PIK3 CA rs4975596基因多态性与口腔癌的相关性研究

目的 探讨PIK3CA rs4975596单核苷酸多态性与口腔癌发生的相关性。方法 应用聚合酶链反应检测PIK3CA rs4975596基因多态性,比较口腔癌组与健康人群PIK3CA rs4975596基因型的分布频率差异以及等位基因频率差异。结果 50例口腔癌组和50例健康人群对照组PIK3CA rs4975596基因型分布频率野生型AA分别为52%和68%,杂合型AG分别为28%和24%,突变型GG分别为20%和8%,两组比较差异有统计学意义(χ²=7.073,P=0.029);等位基因频率野生型A分别为65%和76%,突变型G分别为35%和24%,两组比较差异有统计学意义(χ²=5.360,P=0.024)。口腔癌组与健康人群对照组PIK3CA rs4975596基因型分布频率和等位基因频率差异有统计学意义。结论 口腔癌的发生可能与PIK3CA rs4975596基因型多态性具有某种关联。     

ERCC1 Asn118Asn(rs11615)和ERCC2 Lys751Gln(rs13181)基因多态性与胆囊癌的关联性研究

目的 探讨ERCC1 Asn118Asn (rs11615)和ERCC2 Lys751Gln (rs13181)单核苷酸多态性与胆囊癌的关系。方法 选择2014年5月至2016年5月期间重庆市红十字会医院普外科收治的50例胆囊癌病人为胆囊癌组,应用聚合酶链反应检测ERCC1 Asn118Asn (rs11615)和ERCC2 Lys751Gln(rs13181)基因多态性,比较胆囊癌组与健康人群(对照组)ERCC1 Asn118Asn(rs11615)和ERCC2 Lys751Gln (rs13181)基因型的分布频率差异以及等位基因频率差异。结果 胆囊癌组和对照组ERCC1 Asn118Asn(rs11615)基因型分布频率野生型CC为54% 比 66%,杂合型CT为26% 比 26%,突变型TT为20% 比 8%,两组比较差异有统计学意义(χ²=7.05,P=0.028),等位基因频率野生型C为67%比79%,突变型T为33%比21%,两组比较差异有统计学意义(χ²=5.27,P=0.026)。ERCC2 Lys751Gln (rs13181)基因型分布频率野生型AA为20%比56%,杂合型AB为44%比32%,突变型BB为36%比12%,两组比较差异无统计学意义(χ²=0.83,P=0.669),等位基因频率野生型A为42%比72%,突变型B为58%比28%,两组比较差异有统计学意义(χ²=0.75,P=0.448)。结论 胆囊癌的发生可能与ERCC1 Asn118Asn(rs11615)和ERCC2 Lys751Gln (rs13181)基因型多态性具有某种关联。     

CYP2 C19?2和CYP2 C19?17基因多态性与冠状动脉介入 治疗后病人氯吡格雷反应性的关联分析

目的 探究CYP2C19*2和CYP2C19*17基因多态性与冠状动脉介入治疗后病人氯吡格雷反应性的关系。方法 青海省心脑血管病专科医院于2014年3月至2017年3月期间招募了347例经皮冠状动脉介入的支架植入病人。采集经氯吡格雷(75 mg/d)治疗至少7 d的病人血液样品,用VerifyNow P2Y₁₂测定法测量血小板活性(PRU)和(%)抑制性。应用聚合酶链式反应检测CYP2C19*2(rs4244285)和CYP2C19*17(rs12248560)基因多态性,比较氯吡格雷应答组和无应答组病人CYP2C19*2(rs4244285)和CYP2C19*17(rs12248560)基因型的分布频率差异以及等位基因频率差异。结果 分组时,PRU>208的病人对氯吡格雷治疗无反应;104例(30%)病人为无应答者,243例(70%)病人为应答者。243例氯吡格雷应答组和104例无应答组CYP2C19*2(rs4244285)基因型分布频率野生型GG为80.7%/54.8%,杂合型GA为17.3%/38.5%,突变型AA为2.1%/6.7%,两组比较χ²=7.04,P<0.001;等位基因频率野生型G为89.3%/74.0%,突变型A为10.7%/26.0%,两组比较χ²=5.25,P<0.001。CYP2C19*17(rs12248560)基因型分布频率野生型CC为67.9%/75.0%,杂合型CT为30.5%/23.1%,突变型TT为1.6%/1.9%,两组比较χ²=0.81,P=0.388;等位基因频率野生型C为83.1%/84.1%,突变型T为16.9%/13.1%,两组比较χ²=0.68,P=0.416。结论 CYP2C19*2多态性与氯吡格雷治疗无反应相关,CYP2C19*17多态性增强了氯吡格雷的抗血小板活性。根据这两种多态性的单倍型,氯吡格雷治疗的病人可以被保护或不受支架血栓形成和缺血事件的威胁。     

