基于网络药理学探讨牛蒡子治疗糖尿病肾病的作用机制

目的:基于网络药理学分析中药牛蒡子治疗糖尿病肾病作用机制。方法:依托TCMSP数据库筛选得到中药牛蒡子的有效成分，并结合Uniprot数据库进一步预测对应靶点。通过GeneCards数据库收集与糖尿病肾病相关的基因，将疾病与中药牛蒡子靶点取交集，而后导入String数据库，构建蛋白质-蛋白质互作网络，进而分析得到核心靶点。最后通过David数据库对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:预测筛选出牛蒡子8个有效成分和108个不重复的作用靶点，糖尿病肾病相关基因3 513个。中药牛蒡子与疾病共有靶点68个。通过PPI网络分析，TNF、AKT1、JUN、PTGS2、ESR1等可能是中药牛蒡子治疗糖尿病肾病的关键靶点。TNF信号通路、VEGF信号通路、HIF-1信号通路等很可能为中药牛蒡子治疗糖尿病肾病的关键通路。结论:网络药理学系统阐述了中药牛蒡子治疗糖尿病肾病的潜在药理机制与多个靶点、多种信号通路有关。     

黄芪-生地治疗糖尿病肾病作用机制的网络药理学研究

目的:应用网络药理学方法探讨黄芪-生地干预糖尿病肾脏疾病(diabetic kidney disease, DKD)的物质基础及作用机制。方法:应用TCMSP及TCMID数据库及结合相关文献筛选黄芪、生地药物成分,运用Swiss Target Prediction分析平台获取活性成分关键靶点,GeneCards数据库获取疾病靶点信息;利用韦恩图获取药物和疾病交集靶点,String数据库对交集靶点进行PPI分析;将交集靶点上传至Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,应用Cytoscape3.8.2软件构建“成分-靶点-信号通路”网络。结果:共查找符合筛选条件药物成分33个,活性药物靶点263个,疾病靶点756个,药物和疾病交集靶点67个,设定条件下,GO功能富集分析共得到53个条目,涉及分子功能、细胞组成及生物过程,KEGG富集分析筛选18条信号通路,关键靶点VEGFA、JUN、MET、EGFR、IGF等主要富集在肿瘤信号途径、c型凝集素受体信号通路、白介素17信号途径等相关信号通路。结论:黄芪-生地可通过多靶点、多途径干预DKD进展,预测中药潜在作用机制,为进一步...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨聚精丸治疗精索静脉曲张性男性不育的作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨聚精丸治疗精索静脉曲张性男性不育的潜在作用机制。方法:通过TCMSP数据库及BATMAN数据库检索聚精丸中药成分并获取成分对应的靶点;在“GeneCards”“DISGENET”“OMIM”“HPO”数据库检索“varicocele”、“male infertility”,获得精索静脉曲张性男性不育的潜在靶点;利用jvenn工具绘制韦恩图,获得中药靶点与疾病靶点的交集靶点;筛选出与交集靶点相对应的成分及中药,在Cytoscape3.8.2构建中药-活性成分-靶点网络图;应用STRING平台构建病药交集靶点的蛋白-蛋白相互作用网络(PPI);将病药交集靶点导入DAVID数据库进行GO富集分析并进行基于KEGG的通路富集分析;再将病药交集靶点上传至KEGG数据库,选择与本课题最为相关的通路,使用mapper工具构建KEGG通路图;进一步使用FDR值排名前15的通路与其相关靶点、成分绘制核心成分-靶点-通路图;最后,利用AutoDock及PyMol软件对核心基因的蛋白受体和小分子配体进行分子对接验证及结果的可视化分析。结果:共筛选出聚精丸207种成分和1...     

基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病的作用机制

目的:基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease, CKD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库收集药物活性成分和潜在靶点,通过GeneCards和Disgenet数据库获取CKD靶点;利用软件Venny2.1获取药物-疾病交集靶点,采用STRING数据库构建PPI蛋白网络,并筛选核心靶点;通过DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,借助软件Cytoseape3.9.1构建活性成分-疾病-靶点-信号通路网络。结果:筛选得到健脾养血排毒方有效成分130种,主要为槲皮素、山柰酚、刺芒炳花素等,涉及257个靶点基因;疾病靶点1 817个,健脾养血排毒方-CKD交集靶点156个,经拓扑分析获得TNF、VEGFA、TP53等69个核心靶点;富集分析涉及PI3K-Akt、AGE-RAGE及MAPK信号通路。结论:本研究初步探析了健脾养血排毒方治疗CKD的活性成分、潜在靶点及信号通路,为其干预CKD的作用机制提供了理论依据。     

