线粒体DNAD-loop基因多态性与肾透明细胞癌患者发病年龄的关系研究

目的探讨线粒体DNA D-loop(mt DNA D-loop)基因多态性与肾透明细胞癌患者(CCRCC)发病年龄的关系。方法采用聚合酶链反应(PCR)对59例CCRCC患者的mt DNA D-loop区进行扩增并测序。将mt DNA D-loop区的测序结果与线粒体文库中的剑桥序列(r CRS)比对进行单核苷酸多态性(SNP)分析。单核苷酸多态性与患者发病年龄关系的分析采用Kaplan-Meier方法,组间比较采用Log-rank检验,多因素分析采用Cox比例风险回归模型。结果单因素分析显示,高TNM分期组患者的发病年龄低于低TNM分期组;肿瘤直径≥5 cm的患者发病年龄低于肿瘤直径<5 cm的患者(均P<0.05),单核苷酸多态位点16293A/G基因型与发病年龄有关,多态位点16293G基因型患者的发病年龄明显早于16293A基因型患者(P<0.05)。多因素分析显示,TNM分期高低、肿瘤直径大小、16293位点的多态性是影响肾透明细胞癌患者发病年龄的独立危险因素。结论线粒体DNA D-loop区基因多态性可作为肾透明细胞癌患者发病年龄的预测因素,同时线粒体DNA D-loop区基因多态性有助于识别早发的肾透明细胞癌。     

信号转导和转录激活因子4基因多态性与类风湿关节炎发病的相关性

目的探讨信号转导和转录激活因子4（STAT4）基因多态性与类风湿关节炎发病的相关性。方法以聚合酶链反应连接酶检测反应（PCR-LDR）法对139例RA患者和139名正常对照组进行STAT4基因rs7574865位点的SNP分型,比较各基因型及等位基因频率在正常人群和RA患者中的差异。结果 RA组STAT4 rs7574865各基因型分布频率与正常对照组有明显差异（P〈0.05）,T型和G型等位基因频率在RA组与正常对照组比较有显著差异（P〈0.01,OR1.658,95%可信区间为1.154～2.383）。结论 STAT4 rs7574865位点GT/TT基因型与RA发病具有相关性,STAT4基因rs7574865位点T等位基因为RA患者的易感基因。     

线粒体DNA D-环区单核苷酸多态性与胃癌发病年龄的关系研究

背景 胃癌发病率和死亡率长期居高不下,防控形势严峻,且发病年龄逐渐年轻化,但目前关于胃癌发病年龄预测因素的研究报道较少。 目的 探讨线粒体DNA D-环区（D-Loop区）单核苷酸多态性（SNPs）与胃癌患者发病年龄之间的关系。 方法 选取2007年7月至2008年12月在河北医科大学第四医院消化内科经胃镜病理证实的胃癌患者150例为研究对象,提取胃癌患者外周血中的线粒体DNA,采用聚合酶链反应（PCR）扩增目的片段,并进行线粒体DNA D-Loop区测序。采用Kaplan-Meier法绘制胃癌患者发病年龄的生存曲线,比较采用Log-rank检验;采用多因素Cox比例风险回归分析探究胃癌患者发病年龄的影响因素。 结果 不同分化程度患者发病年龄比较,差异有统计学意义（P<0.05）。Log-rank检验结果显示,153G基因型患者的发病年龄〔（48.0±5.3）岁〕早于153A基因型患者〔（60.1±0.8）岁〕（χ2=7.757,P=0.005）。多因素Cox比例风险回归分析结果显示,线粒体DNA D-Loop区SNPs位点153A/G是预测胃癌患者发病年龄的影响因素〔HR=0.323,95%CI（0.140,0.745）,P=0.008〕。 结论 线粒体DNA D-Loop区SNPs位点153A/G或许可以作为胃癌发病年龄的新型预测指标,通过分析线粒体DNA D-Loop区的多态性,可以帮助识别早发的胃癌患者。     

