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相似文献
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1.
目的 分析2012--2013年冬季中国地区诺如病毒新流行株GII.4/Sydney 2012的衣壳蛋白区核苷酸与氨基酸变异特点。方法 对已获得的22份2012--2013年冬季北京地区GⅡ.4/Sydney2012株进行全衣壳蛋白区基因扩增。从GenBank检索中国其他地区的GⅡ.4/Sydney 2012株衣壳蛋白区核苷酸序列。对获得的GII.4/Sydney 2012株的衣壳蛋白区核苷酸及氨基酸序列与往年GⅡ.4流行株进行系谱分析。结果 获得中国7个地区(北京、上海、江苏、湖州、荆州、香港和台湾)的GⅡ.4/Sydney 2012株资料共38份(至少包含完整VPl核苷酸序列)。GH.4/Sydney 2012株之间VPl核苷酸差异为0.1%~3.3%,氨基酸差异为0~3.1%。系谱分析发现GⅡ.4/Sydney2012株与Apeldoorn 2008和NewOrleans 2009起自共同的分支。中国和悉尼GH.4/Sydney 2012代表株的A、D、E抗原表位氨基酸序列组合有两种:TSRN-GTT-SNT和TSRN-STT-SNT。结论 G II.4/Sydney 2012株已在中国多个地区出现,各地区病毒株同源性较高。G H.4/Sydney 2012株的抗原表位氨基酸组合发生明显改变。  相似文献   

2.
目的 检测分析引发浙江省急性出血性结膜炎(AHC)爆发流行的病原学及毒株的分子特征.方法 采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应方法直接从AHC患者眼拭子样本中检测肠道病毒(EV)和柯萨奇病毒A24变异株(CA24v)核酸;用Hep-2细胞分离病毒,对阳性分离物扩增病毒VP1基因和3C区片段,测定核苷酸序列,应用DNAMAN和MEGA软件进行同源性和进化分析.结果 3株浙江CA24v分离株VP1基因全长915个核苷酸(nt).3C区全长549 nt,均没有nt的插人和缺失;浙江分离株Zhejiang/13/08与CA24v原型株EH24/70在VP1和3C区核苷酸同源性分别为85.3%和86.5%,与2005年新加坡分离株Singapore/DSO-26/05和2007年广东分离株Guangdong/332/07株在VP1区和3C区的核苷酸同源性分别为97.0%~99.1%和96.7%~99.5%;浙江CA24v分离株在3C区进化树的Ⅲ基因亚型B分支上(GⅢ/B),在VP1进化树的CA24v Group2分支上.结论 引起2007-2008年浙江省急性出血性结膜炎爆发流行的病原为CA24v GⅢ亚型,该病毒最有可能来源于新加坡.  相似文献   

3.
目的 分析河南省柯萨奇病毒B5(cvBs)分离株全基因序列,了解其遗传特性。方法 采集2例脑炎患者临床标本,分离病毒,提取病毒阳性分离物RNA,进行RT-PCR扩增,产物直接测序。利用DNAStar 5.01和Mega 5.05软件进行全基因序列拼接及亲缘进化分析。结果 获得2株CVB5分离株(03001N和17Y)全基因组序列,核苷酸长度分别为7408bP和7404 bP,两者核苷酸同源性为97%,同2010年河南CVB5分离株同源性最高,分别为98%和99%。5-UTR分别为747 bP和743 bP<;3-UTR区均为103 bP;病毒基因组编码区全长同为6558 bP,编码含2185个氨基酸残基的多聚蛋白,氨基酸同源性为99%。VPl区系统发生树分析显示,2株CVB5分离株进化关系较近,同近年来国内其他分离株成一簇,而2009年的河南省CVB5分离株同山东省CVB5分离株成一簇。结论河南省内存在不同CVB5株传播链的流行,此次分离株为近几年内的主要流行株。  相似文献   

4.
目的分析柯萨奇病毒B5(cvB5)云南分离株A210/KIVI/09全基因序列及其遗传特性。方法设计针对CVB5引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列,利用Mega 4.1、RDP3和SimPlot 3.5.1软件分析全基因序列。结果CVB5 A210/K1w09全基因组核苷酸序列长度为7 372 bp,编码含2 18,5个氨基酸残基的多聚蛋白;A210/KNU09全基因组核苷酸及所推导的氨基酸与CVB5/CCl0/10同源性最高,其同源性分别为92.5%和97.3%;而与其他CVB5毒株如17Y、19CSF、20CSF、1954/85,US、2000/CSF/KOR、03001N、CoxB5/Henard2010、CVB5/SD/09和Faulkner核苷酸和氨基酸同源性分别为80.1%一925%和95.0%一97.3%;A210/K_M/09与其他CVB5毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为75.3%~96.3%和85.3%,100.0%,其中与VP3、3D区段核苷酸的同源性最低。基于CVB5全长VPl基因序列进行种系进化分析,可将CVB5分为A、B、C和D4个基因型,其中C基因型可再分为CI~c4基因亚型,D基因型再分为D1。D4基因亚型。中国CVB5流行株主要聚集在C4基因亚型,国外流行株主要聚集在Dl、C2亚型。结论A2 10/KM/09分离株为C4:基因型。  相似文献   

