嘉兴地区幽门螺杆菌临床菌株cagA和vacA优势基因型研究

目的研究嘉兴地区幽门螺杆菌（Hdicobacter pylori，Hp）临床菌株cagA和vacA优势基因型状况及与疾病的关系。方法从胃、十二指肠疾病患者的胃粘膜活检组织中分离培养出44株HD。采用PCR检测cagA基因和vacA基因的信号区（s）和中间区（m）亚型的分布，用卡方检验分析各基因在不同消化性溃疡或慢性胃炎中的Hp差异。结果44株Hp中cagA的阳性率为100％（44／44），vacA sla／m2基因型阳性率为61．4％（27／44），vacA sla／mlb为25．0％（11／44），vaeA sla／mlb-m2为9．0％（4／44），其中有2株HD同时检出sla／m2和sh／mlb-m2基因，另有2株Hp未检测到m区基因。慢性胃炎患者Hp的vacA sla／m2和vacA sla／mlb基因阳性率赐显高于消化性溃疡患者的Hp（P〈0．05），其余基因在不同类型疾病中的分布无统计学差异（P〉0．05）。结论cagA＋vacA sla／m2、cagA＋vacA sla／mlb均为嘉兴地区消化性溃疡或慢性胃炎患者感染的Hp的优势基因型，部分患者可混合感染多株不同vacA基因型的HD。     

马鞍山市志贺菌福氏4c亚型毒力基因分布

目的了解马鞍山地区志贺菌福氏4c亚型感染株毒力分布特点,分析其流行模式。方法应用PCR技术,检测48株志贺菌福氏4c亚型菌株的ipaH,ial、set、sen等4种毒力基因。结果ipaHi、als、ets、en等4种毒力基因在48株志贺菌福氏4c亚型的分布分别为100?%,96%,88%;其毒力基因模式主要分成5型,其中Ⅰ型是本地区主要流行模式。结论马鞍山地区志贺菌福氏4c亚型普遍携带ipaHials、et、sen等4种毒力基因;毒力强、感染力强是该血清型成为本地主要流行型别的主要原因。     

三峡水库不动杆菌分离株的毒力基因分布与进化分析

目的 比较不同不动杆菌分离株的毒力基因分布特征有助于探究不动杆菌的毒力基因与致病性之间的关系。方法用PCR检测88个毒力基因在5株致病性不动杆菌基因组中的分布情况，筛选出共有毒力基因，然后扩增测序分析共有毒力基因在40株不动杆菌分离株中的同源性，并通过16S r RNA测序构建分离株的系统发育树。结果 PCR扩增结果发现，88个毒力基因分别在鲍曼不动杆菌和不动杆菌AC1、AC15、AC18、AC21分离株中检测出39、16、38、35和33个，88个毒力基因在五株致病性不动杆菌中分布存在差异。ompA、basD、zigA为5株致病性不动杆菌的共有毒力基因，3个共有毒力基因在40株不动杆菌分离株中的检出率分别为97.5%、77.5%和100%。16S rRNA系统发育树结果显示，除AC38之外，其余分离株的同源性较近。结论 不动杆菌分离株的毒力基因分布有明显差异，但存在共同的毒力基因，ompA和zigA毒力基因在所有检测的菌株中高度保守可作为不动杆菌临床检测的参考靶基因。     

下呼吸道分离肺炎克雷伯菌CRISPR-Cas系统分布及其与细菌毒力的相关性

目的 了解下呼吸道分离肺炎克雷伯菌规则间隔的短回文重复序列及相关蛋白(CRISPR-Cas)系统分布及其与细菌毒力的相关性。方法 收集2019年8月-2021年12月淄博市第一医院下呼吸道标本分离的200株非重复肺炎克雷伯菌进行毒力基因、CRISPR-Cas系统基因检测，分析下呼吸道分离肺炎克雷伯菌中CRISPR-Cas系统的亚型分布、CRISPR-Cas系统亚型与细菌毒力基因的相关性。结果 200株下呼吸道分离的肺炎克雷伯菌中除毒力基因prmpA2外，毒力基因iucA、iroB、prmpA、peg-344的阳性率均在50%以上；200株菌中携带CRISPR-Cas系统I-E*型菌株50株，占比25.00%,携带CRISPR-Cas系统I-E型菌株21株，占比10.50%;质谱图谱聚类分析发现，CRISPR-Cas系统I-E*型肺炎克雷伯菌具有同源性，CRISPR-Cas系统I-E型菌株中未发现聚类现象；毒力基因在携带CRISPR-Cas系统I-E*型菌株中的阳性率高于CRISPR-Cas系统基因阴性菌株(P<0.05),毒力基因在CRISPR-Cas系统I-E型阳性菌株及CRI...     