骨康方君臣佐使药治疗骨质疏松药理机制探讨

目的 基于网络药理学分析骨康方中药治疗骨质疏松(OP)的具体作用机制及其作用靶点、通路的异同。方法 首先通过数据库以及文献检索分别筛选出骨康方中君臣佐使各药的主要活性成分及其作用靶点;同时利用网络数据库得到OP相关的靶点;通过Venny 2.1分别筛选出君臣佐使-OP的交集靶点;然后通过STRING和Cytoscape软件分别构建骨康方中君臣佐使-OP交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络并筛选出关键靶点;最后通过DAVID数据库分别对君臣佐使-OP的关键靶点进行KEGG通路分析,并使用Venny 2.1对KEGG结果进行交集。结果 经交集筛选后获得君臣佐使-OP的关键靶点,其中君药有6个、臣药有30个、佐药有31个和使药有30个,KEGG通路富集结果显示有9条君臣佐使各药关键靶点的共同通路、7条君药所特有的通路、2条臣药特有通路和1条使药特有通路,而佐药无特有的通路。结论 骨康方中君臣佐使各药有共同的调节通路,可能通过MAPK通路治疗OP,同时也有各自特殊的调节机制,发挥独特作用。     

基于网络药理学的排毒保肾丸治疗慢性肾衰竭作用机制研究

目的:通过网络药理学筛选排毒保肾丸治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure,CRF)的作用靶点和相关信号通路,明确其作用机制。方法:应用TCMSP、BATMAN-TCM数据库结合文献挖掘获取排毒保肾丸的活性成分和作用靶点;通过Gene Cards、OMIM数据库获取慢性肾功能衰竭的疾病靶点;筛选出与排毒保肾丸共同的靶点,进而利用Venny 2.1绘制共同靶点韦恩图;利用STRING构建共同靶点互作网络(PPI);应用Cytoscape 3.7. 1软件构建成排毒保肾丸丸活性成分-CRF-靶点交集的网络;通过R语言软件对共同靶点进行GO分析和慢性肾功能衰竭作用靶点的KEGG分析,筛选出潜在通路并分析其作用机制。结果:筛选出排毒保肾丸中生物活性成分44个,作用于22个CRF的共同靶点,核心靶点为IL-6、CCND1、CASP3、VEGFA、FOS,主要涉及类固醇受体活性、DNA转录活性、核受体活性等生物过程,主要富集在IL-17、TNF、AGE-RAGE、NF-κB等信号通路。结论:排毒保肾丸通过多成分、多靶点、多通路的整体调节作用而治疗CRF,为后续实验研究提供可靠的理论基础及参考。     

桃红四物汤治疗骨质疏松性骨折的网络药理学和分子对接研究

目的 运用网络药理学和分子对接的技术,研究桃红四物汤作用于骨质疏松性骨折的潜在作用机制。方法 检索TCMSP,获取桃红四物汤药物的有效成分、潜在靶点,运用GeneCards、OMIM、DrugBank、DisGeNET数据库收集骨质疏松性骨折的相关靶点,获取药物和疾病的交集靶点,并通过Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络图,筛选出药物关键成分。将交集靶点上传到STRING数据库,并绘制PPI网络图,筛选核心靶点;并使用Metascape数据库进行交集靶点的GO以及KEGG通路的富集分析。最后运用AutoDock Tools1.5.6和Pymol2.4.1软件,分子对接关键成分与核心靶点。结果 桃红四物汤与骨质疏松性骨折的交集靶点有152个,“药物-成分-靶点-疾病”网络图及PPI提示IL6、JUN、AKT1、MAPK1、TNF可能是桃红四物汤治疗骨质疏松性骨折的关键靶点。GO富集分析显示,桃红四物汤治疗骨质疏松性骨折的交集靶点的生物功能主要涉及炎症免疫、细胞增殖分化、细胞凋亡等方面。KEGG通路富集分析显示,桃红四物汤治疗骨质疏松性骨折的交集靶点主...     

