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相似文献
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1.
目的了解漳州市肠道病毒71型分离株的VP1区基因特征。方法对2010年漳州市的5株肠道病毒71型分离株进行VP1区基因全长序列测定,测序结果利用DNASTAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega4.0软件构建系统发生树。结果5株肠道病毒71型分离株的VP1区核苷酸序列全长均为891bp,且与2008年安徽阜阳流行株Fuyang.Anhui.P.R.C-17.08-2的VP1区核苷酸序列同源性和氨基酸序列同源性最高,分别为98.2%-98.8%和99.7%-100.0%。5株肠道病毒71型分离株间的核苷酸序列同源性为97.2%-99.8%.氨基酸序列同源性为99.3%~100.0%。氨基酸在98位和218位这两个位点发生了特异性变异。VP1区基因遗传进化分析表明,漳州市所有分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支。结论5株肠道病毒71型分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支.与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型完全-致。  相似文献   

2.
宁夏2004-2007年流行麻疹野病毒基因特征分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的了解宁夏2004-2007年流行的麻疹野病毒分离株基因特征,为控制、消除麻疹提供科学依据。方法用B95a、Vero/Slam细胞从疑似麻疹暴发和散发患者的标本中分离麻疹病毒,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),从分离到的麻疹病毒中扩增出核蛋白(nucleoprotein,N)基因C末端676个核苷酸片段,再对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并以C末端456个核苷酸片段构建基因亲缘性关系树,进行核苷酸、氨基酸同源性分析。结果分离的36株麻疹野病毒全部为H1基因型H1a亚型。36株麻疹野病毒的核苷酸同源性为96.2%-100.0%,氨基酸同源性为94.0%-100.0%。宁夏14株麻疹病毒代表株与中国S191疫苗株的核苷酸同源性为91.0%-92.5%,氨基酸同源性为85.4%-89.4%。结论宁夏2004-2007年流行的麻疹野病毒为H1基因型H1a亚型,未发现其它基因亚型。H1a基因亚型病毒株引起了多个传播链造成宁夏各市的麻疹流行。  相似文献   

3.
目的了解宁波地区流行性感冒(流感)病毒株的变异情况。方法采集2004年5月宁波大学流感爆发期间病人的含漱液进行病毒分离、鉴定,并对其中1株病毒的血凝素重链区进行了核苷酸和氨基酸序列分析。结果在9份样品中共分离到流感病毒3株,经血清学试验鉴定为甲3型。与2002年宁波市流感病毒流行株的核苷酸同源性为98.2%-98.3%,氨基酸同源性为96.7%-97.3%;与2003年流行株的核苷酸同源性为98.7%,氨基酸同源性为97.6%;与参考株A/Sydney/05/1997的核苷酸同源性为95.9%,氨基酸同源性为92.7%;与参考株A/Wuhan/359/1995的核苷酸同源性为94.6%,氨基酸同源性为91.2%。结论2004年宁波大学流感爆发的病毒为甲3型。其HA1区序列更接近2003年流行毒株,与A/Sydney/05/1997毒株的同源性要高于A/Wuhan/359/1995。该爆发流行的毒株可能是在宁波以前流行毒株的基础上进化而来的。  相似文献   

4.
河南省9株狂犬病毒的N基因序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
 目的 分析河南省9株狂犬病毒的核蛋白基因序列,探讨狂犬病毒流行株毒力与致病性的可能变异。方法 以RT-nested-PCR扩增9株2006年12月分离于河南省信阳市的狂犬病毒街株,经纯化、克隆、测序后获得9条N基因全长序列,采用生物信息学软件对N基因序列进行分析。结果 9株狂犬病毒核蛋白在核苷酸及氨基酸水平上彼此的同源性分别为97.5%~99.3%和98.4%~99.8%;病毒与CTN疫苗的核苷酸序列同源性最高,为88.9%~90.1%,氨基酸序列同源性为97.6%~98.0%;与其他疫苗株相比,9株病毒与其核苷酸及氨基酸同源性范围分别为84.4%~87.9%和94.2%~97.3%;与已知的基因1型狂犬病毒比较,9株病毒核蛋白氨基酸序列发生了若干位点的取代。结论 9株河南省狂犬病毒流行株均属基因1型,其核蛋白在基因的核苷酸及推导的氨基酸水平上均有变异,这些变异可能影响疫苗对流行株所致狂犬病的保护效果。  相似文献   

