基于网络药理学和分子对接技术探究丹参治疗重症急性胰腺炎的机制

目的 基于网络药理学和分子对接方法探究丹参对治疗重症急性胰腺炎(severe acute pancreatitis, SAP)的作用机制。方法 通过检索中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)筛选出丹参的有效成分及靶点蛋白,应用Uniprot数据库将获取的靶点蛋白转换为靶基因。在OMIM、Gene Cards数据库中收集重症急性胰腺炎相关靶基因,利用Venny2.1.0分析得到药物及疾病的交集靶基因;将交集靶基因导入至STRING11.5数据库进行分析,并利用Cytoscape3.9.1软件构建蛋白相互作用网络(protein protein interaction, PPI),Network Analyzer分析丹参作用于重症急性胰腺炎的关键靶基因;通过Metascape进行富集分析,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物成分-靶基因-通路图;借助AutoDock Tools 1.5.6、Pymol软件对药物活性成分与关键...     

基于网络药理学和分子对接的红芪活性成分抗阿霉素心肌毒性的分子机制研究

目的 基于网络药理学和分子对接研究红芪活性成分抗阿霉素心肌毒性的作用机制.方法 通过系统药理学平台(traditional chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)、瑞士靶点预测数据库(swiss target prediction)检索红芪化学成分及对应靶点.以毒性基因...     

基于网络药理学和分子对接探讨鼻炎数据挖掘核心方苍耳子散作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探究苍耳子散（CRZS）治疗异质性鼻炎的作用机制以及“多成分-多靶点-多通路”的整体药理作用特征。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索CRZS的活性成分及靶点;从GeneCards、DisGeNET、Phenopedia、TTD和PharmGKB数据库获取相关鼻炎的基因。通过STRING数据库与Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用STRING数据库对核心基因进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。通过Cytoscape软件构建“中药成分-靶点-信号通路”网络并筛选核心靶点;采用AutoDock软件对筛选得到的关键通路靶点进行分子对接。结果 CRZS有131个核心基因,鼻炎相关靶点756个,交集靶点41个。GO生物富集条目2005条,KEGG通路富集条目151条,HIF-1、Lipid and atherosclerosis、Fluid shear stress and atherosclerosis等通路最具连接可能。分子对接显示,CEZS靶点的有效成分与3...     

基于网络药理学和分子对接探讨“海藻-昆布”治疗甲状腺结节的作用机制

目的： 运用网络药理学探讨"海藻-昆布"治疗甲状腺结节作用机制。方法： 利用中药系统药理学数据库和分析平台（Traditional Chinese Medicine System Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）筛选海藻、昆布的活性成分和相关靶点,通过UniProt数据库进行靶点标准化;运用Cytoscape软件构建活性成分-靶点网络;通过Genecards数据库检索甲状腺结节相关基因;利用String数据库构建蛋白互作网络图;通过R语言和Bioconductor数据库对潜在靶点进行基因本体（Gene Ontology,GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路富集分析;最后通过分子对接技术将核心活性成分与核心靶点进行对接。结果： 筛选后得到海藻、昆布共11个活性成分,194个相关靶点,核心靶点有AKT1、IL-6、VEGFA、CASP3等;GO分析得到129个相关过程,KEGG分析得到155条信号通路,分子对接结果显示核心成分与核心靶点具有较好的结合能。结论： "海藻-昆布"治疗甲状腺结节是多成分、多靶点、多通路相互作用的结果,为"海藻-昆布"的临床应用以及甲状腺相关疾病临床研究提供一定的理论依据。     