线粒体D-loop区单核苷酸多态性与食管鳞状细胞癌患者发病年龄关系的研究

目的 探讨线粒体D-loop区单核苷酸多态性与食管鳞状细胞癌患者发病年龄关系.方法 2003-2005年在河北医科大学第四医院完成食管鳞状细胞癌患者线粒体D-loop区测序55例,单核苷酸多态性与患者发病年龄的关系分析采用Kaplan-Meier法,组间比较使用Log-rank检验.结果 经Log-rank检验,单核苷酸多态位点16266C/T基因型与发病年龄有关,多态位点16266T基因型患者发病早于16266C基因型患者,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 线粒体DNA D-loop区基因多态性位点可作为食管鳞状细胞癌患者发病年龄的预测标记,同时线粒体D-loop区多态性位点有助于识别早发的食管鳞状细胞癌患者.     

MicroRNA 基因单核苷酸多态性与类风湿关节炎的相关性研究

目的 分析类风湿关节炎（RA）患者和健康人群microRNA-146a（miR-146a）、miR-499a、 miR-149 及miR-196a 多态性位点的相关rs2910164、rs3746444、rs2292832 及rs11614913 等位基因和基因型 频率分布的差异。探讨其与类风湿关节炎（RA）发病风险的相关性,以及与疾病活动性及严重性的关系。 方法 收集600 例RA 患者和398 例健康人群的外周静脉血,提取基因组DNA,采用基于连接酶检测反应的 单核苷酸多态位点（SNP）分型技术对研究对象的4 个SNP 位点进行检测。结果 rs3746444 位点的CT 基 因型与中国汉族人群RA 疾病的活动性和严重性相关,并且rs11614913 位点（miR-196a）与性别存在交互作用, 可能与RA 发病有关。结论 miR-499a 的rs3746444 位点的CT 基因型可能与中国汉族人群RA 疾病的活动 性和严重性相关。     

类风湿关节炎与肿瘤坏死因子受体Ⅱ196位点多态性相关性的Meta分析

目的  探讨类风湿关节炎（RA）与肿瘤坏死因子受体Ⅱ196（TNFRⅡ196）基因位点多态性的关联情况。方法  检索已发表有关RA和TNFRⅡ196基因位点多态性的文献进行Meta分析。结果  有9篇文献入选,共纳入2140例RA患者(RA组)和1297例健康者(健康对照组)。综合分析显示RA与TNFRⅡ196位点等位基因及TG、GG基因型不存在关联,OR值、95%CI和P值分别为1.11,（0.91,1.34）,P=0.32;1.38,（0.97,1.98）,P=0.07;1.09,（0.93,1.27）,P=0.31。家族性RA与TNFRⅡ196位点等位基因及GG基因型存在关联,OR值、95%CI和P值分别为1.43,（1.11,1.86）,P=0.006;2.68,（1.39,5.17）,P=0.003;家族性RA与TNFRⅡ196TG基因型不存在关联,OR=1.00,95%CI（0.71,1.39）,P=0.98。散发性RA与TNFRⅡ196位点等位基因及GG、TG基因型不存在关联,OR值、95%CI和P值分别为1.13,（0.89,1.44）,P=0.32;1.44,（0.75,2.76）,P=0.27;1.03,（0.76,1.39）,P=0.86。结论  Meta分析显示TNFRⅡ196基因位点多态性与RA患者不具有关联,TNFRⅡ196位点等位基因及GG基因型可能与家族性RA患者存在关联,与散发性RA无相关性。     

浙江省金华地区人群PTPN22-1123GC多态性在类风湿关节炎易感性中的意义

目的：探讨浙江省金华地区类风湿关节炎(RA)群体PTPN22-1123GC多态性特点以及临床检测意义。方法：自浙江大学医学院附属金华医院2020年1—5月接诊的RA患者中选取50例作为病例组，同期健康体检人群中选取20例健康人员作为对照组，对两组对象行血样采集，并行基因多态性位点检测了解两组对象PTPN22-1123GC位点基因分布情况，并进行单因素与多因素分析。结果：病例组与对照组GC基因型频率分布存在统计学差异(P<0.05);对两组三种基因型进行双尾χ²检验，结果显示有统计学差异(P=0.036);其中杂合子GC型会导致患者RA发病风险增加1.966倍，携带C等位基因会导致RA的发病风险增加1.584倍。结论：PTPN22-1123的SNPs与RA易感染之间存在密切相关性，其中CG基因型是导致浙江省金华地区RA易感染的关键基因型，具有较高临床检测意义。     

