新冠病毒受体蛋白ACE2结构与功能的生信分析及原核表达

目的：构建ACE2原核表达载体并对其进行结构与功能的生物信息学分析,探究其介导SARS-CoV-2入侵人体的分子机制。方法：采用Protparam、ProtScale、NetPhos3.1、SignaIP 4.1、YinOYang 1.2 Server、NetNGlyc 1.0 Server、SOPMA、SWISS-MODEL、Blast、Clustal X2和MEGA7.0等对ACE2的生物学特性、同源性及进化性进行系统分析。采用分子克隆技术构建pET-22b-ACE2,在大肠杆菌中进行表达。结果：ACE2全长805个残基,呈酸性,分子量为92.5 kD,pI=5.36,共含77个潜在的磷酸化位点和14个糖基化位点,是一种亲水性较强的跨膜蛋白。ACE2主要散布于内质网膜、高尔基体和胞质膜,二级结构组成以α-螺旋为主。原核表达结果显示,细菌裂解后,沉淀中ACE2表达多于上清与全菌,为疫苗研发提供了理论依据。多序列比对和进化分析显示,倭黑猩猩与智人亲缘关系最近。结论：本研究为ACE2蛋白的纯化及研究奠定了基础,有助于阐明ACE2介导SARS-CoV-2入侵人体的分子机制,对SARS-Co...     

九种冠状病毒核衣壳蛋白的原核表达及纯化

目的 探索SARS冠状病毒（SARS-CoV）、HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63、HCoV-HKU1等5种人类冠状病毒以及牛冠状病毒（BCoV）、鼠肝炎病毒（MHV）、猫传染性腹膜炎病毒（FIPV）和禽传染性支气管炎病毒（IBV）4种动物冠状病毒核衣壳（N）蛋白在大肠杆菌中克隆表达及纯化条件。方法 利用原核表达载体pET30a（+）经IPTG诱导表达重组蛋白,并采用离子交换及镍离子螯合亲和层析法对重组蛋白进行纯化,用SDS-PAGE及Western blot对重组蛋白进行鉴定。结果 成功表达、纯化出9种冠状病毒N蛋白,纯度达90%以上。结论 在原核系统中表达得到了高纯度的9种冠状病毒N蛋白,为相关功能性研究奠定了基础。     

SARS病毒核衣壳蛋白抗体消长规律

研究SARS病毒抗体的消长规律对于评价患者的愈后及SARS疫苗的使用效果具有重要意义。本项目选用了军事医学科学院生物工程研究所研制的双抗原夹心SARSN蛋白抗体ELISA诊断试剂。对2 79例临床确诊的、发病不同时间SARS患者的血清进行检测,并同时跟踪检测了4 1例SARS患者在不同发病时间(发病3d至16 0d)的血清标本,对抗体产生的时间规律进行了研究。材料和方法标本来源:所用的SARS病例标本为本院检验科从2 0 0 3年2月7日开始,从本院收治病人及广州市中山二院、177医院、广州市第八人民医院、北京小汤山医院收集的SARS病人血清标本…     

重组SARS-CoV核衣壳蛋白的表达及免疫原性研究

我们利用全基因合成方式及原核表达系统获得大量纯化的N蛋白，为SARS-CoV的早期诊断及进一步研究提供新的思路。由于长片段目的基因在原核系统中不易表达，根据抗原性预测分析将N蛋白分成两部分表达，第一部分为N-4蛋白1-549bp，第二部分为N-2蛋白496-1269bp，上下游分别设计BamH Ⅰ、     

