利用RAPD标记分析长白山越桔的遗传多样性及亲缘关系

目的分析长白山越桔遗传多样性及其亲缘关系。方法用随机扩增多态DNA(RAPD)标记方法对1种野生越桔和2种不同的栽培越桔进行遗传多样性检测和遗传分析。结果采用40个随机引物共检测72个位点,其中多态位点27个,占37.5%;相似系数矩阵表明野生越桔和栽培越桔Ⅰ、栽培越桔Ⅱ的遗传距离分别为0.764和0.809;聚类图表明野生越桔和栽培越桔Ⅱ亲缘关系较近。结论长白山越桔的遗传多样性水平较低,野生越桔和栽培越桔之间的遗传变异不大,遗传因素在越桔形态变异上的作用小于环境因素。     

WHBE兔、日本大耳白兔和新西兰兔遗传多样性的RAPD分析

目的 应用随机引物扩增多态性DNA技术 （random amplified polymorphic DNA,RAPD） 对大耳白黑眼兔（white hair black eyes rabbit,WHBE rabbit）、日本大耳白兔（Japanese white rabbit,JW rabbit）和新西兰兔（New Zealand white rabbit,NZW rabbit） 3个实验兔品系进行遗传分析。方法 选用90只实验兔的皮肤组织样品提取基因组DNA,用60个随机引物对实验兔基因组DNA进行PCR扩增,根据电泳结果筛选出多态性较高的引物进行RAPD-PCR分析,再利用Popgene 3.2统计软件对3个品系的扩增条带进行遗传分析,获得实验数据。结果 分析结果表明：（1） 60个随机引物中筛选出25个多态性较高的引物,3个品系实验兔共检测到493个扩增片段,长度在100 ~1800 bp之间,筛选的25个引物中,其中16个引物既可扩增出3个品系共同的DNA条带,也可扩增出WHBE兔特有的特征条带;（2） WHBE兔位点数为234个,其中多态位点数166个,多态位点比为70.94%,JW兔位点数为228个,其中多态位点数122个,多态位点比为53.51%,NZW兔位点数为231个,其中多态位点数94个,多态位点比为40.69%;（3） 三个群体的Shannon多样性指数分别为0.3385,0.2222和0.1905;（4） JW兔和NZW兔的遗传相似系数最高,为0.8443,其次为WHBE兔和JW兔的遗传相似系数,为0.8204,WHBE兔和NZW兔的遗传相似系数最低,为0.7862。结论 结果表明WHBE兔与JW兔和NZW兔之间有遗传的相似性,也存在着遗传差异,应用RAPD技术可以很好地检测实验兔不同品系之间以及同一品系不同个体之间的亲缘关系。     

我国仙茅属植物遗传关系的RAPD分析

目的 从分子水平研究我国仙茅属（Curculigo Gaertn.）植物的遗传关系。方法 对我国仙茅属植物7个国产种30个单株进行RAPD分析。运用Popgene Version1.31软件计算相关参数,采用UPGMA聚类法进行聚类分析。结果 11个RAPD引物共扩增出157条带,其中有145条呈多态性。我国仙茅属植物的遗传多样性极为丰富,在物种水平上,多态位点百分率（PPB）为92.36%,平均每个位点的有效等位基因数（N_e）为1.493 7, Nei’s基因多样性指数（H）为0.300 1,Shannon’s多样性信息指数H_sp为0.457 7。在种内水平上,PPB＝5.09%,N_e＝1.036 6,H＝0.020 4,种内Shannon’s多样性信息指数（H_pop）为0.029 8。Nei’s 基因多样性指数计算的种间遗传分化系数（G_st＝0.931 3）与Shannon’s分化系数（0.934 9）基本一致,均说明大部分遗传变异存在于种间。种间基因流（N_m）为0.036 9,说明种间基因流动较少,遗传分化程度较高。两种间的Nei’s遗传一致度（I）的范围为0.520 8～0.823 7。根据Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类,基于RAPD分子标记的聚类结果与传统分类一致。结论 我国仙茅属植物的遗传多样性十分丰富,且种间的遗传差异大于种内的遗传差异。     

NJS小鼠与其亲本小鼠遗传多样性的RAPD分析

目的分析NJS及其亲本小鼠的遗传结构.方法筛选出5条随机引物对NJS及其亲本小鼠的遗传结构进行RAPD分析,并对NJS小鼠个体之间的基因组DNA进行相似性分析.结果两种小鼠均有相同的扩增片段且产生了各自的特异性条带;NJS小鼠不同个体间拥有的RAPD条带也具有差异,但拥有相同条带的个体小鼠比率较高.该群体小鼠的相似系数(F)为0.927(0.880～0.980).结论 RAPD分析获得的多态性可用于NJS与其亲本小鼠之间的遗传分析;而且NJS小鼠个体间具有较好的遗传一致性和遗传稳定性,其群体分化程度处在一个较低的水平.     

