食管鳞癌中hMLH1、E-cadherin、p16^INK4a基因启动子甲基化及其意义

背景与目的:目前认为抑癌基因启动子甲基化导致转录抑制是恶性肿瘤发生的重要机制之一,hgLH1、E-cadherin及p16INK4a基因在多种恶性肿瘤中都已被证实存在较高频率的甲基化.本研究通过检测食管鳞癌组织及癌旁组织中hMLH1、E-cadherin,p16INK4a基因启动子甲基化的发生情况,探讨hMLH1、E-cadherin、p16INK4a基因启动子甲基化在食管鳞癌发生发展中的作用.方法:采用酚-氯仿法提取105例食管鳞癌组织及癌旁组织的基因组DNA,应用甲基化特异性PCR对所提DNA进行hMLH1、E-cadherin、p16INK4a基因甲基化检测.采用EnVison免疫组织化学二步法对癌组织中上述3种基因蛋白表达进行检测.结果:癌组织中E-cadherin、hMLH1、p16INK4a基因启动子甲基化的阳性率分别为57.1%(60/105)、20.9%(22/105)和50.5%(53/105),而癌旁食管组织中相应的3个基因的甲基化率分别为10.5%(11/105)、1.9%(2/105)和7.6%(8/105),均显著低于癌组织.E-cadherin(P=0.021)及p16INK4a(P=0.026)基因甲基化与蛋白表达缺失密切相关,而hMLH1基因甲基化与蛋白表达无显著相关性.E-cadherin基因启动子甲基化与淋巴结转移有关(P=0.016),p16INK4a基因启动子甲基化与低分化癌有关性(P=0.024).hMLH1基因甲基化与各项临床病理特征均无关.结论:食管鳞癌中p16INK4a基因启动子甲基化与相应蛋白表达缺失密切相关,且在低分化癌中更多见;E-cadherin基因启动子甲基化与相应蛋白质表达缺失有相关性,并且有淋巴结转移多见的显著特征,这2个基因的甲基化位点与食管鳞癌密切相关.hMLH1基因甲基化可能并不直接参与食管鳞癌的发生、发展.     

Gadd45G基因在食管鳞癌组织中的异常甲基化及表达

目的:检测食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,本文中简称为食管鳞癌)中生长阻滞和DNA损伤诱导基因G(growth arrest and DNA-damage-inducible 45gamma,Gadd45G)的异常甲基化及表达,并探讨其临床意义。方法:分别应用亚硫酸氢盐转换-甲基化特异性PCR(bisul te conversion-methylation specific PCR,BS-MSP)、RT-PCR及免疫组织化学法检测Gadd45G基因在食管鳞癌组织及癌旁正常组织中的甲基化、mRNA及蛋白表达情况,并分析Gadd45G异常甲基化及表达水平与食管鳞癌患者临床病理特征的相关性。结果:食管鳞癌组织中Gadd45G远端启动子区(region1)的甲基化率为4.7%(6/128),与癌旁正常组织(0.0%,0/128)相比差异有统计学意义(P<0.05);Gadd45G此区域发生甲基化的食管鳞癌组织其mRNA和蛋白表达水平与未发生甲基化的食管鳞癌组织相比差异无统计学意义(P>0.05)。食管鳞癌组织Gadd45G第2个CpG岛的近端启动子区(region2)及第1外显子区(region3)的甲基化率相同,均为45.3%(58/128),与癌旁正常组织相比(0.0%,0/128),差异具有统计学意义(P<0.01);且食管鳞癌组织中此2个区域的甲基化与TNM分期及组织学分化程度密切相关(P<0.05)。食管鳞癌组织中Gadd45G的mRNA和蛋白表达水平显著低于癌旁正常组织(P<0.05),并与TNM分期和组织学分化程度密切相关(P<0.05),与其近端启动子区(region2)及第1外显子区(region3)的甲基化状态之间也有明显相关性(P<0.05)。结论:Gadd45G基因近端启动子区及第1外显子区的高甲基化导致其表达降低,这可能是食管鳞癌发生的机制之一。     