5.
目的:从分子水平探讨2002年-2008年柯萨奇病毒A24型变异株(Coxsackie virus type A24 vari-ant,CoxA 24v)VP1基因变异情况。方法:在GenBank基因库上下载26株2002年-2008年引起AHC的CoxA 24v病毒株VP1基因核苷酸和氨基酸全序列,分析各株之间核苷酸和氨基酸序列差异;并与CoxA24原型株Joseph株核苷酸和氨基酸序列进行比较。结果:各株之间VP1基因核苷酸全序列的同源性为94.3%~100%,氨基酸全序列的同源性为97.7%~100%;与Joseph株比较,核苷酸全序列的同源性为76.4%~77.9%,氨基酸全序列的同源性为90.5%~91.8%。结论:2002年-2008年CoxA 24v病毒株VP1基因在核苷酸水平上存在着一定的变异,在氨基酸层面上也存在变异,但变异幅度相对较小。  相似文献   

6.
目的 对近年来浙江省禽流感病毒H5N1分离株的基因特性与进化重组特征进行分析.方法 通过对2002-2006年浙江省禽与人的H5N1病毒株进行全基因序列测定,采用Mega 3.0生物信息学软件分析病毒株基因特性并与相关基因型标准病毒株进行系统进化分析.结果 2002-2006年浙江省HSNl病毒株HA序列裂解位点序列含多个碱性氨基酸,符合高致病性禽流感病毒特征;与Gs/Guangdong/1/96相比,除Dk/Zhejiang/2/02和Ck/Zhejiang/8/03株外其他病毒株均在NA蛋白茎区缺失20个氨基酸.全基因系统进化分析表明,2002-2003年的分离株遗传基因基本属于当年流行的B、W、X、Y、z等基因型,但部分病毒株不同基因片段属于不同基因型.结论 浙江省禽类中也广泛存在H5N1的基因片段重组现象,2005年后的Ck/Zhejiang/24/05株及人H5N1 Zhejiang/16/06株各遗传基因基本上稳定于近年大陆流行的FJ-like基因型.  相似文献   

7.
2002年福建省急性出血性结膜炎病原分离和鉴定   总被引:2,自引:1,他引:1  
[目的]查明2002年我省急性出血性结膜炎(AHC)流行的病原。[方法]采集福州和漳州市临床诊断为AHC的患者眼拭子57份、双份血清7份。分别用Hep-2和Vero细胞对标本进行病原分离;用免疫血清微量中和试验对分离出的毒株进行鉴定;用诊断血清鉴定的4株病毒,对7例患者的双份血清进行中和抗体效价测定。[结果]从57份眼拭子标本中分离出47株(阳性率82.5%);经诊断血清微量中和试验鉴定,均为柯萨奇病毒24变异株(CA24v);7例患者双份血清经微量中和试验测定,中和抗体均呈≥4倍增长。[结论]CA24v是引起2002年我省AHC流行的病原。  相似文献   

8.
目的调查广州市l例柯萨奇A6型(CA6)手足El病合并脊髓灰质炎病毒(pv)1I型疫苗衍生株(VDPV II)感染病例,明确其感染病原及特征。方法通过现场调查获取病例相关流行病学资料,收集病例标本及其密切接触者粪便标本共16份进行肠道病毒(EV)分离鉴定。对病例就诊医院当月收集手足口病病例标本共21份,采用实时荧光RT-PCR检测手足口病相关病原,并用RT-PCR方法检测PV,CA6及PV阳性标本用RT-PCR方法扩增其VPl区基因片段进一步测序分析。结果该病例临床仅表现为手足13病症状,无急性弛缓性麻痹(AFP)。16份病例及其密切接触者粪便标本均未检出EV,人户主动搜索调查未发现类似病例。在该病例当月就诊医院收集的手足口病病例标本中,EV71阳性4例,CAl6阳性2例,包括该病例在内的其余15例均为CA6阳性,但仅该病例同时检出VDPVlI。对包括该病例在内的9例CA6阳性标本的VPI区扩增测序并进行同源性分析,9株病毒核苷酸同源性为98.9%一100.0%,推导的氨基酸同源性为96.0%~100.0%。遗传进化分析显示该9株属于同一分支。对该病例VDPV株VPl区扩增测序分析,与SabinⅡ相比,有包括U2909A在内的6个位点发生突变,其中2个位点发生氨基酸突变。遗传进化分析显示,该病例VDPV分离株不同于以往发现的VDPV。结论该病例为CA6手足口病合并VDPVII感染,其手足口病症状由CA6感染引起,推测该病例无AFP症状可能是接种脊髓灰质炎疫苗所致。分离的VDPV为当地新发现毒株,但未造成VDPV循环。  相似文献   

