一条新肺腺癌多药耐药细胞cDNA片段在胃癌中表达的研究

目的 我们在前期工作中通过抑制消减杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH)在肺腺癌细胞中发现了1条新的耐药相关基因片段。本研究主要探讨该片段在胃癌及癌旁正常组织中的表达情况。方法 利用随机引物法将新片段用地高辛标记为探针，通过组织原位杂交技术(In situ hybridization histochemistry,ISHH)检测其在胃癌及癌旁正常组织中的表达情况。结果 该片段在大多数(12／16例)胃腺癌组织中有表达，在癌旁正常组织中没有表达，二者之间相差非常显著(P＜0．01)，而印戒细胞癌组织中无该片段表达，与腺癌相比较相差非常显著(P＜0．01)。结论 在大多数被检测的胃腺癌组织中有该片段的表达；该片段可能是一些肿瘤组织本身所具有的，即内源性表达的基因片段。     

应用抑制消减杂交技术构建耐多药结核杆菌差异表达基因消减cDNA文库

目的：构建结核杆菌耐多药株与敏感株的差异表达消减cDNA文库,进一步探索结核杆菌耐多药的分子机制。方法：以耐多药菌株cDNA为实验组（Tester）,敏感株cDNA为驱动组（Driver）应用抑制消减杂交（Suppression subtractive hybridiza－tion,SSH）技术结合T/A克隆技术构建结核杆菌耐多药株与敏感株的差异表达消减cDNA文库。结果：成功构建了耐多药结核菌株差异表达消减cDNA文库,获得113个差异表达cDNA片段。结论：研究表明SSH技术是筛选新功能基因的有效方法;多种已知或未知基因均参与了结核杆菌耐多药的调节,大规模筛选与克隆这些基因为进一步研究结核杆菌耐多药机制的产生奠定了必要的理论基础。     

人小细胞肺癌多药耐药细胞差异表达基因的克隆研究

目的 构建小细胞肺癌多药耐药细胞(H446/CDDP)差异表达消减cDNA文库.方法 ①以H446/CDDPcDNA为实验方(Tester),小细胞肺癌细胞H446 cDNA为对照方(Driver),应用抑制消减杂交(SSH)技术结合T/A克隆技术构建小细胞肺癌多药耐药细胞差异表达消减cDNA文库.②通过斑点杂交筛选、测序及同源性分析获取H446/CDDP细胞差异表达cDNA片段.结果 成功构建了小细胞肺癌多药耐药细胞H446/CDDP差异表达消减cDNA文库,获得21个H446/CDDP细胞差异表达cDNA片段,经测序及同源性分析表明它们分别代表6个已知基因(同源性为96%～100%).结论 SSH技术是筛选新的功能基因的有效方法;获取的6个差异表达基因可能参与了小细胞肺癌多药耐药细胞H446/CDDP的耐药形成,进一步的功能研究有利于了解它们在小细胞肺癌多药耐药机制中所发挥的作用.     

肺腺癌细胞MRP基因甲基化与多药耐药的相关性

目的探讨肺腺癌SPCA-1细胞中多药耐药相关蛋白(MRP)基因甲基化状态与MRPmRNA、MRP表达的关系.方法应用限制性内切酶Ec047Ⅲ和PCR法检测人胚肺WI-38细胞、肺腺癌SPCA-1细胞及经阿霉素诱导的耐药细胞MRP基因甲基化状态;原位杂交法检测MRPmRNA表达;免疫组化法测定MRP表达.结果 WI-38细胞MRP基因启动子区处于高甲基化状态,SPCA-1肺腺癌细胞和经阿霉素诱导的耐药细胞MRP基因启动子区处于低甲基化状态.WI-38细胞、SPCA-1肺腺癌细胞、不同浓度阿霉素诱导的耐药SPCA-1细胞MRPmRNA和MRP表达的阳性率和强阳性率,经组间多重比较均有显著性差异. 结论 SPCA-1肺腺癌细胞MRP基因启动子区处于低甲基化状态,尤其5'端调控区低甲基化是导致转录活性增加的重要结构基础,参与肺癌耐药的发生.     

