基于“肺阴虚证”本体的中医证候知识库构建方法研究

在本体思想的指导下,以Protégé为工具建立基于“肺阴虚证”病机规则的资源描述框架（RDF）,以探讨应用本体技术构建中医证候知识库的可行性。本体研究将为中医领域内的知识组织提供一种新的方法。     

中医厥证领域本体构建研究

目的 利用本体技术实现中医厥证领域知识的共建、共享及推理。方法 提取中医文献中的厥证相关知识,使用斯坦福大学提出的本体构建“七步法”,基于Protégé工具构建中医厥证领域本体,实现厥证相关知识的领域建模,并进行内部一致性检验,实现本体的推理功能。结果 构建的中医厥证领域本体共有27类,585个实例,25个对象属性,其中反向属性6个,数值属性1个,均通过了一致性检验,实现厥证领域知识的语义化表达,完成厥证知识的共建、共享和推理。结论 本研究采用本体技术,促使中医厥证领域知识的融合重组与推理,为将来中医急危重症诊疗知识库的构建、中医急危重症应急决策和辅助诊疗等系统的建立,奠定基础并提供参考。     

基于本体的中西医知识体系对比研究

中医知识体系中包含大量的隐性知识,运用本体构建中医知识体系有利于中医隐性知识的表达与共享。通过对医学系统命名法-临床术语(SNOMED CT)和中医临床术语系统的研究,从本体论的角度分析中西医学知识特点,对发展中医进行提示:利用本体论构建中医知识体系,进而完善中医临床术语系统,促进中医临床知识共享。     

基于本体的神经信息学概念及其关系研究

目的：通过构建神经信息学本体,为神经信息学研究提供良好的信息整合、知识表示、文本挖掘、智能教育和数据共享服务。方法：分析生物医学领域已有的统一医学语言系统、基因本体、癌症本体、解剖学本体、疾病本体和药物本体的结构和内容,对神经信息学领域专业概念及其关系进行了探讨,提出了神经信息学本体的设计原则、标准和规范、构建方式和基本流程,并利用Protégé工具编制本体。结果：构建了基于多层次概念语义网络的、符合网络本体语言（web ontology language,OWL）规范的神经信息学本体。结论：神经信息学本体可以从不同层次的形式化模式上给出神经信息学领域概念和概念之间相互关系的明确定义,形成清晰的神经信息学理论框架,实现对相关领域知识的共同理解。     

基于本体论构建中医古籍知识库的探索

简要介绍本体、知识模型等基本概念和基于本体论构建中医古籍知识库的建库目标,阐明中医古籍知识表达相关理论,从规范控制、构建原则、本体构建工具、系统架构、术语规范化、构建本体模型等方面具体论述基于本体的中医古籍知识库的构建。     

心力衰竭知识图谱的构建

目的：利用现有资源构建专病知识图谱,为临床决策提供知识与技术支持。方法：以心力衰竭为例,首先明确疾病、检查、手术、药物、科室、症状、解剖学7类顶层语义概念以及2类属性和14类语义关系,其次复用现有词表、本体按照语义概念类型分别进行层级关系构建和同义术语归并,最后利用知识库资源进行语义关系抽取和同义术语归并。结果：形成包含524个概念、4 360对语义关系的心力衰竭知识图谱。结论：利用现有词表、本体和知识库资源采用知识融合的方法可以实现专病知识图谱的构建。     

糖尿病医案本体库的构建及应用研究

当前中医医案缺少规范统一的形式化描述方法,难以实现有效分析和检索,利用本体技术针对中医糖尿病医案进行分析和描述,通过改进的七步法构建糖尿病医案本体库,在protégé系统中完成了对本体中类实例、属性和关系的定义和实现。糖尿病医案本体库的构建步骤包括:确定本体的专业领域和范畴;复用现有的本体;收集医案书籍,获取糖尿病领域知识;定义糖尿病医案的类、属性及其关系,建立糖尿医案本体;本体的检验;本体的存储。     

领域本体的构建实践

以医学领域内的心瓣膜疾病为例,通过建立概念、概念之间的继承、约束、实例关系表达了心瓣膜疾病的领域知识,并利用Protégé构建心瓣膜疾病本体模型。     

军事医学本体构建的理论问题探讨

军事医学本体构建的理论问题探讨是将本体理论应用于军事医学知识组织的前提,有助于理清军事医学本体构建的相关概念。依据本体所要实现的目标分析军事医学现有术语标准的现状,并剖析军事医学本体构建的难点问题。从军事医学本体构建的相关概念内涵及关系、军事医学本体构建的需求分析、军事医学本体构建的复杂性分析三方面对军事医学本体构建的基本理论问题进行了探讨。     

MeSH和本体在医学知识组织中的应用

介绍知识组织的概念和研究领域,阐明MeSH和本体的概念及其在医学知识组织中的应用特点,论述如何在手术库构建中采用MeSH和本体表达术语进行医学知识组织,服务于广大医学工作者。     

临床实践指南实施性促进研究之七：基于本体的临床实践指南术语体系的对比与分析

目的 通过对临床实践指南已有的术语进行特征分析,学习常用的术语表达方法,为指南本体的研究和构建提供一定的参考。方法 系统检索了UMLS、SNOMED-CT、MeSH主题词表、OBI、schema.org、CMeSH主题词表、中医临床术语系统和中医药一体化语言系统,对指南相关术语进行识别与抽取,分析本体中指南相关术语的分类结构和映射关系。结果 检索得到“指南”“证据等级”和“推荐意见”的术语,分析了术语间的层次关系、概念表征和映射关系。结论 指南相关术语仍需进一步补全完善,规范化和完善的指南术语标准可以消除概念的不确定性,有利于指南的制订,并促进指南证据和推荐意见在不同国家和地区之间的分享与利用。     

