肠道腺瘤性息肉和结直肠癌患者肠道菌群变化及其差异

目的探讨肠道腺瘤性息肉和结直肠癌患者肠道菌群变化及其差异。方法回顾性分析2018年7月至2019年12月于南阳市第二人民医院接受治疗的110例患者临床资料,根据疾病类型分为A组(50例,肠道腺瘤性息肉)、B组(30例,Ⅰ期、Ⅱ期结直肠癌)、C组(30例,Ⅰ期、Ⅱ期结直肠癌合并肠道腺瘤性息肉),以50例健康体检者为D组。分析4组肠道菌群多样性指数及前3组患者肠道菌群结构丰度。结果 A、B、C组患者Chao指数、shannon指数均低于D组,C组低于A、B组,B组低于A组,差异有统计学意义(均P<0.05)。C组变形菌门、放线菌门、梭杆菌门水平丰度值高于A、B组,B组高于A组,差异有统计学意义(均P<0.05)。C组厚壁菌门、拟杆菌门水平丰度值低于A、B组,B组低于A组,差异有统计学意义(均P<0.05)。结论肠道腺瘤性息肉、早期结直肠癌、早期结直肠癌合并肠道腺瘤性息肉患者与健康人群在菌群多样性上存在差异,发生肠道癌变患者Chao指数、shannon指数下降,且癌变患者可见厚壁菌门、拟杆菌门水平丰度值低,而变形菌门、放线菌门、梭杆菌门水平丰度值高。     

中老年痰湿质人群肠道菌群结构特征研究

目的 探究中老年痰湿质与平和质人群肠道菌群样品在物种分类、丰度及多样性等方面的差异,找出中老年痰湿质人群肠道的特征功能菌群,以期为痰湿质与代谢性疾病相关性研究提供肠道微生物层面的依据。 方法 选择于2017年5月—12月在浙江医院中医内科就诊或体检中心行健康体检的人群为研究样本,通过中医体质辨识软件结合专业人员辨证,纳入痰湿质与平和质各30人,采集粪便样品并对其总RNA进行提纯,用Miseq测序仪进行基于16SrRNA的生物多样性测序,利用R(v3.1.1)软件对样品的物种分类、丰度、多样性及组间差异等进行统计分析。 结果 ①各样品间菌群构成及相对丰度均存在差异,但主要构成菌种均为拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)及放线菌门(Actinobacteria)。②痰湿质组的observed species指数、chao指数、ACE指数及shannon指数均小于平和质组(均P<0.05),simpson指数大于平和质组(P<0.05)。③痰湿质组拟杆菌门(38.439±13.545)相对丰度低于平和质组(46.669±12.984),厚壁菌门(52.802±13.861)相对丰度高于平和质组(45.742±12.990),差异有统计学意义(均P<0.05)。 结论 痰湿质人群肠道菌群的丰度及多样性均显著降低;拟杆菌门相对丰度降低及厚壁菌门相对丰度升高为痰湿质人群肠道菌群的重要结构特征。      

宁波地区人群肠道菌群的特点及对结直肠癌与癌前病变发生和发展的影响

目的 探讨肠道细菌在健康人类、大肠肿瘤患者和大肠息肉患者之间的差异,分析微生物对大肠息肉及大肠肿瘤的发生、进展的影响。 方法 样本来源于常规做肠镜检查患者的粪便以及术前愿意参加实验的患者,分为3大组:肠镜检查健康组、息肉组和大肠腺癌组,同时以高血压为独立的考察因素,健康组和息肉组又各分为高血压和非高血压2个亚组,样本经过DNA提取后,16SrRNA基因全长扩增和V3、V4区PCR扩增,采用DGGE预评判提取DNA质量,采用高通量测序技术分析各样本中细菌的种类和丰度,并通过主成分分析探讨不同分组患者肠道细菌的多样性和群落结构差异。 结果 不同分组患者的肠道细菌具有较高的多样性,在获得的所有OTUs中,厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、梭杆菌门分别占44.9%、28.4%、18.6%和5.5%,这4门的OTUs累计占97.4%。这些构成了大多数样本中的优势菌,但不同样本中优势细菌的组成有显著的区别。各分组的多样性指数统计分析发现,不同组之间的多样性指数差异不显著。健康人肠道细菌群落结构与肿瘤患者有着显著差异,结肠息肉患者的肠道细菌群落结构与健康人群的肠道细菌群落结构差异显著。健康组中非高血压和高血压组的肠道细菌群落结构差异无统计学意义,结肠息肉组中非高血压和高血压组的肠道细菌群落结构差异无统计学意义。 结论 肠道菌群的变化可能影响或导致结肠息肉和结肠肿瘤的发生、发展,观察肠道菌群的变化有助于研究结肠癌发展的微环境及机制,而高血压对健康人和肠道息肉患者的肠道菌群变化的无显著影响。      

