SELDI-TOF-MS筛查乳腺癌患者血清特异性蛋白的探讨

目的：应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白.方法：应用弱阳离子蛋白质芯片（WCX2）及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量.结果：三组样本质荷比在2000～30000 Da间3939.314Da与3960.478Da的2个蛋白峰有显著差异.结论：SELDI-TOF-MS技术对乳腺癌早期诊断和特异性肿瘤标记物的筛选等方面具有一定价值,值得推广.     

表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱技术对卵巢不同病变组织差异蛋白质的检测

 目的　检测正常卵巢组织及良性、交界性和恶性卵巢肿瘤组织蛋白的指纹图谱,寻找差异表达蛋白质。方法　取卵巢不同病变组织,提取蛋白质,采用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱仪对其进行蛋白质指纹图谱检测并进行初步分析。结果　良、恶性卵巢肿瘤蛋白指纹图谱比较,癌组织中一些蛋白质高表达,如质荷比（M／Z）为15 112.15、15 296.79、7560.78、16 049.39、7682.06、7932.30、15 851.32、4619.68和 8052.10的蛋白质。交界性卵巢肿瘤蛋白指纹图谱介于良、恶性图谱之间,如M／Z为15 112.15、15 851.32、7560.78、7682.06和 7932.30的蛋白质。结论　卵巢不同病变组织的蛋白指纹图谱中具有差异蛋白质,其有可能为卵巢肿瘤的临床诊断和治疗奠定分子基础。     

蛋白芯片表面增强激光解吸电离-飞行时间-质谱技术在肿瘤早期诊断中的

 蛋白质芯片表面增强激光解吸电离-飞行时间-质谱（surface enhanced laser desorp-tion/ionization time of flight mass spectrometry, SELDI-TOF-MS）技术是近年发展起来的蛋白质组学研究的新技术，在各种肿瘤的早期诊断和研究中，具有广阔的发展前景及临床意义。就其技术原理、组成、在肿瘤早期诊断中的运用及发展前景作一综述。     

表面增强激光解吸电离飞行时间质谱蛋白质芯片筛查肺癌血清相关蛋白质及其临床意义

目的 探讨用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）筛查肺癌血清特异性蛋白质的临床意义.方法 应用CM-10蛋白质芯片对肺鳞状细胞癌38例,肺腺癌30例,健康对照组50例的血清样品进行蛋白质指纹图谱测定,其中34例肺癌患者进行术前和术后对比检测,用BioMarker Wizard及BioMarker pattern system分析软件对所得的数据进行处理并建立诊断模型.结果 共检测到167个蛋白质峰,筛选出2个肺癌特异蛋白质峰[质荷比（M/Z）分别为6 010、5 330]建立了诊断模型.模型的原始判别敏感度为100％,特异度为100％.交叉验证敏感度为98％,特异度为96％.肺癌术前和术后有9个差异蛋白质（P＜0.05）,转移和无转移肺癌患者血清有8个差异蛋白质（P＜0.05）.结论 SELDI技术在肺癌的诊断中具有较高的敏感性和特异性,可能成为一种有效的筛查手段.     

应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术筛选乳腺癌相关蛋白标志物

目的 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选乳腺癌的特异性蛋白标志物.方法 用SELDI-TOF-MS仪及CM10蛋白芯片检测110例乳腺癌患者治疗前及100名健康对照的血清蛋白指纹图谱,应用软件自动采集数据、筛选差异表达蛋白,对表达有差异蛋白的诊断效率进行统计分析,采用多变量的Logistic回归模型校正混杂因素.结果 乳腺癌组与健康对照组相比,共有49个蛋白峰的强度差异有统计学意义(P＜0.05).结合以前的文献,筛选出6个蛋白标志物,质荷比(M/Z)分别为3264、3968、4376、8124、8924和9180,组建成乳腺癌诊断模型,其中表达下调的蛋白M/Z有4376、8126和8924,表达上调的有3264、3968和9180.M/Z为3264、3968、4376、8126、8924的蛋白诊断乳腺癌的ROC曲线下面积分别为0.936、0.933、0.727、0.976和0.751,可作为诊断乳腺癌的标志物.M/Z为9180的蛋白与乳腺癌的TNM分期和Her-2的表达相关(P＜0.05),M/Z为8926的蛋白峰与乳腺癌淋巴结转移有一定的关系(P＜0.05).结论 SELDI蛋白质谱技术可能有效地区分乳腺癌患者和健康人,筛选出的蛋白对乳腺癌诊断的灵敏度和特异度较高.SELDI在乳腺癌的诊断及乳腺癌特异性分子生物标志物的筛选方面具有一定的应用价值.     

