应用生物信息学技术筛查绒毛膜癌相关基因

目的比较和挖掘葡萄胎、绒毛膜癌基因表达谱数据，筛选与绒毛膜癌恶性演进相关的新基因。方法分别以葡萄胎、绒毛膜癌为检测组．均以正常胎盘绒毛为对照组，在对两组各3例葡萄胎、绒毛膜癌进行基因芯片检测的基础上，对其共表达基因表达谱数据进行分层聚类分析，找到有相似表达趋势的候选基因，应用生物信息学方法，进行电子Northern分析及基因结构功能初步分析，用半定量RT-PCR技术对3个筛选基因进行初步鉴定。结果在所有3例绒毛膜癌基因表达数据中找到共表达候选基因52条．经聚类分析初步筛选出绒毛膜癌相关基因19条，主要包括dynamin(L07807)，zincfinger protein ZNF184(U6656)，calmodulin(U12022)，carboxypeptidase M(BC022276)，kataninp 60(AF056022)，calcineurin binding protein cabin 1(NM_012295)，transducin-like enhancer protein(TLE1，M99435)等。结论通过对基因表达谱数据的分析和挖掘．初步筛选了绒毛膜癌相关基因．为寻找绒毛膜癌发生与演进的关键基因提供了新的线索。     

应用生物信息学技术筛查绒毛膜癌相关基因

目的 比较和挖掘葡萄胎、绒毛膜癌基因表达谱数据,筛选与绒毛膜癌恶性演进相关的新基因。方法 分别以葡萄胎、绒毛膜癌为检测组,均以正常胎盘绒毛为对照组,在对两组各3例葡萄胎、绒毛膜癌进行基因芯片检测的基础上,对其共表达基因表达谱数据进行分层聚类分析,找到有相似表达趋势的候选基因,应用生物信息学方法,进行电子Northern分析及基因结构功能初步分析,用半定量RT-PCR技术对3个筛选基因进行初步鉴定。结果 在所有3例绒毛膜癌基因表达数据中找到共表达候选基因52条,经聚类分析初步筛选出绒毛膜癌相关基因19条,主要包括dynamin(L07807),zinc finger protein ZNF184(U6656),calmodulin(U12022),carboxypeptidase M(BC022276),kataninp60(AF056022),calcineurin binding protein cabin1(NM_012295),transducin-like enhancer protein(TLE1,M99435)等。结论 通过对基因表达谱数据的分析和挖掘,初步筛选了绒毛膜癌相关基因,为寻找绒毛膜癌发生与演进的关键基因提供了新的线索。     

生物信息学能否推动现代中医药研究的发展？

随着当代生物信息学技术的不断发展，充分发挥生物信息学技术优势解决现代中医药研究中的复杂问题，不断推动现代中医药研究的发展，实现中医药现代化改革与创新目标。分析了现代中医药研究存在的挑战，并从生物信息学角度出发提出解决问题的思路。现代中医药研究借鉴生物信息学技术,多层次挖掘中医药现代化的内涵与外延，在系统层面上进一步推动了中医药现代化研究的改革与创新。     

生物信息学在后基因组时代的发展与展望

介绍了基因组信息学的研究内容、应用状况及前景,并详细介绍了基因组信息学所应用的技术方法,最后讨论了目前生物信息学发展所面临的主要困难,并对我国生物信息学发展予以展望。     

生物信息学在药物研发中的应用与展望

生物信息学为药物研发提供了新的手段,导致了药物研发模式的改变。本文阐述了生物信息学的定义、研究范围及其发展,对寻找先导化合物常用的几种生物信息学方法:三维结构搜寻、分子对接、全新药物设计进行了综述,并对其在药物研发中的应用前景进行了展望。     

数理统计方法在中药质量评价中的应用

数理统计是中药质量评价中不可或缺的重要方法,随着科学技术和经济与社会的不断发展,其内容也逐步扩大。介绍了目前数理统计应用于中药质量控制的几种主要方法。     

R语言在医学院校生物信息学实验教学中的应用与探索

分析生物信息学及其研究工具R语言的特点,以山西医科大学为例阐述生物信息学实验教学现状以及以学生为中心的实验教学方案设计,实践表明该方案对提高学生成绩具有一定作用。     

人工智能在医学诊断知识图谱构建中的应用研究

介绍人工智能在医学领域的应用,通过自然语言处理方法自动构建基于"疾病-症候-特征"3层结构模型的医学诊断知识图谱,具体阐述智能构建方法与构建过程,将其运用到临床决策支持系统中检测临床疗效,结果表明通过该方法构建的医学知识图谱具有效率高、疾病诊断正确率高等特点。     

生物信息学技术在结核分支杆菌ESAT-6重组抗原研究中的应用

目的 应用生物信息学分析软件预测分析结核分支杆菌ESAT-6基因及相关蛋白的特性.方法 应用NCBI、Expasy等在线生物信息学网站及DNAstar、Rasmol等软件包分析ESAT-6并进行同源比对;预测二级、三级结构,以及预测主要抗原表位等.结果 结核分支杆菌重组抗原ESAT-6与已发表氨基酸序列同源性为90%.预测该蛋白分子质量约为9885.7Da,PI为4.6,4个抗原表位,其结构域位于56-87位.结论 生物信息学技术在结核分支杆菌ESAT-6重组抗原研究中有一定的理论和应用价值.     

OBE理念下基因组学与生物信息学分析技术教学改革探索

基因组学与生物信息学分析技术是一门多学科交叉的工具类课程,致力于培养学生获取、分析和利用生物信息数据的能力.文章将成果导向型教学(OBE)理念应用在基础医学专业基因组学与生物信息学分析技术课程教学改革中,在OBE理念指导下进行了课程的重新设计和实施,并对教学改革的实施效果进行了调研.     