基于16S rDNA测序分析功能性便秘婴幼儿的肠道菌群组成

目的：探讨16S rDNA测序分析功能性便秘婴幼儿肠道菌群的结构与组成,为临床治疗提供依据。方法：选取2020 年1月至12 月湖州市妇幼保健院门诊就诊的功能性便秘婴幼儿17 例作为便秘组,正常婴幼儿15例作为对照组,收集粪便,采用16S rDNA扩增子测序的方法检测2组婴幼儿肠道菌群的组成并分析其结果。结果：2组肠道菌群Alpha多样性差异无统计学意义（P ＞0.05）,但Beta多样性差异有统计学意义（P ＜0.01）。在门水平中放线菌门、厚壁菌门、变形菌门是2组儿童肠道微生物群落中最丰富的菌群,其中疣微菌门在便秘组中丰度高于对照组（P ＜0.05）。在属水平中,双歧杆菌为2组优势菌种,乳酸菌属与阿克曼菌属在便秘儿童肠道中的丰度高于对照组（P ＜0.05）。便秘组中双歧杆菌种、疣微菌门、阿克曼菌属、副干酪乳杆菌的丰度差异有统计学意义,而对照组齿双歧杆菌、放线菌目、放线菌科、放线菌属、鼠李糖乳杆菌的丰度差异有统计学意义（均P ＜0.05）。结论：功能性便秘婴幼儿存在肠道菌群结构和多样性的改变,便秘与肠道菌群之间可能存在相关性。     

免疫性肝损伤大鼠肠道菌群的变化及肠黏膜屏障损伤研究*

目的: 探讨免疫性肝损伤大鼠肠道菌群及肠黏膜屏障变化。方法: 利用卡介苗(BCG)诱导建立免疫性肝损伤模型,观察大鼠肝组织的病理学改变,检测血清谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、二胺氧化酶(DAO)和D-乳酸(D-LA)水平,并留取粪便进行肠道菌群16S rDNA测序分析。结果: 模型组大鼠肠道菌群多样性较对照组显著升高(P＜0.05)。门水平上,两组的优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes),正常对照组分别占59.50 %和37.90 %,造模组中依次占47.92 %、46.84 %,门水平肠道菌群构成差异分析,模型组厚壁菌门丰度明显降低,差异有统计学意义(P＜0.05);变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)与对照组相比丰度增加,差异有统计学意义(P＜0.05)。属水平肠道菌群构成差异分析,丰度较高的前20个菌属中,模型组乳酸杆菌属(Lactobacillus)、毛螺旋菌属(Lachnospiraceae)丰度均低于对照组,差异具有显著性(P＜0.05)。模型组瘤胃球菌属(Ruminococcaceae)、拟普雷沃菌属(Alloprevotella)、布劳特氏菌(Blautia)、帕拉普氏菌属(Paraprevotella)丰度均高于对照组(P＜0.05)。结论: 卡介苗所致急性肝损伤大鼠存在肠道细菌过度生长,厚壁菌门及乳酸杆菌属丰度明显下降,变形菌门、放线菌门丰度升高,存在肠道菌群结构失衡,肠道屏障受损。     

