71例新型冠状病毒肺炎不同病程生物学样本核酸检测分析

目的 对新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019, COVID-19）患者在不同病程阶段不同生物学样本新型冠状病毒（SARS-CoV-2）进行核酸检测,并分析其临床意义。 方法 采用横断面观察性研究设计,收集烟台市奇山医院1月24日—2月28日COVID-19确诊患者病例的相关临床资料,应用实时荧光逆转录聚合酶链反应检测技术,在疾病不同阶段采集鼻/咽拭子、痰液样本进行SARS-CoV-2核酸检测。对危（重）型及普通型患者的核酸阴转时间进行统计学分析。 结果 共纳入71例确诊患者,男性40例,女性31例。患者首发症状80.3%为发热,57.8%为咳嗽。普通型病例57例（占80.3%）,轻型病例5例（占7.0%）,重型病例8例（占11.3%）,危重型病例1例（占1.4%）。治愈出院40例,平均住院（22.78±6.19）d;鼻咽拭子和痰液样本在发病的1、2、3、4和5周的核酸检出率分别为100.0%和87.5%、48.6%和88.2%、44.7%和86.1%、19.1%和58.7%、11.5%和33.3%。鼻咽拭子的假阴性率在发病的1、2、3、4和5周分别为12.5%、52.9%、、44.1%、42.9%、20.0%。同期两种样本送检结果一致率在发病第1周及第5周较高;发病1周无病毒学核酸检测阴转的病例,发病2周有2例（占3.9%）,3周有12例（占23.5%）,4周有20例（占39.2%）,5周有16例（占31.4%）,5周后有1例（占2.0%）。第4~5周病毒核酸转阴率最高（占70.6%）;危（重）型和普通型病人的核酸阴转时间分别为（30.00±3.54）d和（24.00±5.84）d ,差异有统计学意义（P<0.05）。 结论 COVID-19的主要症状为发热,干咳。普通型病例为主。痰液样本核酸检测的阳性率高于鼻咽拭子样本,鼻咽拭子检测结果存在假阴性,两种样本联合送检可减少假阴性的发生。在发病的第4周及第5周病毒核酸转阴率最高。重症患者病毒的持续存在,可能是病情加重的主要因素之一。     

孕产妇感染新型冠状病毒Omicron变异株的研究现状

COVID-19的新变种B.1.1.529于2021年11月24日首次由南非正式报告给世界卫生组织（WHO）。目前高度传染性的Omicron已成为世界上最流行的COVID-19变异株。尽管初步数据表明,妊娠期间感染Omicron变异株发生母胎严重并发症的风险低于以前的变异株及Delta变异株,但由于病毒传播速度快,受害人群广,其临床危害仍值得产科医生的关注。本文从Omicron变异株感染流行现状、孕妇感染Omicron的临床特点、预防和治疗以及新生儿母乳喂养等几个方面展开综述,认为Omicron感染不会增加早期自然流产率及婴儿先天性畸形发生率,但有可能增加孕晚期妊娠期高血压疾病、早产、剖宫产及产后出血等风险,同时也提出了相应的管理策略建议,希望对我国新型冠状病毒孕产妇感染的诊疗策略提供参考。     

昆明地区COVID-19患者多种生物样本的病毒核酸检测结果

目的 通过国产2019-nCoV(新型冠状病毒)核酸测定试剂,测定确诊的COVID-19(新型冠状病毒肺炎)患者的多种生物样本内SARS-CoV-2核酸的携病毒情况,对机体不同系统中SARS-CoV-2的状态展开观察,并分析其临床价值,为诊断和治疗提供参考.方法 收集昆明市第三人民医院53例确诊的新型冠状病毒肺(COV...     

新型冠状病毒Omicron变异株的流行病学特征及防控研究

Omicron（B.1.1.529）变异株于2021年11月24日首次从南非报告给世界卫生组织,截至2021年12月8日全球共有57个国家和地区报告了Omicron感染病例。目前Omicron变异株在部分非洲国家已成为主导毒株,且传播速度快。尽管Omicron变异株引起的疾病症状较轻,多数病例为无症状感染者和轻型患者,但病例数量的快速增长可能给全球卫生系统带来沉重压力。此外,Omicron变异株的变异来源、传播特征、疫苗抗性等尚不明确,给各国和地区的疫情防控带来很大挑战。本文就Omicron变异株的病原学特征、变异来源、传播特征及可能的机制、流行现状、疫苗对其保护效果、防控措施等方面的研究进展进行综述,以期为科学防控Omicron变异株所致疫情提供参考。     

