Human metapneumovirus and respiratory syncytial virus, Brazil

We describe the epidemiologic and clinical characteristics of 111 children attending clinics and hospitals in Aracaju, northeast Brazil, with acute respiratory infections attributable to human metapneumovirus (HMPV), respiratory syncytial virus (RSV), or both in May and June 2002. Fifty-three (48%) children were infected with RSV alone, 19 (17%) with HMPV alone, and 8 (7%) had RSV/HMPV co-infections.     

Molecular epidemiology of human respiratory syncytial virus and human metapneumovirus in hospitalized children with acute respiratory infections in Croatia, 2014–2017

Acute respiratory infection (ARI) is the most common infection in children under 5 years of age and it is frequently caused by two pneumoviruses, human respiratory syncytial virus (HRSV) and human metapneumovirus (HMPV). Epidemic seasons of these viruses overlap and disease manifestations are highly similar, including severe lower ARI such as bronchiolitis or pneumonia. Reinfections with pneumoviruses are frequent and limited prevention treatment is available. Genetic diversity of HRSV and HMPV strains circulating in Croatia was monitored during four consecutive years (2014–2017). Co-circulation of multiple lineages was observed for both viruses. Within HRSV group A, ON1 strains gained strong predominance during the 4-year period, while previously dominant genotype NA1 was detected only sporadically. Similarly, newly occurring HMPV genotype A2c gained predominance over genotype A2b during this period, resulting in all infection in 2017 being caused by A2c. Along with phylogenetic analysis based on the commonly used fragments for detection and genotyping of these viruses, full length G and SH genes were also analysed. Evolutionary dynamics showed that inferred substitution rates of HRSV and HMPV are between 2.51 × 10⁻³ and 3.61 × 10⁻³ substitutions/site/year. This study established presence of recently described HMPV strains containing large duplications in the G gene in Croatia. Viruses with either of the two duplications belong to a subcluster A2c, which has completely replaced all other group A subclusters in 2017.     

Respiratory tract reinfections by the new human Metapneumovirus in an immunocompromised child

The human Metapneumovirus (HMPV), a new member of the Paramyxoviridae family, has been recently associated with respiratory tract infections in young children. We report the case of a young, immunocompromised child who had severe lower respiratory tract infections during two consecutive winter seasons caused by genetically distinct HMPV strains.     

武汉地区冬春季儿童急性呼吸道感染病原学研究

目的 了解武汉地区冬春季儿童急性呼吸道感染不同病原体的检出率、构成等相关流行病学特征.方法 对6348例于2010年10月-2011年3月到医院就诊,诊断为呼吸道感染的儿童,用间接免疫荧光法检测9种呼吸道病原体IgM抗体.结果 病原体总阳性检出率为34.40％,9种病原体检出率由高到低依次为:肺炎支原体占21.88％、腺病毒占10.41％、乙型流感病毒占10.03％、呼吸道合胞病毒占7.36％、副流感病毒占5.01％、肺炎军团菌血清1型占1.02％、甲型流感病毒占0.72％、Q热立克次体占0.09％、肺炎衣原体0.02％;肺炎支原体在整个冬春季其间检出率均较高,腺病毒在10月份检出率较低,但在随后月份中其检出率均比较高,乙型流感病毒在2011年1月呈暴发态势,阳性病例数和检出率上升5倍,呼吸道合胞病毒阳性检出率在2010年12月份达到最高.结论 引起武汉地区冬春季急性呼吸道感染患儿的主要病原体为肺炎支原体、腺病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒,且乙型流感病毒在2011年1月有暴发流行的趋势.     

