丙型肝炎病毒基因分型研究

为了解青岛地区丙型肝炎病毒基因型分布以及ＨＣＶ－５；ＮＣ和ＨＣＶ－ＮＳ５ｂ两区域分型结果间的差异。本文对采１４７例各型佩肝患者和７例有偿供血者的１５４份ＨＣＶ－ＲＮＡ阳性血清，同时进行了ＨＣＶ－５’ＮＣ和ＨＣＶ－ＮＳ５ｂ两个区域酶切分型研究。     

丙型肝炎病毒基因分型研究及其意义

1989年choo获得首株丙型肝炎病毒(HCV)的基因克隆,并完成了核酸序列测定。至目前已报道了许多HCV全序列及部分序列,对这些毒株序列进行比较研究,发现HCV基因组存在很大变异,即株间变异大,因而认为HCV存在不同基因型,并进行了广泛研究。HCV分型标准初步定为:同型之间的核酸序列的同源性应大干80％,并且具有一些型特异性的核酸序列,型与型之间的变异应大于20％。分型研究显示不同基因型与HCV感染的地区分布、临床表现、预后以及对干扰素治疗的反应可能具有相关性。因此,对HCV进行基因分型,具有一定实用价值。现将近几年分型研究综述如下。     

九江地区丙型肝炎病毒基因分型

丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)是引起输血后非甲非乙型肝炎的主要病原分子.HCV是小的有包膜的单股正链RNA病毒,属黄病毒科丙型肝炎病毒属,颗粒大致呈球形,直径约50nm,基因全长约9400个核苷酸.     

102例丙型肝炎病毒基因分型结果分析

目的分析了解萍乡地区慢性丙型肝炎患者的丙型肝炎病毒(HCV)基因分型情况,为HCV诊断和治疗提供有力的依据。方法利用门诊及住院患者血清HCV抗体阳性标本,经荧光定量PCR检测HCVRNA阳性的102例标本用基因芯片进行不同基因分型检测。结果检测HCV感染标本102例,共检出7种基因亚型,分别为1b、6型、2a、1b+2a、1b+3a、3a和3b,其中1b占72.6%,6型占8.8%,2a占7.8%,1b+2a占5.9%,1b+3a占2.9%,3a占1.0%,3b占1.0%。结论萍乡地区HCV基因型主要为1b与中国南方地区HCV基因型分布比较一致。按照年龄分组20岁以下4例,占3.9%,20～30岁33例,占32.4%,30～40岁39例,占38.2%,40～50岁11例,占10.8%,50～60岁4例,占3.9%,60岁以上11例,占10.8%。青壮年和有吸毒史、外伤手术史、输注血液制品史的人群阳性率较高。     

南京地区丙型肝炎病毒基因分型的研究

目的 了解南京地区丙型肝炎病毒(HCV) 基因型分布的特点.方法 采用针对HCV三种主要基因型1,2,3和1b亚型设计的型-特异性引物,通过RT-PCR和套式PCR扩增HCV基因组高度保守的5'端非编码区,检测55例HCV IgG阳性血清的HCV RNA,并对其中40例进行基因分型.结果 PCR检测的抗HCV IgG阳性血清标本55例中,50例为HCV RNA阳性,阳性率为90.91%;对40例HCV RNA阳性的血清进行分型,发现23例为1b型,15例为2,1 b混合型,HCV-1b亚型含有率为95%,其余两例分别为2型和1,2混合型.结论 该地区HCV流行优势株为1b亚型.     

经宫内传播的丙型肝炎病毒基因分型

目的：探讨经宫内传播的丙型肝炎病毒(hepatitis C virus，HCV)在母亲与子代间的基因型别一致性，进一步确定HCV母婴传播的分子学基础。方法：选择6对母亲与胎儿抗-HCV与HCV RNA(ribonucileic acid)均阳性者为研究对象，以PCR技术检测母亲与胎儿HCV RNA的基因型别。结果：6对母亲与胎儿的HCVRNA基因型均一致，其中5对基因型别属Ⅱ型，1对属Ⅲ型。结论：母亲与胎儿所携的HCV基因型别一致。     

