率最高达到0.2225。杂合度达到了0.802±0.051,随机个体相同表型偶合率值为0.068±0.031,多态信息总量值为0.778±0.060,个体识别能力和非父排除率值分别为0.932±0.032和0.607±0.091。FGA、D12S391基因座在发生24次突变的11个基因座中有较高的突变率。结论通过大量的样本实验和等位基因频率总结,得到了江苏人群更多法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性的客观数据。     

福建汉族人群6个Y染色体STR基因座遗传多态性研究

目的对福建汉族人群中DYS393、DYS19、DYA389Ⅱ、DY$390、DYS391、DYS385等6个Y-STR基因座的等位基因及单倍型的分布进行调查。方法采用多重PCR和四色荧光自动化检测技术对212例无血缘关系的福建汉族个体6个Y-STR基因座进行检测。结果DYS393、DYS19、DYA389Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS385基因座分别有6、5、6、4、4、38个等位基因或等位基因组，基因多样性（GD）分别为0．6131、0．6913、0．7381、0．6459、0．3829、0．9570，共发现153种单倍型，单倍型多样性（HD）为0．9921。结论6个Y-STR基因座在福建省汉族人群中均具有较高的遗传多态性，可应用于法医学个体识别和亲子鉴定。     

河南汉族6个STR基因座的遗传多态性研究

目的 对河南汉族人群6个STR基因座的等位基因频率进行研究并获得群体遗传学数据.方法 对121名无血缘关系河南汉族个体的EDTA抗凝血样用酚-氯仿法提取DNA,应用多重PCR扩增技术结合聚丙烯酰胺凝胶电泳对D2S1338、D4S2639、D7S3048、D8S1132、D14S306、D18S535共6个基因座在河南地区汉族人群中的基因型分布进行分析.结果 6个STR基因座的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡,各基因座的观察杂合度分别为0.843、0.842、0.857、0.900、0.824、0.826.结论 6个基因座在河南汉族群体中具有较高的非父排除率和个体识别率,在法医学和群体遗传学研究中有一定的应用价值.     

山西省高平地区汉族人群19个短串联重复系列基因座遗传多态性调查

目的:调查19个短串联重复系列(STR)基因座在山西省高平市汉族人群中的遗传多态性,并对其法医学应用进行评价。方法:采用Goldeneye20A STR荧光标记复合扩增试剂盒,对山西省高平市汉族210份无关个体进行扩增,利用3130XL遗传分析仪对扩增产物进行电泳分型,统计D19S433等19个STR基因座的等位基因频率和法医遗传学数据。结果:获得19个STR基因座的等位基因频率分布,分别检出10,9,15,13,13,6,8,7,7,7,10,8,9,5,17,6,11,13,17个等位基因,并分别获得19个STR基因座的杂合度观察值(Ho)、杂合度期望值(He)、个人设别能力(DP)、偶合率(PM)、非父排除率(PE)及多态信息总量(PIC)等法医遗传学参数,累积个人识别率和累积非父排除率分别为1~1.49×10-22和0.999 999 993。结论:Goldeneye20A STR荧光标记复合扩增体系的19个STR基因座在山西省高平市汉族人群中具有较高的个体识别能力和遗传多态性,对于法医学个体识别和亲子鉴定具有重要的应用价值。     

山西陵川地区汉族人群19个STR基因座遗传多态性调查及法医学应用

目的:通过对山西省陵川县汉族人群19个STR基因座的遗传多态性进行调查,为本地区人群的同一认定和亲权鉴定活动提供计算基础。方法:STR复合扩增选取Goldeneye 20A系统,扩增对象为随机选取的山西省陵川县汉族201份无关个体血样,扩增产物的电泳使用3130XL遗传分析仪,并利用Genemapper3.2软件分析电泳结果。统计201份无关个体血样19个STR基因座的法医遗传学参数。结果:19个STR基因座分别检出12、8、14、17、13、6、7、7、7、8、10、7、9、6、18、6、12、12、18个等位基因,计算出19个STR基因座的基因频率、杂合度期望值(He)、杂合度观察值(Ho)、个人识别能力(DP)、偶合率(PM)、非父排除率(PE)、多态信息总量(PIC)等法医遗传学参数,并得到Goldeneye 20A系统效能数据:累积个人识别率为1~8.11×10~(-23),累积非父排除率为0.999 999 988。结论:在山西陵川地区汉族人群中,Goldeneye 20A复合扩增系统19个STR基因座的识别能力和遗传多态性较高,为山西陵川地区区域性法医学个体识别和亲权鉴定提供强有力的基础数据支撑。     