食管鳞状细胞癌中CDH1基因启动子区甲基化状态与β-catenin异质表达的相关性

目的:研究食管鳞状细胞癌(Esophageal Squamous Cell Cancer,ESCC)中CDH1(cadherin 1)基因的甲基化状态,探讨其与Wnt中心因子β-catenin表达及与食管鳞癌发生的关系.方法:应用甲基化特异性PCR(MSP)及RT-PCR的方法检测91例食管鳞癌中CDH1基因的甲基化状态及其mRNA表达情况,应用免疫组织化学的方法检测β-catenin蛋白的表达情况,并分析与临床病理参数间的关系.结果:在91例食管鳞癌中,有72例CDH1基因发生了甲基化,甲基化率为79.1%,明显高于癌旁非肿瘤组织(P＜0.01);癌组织中CDH1基因的高甲基化与肿瘤患者的临床分期相关,与病理分级无关;癌组织中该基因mRNA的阳性表达率42.9%,明显低于癌旁非肿瘤组织(97.8%,P＜0.01);癌及癌旁组织中β-catenin蛋白的异质表达率分别为89.0%和24.2%,差异均有统计学意义(P＜0.01):癌组织中CDH1基因mRNA表达及β-catenin蛋白的异质表达均与该基因的甲基化状态明显相关(P＜0.05).结论:CDH1基因启动子区甲基化在食管鳞癌中频繁发生,该基因的高甲基化状态可能是引起食管鳞癌发生的分子机制之一,并有可能通过Wnt/β-catenin信号传导通路发挥作用.     

食管鳞癌组织中TSLC1基因启动子甲基化状态检测的临床意义

目的:探讨肺癌抑癌基因1（TSLC1）在食管鳞癌组织中基因启动子甲基化状态及其与临床病理参数的关系。方法:应用甲基化特异性PCR检测TSLC1基因启动子在98例食管鳞癌组织及相应癌旁组织中的甲基化状态并结合临床病理资料进行分析。结果:在食管鳞癌组织中TSLC1基因甲基化阳性率（55.1%,54/98）显著高于癌旁组织（4.1%,4/98）（P<0.01）。TSLC1甲基化与食管鳞癌临床分期和浸润深度显著相关（P=0.035和0.001）。结论:TSLC1基因甲基化可能是参与食管鳞癌发展的重要分子事件。     

食管鳞状细胞癌中MGMT基因异常甲基化与MTHFR C677T基因多态的关系

背景与目的:作为基因失活的主要原因之一,肿瘤相关基因启动子区异常甲基化正日益受到关注,但是在食管癌方面研究尚十分有限.本研究的目的在于探讨DNA损伤修复基因MGMT异常甲基化与食管鳞状细胞痛临床特征和叶酸代谢酶基因MTHFR C677T多态之间的联系.方法:选择2005年1月至2006年3月间新发的、经病理学检查确诊并在江苏省扬中市人民医院进行手术治疗的食管鳞癌患者开展流行病学问卷调查,并采集其外周静脉血标本、癌组织和癌旁正常组织标本.应用甲基化特异性PcR法检测MGMT基因启动子区CpG岛甲基化状态.应用限制性片断长度多态(restriction fragment length polymorphism,RFLP)技术检测叶酸代谢酶基因MTHFR C677T多态.并分析和探讨食管粘膜组织中MGMT基因甲基化分布规律及其与MTHFR C677T基因多态间的联系.结果:125例食管鳞状细胞癌组织中MGMT基因甲基化频率达27.2%,癌旁组织甲基化频率11.2%,10例正常成人健康对照的食管粘膜均呈去甲基化状态.患者淋巴结转移与否与DNA甲基化频率有关,存在淋巴结转移的患者癌组织中MGMT基因甲基化频率(37.3%)高于无淋巴结转移的患者(18.2%).患者性别、年龄、吸烟、饮酒、饮茶等因素与DNA异常甲基化之间的相关性无统计学意义(P>0.05).在调整了相关潜在混杂因素后,携带MTHFR变异基因型CT和TT者食管癌组织中MGMT基因甲基化频率增高,与野生基因型CC比较,比值比OR分别为3.34(95%Cl:1.07～10.39)和3.83(95%CI:1.13～12.94).结论:食管鳞状细胞癌中MGMT基因启动子区异常甲基化与MTHFR基因多态有关,携带MTHFRC677基因变异基因型CT与TT的癌组织中MGMT基因异常甲基化频率更高.     