不同类型慢性胃炎患者幽门螺杆菌的分离培养、耐药与毒力基因研究

目的 研究不同类型慢性胃炎患者幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,Hp）的感染情况,检测分离株的耐药性与毒力基因。方法 采集患者胃黏膜,分离Hp并进行药敏试验。PCR扩增克拉霉素、左氧氟沙星耐药相关基因23S rRNA、gyrA及毒力基因cagA、vacA、iceA,测序并分析23S rRNA和gyrA扩增产物的突变位点。分析慢性胃炎类型与Hp的分离率、耐药性和毒力基因的关系。结果 120例患者共分离获得45株Hp（37.5%）。Hp对甲硝唑、克拉霉素、左氧氟沙星、阿莫西林、呋喃唑酮和四环素的耐药率分别为97.8%、28.9%、28.9%、4.4%、0和0。在克拉霉素和左氧氟沙星耐药菌株中,23S rRNA、gyrA基因最常见的突变位点分别为A2143G（76.9%）和N87K（38.5%）。cagA、vacA s1a、vacA s1b、vacA s1c、vacA s2、vacA m1、vacA m2、iceA1、iceA2阳性率分别为97.8%、97.8%、0、95.6%、0、37.7%、62.2%、71.1%、24.4%。在不同类型慢性胃炎组间,Hp的分离率差异有统计学意义（χ2 = 13.299,P＜0.05）,分离株的耐药率差异均无统计学意义（均P＞0.05）,iceA1、iceA2的分布差异有统计学意义（均P＜0.05）。结论 不同类型慢性胃炎患者Hp的分离率不同,Hp感染治疗可选呋喃唑酮和四环素,iceA1和iceA2毒力基因可能与胃炎类型有关。     

幽门螺杆菌的毒力基因、vacA基因亚型与上消化道疾病关系的研究

目的研究镇海地区幽门螺杆菌(Hp)尿素酶基因(ureA)、细胞毒素相关基因(cagA)、空泡细胞毒素基因(vacA)及vacA基因亚型与上消化道疾病之间的关系。方法用普通聚合酶链反应(PCR)技术,测定84株从上消化道疾病患者胃窦黏膜中分离获得的Hp的ureA基因、cagA基因、vacA基因、vacA基因亚型。结果84株Hp中,ureA、cagA、vacA基因的阳性率分别为100.00%、90.48%、95.24%,cagA、vacA在胃炎、消化性溃疡的阳性率高于胃癌(P<0.05);vacAm2基因的阳性率为79.76%,明显高于vacAm1a(20.24%)、vacAm1b(8.33%)及vacAm1bm2(4.76%),vacAm2在胃炎、消化性溃疡的阳性率高于胃癌(P<0.05),其余3个基因亚型阳性率差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论镇海地区Hp相关性上消化道疾病患者感染Hp以ureA阳性、cagA阳性、vacAm2亚型占优势,且均在消化性溃疡及胃炎中的检出率更高。     

大连市儿童手足口病肠道病毒71型基因型别和毒力位点分析

目的分析大连市引起儿童手足口病(hand-foot-mouth Disease,HFMD)的肠道病毒71型(Enterovirus71,EV71)VP1基因特征,寻找与毒力相关的基因位点。方法用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法对HFMD轻症和重症临床标本进行EV71的VP1全基因扩增,分析扩增产物同源性,并与各基因型代表株构建进化树,比对分析轻症和重症间EV71的VP1基因。结果扩增产物核苷酸和蛋白质序列与C4a亚型具有较高的同源性,在系统进化树上,与C4a亚型处于同一分支。轻症和重症EV71的VP1基因无共同差异位点。结论大连市HFMD病原体EV71为C4a亚型,EV71存在多种传播链,在VP1基因上未发现与毒力相关的基因位点。     

幽门螺杆菌毒力基因表达与反流性食管炎发病率及病情严重程度的相关性

目的探讨Hp毒力基因表达与反流性食管炎发病率及病情严重程度的相关分析。方法选取2018年6月-2019年6月在本院确诊为反流性食管炎的患者90例作为观察组,并以同期90例健康体检者作为对照组,所有患者均检测血清幽门螺杆菌感染情况,分析Hp毒力基因Vac A、Cag A表达情况,Logistic回归分析探讨患者Hp毒力基因与反流性食管炎发病及病情的关系。结果以Hp阴性为参照,发现Cag A+Hp感染的患者发生反流性食管炎的风险是Hp阴性患者的1. 5倍,Vac A+Hp感染的患者发生反流性食管炎的风险是Hp阴性患者的1. 7倍,Cag A+Vac A+Hp的患者是Hp阴性患者风险的1. 9倍; Cag+Vac+Hp感染的反流性食管炎患者血清中PGI、PGⅡ、胃泌素水平均低于Hp-、Vac A+、Cag A+的患者(P 0. 05)。结论毒力型Hp感染患者与反流性食管炎发病及病情严重程度密切相关。     

