Toll样受体3基因单核苷酸多态性与湿性年龄相关性黄斑变性的关联研究

目的 分析中国平原地区汉族人群Toll样受体3(toll-like receptor 3,TLR3)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的基因型分布,探讨该基因SNP与湿性年龄相关性黄斑变性(age-related macular degeneration,AMD)的相关关系.方法 本研究是以医院病例资料为基础的对照研究.收集南通大学附属医院确诊的湿性AMD患者109例(病例组)及同一地区正常对照150例(对照组),采用TaqMan-MGB荧光探针法检测TlR3外显子4片段上SNP位点Leu412Phe(rs3775291),比较两组等住基因及基因型的频率分布.结果 在平原地区汉族人群中TLR3基因ku412Phe存在三种基因型(CC、CT、TT),其分布频率分别为48.7%、44.O%、7.3%.病例组与对照组年龄、性别、吸烟情况差异均无统计学意义(均为P＞0.05),两组具有可比性.病例组的基因型频率分别为CC 57.8%、CT 34.9%、TT7.3%,同对照组相比差异均无统计学意义(均为P＞0.05).病例组等住基因T的频率低于对照组(分别为25%和29%),但2组差异无统计学意义(P=0.25).结论 中国平原地区汉族人群中TLR3基因的SNP位点rs3775291与湿性AMD的发生无明显相关性.     

LOXL1基因启动子区单核苷酸多态性与维吾尔族剥脱综合征发病的关联性研究

背景 剥脱综合征(XFS)是一种细胞外基质异常聚集的系统性疾病.研究证实,位于赖氨酰氧化酶样1(LOXL1)基因第一外显子区的单核苷酸多态性(SNPs)位点与XFS发病有一定关联,但这些研究在不同种族、国家和地区间结果并不一致.目的 探讨新疆维吾尔族人群中LOXL1基因启动子区SNPs与XFS发病的关联性.方法 采用病例对照研究设计,于2014年1-8月收集新疆地区维吾尔族无亲缘关系的152例XFS患者为XFS组,收集同期民族和性别匹配的228名眼部正常者为对照组.采集所有受检者外周血各5 ml并提取DNA,选取LOXL1基因启动子区rs12914489、rs4886467、rs4558370、rs4461027、rs4886761、rs 16958477共6个SNPs位点,利用PCR-连接酶检测反应(LDR)法对各SNPs位点进行基因分型,采用x2检验分析等位基因频率及基因型频率分布,并计算比值比(OR)值及95％可信区间(CI).结果 本研究中对照组rs12914489位点偏离Hardy-Weinberg平衡(HWE) (P=0.033),rs4886467、rs4558370、rs4461027、rs4886761、rs16958477位点均符合HWE.XFS组rs4886467等位基因G和基因型GG频率均低于对照组,差异均有统计学意义(均P=0.00),为保护因素(OR=0.54,95％CI:0.40 ～0.74,P=0.000;OR=0.51,95％ CI:0.33～0.78,P=0.001);XFS组rs4558370等位基因G和基因型GG频率均高于对照组,差异均有统计学意义(均P=0.00),二者是发病危险因素(0R=1.96,95％CI:1.23 ～3.11,P=0.004;OR=2.18,95％CI:1.31 ～3.64,P=0.002);XFS组rs4461027等位基因C和基因型CC频率均明显高于对照组,差异均有统计学意义(均P=0.00),二者是发病的危险因素(OR=2.25,95％ CI:1.67 ～3.04,P=0.000;OR=3.06,95％CI:1.89～4.96,P=0.000);XFS组rs4886761等位基因T和基因型TT频率均高于对照组,差异均有统计学意义(均P=0.00),二者是发病危险因素(OR=2.44,95％ CI:1.79～3.33,P=0.000;OR=3.02,95％CI:1.63～5.60,P=0.000);XFS组rs16958477位点等位基因C和基因型CC频率均高于XFS组,差异均有统计学意义(均P=0.00),二者是发病的危险因素(OR=2.00,95％CI:1.47 ～2.71,P=0.000;OR=2.37,95％CI:1.31～4.27,P=0.004).结论 新疆维吾尔族人群LOXL1基因启动子区的SNPs与新疆维吾尔族XFS发生存在关联,其中rs4886467位点是发病的保护因素,rs4558370、rs4461027、rs4886761和rs16958477位点是XFS发生的危险因素.     

