新型冠状病毒抗体检测结果的标准化和平行比较北大核心CSCD

目的通过世界卫生组织(world health organization,WHO)新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)抗体国际标准品(international standard,IS)(G样本)、抗体参考盘(样本E、F、H、I、J)的应用降低SARS-CoV-2抗体检测结果差异、提高检测结果一致性。方法利用基于SARS-CoV-2活病毒的微量中和试验、假病毒中和试验以及商品化的ELISA试剂盒对WHO的SARS-CoV-2抗体IS和参考盘等共10个样本(A~J)分别进行检测,对检测结果进行分析比较。结果以IS为参考品确定其他样本的相对浓度,降低了检测结果之间的差异。假病毒中和试验、ELISA检测血清抗体参考盘结果与基于SARS-CoV-2 HB02株的中和试验基本一致,个别试剂可检测弱阳性样本。结论SARS-CoV-2抗体IS的使用促进了血清学检测方法的标准化,抗体参考盘适用于基于SARS-CoV-2原型株的所有检测方法,假病毒中和试验、ELISA等在一定程度上可作为活病毒中和试验的替代方法。     

一种新型冠状病毒荧光定量PCR快速检测方法的应用评价

目的:建立并评价一种基于COYOTE ? Flash20实时荧光定量PCR仪用于新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸快速检测的方法。 方法:通过使用靶向SARS-CoV-2 ORF1ab和N基因的特异性引物探针组构建快速反应体系,并验证体系的灵敏度和特异性。同时,使用108例新型冠状病毒肺炎(...     

一起新型冠状病毒暴发疫情的基因组特征与溯源分析

目的:了解引起河南省2021年11月COVID-19暴发疫情的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组特征,分析核苷酸和氨基酸变异情况并进行溯源。方法:收集病例急性期咽拭子标本,应用实时荧光RT-PCR方法对SARS-CoV-2核酸进行检测。选取SARS-CoV-2核酸阳性样本进行高通量基因序列测定和全基因组序列比对...     

新型冠状病毒抗原自测应用于隔离人员筛查的初步评价

目的对新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)抗原检测试剂盒(胶体金免疫层析法)进行临床评价, 初步评价其应用于隔离人员筛查的效果。方法采集172位隔离人员的临床平行样本(分别用于核酸和抗原检测)共516份, 由研究人员和隔离人员分别采用胶体金免疫层析法进行SARS-CoV-2抗原的快速检测, 同时在实验室进行核酸检测, 计算阳性符合率、阴性符合率、总符合率和Kappa值。结果两种方法的总符合率为91.86%(95%CI:86.80%～95.09%), 一致性分析Kappa系数为0.527(95%CI:0.318～0.736), 0.4≤Kappa<0.8。研究人员和隔离人员自测结果的总符合率为99.42%(95%CI:96.78%～99.90%), 一致性分析Kappa系数为0.944(95%CI:0.836～1.000), Kappa>0.8。结论胶体金免疫层析法检测SARS-CoV-2抗原在发病初期及病毒载量较高时有较好的检测效果, 可应用于对隔离人员的现场筛查。但鉴于其方法...     

SARS-CoV-2 Omicron变异株TaqMan探针法荧光定量RT-PCR的建立及应用

目的开发和评估一种快速、简单和经济的替代测序的Omicron变异株荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)。方法针对SARS-CoV-2 ORF1ab保守区域、Omicron变异株S基因高频共同突变位点设计引物和TaqMan探针, 建立Omicron株RT-qPCR检测方法, 用经全基因组测序确定型别的样本进行验证, 并对该方法的特异度和敏感度进行评估。结果本研究建立的RT-qPCR分型法可以将Omicron变异株与包括早期A型流行株、Alpha和Delta变异株在内的SARS-CoV-2毒株进行区分, 结果与全基因组测序结果一致, 符合率为100.00%(28/28);与其他6种呼吸道病毒及柯萨奇病毒A组16型无交叉反应;该方法RNA标准品在109～103拷贝/μl之间呈良好的线性关系, 相关系数R2均大于0.99, 检测敏感度为103拷贝/μl。结论本研究设计的针对Omicron变异株的RT-qPCR敏感度高且特异度好, 在任何可以进行PCR检测的实验室中都容易开展, 可极大地促进对Omicron变异株的传播监测。     

BSL-2实验室开展SARS-CoV-2核酸检测过程中的生物安全管理

目的:总结生物安全二级（bio-safety level 2,BSL-2）实验室开展新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2）核酸检测过程中的生物安全管理经验与效果。方法:检测样本来源于2020年2月21日到2020年11月5日送...     

