PACS在中枢神经系统影像学教学中的应用

目的:检测乳腺癌蒽环类药物耐药细胞株中微小RNA(microRNA,miRNA)的表达差异,探讨miRNA与乳腺癌化疗耐药的关系.方法:miRNA芯片检测乳腺癌蒽环类药物(阿霉素)耐药细胞MCF-7/ADM和其亲本细胞MCF-7的miRNA表达谱,找出差异表达的miRNA,并利用实时荧光RT-PCR法对miRNA芯片结...     

多组学数据筛选乳腺癌miRNA效应标志物研究

目的:通过比较正常人和乳腺癌患者乳腺组织中miRNA表达状况,寻找可以作为生物标志物的miRNA.方法:采用GEO数据库中的GSE26659、GSE44899、GES44124数据集和TC-GA数据库的乳腺癌测序数据,通过差异分析和生存分析确定筛选表达差异的miRNA,评估选出miRNA的分类性能,进行靶基因预测、富集分析并构建蛋白相互作用网络.结果:通过分析乳腺癌芯片数据,筛选出3个有作为生物标志物潜力的miRNA,经TCGA数据验证,miR-96-5p、miR-425-5p对肿瘤和正常组织具有较好的区分能力.结论:miR-96-5p、miR-425-5p有作为效应标志在乳腺癌筛查发挥作用的潜力.     

探讨miRNA-193b和miRNA-100在乳腺癌中的差异表达

目的 采用已知的miRNA(microRNA)基因中选定的目标基因,筛选与乳腺癌相关miRNAs,并采用 real time-PCR方法验证基因,探讨其在乳腺癌发生发展中的作用,研究结果为探明miRNA在乳腺癌中的差异表达及乳腺癌的基因诊断和治疗提供实验依据.方法 收集乳腺癌组织及对照的癌周组织10对,分别提取RNA.对乳腺癌中的差异表达miRNA基因进行验证.从中选取表达上调明显的miRNA-193b及下调明显的miRNA-100,采用实时定量PCR技术进一步验证结果.结果 证实miRNA的real time-PCR结果与已知基因结果基本吻合,miR-193b是乳腺癌中上调的miRNA基因,miR-100是乳腺癌中明显下调的miRNA基因.结论 对miRNA基因与乳腺癌的关系有进一步深入了解,相对于癌周组织进一步验证了1个表达上调和1个表达下调的miRNA基因,表达上调基因可能为潜在的致癌基因,表达下调基因可能为潜在的抑癌基因.     

基于TCGA数据库构建雌激素受体阳性乳腺癌患者的预后风险模型

目的:构建微小RNA(miRNA)表达的预测雌激素受体(ER)阳性乳腺癌患者预后的风险模型.方法:分析了TCGA数据库下载的ER阳性乳腺癌患者的miRNA表达数据和临床资料,筛选出与ER阳性乳腺癌特异性相关的miRNA并构建了miRNA-临床的预测ER阳性乳腺癌患者3年和5年生存率的预测模型.受试者工作曲线(ROC)和...     

人血清新miRNA分子的预测及表达分析

目的:基于高通量测序结合生物信息学挖掘人新miRNA分子,以期为疾病诊治提供理论基础.方法:分别提取4例正常人和乳腺癌患者的血清外泌体,通过Illumina HiSeq SE50高通量miRNA测序,滤掉已知miRNA后,用Bowtie2筛选出与人全基因组数据库(GRCh38.P13)匹配的序列,再用MIREAP和RNAfold软件筛选出新miRNA候选序列.分别收集18例正常人和29例乳腺癌患者血清,用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析其中两个新miRNA的表达水平.最后通过miRWalk 2.0数据库对一个miRNA分子进行靶基因预测,并进一步利用GEPIA和UALCAN数据库预测靶基因在乳腺癌中的临床意义.结果:提取得到的外泌体质量良好.通过筛选得到7条新miRNA的候选序列,其中miRNA-A和miRNA-B在正常人和乳腺癌患者血清中均有表达,但无显著差异.预测得到的miRNA-A靶基因包括CLK1、CLK4、GNG2和NPR2,它们在乳腺癌组织中均低表达,并且其表达水平在乳腺癌的不同分子分型和组织类型存在显著差异.结论:经外泌体高通量miRNA测序筛选并已初步验证得到两个新miRNA分子,其功能有待进一步研究.     