5.
目的:了解2011年河南洛阳和南阳地区流行的肠道病毒71型(EV71)基因特征。方法:分离洛阳和南阳地区EV71病毒各一株,分别进行全基因测序和基因进化分析。结果:EV71/Luoyang2011和EV71/Nanyang2011的VP1区序列在进化树上均属于C4亚型,与国内流行株都具有较高同源性,与2008年广东流行株亲缘关系最近。这2株全基因核苷酸序列同源性为99.3%,氨基酸序列同源性为97.6%,并且氨基酸均没有发生明显改变。结论:EV71/Luoyang2011和EV71/Nanyang2011属于C4亚型,与我省及我国既往流行株相比,未发生大的变异。  相似文献   

6.
目的 分析2019—2020监测年度(2019年4月1日—2020年3月29日)海南省A (H1N1) pdm09亚型流感病毒基质蛋白基因(Matrix, M)进化规律和M2蛋白氨基酸位点变异情况。方法 选取14株2019—2020年海南省分离的A (H1N1) pdm09亚型流感病毒进行基因序列测定,采用Neighbor-Joining方法进行种系进化分析,通过系统进化树比较海南流行株与疫苗株的差异。测序结果用MEGA 10.1.8和DNASTAR7.0.1软件进行基因特性分析及基因同源性分析。结果 2019—2020监测年度,海南省A (H1N1) pdm09亚型流感病毒分离株占分离株的4.9%。序列分析显示,海南省A (H1N1) pdm09亚型流感病毒与国际疫苗株A/Brisbane/02/2018的M基因在核苷酸系统进化树6B.1分支上,核苷酸与氨基酸同源性范围为98.7%~100.0%、98.8%~100.0%。12株分离株胞外区编码区S23N氨基酸发生变异;跨膜区14株分离株均发生S31N位点突变,突变率为100.0%;1株I39V位点氨基酸变异;9株分离株在胞浆区E70D位氨基酸位点发生变异。结论 2019—2020监测年度海南省A (H1N1) pdm09亚型流感病毒活动水平较低,与疫苗株相匹配,对金刚烷胺类药物耐药,应特别关注M2蛋白氨基酸变异情况,为临床抗流感病毒药物的使用提供科学依据。  相似文献   

7.
目的分析2019—2020监测年度(2019年4月1日—2020年3月29日)海南省A (H1N1) pdm09亚型流感病毒基质蛋白基因(Matrix, M)进化规律和M2蛋白氨基酸位点变异情况。方法选取14株2019—2020年海南省分离的A (H1N1) pdm09亚型流感病毒进行基因序列测定,采用Neighbor-Joining方法进行种系进化分析,通过系统进化树比较海南流行株与疫苗株的差异。测序结果用MEGA 10.1.8和DNASTAR7.0.1软件进行基因特性分析及基因同源性分析。结果 2019—2020监测年度,海南省A (H1N1) pdm09亚型流感病毒分离株占分离株的4.9%。序列分析显示,海南省A(H1N1) pdm09亚型流感病毒与国际疫苗株A/Brisbane/02/2018的M基因在核苷酸系统进化树6B.1分支上,核苷酸与氨基酸同源性范围为98.7%~100.0%、98.8%~100.0%。12株分离株胞外区编码区S23N氨基酸发生变异;跨膜区14株分离株均发生S31N位点突变,突变率为100.0%;1株I39V位点氨基酸变异;9株分离株在胞浆区E70D位氨基酸位点发生变异。结论 2019—2020监测年度海南省A (H1N1) pdm09亚型流感病毒活动水平较低,与疫苗株相匹配,对金刚烷胺类药物耐药,应特别关注M2蛋白氨基酸变异情况,为临床抗流感病毒药物的使用提供科学依据。  相似文献   