野生树鼩与人工饲养树鼩消化道不同部位微生物组成的比较研究

目的以树鼩为研究模型,探讨野生树鼩与人工繁育树鼩不同肠段的菌群组成。方法分别收集3只健康野生及人工繁育树鼩七个胃肠段样本,提取细菌总DNA,采用高通量测序技术对16S rRNA基因的V3-V4高变区测序,分析比较菌群结构及多样性。结果不同肠段Alpha指数多样性分析显示野生组与人工繁育组树鼩在盲肠和胃Shannon指数存在显著差异(P0. 05)。野生组与人工繁育组各肠段微生物组成存在较大差异,门水平上,野生组直肠、结肠、盲肠及胃四个部位中Firmicutes菌门的平均占比显著高于人工繁育组(P0. 05);人工繁育组直肠、结肠、盲肠及回肠内Spirochaetes菌门的平均占比显著高于野生组(P0. 05);野生组直肠内Bacteroidetes菌门的平均占比显著高于人工繁育组(P0. 05);属水平上,野生组明显高于人工繁育组的主要菌属为:回肠、空肠和胃内的Weissella菌属,直肠内的Bacteroides菌属以及回肠段内的Lactococcus菌属;人工繁育组明显高于野生组的主要菌属为:直肠、结肠、盲肠及回肠内的Brachyspira属,盲肠和胃内的Prevotella_9菌属,盲肠和空肠内的Streptococcus属以及回肠中的Lactobacillus菌属。不同肠段菌群功能基因预测显示两组共有5个解剖部位17个基因类别之间的差异有统计学意义(P0. 05)。结论野生树鼩与人工繁育树鼩各肠段菌群组成差异较大;各肠段细菌功能差异较大,且与其生理功能、饮食结构有一定关联;在肠道菌群研究中,应充分考虑粪便样品微生物的组成是否能够完全代表肠道微生物的组成。     

代谢综合征患者肠道菌群特征探析

目的分析代谢综合征(MS)患者肠道菌群的特征。方法选取26例MS患者为观察组,32例健康人群为对照组,运用PCR技术检测研究对象的肠道菌群,分析两组研究对象肠道菌群的特征差异。结果两组样品肠道菌群β多样性具有差异。观察组的菌群多样性指数(Ace指数和Shonnon指数)、瘤胃球菌属及毛螺菌属丰度低于对照组,芽孢杆菌属、梭菌属、普雷沃氏菌属、巨单胞菌属、肠球菌属丰度高于对照组(均P<0.05)。结论 MS患者肠道菌群的多样性及特定菌群丰度与健康人群存在差异,差异菌群集中在厚壁菌门(包括芽孢杆菌属、梭菌属)、普雷沃氏菌属、巨单胞菌属、肠球菌属、瘤胃球菌属、毛螺菌属等,肠道菌群失调可能与MS的发生和发展有关。     

高通量测序分析结肠腺瘤患者肠道黏膜菌群的构成变化

目的 探讨结直肠癌发展早期肠道菌群的变化规律.方法 通过结肠镜活检收集31例结肠腺瘤患者的腺瘤组织以及20例健康志愿者的肠道黏膜,提取基因组DNA,对细菌16SrRNA基因序列V3～V4高变区进行PCR扩增,lluminaMiSeq平台上高通量测序分析.结果 结肠腺瘤患者的肠道黏膜菌群多样性比健康对照人群显著增高(P＜0.01),腺瘤组黏膜菌群结构和健康对照者相比差异显著.门水平上:结肠腺瘤组变形菌门明显增多(P＜0.01),厚壁菌门/拟杆菌门比值下降.属水平上:结肠腺瘤组乳球菌属、链球菌属和假单胞菌属增多(P＜0.01),而肠球菌属,杆菌属丰度明显下降(P＜0.01).不同病理类型腺瘤比较发现:结肠高级别和低级别上皮内瘤变组肠道黏膜菌群整体结构相似,埃希菌-志贺菌属在高级别上皮内瘤变组呈现上升趋势,但差异无统计学意义(P＞0.05).结论 结肠腺瘤患者肠道菌群多样性和构成与正常健康人存在明显差异,腺瘤患者黏膜菌群结构发生明显失衡,形成了易于肿瘤生长的肠道微生态环境.     

中医辨证远程智能护理对肠内营养相关性腹泻患者生活质量和肠道菌群的影响

目的 探讨中医辨证远程智能护理对肠内营养相关性腹泻(ENAD)患者生活质量和肠道菌群的影响。方法 选取82例ENAD患者作为研究对象,随机分为对照组和观察组,每组41例。给予对照组常规延续护理,给予观察组中医辨证远程智能护理,两组均连续干预3个月。比较干预前后两组肠道菌群(厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门)相对丰度、肠道菌群Alpha多样性(Chao、Simpson、Shannon、Ace指数)和肠道菌群Beta多样性(菌群整体结构),以及胃肠道生活质量指数(GIQLI)评分。结果 干预后,两组患者变形菌门、放线菌门相对丰度,Simpson指数均较干预前降低,厚壁菌门、拟杆菌门相对丰度,Chao、Shannon、Ace指数均较干预前升高,且观察组上述指标改善程度均优于对照组(均P<0.05);观察组和对照组肠道菌群整体结构相差较大,菌种发生明显分离;两组患者GIQLI评分较干预前升高,且观察组GIQLI评分高于对照组(均P<0.05)。结论 相比于常规延续护理,中医辨证远程智能护理可更好地调节ENAD患者肠道菌群,提高患者生活质量。     

