新疆维吾尔族、汉族结直肠癌患者中KRAS及BRAF基因突变差异及其与预后的关系研究

目的探讨新疆维吾尔族(维族)、汉族结直肠癌伴肝转移患者中KRAS基因及BRAF基因突变差异及其与临床病理特征和预后的关系。方法选择新疆医科大学第一附属医院2005年1月-2010年12月收治的100例新疆维、汉族结直肠癌伴肝转移患者,应用PCR及Pyrosequencing测序法检测分析KRAS基因及BRAF基因突变情况,分析其与临床病理特征和预后的关系。结果维、汉族结直肠癌伴肝转移患者的KRAS与BRAF基因突变率分别为28%(28/100)与5%(5/100)。50例汉族患者中KRAS基因突变18例,BRAF基因突变2例;50例维吾尔族患者中KRAS基因突变10例,BRAF基因突变3例。原发肿瘤组织学分级、区域淋巴结转移、脉管瘤栓、肝外侵犯或转移、KRAS和BRAF为结直肠癌的预后影响因素(P<0.05);多因素分析显示,脉管瘤栓(P=0.035)、KRAS基因(P=0.001)为结直肠癌的独立的预后因素。结论在新疆维、汉族结直肠癌伴肝转移患者中,脉管瘤栓及KRAS基因具有主要的预后价值。积极检测KRAS基因,可望延长患者生存期。     

中国汉族与蒙古族结肠癌患者KRAS, NRAS, PI3KCA, BRAF基因突变频率及分布测定

目的：测定中国汉族与蒙古族结肠癌患者KRAS, NRAS, PI3KCA, BRAF基因突变频率及分布情况,进而评估基因突变与临床病理特征的关联。 方法：在内蒙古自治区人民医院收集需手术治疗的汉族及蒙古族结肠癌患者。术中切取肿瘤组织,石蜡包埋,DNA提取。基因突变检测试剂盒测定KRAS, NRAS, PI3KCA, BRAF基因突变情况。 结果：汉族右半结肠癌KRAS及PI3KCA基因突变频率显著高于左半结肠癌（P<0.05）。T3+T4组蒙古族结肠癌患者KRAS基因突变显著高于T1+T2组（P= 0.029）。此外,汉族右半结肠KRAS基因突变频率明显高于蒙古族突变频率（P= 0.025）。 结论：汉族与蒙古族结肠癌患者KRAS, NRAS, PI3KCA, BRAF基因突变频率相似,然而,汉族右半结肠KRAS基因突变率明显高于蒙古族突变率。后续的研究应着重于评估这种差别对右半结肠癌靶向治疗有效率及预后情况的影响。 关键词：结肠癌, 基因突变,汉族,蒙古族     

结直肠癌KRAS、BRAF及PIK3 CA基因突变的检测及内在关系

目的：检测结直肠癌组织KRAS、BRAF及PIK3CA基因突变情况,并分析其内在关系。方法：收集内蒙古巴彦淖尔市医院普外一科2011年3月至2011年8月结直肠癌手术切除标本41例,提取DNA经PCR扩增后,检测KRAS、BRAF和PIK3CA基因的突变情况,分析结直肠癌组织KRAS、BRAF及PIK3CA基因突变间的内在关系。结果：（1）15例患者的KRAS基因发生突变,突变率36．6％,5例患者的BRAF基因发生突变,突变率12．2％,7例患者的PIK3CA基因发生突变,突变率17．1％。（2）BRAF基因突变者共5例,全部为KRAS野生型的患者;PIK3CA基因突变者共7例,其中3例（42．9％）为KRAS野生型的患者,4例（57．1％）为KRAS突变型的患者;BRAF与PIK3CA基因不存在共突变。结论：（1）结直肠癌患者KRAS基因突变率较高,有必要进行常规检测。（2）KRAS野生型患者中部分患者的BRAF基因突变可能是促进结直肠癌发生发展的原因之一。 PIK3CA与KRAS基因的共突变可能促进了结直肠癌发生发展。     