血液透析患者丙型肝炎病毒型特异性PCR基因分型

目的 建立一种丙型肝炎病毒型特异性PCR基因分型方法。方法 对47份血液透析患者HCV RNA阳性的标本,用5’非编码区(5'-NCR)1、2、3、1b型特异性引物,进行逆转录巢式PCR扩增分型。结果 47份HCV RNA样本43例可以分型;优势株为1b亚型,1b及1b相关型占总样本数的87．23％(41／47);7例为混合感染,占可分型数的16．27％(7／43)。结论 本组血液透析患者感染的HCV基因型的分布可能与地区流行及医源性传播有关,其同源性有待核苷酸序列分析加以印证。     

不同丙型肝炎病毒基因分型检测方法学的比较

目的 通过丙型肝炎基因分型检测方法学的比较,为实验室选择提供依据。方法 选取宁夏回族自治区人民医院2019年1月至2021年12月丙型肝炎确诊患者血清样本148份,使用PCR-荧光探针法、PCR-反向点杂交法及Sanger测序法进行丙型肝炎病毒基因分型检测,并采用卡方检验、Kappa检验对这三种检测方法进行比较分析。结果 PCR-荧光探针法检出136例,检出率91.89%,共检出4种基因型,分别为1b、2+、3+和6+。PCR-反向点杂交法检出135例,检出率为91.22%,共检出5种基因型,分别为1b、2a、3a、3b和6a。Sanger测序法检出148例,检出率100%,共检出7种基因型,分别为1b、2a、3a、3b、6a、1g和6xa。PCR-荧光探针法未检出的12例样本中,Sanger测序法均已检出,其中包括1例6xa型,1例1g型。两种方法的检出率比较差异无统计学意义(χ²=7.565,P>0.05)。两种方法比较一致性较高(k=0.871,P<0.001)。PCR-反向点杂交法未能测出的13例样本,Sanger测序法均已检出,其中包括1例1...     

云南德宏地区丙型肝炎病毒基因分型特点分析

目的 探讨云南德宏地区丙型肝炎(丙肝)患者的丙肝病毒(HCV)基因分型情况,旨在为丙肝患者的诊断和治疗提供方向.方法 收集2018年12月—2020年9月于云南省德宏州人民医院感染性疾病科就诊的133例丙肝患者,通过Sanger测序法进行HCV基因分型的测定并进行分析.结果 133份来自云南德宏地区HCV-RNA阳性的...     

丙型肝炎病毒基因分型检测策略

自1989年以来[1],丙型肝炎病毒感染已成为全世界最关注的问题.据WHO报道,全世界有1.7亿感染者,其流行率约3%[2].HCV感染后病情隐匿,50%～80%会转变成慢性肝炎,如未经任何合理的治疗,在10～20年后,有10%～30%会发展成为肝硬化,1%～5%甚至会发展成原发性肝癌[3],严重危害患者的健康和生命. 丙型肝炎病毒(HCV)是一类球形、单股正链RNA病毒,其基因组序列具有高度变异性.根据不同区域的基因序列变异情况,HCV分为6个基因型,80多种基因亚型,最近在加拿大还报道出7a这个新的亚型[4].由此可以看出,随着时间推移和分子生物学技术的不断发展,越来越多新的基因亚型将被人类所发现.而本文将根据近几年来对HCV基因分型的检测经验,分别从以下几个方面来探讨HCV基因分型的检出策略.     

丙型肝炎患者基因分型与干扰素治疗疗效分析

目的讨本地区丙型肝炎病毒基因型与干扰素疗效的关系。方法156例慢性丙型肝炎（CHC）患者,HCVRNA采用荧光定量PCR试剂盒,RFLP分析进行HCV基因分型,57例慢性丙型肝炎患者采用IFN—alb治疗,疗程24周。全自动生化分析仪检测血清ALT。结果156例抗HCV阳性患者HCVRNA检出率82．05％（128／156）,HCVⅠ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型、Ⅱ＋Ⅲ型分别为0、21．15％、55．13％、0,5．78％。干扰素治疗病例中,HCVⅡ型、Ⅲ型、Ⅱ＋Ⅲ型感染的应答率分别为28．95％、53．33％、25．00％,有显著性差异（P〈0．05）。HCV基因型与血清ALT水平无相关性。结论鲁北地区HCV感染以Ⅱ、Ⅲ型感染为主,干扰素对HCVⅢ型感染的疗效优于HCVⅡ型,ALT与HCVRNA水平可作为干扰素疗效的参考指标,HCV基因分型有预测干扰素疗效的意义。     