DNA甲基化转移酶(DNMT)3b基因的单核苷酸多态性与年龄相关性白内障

目的 探讨江苏汉族人群中DNA甲基化转移酶(DNA methyltransferases,DNMT)3b基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与年龄相关性白内障(age-related cataract,ARC)的相关性.方法 选择江苏眼病研究阜宁县基地人群ARC确诊患者357例为ARC组,356例与患者年龄、性别相匹配且无亲属关系的健康者为对照组,入选者均为汉族.采用荧光定量PCR方法检测DNMT3b基因3个位点(rs2424908、rs6119954、rs2424932)SNP.Stata 13.0软件进行统计分析.结果 rs2424908位点不符合哈迪-温伯格平衡,故排除出结果分析.SNP位点rs6119954及rs2424932在对照组中基因型AA、AG、GG的分布频率分别为12.26％、43.73％、44.01％和0.28％、12.64％、84.55％,在ARC组中的分布频率分别为9.52％、32.49％、43.98％和0.28％、16.48％、83.24％,两组间各基因型分布频率差异均无统计学意义(均为P＞0.05).结论 DNMT3b基因SNP的位点rs6119954、rs2424932与江苏汉族人群中ARC发病无相关性.     

汉族人群MMP-9基因单核苷酸多态性与PACG的相关性

目的：探讨基质金属蛋白酶9(extracellular matrix metalloprotease 9,MMP-9)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与汉族人群原发性闭角型青光眼(primary angle closure glaucoma,PACG)易感性的关联。

方法：选取我院2014-01/2016-12收治的200例汉族PACG患者作为PACG组,同时招募200例汉族体检健康者作为正常对照组。常规外周静脉采集,提取全血基因组DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(polymerase chain reaction- restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)检测两组受检者MMP-9基因rs2250889、rs2274755及rs2664538位点等位基因及基因型,分析等位基因和基因型频率分布及其与PACG易感性之间的关系。

结果：两组受检者年龄、性别、体质量指数、血压等一般资料差异均无统计学意义(P>0.05)。MMP-9基因rs2250889、rs2274755及rs2664538位点基因型频率均符合哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)。两组受检者rs2250889和rs2664538位点基因型及等位基因频率分布差异均有统计学意义(P<0.05),而rs2274755位点基因型及等位基因频率分布差异均无统计学意义(P>0.05)。rs2250889位点中携带CC基因型人群为PACG的易感人群。同样,rs2664538位点中携带GG基因型人群为PACG的易感人群。

结论：汉族人群中,MMP-9基因rs2250889和rs2664538位点多态性与 PACG 的发病存在一定关联,而rs2274755位点多态性与PACG的易感性无关。     

单核苷酸多态性与年龄相关性白内障的研究进展

年龄相关性白内障是最常见的白内障类型,也是全球首位的致盲性因素。大量研究表明,遗传因素在年龄相关性白内障发病过程中发挥着重要作用。单核苷酸多态性作为第３代分子遗传标志,是最常见的多态性表现形式,本文就近年来单核苷酸多态性与年龄相关性白内障相关性的最新研究成果作一简要综述。     