基于网络药理学及分子对接探究吴氏侗药烧伤油治疗烧烫伤的作用机制

摘要：目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨吴氏侗药烧伤油治疗烧烫伤的潜在作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库中检索吴氏侗药烧烫伤油的相关活性成分和作用靶点,使用人类孟德尔遗传病数据库（MOIM）、人类基因综合分析数据库（GeneCards）数据库查找与烧烫伤相关的靶点,利用String、DAVID、Metascape数据库和Cytoscape3.9.0软件对治疗烧烫伤的共同靶点构建蛋白-蛋白相互作用网络（PPI）,并对潜在靶点进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析,最后采用SYBYL-X2.0进行分子对接验证。结果:筛选出吴氏侗药烧烫伤油治疗烧烫伤共涉及141个有效成分和160个共同靶点;GO功能富集提示治疗烧烫伤的生物学过程主要与药物反应、凋亡过程的负调控、凋亡过程、对脂多糖的反应、老化、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、积极调控一氧化氮生物合成过程等有关;KEGG通路分析主要涉及癌症通路、乙型肝炎、糖尿病并发症中的晚期糖基化产物（AG）E-晚期糖基化终末产物受体（RAGE）信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、癌症中的蛋白多糖等通路信息;分子对接验证结果显示吴氏侗药烧伤油能与“成分-疾病-靶点网络”中自由度排名前3个靶点丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、TNF、白细胞介素6（IL-6）具有较好的亲和性。结论:通过网络药理学证实了吴氏侗药烧烫伤油多途径、多成分、多靶点、整体调节的作用特点,预测了吴氏侗药烧烫伤油治疗烧烫伤可能具有的作用机制,为其之后进行药物活性成分研究验证奠定理论基础。     

基于网络药理学附子归芍颗粒防治慢性疲劳综合征的作用机制

目的 基于网络药理学方法和分子对接技术,探讨附子归芍颗粒防治慢性疲劳综合征(CFS)的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选附子归芍颗粒的有效成分及作用靶点;利用人类基因数据库、在线《人类孟德尔遗传》数据库筛选慢性疲劳综合征的相关基因,运用cytoscape构建附子归芍颗粒活性成分-靶点图,通过STRING数据库对关键靶点构建网络互作(PPI)网络,DAVID数据库进行基因本体(GO)基因、京都基因和基因百科全书(KEGG)通路富集分析,最后利用AutoDock Vina软件和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接。结果 通过数据库的查找和筛选,最终获得136个主要活性成分和214个作用靶点;交集靶点100个,其中核心靶点10个;通路富集结果共119个。结论 初步探讨了附子归芍颗粒防治慢性疲劳综合征的主要活性成分、相关靶点及相关通路,发现附子归芍颗粒能通过多成分、多靶点、多通路发挥防治作用,为其防治CFS临床使用提供了一定的参考依据。     

基于生物信息学和分子对接分析栀子柏皮汤治疗炎症性肠病的作用机制

目的 基于生物信息学和分子对接,探讨栀子柏皮汤治疗炎症性肠病(Inflammatory bowel disease, IBD)的主要活性成分及作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform, TCMSP)和本草组鉴(HERB)数据库筛选“栀子”“甘草”“黄柏”三味药材的有效成分和作用靶点,构建“中药-成分-靶点”网络图。通过基因表达数据库(GEO)和DisGeNET数据库筛选炎症性肠病的相关基因,并用R软件进行数据分析和可视化。通过String平台构建药物和疾病交集靶点的蛋白互作网络(PPI),并利用Cytoscape的MCODE插件筛选核心靶点。使用DAVID平台对核心靶点进行GO和KEGG富集分析。使用AutoDock将核心靶点与活性成分进行分子对接。结果 栀子柏皮汤与炎症性肠病共同作用的目标靶点有13个,GO富集分析得到相关条目49个,KEGG通路富集得到35条信号通路。结论 初步探究了栀子柏皮汤治疗炎症性肠病的潜在靶点和相关通路,栀子柏皮汤中的槲皮素、小檗碱等活性...     

基于网络药理学和分子对接探讨菟丝子治疗胰岛素抵抗的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨菟丝子治疗胰岛素抵抗(IR)的分子机制。方法 运用中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库,筛选菟丝子的化合物和有效靶点;使用GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库预测IR的相关靶点,并利用Uniprot数据库转换成相应的基因名称;选取Cytoscape软件构建菟丝子—活性成分—靶点网络关系图、String数据库构建靶点蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络;利用David数据库进行GO生物学功能富集分析和KEGG通路富集分析,并绘制柱状图和气泡图;使用Autodocktools软件对活性成分与核心靶点进行分子对接分析。结果 获得菟丝子的关键化合物10个、药物靶点207个、疾病靶点1 279个、交集靶点122个,得到JUN、AKT1、TP53、RELA、MAPK1和TNF 6个PPI网络核心分子,网络药理学结果提示菟丝子可能通过TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路和FoxO信号通路等121条信号通路参与调控IR。分子对接结果显示,菟丝子中活性成分槲皮素、苦参碱、β-谷甾醇与核心靶点JUN、TP53、MAPK1和RELA间存在结合位点。...     

