转运tRNA：第二套遗传密码

第二套遗传密码,目前大部分还没有被破译,存在于氨基酰tRNA合成酶的结构中,该酶是催化氨基酸与相应的tRNA分子结合。这套密码可能是非简并性的,比经典的遗传密码更古老,更具有决定性。在本期第140页(指Nature 1988;333:140,译者注)上,Hou和Schimmel阐明了这套密码系统起作用的一种机制。作者揭示了一对碱基可以决定一个tRNA分子的氨基酸特异性。遗传信息翻译的准确性依赖于两个连续的、独立的配对精确性:第一,氨基酸与tRNA分子的结合;第二,负载有氨基酸的tRNA分子与连接在核糖体的mRNA结合。     

铜绿假单胞菌外毒素A免疫毒素片段的抗原性评估及三级结构模拟

目的 克隆铜绿假单胞菌外毒素A(PEA)基因及分析不同克隆序列中不同性质氨基酸对抗原性及三级结构的贡献.方法 以铜绿假单胞菌基因组DNA为模板,以PEA编码基因特异区段为引物,采用Touchdown PCR克隆PEA编码基因.阳性克隆经菌落PCR鉴定后进行DNA测序及Clustal X(1.83)比对分析;采用生物信息学在线软件BIMAS及SWISS-Model对所得基因编码蛋白进行抗原性评估及三级结构模拟.人为置换关键部位的氨基酸残基,考察不同性质氨基酸对三级结构的影响.结果 从铜绿假单胞菌DNA中获得3个克隆.抗原性分析及三级结构模拟结果显示,3个克隆与公开发表的序列之间存在少数氨基酸的差异;个别区段上氨基酸的改变可引起相应位点抗原性的改变,但仅有个别位点的改变对空间结构产生影响.结论 基于抗原性评估及三级结构分析,获得了不同性质氨基酸对抗原性及三级结构的贡献等信息,为PEA编码基因用于弱化抗原性靶向性毒素的构建奠定了基础.     

Hermansky-Pudlak综合征Ⅰ型的分子遗传学研究进展

Hermansky-Pudlak综合征是白化病综合征的一种，呈常染色体隐性遗传，具有高度遗传异质性。目前。国际上已经报道8种亚型（HPS1—8），其中HPS1最常见。HPS1基因与小鼠灰耳基因（pale ear，ep）同源，基因定位于10q23.1-23.3。HPS1基因编码一种由700个氨基酸残基组成的蛋白质，其功能尚未清楚。迄今为止，国际上报道了23种HPS1基因突变和至少23种DNA多态性。基因的分子病理学研究为HPS1临床确诊和产前诊断奠定了基础。     

人巨细胞病毒UL136基因在临床低传代分离株中多态性分析

目的 研究人巨细胞病毒(human cytomegalovirus，HCMV)UL136基因在临床低传代分离株中的多态性，探讨其多态性与HCMV先天性感染不同致病性之间的关系。方法 对48株经荧光定量PCR方法检测HCMV DNA为阳性的临床低传代分离株进行HCMV ULl36全序列PCR扩增，对于扩增阳性的12株PCR产物进行ULl36基因全序列测定及结果分析。结果 48株临床低传代分离株ULl36 PCR扩增，12株阳性，阳性率25％，以HCMV Toledo株作为参考株，进行序列比较分析表明，12株临床分离株ULl36开放阅读框架(open reading frame，ORF)长度均与Toledo株相同，为723bp，编码241个氨基酸的蛋白。DNA序列变异均为碱基替换，不同临床分离株ULl36基因与Toledo株进行同源性比较，结果在核苷酸水平为97．7％～99．3％，氨基酸水平为96．6％～99．1％。ULl36编码蛋白的氨基酸变异率为0．83％～3．3％。二级结构预测分为两种构象。大多数HCMV ULl36蛋白翻译后修饰位点在所有分离株中均高度保守，仅几个位点在一些分离株中存在缺失或新增。Toledo株及12株临床分离株核苷酸及氨基酸序列系统进化树分析表明：45J最接近Toledo株。结论 12株临床低传代分离株HCMV ULl36基因DNA及其编码产物的氨基酸序列比较保守，但仍存在一定多态性。未发现不同临床分离株ULl36基因多态性与HCMV先天性感染的表现关系。     