甲亢患者肠道微生态的特征

目的 探讨甲亢患者肠道菌群的特征。方法 以15例甲亢患者作为甲亢组,15例健康志愿者作为对照组。采用Illumina Miseq高通量测序平台对甲亢组和对照组新鲜粪便样本中所有细菌的16S rRNA (16S ribosome RNA)-V3区进行DNA测序,分析操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)数量,分析肠道菌群物种的丰度,并进行聚类分析和代谢通路相关性分析。结果 样本稀疏曲线表明测序深度充分,物种多样性分析显示OTU值为24 578,微生物丰度较高,测序覆盖深度(Coverage指数)>0.99。与对照组相比,在属水平,甲亢组肠道菌群的3个丰度指数(Ace、Sobs和Chao)均低于对照组(P<0.05),2个多样性指数(Shannon和Simpson)分别低于和高于对照组(P<0.05)。30份样品共检测到13个菌门,均以厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和变形菌门占优势,差异无统计学意义。在属水平,共检测到246种菌群,对照组含有51种特有菌群,而甲亢患者肠道菌群种类显著减少,仅含有7种特有肠道菌群。甲亢组的直肠真杆菌属丰度明显低于对照组(P<0.05),ROC曲线的曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.72。在同与免疫有关的功能代谢的相关性分析中,发现直肠真杆菌属与上皮细胞的细菌侵入这一代谢通路呈负相关(r=-0.367,P=0.046)。结论 甲亢患者肠道菌群的丰度和多样性下降,直肠真杆菌属是甲亢患者区别于健康人的明显差异菌,直肠真杆菌属丰度的降低可能与甲亢免疫机制相关。菌群的定量分析可能早期预测甲亢。     

基于16S rRNA基因测序的黄褐斑病人肠道菌群差异研究

目的：利用新一代16S rRNA测序技术比较黄褐斑病人与健康人的肠道菌群多样性和细菌表型差异。方法：纳入30例黄褐斑病人为研究组,以20名正常人作为健康对照,测序分析粪便样品中细菌群落的结构组成和表型特征。结果：研究组肠道微生物群落丰度、多样性相对降低。研究组拟杆菌门、拟杆菌纲、拟杆菌目、普雷沃菌科、拟杆菌科、普雷沃氏菌、拟杆菌属等丰度显著降低,而厚壁菌门、放射菌门、放线菌纲、乳杆菌目、双歧杆菌目、毛螺菌科、布劳特氏菌等升高,差异均有统计学意义(P<0.05～P<0.01)。结论：黄褐斑病人与健康人肠道菌群存在一定差异。     

长蛇灸治疗脾肾阳虚型功能性腹泻的临床研究

【目的】观察长蛇灸疗法对脾肾阳虚型功能性腹泻患者的临床疗效及对肠道菌群的影响。【方法】将60例脾肾阳虚型功能性腹泻患者随机分为观察组和对照组,每组各30例。观察组给予长蛇灸治疗,每周1次,连续治疗4周。对照组给予四神丸合附子理中丸治疗,每次各9 g,每日2次,7 d为1个疗程,共治疗4个疗程。评价2组临床疗效,比较2组患者治疗前后各项中医症状积分及症状总积分的变化情况,以及观察组患者肠道菌群物种丰度、Alpha多样性指数、优势菌群、菌群分布及治疗前后群落差异等指标。【结果】(1)观察组总有效率为73.33%,对照组为56.67%。观察组疗效优于对照组(P<0.05)。(2)治疗后,2组患者的各项临床症状积分均明显改善,但差异无统计学意义(P>0.05);治疗后,2组患者症状总积分明显改善(P<0.05),且观察组优于对照组(P<0.05)。2组患者治疗前后症状总积分差值比较,观察组优于对照组(P<0.05)。(3)治疗前后能够检测到的比例在1%以上的肠道菌群共有5个门,即拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门、放线菌门、梭杆菌门。其中长蛇灸疗法治疗后梭杆菌门的相对丰度明显高于治疗前(P<0.05),其他菌门相对丰度值治疗前后比较,差异无统计学意义(P>0.05)。(4)治疗后观察组毛螺菌属、嗜血杆菌属、萨特氏菌属相对丰度值明显低于治疗前,而梭杆菌属相对丰度值明显高于治疗前(P<0.05)。(5)观察组属分类水平物种丰度聚类热图结果显示:普雷沃氏菌属、拟杆菌属、栖粪杆菌属在各样本中丰度较高;患者治疗前后样本肠道菌群的优势菌群存在明显区别。(6)观察组患者治疗后Observed species指数较治疗前下降(P<0.05),治疗前后Chao1指数、Shannon指数、Simpson指数和PD whole tree指数变化无统计学意义(P>0.05)。(7)Beta多样性检测显示,治疗前5个样本分布比较集中;治疗后3个样本较集中、2个样本分布离散,可能是由于个体差异的存在,治疗对不同个体的肠道菌群结构的作用也存在一定差异。(8)观察组治疗后毛螺菌科梭菌属较治疗前显著升高,梭菌科梭菌属、毛螺菌属以及厚壁菌门梭菌目菌属均较治疗前显著下降。(9)2组患者中仅有1例患者在长蛇灸治疗后出现了少量局部的水泡,其余患者均无不良反应发生。【结论】长蛇灸疗法治疗脾肾阳虚型功能性腹泻具有良好的临床疗效,其疗效可能是通过改善肠道菌群结构来实现的。     