芪骨胶囊治疗绝经后骨质疏松症的分子机制

目的运用网络药理学的方法探究芪骨胶囊治疗绝经后骨质疏松症(postmenopausal osteoporosis,PMOP)的活性成分与潜在分子机制。方法从BATMAN-TCM数据库中获取芪骨胶囊的主要活性成分及其对应的靶点,在Gene Cards数据库和GEO数据库中筛选PMOP疾病靶点,将药物靶点与疾病靶点取交集,运用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点"网络图,同时将交集靶点导入String在线软件构建蛋白互作网络,筛选出核心靶点进行GO(gene ontology)生物过程及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析。结果筛选获得67个活性成分,核心活性成分包括24-羟基-11-脱氧甘草次酸、菊油环酮、β-谷甾醇、γ-谷甾醇等;获得交集靶点共57个,其中核心靶点有胰岛素(INS)、白介素-6(IL-6)、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)等。核心靶点GO生物过程和KEGG通路富集分析结果显示,GO生物过程主要涉及女性怀孕、多细胞生物过程等,KEGG通路主要涉及雌激素信号通路、卵巢甾体生成、流体剪切应力与动脉粥样硬化、白细胞介素17信号通路等。结论对于芪骨胶囊治疗PMOP的作用机制可能与菊花、黄芪、肉苁蓉中的主要成分如α-蒎烯、菊油环酮、β-谷甾醇等有关,并可能通过雌激素、白细胞介素等信号通路作用于人体INS、IL-6、IGF-1等靶点发挥疗效。     

基于网络药理学研究杜仲治疗骨质疏松性骨折的作用机制

目的基于网络药理学研究杜仲治疗骨质疏松性骨折的分子作用机制。方法利用TCMSP计算系统生物学实验室、Gene Cards数据库,分别对杜仲的有效成分、杜仲的治疗靶点和骨质疏松性骨折的靶标进行筛选,然后利用R语言软件对杜仲治疗靶点与骨质疏松性骨折疾病靶标进行取交集,得到中药-疾病靶标,再利用Cytoscape技术对杜仲的多组分、多靶点、多通路、多疾病网络进行可视化研究,构建中药-疾病-成分-靶标的调控网络,然后通过构建杜仲与骨质疏松性骨折靶标的相互作用网络图以及柱状图,从而筛选得到其关键核心的靶标。最后对核心靶标进行GO和KEGG分析。结果筛选得到杜仲治疗骨质疏松性骨折19个有效成分,59个中药-疾病靶标,杜仲-骨质疏松性骨折靶标涉及的GO功能富集的结果包括核受体的活动、转录因子活性、类固醇激素受体活性等。杜仲-骨质疏松性骨折靶标涉及的KEGG信号通路富集分析的结果主要包括:细胞凋亡信号通路、内分泌抵抗、p53信号通路、MAPK信号通路、NF-kappaB信号通路、PI3K-Akt信号通等。结论杜仲治疗骨质疏松性骨折的作用机制是杜仲中所含有的多个有效成分调节骨质疏松骨折愈合过程中的多个相关的基因,进而介导了骨折愈合过程中的多条信号通路,经与相关文献报道信息整合发现,杜仲治疗骨质疏松性骨折的调控信号通路主要为细胞凋亡、PI3K-Akt、MAPK、p53、NF-kappaB等信号通路,这些通路通过直接或间接调节骨代谢稳态平衡,最终达到治疗骨质疏松性骨折的目的。     

枸杞子治疗骨质疏松症的分子机制

目的 运用网络药理学方法分析枸杞子治疗骨质疏松症的药理学机制。方法 从TCMSP分析平台上获取枸杞子药物的活性成分及潜在的作用靶点,运用Citespace3.7.1软件绘制“有效成分-靶点”网络图;同时分别在OMIM、Drugbank和Genecards三种数据库平台上获取骨质疏松疾病的相关基因,并取并集作为疾病的潜在作用靶点。将枸杞子和骨质疏松疾病的潜在作用靶点取交集,得到中药-疾病共同作用靶点。运用STRING数据分析平台对共同作用靶点进行PPI网络分析,利用cytohubba插件选取前20位显著性基因并取交集即可得到核心基因。对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富分析,而后使用R语言软件对上述的富集结果进行可视化绘图。结果 共筛选获得枸杞子中主要有效成分36个,其中主要核心有效成分有槲皮素、黄豆黄素、β-谷固醇、豆甾醇、谷甾醇α1。活性成分所对应的靶点基因有117个,其中核心基因16个：IL-6、JUN、TNF等。GO富集所得的生物过程主要与调控成骨细胞和破骨细胞的增殖、分化有关。KEGG信号通路富集结果提示,枸杞子治疗骨质疏松疾病作用集中于IL-17、TNF、AGE-RAGE、MAPK等信号通路。结论 枸杞子可能通过多种有效成分、多靶点作用于免疫炎性反应、细胞分化等多方面来发挥抗骨质疏松症的作用。     