中国香港地区幽门螺杆菌毒力基因型与十二指肠溃疡关系的研究

目的：研究幽门螺杆菌（Hp）的重要毒力因子vacA，cagA，iceA及插入序列IS在中国香港地区分离菌株中的分布特征及其与十二指肠溃疡的关系。方法：采用聚合酶链反应（PCR）和Southern blot方法，对72例证实为Hp感染的胃十二指肠疾病患者的胃黏膜标本直接进行检测。结果：72例患者中，69例（95.8％）感染的Hp菌株为vacA sIc型，3例（4.2％）为sIa型；23例（31.9％）为vacAm1b型，46例（63.9％）为vacAm2型；6例（8.3％）为混合型。63.9％（46/72）的患者感染菌株为iceA1型，29.2％（21/72）为iceA2型。CagA的阳性率为88.9％（64/72）。结论：Hp毒力因子vacA，cagA和iceA在香港菌株中的分布有自己的特点；未发现特定cagA，vacA和iceA基因型别与DU相关。     

某院幽门螺杆菌的抗生素耐药筛查及其与cagA、vacA基因多态性关系探讨

目的 探讨某院幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)的抗生素耐药筛查情况及其与细胞毒素相关基因A(cytotoxin associated gene A,cagA)和细胞空泡毒素基因A(vacuolating roxin A,vacA)基因多态性的关系。 方法 选取2019年8月—2020年8月,郑州某医院收治的320例上消化道疾病患者,从胃窦黏膜标本中分离培养72株Hp,采用琼脂稀释法检测Hp对甲硝唑、替硝唑、阿莫西林、利福平、四环素、克拉霉素的耐药率,采用多重PCR鉴定cagA、vacA基因型,分析Hp对甲硝唑、替硝唑、阿莫西林耐药与cagA、vacA基因型的关系。 结果 Hp菌株对甲硝唑耐药率最高66.67%,其次为替硝唑37.50%,阿莫西林耐15.28%,对利福平、四环素、克拉霉素耐药率低,不同药物间耐药率差异有统计学意义(χ²=119.620,P<0.001);Hp对甲硝唑、替硝唑、阿莫西林耐药与cagA基因型、vacA信号区基因亚型、vacA中间区基因亚型、vacA基因亚型差异均无统计学意义(P>0.05)。 结论 Hp菌株对甲硝唑耐药率较高,Hp对甲硝唑、替硝唑、阿莫西林耐药与cagA、vacA基因型无关。     

2001-2008年北京市居民被动吸烟情况分析

吸烟产生的支流烟雾中尼古丁等有害物质的含量是主流烟雾的5.1倍,主要由被动吸烟者吸入.被动吸烟越来越引起社会各界的关注,已被确认是患肺癌、冠心病、成人慢性呼吸系统疾病和儿童哮喘等疾病的危险因素^[1].主动吸烟的危害已为大多数公众所知,但被动吸烟的危害及在我国目前的严重状况,应当引起公众的普遍关注.     

99例手足口病临床分析

手足口并且病近年在儿童中常见流行,该病的主要原体为柯萨病毒A组16型(CA16)和肠道病毒71型(EV71),二者所致的手足口病临床难以区别,但EV71引起的症状较重,并可伴发无菌性脑膜炎、脑炎、瘫痪及病毒性心肌炎等严重病发症[1].     

一株产H2S单核细胞增生李斯特菌的鉴定

单核细胞增生李斯特菌（Lm）是一种重要的食源性致病菌和人畜共患病致病菌。国内外的检验方法中均把产H2S的可疑Lm判为非Lm。2005年我们在水产品冻沙尖鱼中分离到1株产H2S的可疑Lm，现报告如下。     

江苏省东台市大肠埃希菌O157:H7监测

为了解东台地区1999-2001年和2005-2006年间肠出血性大肠埃希菌(E.coli O157:H7)宿主动物和腹泻患者带菌情况,按照《江苏省大肠杆菌感染性腹泻监测工作实施计划》及《国家大肠杆菌感染性腹泻监测方案》在东台市开展E.coli O157:H7监测工作.     

谷胱甘肽S一转移酶M1、T1基因多态性与抗结核药物所致肝损害易感性的Meta分析

结核病目前仍然是严重危害人类健康的公共卫生问题.研究发现,WHO推荐的标准短程化疗方案主要使用的三种一线药物异烟肼、利福平、吡嗪酰胺,均能引起不同程度、不同频度的不良反应,其中最主要的不良反应是肝损害.     