基于16S rRNA基因测序的四妙散加减方治疗痛风性关节炎的作用机制研究

目的 研究四妙散加减方治疗痛风性关节炎患者前后肠道菌群结构和丰度的差异,阐释治疗措施与肠道微生物种群的关联性。方法 将2020年5月-2022年5月符合纳入标准的痛风患者采用四妙散加减方治疗,收集治疗前后的粪便组织样本,采用高通量测序的技术对痛风患者肠道菌群中的16S rRNA V3-V4 区进行基因测序,将得到的结果进一步进行生物信息学的分析,比较各种菌群的群落结构及多样性。结果 共入选15例患者。α多样性方面,Kruskal-Wallis方法结果显示,A治疗前组Shannon指数低于B治疗后组(P<0.05),Observed OTU、Faith"s PD和chao1指数虽然也是降低的但无统计学差异；β多样性方面,主坐标分析显示,第1主成分的贡献度为12.5%,第2主成分的贡献度为8.5%；Permanova分析显示T=1.764,P= 0.005,分组有意义。与治疗前相比,治疗后含有Firmicutes(厚壁菌门)、Proteobacteria(变形菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门)和Fusobacteri(梭杆菌门)的比例减少,而Actinobacteria(放线菌门)的比例增多。结论 采用四妙散治疗痛风性关节炎患者前后的肠道菌群存在一定的差异性,为四妙散加减方辨证治疗痛风性关节炎的相应机制提供依据,为中医药治疗痛风性关节痛提供全新的思路。     

性早熟儿童肠道菌群结构特征分析

目的 分析性早熟儿童肠道菌群结构特征,探寻肠道菌群与儿童性早熟之间的关系,探讨儿童性早熟与肥胖之间的联系。方法 纳入2018年9月～2019年10月于江苏大学附属医院就诊的性早熟儿童,分为治疗前、后组,选择同期于笔者医院体检的单纯性肥胖儿童及体重指数(body mass index, BMI)正常的健康儿童分别为肥胖组及对照组,收集各组儿童新鲜粪便标本,应用16S rRNA高通量测序分析其肠道菌群结构特点,采用问卷调查的形式调查分析纳入研究的各组儿童饮食习惯,性早熟组住院按照临床路径管理完成性激素等检查。结果 代表肠道菌群丰富度指数Ace指数,Chao1指数在性早熟治疗前组均明显低于对照组(P<0.05),而与肥胖组之间比较差异无统计学意义(P>0.05);性早熟治疗后组Ace指数及Chao1指数明显高于治疗前组,多样性指数Shannon指数比较,差异无统计学意义。对各组儿童肠道菌群门水平分布研究显示,性早熟治疗前组拟杆菌门丰富度较对照组明显升高,而厚壁菌门、放线菌门及疣微菌门丰富度明显下降(P<0.05),且与肥胖组比较差异无统计学意义。各组儿童肠道菌群属水平分布显...     