单叶蔓荆种质资源遗传多态性的RAPD分析

目的：利用RAPD技术分析野生单叶蔓荆（Vitex trifolia L.var.simplicifolia Cham.）种质资源的遗传多态性及种内遗传差异。方法：本研究以7个不同产区的野生蔓荆为试材,采用RAPD技术对其遗传物质进行分析,结合NTSYS-2.10e软件进行遗传相似系数计算和UPGMA方法聚类分析。结果：10个随机引物共获得88条DNA谱带,其中46条（52.3%）具有多态性;采用CTAB法提取DNA时,先将试材在0.9%的蔗糖溶液中暗培养48 h,有利于提高DNA提取率和纯度。结论：各种质之间均存在一定的遗传差异,与地域关系和主要有效成分的化学差异并不一致,尚需进一步的植物逆境生理和功能基因组学研究来解释这一现象。     

癌组织中的遗传不稳定性的RAPD分析

目的　检测肿瘤发生发展过程中DNA和染色体的不稳定性及筛选与新的癌基因或抑癌基因相关的分子标志。方法　用 9个随机引物对 5种肿瘤共 12 8个样本进行RAPD分析 ,检测其DNA和染色体的不稳定性。不稳定性的扩增带被切割回收纯化 ,克隆 ,然后被标记为探针作Southern和Northern印迹杂交分析 ,再进一步测序分析。结果　在所有的癌组织标本中胃癌样本 5号和 3号显示出最高的遗传变异。这 5种癌组织中遗传不稳定性的平均检出率分别从 4 2 2 %到 4 9 4 %。每个随机引物的检测能力有极显著差异 ,分别从 2 7%到 6 8%不等。其中引物2最高达 6 8% ,引物 8最低 ,为 2 7%。图 2中的B带为一个单拷贝片段经RFLP分析后发现其在胃癌和结肠癌中是缺失突变 ,测序后 ,经查询是一个新的序列并被GeneBank收录 (登录号AF15 10 0 5 )。进一步研究显示它可能是一个新抑癌基因的调控元件部分 ,含有一个顺式作用的“CACA”启动子 ,一个“GATA”家族序列的增强子和一个转录起始密码子。结论　RAPD与其他方法结合使用能检测肿瘤发生过程中DNA和染色体的不稳定性 ,并筛选与新的癌基因或抑癌基因相关的分子标志。     

利用RAPD技术分析实验用比格犬的遗传背景

目的　运用RAPD技术对实验用比格犬 (Beagle)进行遗传背景分析。方法　筛选的 16个RAPD引物对 4 0个样品的分析 ,共得到 93个扩增条带。结果　所有样品的相似系数 80 4 %到 10 0 %间变动 ,平均相似系数为93 2 8% ,聚类分析得到了这些个体的同源树资料。结论　本遗传背景资料可以为以后的比格犬繁育生产和生物医药学的研究应用提供技术指导     

霍山石斛种内遗传稳定性的RAPD初探

目的 研究霍山石斛荚果内遗传稳定性及荚果间的差异大小。方法 利用从20个随机引物筛选出来的3个稳定性较好的10碱基引物对来自5个不同荚果的霍山石斛种群进行RAPD检测。结果 5个荚果内遗传相似系数较大,在92.5926%-100.00%,其中H1、H9、H10、H14存在一定程度的变异,H23是一个较为稳定的群体;5个荚果间H1、H9、H10、H23的遗传距离较小,H14与其他4个荚果的遗传距离则较大。结论 建立霍山石斛稳定的无性快繁体系是切实可行的,同时说明霍山石斛种内存在一定的变异,H14与其他荚果的差异最大。     