结直肠癌KRAS、BRAF及PIK3CA基因突变状态分析

目的检测结直肠癌组织KRAS、BRAF及PIK3CA基因突变状态,分析突变与临床特征的关系。方法收集结直肠癌手术切除或穿刺活检标本177例,提取DNA经探针扩增阻滞突变系统聚合酶链反应扩增后,检测KRAS、BRAF及PIK3CA基因的突变状态,分析结直肠癌组织中3个基因间突变的内在关系,并分析KRAS突变与临床特征的关系。结果 KRAS基因突变率为37.9%,以Gly12Val突变最多,占总突变率的32.8%;BRAF基因突变率为4.0%;PIK3CA突变率为14.1%,以E542K突变最多,占总突变率的36.0%。BRAF基因突变者共7例,全部为KRAS和PIK3CA野生型的患者;PIK3CA基因突变者共25例,其中19例(76.0%)与KRAS存在共同突变。结论结直肠癌患者KRAS基因突变率较高,KRAS基因突变与淋巴结转移和肿瘤进展相关。联合检测KRAS、BRAF及PIK3CA基因对指导临床制定个体化治疗有重要意义。     

结直肠癌组织中错配修复蛋白基因表达与临床病理及KRAS BRAF基因突变的相关性分析

目的 分析结直肠癌肿瘤组织中错配修复蛋白（MMR）表达与临床病理因素及KRAS、BRAF基因突变的相关性。方法 采用免疫组织化学法和扩增阻滞突变系统对212例结直肠癌根治标本石蜡组织的MMR蛋白表达及KRAS、BRAF基因突变状态进行回顾性分析。结果 212例结直肠癌肿瘤组织中错配修复蛋白表达缺失率为11.3%(24/212)。212例结直肠癌组织中KRAS、BRAF基因的突变率分别为40.6%(86/212)、3.3%(7/212)。结论 错配修复蛋白联合KRAS、BRAF突变检测可为结直肠癌患者预后评估及个体化治疗提供依据。     

结直肠癌组织中KRAS、NRAS及BRAF基因突变状态与临床病理特征的关系

目的:探讨结直肠癌组织中KRAS、NRAS及BRAF基因突变状态与临床病理特征的关系.方法:选取接受根治手术治疗的1205例结直肠癌患者的肿瘤组织标本,采用突变扩增阻滞系统检测KRAS、NRAS、BRAF基因的突变状态.1205例患者中,<40岁88例,40～岁663例,≥60岁454例;男722例,女483例;原发于...     

晚期结直肠癌患者血浆循环肿瘤DNA与组织中KRAS及NRAS等基因突变一致性的影响因素分析

目的:分析血浆循环肿瘤DNA （ctDNA）与肿瘤组织DNA检测晚期结直肠癌患者KRAS/NRAS/BRAF/PIK3CA基因突变的一致性,同时探索影响两者一致性的因素。方法:纳入 2018年12月至2020年5月就诊于复旦大学附属中山医院的晚期结直肠癌患者165例,收集患者的ctDNA及组织基因检测结果、临床病理信息...     