汉滩病毒核衣壳蛋白与宿主相互作用蛋白的分离与纯化

目的构建带有亲和素标签的汉滩病毒(HTNV)核衣壳蛋白(NP)表达质粒,转染HEK293T细胞并表达后,鉴定与其相互作用的宿主蛋白。方法合成亲和素标签基因(SF)与HTNV NP基因,先后克隆入哺乳动物真核表达载体pCAGGS,构建带有亲和标签SF的HTNV NP表达质粒,酶切鉴定重组质粒,获得的重组质粒命名为pCAGGS-SF-NP。将重组表达质粒瞬时转染到HEK293T细胞中, Western blot法检测重组质粒的表达;瞬时转染并收获蛋白样品,与StrepTrap~(TM) HP琼脂珠混匀后, 4℃过夜孵育;转移到层析柱中,经缓冲液洗涤、脱硫生物素洗脱完成亲和层析,获得洗脱样本;洗脱样品进行SDS-PAGE,分离得到与NP相互作用的宿主蛋白。结果酶切鉴定结果表明成功构建pCAGGS-SF和pCAGGS-SF-NP,重组质粒成功表达串联SF与NP的融合蛋白;在亲和层析过程中,成功特异富集融合蛋白SF-NP;洗脱样品成功分离出与NP相互作用的宿主蛋白。结论构建的重组表达质粒可以在真核细胞中成功表达融合蛋白SF-NP并获得了与NP相互作用的宿主蛋白。     

SARS-CoV核衣壳蛋白重组表达及单克隆抗体特性鉴定

SARS-CoV具有与其他冠状病毒相类似的结构。在有关动物冠状病毒的研究中发现,N蛋白是病毒主要的免疫原蛋白和良好病毒抗体检测抗原。在所有冠状病毒的结构蛋白中,无论从mRNA水平还是蛋白表达水平,N蛋白是病毒在整个感染过程中含量最丰富的蛋白。同时N蛋白含有大量的极性氨基酸残基且不含糖基化位点,因此即使在原核体系中表达,也不会改变其免疫特性。基于SARSCoVN蛋白以上这些特性,决定了可以利用纯化的N蛋白及制备的单克隆抗体研制诊断检测试剂,建立特异的血清学诊断方法,以利于快速、高效检测血清中的病毒抗体。为寻找针对SARS的…     

四株中国狂犬病病毒核衣壳蛋白和糖蛋白抗原性分析

狂犬病病毒核蛋白（ＮＰ）单克隆抗体可以清楚地区分狂犬病病毒和狂犬病相关病毒。用抗狂犬病病毒单抗还可以在同一血清型内进一步的分组以及分析毒株传播的宿主动物和地理位置,从而有可能找到流行的线索。病毒间的差异同样表现在与病毒ＧＰ单抗的特异反应中。用特异性Ｇ...     

汉滩病毒核衣壳蛋白C-端T细胞表位鉴定

目的　鉴定汉滩病毒核衣壳蛋白 (HTNVNP)C 端T细胞表位 ,为肾综合征出血热(HFRS)发病机理、疫苗研制及抗病毒免疫反应研究奠定基础。方法　采用Ficoll密度梯度离心法分离HFRS恢复期患者外周血单个核细胞 (PBMC)。用IFN γELISPOT实验和T细胞增殖实验 ,测试 7名患者PBMC对 2 3条NPC 端合成多肽的T细胞应答。结果　IFN γELISPOT实验结果表明 ,2名供体(3、4 )可分别检测到对 5 1、70号 2条多肽特异性T细胞应答。在供体 3,70号肽特异性T细胞频率为4 5SFC 10 6 PBMC ;在供体 4 ,5 1号肽特异性T细胞频率为 82SFC 10 6 PBMC。T细胞增殖实验与ELISPOT结果基本一致 ,但 5 3号肽和 6 4号肽还可分别刺激供体 1和供体 4的T细胞增殖 ,而未能诱导IFN γ分泌。结论　 5 1号和 70号多肽可能是NPC 端较强的T细胞表位。     

