清远地区急性呼吸道感染儿童人冠状病毒检测分析

目的了解清远地区急性呼吸道感染婴幼儿人冠状病毒HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-HKU1和HCoV-NL63的感染情况和流行特征。方法收集0~6周岁急性呼吸道感染患儿鼻咽拭子标本,采用多重荧光PCR方法分别检测标本中的人冠状病毒HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-HKU1和HCoV-NL63。结果共采集鼻咽拭子标本318份,检出人冠状病毒阳性数为36份,总阳性率为11.32%,人冠状病毒HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-HKU1和HCoV-NL63阳性率分别为2.83%、2.52%、1.89%和4.09%。男性组人冠状病毒阳性率为9.74%,女性组人冠状病毒阳性率为13.82%,不同性别4种人冠状病毒阳性率差异无统计学意义。0~5周岁年龄组均有检出人冠状病毒,但6周岁年龄组没有检出人冠状病毒。结论清远市地区急性呼吸道感染婴幼儿患者中存在感染人冠状病毒HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-HKU1和HCoV-NL63的情况。     

2010—2018年南昌市人冠状病毒NL63感染和基因特征分析

目的 掌握南昌市人冠状病毒NL63感染特征和基因型,为人冠状病毒NL63感染疾病的防控提供技术支撑。方法 采集急性呼吸道感染病例标本,采用Real-Time RT-PCR方法进行人冠状病毒NL63核酸检测。阳性标本Ct值小于30进行S1 结构域基因巢式PCR扩增,产物纯化后使用测序仪进行序列测定。使用Excel 2016、SPSS 13.0、CLC 21、DNAStar 7.1和MEGA 7.0分析数据。结果 共采集3744份标本,检出NL63阳性19份,阳性率0.51％;NL63阳性率男性病例高于与女性病例,阳性率在9月最高,差异有统计学意义。2014年NL63阳性率最高,2015、2017和2018年未检出。2010—2018年南昌市NL63阳性标本序列基因分型结果为, A型4份, B型4份。结论 南昌市人冠状病毒NL63感染男性高于女性,3岁以下儿童是人冠状病毒NL63感染的高危人群,应加强关注。NL63阳性率在9月最高,各年间阳性率有大差异。本研究发现本市NL63流行株基因型为A型和B型。     

人冠状病毒HCoV-HKU1和HCoV-NL63双重实时荧光RT-PCR检测方法的研究

目的建立一种快速、灵敏、高效的人冠状病毒HKU1(HCoV-HKU1)和NL63(HCoV-NL63)双重实时荧光RTPCR检测方法。方法根据GENBANK数据库中HCoV-HKU1和HCoV-NL63的基因序列,利用BIOEDIT5.0软件进行序列比对分析,选择基因组的保守序列,并借助引物设计生物信息学软件,设计筛选出一套针对HCoV-HKU1和HCoV-NL63双重实时荧光PCR扩增的引物。从特异性、最低检测限、重复性等方面进行评估,建立了HCoV-HKU1和HCoV-NL63双重实时荧光PCR检测方法。结果分别以HCoV-HKU1和HCoV-NL63质粒为模板,HCoV-HKU1和HCoV-NL63双重实时荧光PCR方法的最低检测量分别为4.96×102 copies/ml和4.96×102 copies/ml。该方法针对其他病原微生物及人类基因组无反应信号,特异性好。4个梯度稀释质粒样本的4次重复检测Ct值变异系数均5%,重复性好。结论 HCoV-HKU1和HCoV-NL63双重实时荧光RT-PCR方法准确性好、灵敏度高、稳定性好,在临床鉴别诊断和口岸冠状病毒的监测中具有很好的应用前景。     

汕头地区690例急性呼吸道感染患儿中人冠状病毒NL63的检测及分析

目前所确定的人冠状病毒增至5种:HCoV-229E、HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-NL63及HCoV-HKU1~[1,2].其中,HCoV-NL63已在国外及国内北京~[3]、福州~[4]等地区检测发现.为了解HCoV-NL63在汕头地区的流行情况及其所致疾病的特点,对该病毒核酸进行检测及相关分析.     