8.
目的 了解2005~2006年宁波市流行的甲型流行性感冒病毒A(H1N1)亚型的病原学分子生物学特性.方法 将2005~2006年分离的流感病毒进行血清学分型,挑选H1N1亚型流感病毒的代表株进行血凝素基因(HA1)片断的核苷酸序列测定,分析抗原变异情况.结果 H1N1亚型在2005年3月起在宁波市开始活动加强,同年9月起逐渐形成优势成为主要的流行株.病毒核苷酸序列测定结果,2005年3~4月流行的H1N1与9月以后流行的H1N1氨基酸序列有较大的差异,两者为不同性状的毒株.而且后者的氨基酸序列在2006年又进一步发生了变异,与当前疫苗株A/New caledonia/20/1999的抗原性差异进一步加大.同源性降至96.3%.结论 H1N1亚型流感病毒重新引起流行并成为优势株与其抗原性的变异及人群中针对这一病毒的免疫力下降有关.  相似文献   

9.
目的 通过检测分析2015年杭州市柯萨奇病毒A组16型(CA16)病毒株VP1区核苷酸序列,掌握杭州市CA16的流行情况及种系进化关系,为手足口病的预防和治疗提供支持,同时为CA16疫苗株的选择提供依据。方法 收集2015年杭州市儿童医院256例临床资料齐全且临床诊断为手足口病患儿的粪便或咽拭子,利用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增CA16病毒株VP1区核苷酸序列(约1 020 bp),测序后利用DNASTAR和Primer Premier 5.0进行序列比对分析,并用Mega 3.1软件建立检测样本VP1区序列与GenBank上CA16参考毒株VP1核苷酸序列的系统发育树。结果 共分离到80株CA16阳性病毒。序列比对分析结果显示,CA16分离株的核苷酸同源性为90.8%~100.0%,氨基酸同源性为99.5%~100.0%。系统发育树分析结果显示,17株CA16全部属于B1基因亚型,并且同时存在B1a和B1b两个进化分支,其中4株属于B1a亚型,13株属于B1b亚型。结论 2015年杭州市CA16病毒株属于B1基因亚型,与国内外某些地区手足口病病原学及分子进化研究结果一致,有望成为疫苗候选株作进一步研究。  相似文献   

10.
目的 了解甲型肝炎病毒 (HAV)在中国几个城市的基因型分布 ,为HAV的分子流行病学追踪调查提供方法和依据。方法  17株HAV代表株分别来自不同城市的甲型肝炎病人粪便或血清 ,病毒RNA经蛋白酶K消化、酚 /氯仿提取和乙醇沉淀后 ,以逆转录 套式聚合酶链反应 (RT PCR)扩增合成HAVVP1/ 2A交接区基因区 ,并进行直接核苷酸序列分析和差异比较。结果 VP1/ 2A交接区核苷酸序列分析表明 ,所有病毒株均从属于基因Ⅰ型 ;约 53%为ⅠB亚型 ,亚型间差异小于6 % ;约 4 7%为ⅠA亚型 ,亚型间差异小于 5 3% ;ⅠA与ⅠB亚型间的同源性为 88 7% - 92 3%。结论 中国流行或散发的HAV株可能有基因ⅠA、ⅠB亚型同时存在 ,流行病学相关的病毒株核苷酸序列相同或相近。  相似文献   