食管鳞癌中CAV-1基因的表达及甲基化状态

背景与目的：作为重要的表观遗传学现象之一,DNA甲基化对基因表达发挥着重要的调控功能。研究表明肿瘤细胞基因组正常DNA甲基化模式异常改变所导致的肿瘤相关基因功能异常可能参与肿瘤发生与发展。本研究通过检测食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinomas,ESCC)组织中质膜微囊蛋白-1(caveolin-1,CAV-1)基因的表达及甲基化状态,探讨CAV-1基因在食管鳞癌发生及发展中的作用。方法：分别应用甲基化特异性PCR(MSP)、RT-PCR法、免疫组织化学SP法检测食管癌及相应癌旁正常黏膜组织标本中CAV-1基因甲基化状态、mRNA及蛋白表达情况。结果：CAV-1 mRNA在食管癌和癌旁正常组织中的表达量分别为0.86±0.56和0.40±0.36,食管癌组织中CAV-1 mRNA表达量明显高于癌旁正常组织,2者差异有统计学意义(P<0.05)。CAV-1 mRNA表达与患者的淋巴结转移及肿瘤组织学分级有关(P<0.05);食管鳞癌组织中,CAV-1蛋白表达阳性率为66.7%(34/51);显著高于正常食管黏膜组织(15.7%,8/51)(P<0.01)。CAV-1蛋白表达与患者的淋巴结转移有关(P<0.05),而与肿瘤的临床分期和分化程度无关(P>0.05)。51例食管癌组织中1例发生了基因启动子区甲基化,甲基化率为2.0%(1/51);而相应癌旁正常黏膜组织中未发现有该基因的甲基化现象。食管癌组织中该基因的甲基化率与相应癌旁正常组织相比,差异无统计学意义(P>0.05)。结论：CAV-1基因在食管鳞癌组织中mRNA及蛋白表达均明显高于癌旁正常黏膜组织,该基因的高表达对于肿瘤的发生及淋巴结的转移起到了一定的促进作用;癌及癌旁组织中该基因的表达异常均与该基因的甲基化状态无关。     

食管鳞癌患者血浆中DAPK基因异常甲基化及临床意义研究

[目的]研究食管鳞癌患者癌组织及血浆中DAPK基因甲基化的情况,探讨血浆中DAPK甲基化检测在食管鳞癌早期诊断、治疗、预后评估中的作用。[方法]食管鳞癌患者155例,分别提取血浆、癌组织及癌旁正常组织中DAPK基因的DNA,并结合临床病理以及随访结果,进行DAPK甲基化分析。[结果]癌组织与癌旁正常组织中DAPK的甲基化率差异有统计学意义(P=0.000),癌组织和血浆DAPK基因的甲基化在是否淋巴结转移、是否远处转移、不同分期时差异均有统计学意义(P<0.05)。癌组织和血浆中DAPK基因甲基化的相关系数r为0.849(P<0.000)。癌组织中和血浆中DAPK基因非甲基化患者具有明显的生存优势(P均为0.000)。Cox回归分析显示血浆DAPK甲基化是食管鳞癌患者生存的独立影响因子。[结论]食管鳞癌癌组织和血浆中DAPK基因甲基化均与肿瘤分期、淋巴结转移、远处转移相关;癌组织和血浆中DAPK基因甲基化有显著相关性,血浆中DAPK高甲基化可作为食管鳞癌预后不良的生物标志物。     