贵州省1例人类冠状病毒HKU1感染死亡病例流行病学调查

目的分析贵州省1例感染人类冠状病毒HKU1(HCoV-HKU1)死亡病例的临床表现及流行病学调查结果,为感染HCoV-HKU1疾病的预防控制和诊疗提供参考依据。方法 2019年4月27日,云南省昆明市第三人民医院报告1例贵州省不明原因肺炎病例,经云南省疾病预防控制中心检测复核得贵州省盘州确诊1例HCoVHKU1感染病例。通过对病例进行流行病学调查,收集相关病历资料,开展相关实验室检测,应用描述性流行病学方法对病例的临床表现及实验室检测结果进行分析。结果死亡病例临床表现为发热、咳嗽、咳痰等症状,血常规检测早期白细胞数减少(2.4×10⁹/L)、淋巴细胞数正常(1.8×10⁹/L),后期白细胞增多(14.66×10⁹/L)、淋巴细胞数正常(5.86×10⁹/L),胸部CT检测结果显示双肺感染呈渐进性加重至肺实质改变,经实验室核酸检测确诊为人类冠状病毒HCoV-HKU1。经流行病学调查,感染来源不清,密切接触者未出现2代病例。结论这是贵州报告首例人类冠状病毒HCoV-HKU1感染死亡病例。     

人冠状病毒HKU1重症肺炎病原检测及鉴定

目的 对内蒙古自治区赤峰市重症肺炎病例进行病原检测鉴定,分析pol基因的同源性并确定其病原学分类地位.方法采集10例重症肺炎患者的咽拭子样本,采用逆转录聚合酶链式反应(RT -PCR)进行流感病毒核酸检测,采用多重PCR方法进行呼吸道病毒鉴定,采用RT - PCR法特异性扩增人冠状病毒OC43、299E、NL63和HKU1的pol基因,阳性样本进行pol基因序列测定及同源性分析.结果 检出1份人冠状病毒HKU1阳性样本,RT-PCR法扩增到长度约440bp的特异性目的片段;其pol基因与人冠状病毒HKU1参比毒株的pol基因的同源性最高达99.7％以上.结论1例重症肺炎患者因感染人冠状病毒HKU1而发病,其他患者的病原学鉴定有待进一步研究.     

人冠状病毒HCoV-HKU1环介导等温扩增检测技术的研究

目的建立一种快速、灵敏、高效的人冠状病毒HKU1(HCoV-HKU1)LAMP扩增检测方法。方法应用生物信息学软件设计5套LAMP扩增引物,以合成的HCoV-HKU1质粒为模板,通过实时浊度法进行最佳引物组的筛选,并分析该方法的特异性和灵敏度。结果 HCoV-HKU1 LAMP扩增方法针对其他病原微生物及人类基因组无反应信号。该方法可以检测到1拷贝/μl的HCoV-HKU1质粒。结论 HCoV-HKU1 LAMP扩增方法特异性好、灵敏度高,在临床鉴别诊断和口岸冠状病毒的检测中具有很好的应用前景。     

急性下呼吸道感染患儿人冠状病毒感染状况研究

目的探讨住院急性下呼吸道感染患儿人冠状病毒感染状况,为临床防治提供理论依据。方法选择2013年1月-2015年12月医院就诊急性下呼吸道感染的患儿3140例,36例单纯人冠状病毒(HCoV)感染患儿为研究组,在其余3012例非人冠状病毒感染患儿中选择与研究组一般资料无差异的患儿60例为对照组;采集所有患儿入院1d内的鼻咽吸取物或者鼻咽拭子标本1份,并于72小时内送检;对3140例下呼吸道感染患儿中人冠状病毒感染情况及临床特征进行分析。结果 3140例患儿共检出流感病毒224例,呼吸道合胞病毒652例,多瘤病毒KI173例,多瘤病毒WU 192例,人偏肺病毒257例,人冠状病毒128例,副流感病毒572例,腺病毒358例,鼻病毒584例其中人冠状病毒感染阳性率为4.08%,单纯感染患儿36例,其中HCoV-HKUI、HCoV-OC43、HCoV-229E、HCoV-NL63、HCoV-EMC、SARS-CoV分别为6例,12例、6例、6例、3例、3例;研究组患儿咳嗽、呼吸衰竭、腹泻、发热、喘息和低氧血症比例显著高于对照组(P<0.05);27例患儿出现吸气相湿啰音和双肺呼气相喘鸣音,30例患儿胸部影像学表现支气管炎,3例为喉气管炎,3例为毛细支气管炎,9例患儿表现出肺部实变影,24例患儿表现出过度通气现象。结论下呼吸道感染患儿人冠状病毒感染,咳嗽为首发症状,同时伴随呼吸急促、喘息,多数伴随发热,肺部听诊表现呼气相高调喘鸣声和细湿罗音,部分患儿伴有腹泻症状。对于临床诊断为以上症状的儿童,应该积极采取措施,对患者感染病毒进行检测,进行针对性治疗。     