应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱技术检测结直肠癌肝转移

目的 寻找与结直肠癌肝转移相关的蛋白质,建立结直肠癌肝转移的血清蛋白质指纹图谱诊断预测模型.方法 应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术,对36例结直肠癌无肝转移患者和36例结直肠癌伴肝转移患者的术前空腹外周静脉血标本,进行蛋白质指纹图谱测定,运用Biomarker Wizard软件,建立结直肠癌肝转移的诊断预测模型.用44例结直肠癌患者和44例结直肠癌伴肝转移患者,对所建立的诊断预测模型进行盲法验证.结果 比较36例结直肠癌无肝转移患者和36例结直肠癌伴肝转移患者的血清蛋白质,得到10个差异蛋白峰(P<0.05),质荷比分别为2398、2814、4084、4289、4465、6422、6619、11 482、11 649和13 714.若以P<0.01为标准,则有3个蛋白质峰差异有统计学意义,质荷比分别为2398、2814和13714.建立终末节点数为9的诊断预测模型,其敏感性为91.7%,特异性为97.2%.验证结果显示,敏感性为75.0%,特异性为81.8%.结论 运用SELDI-TOF-MS技术所建立的血清蛋白指纹图谱模型,在预测结直肠癌肝转移中具有非常高的敏感性与特异性,可望成为预测诊断工具.     

运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术建立鼻咽癌特异血清多肽谱诊断模型

目的 探讨鼻咽癌患者与正常健康者血清蛋白谱的差异,建立特异的鼻咽癌血清多肽谱诊断模型.方法 收集治疗前的鼻咽癌患者和正常健康对照者的血清标本,通过特异的液体磁珠分选后,进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)分析,得到鼻咽癌患者的血清多肽谱.采用专用的生物信息学分析软件ClinProtTM进行差异分析,运用遗传算法,建立鼻咽癌的血清多肽谱诊断模型.通过盲法检验模型的灵敏度和特异度.结果 检测出鼻咽癌患者与正常健康者的差异蛋白峰有99个,选取两组间差异有统计学意义的、相对分子质量为808.99、834.61、3954.82和8141.88的蛋白峰,建立鼻咽癌诊断模型,该模型鼻咽癌的识别率为90.0%,预测能力为84.3%,盲法榆验模型的灵敏度为80.0%,特异度为64.0%.结论 鼻咽癌患者与正常对照者的血清间存在蛋白表达的差异,建立的特异的血清多肽谱诊断模型在鼻咽癌的诊断中有一定的应用前景,为寻找特异的鼻咽癌血清肿瘤标记物提供了一定的依据.