近视相关RDH5基因内含子区单核苷酸多态性位点rs3138144（G>C）对其启动子功能的影响

目的　探讨近视相关视黄醇脱氢酶5（RDH5）基因内含子区单核苷酸多态性（SNP）位点rs3138144（G>C）对其启动子功能的影响。方法　从初始密码子ATG往前扩增1500 bp的5’端上游调控区域作为拟研究的启动子片段,以包含rs3138144位点的长220 bp的区段作为研究的内含子片段。与萤火虫荧光素酶报告基因载体pGL3-Basic进行重组质粒的克隆与鉴定,构建rs3138144荧光素酶报告基因质粒野生型（pGL3-RDH5-G）和rs3138144荧光素酶报告基因质粒突变型（pGL3-RDH5-C）载体,同时设定pGL3-Basic作为对照。与内参质粒pRL-TK共转染ARPE-19细胞及HEK293细胞,通过双荧光素酶报告基因系统检测报告基因活性。结果　在ARPE-19细胞中,野生型rs3138144位点荧光素酶相对活性为0.806±0.156,突变型为0.525±0.130,对照为0.085±0.027,野生型荧光素酶相对活性高于突变型及对照,差异均有统计学意义（均为P<0.05）。在HEK293细胞中,野生型rs3138144位点荧光素酶相对活性为0.075±0.013,突变型为0.040±0.006,对照为0.004±0.001,野生型高于突变型及对照,差异均有统计学意义（均为P<0.05）。等位基因G及等位基因C均能与核蛋白中的某种转录因子结合,灰度值分析结果提示等位基因G结合能力更强。结论　RDH5基因内含子区SNP位点rs3138144（G>C）影响RDH5基因启动子转录活性。     

Toll样受体与眼部炎性疾病

Toll样受体是一类存在于哺乳动物细胞的跨膜受体,它可以识别病原微生物保守的病原相关分子模式,参与细胞信号传导及免疫反应,在抗感染中发挥重要作用.本文就Toll样受体家族成员的结构特点、其识别病原微生物参与信号传导及宿主免疫的功能及其与眼部疾病的联系进行综述,为深入研究眼部感染性及免疫性疾病的发病机制提供帮助,为这些疾病的治疗提供新的思路和手段.     

ERCC6基因单核苷酸多态性与年龄相关性白内障的关联研究

目的　探讨江苏汉族人群中ＥＲＣＣ６基因单核苷酸多态性（ｓｉｎｇｌｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙ-ｍｏｒｐｈｉｓｍｓ,ＳＮＰ）与年龄相关性白内障（ａｇｅ-ｒｅｌａｔｅｄｃａｔａｒａｃｔ,ＡＲＣ）的相关性。方法　收集江苏省阜宁县眼病研究数据库（现场工作于２０１０年６月至２０１１年５月进行）中３５７例ＡＲＣ患者为ＡＲＣ组,３５６例与患者年龄、性别相匹配且无亲属关系者为对照组。采用ＴａｑＭａｎ-ＭＧＢ探针实时荧光聚合酶链反应方法检测ＥＲＣＣ６基因４个位点（ｒｓ１２５７１４４５、ｒｓ４２５３１６０、ｒｓ２２２８５２６、ｒｓ３７９３７８４）ＳＮＰ。采用χ２检验比较对照组和ＡＲＣ组之间等位基因及基因型分布是否有差异。结果　ｒｓ２２２８５２６在ＡＲＣ组中等位基因Ｇ的频率为１４．５７％,高于对照组中１０．８１％,差异有统计学意义（Ｐ＝０．０３３）,提示等位基因Ｇ增加白内障的患病风险。该位点Ｇ等位基因和ＧＧ、ＧＡ基因型增加了核型白内障的患病风险（Ｐ＝０．００７;Ｐ＝０．０３１）。其他位点差异均无统计学意义（ｒｓ１２５７１４４５:Ｐ＝０．３３;ｒｓ４２５３１６０:Ｐ＝０．６５）。结论　ＥＲＣＣ６基因ＳＮＰ-ｒｓ２２２８５２６位点与ＡＲＣ发病存在关联,提示该ＳＮＰ在核型ＡＲＣ的发生发展中发挥着一定作用。     

ARMD与转铁蛋白受体基因单核苷酸多态性相关性研究

目的：探讨中国东北地区汉族人群中年龄相关性黄斑变性(ARMD)与转铁蛋白受体2(TFR2)基因单核苷酸多态性的相关性。

方法：选取200例ARMD患者(干性100例,湿性100例)和100名健康志愿者(对照组),采集所有研究对象的外周静脉血并以EDTA抗凝处理,提取基因组DNA,根据相关文献提供的引物序列,扩增TFR2基因多态性位点rs2075674,进行聚合酶链式反应(PCR)。比较各组间的基因型频率,并按照Hardy-Weinberg平衡原理确定样本的群体代表性。