肺腺癌细胞MRP基因甲基化与多药耐药的相关性

目的探讨肺腺癌SPCA-1细胞中多药耐药相关蛋白(MRP)基因甲基化状态与MRPmRNA、MRP表达的关系.方法应用限制性内切酶Ec047Ⅲ和PCR法检测人胚肺WI-38细胞、肺腺癌SPCA-1细胞及经阿霉素诱导的耐药细胞MRP基因甲基化状态;原位杂交法检测MRPmRNA表达;免疫组化法测定MRP表达.结果 WI-38细胞MRP基因启动子区处于高甲基化状态,SPCA-1肺腺癌细胞和经阿霉素诱导的耐药细胞MRP基因启动子区处于低甲基化状态.WI-38细胞、SPCA-1肺腺癌细胞、不同浓度阿霉素诱导的耐药SPCA-1细胞MRPmRNA和MRP表达的阳性率和强阳性率,经组间多重比较均有显著性差异. 结论 SPCA-1肺腺癌细胞MRP基因启动子区处于低甲基化状态,尤其5'端调控区低甲基化是导致转录活性增加的重要结构基础,参与肺癌耐药的发生.     

人肺腺癌多药耐药细胞系的建立及其生物学特征

目的 建立人肺腺癌多药耐药细胞系。方法 以顺铂为诱导药物,人肺腺癌细胞系SPC-A-1为诱导对象,采用大剂量冲击与逐步增加剂量相结合的方法,诱导建立人肺腺癌多药耐药细胞系SPC-A-1/CDDP;MTT法测定药物敏感性,透射和扫描电镜观察形态变化,常规染色体检测分析染色体变化。结果 用192d建成人肺腺癌多药耐药细胞系SPC-A-1/CDDP,它对顺铂的耐药指数为11.2,对顺铂、5-氟尿嘧啶、丝裂霉素、长春新碱和足叶乙甙等药物有不同程度的耐药性,但对羧基喜树碱无耐药性,电镜观察可见SPC0-A-1/CDDP细胞胞核不规则,较大,有丰富的微绒毛。结论 本研究建立了稳定的人肺腺癌多药耐药细胞系（SPC-A-1/CDDP）,可应用于下游实验。     

应用抑制消减杂交克隆支气管哮喘病人嗜酸细胞差异表达基因

目的 探讨嗜酸细胞在支气管哮喘发病中的分子机制。方法 提取1名哮喘发作病人嗜酸细胞总RNA为实验子，治疗后作为对照的嗜酸细胞的RNA为驱动子。检测子、驱动子的总RNA由SMART cDNA合成方法合成双链cDNA，进而由抑制消减杂交方法获得消减杂交产物。消减杂交产物克隆到T载体建立消减文库，对部分克隆进行杂交筛选及序列比对。结果 消减杂交文库挑取400个克隆进行PCR扩增，阳性率约为80％。部分阳性克隆经2轮杂交筛选及序列对比后获得6个差异片段，涉及与编码炎症介质、细胞信号传导、能量代谢和细胞凋亡相关的基因。结论 抑制消减杂交技术有效地克隆了支气管哮喘发作期和缓解期嗜酸细胞差异表达的基因，为阐明嗜酸细胞在支气管哮喘发病中的分子机制奠定了良好的基础，并为临床防治支气管哮喘、寻找新的药物和方法提供了依据。     