Abstract：

Objective To determine the specific serum peptide profile by comparing the serum differences between nasopharyngeal carcinoma patients (NPC) and normal control subjects, and to provide a diagnostic model of nasopharyngeal carcinoma. Methods Pre-treatment serum samples of NPC and normal control subjects were collected and assayed by MALDI-TOF MS analysis. The peptides were extracted with magnetic beads coated with WCX. Mass spectrographic data were analyzed with ClinProtTM software. The specific serum peptide model of NPC was established by using genetic algorithms. The sensitivity and specificity of model were tested by blind testing. Results The serum peptidome patterns of nasopharyngeal carcinoma was obtained. Differential expression of 99 peptide peaks was deteced, and the 808.99 Da,834.61 Da, 3954.82 Da, 8141.88 Da peptide peaks showing statistically significant differences between the two groups, were used to establish the diagnostic model for nasopharyngeal cancer. The recognition rate and predictive power of the model were 90.0% and 84.3%, respectively. The sensitivity and specificity of the model were 80. 0% and 64. 0% determined by blind testing, respectively. Conclusions Significant differences of serum peptide peaks are detected between NPC and normal control groups. The established specific serum peptide model may have certain application in the diagnosis of nasopharyngeal carcinoma, and provides the basis for discovering specific tumor markers of nasopharyngeal carcinoma.     

应用表面增强激光解吸电离-飞行时间-质谱技术筛选淋巴瘤患者血清特异性生物标志物

 目的　应用蛋白质组学表面增强激光解吸电离-飞行时间-质谱（SELDI-TOF-MS）技术筛选淋巴瘤患者血清特异性生物标志物,发现淋巴瘤早期诊断与人群筛查的血清学特异性标志。方法　应用SELDI-TOF-MS技术检测96例淋巴瘤患者血清特异性标志物,包括非霍奇金淋巴瘤（NHL）86例,霍奇金淋巴瘤（HL）10例,以30名健康体检者作为对照。采用生物化学法测定乳酸脱氢酶（LDH）,酶联免疫吸附法（ELISA）测定可溶性白细胞介素-2受体（sIL-2R）、β2-微球蛋白（β2-MG）和糖链抗原125（CA125）。结果　在质荷比（M／Z）为0.2～16.0间,NHL患者有15个蛋白质含量与健康人差异有统计学意义（P＜0.01）,其中M／Z为 6880、8564、8692和13 751的蛋白质低表达对淋巴瘤的敏感度与特异度高,灵敏度和特异度分别为82.29 %和80.00 %、78.13 %和73.30 %、75.00 %和80.00 %、71.88 %和83.30 %。4个蛋白质对淋巴瘤诊断的灵敏度与特异度差异均无统计学意义（P＞0.05）,4个蛋白质联合检测淋巴瘤特异度达100.00 %,与LDH的灵敏度21.74 %、CA125的灵敏度56.80 %、β2-MG的灵敏度70.50 %比较,差异均有统计学意义（P＜0.05）。结论　对M／Z为6880、8564、8692和13 751的蛋白质行质谱检测,有望作为人群筛查、诊断淋巴瘤的血清学特异性标志。     

表面增强激光解吸附-离子化飞行时间-质谱与乳腺癌临床研究

乳腺癌是危害女性健康的主要肿瘤，目前还没有特定的方法及生物标记物能够在早期发现及诊断。蛋白质组学通过对蛋白质动态的分析可以在疾病早期发现最微小的指标和征兆，从而发现各种疾病的特殊标志分子。表面增强激光解吸附-离子化飞行时间-质谱（SELDI-TOF-MS）技术具有所需检测样品少、快速、敏感和准确的特点，显示了在基础研究及临床检验方面的优势。现综述其在乳腺癌临床研究及肿瘤标记物发现中的应用进展。     

血清蛋白质指纹图谱模型在乳腺导管内癌诊断中的应用

摘 要：［目的］ 探讨蛋白质检测技术在乳腺导管内癌患者诊断中的应用价值。［方法］ 用SELDI-TOF-MS技术及配套蛋白质芯片检测40例乳腺导管内癌患者及40名健康者的血清蛋白质指纹图谱,建立诊断模型。［结果］ 3个蛋白质峰（质/荷比分别为4487.9、6468.1和7575.1）组合构建的诊断模型可鉴别乳腺导管内癌患者和健康者,灵敏度为92.50%(37/40),特异性为90.00%(36/40),阳性预测值为90.24%（37/41）,阴性预测值为92.30%（36/39）,准确率为91.25%（73/80）。［结论］ SELDI-TOF-MS在乳腺导管内乳头状癌诊断尤其是早期诊断以及候选标志物筛选等方面具有一定价值,值得进一步深入研究。     

