构建大规模人群新型冠状病毒核酸筛查指标体系研究

目的 建立适用于大规模人群新型冠状病毒（新冠病毒）核酸筛查时,科学确定筛查范围的指标体系。方法 采用文献检索和头脑风暴法,拟定大规模人群新冠病毒核酸筛查指标体系初始框架和指标,通过层次分析法及Delphi法结合的方式,对全国21名专家进行两轮咨询,确定大规模人群新冠病毒核酸筛查指标体系及权重。结果 两轮咨询的专家积极指数均为100%,权威系数（Cr）分别为0.88±0.08、0.89±0.07,变异系数（CV）范围（0.08,0.24）、（0.09,0.25）;Kendall''s W协调系数分别为0.34、0.22,差异有统计学意义（χ²=97.02、249.90,P<0.05）。最终确立了包括4个一级指标、11个二级指标、58个三级指标的大规模人群新冠病毒核酸筛查指标体系,并确定了各指标权重。结论 初步建立了大规模人群新冠病毒核酸筛查指标体系,对卫生行政部门科学和精准地确定大规模人群筛查范围时提供参考依据。     

新冠病毒核酸检测试剂盒的性能分析与评价

目的：对4种新型冠状病毒核酸检测试剂盒的性能包括敏感性与特异性、最低检出限、精密度和分析特异性进行评价,为实验室选择新冠病毒核酸检测试剂盒提供参考,促进新冠肺炎病毒核酸检测技术的创新改进。方法：以20例新冠病毒确诊阳性和10例确诊阴性的咽拭子作为研究样本,经提取得到RNA后根据4种新冠病毒核酸检测试剂盒说明书对其进行检测,分析扩增结果,评估各试剂盒的差异。结果：检测结果显示4种试剂盒对30例研究样本的阴阳性判定情况不尽相同,其中a试剂盒的敏感性和特异性最高,均达到100%;3例阳性样本稀释到100倍时,c试剂盒只能检出其中的1例,而其他三种试剂盒能检出其中的2例,表明c试剂盒的检测敏感性低于其他三种;4种试剂盒在精密度实验中检测样本得到的Ct值的CV值都较接近,且都<10%;加入了8种常见的高浓度干扰物质的临界阳性样本经4种试剂盒检测,结果依然为弱阳性,说明无干扰;4种试剂盒检测5例含非目标病毒的临床样本,检测结果为阴性,即未发生交叉反应。结论：新冠病毒核酸检测试剂盒对低浓度核酸样本的检测能力有所差异,各试剂盒不同的检出限也造成了总体上的敏感性和特异性的差异,实验室在选择新冠病毒...     

应对高校大规模人群新型冠状病毒核酸检测的组织管理策略

新型冠状病毒肺炎流行期间,做好上呼吸道咽拭子标本采集工作直接关系到核酸检测的准确性。然而,标本采集过程存在交叉传播的风险,因此,大规模人群新型冠状病毒核酸检测的组织管理至关重要。重庆市某高校进行了5次大规模人群新型冠状病毒核酸检测,检测现场管控到位,采集标本全部合格,无不良事件发生。本文总结了该高校大规模人群新型冠状病毒核酸检测的组织管理经验,包括以下几点:领导亲临现场,精心组织;采样流程规范,保障质量;人员组织有序,培训到位;时间安排科学,避免拥挤;场地宽敞通风,布置合理;做好消毒工作,避免感染;服务人文关怀,保障到位。以冀为今后高校组织类似活动提供借鉴。     

两种新冠病毒核酸检测系统检测结果的比对分析

目的 对不同新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测方法进行比较和分析,探讨核酸提取扩增检测一体化的实时荧光定量PCR系统的应用价值。方法 2020年1月—10月于新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)复核样本库中随机抽取确诊病例和排除病例的灭活咽拭子标本,共计10份。采用盲法随机编号,同时使用全自动医用PCR分析系统GeneXpert DX system和ABI QuantStudio Dx实时定量PCR检测系统进行检测,每组均进行平行检测,利用四格表法对结果进行一致性分析。结果 检测结束后揭盲,所有样本纳入统计分析,无剔除数据。经检测,两种方法对8例新冠病毒确诊病例咽拭子检测结果均为阳性,2例排除病例咽拭子检测结果均为阴性;两种方法检测结果一致性好(Kappa系数=1,P值=0.002);使用方法A检测前处理时间为30秒,结果报告时间为48分钟;在核酸检测过程中检测人员与样本接触时间短,气溶胶危险较低,试剂盒全程密封,实验完成后标本处理安全性高。结论 方法A与方法B在新型冠状病毒核酸检测中结果一致,方法A具备操作环节简单、生物安全风险系数小、检测更为快速等优点。     