CYP2C9基因多态性对苯溴马隆药动学的影响

目的研究健康人体内不同细胞色素P450(CYP)2C9基因多态性对苯溴马隆药动学的影响。方法采用PCR-RFLP方法对120例健康志愿者进行了CYP2C9基因多态性筛查,其中20例参加苯溴马隆药动学试验。用高效液相色谱法检测受试者体内苯溴马隆的药动学参数,分析不同的CYP2C9基因分型药动学参数的差异。结果 120例志愿者中筛选出9例CYP2C9*1/*3杂合型突变体、1例CYP2C9*3/*3纯合型突变体和110例CYP2C9*1/*1野生型个体。9例CYP2C9*1/*3、1例CYP2C9*3/*3突变型(突变型组)和10例CYP2C9*1/*1(野生型组)志愿者参加了苯溴马隆的药动学试验。CYP2C9*3的等位基因频率为7.5%。突变型组的ρmax、t1/2、AUC0-24均高于野生型组,而CL/F低于野生型组,差异均具有统计学意义(P<0.05)。苯溴马隆给药24 h后,CYP2C9*1/*1野生型、CYP2C9*1/*3杂合突变型和CYP2C9*3/*3纯合突变型志愿者尿酸清除较服药前分别增加了130%、90%和75%,血尿酸浓度较服药前分别减少了60%、43%和41%;突变型组与野生型组相比,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 CYP2C9基因多态性对苯溴马隆的代谢具有显著的影响,苯溴马隆在CYP2C9*3突变个体的代谢显著低于CYP2C9*1野生型个体,检测突变型个体对指导临床个体化用药具有重要意义。     

广东人群CYP3A4基因rs28371759(20070T>C)位点多态性调查

目的:探讨广东人群CYP3A4基因rs28371759(20070T>C)位点的分布特点,为广东患者使用CYP3A4底物药提供理论参考依据。方法:以200名广东志愿者的口腔拭子DNA为模板,PCR扩增包含rs28371759多态位点的DNA片断,用限制性内切酶MspI消化PCR产物,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳-银染获得样品的限制性酶切图谱用于判别基因型。结果:在受检的200例样品中,检出杂合子3例,余者皆为野生型纯合子。野生型纯合子、杂合子、突变型纯合子的频率分别为0.985、0.015、0,突变等位基因20070C即CYP3A4*18A的频率为0.007 5。结论:本研究得到了广东人群CYP3A4基因rs28371759位点的多态性分布情况,为研究CYP3A4基因多态性与临床药物效应的相互关系奠定了基础。     

ORAI1基因rs3741596单核苷酸多态性与川崎病的关系

摘要： 目的 探讨钙释放激活钙调节蛋白1 （CRACM1/ORAI1） 基因rs3741596位点单核苷酸多态性 （SNP） 与川崎病 （KD） 易感性及KD并发冠状动脉病变 （CALs） 是否相关。方法 将确诊的46例KD患儿 （病例组） 和25例健康儿童（对照组） 纳入本研究, 并根据是否出现CALs将病例组分为CAL组 （20例） 和无CAL （NCAL） 组 （26例）。应用聚合酶链反应 （PCR） 技术联合基因直接测序技术检测所有研究对象ORAI1基因rs3741596位点SNP, 并进行统计学分析。结果 所有研究对象均检测到ORAI1基因rs3741596位点SNP, 其基因型分布及等位基因频率在病例组及对照组间差异无统计学意义 （χ2 分别为0.712和0.499, 均P＞0.05）, 而在CAL组和NCAL组间差异有统计学意义 （χ2 分别为 6.524 和 6.891, 均 P＜0.05）; 携带 G 等位基因使 KD 患儿并发生 CALs 的危险性增加（OR=5.444, 95%CI： 1.386~ 21.380）。结论 ORAI1基因rs3741596位点SNP可能与KD易感性无相关性, 但与KD并发CALs易感性相关。     