基于生物信息学的乳腺癌miRNA生物标志物的筛选

目的 筛选与乳腺癌相关的miRNA生物标志物,为乳腺癌的早期诊断、预后评估以及药物靶点的研究提供参考.方法 从TCGA数据库中收集乳腺癌相关基因芯片数据,将肿瘤组织与正常组织样本数据进行对比分析,筛选差异miRNA与mRNA;预测差异miRNA的潜在靶基因并与差异mRNA取交集,进一步对miRNA进行筛选;采用ROC曲线分析对筛选得到的miRNA进行评价.结果 筛选得到9个差异miRNA,对肿瘤样本和正常样本分类良好.分别为6个上调miRNA:hsa-miR-141、hsa-miR-182、hsa-miR-183、hsa-miR-200a、hsa-miR-200b、hsa-miR-21;3个下调miRNA:hsa-let-7c、hsa-miR-125b-1、hsa-miR-145.结论 筛选得到的差异miRNA可作为乳腺癌的生物标志物,可对乳腺癌的发生进行预测.     

miRNA失控表达在乳腺癌耐药中研究进展

近年来，乳腺癌耐药的研究取得了显著的进步。microRNA ( miRNA)作为乳腺癌耐药相关的分子标志物及治疗靶点，可能通过药物转运、DNA修复、细胞凋亡、上皮间质转化、乳腺癌干细胞等方面调控乳腺癌耐药。靶向调节miRNA的异常表达，恢复miRNA正常的调控功能，可能为治疗乳腺癌的提供新方向。     

基于ceRNA调控网络的乳腺癌预后相关生物标志物筛选

目的 利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库筛选差异表达mRNA、miRNA和lncRNA分子标签,构建预后相关的核心ceRNA调控子网络,探索其在乳腺癌预后相关生物标志物筛选中的作用.方法 从TCGA下载乳腺癌患者的测序数据和临床数据,利用R包"Deseq2"和单因素COX比例风险回归模型,分别筛选差异表达且与预后相关...     

基于血清miRNA相对表达秩序关系识别乳腺癌预警标志

目的：基于血清中miRNA相对表达秩序关系识别乳腺癌预警标志。方法：以正常血清样本中miRNA相对表达秩序关系高度稳定的miRNA对为参考,筛选在乳腺癌样本中miRNA相对表达秩序关系高度逆转的基因对为候选乳腺癌预警标志,并在独立数据集中进行验证。通过miRNA靶基因数据库分析预警标志与癌症发生发展的关系。结果：基于2 686例正常样本和1 280例乳腺癌样本miRNA表达谱,筛选得到11对相对表达秩序关系在正常和乳腺癌样本间高度逆转的miRNA对,共涉及13个miRNA。3套独立验证集结果表明这11对预警标志对乳腺癌具有很好的预测能力,预测准确率为93%～100%。功能富集分析表明这13个miRNA的324个靶基因,主要富集到PI3K-AKT信号通路,细胞增殖、转录等与乳腺癌的发生发展相关的通路中。结论：基于血清样本内miRNA间相对表达秩序关系的预警标志,能够有效识别乳腺癌,具有高度的鲁棒性和临床转化价值。     

乳腺癌差异表达的MicroRNA的筛选研究

 【目的】 应用miRNA芯片技术筛选乳腺癌及癌旁组织差异表达的miRNA,发现与乳腺癌相关的miRNA,为进一步阐明其在乳腺癌发病机制中的作用打下基础。【方法】 收集8例新鲜的乳腺癌及其癌旁组织,抽提总RNA并分离出小RNA进行Cy3荧光标记,将标记的小RNA在miRNA芯片上进行杂交反应,应用实时定量RT-PCR方法验证miRNAs芯片结果的可靠性。【结果】 对芯片数据进行SAM分析,结果筛选获得16个乳腺癌相关miRNAs, 相对于癌旁组织,在乳腺癌组织中9个miRNAs表达上调,7个miRNAs表达下调。其中显著上调的有miR-21,miR-365,显著下调的有miR-497,miR-31。【结论】 筛选得到乳腺癌miRNA差异表达谱,其可能与乳腺癌的发生发展有关。     