甘肃东乡族丙型肝炎患者的HCV基因分型研究

目的了解甘肃地区东乡族丙型肝炎患者的HCV基因分型特征。方法对HCV患者样本用实时荧光定量PCR进行病毒载量的确定。对病毒载量大于10^3的样本用多重PCR进行HCV的基因分型。结果通过对甘肃地区东乡族丙型肝炎患者的样本进行基因分型,发现该民族丙型肝炎病毒感染主要为1b型（55．1％）为主,2a（20．6％）次之,再次为1c型（13．7％）和2c型（3．4％）,但未检测到3a型。结论东乡族基因分型有其显著特征,C型基因型以1c为主,国内其他地区少有报道,为临床针对不同基因型HCV感染者的治疗提供了依据。     

甘肃地区不同民族丙型肝炎患者的HCV基因分型研究

[目的]了解甘肃地区汉族和东乡族丙型肝炎患者的HCV基因分型情况。[方法]对HCV感染的患者样本用实时荧光定量PCR进行病毒载量的确定。对病毒载量大于10。样本用多重PCR进行HCV的基因分型。[结果]通过对甘肃地区汉族、东乡族丙型肝炎感染者的样本进行基因分型,发现两个民族丙型肝炎病毒感染主要为1b型为主,其次是2a型和3a型,但1c型、2c型的感染有显著性差异,汉族以2c型为主,东乡族以1c型为主。[结论]甘肃地区汉族和东乡族丙型肝炎病毒的感染,主要以1b型为主,其次是2a型,和3a型,此外还发现了别的地区少有的1c型和2c型。这两个型不同民族有显著性差异,汉族以2c型为主,东乡族以1C型为主。初步说明甘肃地区丙型肝炎流行的基因型程多样性。     

基于丙型肝炎病毒NS5B基因序列分析的基因分型

目的：建立基于丙型肝炎病毒(HCV)NS5B基因序列分析的基因分型方法，对上海地区慢性丙型肝炎进行基因分型。方法：用HCVRNA实时荧光定量检测试剂盒对慢性丙型肝炎患血清标本的HCV RNA水平进行定量分析。用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和套式-PCR扩增HCV RNA阳性的41份标本的部分HCV NSSB区基因，PCR产物经回收、纯化后直接进行测序分析。从GenBank中下载25份不同基因型的HCV原型序列，用NSSB区222bp的基因片段构建系统进化树，对临床标本相应的HCVNS5B区序列进行分析。结果：基于HCVNS5B基因序列的系统进化树分析，可成功地对本组41份标本进行基因分型。分型结果显示，1b型占85．4％(35／41)，2a型占12．20％(5／41)，3a型占2．44％(1／41)。结论：基于HCVNSSB区基因序列的系统进化树分析是一种可靠和方便的HCV基因分型方法。上海地区的HCV基因型以1b型为主。     

基因芯片法和线性探针法在HCV基因分型的应用比较

目的　评价基因芯片技术在丙型肝炎病毒 (HCV)基因分型中的临床应用价值。方法　对HCVRNA阳性血清用基因芯片法和线性探针法进行基因分型。结果　基因芯片法和线性探针法的符合率是 10 0 %。结论　基因芯片法的准确率与国外第二代线性探针法试剂盒相同 ,而操作简单 ,特别是能准确地检出HCV混合感染 ,具有良好的应用前景。     

福建省慢性丙型肝炎患者丙型肝炎病毒基因分型的分析

目的观察福建省慢性丙型肝炎患者基因型分布特点以及与患者性别、年龄、丙型肝炎病毒（HCV） RNA 之间的关系。方法应用反转录聚合酶链反应（RT-PCR）和 SANGER 测序法对155例慢性丙型肝炎患者的HCV 进行基因分型。结果在155例标本中,HCV 基因1型占55．48％,基因2型占18．71％,基因3型13．51％,基因6型12．26％,未见基因4、5型;男女慢性 HCV 感染均以1型为主要基因型,在其他基因型中,男性3型、6型多于2型,女性则以2型为主,差异有统计学意义（P ＜0．05）;基因2型平均年龄为（49岁）,3型平均年龄为（35岁）,差异有统计学意义（P＜0．05）。结论福建地区 HCV 基因型以1b 型为主,其次是2a 型,未见基因4、5型;基因2型的感染者平均年龄较基因3型大。     

