基于网络药理学探讨乌头汤配伍原则

目标探讨乌头汤中川乌与黄芪的增效作用及甘草联合川乌减毒作用的机制,阐明乌头汤的配伍原则.方法通过中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)进行相关药物的活性成分及靶点的检索.针对川乌毒性靶点的研究,我们主要选取了其成分中5种具有明确毒性的成分并运用瑞士的靶点预测平台(SwissTarg...     

基于网络药理学探讨固本平喘剂治疗支气管哮喘的作用机制

目的：基于网络药理学方法筛选固本平喘剂(补骨脂、地龙、防风)中的主要活性成分,探讨其治疗支气管哮喘的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库TCMSP数据库、中药与化学成分数据库,筛选固本平喘剂的活性成分及靶标。利用Genecards、OMIM数据库获得支气管哮喘的潜在靶标基因。将两者靶基因进行映射后通过Cytoscape3.6.1软件构建“成分-靶标”网络、结合String数据库构建蛋白质相互作用网络扩充核心靶点。依托功能注释生物信息学分析平台DAVID数据库对固本平喘剂的作用靶点进行基因本体(gene ontology, GO)生物学过程和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集注释分析,通过Autodock vina软件进行分子对接以验证结果。结果：符合筛选条件的共有53个活性成分,补骨脂18个,地龙17个,防风18个,筛选得到固本平喘剂关键成分,包括补骨脂黄酮类、补骨脂查耳酮类、汉黄芩素、补骨脂酚、β-谷甾醇等;通过GenCards、OMIM数据库剔除重复后,共收集支气管哮喘潜在靶点2 358个。将固本...     

基于网络药理学探讨甘草-枳壳活性成分抗乳腺癌作用机制

目的:基于网络药理学进行数据挖掘,探讨甘草-枳壳的抗乳腺癌的潜在活性成分和可能作用机制。方法:从中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选的甘草-枳壳活性成分与药物数据库Therapeutic Target Databas(TTD)数据库检索的乳腺癌靶点进行了对比分析,归纳总结出甘草-枳壳中活性成分抗乳腺癌作用的主要潜在靶点,利用Cytoscape 3. 7. 1软件构建甘草-枳壳活性成分-靶点-疾病网络并进行分析。结果:根据类药性(DL)及口服生物利用度(OB)相关条件筛选获得甘草-枳壳活性成分-乳腺癌靶标网络图,该网络总共包括133个节点,化学成分116个,乳腺癌药物靶点有17个;与乳腺癌药物靶点相互作用的甘草活性成分有109个;与乳腺癌药物靶点相互作用的枳壳活性成分有6个;与乳腺癌药物靶点相互作用的枳壳、甘草共有的活性成分有1个;网络图中有400个乳腺癌靶点-相互作用靶标对。结论:甘草-枳壳抗乳腺癌作用的发挥是基于多成分、多通路和多靶点的整体药效效应,挖掘了抗乳腺癌的潜在作用机制,为进一步实验研究提供了理论基础。     

基于网络药理学探讨甘草泻心汤复方成分治疗口腔溃疡的作用机制

目的：运用网络药理学的方法探讨“甘草泻心汤”复方成分治疗口腔溃疡的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选甘草泻心汤所含六味中药半夏、黄连、黄芩、干姜、大枣、甘草含有的活性成分及作用靶点,利用GeneCards数据库收集口腔溃疡相关靶点基因;使用VENNY 3.0软件构建韦恩图,得到甘草泻心汤治疗口腔溃疡的潜在靶点;采用Cytoscape 3.7.0软件和STRING数据库进行“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络的构建与分析;基于STRING数据库进行基因本体论（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：获得“甘草泻心汤”复方所含六味中药共66个活性成分和256个有效靶点;口腔溃疡疾病4 182个靶点,获得191条GO生物过程和174条相关信号通路,涉及脂质和动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、乙型肝炎、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、前列腺癌信号通路等。结论：“甘草泻心汤”复方可能通过调控血红素结合水平、聚合酶水平,提高信号受体激活剂活性、核受体活性、配体转录因子的相互作用等来治疗口腔溃疡...     