乳腺癌干细胞相关miRNA的高通量筛选及miR-25介导自噬对乳腺癌干细胞的调控作用

目的探讨乳腺癌干细胞相关微RNA(miRNA)的高通量筛选及miR-25介导自噬对乳腺癌干细胞的调控作用。方法以MDA-MB-231乳腺癌干细胞为研究对象,通过干细胞成球实验、高通量芯片检测、生物信息学分析、乙醛脱氢酶(ALDH)流式检测、实时自噬活性监测及自噬相关蛋白表达的检测明确miRNA如何通过介导自噬影响乳腺干细胞自我更新能力。结果 miRNA微阵列芯片共筛选出131个差异miRNA,其中56个上调miRNA,57个下调miRNA。与非乳腺癌干细胞相比,一部分miRNA在乳腺癌干细胞上低表达,其中miR-25的表达在乳腺癌干细胞内显著下调约41%。差异的miRNA按照5个数据库(miRWalk、miRanda、miRDB、RNA22和Targetscan)来预测其靶基因,共获得4 565个靶基因。与紫杉醇单药组相比,紫杉醇联用3-甲基腺嘌呤或氯喹均导致成球直径缩小近1/2[(254±16)μm、(226±38)μm比(494±44)μm](均P <0. 05)。与空白对照组相比,紫杉醇组的微管相关蛋白1轻链3-Ⅱ表达水平升高且p62表达水平降低;与Nc+紫杉醇组相比,Mimics+紫杉醇组的UNC-51样激酶1蛋白表达明显降低。结论 miR-25可能是介导自噬活性与乳腺癌干细胞之间的重要信号分子,其表达异常可能与其启动子区域DNA甲基化调控有关。     

乳腺癌差异表达的MicroRNA的筛选研究

【目的】应用miRNA芯片技术筛选乳腺癌及癌旁组织差异表达的miRNA,发现与乳腺癌相关的miRNA,为进一步阐明其在乳腺癌发病机制中的作用打下基础。【方法】收集8例新鲜的乳腺癌及其癌旁组织,抽提总RNA并分离出小RNA进行Cy3荧光标记,将标记的小RNA在miRNA芯片上进行杂交反应,应用实时定量RT-PCR方法验证miRNAs芯片结果的可靠性。【结果】对芯片数据进行SAM分析,结果筛选获得16个乳腺癌相关miRNAs,相对于癌旁组织,在乳腺癌组织中9个miRNAs表达上调,7个miRNAs表达下调。其中显著上调的有miR-21,miR-365,显著下调的有miR-497,miR-31。【结论】筛选得到乳腺癌miRNA差异表达谱,其可能与乳腺癌的发生发展有关。     

姜黄素脂质体通过调节miRNA的表达改变乳腺癌细胞对阿霉素的化疗敏感性

目的初步研究姜黄素脂质体(CUR)在人乳腺癌细胞株MCF-7中对阿霉素(ADR)药物敏感性的影响,并分析其通过调控miRNA途径的作用机制。方法以人乳腺癌细胞株MCF-7为亲本细胞,采用低浓度逐步加量法诱导阿霉素耐药株MCF-7/ADR,利用薄膜法制备姜黄素脂质体,MTT法检测姜黄素脂质体增加MCF-7/ADR耐药株敏感性的性能及与阿霉素的协同增效作用,miRNA和mRNA微阵列分析筛选出差异表达的miRNA和mRNA,联合生物信息学预测软件和mRNA微阵列预测差异表达的miRNA可能的靶基因,应用荧光定量PCR验证部分微阵列结果。结果阿霉素与姜黄素脂质体对MCF-7/ADR的细胞抑制率有协同增效作用。芯片结果显示,与耐药株MCF-7/ADR细胞相比,miRNA和mRNA在亲本MCF-7/ADR细胞和经姜黄素脂质体处理后的MCF-7/ADR细胞中的表达差异明显,共发现67个差异表达的miRNA和323个差异表达的mRNA。根据预测软件和mRNA芯片结果发现20个共同靶基因。qPCR进一步验证hsa-miR-29b-1-5p,hsamiR-29b-3p,hsa-miR-6068,hsa-miR-6790-5p,has-miR-4417和DDIT4,EPAS1,VEGFA,RPS14,DCDC2在3株细胞中的表达与芯片结果基本一致。结论姜黄素脂质体能在一定程度上逆转人乳腺癌对阿霉素的耐药性。通过调控miRNA的表达来影响相关信号通路可能是姜黄素脂质体调节乳腺癌细胞对阿霉素药物敏感性的一条重要分子途径。     