西宁地区儿童急性呼吸道感染病毒病原学检测分析

目的:探讨西宁市儿童常见呼吸道病毒感染的病原学特点和分布特征。方法:采集141例急性呼吸道感染住院患儿的咽拭子标本,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行合胞病毒(RSV),流感病毒A、B型(IFV A、B),副流感病毒Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型(PIVⅠ、Ⅱ、Ⅲ),腺病毒(ADV),冠状病毒(HCoV)OC43/HKU1、229E/NL63,博卡病毒(HBoV),偏肺病毒(hMPV)检测。结果:从141份鼻咽拭子样本中检测出呼吸道病毒阳性22例,阳性率为15.6%。检出4种呼吸道病毒,其构成比分别为ADV 45.5%、PIVⅡ26.1%、HCoV-229E/NL63 17.4%、IFV A 13.0%。不同性别间患儿呼吸道病毒阳性率无统计学差异(P>0.05)。<6个月组阳性率最低(6.3%),3～6岁年龄组阳性率最高(29.2%)。结论:西宁地区急性呼吸道感染病毒病原检出率低于全国水平,ADV为西宁地区急性呼吸道感染的首位病毒病原体,HCoV-229E/NL63是该地区急性呼吸道感染的病原之一。     

湖南省2012-2014年发热呼吸道症候群哨点监测结果及分析

目的 通过“发热呼吸道症候群监测”了解湖南省主要呼吸道病毒流行情况及病原谱分布,为发热呼吸道症候群防控及临床诊疗提供科学依据。 方法 2012年1月-2014年12月,从符合发热呼吸道症候群定义的患者身上采集鼻/咽拭子、肺泡灌洗液、痰液样本。采用基于毛细管凝胶电泳的“9+7呼吸道病毒多重PCR检测法”对标本中流感病毒(Flu)、呼吸道腺病毒(AdV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、人鼻病毒(hRV)、副流感病毒(PIV)、偏肺病毒(HMPV)、人博卡病毒(hBoV)和人冠状病毒(hCoV)共8种病毒的16个亚型进行核酸检测。使用SPSS17.0统计学软件对个案信息及检测结果进行统计学分析。 结果 2012年1月-2014年12月,从哨点医院采集各类呼吸道标本共961份,其中男性病例标本595份,占61.91%;女性病例标本366份,占38.09%。在961份已检测的标本中,通过PCR检出阳性标本456份,阳性检出率为47.45%。男、女病例标本的阳性检出率差异无统计学意义(P>0.05)。按年龄将病例分为7个年龄组,各年龄组的阳性检出率分别为 1岁以下(52.80%)、1~2岁(66.53%)、2~5岁(49.86%)、6~15岁(25.56%)、16~49岁(11.11%)、50~64岁(17.39%)和65岁以上(19.40%)。在456份病毒阳性的标本中,检出混合感染48例,非混合感染408例。在检出的呼吸道病毒中,AdV、RSV和Flu所占的比例最大(病原谱构成比分别为25.90%、21.31%和17.73%),其次为hRV(14.14%)和PIV(11.75%);HMPV(4.78%)和hBoV(3.98%)检出较少,而hCoV只有两例阳性被检出。男性、女性的病原构成差异无统计学意义(P>0.05)。各年龄段的病原构成差异有统计学意义(P<0.05),其中2岁以下的儿童病例中检出的病毒以RSV(29.36%)和AdV(23.02%)为主,其次为PIV(13.10%)、hRV(11.90%)和Flu(11.11%);2~5岁的儿童病例中,AdV所占比例最大(34.02%),其次为hRV(18.56%)、Flu(18.04%)和RSV(15.46%);6~15岁少儿病例中以Flu(31.43%)和PIV(34.29%)为主,其次为AdV(17.14%)和hRV(14.29%);在16~49岁的病例中,只有Flu检出;在50岁以上老年病例中,病原构成以Flu(68.41%)为主,其余为PIV(10.53%)、HMPV(10.53%)和RSV(10.53%)。监测还发现,Flu、AdV有夏季和冬春季两个流行高峰;RSV有冬春季流行高峰;hRV有秋冬季流行高峰。 结论 所监测的8种呼吸道病毒是引发严重急性呼吸道住院病例的重要病原。5岁以下儿童及65岁以上的老人可能是主要的易感人群。其中,RSV、AdV、 Flu可能是引发儿童病毒性呼吸道感染的主要病原,而Flu则可能是引发成人病毒性呼吸道感染的主要原因。因此,应将这几种病毒作为呼吸道病毒防控的重点,进行更多的监测和更深入的研究。     