11.
12.
OBJECTIVE: To describe five outbreaks of hepatitis A virus (HAV) infection associated with illicit drug use during a statewide outbreak of HAV infection in Queensland. DESIGN: Risk factor prevalence survey. PATIENTS AND SETTING: All 875 cases of HAV infection notified to Public Health Units in Queensland in the 12 months to 30 November 1997. MAIN OUTCOME MEASURE: Type and prevalence of illicit drug use. RESULTS: Risk factor assessment was completed for 804 cases (91.9%). We identified five outbreaks of HAV infection linked to illicit drug use. These outbreaks accounted for 24.6% (215/875) of all notified cases and 39% (190/482) of notified cases in the 15-34 years age group. The main type of illicit drug use in four of the five outbreaks was injecting drug use (74%; 118/160), while in the other outbreak it was sharing of smoking implements for marijuana (38%; 21/55). CONCLUSION: Illicit drug use may be an under-recognised risk factor for HAV infection, particularly in young people. Faecal-oral transmission through poor personal hygiene, including sharing of implements for smoking marijuana, is the most probable route of transmission in these drug-linked outbreaks. The role of contaminated drug and needle-sharing remains to be clarified.  相似文献   

13.
郭瑞玲 《医学动物防制》2011,(2):120-121,124
目的明确本次甲肝暴发的原因。方法采用病例对照研究方法,根据预调查结果,设计统一调查表,对14岁儿童进行调查,同时采集血清检测甲肝抗-IgM抗体,以抗HAV-IgM抗体阳性儿童为病例组,以抗HAV-IgM抗体阴性且HAV-IgG抗体阴性的儿童为对照组。将调查结果用EPIDATA软件建立数据库,并用SPSS13.0进行分析。结果本次暴发历时2个常见甲肝潜伏期,共感染20例幼儿。统计结果显示,经常去幼儿园玩耍和与首发病例共餐及经常去首发病例家玩耍为本次感染的主要危险因素(P<0.001)。结论本次为典型的人传人连续性传播,患病儿童对幼儿园玩具的污染导致甲肝病毒的播散,而儿童没有良好的卫生习惯如饭前不洗手、喝生水等是其得以发病的重要条件。  相似文献   

14.
目的对2011年7月广州市发生的一起细菌性食物中毒进行病原学特征分析。方法对送检病人粪便、厨工肛拭及食物等样品进行荧光PCR检测和分离培养,对分离株进行生化鉴定,血清分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型和药敏分析。结果从病人粪便、肛拭和厨房抹布共分离到18株利齐菲尔德沙门菌,为相同的PFGE型别,药敏结果显示菌株对实检和定阿米卡星,庆大霉素及妥布霉素耐药,对头孢噻肟、亚胺培南、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑等15种抗生素均敏感。结论实验判定这是一起由同一克隆型的利齐菲尔德沙门菌污染厨房环境所引起的食物中毒事件,PFGE分型法为暴发溯源提供分子流行病学证据和支持。  相似文献   

15.
目的了解2005年宁夏麻疹流行株基因型特征,为进一步的麻疹防治策略提供科学依据。方法采集宁夏2005年麻疹暴发病例的咽拭子或尿液标本19份,用EB病毒转化的狨猴淋巴母细胞(B95a)分离麻疹病毒。使用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增出分离的麻疹病毒株核蛋白(N)基因C末端676个核苷酸。再对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并以C末端456个核苷酸片断构建基因亲缘性关系树,进行核苷酸同源性分析。结果从19份标本中分离到13株麻疹病毒,均为H1基因型H1a亚型。结论引起2005年宁夏部分地区麻疹暴发流行的野毒株为H1基因型,并以H1a为绝对优势亚型。不同暴发之间存在相同毒株引起的传播链,同一暴发中存在不同毒株的传播。  相似文献   

16.
目的了解一起工厂细菌性痢疾(菌痢)爆发的特点和流行原因,积累对爆发疫情调查处理的经验并为制定防治对策提供科学依据。方法采用现场流行病学调查分析和实验室病原分离培养鉴定方法,并结合发病危险因素的病例进行对照研究。结果2006年10月30日至11月4日,该厂发生细菌性痢疾70例,罹患率为1.00%,发病均为工厂民工,年龄16~42岁,病例呈散在分布,无明显宿舍及工种聚集性,临床表现以发热、腹泻、腹痛、粘液血便、里急后重为主。从病人粪便和肛拭标本中分离培养出15株福氏2b型志贺氏菌。病例对照研究食用凉拌粉丝的OR值为7.75,经采取隔离治疗病人、食品卫生管理等综合措施后,疫情迅速终止。结论本次疫情为一起菌痢爆发,爆发原因初步排除水源和接触因素,凉拌粉丝为可疑食物。集体食堂卫生安全存在诸多薄弱环节,加强集体食堂的管理是遏止食物中毒和肠道传染病爆发的关键。  相似文献   