多个抑癌基因启动子区域CpG 岛异常甲基化与非小细胞肺癌关系及临床意义的研究*

目的:分析多个抑癌基因启动子区域CpG 岛异常甲基化与非小细胞肺癌关系。方法:收集原发性非小细胞肺癌患者肺癌组织与癌旁正常组织,提取DNA并利用甲基化特异PCR（MSP）方法进行抑癌基因甲基化检测,对资料进行Logistic回归分析。结果:对94例肺癌患者资料进行的分析结果表明,91.49% 肺癌患者肺癌组织中抑癌基因发生了甲基化,明显高于相应的癌旁正常组织（40.43%）（P<0.01）。 其中p16INK 4a、DAPK、MGMT、TIMP- 3 和RAR β 基因的甲基化频率分别是41.49% 、50.00% 、17.02% 、24.47% 和68.09% ,比癌旁正常组织高且具有统计学意义。抑癌基因甲基化对肺鳞癌、中央型肺癌和临床Ⅲ期及以上期肺癌的影响相对比较大,并随着甲基化指数的增加而显著增加。吸烟显著增加抑癌基因甲基化,尤其是p16INK 4a和DAPK 基因甲基化,分别是不吸烟者的21.714 倍和15.268 倍（P<0.01）。 而且,吸烟时间或吸烟指数与抑癌基因甲基化之间显示出剂量- 反应关系。结论:吸烟增加抑癌基因甲基化的危险性,肺癌发病与多个抑癌基因甲基化密切相关。      

利用甲基化芯片及转录组测序方法筛选哈萨克族食管癌DNA异常甲基化谱

目的： 筛选新疆哈萨克族食管鳞癌DNA异常甲基化谱,为深入研究食管癌的发生机制提供线索。方法：采用Illumina Human Methylation 450K甲基化芯片,对6例哈萨克族食管癌组织及其癌旁正常组织进行全基因组甲基化检测,筛选DNA异常甲基化基因;利用Hiseq2000测序平台,对2例哈萨克族食管癌组织及其癌旁正常组织进行RNA水平检测,建立mRNA文库,并与DNA 甲基化结果进行关联分析,筛选DNA异常甲基化谱,同时对这些基因进行生物信息学分析。结果：食管癌组织中含高甲基化基因227个,低甲基化基因6个;癌组织mRNA表达量在0.031 2～8 192,癌旁正常组织在0.031 2～1 024。DNA异常甲基化基因与表达谱关联分析,呈负相关关系(即DNA高甲基化、mRNA低表达,或DNA低甲基化、mRNA高表达)的启动子区域基因共20个,包括启动子区域CpG岛高甲基化且表达下调10个位点、10个基因,低甲基化且表达上调11个位点、10个基因。生物信息学分析表明这些基因参与甲酰四氢叶酸分解代谢及调控细胞增殖等生物学过程,涉及一碳代谢通路及诱导细胞凋亡通路等。结论：初步建立了新疆哈萨克族食管癌DNA 异常甲基化谱,为哈萨克族食管癌的发病机制研究提供了新的思路。     

食管鳞癌中GPX3基因的甲基化特征及其临床意义

目的:采用将食管鳞癌组织和癌旁组织相对比,并将食管鳞癌患者的血浆与正常人的血浆相对比的策略,检测GPX3的甲基化状态和频率。结合患者的临床病理特征,分析GPX3基因甲基化在食管鳞癌中的意义。 方法:收集42例食管鳞癌组织标本和相对应的癌旁组织标本,同时收集42例食管鳞癌患者和50例正常人的血浆标本;应用甲基化特异性PCR（MSP）结合琼脂糖凝胶电泳检测GPX3在组织和血浆中的甲基化情况,对比分析。 结果:GPX3在肿瘤组织中的甲基化频率为54.8%,显著高于癌旁组织9.5%（P＜0.001）。GPX3在肿瘤患者血浆中的甲基化频率为40.5%,在正常对照组的血浆中没有检测到甲基化。组织中的甲基化频率在病理分期为T3组和N2组分别显著高于病理分期为T1-T2组和N0-N1组。血浆中的甲基化频率在病理分期T3组明显高于病理分期T1-T2组。结论:GPX3在食管鳞癌组织的甲基化频率高于癌旁组织,在食管鳞癌患者血浆中的甲基化频率显著高于正常人,且临床分期越晚的甲基化频率越高。     

