基因芯片技术在肿瘤研究中的应用

随着人类基因组计划 (ＨＧＰ)即全部核苷酸测序的完成 ,人类基因组研究的重心逐渐进入功能基因组时代。通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析 ,研究基因在生物体内的功能 ,阐明不同基因协同作用的机制 ,进而在人类重大疾病如癌症等的发病机制、诊断治疗和药物开发等方面的研究将发挥巨大的作用。基因芯片又称ＤＮＡ微阵列 (ＤＮＡｍｉｃｒｏａｒｒａｙ)是近年发展起来的一项ＤＮＡ分析技术 ,一般包括寡核苷酸芯片和ｃＤＮＡ芯片 2种 ,其基本原理是将成千上万个代表不同基因的寡核苷酸或ｃＤＮＡ“探针” ,密…     

基因芯片技术在恶性肿瘤中的应用

随着人类基因组 (测序 )计划 (ｈｕｍａｎ ｇｅｎｏｍｅ ｐｒｏｊｅｃｔＨＧＰ)即全部核苷酸测序的即将完成 ,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代 (ｐｏｓｔｇｅｎｏｍｅＥｒａ) ,向基因功能及基因的多样性倾斜[1] 。然而 ,怎样去研究如此众多基因在生命过程中担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题 ,今后相当长一段时间主要工作将集中在揭示所有基因转录表达层次上的信息 ,研究相应基因在生物体内的功能 ,阐明不同层次多基因共同作用 ,进而在人类重大疾病如肿瘤、心血管疾病、药物开发等方面的研究发挥巨大作用 ,将大大推…     

基因表达谱芯片在肿瘤研究中的应用

20世纪人类最宏伟的基因组 (ｈｕｍａｎｇｅｎｏｍｅｐｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ)计划已基本完成。目前已逐步进入了功能基因组时代[1] 。人类面临的更艰巨的任务是研究基因组功能 ,今后相当长一段时间的主要工作将集中在揭示所有基因转录表达层次上的信息。基因芯片 (ｇｅｎｅｃｈｉｐ)又称ＤＮＡ芯片 ,ＤＮＡ微阵列 (ＤＮＡｍｉｃｒｏａｒｒａｙ)、ｃＤＮＡ微阵列、寡核苷酸微阵列(ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓｍｉｃｒｏａｒｒａｙ) ,是近几年发展起来的一项前沿生物技术[2 ] 。基因芯片技术的出现使全面、综合分析某些生命现象成为可能…     

功能基因组学及生物芯片技术在中药现代化研究中的应用

在新世纪来临之际,伴随着人类基因组计划的初步完成,人类对生命本质与疾病的研究进入了后基因组时代。后基因组时代的主要任务之一就是阐明单个基因的功能与基因或基因产物间的相互作用,称为功能基因组学(Functional Genom ics)[1]。“中药基因组学”[2,3]是通过现代科学技术手段结合传统中药理论和现代科学理论,将中药的药性、功能及主治与其对特定疾病相关基因表达和调控的影响关联起来,在分子水平上用现代基因组学,特别是功能基因组学的理论来诠释传统中药理论及作用机制。实际上是将人类基因组研究的内容和成果与中药研究互相联系,即在基因水平探讨中药作用的机制和原理。生物芯片技术是随着人类基因组研究的进展,在最近几年出现的高新技术。由于该技术可以在有限的实验条件下获得极为大量的生物信息,使研究工作的效率得到极大的提高,受到科学界的重视。生物芯片包括基因芯片、蛋白芯片、细胞芯片、组织芯片以及其他多种由生物材料制成的芯片。目前研究最成熟、应用最广泛的是基因芯片。基因芯片是利用核酸杂交原理来检测未知分子,它是将核酸片段种植到一个支持物上(如膜、玻璃、塑料和硅片等),与检测样品杂交后由标记分子标记杂交体,经自动阅读设备分...     

