ARID1A对乳腺癌生长的抑制及潜在调控机制

 目的  探讨ARID1A (AT-rich interactive domain containing protein 1A)对乳腺癌发生、发展的影响,包括对细胞增殖、细胞周期、细胞凋亡的影响及潜在的机制。  方法  采用小发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)及小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)的RNA干扰技术(RNA interference,RNAi)下调细胞ARID1A基因表达,采用瞬时表达及稳定表达方法过表达ARID1A;通过Western blot检测干扰或过表达ARID1A基因后其蛋白表达水平及P-Akt、PARP和Caspase-3蛋白水平的变化,应用MTT法、细胞计数法及克隆形成检测细胞增殖的变化;应用流式细胞仪检测细胞凋亡及细胞周期的变化。  结果  应用RNA干扰技术沉默ARID1A基因后,乳腺癌细胞或正常乳腺细胞增殖速度显著上升(Bcap-37-siARID1A,P<0.001;MCF7-siARID1A,P<0.01;MCF10A-shARID1A,P<0.001;HMEC-shARID1A,P<0.001),Akt磷酸化水平上升,克隆形成能力显著提高。过表达ARID1A后,细胞增殖速率均显著下降(P<0.001),Akt磷酸化水平下降,细胞周期发生变化,其中S期减少,G2期增多,同时细胞凋亡比例上升。  结论  ARID1A在乳腺癌中发挥着抑制肿瘤生长的作用,提示ARID1A可能成为临床检测、诊断和治疗的有效潜在靶标。     

染色质重塑基因ARID1A在妇科肿瘤中的研究进展

<正>在真核细胞中,遗传信息储存于染色质,这是一种由DNA、组蛋白及非组蛋白通过高度浓缩机制而形成的复杂结构,但在DNA复制、修复、重组及转录等过程中需动态变化以促使相关因子与DNA结合,这种作用称为染色质重塑。而染色质重塑包括DNA复制、转录、修复、甲基化和重组,对于细胞核活动至关重要,染色质重塑复合物的分子基因型改变是癌症发病的一个新机制。其中染色质重塑基因ARID1A在多种人类癌     

ARID1A表达与肝内胆管癌免疫细胞浸润及预后的相互关系研究

目的：探讨ARID1A基因的表达与肝内胆管癌免疫细胞浸润的关系及预后分析。方法：纳入2011年1月—2017年12月天津医科大学肿瘤医院接受手术治疗的136例肝内胆管癌患者,收集患者的临床资料和病理组织标本,构建组织微阵列芯片,采用免疫组织化学染色方法检测ARID1A表达和不同类型的免疫细胞浸润程度。分析ARID1A基因的预后价值、临床特征和免疫细胞浸润的关系。通过在线数据库评估ARID1A拷贝数与多种肿瘤免疫细胞浸润关系。结果：136例肝内胆管癌患者中ARID1A在108例(79.4%)中表达,而在28例(20.6%)中表达缺失。与癌旁组织相比,CD4+、CD8+T淋巴细胞和CD163+巨噬细胞在肿瘤组织中浸润明显减少(t=6.962、7.364、7.905,均P<0.000 1),而CD66b+中性粒细胞在肿瘤组织浸润明显增加(t=4.093,P<0.000 1)。在ARID1A表达缺失组和ARID1A表达组中CD163+巨噬细胞的浸润水平与生存呈负相关(log-rankχ²=5.399、6.376,P=0.02、0.012)。ARID1A的表达与...     

ARID1A下调促进甲状腺癌细胞增殖和凋亡的作用机制

目的 ARID1A是SWI/SNF染色质复合体的关键成员,该基因已成为人类各种癌症的肿瘤抑制基因。分析了ARID1A在甲状腺癌中的表达情况和临床意义。方法 利用免疫组化技术对甲状腺癌患者组织与癌旁组织进行检测,并结合聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)技术了解ARID1A基因在甲状腺癌中的mRNA表达情况。此外,本研究还通过蛋白质印迹技术、MTT增殖试验、集落形成试验以及细胞凋亡检测技术探究ARID1A在甲状腺癌发生、发展中对肿瘤细胞增殖和凋亡影响的作用机制。结果 与正常腺上皮比较,甲状腺癌组织中ARID1A表达降低,并且与淋巴结转移、TNM分期和分化差具有显著的相关性,并且ARID1A在甲状腺癌细胞系中的表达低于正常腺上皮TEC细胞系。本研究还进一步探讨了ARID1A在甲状腺癌细胞系生物学行为中的作用,FTC133和BCPAP细胞系中转染小干扰RNA(siRNA)的ARID1A缺失促进增殖、集落形成能力,并抑制细胞凋亡。结论 ARID1A可能是甲状腺癌中的重要肿瘤抑制因子,该基因的下调能够促进甲状腺癌细胞增殖,抑制细胞凋亡。     