Ⅳ期结直肠癌轻微症状患者原发灶切除和KRAS基因突变对其预后的影响

目的：探讨Ⅳ期结直肠癌轻微症状行原发灶切除患者KRAS基因突变情况,阐明其对预后的影响。方法：收集46例Ⅳ期结直肠癌轻微症状患者的临床资料,所有患者均行原发灶切除,留取手术切除的肿瘤组织标本,采用直接测序法检测患者KRAS基因突变情况,并进行为期5年的随访,分析Ⅳ期结直肠癌患者原发灶切除和KRAS基因突变对预后的影响,对可能影响预后的临床病理因素进行生存分析。结果：46例患者中,KRAS基因突变20例,突变率为43.4%,其中12密码子突变发生频率最高（95.7%）。KRAS基因突变与肿瘤原发部位和肿瘤的多发转移有密切关联（P<0.05）。Kaplan-Meier生存曲线及单变量分析,原发灶切除术后KRAS基因野生型患者中位生存时间为58.4个月,KRAS基因突变型患者中位生存时间为42.2个月,组间比较差异无统计学意义（P>0.05）。右半结肠癌患者中位生存时间为34.2个月,左半结肠癌患者中位生存时间为58.3个月,组间比较差异有统计学意义（P<0.05）。癌细胞的肝、肺和多发转移与结直肠癌患者术后预后不良有关（P<0.05）。Ⅳ期结直肠癌轻微症状患者术后中位生存时间为39.6个月。结论：Ⅳ期结直肠癌轻微症状患者原发灶切除术后,左半结肠癌患者及右半结肠癌患者生存时间均有延长趋势,右半结肠癌患者预后较左半结肠癌患者差。结直肠癌患者KRAS基因突变与肿瘤原发部位和肿瘤的多发转移有关联,转移部位影响手术预后。     

ctDNA检测KRAS基因在结直肠癌预后中价值的临床研究及Meta分析

目的通过临床病例数据研究,探讨ctDNA检测结直肠癌患者外周血中KRAS等基因突变在患者预后中的意义,并根据探索的结果做进一步的Meta分析,分析ctDNA检测KRAS突变对结直肠癌患者术后无病生存期的影响。方法采集30例患者外周血标本,通过探索队列和验证队列,分析KRAS等基因突变与患者的临床病理特征、疗效及预后的关系。收集多个Ⅲ期临床试验中KRAS突变与结直肠癌患者术后无病生存期的数据,应用Stata MP.17软件进行Meta分析,评估KRAS突变对结直肠癌患者术后无病生存期的影响。结果30例临床病例中,共有12例发现RAS突变情况,其中KRAS突变10例,是突变频率最高的基因,探索队列分析显示RAS、TP53、SMAD4基因共突变患者无病生存期较短。按关键词共检索文献513篇,最终纳入6项临床试验(PETACC-3、CALGB、N0147、QUASAR2、NSABP-8、NSABP-C07),共9152例患者,其中KRAS突变患者3090(33.8%)例,野生型患者6062(66.2%)例。Meta分析结果显示,KRAS突变患者的无病生存期较野生型患者差(合并效应值HR=1.33,95%CI: 1.11~1.59,P<0.01),提示KRAS突变患者预后可能不良。亚组分析显示,未使用靶向药物治疗组KRAS突变组和KRAS野生型组预后无显著差异［I2=0%,P=0.899;DFS合并效应值HR(95%CI)为1.09(0.96~1.24),P=0.172］,而使用靶向药物治疗组KRAS突变组较KRAS突变组预后差［I2=23.6%,P=0.270;DFS合并效应值HR(95%CI)为1.58(1.35~1.83),P<0.001］,表明是否使用靶向药物治疗可能是部分异质性的来源。结论KRAS突变与较短的无病生存期相关,通过ctDNA检测结直肠癌患者KRAS等基因的突变状态,可用于判断结直肠癌患者的预后并指导治疗。     

sARMS-PCR 检测非小细胞肺癌肿瘤组织中KRAS、BRAF 基因突变研究

目的：针对非小细胞肺癌（NSCLC）患者组织标本鼠类肉瘤病毒癌基因同源基因（KRAS）和鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体 B1（BRAF）驱动基因突变使用特异引物双扩增实时蝎形探针扩增阻滞突变系统（sARMS-PCR）检测的可行性;了解 KRAS 和 BRAF 基因突变患者临床病理特征,为NSCLC 患者个体化治疗提供理论依据。方法收集89例NSCLC 患者肿瘤组织甲醛固定石蜡包埋标本（FFPE）,采用FFPE 样品 DNA 分离试剂盒（离心柱型）提取 DNA,使用sARMS-PCR 同时进行 KRAS 及 BRAF 基因突变检测。结果① KRAS 基因突变21例（21／89）;其中KRAS 基因7种热点突变中,检出6种热点突变,均位于第12、13位密码子,1例同时检出存在G12D 及G12V 位点突变,1例同时检出存在G12C 及G12V 位点突变;未发现G12S 突变型;② BRAF 基因突变1例（1／89）,突变位点为V600E,为女性,黏液腺癌;③未见KRAS 和BRAF 基因同时突变现象。结论临床使用sARMS-PCR 技术检测NSCLC 患者KRAS 和BRAF 基因突变有较强敏感性,且石蜡组织标本取材方便,可以作为两种基因的临床检测方法;KRAS 和BRAF 基因突变与年龄、吸烟史、病理分型等均无明显相关性,KRAS 基因突变与性别相关,男性高于女性;KRAS 与BRAF 基因是独立存在的。     