多药耐药相关蛋白基因在非小细胞肺癌中的表达

探讨多药耐药相关蛋白（ＭＲＰ）基因表达与非小细胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）多药耐药（ＭＤＲ）发生的关系。采用半定量逆转录多聚酶链反应（ＲＴＰＣＲ）和免疫组织化学染色方法，结合体外化疗药敏实验，检测３２例ＮＳＣＬＣ中ＭＲＰ基因表达水平和对９种化疗药物敏感性。结果：ＮＳＣＬＣ中ＭＲＰｍＲＮＡ表达阳性率为７１．９％，癌旁肺组织中为１０％；ＭＲＰ蛋白表达阳性率为６５．６％，在肿瘤细胞胞膜和胞浆内均有表达，癌旁肺组织中未见表达；中～高分化癌中ＭＲＰｍＲＮＡ和蛋白表达明显高于低分化癌（Ｐ＜０．０５）；ＮＳＣＬＣ中ＭＲＰｍＲＮＡ表达和ＭＲＰ蛋白表达呈正相关（ｒ＝０．９７，Ｐ＝０．０００１）。ＮＳＣＬＣ中对长春新碱、足叶乙甙和阿霉素耐药组，其ＭＲＰ蛋白表达率明显高于敏感组（Ｐ＜０．０５）。表明ＭＲＰ基因表达是非小细胞肺癌原发性多药耐药的重要参与因素，它的过度表达通过转录水平和翻译水平调节实现，ＮＳＣＬＣ对长春新碱、足叶乙甙和阿霉素耐药的重要原因是ＭＲＰ蛋白表达，ＭＲＰ基因检测和体外化疗药敏实验对进一步阐明肺癌耐药机理有重要意义     

凋亡抑制基因Livin对肺腺癌细胞A549增殖与耐药的作用

目的研究凋亡抑制Livin对肺腺癌细胞A549增殖与耐药的作用。方法通过脂质体将真核表达载体pc DNA3.1-Livin转染至人肺腺癌细胞A549中,经过G418筛选获得稳定表达Livin的A549细胞克隆;采用RT-PCR和Western blot法检测Livin在转染细胞中基因和蛋白的表达,通过流式细胞仪分析细胞周期的分布,应用MTT比色法检测细胞在不同化疗药物作用下的细胞耐药性,并通过RT-PCR和Western blot法检测转染细胞中P-糖蛋白(P-gp)基因和蛋白的表达。结果在pc DNA3.1-Livin转染后的A549细胞中,Livin基因的m RNA和蛋白表达显著增加,G0/G1期细胞比例降低,而S期细胞比例增高;与对照组比较,转染pc DNA3.1-Livin的A549细胞中P-gp基因的表达明显增高,对ADM、MTX、CTX和DDP等多种化疗药物的耐药性也明显增强(P<0.05)。结论 Livin基因的表达升高能增强肺腺癌细胞A549的增殖能力,并且可以通过增加P-gp的表达降低细胞对多种化疗药物的敏感性。     

应用抑制消减杂交克隆支气管哮喘病人嗜酸细胞差异表达基因

目的 探讨嗜酸细胞在支气管哮喘发病中的分子机制。方法 提取1名哮喘发作病人嗜酸细胞总RNA为实验子,治疗后作为对照的嗜酸细胞的RNA为驱动子。检测子、驱动子的总RNA由SMART cDNA合成方法合成双链cDNA,进而由抑制消减杂交方法获得消减杂交产物。消减杂交产物克隆到T载体建立消减文库,对部分克隆进行杂交筛选及序列比对。结果 消减杂交文库挑取400个克隆进行PCR扩增,阳性率约为80%。部分阳性克隆经2轮杂交筛选及序列对比后获得6个差异片段,涉及与编码炎症介质、细胞信号传导、能量代谢和细胞凋亡相关的基因。结论 抑制消减杂交技术有效地克隆了支气管哮喘发作期和缓解期嗜酸细胞差异表达的基因,为阐明嗜酸细胞在支气管哮喘发病中的分子机制奠定了良好的基础,并为临床防治支气管哮喘、寻找新的药物和方法提供了依据。     

Suppression subtractive hybridization for identifying differentially expressed genes in renal cell carcinoma