17.
目的 探讨海马及皮层神经元细胞膜上快速失活钾通道的特性。方法 急性分离大鼠海马及皮层神经元;利用whole-cell膜片钳技术记录IA电流。结果 海马神经元上的IA通道电流幅度较皮层神经元大、潜伏期短。结论 海马神经元与皮层神经元上的IA电流特征存在差别。  相似文献   

18.
OBJECTIVE: To assess the side effects and immune responses after three serial doses of a new inactivated hepatitis A vaccine in people 40 years of age or more. DESIGN: Open, noncomparative trial. SETTING: A hospital, a regional laboratory and public health units in British Columbia. PARTICIPANTS: A volunteer sample of 64 healthy adults aged 40 to 61 years who were seronegative for hepatitis A virus (HAV). All were staff or associates of the health facilities. Exclusion criteria included elevated serum alanine and aspartate aminotransferase levels, a history of liver disease and recent travel to areas of high risk for HAV infection. INTERVENTION: A formalin-inactivated, alum-adsorbed vaccine containing 720 ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) units of antigen from HAV strain HM175 per 1.0-mL dose was injected intramuscularly into the delgoid area. The second and third doses were given 1 and 6 months later respectively. MAIN OUTCOME MEASURES: A detailed diary of any adverse effects for 3 days after each dose. HAV antibody levels in blood samples taken before and 30 days after each dose. RESULTS: All subjects completed the planned series of vaccinations and blood tests; symptom diaries were returned after 190 (99%) of 192 vaccinations. Local symptoms, most often soreness, were reported after 46% of the vaccinations but were mild and usually resolved within 24 hours. A temperature of more than 38.0 degrees C was never reported. Seroconversion occurred in all cases after the two primary doses, and the subjects were still seropositive at 6 months. After the booster dose the geometric mean titre was 2380 mIU/mL, all values being 200 mIU/mL or greater. CONCLUSION: In healthy adults 40 years of age or more the HAV vaccine was well tolerated and highly immunogenic. Final antibody levels were much higher than reported in people passively immunized against HAV with immune serum globulin.  相似文献   

19.
目的分析张家口地区慢性丙型肝炎患者中甲型肝炎病毒(HAV)的流行情况,为疾病控制和治疗提供依据。方法选取2010年3月至2012年6月张家口地区万全县中医院、河北北方学院第一附属医院及解放军251医院收治的83例慢性丙型肝炎患者作为研究对象,收集其详细临床资料,应用酶联免疫吸附试验法检测受试者血清中HAV IgM抗体水平,并对所得数据进行统计分析。结果慢性丙型肝炎患者中HAV IgM总阳性率为48.2%;不同年龄段患者HAV合并感染率比较差异无统计学意义(P>0.05);患者性别、受教育程度及有无静脉注射毒品史的特征与HAV IgM阳性率之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论张家口地区丙型肝炎合并甲型肝炎感染率非常高,临床危害大,对确诊的丙型肝炎患者接种甲型肝炎疫苗以产生足够的免疫反应是非常必要的。  相似文献   

20.
目的 探讨无创性肢体缺血后适应(RPOC)是否具有减轻大鼠心梗后再灌注时心肌损伤的作用.方法 所有大鼠随机分为3组(每组15只):心肌缺血/再灌注损伤组(L/R)、再灌注前冠脉缺血后适应组(CPOC)和再灌注同时无创性肢体缺血后适应组(RPOC).观察再灌注期间心电、心肌缺血范围(AAR)、心肌梗死范围(IA)、梗死范...  相似文献   

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