基于网络药理学的甘草治疗溃疡性结肠炎作用机制研究

目的:采用网络药理学方法探讨甘草治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选甘草的活性成分并检索出活性成分的作用靶点;通过CTD数据库查询与溃疡性结肠炎相关的靶点;采用UniProt数据库、Cytoscape 3.7.2软件构建成分-靶点、靶点蛋白相互作用和成分-靶点-生物学通路网络。结果:通过筛选,得到甘草中92个活性成分,相应靶点227个,其中与溃疡性结肠炎相关的靶点41个,主要包括肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等;这41个靶点主要涉及IL-17、阿米巴病、炎症性肠病等28条生物学通路。结论:甘草治疗溃疡性结肠炎是多成分、多靶点、多途径相互作用的结果,为其进一步深入研究提供参考。     

基于网络药理学探讨甘草活性成分对小儿肺炎的作用机制

目的基于网络药理学探讨甘草治疗小儿肺炎的潜在活性成分和可能作用机制。方法将中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选的甘草活性成分与药物数据库(Genecard数据库)检索的小儿肺炎靶点进行对比分析,归纳总结出甘草活性成分中对小儿肺炎治疗作用的主要潜在靶点。结果得到小儿肺炎疾病基因靶点1 110个,药物有效成分92个,通过uniprot数据库筛选出目前已知有意义的靶点105个,利用Cytoscape 3.7.0软件构建药物-疾病基因靶点网络图,并对其进行分析,取得44个药物-疾病基因靶点,登陆string数据库,输出药物-疾病基因靶点分析得到疾病蛋白-基因互作PPI网络,筛选蛋白-疾病交集最多的30个基因,通过GO富集分析,筛选出与疾病最相关的20个富集过程。通过KEGG通路富集分析得到6条通路。结论甘草对小儿肺炎治疗作用的发挥是基于多成分、多通路和多靶点的整体药效效应,挖掘了甘草治疗小儿肺炎的潜在作用机制,为进一步实验研究提供了理论基础。     

基于网络药理学探讨补骨脂与儿童性早熟的关联性

基于网络药理学方法及分子对接技术,探讨补骨脂是否可能促进儿童性早熟及其潜在机制。【方法】通过 BATMAN-TCM在线平台获取补骨脂主要活性成分及其作用靶点,从GeneCards数据库中获取性早熟相关疾病靶点,采用 Cytoscape 3.7.1软件构建“活性成分-疾病靶点” 可视化网络。基于STRING在线数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI） 的网络图构建。使用Metascape在线工具进行靶点基因的基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路的富集分 析。从PubChem数据库中获取主要活性成分结构,从RCSB PDB数据库中获取核心靶点结构,导入Autodock进行分子对接, 最后利用PyMOL软件绘制分子对接模拟图。【结果】得到12种补骨脂的活性成分,涉及274个靶点,其中11种活性成分和 98个靶点与性早熟相关。主要活性化合物为豆甾醇、补骨脂酚、异补骨脂素、补骨脂查尔酮、补骨脂乙素、甲氧基补骨脂 素,主要靶点有雌激素受体1（ESR1）、雌激素受体2（ESR2）、胰岛素样生长因子1（IGF1）、孕酮受体（PGR）,主要涉及卵巢 类固醇生成通路、Hippo信号通路。分子对接结果表明这些活性化合物与靶标具有良好的结合作用。【结论】补骨脂存在促进 儿童性发育的可能性及具有潜在药理作用机制,分析结果可为儿童性早熟、青春期早发育等临床防治提供理论参考。     