基于网络药理学和分子对接技术探究健神糖浆治疗失眠症的作用机制

目的 采用网络药理学方法及分子对接技术分析健神糖浆治疗失眠症的作用机制。方法 借助中药系统药理学数据库和分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）、中医药整合药理学网络计算研究平台（Integrative Pharmacology-based Research Platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP）、中国知网（China National Knowledge Infrastructure,CNKI）检索搜集健神糖浆所含中药的化学成分和潜在作用靶点,借助Genecards数据库和OMIM数据库检索失眠症的人类相关靶点基因。使用Cytoscape 3.8.2软件构建网络图,筛选出核心成分。利用STING数据库制作蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）网络图,并使用Cytoscape-Cyto NCA拓扑分析筛选核心靶点基因。基于Metascape数据库进...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨丹灯通脑软胶囊治疗中风的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术,探讨丹灯通脑软胶囊治疗中风的活性成分和作用机制。方法：借助中药系统药理学数据库与分析平台、中国台湾中医药资料库、BATMAN-TCM数据库以及文献,筛选丹灯通脑软胶囊相关成分,在成分靶点预测数据库中预测其作用靶点,结合药物与疾病数据库、人类孟德尔遗传综合数据库、治疗靶点数据库和DisGeNET数据库中得到的中风靶点构建网络,通过STRING数据库对共同靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,筛选关键靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用Autodock Tools 1.5.7软件进行分子对接,预测核心成分和关键靶点间的结合活性。结果：共检索到丹灯通脑软胶囊相关成分161个,对应靶点856个,中风相关靶点234个,取交集得到86个共有靶点,构建PPI网络并进行拓扑学分析得到30个关键靶点,其富集分析得到2 712个GO功能进程和122条KEGG通路。分子对接结果显示,核心成分槲皮素、木犀草素可以与核心靶点前列腺素内过氧化物合酶2、蛋白激酶B、基质金属蛋白酶(MMP)9、半胱天冬酶-3和MMP...     

基于网络药理学和分子对接探讨天花粉治疗肺癌的作用机制

目的基于网络药理学和分子对接的方法探讨天花粉治疗肺癌的作用靶点及机制。方法检索时限为建库至2022年7月。采用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)结合PubChem数据库相关文献筛选出天花粉的活性成分, 通过TCMSP、TCMID、SwissTargetPrediction数据库获取活性成分的潜在靶点;检索GeneCards、人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM)、TTD、DrugBank数据库收集肺癌疾病靶点;利用线上网站Venny 2.1将药物与疾病靶点取交集并绘制韦恩图;应用String数据库绘制交集靶点的蛋白互作网络;使用Cytoscape 3.8.2软件构建"药物-活性成分-疾病-靶点"网络图;运用Metascape数据库对共同靶点进行基因本体(GO)富集化分析和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析;采用Autodock软件进行分子对接验证。结果天花粉通过筛选得到活性成分28种, 201个作用靶点;检索4大疾病数据库共获取肺癌靶点1 645个;药物与疾病共有37个交集靶点;根据连接度(degree)值大小, 确定雌激素受体1(E...     

基于网络药理学与分子对接方法探讨羌活胜湿汤治疗类风湿关节炎的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接方法,探讨羌活胜湿汤治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制。方法：通过查阅文献结合中药系统药理学数据库与分析平台,得到羌活胜湿汤中7味中药的主要活性成分及其靶点基因;在GeneCards和人类孟德尔遗传综合数据库中进行检索,查找RA相关靶点基因,基于R语言,获得羌活胜湿汤-RA共同作用的靶点基因。运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图,利用R语言计算各节点的度值得到柱形图并获得度值排序居前5位的靶点蛋白;运用Cytoscape 3.8.2软件,构建中药相关成分与RA靶点相互作用的网络图,使用Analyze Network插件进行分析,得到度值排序居前5位的活性物质。运用R语言和Bioconductor生物信息软件包对获得的基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Cytoscape 3.8.2软件构建信号-靶点通路网络图。运用Pymol和Auto Dock Tools软件处理得到的蛋白、配体及小分子,利用Vina计算结合自由能并绘制分子对接图。结果：筛选得到羌活胜湿汤活性成分141个,靶点基因2...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨杏贝止咳颗粒治疗感染后咳嗽的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接方法探讨杏贝止咳颗粒治疗感染后咳嗽(PIC)的作用机制。方法：采用中药系统药理学数据库与分析平台检索杏贝止咳颗粒的活性成分并预测潜在靶点,根据人类孟德尔遗传综合数据库、GeneCards数据库、Pharm GKB数据库和DrugBank数据库检索PIC相关靶点,并与杏贝止咳颗粒活性成分潜在作用靶点取交集,获得共有靶点;采用Cytoscape 3.8.2构建杏贝止咳颗粒活性成分-靶点-PIC疾病网络图;使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;采用Metascape数据库对共有靶点进行基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析,并构建通路-靶点网络图;最后使用AutoDockTools 1.5.6、AutoDock 4.2.6进行分子对接。结果：通过对杏贝止咳颗粒的研究,共获得96个活性成分,有效靶点272个,PIC靶点212个,共有靶点55个,对应于杏贝止咳颗粒82个活性成分;以槲皮素、β-谷甾醇和豆甾醇为重要活性成分,5-羟色胺转运体基因、白细胞介素6、肾上腺素能受体β2、糖皮质激素受体、原癌基因和前列腺素内过氧化物...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨知柏地黄丸治疗特发性中枢性性早熟的机制

