基因芯片技术在肿瘤研究中的应用

基因芯片又称DNA微阵列(DNA m icroarray)是近年发展起来的一项DNA分析技术,一般包括寡核苷酸芯片和cDNA芯片2种,其基本原理是在固相载体上按照特定的排列方式固定上大量已知的DNA片段,形成DNA微矩阵,将样品DNA/RNA通过PCR/RT-PCR扩增、体外转录等技术渗入荧光标记分子后,与位于芯片上的已知序列杂交,最后通过扫描仪及计算机进行综合分析,比较不同荧光在各点阵的强度,即可获得样品中大量基因表达的信息。基因芯片在一张微小的芯片上能够在同一时间内平行分析大量的基因,进行大量信息的筛选和检测分析。目前研究认为,肿瘤的发生和发展是一个多阶段、多基因参与的复杂过程。正常基因的突变、癌基因的异常激活以及肿瘤抑制基因的失活、基因本身的多效性和机体免疫因素,决定了肿瘤表型的表达与否[1]。基因芯片不仅为研究肿瘤发生发展过程中相关基因的激活和失活提供了强有力的工具,也为肿瘤的诊断和治疗提供了新的武器。1基因芯片用于寻找肿瘤相关基因用cDNA微阵列技术通过比较组织细胞基因的表达谱差异,可以发现新的可能致病基因或疾病相关基因。G ress等[2]从胰腺癌细胞株PATU、胰腺癌组织、慢性胰腺炎及对照胰腺组...     

基因芯片在肿瘤研究中的应用

人类已逐步进入功能基因组时代,基因芯片作为近期发展起来的一项新技术,能够研究细胞内所有基因的表达谱,同时获得成千上万基因活化的模式,并为研究肿瘤发生发展过程中的基因表达情况提供了强有力的工具。本文对基因芯片技术在肿瘤研究中的应用,包括寻找新的肿瘤相关基因,基因表达谱研究、基因功能研究,肿瘤分子病理分型及诊断芯片等方面进行了探讨。     

基因芯片技术及其在肿瘤研究中的应用

生物芯片由美国Affymetrix公司首先开发 ,在短短数年中 ,芯片技术进步迅速 ,并呈现发现高峰。所谓生物芯片是由固定于不同种类支持介质上的高密度的寡核苷酸分子、基因片段或多肽分子的微阵列组成 ,其中每个分子的位置及序列为已知 ,当荧光标记的靶分子与芯片上的探针分子结合后 ,可通过激光共聚焦荧光扫描或电荷耦联摄影像机 (CCD)对荧光信号强弱的检测而判断样本中的靶分子数量 ,以实现对化合物、核酸、蛋白质、细胞及其他生物组分的准确、快速和大信息量的筛检 ,其特点是高度平行性、多样性、微型化和自动化[1] 。按芯片上探针的不同 ,…     

基因芯片技术在肿瘤研究中的应用

基因芯片也称为基因微阵列 (Microarray) ,是近几年发展起来的一项前沿生物技术 [1 ] ,是指采用原位合成或直接点样的方法将 DNA片段或寡核苷酸片段排列在硅片、玻璃等介质上形成微阵列 ,待检样品用荧光分子标记后 ,与微阵列杂交 ,通过荧光扫描及计算机分析即可获得样品中大量的基因序列及表达信息 ,以达到快速、高效、高通量地分析生物信息的目的。基因芯片能将 c DNA文库中的已知和未知序列固定于玻片上 ,可同时检测比较生物样品中多个已知或未知的序列表达状况 ,向研究者报告所要比较样品中的差异基因 ,为进一步有效地进行基因测序和…     

基因芯片在肿瘤治疗研究中的应用

基因芯片技术系指将大量探针分子固定于支持物上后与标记的样品分子进行杂交，通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息。该技术具有较高可行性、多样性．微型化和自动化四太特点，可用于肿瘤的诊断．分型．预期，及相关基因和药物的研究。奉支综合相关文献，对目前基因芯片在肿瘤治疗方面的研究现状进行简要概迷。     

基因芯片及其在肿瘤研究中的应用

基因芯片技术是将成千上万个寡核苷酸序列或cDNA序列规律的排列在1-2cm^2的支持物上,然后将荧光标记的样本DNA／mRNA与芯片杂交,并用计算机对杂交信号作出检测从而研究基因表达谱。目前,基因芯片在肿瘤诊断中的应用主要包括肿瘤的分子学分类,预测肿瘤对某些化疗或激素治疗的敏感性,肿瘤的分期,发现新的治疗靶点等方面。本文还对基因芯片的应用前景作一简要介绍。     