温通膏治疗膝骨关节炎的网络药理学分析

目的 基于网络药理学方法探讨温通膏（补骨脂、续断、干姜等）治疗膝骨关节炎（KOA）的潜在作用机制。方法 利用中药系统药理学分析平台（TCMSP）和BATMAN-TCM数据库筛选温通膏的活性成分及其作用靶点;利用GeneCards、OMIM和DisGeNet数据库检索KOA疾病相关靶点;通过Venny 2.1.0在线平台对温通膏的活性成分作用靶点与KOA疾病相关靶点映射取交集,即得温通膏治疗KOA的关键靶点（共同靶点）;将共同靶点导入STRING平台构建蛋白相互作用（PPI）网络;利用Cytoscape 3.8.0软件构建“活性成分-关键靶点”网络;将共同靶点导入DAVID数据库,进行GO功能及KEGG通路富集分析,并利用Cytoscape 3.8.0软件构建“关键靶点-信号通路”网络。结果 共筛选得到103个活性成分及其作用靶点共348个;得到温通膏治疗KOA的关键靶点（共同靶点）147个;PPI网络分析得到AKT1、TNF、IL6、TP53、IL1B、VEGFA、JUN等核心靶点;槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、豆甾醇等活性成分可能是温通膏治疗KOA的核心成分;GO功能富集分析得到612...     

基于网络药理学和实验验证探讨甘草防治非酒精性脂肪肝病及肥胖的作用机制

目的 基于网络药理学和实验验证探讨甘草Glycyrrhizae Radix et Rhizoma防治非酒精性脂肪肝病（nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD）及肥胖的活性成分、作用靶点及潜在机制。方法 采用TCMSP数据库结合已发表文献筛选获得甘草主要活性化学成分及其作用靶点,GeneCards数据库获取NAFLD及肥胖靶点,分别用String平台、Cytoscape 3.9.1软件分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）网络。借助Metascape平台分析交集靶点并进行基因本体（gene ontology,GO）功能及京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析,采用Cytoscape 3.9.1软件构建“甘草成分-疾病靶点-通路”网络,进一步采用分子对接验证预测的关键成分与靶点之间的结合能力与亲和力,通过动物实验证实关键成分对靶点通路的调控作用。结果 甘草主要通过核心活性成分槲皮素、甘草酸、山柰酚、柚皮素...     

基于网络药理学的辛夷治疗过敏性鼻炎作用机制研究

目的 基于网络药理学探讨辛夷治疗过敏性鼻炎的活性成分及作用机制.方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取辛夷活性成分,并借助SwissTargetPrediction、PubChem进行辛夷成分的作用靶点预测和筛选,构建成分-靶点网络.通过TTD、DrugBank、DisGeNET、OMIM数据库获取...     

基于网络药理学的八珍汤治疗手术后贫血作用机制研究

目的:基于网络药理学研究八珍汤治疗术后贫血的作用机制,为其临床应用提供参考。方法:通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得八珍汤中人参、白术、茯苓、甘草、熟地黄、当归、白芍、川芎的主要化学成分及靶点;通过检索GeneCards、OMIM、TTD数据库获取术后贫血相关靶点;运用Perl语言和Venny软件得到共有靶点;采用Cytoscape 3.7.0软件构建疾病-靶点-成分网络图;运用STRING 11.0在线网站分析共有靶点,得到蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;运用R语言对共有靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集。结果:八珍汤治疗术后贫血的主要有效成分为槲皮素、山柰酚、柚皮素、甘草查耳酮a,核心靶点为蛋白激酶B1 (Akt1)、白细胞介素-6 (IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、血管内皮生长因子A (VEGFA)、胱天蛋白酶3 (CASP3)等。八珍汤治疗术后贫血是通过调节晚期糖基化终末产物及其受体(AGE-RAGE)、磷脂腺肌醇3-激酶(PI3K)-Akt、MAPK等信号通路,调节细胞因子活性,促进细胞增殖来改善贫血症状。结论:八珍汤通过多靶点、多途径方式改善术后贫血,为临床进一步研究提供参考。     