急性白血病患者NF-κB1基因单核苷酸多态性与异基因造血干细胞移植后急性肾损伤的相关性分析

探讨NF-κB1基因rs3774937、rs3774959、rs3774963位点基因多态性与急性白血病患者异基因造血干细胞移植(Allo-HSCT)后并发急性肾损伤(AKI)的相关性。选取2018年1月至2021年12月于江苏省人民医院接受Allo-HSCT的急性白血病患者82例,应用TaqMan探针法检测NF-κB1基因rs3774937、rs3774959、rs3774963位点基因型。与非AKI组相比,AKI患者rs3774937位点CC基因型和C等位基因频率、rs3774959位点AA基因型和A等位基因频率、rs3774963位点GG基因型和G等位基因频率均明显增高(P<0.05)。回归分析显示,rs3774937位点CC基因型、rs3774959位点AA基因型、rs3774963位点GG基因型与AKI发生风险增加相关(P<0.05),并且血肌酐水平较其他基因型更高(P<0.05)。单倍体分析显示,C-A-G单倍体携带者与AKI发生风险增加相关(P<0.05)。本研究结果提示,NF-κB1基因rs3774937、rs3774959和rs3774963位...     

新疆维吾尔族患者CYP2C9和VKORC1基因多态性分布及不同种族间的比较

目的:为建立适合新疆维吾尔族患者的华法林个体化给药模型提供研究基础。方法:检测200例新疆维吾尔族患者中CYP2C9和VKORC1的基因型,并与世界不同种族人群基因型及等位基因频率进行比较。结果:新疆维吾尔族CYP2C9*1/*1基因型频率低于韩国、日本、美国及中国汉族,高于土耳其;*1/*2杂合突变型频率低于土耳其、瑞典、英国,高于韩国、日本及中国汉族;*1/*3杂合突变型频率高于日本、韩国、中国汉族、英国、美国;*3/*3基因频率高于上述人群(P<0.05)。新疆维吾尔族*1等位基因频率低于中国汉族、日本、韩国、美国,高于土耳其;*2等位基因高于中国汉族、日本、韩国,低于土耳其、瑞典、英国;*3等位基因高于中国汉族、日本、韩国、瑞典、英国和美国(P<0.05)。VKORC1-1639AA型频率高于美国、瑞典、英国,低于新加坡、日本、中国台湾、中国汉族;AG型频率高于新加坡、日本、中国台湾、中国汉族;GG型频率高于新加坡、日本、中国台湾、中国汉族,低于美国、瑞典、英国(P<0.05)。新疆维吾尔族A型等位基因频率低于中国汉族、中国台湾、日本、新加坡,高于美国、瑞典和英国;G型等位基因高于中国汉族、中国台湾、日本、新加坡,低于美国、瑞典、英国(P<0.05)。结论:新疆维吾尔族患者CYP2C9和VKORC1基因多态性分布与亚洲及欧美人群均存在明显差异。     