Hepatitis C virus genotypes and clinical features in hepatitis C virus-related mixed cryoglobulinemia

Mixed cryoglobulinemia is a systemic disease, almost always associated with hepatitis C virus infection and characterized by purpura and cutaneous vasculitis, asthenia, arthralgias, and often renal and neurological involvement. No significant differences have been described to date in mixed cryoglobulinemia patients with type 1, 2, or 3 hepatitis C virus infection with respect to symptoms, while a higher prevalence of genotype 2a has been reported in patients without clinical and biochemical signs of liver disease or with serum autoantibodies. We examined 33 hepatitis C virus-positive patients with mixed cryoglobulinemia to assess if any clinical or serological feature is related to infection with different genotypes. All subjects underwent viral genotype determination by means of a single-step polymerase chain reaction. Thirteen patients (39%) were infected with hepatitis C virus type 1b, 17 (52%) with type 2a or 2a/c, and 3 (9%) with type 3. There was a significant difference in the frequency of peripheral nervous system involvement: paresthesias or other symptoms of peripheral neuropathy were less frequent in patients with 2a or 2a/c infection (29%) than in patients with type 1b or type 3 infection (88%,P=0.003). Only patients with hepatitis C virus type 2 had urticaria or cutaneous ulcers. These patients also had a lower frequency of arthralgias, lower cryocrit values (P=0.02), and lower serum levels of alanine-aminotransferase and γ-glutamyl-transpeptidase (P<0.04) than patients with type 1 and type 3 infection. The prevalence of antinuclear antibody positivity was similar in the three groups.     

乙型肝炎病毒YMDD变异与基因分型及临床关系的研究

目的了解青岛市乙型肝炎患者乙型肝炎病毒（HBV）基因变异特征,探讨HBV YMDD变异与基因分型、DNA载量及临床分型的关系。方法应用实时荧光聚合酶链反应（PCR）技术对820例乙肝患者血清进行基因变异检测,HBV DNA定量监测及基因分型检测。结果 820例HBV感染者中检出YMDD变异154例,变异率18.78%;各基因型间YMDD变异的差异有统计学意义,P〈0.05;患者HBeAg阳性与否与YMDD变异差异有统计学意义（P〈0.05）,HBeAg阳性者更易发生变异;HBV感染者临床分型各组间YMDD变异的差异有统计学意义（P〈0.05）,其中以LC（36/113）、CHB（97/368）为主;病毒变异在性别、年龄及DNA载量各组间的差异均无统计学意义（P〉0.05）。结论 HBV YMDD变异的监测对乙肝患者的治疗、病情预测和转归都有重要临床意义。     

Utility of a commercial quantitative hepatitis C virus core antigen assay in a diagnostic laboratory setting

In this study, the utility and impact of hepatitis C virus (HCV) core antigen (Cag) detection via a commercial assay have been evaluated in diagnostic laboratory conditions. In a total of 272 samples from 226 individuals, HCV RNA was detected in 81.3% and anti-HCV antibody prevalence was 86.4%. HCV Cag reactivity was identified in 59.9% of the samples and in 75.8% with detectable RNA. The sensitivity and specificity of HCV Cag assay have been calculated as 75.8% and 95.1%, respectively, and agreement between HCV RNA and HCV Cag was moderate (κ = 0.554). HCV Cag and RNA levels were highly correlated (r = 0.915 and 0.937). A viral load threshold of 10³ IU/mL has been recognized, above which the correlation with RNA became statistically significant and sensitivity increased to 90.9%. Detection and quantification of HCV core antigen have been observed as a strong alternative to nucleic acid testing for HCV monitorization.     

丙型肝炎患者外周血NKT细胞含量变化特征的研究

目的探讨丙型肝炎病毒感染者外周血NKT细胞含量变化的特征。方法应用FITC标记的TcR Vα24单克隆抗体和PE标记的TcR Vβ11单克隆抗体对丙型肝炎病毒感染者外周血进行标记,流式细胞仪检测TcR Vα24/TcRVβ11双阳性NKT细胞的含量。结果抗-HCV＋、HCV RNA＋组NKT细胞明显低于抗-HCV＋、HCV RNA-组和对照组（P〈0.01）;抗-HCV＋、HCV RNA-与正常对照组的NKT细胞无显著性差异（P〉0.05）。结论NKT细胞数量减少不利于丙型肝炎病毒的清除。