食管鳞癌中DACT2基因表达及甲基化状态研究

[目的]检测食管鳞状细胞癌(ESCC)中DACT2基因表达及启动子区甲基化状态,探讨DACT2基因在食管鳞癌发生发展中的作用.[方法]分别应用逆转录—聚合酶链反应(RTPCR)以及甲基化特异性PCR(MSP)的方法检测DNA甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-dC)处理前后的食管癌细胞系(TE1、TE13、T.Tn、Eca109)以及食管鳞癌组织及相应癌旁组织中DACT2 mRNA表达情况及启动子区甲基化状态.[结果]经5-aza-dC处理后4种食管癌细胞系中DACT2基因的表达均增高.4种未经5-aza-dC处理的食管癌细胞系中DACT2基因呈高甲基化状态.应用5-aza-dC处理后,DACT2基因在4种细胞系中均呈非甲基化状态.DACT2基因在食管鳞癌组织中的表达显著低于癌旁组织(0.66±0.53 vs 0.95±0.64,t=-2.43,P=0.018),并与淋巴结转移密切相关(t=-2.030,P=0.048).食管鳞癌组织中DACT2基因的启动子区甲基化率显著高于癌旁组织(50.0％ vs 21.1％,x2=9.439,P=0.002),并与TNM分期、组织学分化程度和淋巴结转移密切相关(P均＜0.05).发生DACT2基因甲基化的食管鳞癌组织中DACT2基因的表达量显著低于未发生甲基化的食管鳞癌组织(0.46±0.32 vs 0.78±0.61,t=-2.341,P=0.023).[结论]DA CT2基因在食管鳞癌中的异常低表达与食管鳞癌的发生、发展密切相关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一.     

Expression and promoter methylation of the RASSF1A gene in sporadic breast cancers in Chinese women

The novel tumor suppressor RASSF1A is frequently inactivated during human tumorigenesis by promoter methylation. In this study, we detected the RASSF1A promoter methylation by methylated-specific PCR and investigated RASSF1A gene expression by semi-quantitative RT-PCR and immunohistochemical staining in 36 cases of breast cancer and their adjacent normal tissues in Chinese women. The promoter methylation of the RASSF1A gene was found to be a frequent event in the breast cancers (61.1%). RASSF1A methylation was not found in the matched adjacent normal tissues. The loss frequency of RASSF1A mRNA was 33.3% and that of the RASSF1A protein was 44.4% in breast cancers. RASSF1A mRNA and protein were all expressed in adjacent normal tissues. The mRNA and protein expression level of RASSF1A was significantly lower in breast cancer than in adjacent normal tissue. However, the promoter methylation of the RASSF1A gene in breast cancers were not correlated with clinical parameters, such as ages, histological types, TNM stages and lymph node metastases. Thus, the promoter methylation of RASSF1A was one reason for the low level of RASSF1A mRNA and protein expression and was a frequent event in primary sporadic breast tumorigenesis in Chinese women.     

胃癌BRCA1基因甲基化与BRCA1 mRNA表达的关系研究

目的：探讨乳腺癌易感基因1（BRCA1）启动子CpG岛甲基化与BRCA1 mRNA表达的相关性及其意义。方法采用甲基化特异性PCR技术检测37例胃癌组织和对应癌旁组织及6例正常胃组织中BRCA1基因启动子CpG岛甲基化状态;采用逆转录PCR技术检测37例胃癌组织和对应癌旁组织及6例正常胃组织中BRCA1 mRNA 表达水平。结果胃癌组织中 BRCA1基因启动子 CpG 岛总甲基化率为48.6%（18/37）,显著高于癌旁组织[5.4%（2/37）]和正常胃组织[0.0%（0/6）],差异有统计学意义（χ2=17.541、5.021,P均〈0.05）。胃癌组织中BRCA1 mRNA阳性表达率为48.6%（18/37）,显著低于癌旁组织[94.6%（35/37）]和正常胃组织[100.0%（6/6）],差异有统计学意义（χ2=19.215、5.520,P均〈0.05）。BRCA1基因启动子CpG岛甲基化与BRCA1 mRNA表达成负相关（ r=-0.515,P〈0.05）。结论 BRCA1基因启动子CpG岛甲基化可能是导致BRCA1 mRNA失表达的主要原因之一。     