干扰素调节因子-5基因多态性与类风湿关节炎的相关性

目的探讨干扰素调节因子-5（IRF-5）基因rs2004640位点基因多态性与河北汉族人群类风湿关节炎（RA）的相关性。方法应用聚合酶链反应-连接酶检测反应（PCR-LDR）法检测河北汉族人群136例RA患者和152名正常对照者IRF-5基因rs2004640位点多态性。应用ELISA法对RA患者进行抗环瓜氨酸抗原肽（CCP）抗体检测。结果 IRF-5基因rs2004640位点T等位基因频率在RA组明显高于对照组（28.1%vs20.4%）,两组差异有统计学意义（χ2=4.257,P〈0.05,OR=1.522,95%CI：1.038～2.231）。进一步将RA组按抗环瓜氨酸抗原肽（CCP）抗体阴性、阳性分层发现,抗CCP抗体阴性RA患者与对照组人群比较,T等位基因频率的差异有高度统计学意义（χ2=6.803,P〈0.01,OR=1.980,95%CI：1.209～3.242）。结论 IRF-5 rs2004640基因多态性与抗CCP抗体阴性RA患者发病存在相关性。     

类风湿关节炎与肺栓塞的相关性：一项两样本 孟德尔随机化研究

目的 评估类风湿关节炎（rheumatoid arthritis,RA）与肺栓塞（pulmonary embolism,PE）的相关性。方法 从大规模全基因组关联分析（genome wide association study,GWAS）获取研究数据,选择相互独立且与RA和PE相关的遗传位点作为工具变量。从GWAS中获取361 194例RA患者和9 704 049名对照者、361 194例PE患者和10 721 750名对照者数据。利用逆方差加权法（inverse variance weighted,IVW）、MR Egger、加权中位数法和加权模式进行两样本孟德尔随机化（Mendelian randomization,MR）分析,对RA与PE的相关性进行探讨。应用Cochran Q检验和孟德尔随机多态性残差和离群值（Mendelian randomization pleiotropy residual sum and outlier,MR-PRESSO）进行单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）异质性评估。应用MR Egger截距测试检验SNP的水平多效性。利用“留一法”敏感度分析对MR研究是否受单个SNP的影响进行评价。结果 IVW结果显示,RA可显著降低PE风险（β=–0.148,SE=0.063,P=0.018）,且在加权中位数法及加权模式中被证实（β=–0.166,SE=0.051,P=0.001;β=–0.155,SE=0.054,P=0.045）。MR-PRESSO检测和MR Egger截距测试显示工具变量之间不存在异质性及水平多效性;“留一法”敏感度分析亦证实,无单个SNP对整体结果有较大影响。结论 RA在遗传上与PE的风险降低有显著相关性。     

12个候选单核苷酸多态性位点与中国儿童急性淋巴细胞白血病易感性和预后的关系

目的：探讨12 个候选单核苷酸多态性（SNP）位点和中国儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）易感性及预后的关系。方法：复习文献选取12 个候选SNP位点,采用多重PCR后靶向捕获二代测序技术检测各SNP的基因型。采用χ2检验及logistic回归分析对556 例ALL患儿和191 例健康志愿者进行病例-对照研究验证SNP位点与中国儿童ALL易感性的关系。采用Kaplan-Meier生存分析及Cox回归分析365 例ALL患儿SNP位点与ALL预后的关系。结果：Logistic回归分析显示SNP位点基因型与ALL风险增加显著相关：ARID5B 基因的rs10821936 风险等位基因C（OR =1.687,95%CI =1.318～2.135,P ＜0.001］和rs10994982 风险等位基因A（OR =1.594,95%CI =1.259～2.018,P ＜0.001）,IKZF1 基因的rs11978267 风险等位基因G（OR =2.133,95%CI =1.495～3.043,P ＜0.001）和rs4132601风险等位基因G（OR =2.108,95%CI =1.466～3.031,P ＜0.001）以及ZNF230 基因的rs7554607 风险等位基因C（OR =1.481,95%CI =1.161～1.890,P =0.002）。多因素Cox回归分析显示无事件生存率的不良预后因素：SIAT7C 基因的rs10873876 位点TC基因型（HR =2.111,95%CI =1.260～3.539,P =0.005）以及LOC102723724 基因的rs11155133 位点GG基因型（HR =4.787,95%CI =1.652～13.870,P =0.004）,同时它们也是复发率的不良预后因素（前者HR =2.082,95%CI =1.242～3.492,P =0.005,后者HR =4.067,95%CI =1.380～11.988,P =0.011）。结论：ARID5B 基因的rs10821936和rs10994982、ZNF230基因的rs7554607以及IKZF1 基因的rs11978267 和rs4132601为我国儿童ALL潜在易感性位点。SIAT7C 基因的rs10873876以及LOC102723724 基因的rs11155133多态性位点可作为ALL患儿的预后因素。     