Objective To construct a renal cell carcinoma (RCC) cDNA subtractive library using suppres sion subtractive hybridization.Methods Polyadenylated RNA ［Poly (A)(+) RNA］ was isolated from tissues of RCC and norm al kidney, and single- strand cDNAs and double-strand cDNAs were synthesized in turn. RCC cDNAs were divided into two groups and ligated to the specific adaptors l and 2, and then h ybridized with normal kidney cDNA twice with two rounds of suppression PCR. Sec ond round PCR products were cloned to T/A plasmid vectors to set up the subtract ive library. One hundred clones were randomly picked to perform enzyme digest a nalysis, and some underwent sequence analysis and Northern blot to identify RCC specifically expressed genes. SMART RACE procedure was operated to clone full l ength novel RCC specifically expressed genes.Results A human RCC subtractive library with high subtractive efficiency was successfull y set up. The amplified library contains 350 positive clones. Random analysis of 100 clones with enzyme restriction showed that 85 plasmids in the clones cont ained 50-400 bp inserts. Sequence analysis was performed for 10 clones. All t he 10 sequences were unknown before and derived from 6 unique, novel genes among which the cDNA insert RCC18 had five copies. Northern blot analysis showed tha t RCC18 cDNA was highly expressed in RCC, but no signal could be detected in nor mal kidney. Using SMART RACE technique, we obtained the full length of the nove l gene RCC18.Conclusions The constructed cDNA subtractive library of human RCC is a highly efficient one and lays a solid foundation for large scale screening and cloning new and speci fic oncogenes or tumor suppressor genes of RCC. The novel specifically expresse d genes provided an important clue for studying the mechanisms of occurrence and development of RCC.     

用抑制性消减杂交方法筛选人肾癌相关基因

目的 应用抑制性消减杂交技术构建人肾癌差异表达基因文库并进行差异表达基因筛选.方法 以肾癌细胞株RLC-310和肾近曲小管细胞株HK-2互为实验组和对照组,提取mRNA,应用抑制性消减杂交技术进行正反两向消减杂交,获得人肾癌细胞差异表达基因文库,结合反向Northern斑点印迹杂交,筛选差异基因克隆,并进行测序分析.结果 正向和反向文库共包含1200多个阳性克隆,经斑点杂交筛选后,对213个差异克隆进行测序并经BLAST分析,得到144个差异表达基因,与肾癌相关的高表达基因67个,低表达基因77个,其中新EST 14个,未知功能基因21个;对测序基因进行聚类分析发现与细胞生长、黏附、凋亡等肿瘤细胞生物学行为相关.结论 该文库质量可靠,所筛选出的差异基因和新的基因为进一步筛选肾癌特异性相关基因,绘制肾癌差异基因表达谱,最终阐明肾癌发生、发展、转移机制提供了实验材料和研究靶点.     

Identification of differentially expressed genes in anagen dermal papilla by suppression subtractive hybridization

Background We constructed a cDNA subtractive library of dermal papilla cells (DPCs) in anagen with suppression subtractive hybridization (SSH) technique and clone differentially expressed genes related to DPCs in anagen. Methods Total mRNA was isolated from DPCs of anagen and telogen follicles. Moreover, singlestrand (ss) and double-strand (ds) cDNAs were synthesized in turn using SMART PCR cDNA synthesis technology, ds cDNAs then were digested with Rsa I and divided into two groups, and ligated to the specific adaptor 1 and adaptor 2R, respectively. After cDNAs were hybridized with each other twice and underwent two rounds of nested PCR. PCR products were ligated with arms of T/A plasmid vectors to set up the subtractive library. Selected clones were demonstrated by reverse Northern blot and sequenced. The acquired sequence data were aligned against the Genbank nucleotide database. Results cDNA subtractive library of DPCs in anagen follicles was set up successfully with high subtractive efficiency, Thirty-five genes were identified in this study with 22 known functional genesand 13 unknown functional genes. Conclusions All results confirm the effectiveness and sensitivity of SSH in detecting differentially expressed genes from a small amount of clinical samples. Information about such alterations in gene expression could be useful for elucidating the genetic events in hair follicle growth regulation.     