基因芯片技术在中医药防治肿瘤研究中的应用

基因芯片技术已被广泛应用于中医药防治肿瘤的研究。本文归纳总结了近年来,基因芯片技术在肿瘤常见中医证候的物质基础研究、不同中医治法的作用机制研究、中药及其有效成分抗肿瘤的机制研究等领域中的应用情况,并对其中存在的问题及今后的研究前景进行了思考与展望。     

基因芯片在肿瘤个体化治疗中的应用进展

目前临床医生只能依靠用药后肿瘤的缓解率和患者的生存率来获得疗效信息。基因芯片技术的问世使人们找到一种可以在治疗开始前就获得肿瘤对药物的敏感性信息的方法,对肿瘤的生物学特征进行推测,并据此制定出最适合的个体化治疗方案,最大限度的提高肿瘤患者的生存率。本文就此内容作一综述。     

基因芯片技术及其在临床研究中的应用

20世纪 90年代初 ,生物芯片的问世对生物科学的各个领域产生了强大的冲击 ,同时也推动了各领域学科研究的进展。生物芯片 (Ｂｉｏ Ｃｈｉｐ)是通过微加工技术和微电子技术在固相支持物 (或称芯片片基 )上构建微型的生化分析系统 ,借助计算机对检测到的生化反应信号进行搜集、数据整理和分析从而达到对样品大信息量的快速、准确的检测。从理论上讲 ,许多生物分子如蛋白质、糖、脂类、核酸及其它小分子都可以作为芯片上的探针 ,所以生物芯片包含有多种 ,如蛋白芯片、基因芯片、组织芯片以及可在一块芯片上完成一项实验的芯片实验室 (ｌａｂｏ…     

基因芯片技术在垂体腺瘤研究中的应用

基因芯片是能从标本中高通量获取遗传信息的一项新技术。目前，基因芯片已初步应用于垂体腺瘤的发生机制、肿瘤的年龄相关因素及常规治疗的分子机制等方面，增进了人们对于垂体腺瘤的认识。但基因芯片从实验室研究推向临床应用尚需技术上的不断完善。     

基因芯片技术在感染性疾病研究中的应用

基因芯片技术是现代生物研究技术中较为先进的技术之一,以极高的密度将特定的寡核苷酸片段或基因片段排列在片基上,与荧光标记的样本按碱基配对的原理同步杂交,可对基因的序列或功能进行研究。基因芯片技术具有高通量、微型化和较好的可对比性特点,在感染性疾病的检测、诊断、耐药性、致病机制方面的研究不断发展,前景广阔。该文就基因芯片技术在感染性疾病研究中的应用进行综述。     

基因芯片技术在卵巢癌研究中的应用

卵巢癌是一种预后较差的女性生殖道恶性肿瘤。对其发生发展中分子机制及相关基因的研究对于临床上寻找病因、早期诊断及病理分型方面都有重要价值。基因芯片技术以其高通量、高效率的特点在肿瘤研究方面有着无可比拟的优势。本文综述近年来基因芯片技术在卵巢癌中的研究进展,以期对其分子全貌有更深入的了解。     

基因芯片在筛选食管鳞癌相关基因中的应用

目的研究人食管鳞状细胞癌与癌旁正常组织的基因表达谱,通过对比基因表达的差异,寻找与人食管鳞癌发展相关的基因。方法提取人食管鳞癌与正常食管鳞状上皮的mRNA,逆转录成cDNA,并用Cy3-dUTP标记正常食管组织,用Cy5-dUTP标记食管鳞癌组织,制成探针,与基因芯片进行杂交,经扫描仪扫描后,对获取的信号数据进行软件分析、对比。筛选出差异表达的基因。结果在4例新鲜标本的芯片杂交检测中,共发现4329条基因发生差异表达,其中2293条上调,2036条下调,将这些基因按GO（gene ontology）分子功能（function term）进行分类,发现与细胞分化、成熟,分子定位、连接,信号传导,酶活性调节,以及基因转录、翻译调节有关的基因最多。结论①食管鳞癌的发生发展与多条基因的异常表达有关。②应用基因芯片技术可以对食管鳞癌的基因表达谱进行分析,以筛选食管鳞癌相关基因。     