福建畲族人群15个短串联重复序列的遗传多态性及法医学应用

目的对福建畲族群体15个短串联重复序列等位基因遗传多态性进行分析,探讨其种族特异性及其在法医学个体识别和亲权鉴定的中的应用。方法荧光标记15个短串联重复序列(STR)位点和一个性别位点并进行PCR复合扩增,用ABI遗传分析仪以毛细管电泳技术对100例福建畲族无血缘关系健康个体PCR产物进行电泳分离基因,并以分析软件进行基因分型。结果共检出126个等位基因,基因频率范围在0.0050～0.5550。15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。15个STR位点的HET在0.6300～0.8900之间,DP在0.7680～0.9590之间,EPP在0.3280～0.7750之间,PIC在0.5200～0.8600之间。累积DP和EPP分别达到0.99999999和0.99999288。结论15个STR位点均有较高的遗传多态性,并有丰富的信息含量,适合作为福建畲族地区的遗传标记,可用于个体识别和亲权鉴定。     

D3S1358 vWA D8S1179在汉族群体遗传多态性分析

目的研究D3S1358，vwA和D8S1179三个短串联重复序列（STR）基因座的等位基因频率在广东汉族群体内的分布，为这三个基因座的应用提供基础数据。方法用Chelex100法提取抗凝血的DNA，用PowerPlex 16系统扩增样品DNA，扩增产物经ABIPRISM 377DNA Sequencer电泳后，用genscan3、1和genotyper 2．1软件确定各等位基因。统计各等位基因频率，用X2方法检验遗传平衡吻合度。计算杂合度（H）、多态信息含量（PIC）、个人识别概率（DP）及亲权否定概率（PPE）。结果得到3个基因座各等位基因及其频率，分布符合遗传平衡定律，具有高的杂合度和多态信息含量。结论3个基因座具有较高的杂合度，是较理想的遗传标记，可用于法医学个人识别和亲权鉴定以及人类遗传学研究。     

福州地区汉族群体15个STR基因座遗传多态性研究

目的调查福建福州地区汉族群体遗传15个STR基因座多态性参数,同时评估AmpFlmSTR IdentifilerTM体系应用于该地区汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值。方法应用AmpFlmSTR IdentifilerTM体系荧光标记复合扩增系统检测350名福建福州地区汉族无关个体15个STR基因座的多态性,统计计算群体遗传学参数。结果 15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05),发现4个稀有等位基因。15个STR遗传标记均具有高度多态性,杂合度0.12~0.405,匹配概率0.032~0.225,个体识别力0.775~0.968,多态性信息含量0.55~0.86,非父排除率0.285~0.761。结论 15个STR基因座在福建福州地区有较高的多态性。通过这份样本实验和等位基因频率总结,得到了福建福州人群更多法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性的客观数据。     

福建汉族人群STR位点遗传多态性分析及其在亲子鉴定中的应用

目的调查福建汉族人群的D5S818、FGA、D3S1358、THOI、D13S317、D16S539、D2S1338、D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D19S433、vWA、TPOX、D18S51共15个STR位点多态性，探讨STR基因分析在亲子鉴定中的应用价值。方法应用PCR复合扩增和五色荧光Genescan技术对210个福建汉族个体和89例亲子鉴定案件的15个STR位点作基因分型。结果福建汉族人群15个STR位点的等位基因频率、基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。D5S818、FGA、D13S317、D16S539、D2S1338、D8S1179、D21S11、D7S820、D19S433、vWA、D18S51位点属于高鉴别力、高杂合度、高信息含量的STR位点。15个STR位点的累积个体识别能力(DP)、非父排除率(PE)均为0．9999以上。89例亲子鉴定案例中，否定亲权的25个案例中均至少有3个位点不符；认定亲权的64例子中，亲子关系指数(RCP)大于99．73％。结论获得了福建汉族人群中15个STR位点的遗传多态性数据。应用这15个STR位点的等位基因分析，能成功进行亲子鉴定，显著提高亲子关系指数。     

天津汉族女性人群HPRTB、DXS6803、DXS6809STR基因座遗传多态性研究

目的研究天津汉族女性人群HPRTB、DXS6803和DXS6809 STR基因座的遗传多态性,为快速产前诊断X染色体数目异常提供实验依据。方法收集150例无亲缘关系天津汉族女性外周血样本,应用QF-PCR扩增HPRTB、DXS6803和DXS6809 STR基因座、毛细管电泳检测扩增产物、ABI Prism Gene Mapper v3.0软件分析数据,从每个基因座中挑选2个纯合子进行测序、命名。采用χ2检验验证3个STR基因座基因型分布是否符合Hardy-Wein-berg平衡定律。用Power Stats V12软件分析STR基因座的群体遗传学数据。结果 150例样本均在24 h内扩增成功。HPRTB、DXS6803和DXS6809 STR基因座分别检出10、6、10个等位基因和22、12、29种基因型,其最常见等位基因分别是14、13、14,出现频率最高的基因型分别是14-14、12-13和13-14。基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(χ2分别为10.554、5.783和15.355,均P>0.05)。3个基因座的He分别为0.748、0.649、0.806,Ho分别为0.607、0.700、0.713,PIC分别为0.706、0.599、0.775,PD分别为0.894、0.814、0.931,PE分别为0.299、0.428、0.449。结论HPRTB、DXS6803和DXS6809 STR基因座在天津汉族女性人群具有高杂合度、高遗传信息量,是X染色体良好的遗传标记,可用于X染色体数目异常的快速产前诊断。     