基于16S rRNA测序对2型糖尿病患者肠道菌群特征的分析

目的 分析比较2型糖尿病患者(T2D)与正常人群肠道菌群结构、丰度及多样性的差异。方法 收集30例临床粪便样本(健康样本15例为研究组,2型糖尿病病例样本15例为对照组),应用Illumina MiSeq高通量测序技术进行Alpha、Beta多样性分析,比较研究组和对照组肠道菌群丰富度和多样性以及两组间的肠道菌群差异。采用Tax4Fun软件进行差异菌群功能预测。结果 研究组和对照组OTU共有1 565个,其中两组共有OTU为767个。与对照组比较,研究组肠道菌群α多样性下降;Unweighted Unifrac距离显著降低,差异有统计学意义(P<0.05),β多样性存在差异。在门水平上,研究组中厚壁菌门(Fimicutes)、变形杆菌门(Proteobacteria)的相对丰度明显高于对照组,而拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线杆菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobiota)相对丰度低于对照组。在属水平上,研究组克雷伯氏菌(Klebsiella)、普拉梭菌(Faecalibacterium)的相对丰度明显高于对照组,狄氏副拟杆菌(P...     

树鼩大肠内容物细菌的群落多样性分析

目的应用高通量测序技术分析树鼩大肠细菌的结构与组成。方法采集3只雄性树鼩大肠内容物,用细菌16Sr DNA通用引物扩增V3~V4区,采用Illumina PE250平台测序。结果共获得160 157条有效序列,聚类后得437个运算分类单位(operational taxonomic units,OTUs)。树鼩大肠中的细菌有9个门、19个纲、37个目、68个科、137个属和194个种。其中,(1)厚壁菌门和变形菌门的丰度最高,分别为63.30%和28.52%;(2)优势纲是芽孢杆菌纲和γ-变形菌纲(51.46%、28.02%);(3)乳杆菌目和肠杆菌目的丰度最高,为45.33%和27.51%;(4)优势科是乳杆菌科(35.30%)和肠杆菌科(27.51%);(5)乳杆菌属和埃希氏菌属为优势属(35.30%、27.49%);(6)在种的水平,可培养细菌的丰度为37.10%,未分类细菌27.69%,不可培养细菌35.21%。可培养细菌中,唾液链球菌的丰度最高(26.66%)。在丰度最高的20个种中,8种细菌(40%)未分类,为以往未被发现的新种。个体间细菌群落存在一定差异。结论树鼩大肠内容物中的细菌组成具有丰富的多样性,其中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的细菌,需要进一步研究。     

PCOS和输卵管因素不孕患者肠道菌群特征分析

摘要：目的 探讨PCOS和输卵管因素不孕与健康育龄期女性肠道菌群特征之间的差异。方法 收集2020年9月-2020年12月于兰州大学第一医院生殖中心就诊且符合纳入标准的30列不孕症患者为研究对象,分为多囊卵巢综合征（polycystic ovary syndrome,PCOS）不孕患者（P组,n=20）和输卵管因素不孕患者（T组,,n=10）,收集同期于同所医院行备孕检查的健康育龄期女性为对照组（H组,n=10）。收集各研究对象粪便及血液样品,采用16s rRNA检测技术分析三组研究对象肠道菌群的组成特征及与临床参数之间的关系。结果 与H相比,P组和T组肠道菌群结构发生显著改变,表现为Shannon指数升高,Observed-species、Chao1指数降低但差异均无统计学意义（P＞0.05）。在门水平,与H组相比,P组和T组厚壁菌门、放线菌门丰度明显降低（P＜0.05）,拟杆菌门、变形菌门丰度明显升高,以P组升高更为显著（P＜0.05）。与T组相比,P组厚壁菌门丰度降低、变形菌门丰度升高（P＜0.05）。Spearman分析P组:厚壁菌门与FSH,拟杆菌门与TC,变形菌门与T,放线菌门与TC、HOMA-IR,疣微菌门与E2均呈正相关性,且相关性均具有统计学意义（P＜0.05）;厚壁菌门与TC、脱硫杆菌门与FPG、梭杆菌门与HOMA-IR均呈负相关,相关性均具有统计学意义（P＜0.05）。T组：酸杆菌门与HOMA-IR、FPG,弯曲菌门与HOMA-IR、FINS、LH/FSH,未分类菌门与TG、WHR,厚壁菌门与E2均呈正相关性,相关性同样均具有统计学意义（P＜0.05）。结论 与健康对照组相比,PCOS和输卵管因素不孕患者肠道菌群结构显著紊乱,且与糖、脂代谢存在相关性,以PCOS组更为显著,肠道菌群结构紊乱可能是促进或加重PCOS及输卵管功能障碍疾病发生发展的重要环节之一。     