乙型肝炎病毒基因多态性检测芯片的临床应用

目的:评价临床应用乙型肝炎病毒(HBV)基因多态性芯片(中科院上海微系统和信息技术研究所等研制),检测HBV基因前C区1896、1814,基本C区启动子(BCP)1762和1764,P区的YMDD基序552位等的点突变的效能。方法:以该芯片检测49例不同临床类型乙型肝炎病人血清,并对部分血清的PCR扩增产物进行测序分析。结果:HBV前C区1896位在血清HBeAg阳性病例中,野生株、混合(野生/突变)株、突变株和未确定(无杂交信号)的检出率,分别为57.7％,38.5％,0和3.8％;血清抗HBe阳性病例中,相应为33.3％,22.2％,33.3％和11％,后者突变株显著高于前者(P<0.01)。所有病例HBV前C区的1814位均为野生,未检出突变。BCP 1762和1764双突变在慢性重型肝炎和肝炎肝硬化的检出率分别为66.7％和69.2％,显著高于慢性肝炎的19%(P<0.01)。10例拉米夫定治疗6月以上,HBV DNA仍阳性者中,7例检出P区YIDD或YVDD突变,1例兼有YIDD和YVDD突变,余2例无杂交信号。7例1 896,4例BCP,6例YMDD的测序和芯片检测结果一致,6例无信号位点的测序结果显示,这些位点附近,出现了与杂交探针错配的突变。结论:初步结果提示,该芯片适用于临床检测HBV前C区、P区一些已知热点的突变,并可用于研究这些突变与疾病严重性,及产生抗HBV药物耐药间的相互关系。     

基因芯片技术在糖尿病研究中的应用

基因芯片技术是近年来兴起的一种分子生物学技术。它通过对个体在不同生长发育阶段或不同生理状态下大量基因表达的平行分析,研究相应基因在生物体内的功能,阐明不同层次多基因协同作用的机理,进而在糖尿病的发病机理、诊断治疗、药物开发等方面的研究中发挥巨大的作用。     

基因芯片技术及其在医学领域的应用

基因芯片是在固体介质上有序固定上特定的可寻址的核酸分子而形成的核酸微阵列.该技术能一次检测大量的目标分子,是一个高效率和大规模的基因组分析和基因表达研究的技术,可以用于基因表达检测、遗传性疾病诊断、肿瘤相关基因筛选、疾病病原体检测、法医学鉴定等多个方面.     

蛋白芯片法检测恶性胸腹水肿瘤标志物的临床应用价值

目的探讨多肿瘤标志物蛋白芯片技术检测对良、恶性胸腹水的鉴别诊断价值。方法检测100例患者的胸腹水癌胚抗原(CEA)、甲胎蛋白(AFP)、癌抗原125(CA125)、癌抗原153(CA153)、糖链抗原199(CA199)、糖链抗原242(CA242)、前列腺特异性抗原/游离前列腺特异性抗原(PSA/f-PSA)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、人绒毛膜促性腺激素β(β-HCG)、生长激素(HGH)、铁蛋白(FerritinFe)水平,并对检测数据进行统计学分析。结果良恶性组标本的胸腹水NSE、PSA/F-PSA含量比较,差异无统计学意义(P0.05),而两组另9种肿瘤标志物含量比较,差异有统计学意义(P0.05)。胸腹水多肿瘤标志物蛋白芯片检测系统在鉴别良恶性胸腹水诊断中的敏感性、特异性均高于常规检验。结论检测胸腹水肿瘤标志物有助于良、恶性胸腹水鉴别诊断。     

基因芯片数据特征选择法研究

对当前基因芯片数据的特征选择算法、效能进行综述并比较其优劣性,指出从特征自身特点出发的特征选择法可获得较好的分类效能和生物医学应用,同时也可为致病基因的寻找提供重要依据。     

Survivin基因与人类肿瘤

Survivin是一种新的凋亡抑制蛋白，在正常成人组织的表达仅见于胸腺和生殖腺，而在多数人类肿瘤细胞中高表达．对Survivin基因在人类肿瘤的早期诊断、预后判断及基因治疗方面的研究进行综述．     

多肿瘤标志物蛋白质芯片在检测胆管癌中的应用

目的 研究多肿瘤标志物蛋白质芯片在检测胆管癌中的应用。方法 对60例梗阻性黄疸患者于手术前采集静脉血2ml进行多肿瘤标志物蛋白质芯片诊断系统检测。经手术及病理学证实。其中胆管癌32例、胆管良性病变28例。结果 60例患者中，糖类抗原19-9(CA19-9)和糖类抗原242(CA242)同时阳性者31例。其中胆管癌患者26例，其CA19-9大于500U／ml者23例；胆管良性病变者5例，其中1例CA19-9大于500U／ml。当CA19-9和CA242同时阳性时，诊断胆管癌敏感性为81．3％，特异性为82．1‰。结论 应用多肿瘤标志物蛋白质芯片诊断系统检测胆管癌，当CA19-9和CA242同时阳性时，敏感性和特异性均较好，可作为临床诊断胆管癌的筛查指标。