基于网络药理学探究肾康栓治疗糖尿病肾病作用机制

目的:应用网络药理学探究肾康栓治疗糖尿病肾病的药物作用机制。方法:通过TCMSP现有数据库查询肾康栓的活性成分及靶点，在GeneCards数据库查询糖尿病肾病的靶点，制作韦恩图得到二者共同靶点。利用Cytoscape3.9.1软件制作药物-活性成分-靶点-疾病网络，在String平台得到PPI网络并进行拓扑分析，利用Metascape平台做GO和KEGG富集分析。结果:肾康栓活性成分117个，活性成分靶点226个，糖尿病肾病靶点1 191个，二者交集靶点108个，918条成分与靶点相互作用。JUN、STAT3、AKT1、RELA、MAPK1为肾康栓治疗糖尿病肾病关键靶点，AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、肿瘤信号通路等为重要通路。结论:肾康栓在多成分、多靶点、多通路的机制上治疗糖尿病肾病，为后续研究奠定理论基础。     

基于网络药理学的水陆二仙丹治疗肾病综合征的机制探索

目的:运用网络药理学方法探讨水陆二仙丹治疗肾病综合征的药理机制。方法:通过中药系统药理学数据库及分析平台、Swiss Target Prediction数据库分别获取水陆二仙丹药物主要活性成分和作用的靶点,在Genecard数据库中查找NS对应的靶点,将最终筛选的靶点建立靶点相互作用网络,并用DAVID数据库对靶点进行GO分析和KEGG通路分析,最终建立药物-成分-靶点-通路网络。结果:筛选得到水陆二仙丹16个活性成分,涉及86个作用靶点,靶点主要通过调控PI3K-AKT、RAS、Rap1、HIF-1、VEGF等信号通路来发挥治疗NS的作用。结论:黄酮类可能是水陆二仙丹治疗NS的物质基础,通过调节PI3K-AKT、RAS等通路从而修复受损的足细胞、降低肾小球灌注压等作用减轻NS蛋白尿。     

基于网络药理学和分子对接技术结合GEO芯片探究补中清利汤治疗IgA肾病的作用机制

目的:基于网络药理学、分子对接技术,并结合GEO芯片研究中药复方补中清利汤治疗IgA肾病的作用机制。方法:从TCMSP中药数据库中搜索补中清利汤各药物活性成分及靶点。借助多个疾病数据库并结合GEO基因芯片,获取IgA肾病疾病靶点。通过R语言4.2.2获取药物和疾病共同靶点后利用String数据库构建蛋白互作网络。通过Cytoscape 3.9.1(Cyto NCA插件)及Discovery Studio 2019对核心靶点进行筛选及完成分子对接。最后利用R语言4.2.2进行GO注释和KEGG富集分析。结果:补中清利汤治疗IgA肾病共筛选出70个有效活性成分,107个潜在作用靶点(核心靶点基因：JUN、MAPK1、TP53、HSP90AA1、MAPK14和HIF1A),主要涉及通路有：Lipid and atherosclerosis(脂质与动脉粥样硬化)、Fluid shear stress and atherosclerosis(流体剪切应激和动脉粥样硬化)、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications(糖尿病并发症AGE-...     

基于网络药理学的木丹颗粒治疗糖尿病肾病的作用机制研究

目的:基于网络药理学方法探讨木丹颗粒治疗糖尿病肾病的作用机制。方法:利用TCMSP、TCMID和Swiss Target Prediction数据库筛选木丹颗粒的活性成分及其作用靶点。通过Genecards、OMIM数据库检索糖尿病肾病相关靶点。通过Venny 2.1获得的交集靶点利用Cytoscape 3.8.0构建PPI网络图。通过DAVID数据库对关键靶点进行GO及KEGG富集分析。结果:筛选出木丹颗粒的活性成分174个，其中治疗糖尿病肾病的核心活性成分22个，包括槲皮素、木犀草素、山柰酚、黄芩素与甘草查尔酮A等；木丹颗粒治疗糖尿病肾病的核心靶点24个，包括PTGS2、RELA、AKT1、MAPK1、TNF等；KEGG共富集到126条信号通路，包括PI3K-AKT、TNF、HIF-1等信号通路。结论:木丹颗粒可能通过抑制氧化应激、炎症反应等机制治疗糖尿病肾病，为其后续基础研究提供参考。     