我科研人员首提“人类泛基因组”概念

<正>经过不懈研究和攻关,我国科研人员在人类基因组研究中获得新的重大进展——发现人类基因组中存在着种群特异甚至个体独有的DNA序列和功能基因。科研人员还首次提出了"人类泛基因组"的概念。     

我国科学家首次提出“人类泛基因组”

本刊讯近日,我国科研人员在人类基因组研究中获得新的重大进展,发现人类基因组中存在着种群特异甚至个体独有的DNA序列和功能基因。科研人员还首次提出了＂人类泛基因组＂的概念。     

2000年国际人类基因组会议在温哥华召开

国际规模最大的人类基因组研究盛会—— 2 0 0 0年国际人类基因组会议于今年 4月在加拿大温哥华召开。数十个国家的千余名从事基因组研究的科学家与会 ,我国北京、上海、昆明、香港、台湾等地有关科研机构和高等院校派代表参会。中国医学科学院共有 5人前往。我国大陆代表提交的论文涉及基因组测序、疾病相关基因的定位、克隆和功能研究、疾病的遗传变异分析、基因组多样性、基因表达与调控等内容。这些内容都是本次会议研讨的主要议题 ,也基本反映出了我国人类基因组研究的概貌。本次会议传达出如下一些信息 :一、以基因组测序为主要目标的…     

基因芯片在肿瘤研究中的应用

人类已逐步进入功能基因组时代,基因芯片作为近期发展起来的一项新技术,能够研究细胞内所有基因的表达谱,同时获得成千上万基因活化的模式,并为研究肿瘤发生发展过程中的基因表达情况提供了强有力的工具。本文对基因芯片技术在肿瘤研究中的应用,包括寻找新的肿瘤相关基因,基因表达谱研究、基因功能研究,肿瘤分子病理分型及诊断芯片等方面进行了探讨。     

2001年国际人类基因组会议即将召开

2001年国际人类基因组会议将于2001年4月19日～22日在英国爱丁堡举行。这次会议的交流形式为Symposia、ScientificWorkshops和EthicsWorkshops。与以往会议相比,本次会议特别把人类基因组研究中的伦理问题单独设立Workshop进行交流,说明伦理问题在基因组研究中已受到重视。　　在Symposia中,讨论的内容包括：基因调控、基因表达、高通量技术、复杂性状遗传学(疾病)、模式生物——功能研究和医学基因组学。ScientificWorkshops讨论的内容包括：功能基因组学、突变检测、基因表达与调控、模式生物、新技术、人类多样性、多态性和进化、…     

乳腺癌、甲状腺癌和黑色素瘤全基因组关联分析计量和热点研究

全基因组关联研究(GWAS)是利用高通量基因芯片技术,对人类全基因组范围内常见遗传变异-单核苷酸多态性(SNP)和拷贝数变异(CNV)进行总体关联分析的研究方法[1]。国际人类基因组测序和单体型图谱工程的完成,以及经济高效的高通量基因分型技术的开展,使全基因组范围内筛检与疾病相关的序列变异成为可能,通过比较全基因组范围内所有变异的等位基因频率,从中发现与疾病相关联的序列变异[2-3]。2007年,Duggan等[4]和Murabito等[5]利用Illumina及Affymetrix的基因芯片对前列腺癌进行了GWAS,此后,越来越多肿瘤方面的GWAS研究结果陆续发表。本研究使用最新的GWAS数据库之一—NHGRI,分析挖掘乳腺癌、甲状腺癌和黑色素瘤文献特征数据,以期为国内甲状腺、乳腺及皮肤肿瘤GWAS提供参考。     

基因芯片筛选原发性肝癌患者的差异表达基因

目的利用基因表达谱芯片技术探讨原发性肝癌(PHC)不同阶段(癌组织、癌旁组织、正常组织)差异基因的表达,进一步寻找PHC不同阶段组织中的差异表达基因。方法提取20例肝癌癌组织、癌旁组织和正常组织的总RNA,应用Agilent人类全基因组4×44K基因芯片筛选差异表达基因,采用微阵列类分析(SAS)软件对芯片图像进行分析。结果筛选出癌组织与正常组织差异基因4 175个,其中上调基因1 850个,下调基因2 325个。对筛选出的差异基因进行GO分类,主要分为催化活性、信号转导、酶活性调节、转录活性调节、蛋白运输功能、细胞生长、凋亡等功能过程。结论利用基因芯片技术可高通量地筛选出PHC不同阶段组织的差异表达基因,为进一步阐明PHC的发生机制提供实验依据。     

国内外生物基因资源管理利用及人类基因组计划研究现状

本文介绍了国内外生物基因资源以及人类基因组计划的开展状况,提出了加强我国生物基因资源利用及开展人类基因组研究的必要性,并就如何开展我国生物基因资源和人类基因组的研究提出几点意见。     

国内外生物基因资源管理利用及人类基因组计划研究现状

本文介绍了国内外生物基因资源以及人类基因组计划的开展状况，提出了加强我国生物基因资源利用及开展人类基因组研究的必要性，并就如何开展我国生物基因资源和人类基因组的研究提出几点意见。     