病毒核酸检测信息系统在新冠疫情处置中的应用

目的 对新冠病毒核酸检测信息系统在新冠疫情处置中的应用进行探讨,分析现阶段系统在应用中存在的问题,为完善系统功能提供科学建议。方法 通过收集新冠疫情处置中病例相关信息,结合疫情处置中积累的方法和经验,探讨如何对系统中存储的核酸检测信息进行整理和利用。结果 新冠病毒核酸检测信息系统在新冠疫情调查和处置过程中可发挥快速评估社区全员筛查比例、判定密切接触者、评估阳性感染者传染风险和为不明感染来源阳性感染者提供溯源依据等作用。但在多系统对接、系统承载力、同空间的密接判定等方面存在一定局限性。结论 新冠病毒核酸检测信息系统不仅为大规模核酸筛查工作提供了强大的信息化技术支撑,还在疫情处置中发挥不可或缺的作用;应根据疫情处置的需要,及时对系统进行改造升级。     

新冠肺炎方舱核酸检测基地感染防控策略

方舱核酸检测基地是实现快速大规模核酸筛查、控制新型冠状病毒肺炎疫情的核心设施,但由于其检测机构众多、人员构成复杂、水平参差不齐,感染防控风险较大.在张家界航空工业职业技术学院核酸检测基地的实践中,工作人员探索出一套完整的感染防控方案和流程:基地选址、布局、路径规划,完善感染防控组织架构和制定感染防控制度,人员和路径的管...     

新型冠状病毒核酸检测分析

在新型冠状病毒具备较高的传染性和隐蔽性,在发作前会经历14天的潜伏期,新型冠状病毒的核酸检测中值得注意的是相当一部分疑似病例都是通过多次检测才确诊了结果,阳性患者的核酸检测阳性率不到五成,检测反馈效率不高,虽然检测仍然是有效途径,但这无疑对于检测的结果、效率和公共卫生安全问题有所影响,需要加以重视和改善。因此,本文对新型冠状病毒核酸检测进行简要分析,主要从假阴性、假阳性的引起因素出发去分析检测问题,并通过一定的实验结果对比来观察核酸检测问题,以期能够为医疗机构尤其是基层医院提供一些核酸检测工作上的帮助。     

不同人群新型冠状病毒核酸检测的临床价值

 目的 探讨新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测在发热门诊、隔离病房、易感人群以及大规模筛查等不同人群中的应用价值,为SARS-CoV-2实验室检测提供参考依据。方法 采集2020年2月1日-3月22日郑州人民医院不同人群的咽拭子,包括发热门诊、隔离病房患者,一线疫情防控医护人员,以及无新型冠状病毒肺炎（COVID-19）症状的住院患者、陪护家属和复工人员。采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法,使用A、B两种国产检测试剂盒对发热门诊、隔离病房的患者进行SARS-CoV-2核酸检测。结果 共检测15 497份咽拭子标本,SARS-CoV-2核酸阳性24份,核酸阳性病例均来自发热门诊和隔离病房。24例咽拭子SARS-CoV-2核酸阳性患者同时送检的血标本核酸结果均呈阴性。A、B两种试剂首次咽拭子核酸检测结果一致,2例确诊COVID-19患者治疗后复查咽拭子标本,A组试剂检测为阳性,B组试剂检测为阴性。该院疫情防控一线医护人员、未出现COVID-19症状的住院患者、陪护家属和复工体检人员核酸检测均为阴性。结论 复工人员、住院患者、陪护家属和一线疫情防控人员SARS-CoV-2核酸筛查均未发现阳性,咽拭子标本SARS-CoV-2核酸检测阳性率高于血标本,不同核酸检测试剂检测阳性率稍有差异。     

新型冠状病毒灭活样品混合进行核酸检测效果分析

目的了解新型冠状病毒灭活样本混合检测对结果的影响,为大人群样本的新型冠状病毒核酸筛查提供科学检测的方案。方法将新型冠状病毒阳性咽拭子样本和阴性咽拭子样本于56℃30min灭活后,按照阳性样本1份、阴性样本4、9、19份的比例进行混合,用实时荧光RT-PCR技术检测原液和混合液的ORF-lab和N基因。结果20组灭活样品原液核酸检测结果全部为阳性,1∶5混合液和1∶10混合液核酸检测结果也均是阳性,1∶20混合液有1组样品ORF-lab阴性,N基因阳性。各组间核酸检测Ct值均显著相关。不同样本组组间阳性率差异无统计学意义。20组样品ORF-lab基因1∶5混合液、1∶10混合液、1∶20混合液相比原液Ct值分别平均增加1.73、2.86、4.05,N基因1∶5混合液、1∶10混合液、1∶20混合液相比原液Ct值分别平均增加1.69、2.79、3.25。结论当开展大人群样本的新型冠状病毒核酸筛查时,选择<10份灭活样品混合检测,大部分情况下不影响定性结果,但弱阳性样本结果可能会受到影响。     

