长链非编码RNA在肝癌中表达谱的变化

目的 观察长链非编码RNA(lncRNA)在正常肝组织及肝癌中表达谱的变化.方法 利用lncRNA芯片技术检测人正常肝脏、肝癌组织LncRNA表达谱的差异,经过对原始数据进行预处理、均一化后,筛选出差异表达LncRNA,进行分析.结果 与正常肝脏组织比较,其中2倍以上变化并且差异有统计学意义(P＜0.05)的lncRNA,认为是差异表达的lncRNA,2倍以上变化的共837条,占所有lncRNA的4.30%;2倍以上升高的共325条;2倍以上降低的共512条;5倍以上升高为共47条;5倍以上降低的共69条;10倍以上升高为共7条;10倍以上降低的共6条.结论 肝癌与正常肝脏组织比较,LncRNA表达谱发生了显著变化,差异性lncRNAs中,可能包括相当一部分的促癌lncRNA和抑癌lncRNA,参与肝癌分子调节机制的关键环节.

Abstract：

Objective To analyze the expression profile variation of long non-coding RNA (IncRNA) in normal hepatic tissue and hepatocellular carcinoma.Methods Use lncRNA microarray technology to inspect the difference of lncRNA expression profile between normal human liver and hepatocellular carcinoma,screen out the lncRNA with differential expression after pretreatment and homogenization of raw data,and make hierarchical clustering and volcano scatter diagram analysis.Results Compare with normal hepatic tissue,and 837 lncRNA which have more than 2 times variation and significant difference (P ＜0.05 ) by statistical analysis are regarded as lncRNA with differential expression,accounting for 4.30% of all IncRNA ;while 325 increase more than 2 times and 512 reduce more than 2 times;47 increase more than 5 times;69 reduce more than 5 times;7 increase more than 10 times;and 6 reduce more than 10 times.Conclusion LncRNA expression profile of hepatoeellular carcinoma changes significantly in comparison with normal hepatic tissue.The different lncRNAs may include a fair proportion of cancer-promoting IncRNA and cancer-inhibiting lncRNA,participating in the critical section of regulatory mechanism in liver cancer molecule.     

长链非编码RNA肝癌高表达转录本与原发性肝癌关系的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是一类序列长度大于200nt,缺乏编码蛋白质功能的RNA,其在众多生物学过程中具有重要作用。肝癌高表达转录本(HULC)是在肝癌组织中发现的一种特异性高表达lncRNA。现有研究表明,lncRNAHULC与肝癌及其相关疾病(如病毒性肝炎、肝炎后肝硬化)密切相关,可通过表观遗传调控、增加异常脂质代谢、促进血管生成及上皮-间质转化等机制涉及肝癌的发生、发展及预后;此外,lncRNAHULC还具有成为肝癌诊断标志物及治疗靶点的潜在价值。笔者就lncRNAHULC与原发性肝癌关系的研究进展予以综述。     

长链非编码RNA在肝癌中的研究进展

长链非编码RNA(lnc RNA)是一类200~100 000核苷酸长度且无蛋白质编码功能的一类RNA分子。越来越多的证据表明,lnc RNA主要通过在转录、转录后以及表观遗传水平参与基因的表达调控,并以此影响肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭及转移等过程,与原发性肝癌发生、发展的病理生理机制及患者预后密切相关。原发性肝癌中多种显著异常表达的lnc RNA,有望成为原发性肝癌诊断和预后的新的分子标志物。笔者在简要介绍lnc RNA的基础上,对近年来lnc RNA在肝癌中的研究进展进行综述。     

长链非编码RNA AK125512在肝癌组织中的表达及其临床意义

目的 检测长链非编码RNA AK125512 在肝癌、癌旁肝组织中的表达情况,探讨其与临床病理指标的关系及作为预测肝癌患者术后预后标记物的潜在价值。方法从本课题组已完成表达谱芯片（GSE54238）中筛选明显差异表达lncRNA-AK125512,采用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）法检测lncRNAAK125512在肝癌、癌旁肝组织中的表达;x²检验分析肝癌组织中lncRNA-AK125512表达量与临床病理指标相关性;应用Log-rank检验和COX回归模型分析肝癌组织中lncRNA-AK125512表达量与肝癌患者术后预后的关系。结果lncRNA-AK125512在肝癌组织中较癌旁肝组织明显低表达（P＜0.0001）;肝癌组织中lncRNA-AK125512的表达水平与Edmondson分级（P=0.022）、肿瘤包膜完整与否（P=0.005）、血AFP（P=0.018）明显相关;肝癌组织中lncRNA-AK125512相对低表达患者肝癌切除术后无瘤生存期（P=0.0041）及总体生存期（P=0.0008）均显著缩短。肝癌组织中lncRNA-AK125512相对低表达是影响肝癌患者术后无瘤生存期（P=0.037）、总体生存期（P=0.003）的一个独立危险因素。结论lncRNA-AK125512有望成为预测肝癌患者术后预后的一个新的潜在标记物。     