急性下呼吸道感染患儿人冠状病毒感染状况研究北大核心CSCD

目的探讨住院急性下呼吸道感染患儿人冠状病毒感染状况,为临床防治提供理论依据。方法选择2013年1月-2015年12月医院就诊急性下呼吸道感染的患儿3140例,36例单纯人冠状病毒(HCoV)感染患儿为研究组,在其余3012例非人冠状病毒感染患儿中选择与研究组一般资料无差异的患儿60例为对照组;采集所有患儿入院1d内的鼻咽吸取物或者鼻咽拭子标本1份,并于72小时内送检;对3140例下呼吸道感染患儿中人冠状病毒感染情况及临床特征进行分析。结果 3140例患儿共检出流感病毒224例,呼吸道合胞病毒652例,多瘤病毒KI173例,多瘤病毒WU 192例,人偏肺病毒257例,人冠状病毒128例,副流感病毒572例,腺病毒358例,鼻病毒584例其中人冠状病毒感染阳性率为4.08%,单纯感染患儿36例,其中HCoV-HKUI、HCoV-OC43、HCoV-229E、HCoV-NL63、HCoV-EMC、SARS-CoV分别为6例,12例、6例、6例、3例、3例;研究组患儿咳嗽、呼吸衰竭、腹泻、发热、喘息和低氧血症比例显著高于对照组(P<0.05);27例患儿出现吸气相湿啰音和双肺呼气相喘鸣音,30例患儿胸部影像学表现支气管炎,3例为喉气管炎,3例为毛细支气管炎,9例患儿表现出肺部实变影,24例患儿表现出过度通气现象。结论下呼吸道感染患儿人冠状病毒感染,咳嗽为首发症状,同时伴随呼吸急促、喘息,多数伴随发热,肺部听诊表现呼气相高调喘鸣声和细湿罗音,部分患儿伴有腹泻症状。对于临床诊断为以上症状的儿童,应该积极采取措施,对患者感染病毒进行检测,进行针对性治疗。     

人冠状病毒HCoV-HKU1研究进展

人冠状病毒HKU1株（HCoV-HKU1）属于β-冠状病毒,是人冠状病毒中相对神秘的一员,近年来在HCoV-HKU1的体外培养和细胞受体研究方面取得了较大进展。相关流行病学报道表明,HCoV-HKU1的发病率低,各地流行季节不一,我国主要是冬春季节高发,并在内蒙古地区检出首例HCoV-HKU1患者。本文就HCoV-HKU1的流行病学、感染机制、细胞培养和检测技术方面作一简要综述。     

小儿急性呼吸道感染与人博卡病毒相关性的研究

目的:了解小儿急性呼吸道感染与人博卡病毒(Human Bocavirus,HBoV)的相关性。方法:对2008年1～5月在长春市儿童医院住院的1007例急性呼吸道感染患儿鼻咽深部分泌物样本用PCR扩增的方法进行HboV NS1基因检测。随机选取8例HBoV阳性产物进行测序,并将测到的序列与GenBank中的基因序列和HBoV阳性病例的临床资料进行分析。结果:1007例标本共检测出44例HBoV阳性,阳性率为4.37%,其中急性上呼吸道感染、急性支气管炎、毛细支气管炎和支气管肺炎患儿人博卡病毒阳性检出率分别为1.29%(2/155)、5.71%(2/35)、8.70%(2/23)和4.79%(38/794)。HboV急性呼吸道感染的年龄分布为1岁以下39例,占88.64%;1岁以上5例,占11.36%;男女性别比值是1.75∶1;临床表现咳嗽伴喘憋占97.56%,咳嗽伴腹泻占34.14%,入院时体温升高占54.55%,肺部听诊闻及干和/或湿性罗音者占95.12%,X线胸片片状影占87.80%,病程平均为13.79天。结论:人博卡病毒是引起小儿急性呼吸道感染的病原之一;HboV所致呼吸道感染部位多在下呼吸道;感染患儿以1岁以内婴儿为主。     