丙型肝炎病毒F蛋白的原核表达及初步应用

目的构建丙型肝炎病毒(HCV)F基因的原核表达载体,并在大肠杆菌TG1中进行表达,用以检测丙肝患者体内抗体,并制备抗血清。方法提取患者血清中的HCVRNA,并进行基因分型。取鉴定为HCV1b型的病毒,用RT-PCR扩增HCVF蛋白基因的序列。将扩增产物插入pGEM-T载体中,测序正确后,用EcoRI、BamHI双酶切后,再插入表达载体pGEX-4T-2中,转化大肠杆菌TG1,在IPTG诱导下表达GST-F蛋白。用亲和层析法纯化GST-F蛋白免疫BALB/c小鼠制备抗血清。并用纯化的GST-F蛋白进行ELISA法检测丙肝患者血清抗F蛋白抗体。结果在细菌裂解液中检测到重组的融合蛋白,经GlutathioneSepharose4B亲和层析柱纯化获得较高纯度的GST-F融合蛋白。应用Westernblot方法检测证实,用纯化的GST-F蛋白免疫BALB/c小鼠得到了特异性的抗体。用纯化的GST-F蛋白进行ELISA检测120例丙肝患者血清抗F蛋白抗体,82例呈阳性。结论通过上述方法制备的融合蛋白纯度较高,免疫小鼠获得的抗体具有良好的特异性。用纯化的目的蛋白检测丙肝患者血清抗F蛋白的抗体的阳性率为68%,与国外的报道接近,说明在HCV感染的自然病程中有F蛋白的产生,为研究HCVF蛋白及与HCV相关疾病的诊断和治疗提供了条件。     

施马伦贝格病毒核衣壳蛋白单克隆抗体的制备及其特性分析

目的制备施马伦贝格病毒(SBV)核衣壳蛋白(N)的单克隆抗体(mAb)并分析其特性。方法将SBV N基因分别构建至pET-28a-c(+)和pMAL-c5X载体中,在大肠杆菌中诱导表达带组氨酸标签的融合蛋白His-SBV-N和带麦芽糖结合蛋白(MBP)标签的融合蛋白MBP-SBV-N,分别用镍-次氮基三乙酸(Ni-NTA)树脂和直链淀粉树脂纯化两种蛋白;用纯化的His-SBVN免疫BALB/c小鼠制备mAb,以MBP-SBV-N为包被抗原间接ELISA筛选分泌mAb的杂交瘤细胞和测定mAb效价,利用蛋白G琼脂糖凝胶从腹水中纯化mAb;应用Western blot和间接免疫荧光分析mAb的反应性和特异性。结果筛选并纯化出1株抗SBV的mAb(命名为1F2),效价为1∶32 000,重链亚型为IgG2α,轻链为κ;1F2既能与重组SBV N蛋白发生反应,又能识别SBV,但与布尼亚病毒科内亲缘关系较近的沙门达病毒、道格拉斯病毒和赤羽病病毒的N蛋白存在交叉反应,而与裂谷热病毒N蛋白无交叉反应。结论成功制备了抗SBV核衣壳蛋白的mAb,为SBV的血清学检测提供了工具。     

WU多瘤病毒衣壳蛋白原核表达及初步分析

目的 获得WU多瘤病毒重组衣壳蛋白,分析其抗原性,筛选具有诊断价值的抗原.方法 采用PCR技术扩增WU多瘤病毒衣壳蛋白VP1、VP2和VP3的基因片段,并将目的基因插入PGEX-20T表达载体,转化大肠杆菌BL21(DE3)后诱导表达.用免疫印迹法对表达蛋白进行鉴定和分析并用临床样本进行初步验证.结果 重组质粒在BL21(DE3)菌株中经IPTG诱导、SDS-PAGE和免疫印迹鉴定显示在相对分子质量(Mr) 69×103、63×103和56×103处出现清晰条带,重组质粒经双酶切鉴定,表达产物经GST标签鉴定均正确.16份呼吸道分泌物WU多瘤病毒核酸阳性血清标本和70份阴性标本免疫印迹分析表明,重组蛋白具有良好的抗原性.结论 成功构建了WU多瘤病毒衣壳蛋白VP1、VP2和VP3的表达载体,表达的重组蛋白具有良好的抗原性,为进一步研究提供了资料.