线粒体DNA D-loop区多态性与肝癌预后的研究

目的通过对线粒体DNA D-loop区的碱基测序,了解其多态性及突变情况,并探讨其与肝癌发病机率及预后的关系。方法提取49个乙型肝炎后肝癌病人的肝癌组织,癌旁组织和血液中的线粒体DNA,用测序法测定线粒体DNA D-loop区的碱基序列,了解其单核苷酸多态性和变异情况,并分析其与肝癌发病率及2年生存率的关系。结果通过观察发现,肝癌病mt DNA突变情况与肝癌预后无明确相关,而1个SNP位点(核苷酸150C/T)与肝癌的生存期之间存在统计学上的显著差异。经COX回归分析,发现150位点为肝癌预后的独立危险因素;150C的患者生存期显著短于150T的生存期(相对危险度,0.246;95%CI,0.070-0.861;P=0.028)。结论通过分析在线粒体DNAD-loop区的多态性,可以帮助筛别预后不良的肝癌患者。     

CDA基因单核苷酸多态性对中晚期非小细胞肺癌接受吉西他滨化疗患者预后的影响

目的: 探讨胞苷脱氨酶(CDA)基因单核苷酸多态性(SNPs)对吉西他滨化疗效果的影响,阐明CDA基因SNPs与晚期非小细胞癌(NSCLC)患者临床预后之间的关系。方法: 收集93例经病理确诊后接受吉西他滨化疗的中晚期NSCLC初治患者,应用Sequenom Massarray Genotype系统检测CDA基因79A>C基因型。采用Kaplan-meier方法和Log-rank检验分析CDA基因79A>C SNPs与晚期NSCLC患者无进展生存期(PFS)以及总生存时间(OS)的关系,应用COX风险比例模型分析影响因素对预后的影响。结果: CDA基因79A>C基因多态性与NSCLC患者临床及肿瘤病理特征均未见明显相关性。携带野生型基因型A/A患者经吉西他滨化疗后中位PFS为9.3个月,而携带突变型基因型A/C和C/C患者中位PFS为11个月,二者比较差异无统计学意义(P=0.061)。携带野生型基因型A/A患者中位OS为21.7个月,携带突变型基因型A/C和C/C患者中位OS为22.1个月,二者比较差异无统计学意义(P=0.513)。结论: CDA基因79A>C SNPs对接受吉西他滨化疗的NSCLC患者的PFS有一定延长作用,未发现其SNP与OS有关联。     

DCK基因多态性与阿糖胞苷治疗急性髓系白血病疗效的关系

目的研究脱氧胞苷激酶（DCK）的单核苷酸多态性（SNP）及其对阿糖胞苷（Ara-C）治疗急性髓系白血病（AML）疗效的影响。方法采用高温连接酶检测反应技术,检测126例接受Ara-C治疗的AML患者（AML组）和100名健康人（正常对照组）DCK基因7个SNP位点（SNP1~7）的基因型和等位基因分布频率,比较DCK不同基因型分布AML组患者的Ara-C治疗效果。结果 DCK基因SNP1（rs2306744）等位基因和SNP2（rs12648166）基因型分布频率,在正常对照组与AML组和Ara-C治疗无效组（n=35）之间比较,差异均有统计学意义（P〈0.05）。在AML组,SNP1的CC型基因型和SNP2的多态性基因型（AG＋GG型）以及SNP3（rs4694362）的野生型基因型,对Ara-C治疗表现出较好的临床反应。结论 DCK基因的SNP能作为潜在的Ara-C治疗AML患者预后的分子标志之一。     