结果：TFR2基因的多态性位点rs2075674 ARMD组与对照组比较有差异(χ²=6.494,P=0.011); 湿性ARMD组与对照组比较有差异(χ²=11.054,P=0.001),而干性ARMD组与对照组无差异(χ²=1.418,P=0.234)。

结论：中国东北地区汉族人群中TFR2基因多态性rs2075674与ARMD具有相关性,且与湿性ARMD相关性较大。     

CRLR基因单核苷酸多态性与原发性前房角关闭人群的关联研究

目的：探讨降钙素受体样受体（ calcitonin receptor－like receptor,CRLR）基因单核苷酸多态性（ single nucleotide polymorpnism ,SNP）与汉族原发性前房角关闭人群的关联性。方法：以流行病学人群为研究对象,采用病例对照设计。收集江苏省阜宁县流行病学调查中筛查出的原发性前房角关闭（ primary angle closure ,PAC）患者232例,正常对照306例。血样经DNA提取后采用TaqMan－MGB荧光探针法检测CRLR基因的rs1157699（ C／T ）位点SNP基因型,比较两组等位基因及基因型频率的分布。结果：病例组的基因型分布（ CC 67．4％, CT 30．0％, TT 2.6％）,对照组的基因型分布（CC 71．3％,CT 27．0％,TT 1．7％）,两组之间差异无统计学意义（P＞0．05）。结论：中国汉族人群的CRLR rs1157699位点SNP与原发性前房角关闭无相关性。     

年龄相关性白内障患者沉默信息调节因子1(SIRT1)的单核苷酸多态性研究

目的 探讨江苏汉族人群中沉默信息调节因子1(silent information regulator 1,SIRTl)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与年龄相关性白内障(age-related cataract,ARC)的关系.方法 采用分子流行病学病例对照研究方法和Taq-Man RT-PCR法,检测江苏眼病研究苏南无锡市滨湖区、苏北盐城市阜宁县基地人群720例ARC,701例与患者年龄、性别相匹配且无亲属关系的健康者为正常对照组的SIRT1基因5个位点(rs2236319、rs1885472、rs10997868、rs2273773、rs4746720) SNP的基因型,入选者均为汉族.结果 SIRT1基因rs10997868位点不符合哈迪-温伯格平衡,故排除出结果分析.SIRT1基因SNP位点rs2236319及rs1885472在对照组中基因型(AA/AG/GG、CC/CG/GG)的分布频率分别为40.08％、52.60％、7.32％及35.81％、35.23％、28.96％,在ARC组中的基因型分布频率分别为36.94％、56.25％、6.81％及36.67％、32.92％、30.42％.SNP位点rs2273773及rs4746720在对照组中基因型(CC/CT/TT)的分布频率分别为38.37％、54.78％、5.85％及74.75％、17.69％、7.56％,在ARC组中的基因型分布频率分别为39.58％、54.17％、6.25％及71.81％、20.97％、7.22％.两组间各基因型分布频率差异均无统计学意义(均为P＞0.05).结论 SIRT1基因SNP(rs2236319、rs1885472、rs2273773、rs4746720)与江苏汉族人群中ARC发病不相关.     

11q24.1单核苷酸多态性与高度近视遗传易感性相关研究

目的:研究中国大学生高度近视遗传易感性与11q24.1染色体上4个单核苷酸多态性的相关性。方法:收集经常近距离作业的中国大学生血液样本(254例),分为高度近视组(42例)、低中度近视组(61例)和无近视眼的对照组(151例),利用基因分型技术分析位于11q24.1染色体4个单核苷酸rs577948,rs11218544,rs10892819,rs11218553的SNPs位点的等位基因突变频率,利用卡方检验检测其与三组样本之间的差异及相关性。结果:大学生高度近视组一个单核苷酸SNP位点即11q24.1染色体区域rs577948的变异与正常对照组和低中度近视组有显著差异(P=2.28×10-7)。结论:轻度近视和无近视的中国大学生遗传易感性和4个SNPs均无明显关联,且两组之间亦无显著差异。大学生中高度近视人群11q24.1染色体区域rs577948位点A→G变异与高度近视遗传易感性密切相关。     