长链非编码RNA在肝细胞性肝癌中的作用

肝细胞型肝癌(HCC)是常见的消化系统恶性肿瘤,也是与癌症相关死亡的第三大主要原因,目前缺乏有效的治疗手段.长链非编码RNA (lncRNA)是一种长度超过200个核苷酸的非编码转录本.目前,lncRNA被认为在HCC的增殖、凋亡、转移、耐药及肿瘤干细胞的调节起重要作用.笔者结合该领域的最新研究进展概述了lncRNA的...     

长链非编码RNA MALAT1在肝癌组织中的表达及其在肝癌细胞增殖与侵袭转移中的作用

目的:探讨长链非编码RNA MALAT1在肝癌组织中的表达及意义。方法:用qRT-PCR检测85例肝癌组织及其配对癌旁组织中MALAT1的表达,分析MALAT1的表达与肝癌患者临床病理因素的关系;在肝癌SMMC-7721细胞中分别过表达与敲除基因MALAT1后,通过CCK-8与Transwell实验检测肝癌细胞增殖与侵袭转移能力的改变。结果:MALAT1在肝癌组织中的表达明显高于癌旁正常组织(P0.01);MALAT1在肝癌组织中的表达与肿瘤大小、肝癌的分化程度、TNM分期、淋巴结转移明显有关(均P0.05)。肝癌SMMC-7721细胞过表达MALAT1后增殖、侵袭与转移能力明显增强,而敲低MALAT1后增殖、侵袭与转移能力明显减弱(均P0.05)。结论:MALAT1在肝癌组织中表达上调,MALAT1可促进肝癌细胞增殖、侵袭与转移,故可能与肝癌的发生发展密切相关。     

长链非编码RNA HOST2对胰腺癌细胞增殖迁移和侵袭的影响

目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)HOST2对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响及机制。方法:qRT-PCR检测正常胰腺上皮细胞系HPDE6-C7及胰腺癌细胞系Panc-1、AsPC-1、BxPC-3、HPAC中lncRNAHOST2表达水平。将Panc-1细胞分别转染siRNA-HOST2(si-HOST2组)和阴性对照序列(阴性对照组)后,用MTT法测定细胞增殖,细胞划痕和Transwell实验测定细胞迁移和侵袭,Westernblot测定上皮-间质转化(EMT)相关蛋白vimentin、Snail、Twist的表达。以无转染的Panc-1细胞为空白对照组。结果:与正常胰腺上皮细胞HPDE6-C7相比,lncRNAHOST2在各胰腺癌细胞系中的表达均明显上调(均P0.05)。与空白对照组比较,si-HOST2组细胞增殖、迁移和侵袭能力均明显减弱,vimentin、Twist1、Snail蛋白相对表达量均明显下调(均P0.05),而阴性对照组上述指标均无明显变化(均P0.05)。结论:lncRNAHOST2在胰腺癌细胞中高表达,且与胰腺癌增殖、迁移和侵袭密切相关,其机制可能与调节EMT相关蛋白的表达有关。     

长链非编码RNA与前列腺癌

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸,缺少特异开放阅读框,不具备蛋白质编码功能的RNA分子。近年来许多研究表明其可在表观遗传学、转录及转录后等多个水平参与基因的表达调控,影响细胞的生长发育、增殖、分化、代谢和凋亡等重要生理过程。lncRNA的异常表达与肿瘤的发生、发展、侵袭、转移及预后有着密切的联系。前列腺癌的发病是一个多因素、多步骤的复杂过程,而基因表达的异常在其中发挥着重要的作用。本文就lncRNA在前列腺癌中的作用及研究进展进行综述,为临床预防、诊断和治疗前列腺癌提供新策略。     