Abstract：

Objective To express the capsid proteins of WU polyomavirus(WUPyV) for research and find antigen for diagnostic value. Methods Coding sequences of capsid proteins of WU polyomavirus by PCR were cloned in prokaryotic expression vector PGEX-20T. Recombinant plasmids were transformed into E. coli BL21(DE3) and induced by IPTG for proteins expression. Recombinant proteins were identified by Western blot. Results SDS-PAGE proved that recombinant proteins showed three bands with molecular relative mass of 69×103, 63×103 and 56×103. The recombinant proteins were recognized by anti-GST McAb. The antigenicity was tested by Western blot using 16 WU polyomavirus positive and 70 negative sera. Conclusion Recombinant VP1, VP2 and VP3 expressed in E. coli can combine with WUPyV-Ab and have good antigenicity. They can be used for further research.     

HCV Core蛋白与IFN敏感性相关结构及功能的生物信息学分析

目的 生物信息学工具分析不同基因型HCV Core蛋白与IFN敏感性相关的结构功能及差异.方法 应用生物信息学工具对不同基因型HCV Core蛋白二级结构、三级结构、修饰位点及主要功能结构域预测分析.结果 HCV Core蛋白氨基酸序列、二级结构、三级结构各型间存在差异,可能存在酰胺化、cAMP依赖的激酶、PKC、TYR磷酸化等修饰位点及与两性蛋白SH3结构域、ERK、PKC相互作用的区域.结论 不同基因型HCV Core蛋白结构功能不同影响IFN治疗敏感性.     

HCV Core蛋白与IFN敏感性相关结构及功能的生物信息学分析

目的生物信息学工具分析不同基因型HCVCore蛋白与IFN敏感性相关的结构功能及差异。方法应用生物信息学工具对不同基因型HCVCore蛋白二级结构、三级结构、修饰位点及主要功能结构域预测分析。结果HCVCore蛋白氨基酸序列、二级结构、三级结构各型间存在差异,可能存在酰胺化、cAMP依赖的激酶、PKC、TYR磷酸化等修饰位点及与两性蛋白SH3结构域、ERK、PKC相互作用的区域。结论不同基因型HCVCore蛋白结构功能不同影响IFN治疗敏感性。     

HCV Core蛋白与IFN敏感性相关结构及功能的生物信息学分析

目的 生物信息学工具分析不同基因型HCV Core蛋白与IFN敏感性相关的结构功能及差异.方法 应用生物信息学工具对不同基因型HCV Core蛋白二级结构、三级结构、修饰位点及主要功能结构域预测分析.结果 HCV Core蛋白氨基酸序列、二级结构、三级结构各型间存在差异,可能存在酰胺化、cAMP依赖的激酶、PKC、TYR磷酸化等修饰位点及与两性蛋白SH3结构域、ERK、PKC相互作用的区域.结论 不同基因型HCV Core蛋白结构功能不同影响IFN治疗敏感性.     

AAV9衣壳蛋白VP的原核表达、纯化及多克隆抗体制备

目的：表达腺相关病毒（AAV）9型衣壳蛋白VP,制备抗VP蛋白的多克隆抗体。方法：使用PCR技术从AAV9病毒包装质粒中扩增AAV9衣壳蛋白VP,同源重组法构建衣壳蛋白表达质粒pET30a-AAV9-VP。质粒转化表达菌E.coli BL21(DE3)后,IPTG诱导目的蛋白VP表达,亲和层析法纯化VP蛋白,将纯化后的蛋白免疫日本大耳白兔,3次免疫后获得针对VP蛋白的兔多克隆抗体。以Western blot和细胞免疫荧光法检测抗体的应用,ELISA检测所得抗体的效价。结果：成功构建pET30a-AAV9-VP表达质粒,在大肠杆菌BL21中,IPTG可诱导VP蛋白表达。亲和层析法纯化获得高纯度的VP蛋白。该蛋白在日本大耳兔体内能够诱导产生多克隆抗体,ELISA检测抗血清效价达到1∶512 000。结论：成功原核表达和纯化AAV9衣壳蛋白VP并制备了兔多克隆抗体。制备的抗AAV9 VP抗体能够特异性识别和结合AAV衣壳蛋白,并可有效用于Western blot和细胞免疫荧光分析,为后续深入研究AAV9在基因治疗中的作用及AAV9载体开发提供了研究基础。     