SRY-box 17基因在食管鳞状细胞癌中异常甲基化及表达的研究

目的:检测食管磷癌(esophageal squamous cell cancer,ESCC)细胞株及组织标本中Wnt通路相关因子SRY-box 17基因的甲基化状态及表达情况,探讨其与食管鳞癌发生的相关性.方法:分别采用甲基化特异性-PCR(methylation specific-PCR,MSP)和RT-PCR的方法检测食管癌细胞株TE1、TE13及109例食管鳞癌及相应癌旁非肿瘤组织中SRY-box 17基因的甲基化状态及mRNA表达情况,并分析其与Wnit通路中心因子β-catenin蛋白表达的关系.结果:在食管癌细胞株TE1和TE13中,SRY-box 17基因mRNA均呈阴性或弱阳性表达,用甲基化抑制剂5-氮-2’-脱氧胞苷(5-aza-2’-deoxycytidine,5-Aza-dC)处理后,其mRNA全部恢复阳性表达;MSP检测结果显示,在食管癌细胞株中SRY-box 17基因均呈高甲基化状态;在食管癌组织标本中,SRY-box17基因的甲基率为89.0％ (97/109),明显高于癌旁组织的53.2％ (58/109)(P＜0.01);癌组织中SRY-box 17基因的甲基化率在Ⅲ和Ⅳ期肿瘤患者中明显高于Ⅰ和Ⅱ期患者(P＜0.05),而该基因的甲基化率与肿瘤患者的组织学分级无相关性;在癌组织中该SRY-box17mRNA的阳性表达率为28.4％(31/109),明显低于癌旁组织(P＜0.01).其mRNA表达的缺失率及通路中心因子β-catenin蛋白的异质表达率均与该基因的甲基化状态有相关性(P＜0.05).结论:食管鳞癌组织及细胞株中SRY-box 17基因均呈高甲基化状态,该基因的高甲基化可能是引起mRNA表达下调的重要机制之一,并可能通过Wnt/β-catenin信号转导通路的激活在食管癌的发生、发展中具有重要作用;对该基因的甲基化检测可能对食管癌的预后判断有一定的临床指导意义.     

食管鳞癌中p16基因启动子区甲基化及其表达

 目的探讨食管鳞癌（ESCC）p16基因甲基化的状况及其表达与食管鳞癌临床病理特征之间的关系。方法采用甲基化特异性PCR方法（MSP）分别检测75例食管癌组织、癌旁组织和切缘组织p16基因启动子区域CpG岛甲基化状态。采用Envision免疫组化法检测食管癌组织及癌旁组织的p16蛋白的表达。结果75例标本中，食管癌组织、癌旁组织和切缘细织p16基因甲基化率分别为41．3％（31／75）、13．3％（10／75）和6．67％（5／75）。癌组织和癌旁组织P16蛋白的阳性表达率分别为29．3％（22／75）和56．7％0（17／30）。31例癌组织p16基因甲基化阳性标本中有2例（6．4％）检测到P16蛋白的表达，而44例癌组织p16基因甲基化阴性标本中有20例（45．5％）检测到P16蛋白的表达。食管癌组织p16基因甲基化率显著高于癌旁组织和切缘组织（P〈0.01），P16蛋白表达与p16基因甲基化呈负相关。p16基因启动子区甲基化与食管癌的组织学分级、肿瘤部位无明显相关，与临床分期、淋巴转移密切相关。结论p16基因甲基化在食管癌发生发展中起着重要作用，食管鳞癌的分期和淋巴结转移与p16基因甲基化之间有密切关系。     

Genome-wide identification of OTP gene as a novel methylation marker of breast cancer

Aberrant DNA methylation occurs early and frequently in tumorigenesis. Identification of DNA methylation biomarkers is a field that provides potential for improving the clinical process of breast cancer diagnosis. We utilized a genome-wide technique, methylated DNA isolation assay (MeDIA), in combination with high-resolution CpG microarray analysis to identify hypermethylated genes in breast cancer. Among differentially methylated genes between tumor and adjacent normal tissues, 3 candidate genes (LHX2, WT1 and OTP) were finally selected through a step-wise filtering process and examined for methylation status in normal tissues, primary tumor, and paired adjacent normal-appearing tissues from 39 breast cancer patients. Based on the calculated cut-off values, all genes showed significantly higher frequencies of aberrant hypermethylation in primary tumors (43.6% for LHX2, 89.7% for WT1 and 100% for OTP, p<0.05) while frequencies were intermediate in paired adjacent normal tissues and absent in normal tissues. On further analysis, the methylation level in primary tumors was not significantly correlated with clinicopathological features. Interestingly, DNA methylation of a novel gene OTP was detected in adjacent normal tissues even 6?cm away from primary tumors, suggesting that OTP methylation may qualify as a biomarker for the early detection of breast cancer. In conclusion, we successfully identified a novel gene OTP frequently methylated in breast cancer by genome-wide screening. Our results suggest that the OTP gene may play a crucial role in breast carcinogenesis, although further clinical validation will be needed to evaluate the potential application of OTP in the early detection of breast cancer.     