二仙汤防治骨质疏松症的网络药理学研究

目的通过网络药理学分析二仙汤防治骨质疏松症(osteoporosis,OP)的关键靶点,探讨二仙汤防治OP的可能机制及信号通路。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选二仙汤的入血活性成分并预测其作用靶点;利用基因表达数据库(GEO)获取GSE56116基因芯片原始数据,分析二仙汤的治疗靶点;从疾病相关数据库检索已知OP致病基因;通过STRING和Cytoscape软件映射获得二仙汤治疗OP的关键靶点,建立关键靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行KEGG和GO富集分析揭示其可能的作用机制。结果通过检索TCMSP获得符合筛选标准的二仙汤活性成分84个,21个活性成分预测出145个作用靶点;通过R语言对基因芯片进行分析筛选出84个可能致病靶点,通过疾病相关数据平台获得691个OP相关致病靶点,利用STRING和Cytoscape构建PPI网络筛选出40个关键作用靶点和9个核心作用靶点。KEGG和GO分析结果显示,二仙汤治疗OP的关键靶点主要富集在RNA聚合酶II启动子对转录的正向调节、一氧化氮合酶等生物学进程,主要富集的信号通路为TNF信号通路、低氧诱导因子1信号通路和雌激素信号通路等。结论通过网络药理学方法阐释二仙汤可能通过TNF信号通路和HIF-1信号通路治疗OP,本研究为揭开中药复方治疗疾病的作用机制提供了科学的方法。     

基于网络药理学和生物信息学补肾活血胶囊抗骨质疏松的分子机制分析

目的基于网络药理学和生物信息学挖掘补肾活血胶囊的活性成分靶点和骨质疏松症的靶点,探究补肾活血胶囊抗骨质疏松的分子机制。方法通过采用网络药理学和生物信息学的相关手段,对补肾活血胶囊进行活性成分筛选、药物疾病靶点预测,明确补肾活血胶囊防治骨质疏松症的特异性靶点,分析其信号通路富集程度以探究其分子机制。结果通过TCMSP数据库检索共发现补肾活血胶囊相应成分1186个,根据OB值和DL值筛选出入血活性成分249个,在此基础上获得其预测靶点145个。通过二次挖掘GEO数据库的基因芯片筛选出明显的差异基因124个;检索疾病基因相关数据库共发现与骨质疏松症发生发展相关的已知的靶点基因356个。通过cytoscape构建并结合网络拓扑分析共筛选出关键基因229个;利用Clue GO富集分析显示,补肾活血胶囊除与直接作用于骨质疏松症关键节点涉及的信号通路,如Wnt信号通路、TGF-β信号通路和Notch信号通路等有关,还对P13 K-AKT信号通路、VEGF信号通路和甲状腺素信号通路等同时进行调控。结论补肾活血胶囊治疗骨质疏松症具有多成分、多靶点的特点;其主要通路不仅直接参与骨重建的细胞分化,调节成骨、破骨代谢平衡,还通过全身其他系统,如循环系统、神经系统等来干预和影响骨微环境,与目前抗骨质疏松的作用机制相符合。     

基于网络药理学及分子对接探讨桂龙护瘘酊治疗自体动静脉内瘘血管内膜增生的作用机制

目的基于网络药理学方法以及分子对接探讨桂龙护瘘酊(GT)治疗自体动静脉内瘘(AVF)血管内膜增生(IH)的作用机制。方法:本研究基于HERB数据库并查阅相关文献,筛选GT方中药物的活性成分,按Lipinsk五原则筛选有效成分,并使用PubChem数据库获取成分的Smile,再用Swiss TargetPrediction数据库预测成分靶点。利用GeneCards、Pharmgkb、OMIM数据库收集AVF血管内膜增生相关靶点。利用Venn在线网站得到GT-AVF血管内膜增生的交集靶点Venn图。利用String平台构建以药物、活性成分、潜在靶点的PPI网络,利用DAVID数据库中对其进行GO富集分析和KEGG信号通路分析,采用分子对接进行验证。结果:通过网络药理学研究,GT方中共获取到主要活性成分81个、关键成分预测靶点30个,应用PPI网络得到ACE、NOS3等关键交集靶点。富集分析后得到221个GO相关条目、47条相关KEGG信号通路,GO分析结果主要集中在异种生物分解代谢过程、外源性药物分解代谢过程等,KEGG富集分析关键通路是钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路等,关键靶点主要富集在ADRB3,NOS3,ADRB1等。分子对接显示(-)-Limonene、(-)-alpha-Pinene、Tridecnoic acid核心成分与NOS3蛋白(PDB: 1d0c)核心靶点具有非常好的结合构象。结论:本研究采用网络药理学与分子对接技术,为GT治疗AVF血管内膜增生提供了(-)-Limonene、(-)-alpha-Pinene及Tridecnoic acid等多靶点;钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路的作用特点,主要与调控NOS3蛋白表达水平有关,为后期进一步实验、临床研究提供了理论依据,也是对AVF瘘管处局部外用中药复方防治IH进行的新探索。     