AT丰富结合域1A基因在恶性肿瘤中的作用

AT丰富结合域1A(ARID1A)基因是染色质重塑复合物SWI/SNF的重要亚基,是一种抑癌基因,在多种肿瘤中存在突变或缺失,其突变或缺失可能与恶性肿瘤的增殖、侵袭、转移、高分期、不良预后等有关。对ARIDIA抑癌作用机制深入研究,能进一步了解癌症发生发展机制,有望为癌症患者提供治疗靶点。本文对近年来ARID1A在恶性肿瘤中的表达、功能调节及其在肿瘤中的作用做一综述。     

Coffin-Siris综合征携带ARID1B基因变异1例并文献复习

本文报道了1例喂养困难、体质量增长不良、特殊面容、第五趾末关节缺如的6月龄女婴,基因检测显示ARID1B基因c.1818 C>A(p.Cys606 2228*)变异,诊断为Coffin-Siris综合征,复习相关文献,以提高医生对该病的认识,避免漏诊。     

ARID1A通过阻断Wnt/β-catenin通路抑制滋养层细胞增殖、迁移和侵袭

目的 探讨富含AT的相互作用结构域蛋白1A(AT-rich interactive domain 1A,ARID1A)对子痫前期(preeclampsia, PE)滋养层细胞增殖、侵袭及迁移能力的影响及潜在分子机制。方法 采用RT-qPCR及Western blot测定30例PE患者及30例正常妊娠者胎盘组织中ARID1A表达情况。以人绒毛滋养层细胞HTR-8/SVneo为研究对象,实验分组为：control组(无处理)、NC组(转染空载体)、ARID1A组(转染ARID1A过表达载体)、ARID1A+氯化锂(LiCl)组(转染ARID1A过表达载体后再用50 mmol/L的LiCl处理)。采用MTT法检测细胞增殖,采用Transwell实验检测细胞侵袭能力和迁移能力,采用RT-qPCR及Western blot法检测胎盘组织中ARID1A的mRNA和蛋白表达水平,采用Western blot法检测HTR-8/SVneo细胞中ARID1A、MMP-2、MMP-9、Wnt1、β-catenin和Cyclin D1的蛋白表达水平。结果 PE患者胎盘组织中ARID1A的表达水平显著高于正常胎...     

新基因FAM92A1的生物信息学分析及功能预测

目的:运用生物信息学方法对新基因FAM92A1功能进行预测分析,为进一步深入研究FAM92A1功能奠定基础。方法:利用多种生物信息学分析软件,分析FAM92A1基因的表达谱、保守性及其编码蛋白的结构和定位等特征,根据结构预测其功能。结果:该基因表达广泛,高度保守,有多个选择性剪接变异体。编码蛋白属于DUF1208保守结构域家族,与猩猩、小鼠、大鼠、鸟、非洲爪蟾、斑马鱼和果蝇的相似性分别为91%、84%、82%、74%、67%、65%、26%。它含有一个卷曲螺旋结构和多个磷酸化位点,无信号肽及跨膜结构。亚细胞定位预测其定位于细胞核。结论:利用生物信息学方法可初步预测FAM92A1为一细胞核内具有调节作用的蛋白质,其在细胞增殖和分化的精确调控方面可能起着重要作用。     

我国科学家发现肝癌易感基因区域

据了解，我国科学家发现了容易导致肝癌的易感基因区域。这一发现有助于解析肝癌的发病机制，而且为肝癌的风险预测，早期预防和个体化治疗以及新型高效药物的筛选提供了理论依据和生物靶标。     