9.
目的 了解江苏省胃肠炎暴发疫情中诺如病毒(NoV)感染状况,并对其病原分子流行病学特征进行初步研究.方法 收集江苏省2012年10月至2013年3月7起胃肠炎暴发疫情患者肛拭子标本共67份,采用实时荧光RT-PCR定性检测,NoV阳性标本用RT-PCR扩增其聚合酶区及VP1区基因片段进-步测序分型.结果 7起疫情均为NoV感染引起的暴发,检测阳性率为67.2%(45/67).全部45株阳性毒株序列分析表明7起疫情中除-起是由GⅡ.3型感染引起外,其余6起均由新GⅡ.4感染引起,其中38株毒株与2012年澳大利亚参考株GⅡ.4/Sydney株同源性均在99%以上.进-步对6株新型Sydney变异株的衣壳蛋白VP1区扩增测序,并与9株近年流行株的VP1区氨基酸序列比对,发现该6株毒株的VP1区部分氨基酸已出现突变,而氨基酸位点的突变是与病毒抗原性密切相关.结论 江苏省7起疫情暴发聚集且感染毒株型别单-,说明已出现新NoV变异株,其原型株GⅡ.4/Sydney已在国外多地引起暴发和流行,提示该毒株将是今后防控监测的重点.  相似文献   

10.
目的分析近几年浙江省甲3亚型流行性感冒(流感)流行株血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因的特性、变异与流感流行的关系。方法选择浙江省1998—2005年流感流行期间分离的甲3亚型代表株25株,提取病毒RNA,扩增HA1和NA基因,进行序列测定,用BioEdit软件分析处理。结果浙江省近几年甲3亚型流感流行株在HA1区的核苷酸长度均为987bp,编码329个氨基酸;在NA区的核苷酸长度为1362bp,编码454个氨基酸。1998—2005年甲3亚型流感病毒HA1区与NA区的氨基酸同源性分别在90.9%~99.3%与95.2%~99.5%之间,HA1区的变异较NA区更大。这8年间在HA1区共发生了30个氨基酸的替代,其中14个氨基酸位点涉及HA1区的4个抗原决定簇;NA区发生了21个氨基酸替代,其中5个氨基酸位点涉及NA区的3个抗原决定簇。在1998与2002年无论是HA1区还是NA区,均产生了较大的变异,在氨基酸进化树上也形成了独立的分支。近年的甲3亚型毒株HA1区有11个糖基化位点,较早期毒株A/Aichi/2/68增加了5个,仅1998年至今的8年中就增加了3个。结论浙江省1998与2002年的二次较大规模的甲3亚型流感流行均与病毒的抗原性漂移有关。  相似文献   

11.
The perimenopause is a time of physiologic, intrapsychic, and social/cultural changes for middle-aged women, who might require assistance to maintain and enhance their sexuality during this transition. Attending to the biologic, psychological, relational, social, and cultural domains, and encouraging perimenopausal women to address these developmental challenges of midlife facilitates the healthy adaptation to this biologic and social transition. Emphasizing the physiologic changes that affect sexual arousal, and educating about enhancing and attending to arousal, might assist middle-aged women to increasingly enjoy their sexuality.  相似文献   

12.
Of 328 women interviewed at a postnatal clinic, 166 (50.6%) had resumed sexual intercourse, the average interval after delivery being 5 weeks postpartum. Of the various social and clinical factors examined, resumption of coitus was related only to marital status, vaginal laceration, and continuing vaginal bleeding. Of the sexually active group, 89% were practicing effective contraception.  相似文献   

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1. Eight women maintained on a constant diet throughout a single menstrual cycle were studied for cyclical changes in body-weight, carbohydrate, fat and protein metabolism. 2. A cyclical variation in weight occurred with two phases corresponding to the time of ovulation and menstruation. 3. Creatinine and nitrogen excretion in the urine also tended to be higher in the luteal phase. 4. Analysis of gas exchange in a respiratory chamber for 24 h periods at intervals during the cycle suggested that carbohydrate utilization tended to be less in the early follicular phase. 5. Feeding with a mixed diet produced marked increases in carbohydrate utilization during the day with little change in fat utilization from the fasting state. Carbohydrate utilization was less when fasting at night and tended to be less when fed during the day in the early follicular phase of the menstrual cycle. 6. Weight changes were not readily ascribed to changes in colonic function, or in glycogen or body protein storage.  相似文献   

16.
In the continuing search for a simple, noninvasive, reliable method to detect ovulation, phosphorus (P) levels have been measured in women across a menstrual cycle. Salivary P has been reported to increase significantly in women periovulatory. Reports of serum P show no such periovulatory peak. We measured serum P in nine ovulatory and two anovulatory women during one menstrual cycle. Indirect indicators of ovulation were biphasic BBT curve and luteal phase serum progesterone more than 3 ng/ml. No significant periovulatory change in serum P was found, only small fluctations ranging from 0.99–2.76 mg/dl. The absence of a periovulatory serum phosphorus peak in this and other investigations of serum P suggests that if there is altered P metabolism during the menstrual cycle, it is not reflected in the serum. Other mechanisms, such as urinary or salivary excretion, may be operating to maintain serum P within the physiological range. This hypothesis needs to be explored.  相似文献   

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