目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨知柏地黄丸治疗特发性中枢性性早熟(ICPP)的作用机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和文献研究挖掘知柏地黄丸中各个药物的活性成分,并利用TCMSP数据库预测活性成分作用靶点,通过全球蛋白质资源(UniProt)数据库对靶点蛋白进行校正。在GeneCards、在线孟德尔遗传(OMIM)、DisGeNET数据库中获得ICPP的疾病靶点。取药物靶点和疾病靶点的交集靶点并制作韦恩图,运用Cytoscape 3.9.1软件制作“中药-活性成分-靶点”网络并进行网络拓扑分析获取中药核心成分,利用STRING数据库构建蛋白互作网络并导入Cytoscape 3.9.1软件中筛选出核心靶点。利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;利用AutoDockTools和AutoDock Vina脚本将得到的核心成分和核心靶点进行分子对接。结果:筛选得到知柏地黄丸复方中活性成分114个,相关靶点233个,ICPP疾病靶点1 628个,交集靶点111个。复方核心成分包括槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、脱...     

虎杖治疗肺动脉高压作用机制的网络药理学研究

目的 探讨虎杖药材治疗肺动脉高压（PAH）的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）和PubMed检索虎杖活性成分,构建活性成分库。通过TCMSP获取活性成分的潜在靶点,利用Uniprot数据库获取潜在靶基因。利用人类基因数据库（GeneCards）和人类孟德尔遗传数据库（OMIM）筛选PAH致病靶点与活性成分靶点基因,构建“药物-活性成分-疾病靶点”可视化网络。将潜在靶点导入String数据库,构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络;利用DAVID数据库将潜在靶点进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。将节点度值排名前7的活性成分与排名前6的核心靶点利用AutoDock Tools和PyMOL软件进行分子对接和可视化分析。结果 筛选出活性成分39个,对应靶基因323个,与PAH共同靶点138个。经PPI网络分析,其中关键靶点涉及AKT1,VEGFA,TNF等;GO功能富集分析主要涉及低氧反应、炎性反应、血管再生等功能;KEGG通路富集分析主要涉及细胞增殖、细胞凋亡、炎性反应等信号通路;分子对接结果表明,虎杖药材活性成...     

丹参-当归治疗缺血性脑卒中作用机制网络药理学研究

目的 探讨丹参-当归治疗缺血性脑卒中(CIS)的潜在作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Swiss TargetPrediction数据库获取丹参和当归的活性成分及作用靶点,并通过检索PubMed、中国知网相关文献进行补充;通过GeneCards、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DisGeNET数据库获取CIS的潜在靶点;将丹参-当归治疗CIS的共有靶点导入String 11.0平台,构建活性成分与疾病靶点蛋白的蛋白相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.8. 2软件构建疾病-药物-活性成分-靶点可视化网络;将共有靶点导入DAVID数据库进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用Cytoscape 3.8. 2软件构建活性成分-核心靶点-通路网络;利用AutoDock软件对疾病-药物-活性成分-靶点网络中度值排名前6的核心靶点和活性成分进行分子对接验证。结果 共检索到82种活性成分,其中丹参65个、当归17个,潜在作用靶点787个,疾病靶点671个,共有靶点76个。度值排名前6的活性成分为丹参醇B...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨芪藤消浊颗粒治疗慢性肾小球肾炎的作用机制