circ＿0000515/miR-1296-5p/CDK2轴在乳腺癌中的作用

目的:探究circ＿0000515在乳腺癌进展中的可能作用机制。方法:通过GEO数据库下载乳腺癌circRNA芯片数据集(GSE101123)并采用R语言进行表达差异分析,筛选出目标circRNA分子作为研究对象并检测其在乳腺癌细胞株和组织中的表达;生物信息学分析与选择该circRNA的目的miRNA,及后者对应的靶向mRNA,并采用双荧光素酶实验和蛋白质印迹进行验证;将目标circRNA的siRNA转染人乳腺癌MCF-7和MDA-MB-231细胞,CCK-8实验和划痕实验观察细胞的增殖和迁移,荧光定量PCR(qRT-PCR)检测RNA表达,蛋白质印迹实验检测mRNA编码蛋白的表达。结果:选择和下载GSE101123数据集后用R语言筛选出5个高表达的circRNA分子,选定其中的circ＿0000515作为研究对象,生物信息学分析得出circ＿0000515、miR-1296-5p和细胞周期蛋白依赖性激酶2(cyclin-dependent kinase 2,CDK2)三者之间可能存在靶向关系。qRT-PCR结果显示,circ＿0000515中乳腺癌细胞株MCF-7和MDA-MB-23...     

基于miRNA-mRNA调控网络的鼻咽癌相关分子机制研究

目的 通过构建鼻咽癌微小核糖核酸(miRNA)调控网络筛选与鼻咽癌发病相关的分子标志物.方法 从基因表达数据库(GEO)数据库下载鼻咽癌miRNA芯片数据GSE70970和基因芯片数据GSE12452,利用R软件筛选出差异表达miRNA和mRNA,并对其进行功能富集分析.应用FunRich软件预测差异miRNA的转录因...     

P糖蛋白在乳腺癌原发性耐药过程中的表达

目的:研究乳腺癌原发性耐药过程中P糖蛋白(Pglycoprotein,P-gp)的表达特征,初步探讨乳腺癌原发性耐药的发生机制.方法:采用免疫组织化学及逆转录多聚酶链反应技术,对25例接受术前新辅助化疗的乳腺癌患者、15例未接受术前化疗的乳腺癌患者、10例乳腺腺病患者组织标本内P-gp和MDR1 mRNA的表达情况进行检测.结果:P-gp表达阳性率在乳腺癌术前化疗组患者和未化疗组患者中分别为84.0%(21/25)和46.7%(7/15),对照组未见P-gp表达;MDR1表达阳性率在三组则分别为84.0%(21/25)、53.3%(8/15)和10%(1/10),组间差异均显著(P＜0.01).结论:部分乳腺癌细胞在恶性变的过程中同时伴有对化疗药物耐受能力的增加,肿瘤细胞内极低水平的MDR1 mRNA表达即可导致多药耐药,MDR1/P-gp与乳腺癌的内源性耐药相关.     