不同新型冠状病毒变异株感染的COVID-19潜伏期研究

从新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情初始至今,COVID-19的病原体新型冠状病毒（SARS-CoV-2）不断进化和变异,产生传播力和毒力变化的变异株,如Alpha（B.1.1.7）、Beta（B.1.351）、Gamma（P.1）、Delta（B.1.617.2）以及Omicron（B.1.1.529）变异株。深入研究不同变异株感染所致的COVID-19潜伏期有助于追溯传染源,确定密切接触者的留验、检疫和医学观察期限,为及时调整COVID-19疫情防控措施提供依据。本文主要综述了国内外感染SARS-CoV-2野生株和不同变异株的COVID-19潜伏期的相关研究,研究发现,感染SARS-CoV-2野生株的潜伏期在4~8 d,中位潜伏期约为5.5 d。感染Beta、Gamma变异株的潜伏期与野生株基本类似,约为5 d。感染Alpha、Delta和Omicron变异株的潜伏期则低于其他毒株,分别为4 d、4 d和3 d。     

2019新型冠状病毒核酸检测试剂优化、验证及分析

目的 优化敏感性及特异性更高的新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒,提高阳性检出率。并与市售试剂盒进行对比,对临床使用提出指导。 方法 收集2020年1月至3月在山东大学附属济南市中心医院等6家2019-nCoV核酸检测单位的确诊患者88例及阴性患者572例,共计660例。通过对2019-nCoV的全基因组进行序列分析,设计更加灵敏的引物、探针,优化buffer配比及扩增过程。采用交叉实验及内源性物质干扰实验评价其特异性。另外选择3家市售核酸检测试剂盒,对梯度稀释的阳性核酸样本进行对比验证实验。 结果 优化后的开放读码框1a/b(ORF1ab)、核衣壳蛋白(N)对于2019-nCoV的RNA靶点,比市售试剂盒具有更高的灵敏度。当核酸样本中1个病毒浓度为1个拷贝时即可检出,同时扩增曲线更加优越。相比较与世界卫生组织(WHO)或自行设计引物的试剂盒,ORF1ab的灵敏度提高了2倍(1∶10 vs 1∶5);而N基因的灵敏度比中国疾病预防控制中心(CDC)和自行设计引物的试剂盒提高了8倍(1∶80 vs 1∶10),比WHO试剂盒提高了2倍(1∶80 vs 1∶40)。临床验证实验显示,鼻咽拭子检测准确度均为100%,与其他感染部位相同或感染症状相似的其他病原体无交叉反应,试剂盒的分析特异性为100%,阳性符合率和阴性符合率均为100%。 结论 优化后的2019-nCoV核酸检测试剂盒具有更高的检测灵敏度和特异性,有助于解决核酸检测假阴性,提高阳性率,将对低病毒载量患者及出院患者的判定具有重要的意义。     

珠海市新型冠状病毒奥密克戎变异株在成人和儿童感染者中的临床特征

目的 探索珠海市新型冠状病毒奥密克戎变异株BA.5.1进化分支(BA.5.1亚型)、BA.1进化分支(BA.1亚型)和BA.2进化分支(BA.2亚型)在成人和儿童感染者的临床特征。方法 纳入2022年7月12-20日在中山大学附属第五医院凤凰山病区收治的新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者,比较成人和儿童感染者的临床特征,并进一步分析病毒载量变化情况。非正态分布计量资料采用Mann-Whitney U检验或Kruskal-Wallis H检验,计数资料采用χ²检验或Fisher确切概率法,组间率的比较采用Bonferroni校正。结果 共231例新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者纳入研究,成人138例,儿童93例。在成人感染者中,与新型冠状病毒奥密克戎BA.1亚型和BA.2亚型感染者相比,奥密克戎BA.5.1亚型感染者有呼吸道症状比例更低,差异均有统计学意义(χ²=7.217、14.547,P均<0.05),奥密克戎BA.5.1亚型无症状感染者比奥密克戎BA.2亚型少,差异有统计学意义(χ²=7.504,P<0.0...     

造血干细胞移植术后儿童感染新型冠状病毒Omicron的临床特征分析

目的 ：探讨接受造血干细胞移植术后儿童与无基础疾病正常儿童感染新型冠状病毒Omicron（以下简称Omicron）后临床特征差异性。方法 ：回顾性分析2022年12月―2023年1月感染Omicron儿童的临床资料,将接受造血干细胞移植儿童81例纳入移植组,无基础疾病正常儿童507例纳入正常组,比较两组患儿临床特征上的差异。结果 ：移植组与正常组年龄性别均无统计学差异。两组感染Omicron后主要症状均表现为发热,移植组64例（79.0%）正常组389例（76.7%）;其次为咳嗽,移植组57例（70.4%）正常组306例（60.4%）,两组发热和咳嗽症状比较均无统计学意义。同时移植组出现高热（34.6%vs 36.7%）、呼吸困难（4.9%vs 2.8%）、鼻塞（43.2%vs 46.5%）、咽痛（35.8%vs 28.4%）与正常组差异均无统计学意义。但移植组出现胃肠道不适（50.6%vs 27.2%）、败血症（3.7%vs0.2%）、须使用呼吸支持治疗（3.7%vs 0%）、总病程超过2周（43.2%vs 10.1%）均明显高于正常组。结论 ：移植组和正常组患儿感染Omicron后...     