癌组织中的遗传不稳定性的RAPD分析

目的　检测肿瘤发生发展过程中DNA和染色体的不稳定性及筛选与新的癌基因或抑癌基因相关的分子标志.方法　用9个随机引物对5 种肿瘤共128个样本进行RAPD分析,检测其DNA和染色体的不稳定性.不稳定性的扩增带被切割回收纯化,克隆,然后被标记为探针作Southern和Northern印迹杂交分析,再进一步测序分析.结果　在所有的癌组织标本中胃癌样本5号和3号显示出最高的遗传变异.这5种癌组织中遗传不稳定性的平均检出率分别从42.2%到49.4%.每个随机引物的检测能力有极显著差异,分别从27%到68%不等.其中引物2最高达68%,引物8最低,为27%.图2中的B带为一个单拷贝片段经RFLP分析后发现其在胃癌和结肠癌中是缺失突变,测序后,经查询是一个新的序列并被Gene Bank收录（登录号AF151005）.进一步研究显示它可能是一个新抑癌基因的调控元件部分,含有一个顺式作用的"CACA"启动子,一个"GATA"家族序列的增强子和一个转录起始密码子.结论　RAPD与其他方法结合使用能检测肿瘤发生过程中DNA和染色体的不稳定性,并筛选与新的癌基因或抑癌基因相关的分子标志.     

甘肃省半夏种质资源遗传多样性分析

运用荧光标记引物的扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术,对50份甘肃半夏样品进行了DNA指纹图谱构建和遗传差异分析。选出的8对AFLP引物共扩增出517条带,其中396条具有多态性,多态性位点百分率为75．8％,平均每对引物扩增出64．6条带和49．5个多态性条带。系统聚类分析结果表明所有半夏AFLP指纹均不相同,来源地相同的半夏表现出相对密切的亲缘关系,甘肃省西和县的半夏同天水市的半夏遗传差异明显。聚类分析结果获得了Bootstrap校验的支持。甘肃省半夏遗传多样性十分丰富,AFLP分子标记可有效应用于半夏种质资源鉴别和遗传多样性分析。     

栀子种质资源遗传多样性的ISSR研究

目的进行栀子种质资源的遗传多样性研究。方法对12份栀子种质资源进行ISSR分析。利用POPGENE32软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果12个引物共扩增出126条谱带,其中多态性谱带92个,多态带百分率（PPB）73．02％;观测等住基因数（Na）1．7302,有效等位基因数（Ne_1．4643;Nei’s基因多样性（He）27．09％;Shannon’s信息指数（I）0．4027。UPGMA聚类分析可将所有样品分为4类。聚类结果显示栀子种质亲缘关系与地理分布具有一定的相关性,并呈现出一定的地域性分布规律。结论栀子的遗传多样性水平较低,种质问的亲缘关系较近。     

栀子及其近缘类群的随机扩增多态DNA分析

目的:探索栀子与其变种雀舌栀子、重瓣栀子及变型水栀子之间的亲缘关系。方法:从56个随机引物中筛选出12个引物对栀子及其近缘类群进行随机扩增多态DNA分析,应用SPSS10.0分析软件中的Jaccard方法计算任意两样品间的相似系数,用组内聚类方法计算得出聚类树状图。结果:共得到251个有效位点。聚类分析显示,栀子与重瓣栀子最先聚类,然后与水栀子聚类,最后与雀舌栀子聚类。结论:重瓣栀子与栀子亲缘关系最近,雀舌栀子与栀子的亲缘关系最远。     

RAPD技术及其在肿瘤研究领域中的应用

遗传标记是一类易于识别．遵循孟德尔遗传模式．具有个体特异性或其分布规律具有种系特征的表型特征或遗传物质,早期的遗传标记涉及的基因位点数目少,多态水平低,随着分子生物学和分子遗传学的发展,多态性丰富的DNA分子遗传标记大量出现并被广泛应用。1990年Williams和     

人参及西洋参栽培土壤微生物种群遗传多样性的RAPD分析

目的 研究不同年生人参、西洋参栽培土壤中微生物种群结构差异。方法 采用RAPD技术对采集自吉林省抚松县的18份人参、西洋参根际土和根围土中的微生物种群结构进行遗传多样性分析。结果 栽培年限对根际土及根围土中的微生物种群结构有显著影响;人参和西洋参栽培土壤中的微生物种群结构也存在差异;寄主植物对土壤微生物种群结构的影响表现有根际效应。结论 人参或西洋参根系分泌物对土壤微生物的定向选择压力可能是造成土壤微生物种群遗传多样性变化的主要原因之一,人参或西洋参栽培土壤中微生物种群结构变化是导致土壤生态功能紊乱以及连作障碍形成的关键因子。     