北京市2001-2003年3141例儿科急性呼吸道感染中副流感病毒的研究

目的探讨应用传代狗肾细胞（MDCK细胞）进行副流感病毒（PIV）的分离,了解近年来北京地区儿科急性呼吸道感染中PIV的感染状况.方法收集2001年1月至2003年12月急性呼吸道感染患儿的临床标本3141例,应用微量细胞培养法比较MDCK细胞与传代猴肾细胞（Vero细胞）用于分离PIV的敏感性;所有标本接种于MDCK细胞,结合血凝试验及间接免疫荧光法进行PIV检测.结果 Vero细胞PIV分离阳性的标本在MDCK细胞中也得到阳性结果;3141例标本中PIV阳性94例（3.0%）.1191例上呼吸道感染患儿标本中PIV135例（2.9%）,PIV311例（0.9%）;1634例下呼吸道感染患儿标本中PIV115例（0.9%）,PIV3 24例（1.5%）;207例支气管哮喘患儿标本中PIV阳性3例（1.4%）;38例发热患儿中PIV阳性1例;71例其他标本中PIV阳性5例.结论利用MDCK细胞可进行PIV的分离;北京地区儿科急性呼吸道感染中PIV感染是原因之一.     

Hospitalization rates for human metapneumovirus infection among 0- to 3-year-olds in Gipuzkoa (Basque Country), Spain

Numerous studies have been published on human metapneumovirus (HMPV) infection, but few have been population based. The main aim of this study was to estimate the incidence rate of hospitalization for community-acquired HMPV infection in infants and children aged <3 years. Between July 2004 and June 2007, 796 episodes (742 patients) of community-acquired acute respiratory infection were hospitalized. HMPV was detected in 90 episodes (11.3%). Fifty-nine episodes occurred in infants aged <1 year. The mean length of hospital stay was 6.2 days (range 2-31 days). Thirteen children required admission to the intensive care unit. Viral co-infections were detected in 46 episodes (51.1%). The incidence rate of hospitalization per 1000 inhabitants was 2.6 (95% CI 2.1-3.2), lower than that for respiratory syncytial virus, but higher than that observed for the influenza and parainfluenza viruses. HMPV is a major respiratory pathogen that leads to a high hospitalization rate.     

河北省2013-2015年急性上呼吸道感染病毒病原学构成研究

目的 了解河北省2013-2015年引起急性上呼吸道感染（acute upper respiratory infection,AURI）的病原学构成和流行病学特征,为呼吸道感染的诊断和防治工作提供科学依据。方法 采集河北省4家医院门诊就诊的AURI患者的咽拭子标本1 551份,提取核酸后采用多重实时荧光定量聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）方法检测15种呼吸道病毒。结果 采集1 551份临床咽拭子标本,检测出阳性标本714例,阳性率为46.03%,其中鼻病毒阳性率最高,为186（11.99%）例,其次为副流感病毒3型167（10.77%）例、呼吸道合胞病毒122（7.87%）例、腺病毒108（6.96%）例、乙型流感病毒56（3.61%）例、人偏肺病毒40（2.58%）例、甲型流感病毒39（2.51%）例、人博卡病毒38（2.45%）例、副流感病毒1型35（2.26%）例、冠状病毒229E/NL63型33（2.13%）例、肠道病毒32（2.06%）例、副流感病毒4型31（2.00%）例、冠状病毒OC43型30（1.93%）例、副流感病毒2型11（0.71%）例。病毒混合感染病例176例,检出率为11.35%。5岁以下年龄组病毒阳性率最高为56.07%（337/601）。结论 河北省AURI主要以鼻病毒、副流感病毒3型、呼吸道合胞病毒、腺病毒、流感病毒为主,各病毒有各自的流行特征。     