中医药文献语义标注系统研究与开发

目的研究和开发支持中医和现代生物医学本体和术语集的语义标注系统。方法以MedPortal本体库和中医临床术语集等为术语资源库,设计语义标注系统工作流程和功能框架,并开发Web应用系统。结果构建了一个基于Web的中医药文献语义标注系统,支持语料库管理与维护、术语词典管理、语义标注和语义检索等功能,既可以为基于机器学习的信息抽取算法研究提供训练集,又能实现语义层面的多来源数据集成与知识融合。结论该中医药文献语义标注系统设计方案已经过实际项目验证,可为其他同类系统研发提供参考。     

基于OWL的中医证候知识建模方法研究

万维网本体语言（Web Ontology Language,OWL）旨在构建内容丰富、逻辑严谨、可在万维网上共享的领域本体,为表达复杂的中医证候知识体系提供了潜在的解决方案。研究探索如何基于OWL对中医证候知识进行建模,提出了针对证候层次结构、证候特征、证候疾病复合概念及“证候加减”的知识建模方法。     

基于本体的孕产知识库构建及应用

将本体、知识库与孕产疾病知识结合构建基于本体的孕产知识库,阐述具体构建步骤,包括明确本体领域范围,列举概念术语,定义类、属性及类之间的关系,创建本体实例等方面,促进孕产知识复用与共享。     

中文中医本体自动扩展的定量研究

目的对利用新的知识源自动扩展中文中医本体进行定量研究。方法基于中医医疗术语及术语间的关系构建实验用的本体,利用中医药学术论文中提及的病例作为知识源扩展本体,并用作测试集来评测本体扩展前后的质量。结果包含41 652个实例的本体可以通过3000个诊次的医疗信息扩展,对真实临床应用出现的疾病名称的覆盖率由52.3%增至72.4%,证候名称覆盖率由14.8%增至55.8%,药物名称覆盖率由13.7%增至54.8%,治法名称覆盖率由25.8%增至77.2%。结论利用学术论文中提及的病例作为新知识源来自动扩展本体可以显著增加本体的覆盖率。     

随机对照试验评价的语义模型研究

目的：将随机对照试验评价的基本理论和知识整合为计算机可识别的语义模型、属性和元数据,为语义网计算机推理提供知识本体.方法：知识本体的建立以国际上公认的随机对照试验评价规范为依据,采用本体编辑工具Protégé构建语义模型的层级结构,定义类、属性及其关系和其他元数据的规范描述.结果：构建了包含一般信息、分类与分级信息和具体评价项目的语义模型,创建了51个语义属性和元数据,13个随机对照研究的评价实例.结论：构建计算机可识别和处理的随机对照试验评价本体,是网络医学文献信息逻辑推理操作的基础,也为医学研究过程提供了随机对照试验文献质量评价的形式化表达和结果推论的参考.     

基于本体方法构建《伤寒论》知识图谱

目的：构建《伤寒论》知识图谱,促进《伤寒论》在临床的应用。方法：结合《伤寒论》注解和古汉语句法抽取原文中的概念,同时提取概念关系,建立概念和关系之间的联系,形成三元组,在此基础上添加实例构建《伤寒论》知识图谱。结果：基于中医领域语言体系结构构建了《伤寒论》概念等级体系、本体框架和知识图谱,以“点边点”的图数据结构形式对《伤寒论》的知识进行阐述,实现了《伤寒论》知识资源的有效整合。结论：基于本体方法构建的《伤寒论》知识图谱,可为临床和科研人员提供决策建议,提高医疗工作者对《伤寒论》的理解水平。     

2013版SNOMED CT顶层概念调整及属性关系

SNOMED CT是结构化的临床术语集。介绍2013年版的SNOMED CT新增顶层概念"SNOMED CT模型组件"及其亚类"连接概念"。概念含义的逻辑表示通过"定义属性"定义,所有可用作"关系类型"的概念都归在"连接概念"下:"|is a|关系"和"概念模型属性"中的59个"属性关系"。并详细说明"关系"如何完整定义概念,以期为构建中医临床术语系统的研究工作提供参考。     

系统化医学术语-临床术语集疾病分类及概念模型研究

介绍系统化医学术语-临床术语集(Systematized Nomenclature of Medicine Clinical Terms, SNOMED CT)概念及应用,阐述SNOMED CT疾病分类与疾病概念模型、6类疾病定义模式以及对我国中医疾病概念模型开发的启示,为我国中医疾病术语集构建提供参考。     

ISO技术规范“中医药学语言系统语义网络框架”的应用研究

中医药学语言系统是一个采用本体方法构建的大型术语系统。"中医药学语言系统语义网络框架"已于2014年成为国际标准化组织(ISO)的一项正式的技术规范,如何实施这一技术规范成为一个重要的问题。本研究采用语义网技术,根据该技术规范构建中医药领域的顶层本体,并进一步实现了用于本体发布的网络服务。该本体对中医药领域最基本的语义类型和语义关系进行了精确描述,可被用于构建符合规范的术语系统和知识库,为ISO技术规范的推广应用提供了一种便捷、可靠的方式。