中国广西人群miRNA 17 92基因簇启动子区rs1491034和rs982873遗传多态性研究

目的 研究rs1491034和rs982873单核苷酸多态性(SNPs)在广西人群中的分布特点,比较二者基因型和等位基因在不同种族、地区人群间的分布差别. 方法 采用SNaPshot SNP分型技术和DNA测序法检测397例广西人群rs1491034和rs982873 SNPs,比较两位点基因型和等位基因频率与国际人类基因组单体型图(HapMap)计划公布的不同种族和地区人群间的差别. 结果 广西人群rs1491034和rs982873均存在TT,CT及CC 3种基因型.2个位点的基因型和等位基因频率在广西人群不同性别间比较,差别均无统计学意义(P＞0.05).广西人群rs1491034基因型和等位基因频率与HapMap-CEU和HapMap-YRI人群比较,差别均有统计学意义(P＜0.01),而rs982873基因型和等位基因频率与HapMap-JPT和HapMap-YRI人群比较,差别均有统计学意义(P＜0.05),但两位点基因型和等位基因频率与其他人群比较,差别均无统计学意义(P＞0.05). 结论 广西人群存在rs1491034和rs982873多态性,与其他种族、地区人群比较存在不同程度的差别.     

信号传导和转录激活子4基因多态性与中国汉族人群扩张型心肌病的相关研究

目的 研究信号传导和转录激活子4基因(STAT4)单核苷酸多态性与中国汉族人群扩张型心肌病(DCM)的相关性。 方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法,对294例DCM患者和334例正常对照者中STAT4基因rs7574865、rs11889341位点进行群体遗传学研究,分析STAT4基因两SNP位点在两组样本间基因型频率、等位基因频率分布,探讨STAT4基因多态性是否与DCM发病相关。 结果 STAT4基因rs11889341位点GG基因型频率和G等位基因频率在DCM组患者中较高,与正常对照组相比差异有统计学意义(分别为55.8% vs.47.9%,P=0.039和76.4% vs.70.7%,P=0.023,OR=1.341,95%CI为1.042~1.727)。rs7574865位点CC+AC基因型频率在DCM组患者中较高,与正常对照组相比差异有统计学意义(94.2% vs.89.2%,P=0.025,OR=1.968,95%CI为1.081~3.585),该位点的等位基因频率分布在DCM组与对照组之间差异无统计学意义。 结论 本研究首次证明STAT4基因单核苷酸多态性与DCM相关,STAT4基因rs11889341位点GG基因型和G等位基因及rs7574865位点CC+AC基因型可能会增加DCM发生的危险性。     

趋化因子受体CX3CR1基因多态性与扩张型心肌病相关性研究

目的 研究扩张型心肌病(DCM)与趋化因子受体CX3CR1基因多态性的相关性,探讨DCM患者的遗传学发病机制.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法测定211例DCM患者和211例正常对照者CX3CR1基因rs3732378(V249I)和rs3732379(T280M)位点的单核苷酸多态性,比较DCM组与对照组之间在基因型频率、等位基因频率方面差异有无统计学意义.结果 CX3CR1基因rs3732378和rs3732379位点基因型、等位基因频率在DCM组与正常对照组之间差异均无统计学意义.结论 本研究未发现CX3CR1基因rs3732378和rs3732379位点多态性与DCM相关.     