结直肠癌患者Kras基因突变与分化程度及组织类型的相关性研究

目的:探究结直肠癌KRAS基因突变与分化程度及组织类型的相关性研究.方法:选取结直肠癌患者89例,其中26例KRAS突变阳性患者纳入突变组,63例KRAS突变阴性且无其他突变患者纳入未突变组.采用荧光定量PCR Taqman-ARMS探针法测定KRAS基因突变,比较组间的差异性与相关性.结果:结直肠癌患者KRAS突变阳...     

BRAF基因与结直肠癌预后的关系

目的：探讨BRAF基因对结直肠癌预后的影响。方法整群收集2011年1月—2013年1月期间在莆田学院附属医院确诊结直肠癌并行结直肠癌根治术的患者153例,其中BRAF基因突变阳性的患者18例(实验组),BRAF基因突变阴性患者135例(对照组),所有患者均具有完整的随访资料。回顾性分析两组的随访资料,总结BRAF基因突变的突变类型,并分析BRAF基因突变阳性对患者预后的影响。结果在该研究中,发现BRAF基因突变型18例(11.8%),其中位于V600E突变15例,占所有突变患者83.3%;位于exon11上的甘氨酸环的突变为3例,占所有突变患者14.3%,未见其他位点突变。 BRAF基因突变多见于近端结肠,而远端结肠及直肠较少见,二者的差异具有统计学意义(P<0.05)。 BRAF基因在肿瘤分化程度、病理浸润深度、淋巴结转移等方面的差异具有统计学意义(P<0.05)。平均随访时间为1~60个月,生存时间为3~60个月,平均生存时间为(35.2±21.5)个月。生存分析实验组的平均生存时间为(19.7±16.8)个月,术后1、2、3、4、5年总生存率分别为61.1%、27.8%、22.2%、5.6%、5.6%。 Log-rank检验显示两组间总生存率的差异有统计学意义(P=0.001)。结论结直肠癌患者癌组织BRAF基因突变率与患者生存率成负相关,提示患者预后不良。     

结直肠癌组织和静脉血中KRAS基因突变分析及临床意义

目的：研究结直肠癌组织与静脉血中KRAS基因突变情况,探讨其对临床治疗及预后的意义。方法整群收集2013年1月-2014年12月经病理科诊断手术的129例原发结直肠癌组织标本和肘静脉血5 mL及60例癌旁正常组织对照。用PCR-DNA直接测序法检测KRAS突变情况。结果①癌组织KRAS突变率为39.53%(51/129),静脉血KRAS突变率为32.56%(42/129﹚。静脉血KRAS基因突变率比癌组织的低6.97%,差异有统计学意义(P<0.05)。癌旁正常组织无基因突变。②KRAS基因有7种突变类型,12密码子为主要突变占78.43%(40/51)。③癌组织与静脉血野生型与突变型整体的一致率为89.92%(116/129),一致性较高(K=0.783)。结论结直肠癌组织KRAS基因突变与静脉血高度一致,在肿瘤组织无法获取的情况下能代替其作为检测靶点。     