上海市松江区方舱医院678例新型冠状病毒Omicron BA.2变异株感染病例的临床特征

目的 分析感染新型冠状病毒(SARS-CoV-2) Omicron BA.2变异株病例的临床特征,为Omicron BA.2感染的防治提供参考依据。方法 回顾性分析2022年4月3日至4月18日上海市松江区方舱医院收治的678例新型冠状病毒感染确诊患者的临床特征,同时根据临床分型分为无症状组369例和轻型组309例,比较两组患者的临床特征、疫苗接种及转阴时间。结果 患者平均年龄为(36.11±13.20)岁,呈低龄化趋势,主要集中在15～44岁组(73.9%),其次为45～59岁组(18.7%),≥60岁组(4.7%)及0～14岁组(2.7%)占比较少;患有慢性基础疾病者19例(2.8%),主要为高血压及糖尿病;总体疫苗接种率为94.5%,15～44岁组(97.6%)及45～59岁组(95.3%)接种率最高,≥60岁组(81.2%)次之,接种率最低为0～14岁组(27.8%);轻症组患者平均核酸转阴时间为(11.44±2.36) d,明显长于无症状组的(10.80±2.22) d,差异具有统计学意义(P<0.05);两组患者在性别、年龄、疫苗接种针数及完成疫苗接种至确诊感染的间隔...     

核酸阳性新型冠状病毒感染120例临床特征分析

目的了解新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的临床、实验室及影像学特性。方法收集120例确诊为新型冠状病毒感染的病例,并对一般情况、主要临床表现、转归、实验室结果、影像学等进行统计学分析。结果 COVID-19多在中老年发病,性别差距不大,其治疗时间在(14±5)d,病死率7.5%,治愈率33.3%,但重症患者男性较多,且死亡患者年龄较大(中位数为61.5岁)。主要临床症状为发热(75%)、咳嗽(52.5%)、胸闷喘气(14%)、咳痰(7.5%)、乏力(7.5%)等。其实验室结果以白细胞不升、淋巴细胞绝对值降低、嗜酸性粒细胞消失、单核细胞增高及超敏C反应蛋白升高为主,影像学以双肺多发或单发磨玻璃影为主。结论 COVID-19是一种传染性极强的疾病,但其治愈率较高,病死率较低,且为可防、可治的一种疾病。     

污染环境样本新型冠状病毒核酸检测结果分析

新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2）主要经呼吸道飞沫和密切接触传播,在相对封闭的环境中经气溶胶传播;接触被病毒污染的物品后也可造成感染。因此,落实“人、物、环境同防”已成为当前疫情防控的重点。SARS-CoV-2核酸检测是目前实验室诊断的主要方法,环境样本核酸检测成为疫情防控中不可或缺的手段之一。污染环境中不同物品表面SARS-CoV-2核酸检测结果存在差异。另外,研究发现环境“假污染”也不少见,给疫情防控带来诸多困扰。笔者根据疫情防控工作经验,结合文献资料分析,对核酸检测方法、污染环境样本阳性率、阳性位点分布、处置措施等方面进行了探讨。     

两种不同释放剂核酸提取法的新型冠状病毒RT-PCR内标检测结果比较

目的 对新型冠状病毒核酸释放剂一步提取法进行优化,提高内标在荧光定量逆转录PCR中的检出效率,降低因内标未检出带来的复查率,提高核酸检测报告时效性.方法 对深圳市宝安中医院PCR实验室的新型冠状病毒核酸检测标本,采用本实验室优化方法用释放剂一步法提取核酸,与试剂盒说明书原方法进行比较,观察两种方法提取核酸后内标扩增曲线...     

非重症新型冠状病毒Delta变异株病毒转阴因素分析

目的 分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2) Delta变异株感染者病毒转阴时间,探索非重症患者病毒转阴特征及早期转阴的预测因子。方法 选取广州市本地88例非重症COVID-19 Delta变异株感染者,采用RT-PCR检测上呼吸道病毒核酸,根据病毒首次转阴时间将患者分为早期转阴组(<15 d)和晚期转阴组(≥15 d),收集患者血常规、C反应蛋白(CRP)、血清淀粉样蛋白A(SAA),比较两组患者炎症指标及免疫细胞的差异性,采用受试者工作特征(ROC)曲线探讨早期病毒转阴的预测因素。结果 SARS-CoV-2Delta变异株病毒首次转阴时间中位数为19(15,22) d,留观期核酸阳性40例(45.5%),病毒最终转阴时间中位数为28(19,45) d。与晚期转阴组基线横向比较,早期转阴组基线淋巴细胞(LYM)更高(P <0.05),SAA和CRP有更低趋势,但差异无统计学意义(P> 0.05);与晚期转阴组第1周比较,早期转阴组第1周LYM和嗜酸性粒细胞(EOS)更高,而SAA和CRP更低(P <0.05)。纵向比较:两组患者基线LYM和EOS均最低(P ...