基于整合药理学策略探究补肾活血法治疗骨质疏松症作用机制——以补骨脂-三七药对为例

目的:以补骨脂-三七药对为例,从整合药理学角度探索补肾活血法治疗骨质疏松症的作用机制。方法:基于整合药理学平台(TCMIP),收集补骨脂、三七的化学成分信息,以"osteoporosis"作为疾病关键词,得到骨质疏松症全部靶标。通过TCMIP的蛋白质-蛋白质相互作用信息(PPI)数据库,获得补骨脂-三七作用靶标与骨质疏松疾病靶标之间的PPI,构建药对与疾病间的关键靶标网络,基于基因本体和京都基因与基因组百科全书数据库,确定靶标基因、蛋白质分子功能、细胞内定位及其所参与的生物学反应和通路。结果:两药共有靶标34个;作用机制可能与Smad蛋白磷酸化,Smad蛋白导入细胞核和维生素D应答元件结合等生物过程有关;并与破骨细胞分化、氧化磷酸化、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、内分泌和其他因子调节钙重吸收等生物途径有关。结论:补骨脂-三七药对参与Smad蛋白调控及其信号转导过程,可为补肾活血制剂参与调控Smad蛋白,进而影响Runt相关转录因子2等转录因子、胞外信号调节激酶等信号通路,实现防治骨质疏松症提供一定思路。     

四逆汤配伍环境下的附子"效-毒网络"交集调控研究

目的:采用网络药理学方法探索四逆汤配伍环境下,甘草、干姜对附子作用基因"效-毒网络"交集调控的机制。方法:应用Cytoscape软件和插件Agilent Literature Search,进行文本挖掘并建立附子、甘草、干姜作用的基因相互关系网络;根据附子抗心衰、神经毒性和心脏毒性形成附子"效-毒网络"交集;应用插件Clusterviz进行靶标基因聚类,从DAVID数据库中对甘草、干姜调控附子"效-毒网络"交集的可能通路进行预测。结果:与附子神经毒性、心脏毒性和抗心衰作用同时相关的基因有5个,AKT1,BAX,HCC,IL6,IL8,形成附子"效-毒网络"交集有47个节点基因;甘草、干姜与附子"效-毒网络"交集的重合基因分别有29个和27个,可能调控通路有23条和17条。结论:在四逆汤配伍环境下,甘草、干姜可能通过影响免疫-炎症反应信号通路、细胞凋亡-自噬信号通路、神经细胞与心肌细胞缺血缺氧保护信号通路等途径调控附子的效/毒效应。     

基于网络药理学探讨甘松-延胡索组方治疗房颤的作用机制

目的:通过网络药理学预测甘松-延胡索组方治疗房颤的作用靶点及信号通路,进一步探讨潜在作用机制。方法:采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选甘松-延胡索组方的活性成分并预测其作用靶点,构建活性成分-预测靶点网络。通过人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM),治疗靶点数据库(TTD),基因组注释数据库(Genecards)检索房颤的潜在靶点,采用蛋白质相互作用网络数据库(STRING 11. 0)获取房颤靶点蛋白相互作用的网络,通过Cytoscape 3. 7. 1软件对数据进行可视化分析,构建房颤靶点的蛋白互作网络。将甘松-延胡索组方的预测靶点映射至房颤靶点集合上,其交集靶点即为甘松-延胡索组方治疗房颤的潜在靶点。然后运用功能注释生物信息学分析平台(DAVID)数据库对甘松-延胡索组方治疗房颤的潜在靶点进行生物功能及信号通路富集分析。再通过Cytoscape 3. 7. 1软件构建甘松-延胡索组方治疗房颤的活性成分-潜在靶点-信号通路网络。结果:筛选出51个甘松-延胡索组方的活性成分,预测出甘松-延胡索组方治疗房颤的潜在靶点18个,主要通过白细胞介素-6(IL-6),钠通道蛋白亚型5α(SCN5A),肿瘤坏死因子(TNF),内皮源性一氧化氮合酶(NOS3),电压依赖性钾通道亚型H2(KCNH2),胶原α1(I)链(COL1A1),维甲酸受体RXR-α(RXRA),组织因子(F3),α1B肾上腺素能受体(ADRA1B)等靶蛋白,以及环磷酸酸鸟苷(cGMP)/蛋白激酶G(PKG)信号通路,磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路,癌症中的转录失调,钙信号通路,心肌细胞中的肾上腺素信号等信号通路发挥治疗房颤的作用。结论:甘松-延胡索组方是基于多成分、多靶点、多通路治疗房颤,为后续开展实验研究以进一步阐释其作用机制提供了科学依据。     