西宁地区儿童急性呼吸道感染病毒病原学检测分析

目的:探讨西宁市儿童常见呼吸道病毒感染的病原学特点和分布特征。方法:采集141例急性呼吸道感染住院患儿的咽拭子标本,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行合胞病毒(RSV),流感病毒A、B型(IFV A、B),副流感病毒Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型(PIVⅠ、Ⅱ、Ⅲ),腺病毒(ADV),冠状病毒(HCoV)OC43/HKU1、229E/NL63,博卡病毒(HBoV),偏肺病毒(hMPV)检测。结果:从141份鼻咽拭子样本中检测出呼吸道病毒阳性22例,阳性率为15.6%。检出4种呼吸道病毒,其构成比分别为ADV 45.5%、PIVⅡ26.1%、HCoV-229E/NL63 17.4%、IFV A 13.0%。不同性别间患儿呼吸道病毒阳性率无统计学差异(P>0.05)。<6个月组阳性率最低(6.3%),3～6岁年龄组阳性率最高(29.2%)。结论:西宁地区急性呼吸道感染病毒病原检出率低于全国水平,ADV为西宁地区急性呼吸道感染的首位病毒病原体,HCoV-229E/NL63是该地区急性呼吸道感染的病原之一。     

杭州地区急性呼吸道感染患儿人博卡病毒的检测及分析

目的了解杭州地区人博卡病毒(HBoV)的流行情况和基因变异情况。方法对杭州地区160例儿童急性呼吸道感染患者咽拭子样本进行HBoV检测,并对阳性样本进行常见呼吸道病毒的检测,最终选取HBoV单一阳性的HZ1株和HZ2株进行VP1基因扩增,将获得的序列上传Genbank并与其他国家和地区的8株HBoV的VP1基因进行序列比对和分析。结果杭州地区HBoV的检出率为6.9%(11/160),与其他常见呼吸道病毒的合并感染率达到45.5%(5/11),HZ1株和HZ2株与其他国家和地区的8株HBoV的VP1基因相似性达到99%以上。结论研究证明杭州地区急性呼吸道感染患儿中存在HBoV的感染,与其他呼吸道病毒有较高的合并感染,从分离到的HZ1株和HZ2株来看,杭州地区流行的是ST2基因型,其外壳蛋白VP1基因变异很小。     

儿童急性呼吸道感染肺炎支原体抗体检测结果分析

目的 研究肺炎支原体(MP)感染发病率与季节、患儿年龄和性别的关系,了解MP流行趋势和致病特点,为临床诊断MP感染提供依据.方法 用被动凝集法检测呼吸道感染患儿血清中MP抗体(MP-Ab),并对2011年急性呼吸道感染患儿MP-Ab检测结果进行分析.结果 送检的5271份标本中有1603份检出阳性,阳性率为30.41％,其中MP-Ab检测滴度1:80的患儿所占比例最高为27.63％,滴度≥1:1280较少,占6.68％;MP感染的季节性明显,春季和冬季的检出率最高;在不同年龄组中,1～3岁组阳性率最高,为34.20％,其次是3～6岁组为31.25％,≥6岁组的阳性率最低为24.13％,各年龄组差异有统计学意义(P＜0.05);男、女性患儿阳性率分别为30.96％、29.42％,差异无统计学意义.结论 MP感染症状较轻,大多患儿预后良好;全年均可发病,其中以冬春季高发;1～6岁儿童为高危人群;男、女患儿感染机会相当.     