181例肺腺癌的多基因检测分析

目的：报道肺腺癌病例多基因检测的结果,分析肺腺癌驱动基因突变状态的相关因素。方法：回顾性总结武汉大学中南医院2017年1月至2021年7月肺腺癌检测EGFR、ALK、KRAS、HRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF、PTEN、AKT1、HER2、ROS1、RET等12个驱动基因突变的病例资料,探讨肺腺癌驱动基因突变状态的相关因素。结果：181例肺腺癌病例纳入研究,94例为穿刺活检标本,87例手术切除标本。81.21%(147/181)的病例存在驱动基因突变,3个主要突变是EGFR(60.8%,110/181)、KRAS(16.6%,30/181)、NRAS(2.2%,4/181)。6例多基因突变,EGFR/NRAS、EGFR/KRAS、EGFR/PIK3CA、HER2/NRAS、HER2/PTEN和EGFR/KRAS/NRAS各1例。EGFR突变与女性(P<0.001)和非吸烟(P<0.001)相关,最常见的突变位点是Exon 19-del和Exon 21L858R;KRAS突变与男性(P<0.001)和吸烟(P<0.001)相关,最常见的突变位点是Exon...     

结直肠腺瘤，单原发及多原发结直肠癌中P53及K-ras基因的突变分析

【摘要】 目的 探讨结直肠腺瘤、单原发结直肠癌、多原发结直肠癌中P53及K-ras基因的突变。 方法 收集25例正常结直肠组织、38例结直肠腺瘤、78例单原发结直肠癌、19例(同时性多原发癌7例,异时性多原发癌12例)多原发结直肠癌组织标本及患者临床病理资料,提取标本组织中基因组DNA, 直接测序方法进行P53基因外显子5、6、7、8及K-ras基因密码子12、13序列分析,并对结直肠腺瘤及单原发结直肠癌的临床资料与其P53及K-ras基因突变进行多因素相关性分析。 结果 正常结直肠组织、结直肠腺瘤、单原发结直肠癌、多原发结直肠癌中P53基因的突变概率分别是0%(0/25)、44.8%（17/38）、43.6%（34/78）、42.1%（8/19）,K-ras基因的突变概率分别为0%（0/25）、18.4%（7/38）、39.7%（31/78）、47.4%（9/19）,正常结直肠组织中P53和K-ras基因突变概率与结直肠腺瘤、单原发结直肠癌、多原发结直肠癌中突变概率相比,差异均有统计学意义(P<0.05）,结直肠腺瘤中K-ras基因突变概率与单原发结直肠癌、多原发结直肠癌中突变概率相比,差异均有统计学意义(P<0.05）,结直肠腺瘤中P53基因突变概率高于K-ras基因(P<0.05）。P53及K-ras基因在单原发结直肠癌的Ⅰ、Ⅱ期及高分化类型中的突变概率与其在Ⅲ、Ⅳ期及中低分化类型中差异无统计学意义。患者的年龄、性别、家族史、肿瘤位置与结直肠腺瘤及单原发结直肠癌中P53及K-ras基因突变无相关性,肿瘤分期及肿瘤的分化程度亦不是单原发结直肠癌中P53及K-ras基因发生突变的危险因素。 结论 本研究再次证实在结直肠肿瘤的发生和发展过程中,P53及K-ras基因的突变起着重要的作用,并且在结直肠的肿瘤发生发展过程中P53基因的突变可能早于K-ras基因。     

结直肠癌KRAS基因突变检测及临床意义

目的探讨结直肠癌患者KRAS基因突变特点与临床特征之间的关系。方法采用突变荧光定量PCR检测80例经手术证实的结直肠癌患者石蜡包埋肿瘤组织中KRAS基因第12、13密码子突变。结果80例结直肠癌患者中有26例(32.5%)患者存在KRAS基因突变;第12密码子突变19例,突变检出率为23.75%,共检出6种突变类型,其中以Gly12Asp突变率(15%)最高;第13密码子检出1种突变类型(Gly13Asp)7例,突变检出率为8.75%。经统计学分析,KRAS基因突变与患者的性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤分期无明显相关性。结论结直肠癌中KRAS基因突变的发生率较高,其突变率与性别、年龄、肿瘤部位、肿瘤分期无相关性。     