目的通过网络药理学与分子对接技术，分析芪藤消浊颗粒治疗慢性肾小球肾炎( CGN)的物质基础及作用机制。方法 2021年 3—10月，运用 TCMSP、TCMID、HERB数据库收集芪藤消浊颗粒的活性成分及靶点信息，应用 DrugBank、GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD数据库检索收集 CGN疾病基因。对药物和疾病靶点取交集，借助 STRING数据库构建蛋白相互作用( PPI)网络，运用 Cytoscape软件构建“中药化合物 -交集基因”网络、核心基因筛选网络分别获取核心活性成分、核心靶点，利用 DAVID数据库进行基因本体论( GO)功能注释及京都基因与基因组百科全书( KEGG)通路富集分析。最后，通过 SailVina平台进行 Autodock vina分子对接，运用 PyMOL软件进行可视化分析，使用 PLIP网站确定结合位点。结果获取芪藤消浊颗粒中 58种活性成分，核心活性成分可能为槲皮素、山柰酚、雷公藤甲素， CGN疾病基因 1 847个，药物与疾病交集靶点 134个，核心基因筛选网络得到 5个核心靶点分别为促分裂原活化蛋白激酶 1(MAPK1)禽肉瘤病毒 17的假定转化基因( JUN)、信号转导     

整合化学物质组学与网络药理学的四逆汤抗脓毒症“成分-靶点”相关性研究

目的 探讨四逆汤治疗脓毒症的活性成分、作用靶点及机制。方法 采用超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UHPLC-Q-TOFMS)鉴定四逆汤的潜在活性成分，通过中药系统药理学数据库与分析平台和Swiss Target Prediction数据库预测其作用靶点，GeneCards、GisGeNET和comparative toxicogenomics database (CTD)数据库寻找脓毒症靶点，分别用String平台、Cytoscape 3.8.0软件构建蛋白-蛋白相互作用、成分-靶点-通路网络，筛选活性成分和潜在靶点，借助DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体论(gene ontology, GO)注释和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析，最后采用分子对接、表面等离子共振技术验证成分和靶点之间的结合能力与亲和力。结果 共鉴定出46种潜在活性成分、筛选到156个关键靶点；GO富集得到1 019个条目、151条通路，涉及癌症信号、脂质与动脉粥样硬化等；验证结果显示宋果灵、1-脱氢-8-姜酮、芒柄花...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨雷公藤治疗结肠癌的作用机制

目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨雷公藤干预结肠癌的作用机制。方法 雷公藤组分化学成分信息通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库,其化学成分预测的靶点分别通过PubChem和SwissTargetPrediction获得,结肠癌的相关靶点收集源于GeneCards等数据库,应用Venny2.1取两者交集;将交集靶点基因上传至蛋白质相互作用(STRING)数据库,把结果数据导入至Cytoscape软件构建蛋白相互作用(PPI)网络并筛选核心靶点基因。使用Cytoscape软件将相关网络关系可视化,成分与疾病共同靶点经过DAVID数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)富集分析,采用Cytoscape软件进行“药物-活性成分-共同靶点”网络的构建与分析。进一步筛选重要化学成分与疾病靶点进行分子对接预测。采用PyMOL软件对核心活性成分与核心靶点基因进行分子对接验证。结果 雷公藤的有效化学成分能够达到50种左右,有546个靶点,将重复项和未检索到的靶点成分删除后,实现对290个靶点蛋白与15种活性成分关系信息的高效获取。结肠癌靶点共3229个,关联调控...     

网络药理学结合GEO芯片技术探讨黄芎方治疗缺血性脑卒中的作用机制及实验验证

目的 基于GEO芯片联合网络药理学方法探讨黄芎方治疗缺血性脑卒中的作用机制,并构建脑缺血/再灌注(I/R)大鼠模型验证黄芎方药效和核心靶点。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库及文献检索,获得黄芎方的主要活性成分,通过Swiss Target Prediction数据库检索其相应的靶点。通过R软件limma包对GEO平台缺血性脑卒中患者数据集GSE16561进行差异基因分析。利用Venny 2.1.0进行黄芎方成分靶点和缺血性脑卒中差异基因靶点交集靶点分析,采用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用Cytoscape 3.9.0软件构建成分-靶点-通路网络并筛选核心成分,通过STRING数据库与Cytoscape 3.9.0软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选核心靶点基因。利用PyMOL软件对度值排名靠前的成分和靶点基因进行分子对接。通过single sample Gene Set Enrichment Analysis(ssGSEA)进行免疫浸润分析。采用线栓法制备I/R大鼠模型...