磷酸二酯酶4D基因多态性与动脉粥样硬化血栓形成性脑卒中的关系

目的采用病例对照研究探讨中国汉族人群磷酸二酯酶4D(phosphodiesterase 4D,PDE4D)基因与动脉粥样硬化血栓形成性脑卒中(atherothrombosis ischemic stroke,AIS)的关系。方法应用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性方法,检测235例浙南地区汉族人群AIS患者和105例非脑卒中对照组PDE4D基因SNP83、32酶切多态性。结果 AIS患者PDE4D基因SNP83 C等位基因频率明显高于对照组,是AIS的危险因素(OR=1.718,95%CI:1.120～2.633;P=0.012);CC+CT基因型亦明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),(OR=1.875,95%CI=1.137～3.092);调整糖尿病、HDL-C等危险因素后,差异仍存在(OR=2.023,95%CI:1.207～3.391)。PDE4D基因SNP32位点在两组比较无统计学意义(P>0.05)。结论对于中国汉族人群,PDE4D基因SNP83是AIS的危险因素,而SNP32与AIS无关联。     

IL-17基因启动子区单核苷酸多态性与儿童哮喘的关系

目的探讨IL-17基因启动子区单核苷酸多态性（SNP）与儿童哮喘及患儿血清总IgE水平之间的关系。方法提取287例哮喘患儿和217例健康儿童外周血基因组DNA,采用PCR-LDR技术检测了IL-17基因启动子区的4个SNPs位点（rs4711998、rs8193036、rs3819024和rs2275913）,与GenBank公布的IL-17基因序列（NT₀07952.15 GI:224514668）比较,分析其在两组儿童中的基因型及等位基因频率的分布,以及哮喘患儿血清总IgE水平及其在不同基因型中的差异。结果两组rs4711998位点基因型分布差异有统计学意义（P=0.03）,哮喘组GG纯合子基因频率为9.6%,明显高于健康对照儿童组（4.1%）;rs8193036、rs3819024、rs2275913三个SNP位点的基因型分布在两组间差异无统计学意义。哮喘组血清总IgE水平在4个SNP位点基因型间的分布差异均无统计学意义。结论 IL-17基因启动子区SNP rs4711998可能是儿童哮喘易感位点,其中rs4711998 GG纯合子基因型与哮喘发病密切相关。     

原发性开角型青光眼患者小梁网糖皮质激素诱导反应蛋白基因单核苷酸多态性研究

目的 探讨中国汉族人中小梁网糖皮质激素诱导反应蛋白（TIGR）基因的单核苷酸多态性（SNP）及其与原发性开角型青光眼（POAG）发病的关系。方法 应用设爱量构象敏感性凝胶电脉（HTCSGE）和荧光标记自动测序法筛选和鉴定82例POAG患者TIGR基因的SNP,用限制性内切酶酶切分析技术检测150例对照组人群相应的SNP。结果 TIGR基因所有编码区及部分非编码区共检出6种SNP：1－83（G→A）、G12R、R46X、R76K、IVS2＋35（A→G）和T353I。其中,T353I的基因型TC和等位基因T在POAG患者和对照人群中的分布差异有显著意义,POAG患者中基因型TC和等位基因T的基因T在POAG患者和对照人群中的分布差异有显著意义,POAG患者中基因型TC和等位基因T的频率分别为12.2%和6.1%,均显著高于对照组的3.3%(x^2=6.885,P=0.009）和1.7%(x^2=6.655,P=0.010)。其余5种SNP各基因和等位基因频率在两组中差异均无显著意义。结论 TIGR基因T353I多态性可能与我国POAG发病相关,提示TIGR基因是中国汉族人POAG的相关基因。     

云南省精神分裂症患者关联基因检测

目的:采用简易微列阵法检测谷氨酸递质系统中与精神分裂症相关联的基因。方法:采用简易微阵列法,即PCR-等位基因特异性引物延伸和硝酸纤维素膜杂交法分析云南省255例精神分裂症患者和262名对照4个候选基因的4个SNP位点[rs778293(G72/G30)、rs2299225(GRM3)、rs11146020(GRIN1)和rs2814351(GRID1)]与精神分裂症的关联性。结果:对照组谷氨酸递质系统中的4个基因的4个SNP位点均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律。4个位点中,rs778293位点与精神分裂症存在关联性(基因型频率χ2=14.017,等位基因频率χ2=14.951,P<0.05)。结论:G72/G30基因SNP多态性与精神分裂症有关。