肝癌侵袭转移与新的长链非编码RNA UC001kfo的关系

目的 探讨新的长链非编码RNA(lncRNA) UC001 kfo在肝癌中的表达及与肝癌侵袭、转移的关系.方法 收集肝脏组织60例,分为肝硬化组、肝癌组、癌旁组、门静脉转移肝癌组.原位杂交检测UC001 kfo和ACTA2(α-平滑肌肌动蛋白的基因)在肝癌组织的表达.结果 UC001kfo在肝硬化组不表达或低表达,在其他3组均为阳性表达,以上4组的表达值分别为113.30±11.79、137.59±6.23、148.78±8.23、160.28 ±9.47,方差分析显示UC001kfo表达差异有统计学意义(P＜0.01),4组间的差异有统计学意义(P＜0.01),分别为肝硬化组＜癌旁组织＜肝癌组＜门脉癌栓组.ACTA2的表达分别为109.89±9.74、125.22±32.16、149.06±8.43、156.57±8.86,ACTA2表达差异有统计学意义(P＜0.01),4组间差异有统计学意义(P＜0.05),表达分别为肝硬化组＜癌旁组织＜肝癌组＜门脉癌栓组.结论 UC001 kfo和ACTA2在肝癌中表达明显增加,特别是门静脉癌栓组,UC001kfo可能通过调控ACTA2的表达促进肝癌的侵袭转移.     

基因间长链非编码RNA?524346在肝细胞癌中的?表达及临床意义

目的检测基因间长链非编码RNA 524346(long intergenic non-coding RNA 524346,LincRNA 524346)在肝细胞癌患者组织(癌、癌旁)及细胞系(正常肝细胞系LO2及肝癌细胞系SMMC-7721、HepG2和Huh7)中的表达情况,探讨LincRNA 524346与肝细胞癌临床病理特征的关系。方法应用实时荧光定量PCR法(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)检测LincRNA 524346在61例肝细胞癌患者癌组织、配对癌旁组织以及肝癌细胞系的表达水平,分析其与肝细胞癌患者临床病理特征之间的相关性。用受试者工作曲线(receiver operating characteristics,ROC)评价肝细胞癌组织中LincRNA 524346的表达水平在肝细胞癌早期诊断中的效能。结果 LincRNA 524346在83.6%(51/61)肝细胞癌患者的癌组织中较配对癌旁组织表达下调,差异有统计学意义(P0.01);LincRNA 524346的表达水平与肝细胞癌患者的病理分期(P=0.021)、肿瘤数目(P=0.013)、是否合并门静脉癌栓(PVTT)(P0.01)、肝硬化(P=0.005)和微静脉浸润(MVI)(P0.001)具有显著相关性。结论 LincRNA 524346在肝细胞癌组织中表达降低,其有望作为潜在肝细胞癌早期诊断、转移的分子标志物。     

外泌体长链非编码RNA在肝癌中的研究进展

外泌体是由机体内活细胞分泌的大小约40～160 nm、具有脂质双层膜的细胞外囊泡,内含多种蛋白质、脂质、mRNA、非编码RNA、DNA,可经自分泌、旁分泌或循环系统被细胞或远端靶组织及器官吸收,发挥着物质交换、信息传递、诱导免疫应答、抗原呈递、介导炎症反应、组织修复、调节细胞微环境的作用。肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是世界上第六大常见的癌症,也是全球癌症死亡率的第二大原因。研究表明外泌体携带的长链非编码RNA参与介导HCC的发生发展,且在HCC的早期诊断、治疗以及临床预后方面发挥着重要作用。全文旨在概述长链非编码RNA对HCC恶性生物学行为的调控作用,以及作为生物标志物的潜在诊断和预后评估价值,以期为HCC的基础与临床研究提供参考。     

长链非编码RNA CBR3-AS1在胆管癌中的表达及其临床意义

目的:探讨长链非编码RNA CBR3-AS1(lncRNA CBR3-AS1)在胆管癌(CCA)中表达状态及其临床意义。方法:用qRT-PCR检测lncRNA CBR3-AS1在CCA组织与癌旁组织以及CCA细胞与正常胆管上皮细胞中的表达,分析lncRNA CBR3-AS1表达与CCA患者临床病理参数及生存率的关系。将胆管癌细胞分别转染lncRNA CBR3-AS1过表达质粒(过表达组)、阴性对照质粒(对照组)及lncRNA CBR3-AS1沉默序列(沉默组),用MTT实验与Transwell实验检测各组细胞的增殖与侵袭能力。结果:lncRNA CBR3-AS1的表达在胆管癌组织中明显高于癌旁组织,在胆管癌细胞系中明显高于正常胆管上皮细胞(均P0.01)。lncRNA CBR3-AS1表达与CCA患者淋巴结转移、TNM分期和术后复发明显有关(P0.05)。lncRNA CBR3-AS1高表达患者总生存率明显低于lncRNA CBR3-AS1低表达患者(P=0.004)。lncRNA CBR3-AS1表达(P=0.020)与TNM分期(P=0.014)是影响CCA患者总生存率的独立危险因素。与对照组CCA细胞比较,过表达组CCA细胞增殖与侵袭能力明显增高,沉默组CCA细胞增殖与侵袭能力明显降低(均P0.05)。结论:lncRNA CBR3-AS1在胆管癌中表达升高,升高的lncRNA CBR3-AS1与CCA的恶性临床病理特征及患者的不良预后密切相关。     