儿童急性呼吸道病毒感染1200例的抗原检测及分析

目的了解急性呼吸道感染(acute respiratory tract infection,ARI)患儿病毒感染病原分布状况,掌握浙江金华儿童病毒感染的病原学流行趋势,为儿童呼吸道病毒感染诊断提供帮助及临床治疗提供参考。方法收集2013年2月-2014年1月本院住院确诊为急性呼吸道感染的1 200例患儿鼻咽分泌物,采用直接免疫荧光法(DFA)进行七项呼吸道病毒抗原检测,包括流感病毒A(FluA)和流感病毒B(FluB)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)及副流感病毒(PIV)1、2、3型,并进行统计学分析。结果 1 200例患儿送检标本,阳性424例(占35.33%)。阳性标本中RSV检出最高为290例(占68.40%)、FluA 26例(占6.13%)、FluB 10例(占2.36%)、ADV 12例(占2.83%)、PIV1 25例(占5.90%)、PIV2 6例(占1.42%)、PIV3 55例(占12.97%)。儿童呼吸道病毒感染第一至四季度检出率分别为41.27%、11.56%、12.74%及33.96%,第一与第四季度检出率较高且与第二、三季度相比有统计学差异(P0.05)。随着患儿年龄增长,呼吸道病毒感染率逐渐下降,0~6月龄婴幼儿病毒检出率最高(50.85%),3岁以上儿童病毒检出率最低(16.92%),且各年龄组间比较差异有统计学意义(P0.05)。结论病毒是儿童急性呼吸道感染的主要病原,直接免疫荧光法检测不仅可以对临床提供快速、准确的诊断依据,还能及时为临床提供病原学资料,指导合理用药,防止抗生素滥用。     

上海地区人偏肺病毒致儿童急性下呼吸道感染的分子流行病学研究

目的 建立可靠的TaqMan-MGB实时荧光RT-PCR方法 ,检测临床样本中人偏肺病毒(hMPV)N基因,以了解2006年10月至2008年2月期间上海地区hMPV致儿童急性下呼吸道感染(ALRTI)的临床与分子流行病学特点.方法 为了明确hMPV在儿童ALRTI中的地位,用直接免疫荧光方法 检测呼吸道合胞病毒(RSV),腺病毒,A、B型流感病毒,1、2和3型副流感病毒7种儿童常见呼吸道病毒抗原,结合肺炎支原体、沙眼衣原体荧光定量PCR检测结果 及细菌学培养结果 进行分析.结果 2006年10月至2008年2月上海地区ALRTI儿童鼻咽分泌物中hMPV的检出率为3.86%(24/622),2006-2007年冬季和2007-2008年冬季检出率分别为6.60%(14/212)和1.11%(2/180);hMPV致儿童ALRTI以＜5岁儿童多见.该期间上海地区hMPV仅见A2亚型株流行.呼吸道病毒是上海地区儿童ALRTI主要病原,在儿童ALRTI中hMPV感染可能仅次于RSV,是常见的呼吸道病毒.结论 hMPV是上海地区儿童ALRTI的重要病原体.     

粤东地区2008--2010年急性呼吸道感染住院儿童中人鼻病毒检出及临床分析

目的了解2008-2010年粤东地区急性呼吸道感染住院儿童人鼻病毒(HRV)的检出情况、流行规律和感染特点。方法法应用PCR和RT-PCR技术对2008年10月至2010年9月汕头大学第二附属医院儿科住院的部分急性呼吸道感染患儿咽拭子,进行HRV、呼吸道合胞病毒(RSV)等常见10种呼吸道病毒核酸检测,并收集HRV和RSV阳性患者资料。结果1335例呼吸道感染住院患儿咽拭子阳性率最高的是流感病毒A型(IVA)(25.1％),其次是RSV(15.1％),HRV(9.3％)。HRV感染几乎常年都有发生,2009年检出高峰在夏季,2010年为秋季。单纯HRV感染和混合其他病毒感染的患儿临床症状、体征、胸片、白细胞计数、急性反应蛋白和住院天数的差异无统计学意义。单纯HRV和单纯RSV感染患儿临床症状与体征相似,喘息和咳嗽在RSV感染的患儿中更为多见,单纯RSV感染患儿诊断为毛细支气管炎(25例,28.4％)高于单纯HRV感染(6例,10.7％),差异有统计学意义(x!=0.28l,P=0.596)。6)。结论论HRV是粤东地区急性呼吸道感染较为常见的病原,流行季节随年份的不同略有差异,婴幼儿普遍易感。HRV感染患儿所致毛细支气管炎、咳嗽和喘息均较RSV少,但HRV和哮喘急性发作密切相关。