短串联重复序列VWA在太原汉族人群的法医应用研究

目的　获得短串联重复序列 VWA(nt16 40 - 1794)在太原汉族人群的群体遗传学数据 ,探讨其在法医学中的应用。方法　用 TKM法对 2 14名太原地区无关汉族人群抽提血液 DNA。扩增特异性片段 ,含 7m ol/ L 尿素的聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳 ,银染显色分析其多态性。结果　该位点频率分布符合 H- W平衡定律。共检出 8个等位基因 ,长度在 134 - 16 2 bp之间 ,频率分布 ,VWA* 13- 0 .0 0 7;VWA* 14- 0 .194;VWA* 15 - 0 .0 2 8;VWA* 16 -0 .173;VWA * 17- 0 .2 78;VWA * 18- 0 .140 ;VWA * 19- 0 .10 3;VWA * 2 0 - 0 .0 14。个体识别率 :0 .932 ,杂合度0 .82 1,多态信息含量 0 .814,非父排除率 0 .6 0 3。本文调查的频率同大部分欧洲人及美国黑人分布差异有显著性。同其他中国人差异无显著性。结论　 VWA基因座在太原汉族人群中有较高的杂合度、个体识别率及非父排除率 ,是高识别能力遗传标记 ,在法医学和群体遗传学有很高的应用价值。     

瑞格列奈药代动力学特征及有关基因多态性对其药代和药物相互作用的影响

瑞格列奈是一种具有氨基酸结构的非磺脲类促胰岛素分泌的口服降糖药,降血糖作用快而短,模拟胰岛素生理性分泌,主要用于控制高血糖,同时减少低血糖的发生。本文将对瑞格列奈的药代动力学特征、基因组学研究进展、药物相互作用作一综述。以期为指导瑞格列奈的临床用药打下坚实的理论基础,确保临床用药的安全性和有效性,真正实现临床上的个体化给药。     

Points-to-consider documents: Scientific information on the evaluation of genetic polymorphisms during non-clinical studies and phase I clinical trials in the Japanese population

Pharmacotherapy shows striking individual differences in pharmacokinetics and pharmacodynamics, involving drug efficacy and adverse reactions. Recent genetic research has revealed that genetic polymorphisms are important intrinsic factors for these inter-individual differences. This pharmacogenomic information could help develop safer and more effective precision pharmacotherapies and thus, regulatory guidance/guidelines were developed in this area, especially in the EU and US. The Project for the Promotion of Progressive Medicine, Medical Devices, and Regenerative Medicine by the Ministry of Health, Labour and Welfare, performed by Tohoku University, reported scientific information on the evaluation of genetic polymorphisms, mainly on drug metabolizing enzymes and transporters, during non-clinical studies and phase I clinical trials in Japanese subjects/patients. We anticipate that this paper will be helpful in drug development for the regulatory usage of pharmacogenomic information, most notably pharmacokinetics.     

Urinary arsenic metabolism in a Western Chinese population exposed to high-dose inorganic arsenic in drinking water: Influence of ethnicity and genetic polymorphisms

To investigate the differences in urinary arsenic metabolism patterns of individuals exposed to a high concentration of inorganic arsenic (iAs) in drinking water, an epidemiological investigation was conducted with 155 individuals living in a village where the arsenic concentration in the drinking water was 969 μg/L. Blood and urine samples were collected from 66 individuals including 51 cases with skin lesions and 15 controls without skin lesions. The results showed that monomethylated arsenic (MMA), the percentage of MMA (%MMA) and the ratio of MMA to iAs (MMA/iAs) were significantly increased in patients with skin lesions as compared to controls, while dimethylated arsenic (DMA), the percentage of DMA (%DMA) and the ratio of DMA to MMA (DMA/MMA) were significantly reduced. The percent DMA of individuals with the Ala/Asp genotype of glutathione S-transferase omega 1 (GSTO1) was significantly lower than those with Ala/Ala. The percent MMA of individuals with the A2B/A2B genotype of arsenic (+ 3 oxidation state) methyltransferase (AS3MT) was significantly lower than those with AB/A2B. The iAs and total arsenic (tAs) content in the urine of a Tibetan population were significantly higher than that of Han and Hui ethnicities, whereas MMA/iAs was significantly lower than that of Han and Hui ethnicities. Our results showed that when exposed to the same arsenic environment, different individuals exhibited different urinary arsenic metabolism patterns. Gender and ethnicity affect these differences and above polymorphisms may be effectors too.