甘遂与甘草反药相互作用的网络药理学分析

目的:采用网络药理学方法,探讨甘遂和甘草反药配伍后药效/毒性成分的分子作用机制,分析其多成分-多靶点-多通路相互关系。方法:针对甘遂甘草的主要药效/毒性成分——甘遂萜酯A,甘遂萜酯B,甘遂萜酯C,甘草酸,甘草苷,异甘草苷和刺芒柄花素,依据Pharm Mapper数据库构建多成分-蛋白网络,获取的靶点信息利用博奥数据库MAS 3.0系统得到相应通路,通过Cytoscape软件建立成分-靶点-通路网络模型。结果:网络分析表明,甘遂、甘草配伍药效/毒性成分涉及神经-免疫-内分泌-泌尿等相关的61条通路。在调节水和电解质排泄方面药效相反,与肾素血管紧张素系统、类固醇生物合成等通路有关;在抗肿瘤、抗炎、调节免疫方面发挥协同作用,涉及33条通路;两者配伍存在基于肝药酶代谢的毒性增强现象。结论:甘遂与甘草配伍存在药效降低或药效协同和毒性改变等多种情况,体现了中药配伍多成分、多靶点、多途径作用模式,该研究为深入探讨甘遂甘草配伍的分子作用机制提供了参考。     

基于数据挖掘研究辨证论治恶性肿瘤骨转移治则治法

目的：基于数据挖掘分析方法探讨中药治疗恶性肿瘤骨转移及疼痛用药规律。方法：检索国家知识基础设施数据库（CNKI）、中国学术期刊数据库（CSPD）和PubMed中药治疗恶性肿瘤骨转移及疼痛的临床研究或经验探析。将所用处方中的药物建立数据库,通过药物、性味归经的频数分析、SPSS聚类分析、Clementine关联规则分析,探索用药规律。结果：共纳入研究144项,获得治疗恶性肿瘤骨转移及疼痛的中药处方150首,中药198味。药物频数分析中熟地黄、补骨脂、甘草、骨碎补、黄芪等应用最多;性味频数分析结果显示,温性药、甘味、苦味及辛味药使用较多;归经以肝、肾2经最多;聚类分析得到药对2对,3味药药组1组,聚类方1首;关联规则分析结果以补骨脂,当归-骨碎补等置信度最高。结论：中药治疗恶性肿瘤骨转移及疼痛遵循和化痰饮、滋补肝肾、通络止痛及专病专药等治疗原则。     

舒神灵胶囊质量标准研究

目的：建立舒神灵胶囊的质量标准。方法：采用薄层色谱法对该制剂中的丹参、五味子、甘草、人参进行定性鉴别;采用HPLC测定该制剂中五味子的有效成分五味子醇甲的含量。结果：薄层色谱可鉴别出丹参、五味子、甘草、人参的特征斑点,且阴性对照无干扰。HPLC法测定五味子醇甲在0．0407—0．3665μg线性关系良好,平均加样回收率为100．38％,RSD=1．2％（n=6）。结论：该方法简便可靠,专属性强,重现性好,可用于舒神灵胶囊的质量控制。     

基于网络药理学和分子对接研究当归四逆汤治疗原发性痛经的机制

采用网络药理学、分子对接和体内实验研究当归四逆汤治疗原发性痛经(primary dysmenorrhea,PD)的药效基础与潜在的作用机制.通过TCMSP数据库检索当归四逆汤组成药材当归、白芍、通草、细辛、桂枝、大枣、甘草的化学成分,通过Drug-Bank搜集当归四逆汤化学成分的作用靶点.以“primary dysme...