CYP1A1基因3'-UTR6235T-C位点多态性与维医分型乳腺癌遗传易感性的关系

目的 探讨细胞色素氧化酶p450(CYP)1A1基因3'-UTR(3'-非编码区)6235T-C位点多态性与新疆维吾尔自治区汉族人群异常体液型乳腺癌的相关性.方法 按维吾尔医学将乳腺癌患者分为4种体液型,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分子生物学技术对新疆汉族137例乳腺癌患者和148名健康对照组CYP1A1基因3'-UTR6235T-C位点多态性进行检测,比较各组间等位基因和基因型频率分布的差异.结果 (1)CYP1A1基因3'-UTR6235T-C位点3种基因型和两种等位基因分布频率在异常胆液质型乳腺癌患者组和健康对照组间比较差异有统计学意义(x2=8.790,P=0.012;x2=7.102,P=0.008),其中CC基因型和C等位基因在异常胆液质型乳腺癌患者组的分布频率(16.4%和39.8%)显著高于健康对照组(4.7%和25.7%).(2)CYP1A1基因3'-UTR6235T-C位点3种基因型和两种等位基因分布频率在异常黑胆质型乳腺癌患者组和健康对照组比较差异有统计学意义(x2=6.638,P=0.036;x2=5.824,P=0.016),其中TC、CC基因型和C等位基因在异常黑胆质型乳腺癌患者组的分布频率(56.9%,9.8%和39.2%)显著高于健康对照组(41.9%,4.7%和25.7%).结论 CYP1A1基因3'-UTR6235T-C位点CC基因型和C等位基因可能与新疆汉族维吾尔医异常胆液质型和异常黑胆质型乳腺癌的发病有关,可能与异常黏液质型乳腺癌易感性无关.

Abstract：

Objective To explore the association between polymorphism of cytochrome P450 1 Al Gene 3'-UTR (3'-untranslated region ) 6235T-C and breast cancer with abnormal Hilit in Chinese Han population of Xinjiang. Methods The breast cancer patients were divided into four body fluids according to Uighur medical theories. And the technique of polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) was employed to detect the genotypic and allelic frequencies of 6235T-C polymorphism situated in 3'-untranslated region of CYP1A1 gene in 137 breast cancer patients with abnormal Hilit and 148 normal control subjects in Han population of Xinjiang province. Results ( 1 ) Significant differences in the genotypic and allelic distribution frequencies of CYP1A1 gene 3'-UTR6235T-C were found between breast cancer patients with abnormal Sapra Hilit and controls ( x2 = 8. 790, P = 0. 012;x2 = 7. 102,P = 0. 008 ). The frequencies of CC genotype and C allele were significantly higher in breast cancer patients with abnormal Sapra Hilit ( 16. 4% vs 39. 8% ) than in controls ( 4. 7% vs 25. 7% ). ( 2 ) Significant differences in the genotypes and allelic distribution frequencies of CYP1A1 gene 3'-UTR6235T-C were found between breast cancer patients with abnormal Savda Hilit and controls ( x2 = 6. 638, P = 0. 036;x2 =5. 824, P =0. 016). And the frequencies of TC, CC genotypes and C allele were significantly higher in breast cancer patients with abnormal Savda Hilit ( 56. 9%, 9. 8%, 39. 2% ) than those of the controls (41.9%, 4.7%, 25.7%). Conclusion The CC genotype and C allele of 6235T-C polymorphism of CYP1Al may be linked with breast cancer with abnormal Sapra Hilit and abnormal savda Hilit in Chinese Hah population of Xinjiang province. But they are not correlated with the susceptibility to breast cancer with abnormal Balgham Hilit.     

细胞色素P4501A1基因多态性与胃癌易感性的研究

[目的]探讨大连地区人群细胞色素P4501A1(CYP1A1)基因MspI多态性与胃癌易感性的关系.[方法]应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术分别对60例胃癌患者(胃癌组)和57例正常的CYP1A1基因3'端限制性内切酶MspI多态性进行检测,分别计算胃癌组和对照组的3种基因型(A型-m1m1,B型-m1m2,C型-m2m2)频率,并进行统计学分析.[结果]在胃癌组中A基因型频率为43.3%,B基因型45.0%,C基因型11.7%;而对照组3种基因型频率分别为45.6%、49.1%和5.3%,统计学χ2检验结果显示两组间各基因型频率无显著性差异(χ2=1.53,0.25相似文献   

细胞色素P4501A1基因多态与肾癌遗传易感性的关系

目的:探讨细胞色素P4501A1(CYP1A1)酶的基因多态与肾癌易感性的关系.方法:采用病例对照设计,以175名肾癌患者为病例组,200名未患任何肿瘤的健康人为对照组.应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,检测CYP1A1基因A4889G(M2)、C4887A(M4)的多态性.结果:病例组M2、M4各基因型分布与对照组相比无统计学差异.携带M2/M2基因型者与肾癌的发生呈正相关(OR=2.225,95%CI:1.134～4.365,P=0.020).结论:CYP1A1基因M2/M2基因型可能是肾癌的遗传危险因素.     