生物信息学在医学研究中的应用进展

随着高通量技术的出现及其在疾病基因组、蛋白组学研究中的应用,生物信息学在解读基因组、转录组及蛋白质组学分析产生的海量数据中发挥着越来越重要的作用。生物信息学在致病基因寻找、药物有效靶点筛选等医学研究各领域的发展日益深入。现就生物信息学在基础医学、临床医学及药物开发研究中的应用进展进行综述。     

生物信息学在医学基础研究中的应用

介绍生物信息学的概念及其在医学基础研究中的应用,包括发现新基因、基因诊断、功能基因组学、基因芯片分析、蛋白质鉴定、代谢物组学研究以及新药开发等。     

生物信息学研究现状及发展趋势

阐述生物信息学的内涵及发展历程，详细介绍国内外生物信息学的研究现状与发展趋势，在此基础上结合国内基础及优势，提出未来我国生物信息学应当关注的重要科学问题。     

小儿常见发热出疹性疾病智能诊断模型研究

目的 探索实用于社区医生和家庭成员使用的小儿常见发热出疹性疾病智能诊断方法.方法 收集2005年1月至2010年11月第三军医大学西南医院儿科及感染科248例小儿发热出疹性疾病住院患者的临床资料,其中男性133例,女性115例,平均年龄4.56岁.病种包括麻疹、幼儿急疹、水痘、手足口病、猩红热、风疹和药疹等.整理并描述...     

结肠癌核心基因和独立预后因子筛选的生物信息学分析

挖掘基因表达综合（GEO）数据库和癌症基因组图谱（TCGA） 数据库中结肠癌基因表达数据,探讨引发结肠癌的潜在核心基因及独立预后因子。     

小波变换和独立分量分析去除脑电信号中的噪声和干扰

目的：去除脑电信号中的噪声和心电干扰。方法：首先采用小波软门限法去除脑电中的噪声，然后使用扩展独立分量分析算法去除脑电信手中的心电干扰。该算法的优点在于不需要计算信号的高阶统计量，收敛速度快，同时适用于超高斯和亚高斯混合信号的分离。在提取独立分量之前，对观测信号进行白化处理，去除各信号之间的相关性。结果：消除了脑电信号中的噪声和心电干扰。结论：小波门限去噪结合独立分量分析可有效地去除脑电信手中的噪声和心电干扰。     

Characteristics of Atmospheric Fine Particulate Matter(PM_(2.5)) Induced Differentially Expressed Proteins Determined by Proteomics and Bioinformatics Analyses

Objective To screen the differentially expressed proteins(DEPs) in human bronchial epithelial cells(HBE) treated with atmospheric fine particulate matter(PM_(2.5)).Methods HBE cells were treated with PM_(2.5) samples from Shenzhen and Taiyuan for 24 h. To detect overall protein expression, the Q Exactive mass spectrometer was used. Gene ontology(GO), Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG), and Perseus software were used to screen DEPs.Results Overall, 67 DEPs were screened in the Shenzhen sample-treated group, of which 46 were upregulated and 21 were downregulated. In total, 252 DEPs were screened in the Taiyuan sampletreated group, of which 134 were upregulated and 118 were downregulated. KEGG analysis demonstrated that DEPs were mainly enriched in ubiquitin-mediated proteolysis and HIF-1 signal pathways in Shenzhen PM_(2.5) samples-treated group. The GO analysis demonstrated that Shenzhen sample-induced DEPs were mainly involved in the biological process for absorption of various metal ions and cell components. The Taiyuan PM_(2.5)-induced DEPs were mainly involved in biological processes of protein aggregation regulation and molecular function of oxidase activity. Additionally, three important DEPs, including ANXA2, DIABLO, and AIMP1, were screened.Conclusion Our findings provide a valuable basis for further evaluation of PM_(2.5)-associated carcinogenesis.     

主成分改进的Logistic回归模型方法在流行病学分析中的应用

目的探讨在涉及多自变量的Logistic回归分析中变量间多重共线性的诊断和处理方法.方法应用主成分改进的Logistic回归方法进行多重共线性变量的诊断与处理. 结果去除了回归模型中变量间的多重共线性影响,建立了较为理想的关系模型. 结论在Logistic回归模型分析中应用上述方法进行多重共线性的诊断和处理是有效及可行的.     

基于BP神经网络与决策树的大肠癌虚实证型分类对比

采用二进制编码对症状数据进行量化,将专家归纳的8个证型分为虚实两证并赋值量化,建立基于BP神经网络与决策树的大肠癌虚实证型分类模型,结果显示BP神经网络分类模型较决策树分类模型更适合于非线性映射关系的处理。     

应用主成分分析法评价某院科室效益

目的 对36个科室效益进行综合评价,为科室提高经营能力提供参考,为医院制定定量考评寻求依据.方法 选择具有代表性的8个指标,利用excel工具软件对原始数据用均值标准差模式进行标化处理,对处理后的新变量用SPSS 13.0软件进行主成分法分析.结果 36个科室效益得到了客观的综合评价,编号20、32、19、18、3、2、1的科室效益居前,归为第一类科室和第二类科室.归为第四类科室编号为9、15、23、25、34的效益落在后五位.结论 主成分综合评价排名和分类结果与实际情况基本相符,它客观地说明了科室服务能力和经营状况,真实地反映了科室之间存在的差距,评价过程全面,评价结果合理.