Hermansky-Pudlak综合征Ⅰ型的分子遗传学研究进展

Hermansky-Pudlak综合征是白化病综合征的一种，呈常染色体隐性遗传，具有高度遗传异质性。目前，国际上已经报道8种亚型（HPS1-8），其中HPS1最常见。HPS1基因与小鼠灰耳基因（pale ear，ep）同源，基因定位于10q23．1-23．3。HPS1基因编码一种由700个氨基酸残基组成的蛋白质，其功能尚未清楚。迄今为止，国际上报道了23种HPS1基因突变和至少23种DNA多态性。基因的分子病理学研究为HPS1临床确诊和产前诊断奠定了基础。     

乙肝患者血清前S1抗原与HBV DNA的检测及其临床意义

乙型肝炎病毒(HBV)前s1区编码的产物前s1抗原，其第21～47位氨基酸为肝细胞膜的受体，HBV可通过这一受体黏附到细胞膜上从而进入肝细胞(J Med Virol，1992，37：116)。因此，前s1抗原在HBV侵入肝细胞的过程中起着重要作用。本研究中，我们对383例HBsAg阳性患者血清前s1抗原和HBV DNA同时进行检测分析，并探讨其临床意义.     

神经丝轻链基因在腓骨肌萎缩症中的突变分析

目的：探讨神经丝轻链基因（neurofilament-light gene,NF-L）在中国人腓骨肌萎缩症（Charcot-Marie-Tooth disease,CMT）中的突变特点。方法：应用聚合酶链反应－单链构象多态性技术结合DNA序列分析方法，对32个来自全国5省汉族的CMT家系先证者进行了NF－L基因的突变分析。结果：32例先证者中只有1例患者出现异常条带，经DNA测序证实该患者在NF－L基因的外显子3发生了1329C→T碱基改变，由于编码的氨基酸未改变，均为酪氨酸（Tyr），为一种同义突变。结论：NF－L基因突变可能在中国人的腓骨肌萎缩症患者中少见。     

甲状腺激素抵抗综合征一家系TRβ基因突变研究

目的研究一个甲状腺激素抵抗综合征家系甲状腺激素受β（thyroid hormone receptor β，TRβ）基因（TRβ）突变情况。方法提取患者及14名家系成员、7名健康对照的外周血基因组DNA，PCR分段扩增刀够基因的第7～10外显子，产物纯化后直接进行DNA测序检测突变。结果测序结果，该家系中5名成员TRβ基因第10外显子的1642位核苷酸发生C→G的转换突变，该突变为错义突变，使该位点所编码的氨基酸由脯氨酸变为丙氨酸（P1453A），同时刀够基因第7外显子的第1020位核苷酸发生C→T的转换突变，该突变为一同义突变，其所编码的氨基酸仍为苯丙氨酸（F245F），两种突变均为杂合子突变。结论在中国人中发现1例TRβ基因突变所致的甲状腺激素抵抗综合征家系。     

发现DNA修复新机制

据《自然》2010年10月3日报道（Nature,10—3—2010）,美国范德比特大学、宾夕法尼亚州立大学及匹兹堡大学的研究人员发现了一种DNA修复酶检测并修复遗传密码碱基损伤的新机制。通常认为双螺旋结构的DNA是非常稳定的,但事实上DNA性质高度活跃。由于人体细胞内正常的化学活动及自然环境放射和毒性物质的作用,人体的每个细胞每天约有一百万个DNA碱基发生损伤。     

组蛋白修饰与基因调控

基因表达是一个受多因素调控的复杂过程。组蛋白是染色体基本结构—核小体中的重要组成部分 ,其N-末端氨基酸残基可发生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、多聚 ADP糖基化等多种共价修饰作用。组蛋白的修饰可通过影响组蛋白与 DNA双链的亲和性 ,从而改变染色质的疏松或凝集状态 ,或通过影响其它转录因子与结构基因启动子的亲和性来发挥基因调控作用。组蛋白修饰对基因表达的调控有类似 DNA遗传密码的调控作用     