CCNE1、RIP2基因多态性与膀胱癌发病风险的关系

目的 细胞周期蛋白 E1 （CCNE1） 基因和受体相互作用蛋白 2 （RIP2） 基因区域分别存在多态性位点 rs8102137 和 rs42490, 探讨这 2 种多态性与膀胱癌的发病风险及膀胱癌的病理分级和分期之间的关系。方法 收集膀胱癌患者 （膀胱癌组） 176 例及非肿瘤体检患者 （对照组） 210 例血样本并提取 DNA, 聚合酶链反应 （PCR） 测序方法检测 CCNE1 （rs8102137） 和 RIP2 （rs42490） 的多态性。根据术后病理结果确定膀胱癌患者的分级及分期。分析膀胱癌组和对照组中等位基因和基因型的分布差异。对 2 组间基因型的分布情况进行比较, 分析 CCNE1 （rs8102137） 和 RIP2 （rs42490） 各基因型与膀胱癌患者的临床资料间的关系, 及与膀胱癌遗传易感性的关系。结果 对照组样本的基因型分布具有良好的群体代表性。CCNE1 （rs8102137） 突变型 （C/T+C/C） 在膀胱癌组中频率 （40.91%） 高于对照组（30.95%, OR=1.54, 95%CI： 1.02～2.45, P＜0.05）。RIP2 （rs42490） 突变型 （A/G+G/G） 在膀胱癌组频率 （72.73%） 高于对照组 （62.38%, OR=1.61, 95%CI： 1.04～2.48, P＜0.05）。不同膀胱癌病理分级、 分期患者的 CCNE1 （rs8102137） 和 RIP2 （rs42490） 基因多态性差异无统计学意义。结论 CCNE1 （rs8102137）、 RIP2 （rs42490） 基因型与膀胱癌易感性关系密切, 携带突变型等位基因的个体患膀胱癌的风险显著高于野生型个体。     

CDKN2A／B基因三个单核苷酸多态性位点与冠心病的相关性研究

目的研究CDKN2A／B基因邻近的rs2383206、rs10757274、rs10757278三个位点的单核苷酸多态性（SNP）,探讨其与冠心病的发病及冠状动脉病变程度的相关性。方法采用聚合酶链式反应（PCR）扩增CDKN2A／B基因邻近rs2383206、rs10757274、rs10757278三个SNP位点的核苷酸片段,进行多态性分型并分析其与冠心病发病的相关性,对冠心病患者冠脉造影结果进行Gensini积分评定,分析单核苷酸多态性分型与Gensini积分的关系。结果CDKN2A／B基因邻近的3个SNP位点rs2383206、rs10757274、rs10757278的AG／GG基因型分布频率均高于对照组（P〈0．05）,G等位基因分布频率高于对照组（P〈0．05）。经校正混杂因素的影响后,与AA纯合子相比rs2383206、rs10757274、rs10757278的AG／GG基因型具有显著增加冠心病风险的效应校正比值比（OR）分别为1．492,1．915,1．866。冠心病组3个SNP位点AG／GG基因型冠脉Gensini积分均高于AA基因型（P〈0．05）。结论CDKN2A／B基因的rs2383206、rs10757274、rs10757278三个单核苷酸多态性位点是昆明地区汉族冠心病发生的易感位点,且与冠状动脉病变的严重程度呈正相关。     

新疆维吾尔族人群SLC22A1基因的单核苷酸多态性研究

目的：研究有机阳离子转运体SLC22A1基因单核苷酸多态性（SNP）rs2282143位点（P341L,1022C>T）基因型和等位基因在中国新疆维吾尔族人群中的分布频率,并比较其与不同种族间的分布差异。方法：通过SNaPshot SNP分型技术检测276例新疆维吾尔族健康人群的SLC22A1基因SNP rs2282143位点的基因型,并与国际人类基因组单倍型图谱计划（HapMap）中不同国家或地区就该位点的SNP分型数据进行比较,分析基因型频率和等位基因频率间的差异。结果：在新疆维吾尔族健康人群中,SLC22A1基因rs2282143位点中CC基因型最常见,分布频率为90.9%;CT和TT基因型分布频率分别为8.4%、0.7%;最小等位基因T的分布频率为4.9%。新疆维吾尔族SLC22A1基因rs2282143位点的基因型频率和等位基因频率分布与黄种人群存在显著差异;而与高加索人群和黑人不存在显著差异,其中与约鲁巴人群的基因型频率存在显著差异,但与该人群的等位基因分布频率分布不存在显著差异。结论：新疆维吾尔族人群SLC22A1基因具有显著的基因多态性,其SNP rs2282143位点基因型和等位基因的分布频率与部分国家或地区人群存在较大差异,该差异对于有机阳离子转运体SLC22A1基因相关的疾病诊断、药物基因组学以及人类进化史方面的研究可能起重要作用。     

Genotype and allele frequencies of polymorphic <Emphasis Type="Italic">CYP2E1</Emphasis> in the Turkish population