家蚕近交系遗传纯度的RAPD检测

目的分析家蚕近交系IS-c108A的遗传纯度,为家蚕实验动物化的培育工作提供指导。方法应用经过筛选的20条随机引物对家蚕近交系IS-c108A(F10)的3个蛾区各30个个体和该近交系的亲本系统c108、对照实用化品种871各30个个体的基因组DNA进行RAPD扩增,计算个体间和蛾区间的相似系数及遗传距离。结果家蚕近交系IS-c108A(F10)的3个蛾区内的多态性带频率分别为1.807%、1.841%、1.841%,平均为1.830%;起点亲本c108个体间多态性带频率为7.207%,对照品种871个体间的多态性带频率为7.08%;而近交系IS-c108A与c108之间的多态性带频率为49.20%,c108和871品种之间的多态性带频率为58.33%。家蚕近交系IS-c108A10的3个蛾区内个体之间遗传相似系数的平均值分别为0.99581、0.99555、0.99551,总平均为0.99562。结论家蚕近交系IS-c108A(F10)已具有较高的遗传纯合度,家蚕具有易于获得高纯的有利条件。     

黄芩群体不同形态变异类型遗传多样性的AFLP分析

目的研究黄芩群体形态变异类型的遗传多样性。方法采用扩增片段长度多态性(AFLP)技术,对人工栽培群体的8个形态变异类型黄芩进行多态性分析。结果通过筛选得到9对AFLP引物组合,共扩增出2 834个DNA条带,多态性条带为1332个,多态性位点平均为47.8%。聚类分析结果表明,8个形态变异类型黄芩划分为4类。其中,绿茎、小叶、少分枝和紫色花类型与普通类型各自聚为一类,绿茎、大叶、少分枝和淡紫色花类型与紫红茎、大叶、少分枝和紫色花类型聚为一类,绿茎、小叶、多分枝和淡紫色花类型,绿茎、大叶、多分枝和紫色花类型,绿茎、小叶、多分枝和淡紫色花类型与紫红茎、小叶、多分枝和紫色花类型聚为一类。结论人工栽培群体黄芩形态变异类型间存在较高多态性,遗传多样性较丰富。     

巴戟天遗传多样性的RAPD研究

目的应用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)标记技术对广东产5个类群的栽培巴戟天进行遗传多样性研究。方法应用15种引物对64个个体进行检测,应用Popgen32软件分析群体的遗传多样性。结果共得到224条带,其中多态位点112个,多态百分率为50.00%。种群内多态位点百分率在37.05%～53.13%,平均为45.86%。Shannon指数和Nei指数均反映出巴戟天各类群遗传多样性有一定的变化。Shannon指数为0.287 6,各类群的Shannon指数在0.103 3～0.236 2,Nei指数为0.175 6,各类群的Nei指数在0.074 5～0.154 0。结论目前栽培巴戟天居群间有一定的分化,并产生了多种农家类型,其中小叶巴戟天(POP2)遗传多样性明显高于其他类型,这些可能是导致目前栽培巴戟天质量产生变异的主要原因。     

黄连遗传多样性的ISSR分析

目的 对野生黄连进行遗传多样性研究。方法 通过ISSR技术对7个野生黄连居群共78个个体进行遗传多样性分析。结果 用12个随机引物共扩增出106条清晰条带,其中72条具多态性,平均多态性位点比率为67.92%,Nei′s基因多样性指数H=0.180 3,Shannon多样性指数I=0.283 2,遗传分化指数Gst=0.681 5,遗传距离和遗传一致度分别为：0.089 4～0.184 6和0.832 1～0.912 7。结论 黄连种水平上具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群间,遗传多样性与地理关系表现出明显的相关性,ISSR可以作为研究遗传多样性及遗传分化的有效标记。     

长江流域南方鲇（Silurus meridionalis）和鲇（Silurus asotus）分子遗传标记的建立

目的 为南方鲇和鲇的分类提供分子鉴定的依据。方法 随机扩增多态性DNA技术（RAPD）。结果 建立了南方鲇和鲇的分子遗传标记,即S449－1．0kb。结论 南方鲇和鲇的分子遗传标记可在遗传育种中用于物种的有效鉴定,应用随机扩增多态性DNA技术可以发现并建立两个种之间鉴别的分子遗传标记。     

RAPD技术在实验动物遗传育种中的应用

提高实验动物育种的选择效率和减少育种过程中的盲目性是实验动物遗传育种工作者的追求目标。近年来 ,分子标记技术的发展为加速实验动物育种进程带来了新的契机。与以往的表型性状、同工酶分析等方法相比 ,分子标记直接从DNA水平检测基因组的遗传变异 ,不受组织、发育时期、环