旦白质合成及其调节(一)

一、引言蛋白质的一级结构即其分子具有的氨基酸排列顺序。蛋白质合成的主要问题即是如何由一定的20种氨基酸正确地排列成一种蛋白质专一的排列顺序。关于蛋白质合成的许多知识是从细菌和病毒研究中得来的,根据近年来的研究发展,其基本机理亦普遍适用于动物体系。除细菌和病毒以外,生物细胞的DNA主要构成染色体,集中在细胞核内,仅少量DNA类似细菌DNA存在于线粒体内。生物细胞DNA的生理重要性就是作为生物遗传基因的物质基础。蛋白质中     

广州地区HCMV低传代临床病毒株UL143基因的多态性研究

目的研究广州地区人巨细胞病毒（HCMV）临床低传代分离株UL143基因的多态性。方法对3株经多重PCR鉴定的HCMV临床低传代分离株进行HCMV UL143基因全序列扩增，扩增产物克隆到pMD18-T载体上测序，并将其序列与GenBank中公布的其它临床分离株UL143基因一起进行分析。结果D3株UL143基因因碱基缺失形成多处终止密码无法产生有功能的蛋白；Toledo株UL143基因开放读码框由279个核苷酸组成．编码蛋白由92个氨基酸残基组成：其它临床分离株UL143基因开放读码框均由252个核苷酸组成。DNA序列比较保守，变异均为碱基替换。编码蛋白由83个氨基酸残基组成，氨基酸序列也很保守，不同临床分离株氨基酸变异率为1．2％-2．4％：HCMV UL143蛋白翻译后修饰位点在除Toledo株之外的所有分离株中均高度保守．没有缺失或新增；不同临床分离株UL143蛋白二级结构有所不同；除Toledo株外，其余分离株UL143蛋白的等电点均为8．75。结论临床低传代分离株HCMV UL143基因DNA及其编码产物的氨基酸序列极为保守。但仍存在一定多态性。     

原核类mRNA的加工

长期以来,插入序列一直被视为真核类基因的标记。最近人们在一个编码蛋白质的原核类基因中发现了插入序列(或叫内含子)。这一内含子把T4噬菌体胸腺嘧啶核苷酸合成酶的编码序列,分离成两个外显子。外显子Ⅰ编码胸腺嘧啶核苷酸合成酶N末端的183个氨基酸;外显子Ⅱ编码其余103个氨基酸。该内含子长度为1017个核苷酸,以ochre终止密码子开头,以ATG(一种潜在的起始密码子)结束。这些密码子的出现使人们推测T4噬菌体感染时,胸腺嘧啶核苷酸合成酶的合成可能利用一种前所未有的多肽链连接反应;或者,通过一种尚未发现的原核类mRNA加工系统来完成。     

证实表观遗传标记组蛋白修饰与DNA甲基化之间存在关联

据2012年9月30日Rothbart SB（Nat Struct Mol Biol,2012 Sep 30.doi.10.1038/nsmb.2390）报道,美国北卡罗来纳大学医学院的研究人员建立起人类两个最为基本性的表观遗传标记——组蛋白修饰和DNA甲基化——之间存在的首个关联。在过去20年,科学家们已经理解到DNA内拥有的遗传密码只代表生命蓝图的一部分。     

肾综合征出血热山东分离株鲁宁-84刘株的分子特征分析

目的 分析肾综合征出血热山东分离株鲁宁—84刘株的分子特征。方法 应用逆转录聚合酶链反应(RT—PCR)扩增鲁宁—84刘株M和S片段全基因，克隆于T载体，纯化后测定序列，应用DNA STAR软件比较分析。结果 鲁宁—84刘株(JNL株)的M片段的全基因序列共3615个核苷酸，编码1135个氨基酸，S片段的全基因序列共1698个核苷酸，编码429个氨基酸，为HTN型毒株。JNL株与HTN型毒株M和S全基因序列差异分别高达20．0％-20．6％和15．5％-16．0％，基于核苷酸序列的种系发生分析结果也可以看到，鲁宁—84刘株不同于国内外其他的分离株，处于独立的分支。结论 山东地区鲁宁—84刘株流行株是与国内外HTN型毒株不同的新的HTN亚型病毒。     