基于网络药理学及分子对接探究麻黄附子甘草汤合肾着汤治疗膜性肾病的作用机制

目的:通过网络药理学探讨麻黄附子甘草汤合肾着汤治疗膜性肾病(MN)的作用机制。方法:通过TCMSP平台收集麻黄附子甘草汤合肾着汤的活性成分与靶点信息;在GeneCards、OMIN、TTD、DrugBank数据库获得MN相关靶点;利用STRING分析两者交集靶点的相互作用关系并筛选核心靶点;核心靶点输至Metascape数据库进行GO及KEGG富集;使用AutoDock进行分子对接验证。结果:共获得253个复方靶点,4 092个疾病靶点及170个交集靶点;在PPI网络中共获得23个核心靶点并通过Matescape平台得出靶点通路信息;分子对接结果表明主要成分与核心靶点具有良好的结合能力。结论:网络药理学研究得出,方中槲皮素、山奈酚等核心成分作用与AKT1、TNP、TP53、JUN等核心靶点通过直接或间接调控AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路发挥治疗MN的作用。     

基于网络药理学探讨骨碎补治疗骨质疏松症的作用机制

目的运用网络药理学筛选骨碎补有效成分治疗骨质疏松症的作用靶标及信号通路。方法首先借助TCMSP分析平台、GeneCards数据库和OMIM数据库,分别筛选中药活性成分、疾病及相应的靶标,将中药靶标与疾病靶标取交集,得到中药-疾病共同靶标并构建中药-疾病-靶标调控网络。然后通过构建中药-疾病共同靶标的蛋白互作网络,筛选核心靶点基因。最后将中药-疾病共同靶标进行GO功能富集分析和KEGG功能富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路。结果筛选得到骨碎补治疗骨质疏松症的18个有效成分和98个中药-疾病共同靶标,并推断其作用机制可能与糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路、Th17细胞分化信号通路等有关,且白介素-6基因、JUN基因、丝裂原活化蛋白激酶-1基因和表皮细胞生长因子基因可能起着关键性作用。结论基于网络药理学探讨了骨碎补治疗骨质疏松症的作用靶标及信号通路,为中药现代化研究提供了思路。     

基于网络药理学探析金钱草作为石淋要药治疗肾结石的作用机制研究

目的:基于网络药理学方法探讨金钱草作为石淋要药治疗肾结石的作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选金钱草的有效成分及相应的靶蛋白,通过Genecards、OMIM数据库筛选出肾结石的靶点,利用R语言获取药物与疾病的共同靶点并作出Venn图,运用Cytoscape3.7.1软件构建“化合物-靶点-疾病”网络图。使用String数据库绘制蛋白互作(PPI)网络,并对其有效作用靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。结果:在已知61种金钱草有效成分中共筛选出10个,对应有效作用靶点305个。通过Venn图获得81个药物-疾病共同靶点,PPI网络发现AKT1、IL6、JUN、MAPK1、VEGFA等可能是金钱草治疗肾结石的关键靶点。GO功能分析发现81个靶基因影响了100个生物功能,体现在分子的功能上对分子的代谢与合成等生物学功能普遍具有正向调节作用。KEGG通路分析发现81个交集靶点显著富集在141条通路上(P0.05),其中金钱草主要活性成分相关靶点富集最多的通路为AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications,其中包含了钙信号通路、MAPK信号通路等经典信号通路。结论:该研究初步揭示了金钱草治疗肾结石的关键靶点和涉及的生物学过程以及信号通路,发现其作用是多靶点、多通路的,从分子层面对金钱草作为“石淋之要药”治疗肾结石提供了一定的参考依据。