长链非编码RNA与肿瘤

已经有越来越多的证据表明基因组的非编码序列的转录对于生命活动具有重要意义。相对于蛋白编码序列以及各种小分子RNA,长链非编码RNA（lncRNA）的研究还仅仅处于起步阶段,其功能与调控机制仍有待进一步研究。本文对目前关于lncRNA与肿瘤关系的研究进展进行综述,认为lncRNA可能为肿瘤诊断和治疗提供新依据和靶点。     

长链非编码RNA与膀胱癌的研究进展

近年研究发现长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在正常细胞与肿瘤细胞的基因表达调控中起着重要作用,且lncRNA的异常表达与肿瘤发生、进展密切相关。lncRNA可通过类似癌基因或抑癌基因的作用,参与肿瘤细胞的增殖、侵袭、转移等调控过程。由于lncRNA在肿瘤中表达的高特异性,因此,lncRNA可作为疾病的诊断及预后指标,并有望成为疾病治疗的新靶点。本文对近年来lncRNA与膀胱癌发生、进展及诊治等的研究进展作一综述,为临床膀胱癌的诊断和治疗提供新的思路。     

长链非编码RNA与前列腺癌的研究进展

长链非编码RNA（Longnon-coding RNA,LncRNA）在人类生命活动过程中发挥着重要的作用,并维持着正常的细胞功能,然而它们的异常表达与肿瘤发生密切相关。近年来,越来越多的研究表明,LncRNA通过类似癌基因或抑癌基因的作用,参与前列腺癌细胞的增殖、侵袭、转移等调控过程,并由于特定LncRNA在肿瘤当中表达的高特异性,可作为前列腺癌诊断及预后的指标。本文对近年来LncRNA与前列腺癌发生、发展的关系及诊治的研究进展作一综述。     

长链非编码RNA与肿瘤

已经有越来越多的证据表明基因组的非编码序列的转录对于生命活动具有重要意义.相对于蛋白编码序列以及各种小分子RNA,长链非编码RNA(IncRNA)的研究还仅仅处于起步阶段,其功能与调控机制仍有待进一步研究.本文对目前关于IncRNA与肿瘤关系的研究进展进行综述,认为IncRNA可能为肿瘤诊断和治疗提供新依据和靶点.     