2013年湖南省儿童医院住院患儿急性下呼吸道感染病原体分析

目的 了解湖南省儿童医院急性下呼吸道感染患儿常见非典型呼吸道病原的感染和流行情况,为临床诊断急性下呼吸道感染患儿提供病原学依据。 方法 采集该院2013年1-12月诊断为急性下呼吸道感染的1 726例住院患儿的血清标本,用间接免疫荧光法(IFA)快速检测和鉴定肺炎支原体、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒(1.2.3)、腺病毒、嗜肺军团菌、甲型流感病毒、肺炎衣原体、Q热立克次体九种非典型呼吸道病原体。采用χ²检验分析检出率的人群、季节、时间分布差异。 结果 1 726例患儿肺炎支原体检出率为56.78%,其次为乙型流感病毒19.99%、呼吸道合胞病毒12.40%、副流感病毒9.21%、腺病毒5.16%、嗜肺军团菌5.16%,甲型流感病毒2.43%,肺炎衣原体1.10%,Q热立克次体0.9%;其中肺炎支原体检出率存在性别差异(χ²=6.04, P<0.05);副流感病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、肺炎衣原体、肺炎支原体、腺病毒检出率存在年龄差异(P<0.05);肺炎衣原体检出率不存在季节差异,其它病原体在检出率存在季节差异(P<0.05)。副流感病毒、甲型流感病毒检出率5月达最高峰;Q热立克次体秋冬季未检出;肺炎支原体、乙型流感病毒1月是检出高峰。重复感染率22.25%,其中肺炎支原体合并其他病原体感染率高达16.3%。 结论 导致该院儿童急性下呼吸道感染的主要病原体是肺炎支原体、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒;肺炎支原体与其它病原体混合感染普遍。     

WU polyomavirus in children with acute lower respiratory tract infections, South Korea

In South Korea, WU polyomavirus (WUPyV) was detected in 34 (7%) of 486 children with acute lower respiratory tract infections, 3 (4.2%) of 72 asymptomatic children, and as coinfection with other respiratory viruses in 23 (67.6%) children. Although WUPyV was frequently detected, its clinical role has not been distinguished from that of coinfecting viruses.     

儿童急性呼吸道感染578例病毒检测分析

目的 了解三门峡地区儿童急性呼吸道感染(ARI)的病毒病原学构成,指导临床诊断与治疗。方法 采集578例ARI住院患儿的鼻咽拭子,采用直接免疫荧光法检测7种病毒即呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、副流感病毒Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(PIVⅠ～Ⅲ)、流感病毒A、B型(IVA、IVB)。结果 儿童ARI的病毒总检出率为61.59%,混合感染占45.22%。病毒总检出率冬季最高(77.35%)、夏季最低(25.00%)。下呼吸道感染的病毒总检出率高于上呼吸道感染。RSV、PIVⅢ、IVA的检出率位居前三位,分别为30.62%、28.89%、21.97%。RSV及PIVⅢ在秋冬季、下呼吸道感染、3岁以下患儿中检出率较高;IVA在冬季、上呼吸道感染患儿中检出率较高。结论 RSV 、PIVⅢ、IVA是三门峡地区儿童急性呼吸道感染的主要病毒病原。RSV 、PIVⅢ是秋冬季节婴幼儿下呼吸道感染的主要病原;IVA是冬季各年龄患儿上呼吸道感染的主要病原。通过检测儿童ARI的病毒病原,对尽早明确病毒病原,避免滥用抗生素具有重要意义。     

某部急性呼吸道感染病原谱的流行特征

目的调查了解某部队急性呼吸道感染病原体流行情况,为疫情防控提供依据。方法采集该部队急性呼吸道症候群病例咽拭子、血清等标本,采用荧光定量PCR检测呼吸道常见病毒。结果 2年共检测呼吸道感染病例标本801份,阳性299份,阳性率为37.3%。其中2014年检测536份,阳性率为39.9%,病原体主要为季节性H3N2病毒(占57.5%)、腺病毒55型(占40.6%)和乙型流感病毒(占1.9%)。2015年检测265份,阳性率为32.08%,病原体主要为乙型流感病毒(占30.1%)、腺病毒7型(占27.1%)和甲型H1N1病毒(占23.5%),其他为冠状病毒OC43型(占16.5%)和NL63型(占1.2%)。结论当前该部急性呼吸道感染病原体以甲、乙型流感病毒、腺病毒为主,也有冠状病毒检出。做好部队呼吸道病原监测工作,对部队传染病的防控有重要意义。     