Cytochrome P4502E1 (CYP2E1) gene shows genetic polymorphisms that vary markedly in frequency among different ethnic and racial groups. We studied the genotype distributions and allele frequencies of three CYP2E1 polymorphisms: CYP2E1*5B (RsaI/PstI RFLP, C-1053T/G-1293C SNP, rs2031920 /rs3813867), CYP2E1*6 (DraI RFLP, T7632A SNP, rs6413432), and CYP2E1*7B (DdeI RFLP, G-71T SNP, rs6413420) by PCR/RFLP technique in a sample of 206 healthy subjects representing Turkish population. CYP2E1*5B polymorphism analysis yielded the genotype distribution as 96.12% for *1A/*1A (c1/c1), and 3.88% for *1A/*5B (c1/c2). The genotype frequencies for CYP2E1*6 polymorphism were found as 83.98% for *1A/*1A (T/T), 15.53% for *1A/*6 (T/A) and 0.49% for *6/*6 (A/A). For CYP2E1*7B (G-71T) polymorphism, the genotype frequencies were determined to be 86.89% for *1A/*1A (G/G), 12.62% for *1A/*7B (G/T) and 0.49% for *7B/*7B (T/T). Accordingly, the allele frequencies for *5B, *6 and *7B were 1.94, 8.25, and 6.80%, respectively. The genotype distributions of CYP2E1*5B and *6 in Turkish population were similar to those in other Caucasian populations, while differed significantly from East Asian populations. Recently, a novel and functionally important CYP2E1*7B polymorphism was identified in the promoter region. There have been few studies and limited data on CYP2E1*7B polymorphism frequency in the world and, so far, no information has been available for Turkish population. The genotype frequencies of CYP2E1*7B in Turkish population were found to be similar to those of other Caucasian populations. Population studies like this could be useful in assessing the susceptibility of different populations to chemical-induced diseases, including several types of cancer. An account of this work has been presented at the 31st Federation of European Biochemical Societies (FEBS) Congress, in Istanbul, Turkey, on June 24–29, 2006.     

ABCC2基因多态性与肾移植受者环孢素所致肝功能异常的相关性研究

目的:研究肾移植术后患者多药耐药相关蛋白(MRP2/ABCC2)基因多态性对环孢素(CsA)肝功能异常的影响.方法:入选的339例肾移植受者均采用CsA治疗,检测患者rs717620(A/G)和rs2273697 (G/A)多态性的基因型.此外,采用荧光偏振免疫法检测患者的CsA血药浓度,根据肾移植患者发生肝脏损伤的情况分为3组.结果:rs717620和rs2273697突变等位基因发生频率分别为38.89％和10.72％.ABCC2基因rs717620位点的G突变等位基因与CsA肝功能异常的发生密切相关,与对照组比较,CsA肝功异常组的GG基因型发生频率明显升高(P＜0.05),AA基因型发生频率明显降低(P＜0.05).ABCC2基因rs2273697多态性与CsA肝功异常的发生无明显相关.基因型分析结果显示,这两个多态性对CsA谷浓度均无明显相关性,但rs2273697多态性对ALT和AST检测值有明显影响.对于ABCC2基因rs717620而言,GG基因型纯合子携带者的发病风险比AA型纯合子携带者高6倍(OR=6.960,95％ CI.1.636～29.610,P＜0.01).单倍体分析结果显示,与AA-AA基因型个体相比,GG-GG和GG-GA基因型个体移植术后发生CsA肝功异常的风险分别增加5.909倍和13.333倍.结论:ABCC2基因rs717620位点多态性与CsA肝功异常有明显相关性.ABCC2基因单倍体各基因型中,GG-GG和GG-GA单倍体基因型是肾移植术后发生CsA肝功异常的危险基因因素.     