长链非编码RNA LINC00313与miR-342-3p/膜联蛋白A2轴在肝细胞癌细胞中的作用与机制

背景与目的 肝细胞癌（HCC）是造成癌症相关性死亡的常见原因之一，研究表明长链非编码RNA（lncRNA）调控微小RNA（miRNA）的表达，进而通过抑制靶mRNA翻译或促进mRNA降解来参与肿瘤发生及进展过程。LINC00313作为一种具有致癌活性的lncRNA参与肿瘤发生及进展过程；膜联蛋白A2（ANXA2）在包括HCC的多种恶性肿瘤中表达上调，促进恶性表型的发生，并可能受上游miR-342-3p的调控。因此，本研究探讨LINC00313、miR-342-3p、ANXA2在HCC细胞中的表达及其相互关系。方法 用qRT-PCR与Western blot检测人肝实质细胞及HCC细胞系（Li-7、HuH-7、Hep3B2.1-7）中LINC00313、miR-342-3p及ANXA2表达。将体外培养的Li-7细胞分为空白对照组（无处理）、LINC00313 siRNA组（转染LINC00313 siRNA）、miR-342-3p模拟物组（转染miR-342-3p模拟物）、共转染阴性对照组（转染阴性siRNA序列与阴性miRNA序列）、共转染组（转染LINC00313 siRNA及miR-342-3p抑制物），用qRT-PCR与Western blot检测各组细胞LINC00313、miR-342-3p及ANXA2表达；MTT实验及平板集落形成实验检测各组细胞增殖；进行TUNEL染色检测各组细胞凋亡；Transwell侵袭及Western blot分别检测各组细胞侵袭数目及上皮-间充质转化（EMT）相关蛋白波形蛋白（vimentin）、E-钙黏蛋白（E-cadherin）表达；免疫荧光染色检测各组细胞Bcl-2关联X蛋白（Bax）/B淋巴细胞瘤-2（Bcl-2）；双荧光素酶报告实验分析Li-7细胞中LINC00313对miR-342-3p、miR-342-3p对ANXA2的靶向调控。建立皮下裸鼠异种移植瘤模型，验证LINC00313沉默对Li-7细胞体内生长的影响。结果 与人肝实质细胞比较，Li-7、HuH-7、Hep3B2.1-7细胞的LINC00313、ANXA2 mRNA及蛋白表达均明显升高，而miR-342-3p表达均明显降低（均P<0.05）。与对照组比较，LINC00313 siRNA组、miR-342-3p模拟物组细胞ANXA2 mRNA及蛋白表达、增殖率、集落生成率、侵袭细胞数目、vimentin蛋白表达均明显降低（P<0.05），miR-342-3p表达、凋亡率、E-cadherin蛋白表达、Bax/Bcl-2比值均明显升高（均P<0.05）；与LINC00313 siRNA组比较，共转染组细胞ANXA2 mRNA及蛋白表达、增殖率、集落生成率、侵袭细胞数目、vimentin蛋白表达均明显升高，而miR-342-3p表达、凋亡率、E-cadherin蛋白表达、Bax/Bcl-2比值均明显降低（均P<0.05）。Li-7细胞中，LINC00313可靶向下调miR-342-3p表达，miR-342-3p可靶向下调其ANXA2表达（均P<0.05）。体内实验结果显示，与无处理的Li-7细胞移植瘤比较，LINC00313敲低的Li-7细胞移植瘤的体积与质量均明显降低，肿瘤组织中LINC00313、ANXA2 mRNA及蛋白表达均明显降低，而miR-342-3p表达明显升高（均P<0.05）。结论 LINC00313在HCC细胞中的表达上调，LINC00313可能通过抑制miR-342-3p而增加后者靶基因ANXA2的表达，进而促进HCC细胞的恶性表型。     

长链非编码RNA与肿瘤

已经有越来越多的证据表明基因组的非编码序列的转录对于生命活动具有重要意义.相对于蛋白编码序列以及各种小分子RNA,长链非编码RNA(IncRNA)的研究还仅仅处于起步阶段,其功能与调控机制仍有待进一步研究.本文对目前关于IncRNA与肿瘤关系的研究进展进行综述,认为IncRNA可能为肿瘤诊断和治疗提供新依据和靶点.     

长链非编码RNA GAS8-AS1与微小RNA 135b在肝细胞癌中的表达及临床意义

背景和目的：大量研究表明,长链非编码RNA (lncRNA)与微小RNA (miRNA)及其靶基因之间内源性竞争的调控模式与恶性肿瘤的发生发展密切相关。笔者团队前期通过软件预测发现,lncRNA GAS8-AS1和miR-135b之间存在结合位点,但两者在肝细胞癌（HCC）中是否存在竞争关系及其作用尚不清楚。因此,本研究探讨lncRNA GAS8-AS1和miR-135b在HCC组织中的表达及其临床意义。方法：收集2017年2月—2019年2月在青海大学附属医院行手术切除的110例HCC患者的癌组织及癌旁组织标本,通过qRT-PCR检测lncRNA GAS8-AS1和miR-135b的表达,分析两者与患者临床病理特征及预后的关系。结果：lncRNA GAS8-AS1在HCC组织中的表达明显低于癌旁组织,而miR-135b在HCC组织中的表达明显高于癌旁组织（均P<0.05）。两者的表达水平均与HCC患者的Edmondson分期、TNM分期、分化程度及淋巴结转移情况有关（均P<0.05）。lncRNA GAS8-AS1低表达患者与miR-135b高表达患者的3年总生存率分别明...     

长链非编码RNA在胰腺癌转移中的研究进展

胰腺癌侵袭程度高,初诊即有局部淋巴结和远处转移。长链非编码RNA(IncRNA)最初被认为是基因转录组的"噪音"而未受到重视。但随着研究的深入,学者们发现lncRNA在人类基因组普遍被转录且起着重要的调控作用,与肿瘤的发生发展及转移密切相关。胰腺癌中有大量的lncRNA表达失调,其根据自身的亚细胞定位和结构不同,在胰腺癌转移中参与不同的生物学调控,涉及到上皮-间质转化(EMT),自噬,肿瘤代谢,关键驱动基因等多方面。研究lncRNA在肿瘤转移中的作用及其分子机制,有望为胰腺癌提供新的防治策略和新的治疗靶点。