抑制性消减杂交技术检测骨髓CD34+细胞基因差异表达

目的 检测、比较骨髓和动员外周血2种来源不同的CD34+细胞基因表达的差异。方法 从一健康供者分别获取骨髓和动员外周血,分离出CD34+细胞,利用抑制性消减杂交技术检测、比较该2种来源不同的CD34+细胞的基因表达差异。结果在骨髓CD34+细胞中共有21个基因高表达,主要涉及2类:（1）与细胞周期S期、G2期和M期转化相关的基因;（2）C/EBP（CCAAT/增强子结合蛋白）转录因子家族。结论骨髓和外周血CD34+细胞在基因表达上具有明显的不同,大部分骨髓CD34+细胞处于S期、G2期和M明,提示骨髓CD34+细胞比外周血CD34+增殖活跃。     

应用抑制性消减杂交筛选失血性休克所致大鼠心肌差异表达基因

目的：失血性休克可导致大鼠心肌的缺血，缺氧，进而对心肌细胞造成严重损伤，本实验将利用抑制性消减杂交技术（Suppression subtractive hybridization SSH)研究失血性休克大鼠心肌的差异表达基因，以期通过基因线索寻找其损伤机制，方法：建立失血性休克大鼠模型，选其心肌，提取总RNA，构建cDNA文库，应用抑制性消减杂交技术筛选其差异表达基因，通过反向Northern杂交验证差异表达基因阳性克隆，并进行测序分析，登陆Genbank寻找同源性基因。结果：获得42个阳性结果，25个为高表达基因，17个为低表达基因，其中发现5个新的cDNA片段，结论：SSH技术是一种高效的筛选差异基因的方法，本实验发现失血性休克可导致大鼠45S rDNA基因转录起始区域，鼠半胱氨酸富含蛋白61及鼠血清诱导激酶等基因的差异表达，今后的工作中我们将进一步研究它们与失血性休克所致损伤的关系。     

人肺腺癌A549细胞系多重抗药性的形成

本文采用阿霉素逐步诱导人肺腺癌Ａ５４９细胞系，在体外持续培养６个月，获得了具有抗药性的Ａ５４９／Ｒ２细胞，该细胞能在０．２μｇ／ｍｌ ＡＤＭ下持续增殖。通过测定抗癌药物作用的５０％抑制浓度发现，Ａ５４９／Ｒ２细胞对ＡＤＭ的抗药性为Ａ５４９的７－１１８倍，同时对表阿霉素、长春新碱、足叶乙甙（ＶＰ－１６）也具有显著抗药性，对氮芥、丝裂霉素和卡铂低度抗药、对５－氟脲嘧啶、氨甲喋呤和平阳霉素无抗药性。Ａ５     

利用抑制性消减杂交技术筛选大鼠哮喘相关基因

目的:利用哮喘大鼠模型筛选与哮喘发病相关的差异性表达基因.方法:采用抑制性消减杂交技术,以哮喘大鼠肺组织总RNA为检验子,对照大鼠肺组织总RNA为驱赶子,将消减杂交获得的DNA片断与pGEM-T Easy Vector连接,构建cDNA文库后,转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆.将获得的阳性克隆插入片段进行测序分析,测序结果与GenBank数据库中cDNA和EST序列进行相似性比对,获得差异性表达基因的信息.结果:扩增消减cDNA文库获得300余个白色克隆,随即挑选36个测序,除去重复序列,结果中含有已知的基因4 个,ESTs 2个及与任何序列无同源性的新基因片段3个.结论:成功构建了哮喘大鼠肺脏差异性表达基因的正向消减cDNA文库,筛选出数个与哮喘相关的差异表达基因.