基于iTRAQ多重标记串联质谱技术系统性筛选乳腺癌患者血清蛋白表达的差异分析

目的:观察串联质谱技术在乳腺癌血清蛋白表达中的差异。方法:选取2020年2月－2021年2月黑龙江省牡丹江医学院附属二院收治的乳腺癌新辅助化疗患者20例作为研究组,包含10例化疗有效患者及10例化疗无效患者,同时选取8名健康者作为对照组。采集所有患者的肘静脉血,分别采用高通量miRNA、iTRAQ表达谱测序技术,从“组学”的角度对乳腺癌新辅助化疗不同疗效患者miRNA差异表达谱、外周血单个核细胞蛋白组进行研究。随后,先进行Pathway通路分析,该过程在蛋白质层面进行,然后找出sRNA的成熟体序列,在此过程中严格根据miRbase18数据库。将已知的cDNA序列整理为一行,对得到的sRNA对应靶基因进行预测,Pathway分析靶基因,最后将同一Pathway通路中的sRNA靶基因及蛋白质寻找出来。结果:研究组和对照组共筛选出19个差异表达蛋白,选取其中具有较大表达差异的肝细胞生长因子(HGF)进行验证。iTRAQ标记图谱显示,研究组和对照组的血清HGF表达水平比较,差异有统计学意义(P<0.05)。研究组Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期患者的血清HGF表达水平逐渐升高(P<0.05),均高于对照组(均P<0.05),符合i TRAQ标记图谱鉴定结果。结论:串联质谱技术用于筛选发现乳腺癌细胞HGF表达水平升高具有显著效果,可有效指导临床诊治乳腺癌的工作,将有效参考提供给靶向治疗药物的开发。     

胃癌SGC7901细胞长春新碱耐药性相关miRNA的初步分析

目的 探讨胃癌SGC7901细胞对长春新碱(VCR)化疗药物耐药相关的微小RNA(miRNA),并预测异常表达miRNA的靶基因.方法 体外培养胃癌SGC7901细胞和胃癌VCR耐药细胞SGC7901/VCR;提取总RNA并质检,采用miRNA 8.0微阵列芯片检测分析miRNA表达谱;荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)验证差异表达的miRNA,生物信息学分析软件预测可能调控的靶基因;采用Western blot方法检测靶基因的蛋白表达水平.结果 芯片检测发现,SGC7901和SGC7901/ VCR细胞中63个异常表达的miRNA;其中miR-1267、miR-221、miR-223、miR-200c、miR-99a表达显著性上调;miR-122、miR-1246、miR-302a、miR-195、miR-124表达显著性下调.在胃癌细胞和胃癌组织中验证结果初步显示,miRNA-122和miR-302a可能分别调控靶基因IGF-IR和WDR62.结论 获得的差异表达miRNA,以及预测的靶基因IGF-IR和WDR62可能在胃癌化疗药物VCR耐药中起关键性作用.     

微RNA-603靶向山梨糖和SH3结构域包含蛋白3诱导髓核细胞炎症反应影响椎间盘退行性变

目的 筛选椎间盘退行性变(IDD)组织中表达升高的miRNA,探究其在IDD中的作用及可能机制.方法 比较已发表的2个IDD miRNA表达谱测序数据集,筛选出表达升高最显著的miRNA——miRNA-603.收集10例IDD患者和10例腰椎骨折患者的椎间盘组织,取正常椎间盘组织分离培养髓核细胞.用qRT-PCR检测I...     

乳腺癌中GST-π、TOPO II的表达及临床意义

目的从细胞水平探讨乳腺癌耐药机制,以期为选择化疗方案提供参考,获得更有效的化疗效果.方法应用免疫组化S-P法,对乳腺癌的主要耐药指标GST-π、TOPO Ⅱ进行检测,并结合临床分期进行研究.结果 (1)乳腺癌中GST-π表达率为63.6% (28/44),临床Ⅲ期表达率显著高于临床Ⅰ、Ⅱ期.(2) TOPO Ⅱ表达率为47.7% (21/44),临床Ⅲ期表达率显著低于Ⅰ、Ⅱ期.(3) TOPO Ⅱ与GST-π表达关系间无明显相关性,说明它们各自的表达从不同方面对肿瘤耐药起作用. 结论在乳腺癌化疗药物选择时,联合检测GST-π、TOPO Ⅱ的表达具有指导作用 ,对预后的判断有参考价值.