强化期抗结核治疗对肺结核患者肠道菌群的影响

目的 探讨肠道菌群多样性及丰度在抗结核治疗强化期的变化。方法 收集广州市胸科医院20例初治菌阳肺结核患者使用强化方案治疗1周及强化期结束的粪便标本,所有标本进行16S rDNA测序,进行生物信息学分析。结果 强化期结束治疗组的Alpha多样性指标Chao1和observed_otus指数分别为（97.8±28.3）和（97.6±28.2）,高于治疗1周组的（81±34.7）和（81±34.7）,差异有统计学意义（P=0.04;P=0.038）。基于加权和未加权Unifrac距离的PCoA分析显示两组整体菌群结构无明显差异。在相对丰度较高的菌科中,强化期结束治疗组的拟杆菌科、肠球菌科、肠杆菌科、丹毒菌科、卟啉单胞菌科、双歧杆菌科等相对丰度下降,毛螺菌科、梭杆菌科、普氏菌科、瘤胃球菌科、韦氏菌科等相对丰度增加。通过线性判别分析效应量LEfse分析两组数据,发现在属水平上,厚壁菌门的瘤胃球菌、乳杆菌及放线菌门的柯林氏菌为组间显著差异菌种。结论 强化期治疗结束与治疗1周相比,肠道菌群多样性增加,但肠道菌群结构无明显差异。肠道拟杆菌科丰度减少,毛螺菌科丰度增加。     

亚健康状态人群肠道菌群结构明显失调：基于某医院150例护理人员分析

目的 探索亚健康状态人群（SHS）和健康人群之间肠道菌群是否存在差异。 方法 于2020年11月~2021年5月选取南方医科大学南方医院工作的护理人员150例作为研究对象,其中亚健康人群75例为亚健康组（SHS组）,选择75例同期健康人群作为对照组（H组）。针对16S rRNA基因的V3-V4区采用高通量测序技术,对测序结果进行多样性和物种组成差异分析。 结果 α多样性分析显示,Chao1指数在SHS组和H组间差异无统计学意义（P=0.619）,SHS组的Shannon指数升高且2组之间差异有统计学意义（P<0.001）;β多样性分析显示,2组间肠道菌群组成结构上差异具有统计学意义（R=0.227,P=0.001）;在门水平上2组均主要由拟杆菌门（Bacteroidota）、厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteriota）组成;在属水平均主要由普雷沃菌属（Prevotella）、拟杆菌属（Bacteroides）、布劳特氏菌属（Blautia）、栖粪杆菌属（Faecalibacterium）组成;物种差异分析表明,2组在4个门3个纲3个目3个科3个属的相对丰度差异有统计学意义（P<0.05）。结论 与健康人群相比,亚健康状态人群肠道菌群结构明显失衡。     

神曲消食口服液对肠道微生态影响的动物研究

目的 探讨神曲消食口服液治疗儿童消化不良的机制。方法 采用盐酸林可霉素灌胃C57小鼠进行小鼠消化不良造模,灌胃给药“妈咪爱”或神曲消食口服液进行治疗,正常组灌胃等体积的无菌生理盐水。利用16S r DNA高通量测序技术,检测各组小鼠肠道菌群多样性变化。结果 与空白组相比,模型组小鼠体重显著降低(P0.05)。高通量测序结果显示,与空白组相比,模型组小鼠肠道微生物多样性指数降低(Shannon指数,P0.05),在门和属的水平上,肠道微生物多样性均降低。经神曲消食口服液治疗后,小鼠体重明显增加(P0.05),肠道微生物多样性指数升高(Shannon指数,P0.05),肠道微生物多样性增加。在门的水平上,硬壁菌门(Firmicutes)丰度增加(P0.05),变形菌门(Proteobacteria)丰度降低(P0.05)。在属的水平上,小鼠肠道内益生菌乳酸杆菌属(Lactobacillus)的丰度增加(P0.05),有害菌巴氏杆菌属(Pasteurella)的丰度显著降低(P0.05)。结论 采用神曲消食口服液治疗能增加小鼠肠道菌群多样性,恢复小鼠肠道微生态平衡。神曲消食口服液治疗儿童消化不良可能与肠道乳酸杆菌增加有关。