胃癌组织及相关淋巴结中端粒酶逆转录酶基因启动子区域甲基化检测的临床意义

[目的]检测胃癌患者肿瘤组织及其相应的癌旁组织和淋巴结组织中端粒酶逆转录酶(hTERT)基因启动子区域甲基化状态,并探讨其甲基化状态的改变与临床病理特征的关系.[方法]运用甲基化特异性PCR(MSP)方法,检测52例手术切除胃癌组织、癌旁组织及相关淋巴结中hTERT基因启动子区域甲基化状念、以同一标本正常组织作为阴性对照.[结果]正常胃黏膜组织未检测出hTERT表达、胃癌组织及癌旁组织、转移淋巴结中均检测出hTERT表达.转移淋巴结、胃癌组织中hTERT基因的甲基化阳性率分别为81.6％(31/38)、71.1％(37/52),明显高于癌旁组织的29.5％(13/52)(P＜0.01).胃癌组织hTERT基因甲基化阳性率与胃癌的临床分期、组织分化程度、肿瘤大小有相关性(P＜0.05).癌旁组织hTERT基因甲基化阳性率和胃癌的临床分期、肿瘤大小、组织分化程度、淋巴结转移具有相关性(P＜0.05).转移淋巴结hTERT基因 甲基化阳性率则与临床及病理特征无关.[结论]胃癌组织及转移淋巴结中存在hTERT基因启动子区域的异常甲基化调控、可能参与了胃癌的发生与发展.     

人食管癌相关基因4在食管癌细胞系EC9706中表达缺失的机制

目的 探讨人食管癌相关基因4(ECRG4)在食管癌中表达缺失的机制.方法 采用聚 合酶链反应-单链构象多态(PCR-SSCP)和DNA测序的方法检测80对配对食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤组织和癌旁正常上皮中ECRG4的外显子突变;采用DNA亚硫酸氧盐修饰和序列特异性聚合酶链反应(ssPCR)检测EC9706细胞系ECRG4基因启动子CpG岛甲基化状态;采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测去甲基化药物5-氮杂-2-脱氧胞苷或三氧化二砷(As2O3)处理后ECRG4 mRNA的重新表达.结果 80对ESCC配对标本中,ECRG4的4个外显子编码区均未发现突变.EC9706细胞系ECRG4基因核心启动子区16个CpG岛中,有11个呈高甲基化状态,ECRG4 mRNA不表达.EC9706细胞处理前ECRG4 mRNA不表达,去甲基化药物处理后,ECRG4 mRNA均重新表达.结论 甲基化表观遗传学机制是导致ECRG4基因在食管癌细胞系EC9706中表达缺失的一个机制.

Abstract：

Objective To investigate the mechanism of loss of human esophageal cancer-related gene 4 (ECRG4) expression in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC.) Methods PCR-SSCP and DNA sequencing analysis were used to detect the mutation of ECRG4 exons in esophageal cancer and matched adjacent normal tissues of 80 patients. DNA bisulfite-modifying ssPCR sequencing assay was used to examine the methylation status of ECRG4 promoter in human esophageal squamous cell carcinoma EC9706 cells. The re-expression of ECRG4 mRNA was examined by RT-PCR in EC9706 cells, after treatment with either demethylation drug 5-aza-2'-deoxycytidine or arsenic trioxide. Results No mutation in the four ECRG4 exons was found in all the ESCC and matched normal adjacent tissues. RT-PCR showed that 11 of 16 CpG islands of ECRG4 promoter were hypermethylated, while ECRG4 mRNA expression level was undetectable in the EC9706 cells. The ECRG4 mRNA was re-expressed after treatment with either demethylation drug 5-aza-2'-deoxycytidine or arsenic trioxide. Conclusion The epigenetic mechanism of methylation is a reason of loss of ECRG4 gene expression in the ESCC cell line EC9706.