抑癌基因RASSF1A在胃癌中的表达及意义

目的研究胃癌组织中抑癌基因RASSF1A的表达并探讨其临床意义。方法应用免疫组化法分别检测39例胃癌组织标本和18例正常对照胃组织标本RASSF1A蛋白表达;RT-PCR法检测4株胃癌细胞株、正常胃黏膜细胞株GES-1以及阳性对照Hela细胞中RASSF1A mRNA的表达;结合病理学特征进行分析。结果胃癌组织RASSF1A表达阳性细胞明显少于正常对照胃组织(P<0.01);不同分化程度、临床分期及浸润深度的胃癌组织,其RASSF1A表达存在显著性差异(P<0.05)。4株胃癌细胞株中仅MKN45细胞有RASSF1A mRNA表达;而正常胃黏膜细胞株GES-1和阳性对照Hela细胞均表达RASSF1A mRNA。结论胃癌组织中RASSF1A基因表达明显减少,其可作为评估胃癌恶性程度和预后的一项有意义的指标。     

肺癌患者CYP1A1和GSTM1基因多态性检测

目的:探讨CYP1A1与GSTM1基因多态与支气管肺癌癌变的关系.方法:采用回顾性"病例-对照"方法和PCR-RFLP技术,对98例肺癌患者和136名体检健康者(对照组)进行CYP1A1与GSTM1基因多态性检测.结果:对照组和肺癌组CYP1A1 m1、GSTM1缺陷型等位基因频率分别为28%和43%、44%和61%,2组比较,差异有统计学意义(P＜0.05).CYP1A1(w1/m1、CYP1A1(m1/m1、GSTM1(缺陷型)基因型患肺癌的危险度分别升高3.18倍、2.72倍和2.16倍(P均＜0.05).GSTM1(缺陷型)和CYP1A1(w1/m1或CYP1A1(m1/m1基因型携带者患肺癌的危险度为5.62倍(P＜0.01.吸烟使GSTM1缺陷型携带者和CYP1A1 m1携带者肺癌的患病危险度较单一基因作用危险度显著增加(P＜0.05).结论:CYP1A1 m1和GSTM1缺陷型基因均是肺癌的危险因素,2者存在交互作用,且均与吸烟有协同作用.     

尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A7基因多态性与膀胱癌易感性的关系

目的 探讨尿苷二磷酸匍萄糖醛酸转移酶1A7(UGT1A7)基因多态性与膀胱癌易感性的关系.方法 以病例对照研究方法,应用半巢式PCR(SN-PCR)和等位基因特异性PCR(AS-PCR)分别检测208例膀胱癌患者和205例非肿瘤患者的UGT1A7基因多态性,对各基因型和等位基因单独或联合吸烟行为进行统计学分析.结果 膀胱癌组变异纯合基因型[~*x/~*x(x=~*2,~*3,~*4)]的频率(20.7%)高于对照组(12.2%),差异有统计学意义[P<0.05,OR=2.16(1.18～3.96)].膀胱癌组携带变异等位基因~*3的频率(27.9%)高于对照组(20.5%),差异有统计学意义[P=0.009,OR=1.56(95%CI:1.12～2.18)].吸烟人群中,变异杂合基因型[~*1/~*x(x=~*2,~*3,~*4)]或变异纯合基因型者与野生型者相比,膀胱癌组和对照组间差异有统计学意义,OR(95%CI)值分别为2.16(1.07～4.36)、2.64(1.02～6.80).UGT1A7基因多态性与膀胱癌病理分级和临床分期均无相关性(均P>0.05).结论 UGT1A7基因多态性与膀胱癌易感性有关,该基因多态性与吸烟行为在膀胱癌的发生中存在交互作用.     

一个肌萎缩侧索硬化症家系突变的SOD1基因的生物信息学研究

目的利用生物信息学理论和方法对新突变基因Cu/Zn超氧化物歧化酶(SOD1)的基因序列和蛋白序列进行分析,预测和分析突变SOD1功能以及探讨生物信息学在新突变基因研究中的作用。方法以人类基因组数据库为基础,利用BLAST程序对SOD1的基因结构进行分析和序列相似性搜索;进行基因的染色体定位和基因组织结构分析;DNAstar软件进行ORFfinder和编码蛋白进行序列预测和功能分析。结果通过分析得出,突变SOD1定位于染色体21q,其开放阅读框为108bp,编码36个氨基酸,编码氨基酸具有保守性,与人的SOD1具有很高的同源性,为一胞内蛋白,突变后蛋白质的二级结构发生改变。结论突变SOD1可能是新的SOD1成员,可能突变的SOD1酶的活性以及信号通路发生改变从而影响神经细胞的生物功能,生物信息学为新基因的功能研究提供了很好的方法。