I期结直肠癌转移基因突变特征及临床特征分析

目的 借助现有的数据库挖掘，借鉴和浓缩数据采集的要点， 进一步明确I期结直肠癌的突变特征，以期指导临床治疗及判断预后。方法 对纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSKCC）数据通过R语言的maftools工具，进一步分析初始I期患者有转移和无转移组突变特征及临床特征。 结果 针对MSKCC突变数据，在I期患者中APC、TP53、KRAS基因突变比例相对于整体数据而言偏低。APC基因突变约占比65%（整体76%），TP53基因突变约占比68%（整体73%），KRAS约占比28%（整体44%），BRAF突变在结直肠癌整体数据中占比12%。I期发生转移的患者APC和TP53突变的比例均高于未发生转移的患者。I期发生转移的患者APC突变占比70%，未发生转移者突变占比59%；I期发生转移的患者TP53突变占比78%,未发生转移者突变占比53%，I期发生转移者TP53突变占比高于APC突变。I期结肠癌患者女性较男性更容易发生转移，I期发生转移者且均为MSS型。结论 本研究借MSKCC数据进行挖掘，发掘了I期结直肠癌转移的一些基因突变特征，I期病人患者中发生转移的APC和TP53突变的比例均高于未发生转移的患者，进一步指导临床治疗及判断预后，并为开展早期肿瘤转移的临床及基础研究，提供了理论依据。     

结直肠癌肝转移的诊疗进展

肝常是结直肠癌转移的唯一器官（肿瘤屏障效应）,约10%～25%的结直肠癌患者在确诊时伴有肝转移的发生（同时性）,30%～50%的结直肠癌患者在获得根治术后发生肝转移（异时性）。肝转移是结直肠癌患者预后的主要影响因素，肝转移出现时即属DukeD期，未经治疗者中位生存期仅为6-9个月。因此，对结直肠癌肝转移的早期诊断和合理治疗意义重大。我们就结直肠癌肝转移的诊疗进展综述如下。     

胰腺癌组织中BRAF基因和KRAS基因突变分析

目的探讨人胰腺癌组织中BRAF和KRAS基因突变情况及两者的关系。方法对36例胰腺癌组织及癌旁胰腺组织中BRAF基因15号外显子及KRAS基因12号密码子进行测序。结果 36例胰腺癌组织中,25例出现KRAS基因12号密码子突变(69.4%,25/36),3例出现BRAF基因V600E突变(8.3%,3/36),且均同时存在KRAS突变;11例KRAS野生型胰腺癌组织中未发现BRAF突变;癌旁胰腺组织中均未检出突变。结论胰腺癌组织中BRAF基因突变可能并非主要突变,且常与KRAS基因突变同时存在。     

结直肠癌组织中Syndecan-1与EGFR表达及KRAS突变的关系

目的探讨结直肠癌患者中多配体蛋白聚糖-1（Syndecan-1)与表皮生长因子受体（EGFR）表达及鼠类肉瘤病毒癌基因（KRAS）突变的关系。方法选择原发性结直肠癌标本160例，结肠部肿瘤112例，直肠部肿瘤48例；病理类型为腺癌156例，其它病理类型4例。利用免疫组化法检测组织标本中Syndecan-1和EGFR的表达情况，运用直接测序法检测组织标本中KRAS基因外显子2第12、第13位密码子的突变状态。采用Spearman相关分析Syndecan-1的表达与EGFR表达及KRAS基因突变的关系。结果肿瘤标本中Syndecan-1表达阳性41例，主要位于细胞膜20例，主要位于细胞浆16例，细胞膜与细胞浆同时表达5例。EGFR在结直肠癌中的阳性表达率69.4%，所有结直肠癌患者中发生KRAS突变率为37.5%。Syndecan-1的表达在肿瘤区域淋巴结有无转移、有无远处转移中差异均无统计学意义（均P＞0.05）。Syndecan-1的表达与EGFR表达呈显著相关（r=1.488，P＜0.01），而与KRAS状态无相关性（r=9.278，P＞0.05）。结论Syndecan-1的表达可能对结直肠癌患者的进展及预后判断有一定价值。