野生型SARS-CoV-2感染康复者血清中SARS-CoV-2 Omicron突变株BA.1.1.529、BA.2和BA.3的中和抗体评估

目的 分析野生型SARS-CoV-2(2019新型冠状肺炎病毒)感染康复者血清中SARS-CoV-2 Omicron变异株BA.1.1.529、BA.2和BA.3的中和抗体滴度。方法 以8名已从SARS-CoV-2新冠肺炎中恢复的康复者血清为研究对象,采用ELISA方法检测野生型SARS-CoV-2感染康复者血清中SARS-CoV-2 Omicron变异株BA.1.1.529、BA.2和BA.3的中和抗体滴度,并将其与野生株SARS-CoV-2的中和抗体滴度进行对比分析。结果 在野生型SARS-CoV-2感染康复者血清中,SARSCoV-2 Omicron变异株BA.1.1.529中和抗体滴度显著低于野生株SARS-CoV-2中和抗体滴度（P<0.001）,而SARS-CoV-2Omicron的BA.1.1.529、BA.2和BA.3 3个亚系之间的中和抗体滴度无差异。结论 野生型SARS-CoV-2感染康复者血清中SARS-CoV-2 Omicron变异株BA.1.1.529、BA.2和BA.3的中和抗体滴度均较少。提示感染野生株SARS-CoV-2患者康复后可能对Omicro...     

SARS- CoV-2感染者在不同流行时期临床特征的比较

目的 比较SARS-CoV-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-CoV-2)病毒株在不同流行时期,引起COVID-19(corona virus disease 2019,COVID-19)后,发病早期患者的临床表现及实验室检测结果的差异,观察病毒流行不同阶段的致病性变化,为临床提供实验室依据,便于医生采取更加及时有效的治疗措施。方法 收录了216例确诊新型冠状病毒感染的住院患者。通过两独立样本t检验,比较了2020年6月病例组(184例)和2021年1月病例组(32例)在基础病、并发症、实验室检测结果方面的差异,并通过图例更直观地展示有差异的指标在两组性别间的不同。结果 在进行2020年6月病例组和2021年1月病例组的并发症的比较中,咽干咽痛(P=0.018)、恶心(P=0.039)、低钾血症(P<0.001)的P值均小于0.05;实验室检测数据的比较中,血气检测中的pH(P=0.009)、PCO₂(P<0.001)和HCT(P=0.011);血常规检测中,NE%(P=0.0...     

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型与流感病毒合并感染的研究进展

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)感染导致的新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019, COVID-19)引起世界范围大流行。SARS-CoV-2在流行季节、传播机制以及临床表现上与流感病毒均有相似性。本文对流感病毒与SARS-CoV-2合并感染的病原学、流行病学特点、病理机制、临床特征、治疗及预后等情况进行综述。在流感病毒和SARS-CoV-2共同流行期间, 应同时进行SARS-CoV-2和流感病毒等呼吸道病原体检测以便尽早明确诊断, 改善患者预后。     

SARS-CoV-2棘突蛋白特异性多肽的筛选及初步验证

目的 筛选及初步验证新型冠状病毒(SARS-CoV-2)棘突蛋白(S蛋白)的特异性多肽.方法 用多种生物信息学软件对SARS-CoV-2 S蛋白区别于HCoV-229E、HCoV-HKU1、HCoV-NL63、HCoV-OC43、SARS-CoV、MERS-CoV S蛋白氨基酸序列的特异性序列进行筛选并预测其理化性质、...