Role of alcohol and genetic polymorphisms of CYP2E1 and ALDH2 in breast cancer development

OBJECTIVE: We examined the potential association between alcohol consumption and genetic polymorphisms in the alcohol metabolizing enzymes, CYP2E1 and ALDH2, in individual susceptibility to breast cancer in a Korean study population. METHODS: Three hundred and forty-six histologically confirmed breast cancer patients and 377 controls with no present or previous history of cancer were recruited from several teaching hospitals in Seoul during 1995-2001. The CYP2E1 RsaI polymorphism was determined by a real time PCR method, and the ALDH2 Glu487 Lys polymorphism was determined by a PCR method with confronting two-pair primers (PCR-CTPP). RESULTS: The drinking women had a 1.4-fold risk for breast cancer (95% CI = 0.99-2.11) compared to never drinkers after adjustment for age and family history of breast cancer. No statistically significant overall differences were seen in the genotype frequencies between breast cancer cases and controls. However, the "ever"-drinking women with the CYP2E1 c2 allele containing genotypes had a 1.9-fold risk (95% CI = 0.99-3.83) for developing breast cancer compared to non-drinkers with the CYP2E1 c1/c1 genotype (P for interaction = 0.043). CONCLUSION: This study therefore suggests that the CYP2E1 c2 allele may influence the individual susceptibility to breast cancer in alcohol-consuming women.     

维生素D受体基因多态性位点rs7975232与肺癌发病风险的相关性

目的探讨维生素D受体基因rs7975232位点与汉族人群肺癌发病风险的相关性。方法用直接测序法对72例肺癌患者及67名健康对照者进行单核苷酸多态性位点检测,采用ABI3700XL基因分析仪测序。结果维生素D受体基因rs7975232位点等位基因A携带者肺癌发病风险明显低于等位基因C携带者[比值比（OR）=0．501,95％置信区间（CI）为0．273～0．920,P=0．026]。rs7975232位点可能与鳞癌发病相关（等位基因之比：OR=0．274,95％CI为0．087～0．861,P=0．027;显性基因模型：OR=0．269,95％C,为0．074—0．971,P=0．045）。结论维生素D受体基因rs7975232位点与肺癌发病相关。     

胆固醇 7-羟化酶基因 rs4738687多态性与乙型肝炎病毒感染的相关性研究

目的探讨胆固醇 7-羟化酶(CYP7A1)基因 rs4738687多态性与乙型肝炎病毒( HBV)感染的相关性。方法回顾性选     

rs2233678和rs2233679多态性与福建汉族人群肺癌易感性及临床病理学特征的关系

目的了解福建汉族人群肽酰脯氨酰基顺反异构酶1（Pin1）基因rs2233678（-842G/C）和rs2233679（-667T/C）多态性分布规律及其与肺癌发生、发展的关系。方法采用聚合酶链反应（PCR）技术,对80例汉族肺癌患者和135例健康对照的Pin1基因启动子进行扩增并对PCR产物直接测序,分析Pin1基因启动子多态性与肺癌易感性及其临床病理学特征的关系。结果 rs2233678位点只检测到GG和GC两种基因型,没有检测到CC基因型。rs2233678和rs2233679位点的等位基因和基因型分布在肺癌组和健康对照组中比较差异无统计学意义（P〉0.05）;其组成的单体型C-C、G-C和G-T均与肺癌发生风险无相关性（P〉0.05）,rs2233678的基因型分布与肺癌的临床病理学特征无相关性（P〉0.05）,rs2233679的基因型分布与肺癌病理类型呈弱相关（r=0.285,P=0.010）。结论 rs2233678和rs2233679多态性可能与福建汉族人群肺癌易感性无关,rs2233679的基因型分布与肺癌病理类型有一定的相关性。     

海洛因依赖与TPH1 rs1799913和TPH2 rs4570625多态性的关联研究

目的:探讨中国汉族人群中海洛因依赖与色氨酸羟化酶1(TPH1)基因rs1799913和TPH2基因rs4570625多态性的关联性。方法:应用聚合酶链式反应(PCR)扩增技术及DNA测序分别测定189例海洛因依赖患者及195例正常人TPH1基因rs1799913多态性和TPH2基因rs4570625多态性的基因型。结果:海洛因依赖患者与正常人TPH1基因rs1799913多态性(基因型:χ2=0.496,P>0.05;等位基因χ2=0.004,P>0.05)和TPH2基因rs4570625多态性(基因型:χ2=2.043,P>0.05;等位基因χ2=2.148,P>0.05)的基因型和等位基因频率的比较均无显著性差异。结论:汉族人群TPH1基因rs1799913和TPH2基因rs4570625的多态性与海洛因依赖的易患性可能缺乏一定的关系。