Detection of nasopharyngeal carcinoma using surface-enhanced laser desorption and ionization mass spectrometry profiles of the serum proteome

Background and Objective: Early diagnosis of nasopharyngeal carcinoma (NPC) is difficult due to the insufficient specificity of the conventional examination method. This study was to investigate potential and consistent biomarkers for NPC, particularly for early detection of NPC. Methods: A proteomic pattern was identified in a training set (134 NPC patients and 73 control individuals) using the surface-enhanced laser desorption and ionization-mass spectrometry (SELDI-MS), and used to screen the test set (4...     

Diagnosis of tumor-like polypoid lesions of gallbladder by serum proteomic fingerprint

Objective:To search the specific serum proteins in tumor-like polypoid lesions of the gallbladder(PLG)patients. Methods:Surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS)technique and WCX Magnetic Beads were used to detect the serum proteomic fingerprint of 23 patients with tumor-like PLG,21 patients with non tumor-like PLG and 26 normal persons.Biomarker Wizard and Biomarker Patterns Software were used in combination to analyze the data.Results:In the preliminar...     

表面加强激光解析电离蛋白质谱技术在乳腺癌血清学诊断中的应用

 【摘要】 目的: 探讨血清SELDI蛋白质谱技术在乳腺癌诊断方面的应用。 方法: 用表面加强目的　探讨血清表面加强激光解析电离（SELDI）蛋白质谱技术在乳腺癌诊断方面的应用。方法　用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）及WCX2蛋白获得病理确诊的101例乳腺癌患者手术前和45名健康人的血清蛋白指纹图谱,并用Biomarker Wizard和BPS软件分析差异蛋白,建立乳腺癌的分类树诊断模型,并对其进行盲法验证。 结果　乳腺癌组与健康对照组共有49个蛋白质差异有统计学意义（P＜0.05）;以其中3个蛋白质生物标志物（M／Z 5627,8124和2864）组建的诊断模型检测正确率为95 %（139／146）。经盲法验证,其灵敏度为97 %（98／101）,特异度为91 %（41／45）。结论　SELDI蛋白质谱技术可以有效的区分乳腺癌患者和健康人,其灵敏度和特异性高。SELDI在乳腺癌的诊断及乳腺癌特异性的生物标志物分子的筛选方面具有一定的应用价值。     

Identification of serum biomarkers for nasopharyngeal carcinoma by proteomic analysis

BACKGROUND: Early diagnosis of nasopharyngeal carcinoma (NPC) remains a challenge. Serum protein profiling is a promising approach for the classification of cancer versus noncancer samples. The objective of the current study was to assess the feasibility of mass spectrometry-based protein profiling and a classification tree algorithm for discriminating between patients with NPC and noncancer controls. METHODS: Serum samples from patients with NPC and noncancer controls were analyzed by using surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS). The study was divided into a preliminary training set and a blind test set: A preliminary training set and a classification tree of spectra derived from 55 patients with NPC and a group of 60 noncancer controls were used to develop a proteomic model that discriminated cancer from noncancer effectively. Then, the validity of the classification tree was challenged with a blind test set, which included another 25 patients with NPC and 28 noncancer controls. RESULTS: Four protein peaks at 4097 daltons (Da), 4180 Da, 5912 Da, and 8295 Da were chosen automatically as a biomarker pattern in the training set that discriminated cancer from noncancer with sensitivity of 94.5% and specificity of 96.7%. When the SELDI marker pattern was tested with the blinded test set, it yielded a sensitivity of 92%, a specificity of 92.9%, and an accuracy rate of 92.5%. The accuracy of 2 protein peaks (4581 Da and 7802 Da) was 80% for predicting stage I and II NPC and 86% for predicting stage III and IV NPC. CONCLUSIONS: The high sensitivity and specificity obtained by the serum protein profiling approach demonstrated that SELDI-TOF-MS combined with a tree analysis model both can facilitate discriminating between NPC and noncancer controls and can provide an innovative clinical diagnostic platform to improve the detection of NPC.     