基因芯片技术在中医药研究中的应用进展

随着人类基因组计划的完成,人类正从结构基因组学(Structural genomics)进入功能基因(Func-tional genomics)和功能蛋白质组(Functional pro-teomics)时代[1],也促进了基因芯片技术、生物信息学技术等与中医药研究有关的高新技术的发展。其中,基因芯片技术以高通量、高集成、多样化和自动     

基因芯片技术及其在疾病研究中的应用

人类基因组计划（human genome project,HGP）的完成,极大地带动了人类疾病相关基因的定位、克隆、结构与功能研究。人类基因组草图基本绘就之后,人类基因组计划也由此加入到功能基因组时代;生命科学的重点也由基因序列研究上升为基因功能研究,基因芯片就是在这个背景下发展起来的一项先进技术。与传统方法相比,它具有快速、高通量、高准确性、低成本等特点,能够满足临床基因检测的要求;且其操作简单、易于标准化、适于推广,显示出广阔的临床应用前景。本文就基因芯片技术的研究进展及其在疾病研究中的应用做一简要综述。     

我国人类基因组研究的回顾

随着2004年10月人类基因组精细图在Naturc杂志上发表,标志着人类基因组DNA全序列测定的目标已基本达到;最近,绘制人类基因组SNP单体型图谱（HapMap）的国际合作第一阶段的任务也基本完成,识别人体内所有基因的结构与功能,解读包括非编码序列在内的人类遗传物质的全部信息,已是人类基因组研究的主要任务。     

基因芯片技术在肿瘤病理诊断中的应用研究

一、基因芯片的基本概念 基因芯片(gene chip)或称为DNA芯片,DNA微点阵(DNA microarray)、寡核苷酸阵列(oligonucle-tidearray)是20世纪90年代随着人类基因组研究的深入而迅速发展起来的新兴的革命性技术.     

DNA芯片技术的研究进展

随着后基因组时代 (ｐｏｓｔｇｅｎｏｍｅｅｒａ)的到来 ,研究的工作重心已从基因结构方面转向基因功能方面[1] 。传统的建立在电泳基础上的基因表达、序列测定、突变和多态性检测等研究方法 ,费时、耗资 ,且不利于自动化 ;而ＤＮＡ芯片 (ＤＮＡＣｈｉｐ)技术结合人类基因组计划 (ＨＧＰ)提供的大量信息 ,使得我们能够在全部基因组水平上对上述问题进行研究 ,因此有人说今后基因组研究的大部分工作将在芯片上的实验室 (ｌａｂ -ｏｎ-ａ -ｃｈｉｐ)完成。ＤＮＡ芯片又称基因芯片 (ｇｅｎｅｃｈｉｐ)、微排列 (ｍｉｃｒｏａｒ ｒａｙ)。是指一…     

疾病基因组学研究——后基因组时代的主旋律

2001年2月份,6国科学共同体(美、英、日、法、德、中)和Celera公司同时宣告人类基因组测序计划基本完成[1,2],这意味着人类基因组研究取得了"结构基因组学"研究的阶段性突破,进入了以研究基因组功能为主要内容的新阶段,这个新阶段,有人将之称为"后基因组时代(postgenomic era)".     

氨磷汀调控人类造血及免疫相关基因的筛选及生物信息学预测

目的利用开放性基因芯片数据库筛选氨磷汀调控人类造血及免疫相关基因并对其进行生物信息学分析。方法以氨磷汀（Amifostine）为关键词,在互联网开放性数据库包括GEO、SAGE、GeneCard、InterPro、ProtoNet、UniProt和BLOCKS中搜索基因表达数据,对筛选出的数据库进行生物信息学分析,计算差异表达基因,再利用The Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery（DAVID）数据库进行造血及免疫相关基因的功能聚类分析。结果仅在GEO数据库中筛选出1个氨磷汀调控人类基因组表达数据库。分析表明,氨磷汀处理K562细胞后,人类全基因组仅2．14％（460／192000）的基因在转录水平表达有显著差异（P〈0．01）。460个差异基因中有139条为已知功能基因,聚类分析共筛出17个与造血及免疫相关的基因,分属于8大类生物学通路,其中上调基因15个,下调基因2个。结论充分利用开放性基因芯片数据库,可经济、方便和快捷地分析药物调控人类基因表达谱特点,为预测和验证药物新的药理作用提供指导。