汉族人甘露聚糖结合凝集素全长基因的克隆与序列分析

目的 克隆汉族人甘露聚糖结合凝集素(MBL)全长基因.方法 提取汉族人白细胞基因组DNA,高保真PCR扩增MBL基因,应用TA克隆方法将PCR产物与载体pcR(R)-XL-TOPO连接,经DNA测序后利用软件DNAStar进行分析.结果 MBL基因反向插入pCR(R)-XL-TOPO,全长6 321 bp,与GenBank收录的基因序列相比,有17个碱基不同,其中仅1个位于编码区(外显子4),但编码的氨基酸没有改变,且该碱基恰与GenSank收录的人MBL cDNA一致,此序列已被GenBank收录,登录号EU596574.结论成功克隆了汉族人MBL基因全长序列,其结构基因的基因型属于野生型,这为研究MBL基因非编码区对MBL表达的影响奠定了基础.     

DNA免疫制备单克隆抗体的研究进展

DNA免疫是近年发展起来的一种新型抗体制备法。DNA免疫克服了传统蛋白质免疫方法的缺陷,能更为有效地激发机体的体液和细胞免疫应答。尤其是在仅知DNA编码而不能获得目的蛋白或获得的抗原蛋白为低免疫性的情况下,蛋白质免疫将很难得到特异性的抗体,但通过DNA免疫可制备高效价特异性的抗体,这为某些疾病如病毒性疾病和肿瘤等的诊断和免疫治疗开拓了新的途径。     

细胞的能量工厂突破遗传的语言规则

分子生物学业已指明全部地球上的生命都是由相同的化学密码系统指令的。现在,分子生物学家用重组DNA技术扩增和检验基因,发现他们错了。细菌与人可用同一种遗传密码,但它们与人和动物     

BRCA1与DNA损伤修复及转录调节

BRCA1基因定位于人染色体17q12-21，编码蛋白含有1863个氨基酸残基。BRCA1蛋白具有许多与其他蛋白相互作用的位点，通过蛋白之间的相互作用来发挥其重要的生物学功能，包括细胞周期调控，DNA损伤修复，基因的转录调节，细胞凋亡和泛素化等。BRCA1基因的突变与家族性乳腺癌及卵巢癌的发生密切相关，对BRCA1分子功能尤其是DNA损伤修复和转录调节的研究，将有利于阐明肿瘤发生的机理。因此本文就BRCA1的结构及其在DNA损伤修复和转录调节方面的研究进展做一综述。     

《周易》与人类遗传和计划生育浅谈

一、《周易》64卦与遗传64密码子本人自幼就从老人那里听到古代有“八卦”，能背诵乾、坎、艮、震、巽、离、坤、兑此八卦名，同时也会背颂朱熹的八卦歌：“乾三连，坤六断，震仰盂，艮覆碗，离中虚，坎中满，兑上缺，巽下断”。这是说构成八卦的三条横线或连，或断，这样就可以组成八种图形，即卦象。为什么三条线，古代定为天、地、人各占一条。据传说古代伏羲作八卦，周文王(姬旦)作64卦，这是把八卦两两叠加成六画，这样就可以出现64种组合，被称为64卦，每卦都有专名。说的再清楚些，就是一与一一，这叫一阳．一阴。在这里排列组合而已，古人就是用这64种变化，来分析人们生活中的祸福吉凶。而生物遗传的化学物质就是DNA，它是一个很长的大分子链，这条链不是一条线，而是根据不同成分和结构形成一种软扶梯状，或说螺旋梯状。这条长链是由四种成份也是一种排列组合，我们姑切用英文字母代替这四种成分，即A、T(或U)、C、G。奇怪的是每三个字母为一组，就成为一种“天书”(一种自然规律)的遗传密码，起名为密码子。每三个密码子就决定一种氨基酸，那么64种密码子每三个一组，这样就可以搭配出20种氨基酸，不同数量不同排列的氨基酸就可以排列成一种蛋白质这种生命的化...