均衡组间差异的有效方法:倾向评分

目的：实例介绍倾向评分法的基本原理和适用条件，设计适用于分析二分类资料的SAS宏程序。方法：运用倾向评分比较平衡前后两组间差异的改变情况，评价放弃心肺复苏急救与充血性心力衰竭患者院内死亡的联系。结果：采用分层法和匹配法都可以有效地平衡两组各个特征变量间所存在的高度差异，三种分析方法获得相近的估计结果。结论：倾向评分法是均衡组间差异的有效方法，能够匹配和平衡各个特征变量的作用，并用于分析各种观察性研究资料。     

运用倾向值匹配法分析孕妇早期呼吸道感染与新生儿出生孕周的关联

目的 探讨孕妇呼吸道感染与活产单胎新生儿出生孕周之间的关联。方法 采用分层随机整群抽样方法,抽取陕西省30个区（县）。面对面问卷调查2010－2013年符合纳入指标的育龄妇女及其生育子女。应用倾向值匹配法,对孕早期呼吸道感染组和无呼吸道感染组进行1∶1匹配。以母亲孕早期呼吸道感染和子女出生孕周分别作为自变量和因变量,通过逐步校正混杂因素共建立3个线性回归模型,其中模型1仅分析匹配前呼吸道感染变量,模型2在模型1的基础上进一步校正母亲及新生儿个体差异因素,模型3仅分析匹配后呼吸道感染变量。结果 共纳入28 848人,孕早期呼吸道感染3 676人（12.74%）。匹配后感染组和非感染组分别为2 762人。模型1显示母亲孕早期出现呼吸道感染,新生儿出生孕周减少0.111周（P<0.001）,模型2减少0.058周（P=0.025）,模型3减少0.076周（P=0.036）。结论 孕妇出现呼吸道感染与子代出生孕周减少有关。     

Logistic regression had superior performance compared with regression trees for predicting in-hospital mortality in patients hospitalized with heart failure

ObjectiveTo compare the predictive accuracy of regression trees with that of logistic regression models for predicting in-hospital mortality in patients hospitalized with heart failure.Study Design and SettingModels were developed in 8,236 patients hospitalized with heart failure between April 1999 and March 2001. Models included the Enhanced Feedback for Effective Cardiac Treatment and Acute Decompensated Heart Failure National Registry (ADHERE) regression models and tree. Predictive accuracy was assessed using 7,608 patients hospitalized between April 2004 and March 2005.ResultsThe area under the receiver operating characteristic curve for five different logistic regression models ranged from 0.747 to 0.775, whereas the corresponding values for three different regression trees ranged from 0.620 to 0.651. For the regression trees grown in 1,000 random samples drawn from the derivation sample, the number of terminal nodes ranged from 1 to 6, whereas the number of variables used in specific trees ranged from 0 to 5. Three different variables (blood urea nitrogen, dementia, and systolic blood pressure) were used for defining the first binary split when growing regression trees.ConclusionLogistic regression predicted in-hospital mortality in patients hospitalized with heart failure more accurately than did the regression trees. Regression trees grown in random samples from the same data set can differ substantially from one another.     

Risk adjustment performance of Charlson and Elixhauser comorbidities in ICD-9 and ICD-10 administrative databases

Background  

The performance of the Charlson and Elixhauser comorbidity measures in predicting patient outcomes have been well validated with ICD-9 data but not with ICD-10 data, especially in disease specific patient cohorts. The objective of this study was to assess the performance of these two comorbidity measures in the prediction of in-hospital and 1 year mortality among patients with congestive heart failure (CHF), diabetes, chronic renal failure (CRF), stroke and patients undergoing coronary artery bypass grafting (CABG).     

Mortality association between obesity and pneumonia using a dual restricted cohort model

BackgroundAn obesity survival paradox has been reported among obese patients with pneumonia.AimsTo determine the impact of obesity on pneumonia outcomes and analyze the correlation between in-hospital all-cause mortality and obesity among patients with pneumonia.MethodsThe United States Nationwide Readmissions Database (NRD) was retrospectively analyzed for patients with pneumonia from 2013 to 2014. We used a step-wise restricted and propensity score matching cohort model (dual model) to compare mortality rates and other outcomes among pneumonia patients based on BMI. Mortality was calculated by a Cox proportional hazard model, adjusted for potential confounders with propensity score matched analysis.ResultsA total of 70,886,775 patients were registered in NRD during the study period. Of these, 7,786,913 patients (11.0%) were considered obese and 1,652,456 patients (2.3%) were admitted to the hospital with pneumonia. Based on the step-wise restricted cohort model, the hazard ratio comparing the mortality rates among obese pneumonia patients to mortality rates among normal BMI pneumonia patients was 0.75 (95% CI 0.60–0.94). The propensity score matched analysis estimated a hazard rate of 0.84 (95% CI 0.79–0.90) and the hazard ratio estimated from the dual model was 0.82 (95% CI 0.63–1.07).ConclusionsWith the application of a dual model, there appears to be no significant difference in mortality of obese patients with pneumonia compared to normal BMI patients with pneumonia.