长春地区冬季儿童上呼吸道感染病毒病原学检测结果分析

目的了解长春地区冬春季急性上呼吸道感染患儿6种呼吸道病毒感染情况。方法采集门诊119例患儿咽拭子,应用(RT)-PCR方法检测甲型流感病毒(IVA)、A亚型呼吸道合胞病毒(RSVA)、副流感病毒(PIV)3型、腺病毒(ADV)、博卡病毒(HBoV)以及人偏肺病毒(hMPV)等6种常见呼吸道病毒。结果检测出阳性标本53例,阳性率44.54%,以流感病毒最高(19.33%)。经χ2检验,病毒总检出率在性别间差异有统计学意义(χ2=7.96,P<0.05)。结论流感病毒是长春地区2008年冬季患儿急性上呼吸道感染的主要病毒病原,男性患儿较女性患儿对呼吸道病毒易感。     

A comparison of influenza and respiratory syncytial virus infections among infants admitted to hospital with acute respiratory infections.

Among 741 children under 5 years admitted to hospital with respiratory infections during two winters, infection with influenza A virus was diagnosed in 70 (9%), with influenza B virus in 8 (1%), and with respiratory syncytial virus (RSV) in 259 (35%). Both influenza virus and RSV infections were diagnosed most frequently in children under the age of one year, and diagnosed more frequently in males than females. Influenza illnesses were more severe in boys than girls. Both infections occurred more often, but were not more severe, in children from a conurbation than in those from 'rural' areas. Convulsions were the cause of 36% of admissions with influenza A infections, but were rare in RSV infections. Bronchiolitis was the reason for 39% of admissions with RSV infections, but was rare in influenza infections. It is suggested that infants admitted to hospital are a good source of influenza virus strains for monitoring antigenic variation.     

小儿急性呼吸道感染中常见呼吸道病毒的检测情况分析

目的分析急性呼吸道感染患儿中常见呼吸道病毒的检测情况,为防治小儿急性呼吸道感染提供参考。方法收集2019年6—9月我院收治的330例急性呼吸道感染患儿血样并采用ELISA法对血清副流感病毒(parainfluenza virus,PIV)、腺病毒(adenovirus,ADV)和呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)抗体进行检测,对上述各种病毒在不同病种、性别、年龄等患儿中的分布特征进行比较分析。结果330份血样中,三种常见呼吸道病毒抗体总检出212份,总检出率为64.2%;其中PIV-1型抗体检出50份(占15.2%,未检出其他型PIV抗体)、ADV抗体检出44份(13.3%)、RSV抗体检出118份(35.7%)。330例患儿中,急性下呼吸道感染者3类呼吸道病毒抗体检出率均高于急性上呼吸道感染患儿(P<0.05);女性患儿3类呼吸道病毒抗体总检出率高于男性患儿(P<0.05);年龄<3岁患儿血清病毒抗体总检出率、RSV抗体检出率高于年龄≥3岁患儿(P<0.05)。结论本地区小儿急性呼吸道感染病例中,PIV感染以1型为主,3岁以下幼儿易感染RSV,下呼吸道感染患儿常见呼吸道病毒检出率高于上呼吸道感染患儿。     

北京地区2002年秋冬儿童急性上呼吸道感染爆发的病原学调查

目的 了解2002年11～12月北京地区急性上呼吸道感染爆发的病原。方法 收集2002年11～12月北京地区80例患急性上呼吸道感染儿童咽拭子标本,应用经典病毒学方法(病毒分离和血凝试验)进行流行性感冒(流感)病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒及腺病毒分离鉴定,应用巢式聚合酶链反应方法进行流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒及肺炎支原体(Mp)的检测。结果 80例标本中检测到B流感病毒18例(阳性率22.5％)、A3型流感病毒2例(阳性率2.5％)、肺炎支原体13例(阳性率16.3％),未检测到A1型流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒及腺病毒;其中2例同时检测到B型流感病毒与Mp,1例检测到A3型流感病毒与Mp。结论 B型流感病毒是此次儿童上呼吸道感染的首要病原,Mp感染是第二位病原。