SARS冠状病毒核衣壳蛋白的重组表达及其单克隆抗体的制备

目的: 表达SARS冠状病毒核衣壳蛋白(N蛋白),并以表达产物为免疫原制备特异性单克隆抗体 (mAb)。方法: 采用RT- PCR方法, 从灭活的病毒抗原标本中扩增编码N蛋白的基因。测序确认后, 再亚克隆至原核表达载体中。从SDS -PAGE凝胶中回收原核表达产物后免疫BALB/c小鼠, 经融合、筛选制备特异性mAb。结果: 从标本中扩增出 1 269bp的DNA, 测序结果证实为N蛋白基因。将该基因克隆至原核表达载体中后, 在大肠杆菌中获得了较好的表达。表达产物经SDS- PAGE后, 在Mr约为 43 000处可见 1条明显的诱导表达带。Westernblot的结果表明, 该电泳带与SARS患者的恢复期血清呈特异的免疫反应。从SDS- PAGE凝胶中回收表达产物并免疫BALB/c小鼠, 制备出 3株抗N蛋白的mAb。这些mAb与SDS- PAGE凝胶上Mr约为 43 000的蛋白带也呈现很强的免疫反应。结论: 所获的重组N蛋白及特异性mAb, 将为进一步建立SARS病毒感染早期诊断的方法奠定了基础。     

SARS冠状病毒核衣壳蛋白的克隆表达及其临床应用研究

目的　克隆、原核表达严重急性呼吸综合征冠状病毒 (SARS-CoV)核衣壳 (N)蛋白 ,分析、评价其抗原性和在SARS血清学诊断中的应用价值。方法　采用逆转录巢式聚合酶链反应 (RT-nested PCR)扩增SARS CoV的N蛋白基因 ,克隆入pBAD-Thio TOPO原核表达载体 ,表达、纯化重组融合N蛋白 ,WesternBlot分析其抗原性和特异性 ,建立以重组N蛋白为抗原的酶联免疫吸附测定(ELISA)法 ,并与以全病毒裂解液为抗原的ELISA法进行比较。结果　重组表达载体经诱导产生了高水平的重组融合N蛋白 ,融合蛋白经亲和纯化后 ,具备了较高的纯度和抗原反应性 ,以重组蛋白为抗原的ELISA法在特异性和敏感性方面优于以全病毒裂解液为抗原者。结论　重组SARS-CoV的N蛋白具有良好的抗原性和特异性 ,可作为新一代SARS-CoV抗体检测试剂盒的备选抗原     

大鲵虹彩病毒主要衣壳蛋白主要抗原表位区的原核表达及抗血清制备

目的表达大鲵虹彩病毒(CGSIV)主要衣壳蛋白(MCP)主要抗原表位区蛋白,并制备兔抗血清。方法以大鲵虹彩病毒略阳株(CGSIV-LY)基因组为模板,PCR扩增MCP基因,然后克隆到p ET-21a(+)表达载体中,转化大肠杆菌BL21(DE3)菌株,用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达,通过SDS-PAGE和Western blot法检测重组蛋白的表达和免疫活性,用镍柱亲和层析法纯化重组蛋白。以纯化的重组蛋白为免疫原免疫兔制备抗血清,采用Western blot法和ELISA检测抗血清的免疫特异性并测定效价,利用间接免疫荧光法检测鲤鱼上皮瘤(EPC)细胞CGSIV。结果表达了相对分子质量(Mr)为29 000的重组蛋白。制备的兔抗MCP血清具有良好的特异性和高滴度,间接免疫荧光法检测结果显示制备的多抗血清能识别EPC细胞中的CGSIV。结论成功表达了大鲵虹彩病毒MCP主要抗原表位区蛋白,并制备高滴度和良好特异性的兔抗血清。