apelin-APJ系统基因单核苷酸多态性与糖尿病视网膜病变的关系

目的　研究apelin-APJ系统基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与糖尿病视网膜病变（diabetic retinopathy,DR）的关系。方法　横断面研究。自2017年7月至2018年7月纳入2型糖尿病患者885例,参照DR国际临床分型标准对患者进行分组,其中DR组346例,非DR（non-DR,NDR）组539例。两组均行眼部检查,计算体质量指数,测量血压,检测空腹血糖,并进行血液生化指标及血脂等实验室检查。采用定量PCR方法获得apelin基因rs3115757、rs56204867、rs3761581和APJ基因rs7119375、rs9943582共5个位点的基因分型,比较不同性别两组间各基因型分布的差异,采用Logistic回归分析apelin和APJ基因5个SNP与DR的关系。结果　无论男性还是女性,DR组糖尿病病程均显著长于NDR组（均为P=0.000）。男性apelin基因的3个SNP位点突变等位基因频率在DR组与NDR组间分布差异均有统计学意义（均为P<0.05）,APJ基因2个SNP突变位点等位基因频率在DR组与NDR组间分布差异均无统计学意义（均为P>0.05）。女性的5个SNP突变位点等位基因频率在DR组与NDR组间分布差异均无统计学意义（均为P>0.05）。调整年龄、体质量指数、空腹血糖后,Logistic回归分析结果显示,无论男性还是女性,携带rs3115757-C、rs56204867-C、rs3761581-A突变等位基因者患DR的风险均明显高于携带相应野生等位基因者（均为P<0.05）。结论　apelin基因的3个SNP rs3115757、rs56204867、rs3761581与DR的发生有关。     

中国汉族高度近视患者与正常人CTNND2基因单核苷酸多态性的病例对照研究

背景 高度近视是致盲的主要原因之一,迄今尚未找到明确的致病基因,最近报道了一个新加坡人高度近视新的易感位点,CTNND2基因的两个单核苷酸多态性(SNPs)(rs12716080和rs6885224)位点,但其与汉族高度近视的发病是否有关尚不清楚.目的 研究CTNND2基因SNPs位点与中国汉族高度近视发病的相关性.方法 采用病例对照关联研究设计方法.收集933例高度近视患者(高度近视组)和年龄及性别匹配的1227名屈光状态和眼轴长度在正常范围的正常对照者(正常对照组)的外周血各5 ml,并提取基因DNA,用聚合酶链反应(PCR)法扩增目的DNA,采用单碱基延伸(SNaPshot)法进行DNA纯化.选取CTNND2基因的4个标签SNPs,包括已有报道的rs12716080位点和rs6885224位点,分析其与高度近视的相关性.结果 CTNND2基因4个标签SNPs,rs6885224、rs12716080、rs917012、rs16901340的基因型均符合Hardy-Weinberg平衡(HWE) (P=0.181、0.085、0.732、0.313、0.264、0.663、0.084、0.196),高度近视组和正常对照组rs12716080、rs917012、rs6885224、rs16901340 SNPs的基因型频率相比差异均无统计学意义(P=0.654、0.406、0.828、0.403),其等位基因频率在高度近视组与正常对照组间差异均无统计学意义(P=0.377、0.209、0.743、0.198).通过Haploview单体型分析发现,rg12716080和rs917012位于同一个连锁不平衡区域,高度近视组与正常对照组单体型TA的频率(0.784 vs.0.719)和GA的频率(0.087 vs.0.136)比较差异均有统计学意义(x2=6.115,P=0.013;x2 =6.634,P=0.010),而两组间单体型GG的频率比较差异无统计学意义(0.123vs.0.143,x2 =0.889,P=0.346).结论 CTNND2基因rs12716080、rs917012、rs6885224、rs16901340 SNPs与高度近视不相关,但rs12716080位点和rs917012位点的单体型与高度近视相关.