SELDI-TOF-MS技术筛选鼻咽癌血清肿瘤标志物

摘要：目的筛选鼻咽癌患者血清蛋白差异表达并建立诊断模型,分析不同临床特征患者的血清蛋白质谱差异。方法应用SELDI技术分析102例鼻咽癌患者及118例健康对照的血清样本,Biomarker Wizard和Biomarker Pattern 软件分析两组之间的差异,建立分类树诊断模型并进行盲筛验证;进一步分析鼻咽癌不同临床分型及EB病毒感染状态对患者血清蛋白质表达谱的影响。结果发现鼻咽癌与健康对照之间有25个血清蛋白质谱峰差异有统计学意义（P<0.01), 13个蛋白峰表达下调,12个蛋白峰表达上调。经Biomarker Pattern 软件建立分类树模型,盲法验证其敏感度为97.56％,特异性为88.89％,准确率达92.63％;上行型和下行型鼻咽癌之间发现M/Z为10286Da、7569Da及8149Da的3个血清蛋白质峰差异有统计学意义（P<0.05);EB阳性和EB阴性鼻咽癌间M/Z为9354Da及4596Da的2个血清蛋白质峰差异有统计学意义（P<0.05)。结论SELDI-TOF-MS 技术可筛选出鼻咽癌差异性蛋白并建立鼻咽癌诊断的分类树模型,有望成为鼻咽癌早期诊断的辅助指标;并且用SEDLI技术可以发现一些与鼻咽癌临床特征相关的血清蛋白差异峰。     

Identification and typing of the emerging pathogen Candida auris by matrix‐assisted laser desorption ionisation time of flight mass spectrometry

Candida auris is an emerging antifungal resistant yeast species causing nosocomial and invasive infections, emphasising the need of improved diagnostics and epidemiological typing methods. We show that MALDI‐TOF VITEK‐MS followed by amplified length polymorphisms allows for accurate species identification and subsequent epidemiological characterisation of strains encountered during potential outbreaks.     

食管鳞状细胞癌淋巴结转移与血清蛋白指纹图谱的相关性研究

目的 分析食管鳞状细胞癌(ESCC)患者血清蛋白表达谱的改变;比较有无淋巴结转移(LM)的患者血清蛋白指纹图谱,筛选与LM相关的蛋白峰.方法 术前收集64例ESCC患者和60名性别、年龄相匹配的健康成年人的血清.采用弱阳离子交换型(WCX-2)蛋白芯片为检查介质,经SELDI-TOF-MS测定蛋白指纹图谱.行有癌和无癌的对照研究;ESCC患者组内分别按性别、年龄、肿瘤位置、肿瘤大小、浸润程度和有无LM分别进行对照,得到蛋白指纹图谱并用Biomarker Wizard软件分析比较.结果 在质量/电荷(m/z)0～50000范围内,ESCC与健康成年人血清检测出120个蛋白峰,其中31个蛋白峰差异有统计学意义(P<0.05);不同浸润程度分组对比,T1与T3、T4比较有1个m/z是4174的差异蛋白峰(P<0.05);有无LM组间,3个蛋白峰差异有统计学意义(P<0.05),m/z分别为3970、4174、和4277.其中m/z为4174的蛋白峰是浸润组和LM组所共有的;年龄、性别、肿瘤位置、肿瘤大小分组未发现差异蛋白峰.结论 ESCC患者组和健康成年人组比较,血清蛋白有显著差异;ESCC浸润程度的不同和有无LM血清蛋白指纹存在一定差异,但远较ESCC与健康成年人之间差异小;浸润程度严重和LM在血清蛋白指纹中存在着一定的共性.