咽拭子新型冠状病毒核酸检测的临床价值

 目的 了解某院新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者的临床资料及咽拭子检查结果,评价咽拭子新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测的临床价值,为临床诊断COVID-19提供参考。方法 回顾性收集中南大学湘雅医院2020年1月23日—2月18日经SARS-CoV-2核酸检测确诊COVID-19患者病历资料,分析患者临床资料、病毒核酸检测的取样次数、取样方法、标本类型、检测手段等信息。结果 28例确诊患者平均年龄（43.78±14.46）岁,男女比例为2.5∶1,46.42%的患者有武汉/湖北旅居史,14.29%的患者与确诊COVID-19患者有密切接触史。患者临床表现以发热（78.57%）、咳嗽（53.57%）为主,实验室检查可见白细胞计数正常（71.43%）,淋巴细胞计数下降（53.57%）,肺部CT呈多发磨玻璃影（92.59%）及斑片影（70.37%）。28例确诊病例中,发病至确诊的中位时间为5.5 d。首次采集标本SARS-CoV-2检测阳性者18例（64.29%）,首次可疑阳性1例;首次阴性（包括可疑阳性）,第二次采集阳性者5例（17.86%）;前两次采集阴性,第三次采集阳性者2例（7.14%）;经四次检测阳性者1例（3.57%）;经五次检测后阳性者2例（7.14%）。鼻/口咽拭子采样26例（92.86%）,诱导排痰2例（7.14%）,经鼻咽拭子、咽拭子、痰标本RT-PCR确诊27例（96.43%）,痰标本NGS测序确诊1例（3.57%）。结论 COVID-19临床常表现有发热及干咳,但无特异性,仍需依赖SARS-CoV-2核酸检测才能确诊。咽拭子作为发热门诊首选的SARS-CoV-2核酸采集方式具有简便易行的优势,但检测结果呈阴性并不能排除SARS-CoV-2感染。     

及时开展新冠疫情防控与大规模核酸检测的卫生经济学评价

目的 对广州市于第二波新冠疫情及时开展疫情防控以及大规模核酸检测进行卫生经济学评价。方法 基于全社会角度,从相关部门及文献中收集数据,对广州市的所有常住居民构建改进SEIR模型,通过构建不同情景,分析真实世界情景及疫情防控措施分别推迟3天与7天的情景下的结果产出值,并对广州市四轮大规模核酸检测行成本效益分析。结果 真实世界情境下,本轮疫情的总经济负担约为344.02亿元人民币。与及时开展疫情防控措施相比,推迟3天开展疫情防控措施会带来1 391例累计确诊病例、43例死亡以及额外的141.91亿元人民币的经济负担。而推迟7天开展疫情防控措施会带来26 237例累计确诊病例、882例死亡以及额外的294.62亿元人民币的经济负担。四轮大规模核酸检测的净收益为221.82亿元人民币,效益成本比为24.23。结论 面对疫情时及时开展疫情防控措施能够极大地减少经济负担,且进行大规模核酸检测具有良好的经济性。     

新型冠状病毒实验室核酸检测方法及实践

目的研究新型冠状病毒(2019-nCoV)实验室核酸检测的原理方法,探讨实时荧光定量PCR方法在新型冠状病毒实验室检测中的价值与实验室注意事项。方法采用实时荧光定量PCR方法检测2020年1月23日-2020年2月2日就诊于解放军总医院海南医院发热门诊的患者以及筛查的湖北旅居者的咽拭子,采用实时荧光定量PCR的方法检测新型冠状病毒开放读码框1ab(ORF1ab)、核壳蛋白(N)基因。结果共检测的3 824例标本中,阳性病例35例,阳性率0.91%。结论疫情期间对发热门诊患者及湖北旅居者进行2019-nCoV核酸筛查是非常有必要的,实时荧光定量PCR是一种检测2019-nCoV科学可靠的方法,能快速准确地检测待检标本中的2019-nCoV核酸,对监测和控制疫情有重要意义。     

从一起新冠病毒灭活疫苗成分污染标本案例分析新冠病毒核酸检测初筛阳性的快速复核

目的 对一起新冠肺炎防控重点单位人员标本新冠病毒核酸检测初筛阳性事件调查处置进行分析,为初筛阳性快速复核提供参考。 方法 制定初筛阳性定义,将复核内容划分为实验室检测复核和流行病学调查复核,并分析、探讨复核结果的判定。 结果 实验室检测复核结果:邵阳市疾病预防控制中心对原始标本的审查结果与初筛结果一致,CT值大于35;重新采集初筛阳性者的标本进行检测,全部为阴性。流行病学调查复核结果:标本在采集过程中使用的治疗推车15 d前曾被用于接种新冠病毒灭活疫苗,该治疗推车使用后未消毒,一直闲置至本次采样前;调查中对治疗推车表面采样进行新冠病毒核酸检测,结果为阳性(CT值为34.2);此外采样人员在采样过程中无菌操作不规范(剪刀剪断拭子后直接放置在治疗推车上),推测原始标本极可能被新冠病毒灭活疫苗成分污染。综合实验室检测复核和流行病学调查复核对本起初筛阳性事件予以排除。 结论 明确复核流程,实验室检测复核和流行病学调查复核同时开展,有利于加快初筛阳性复核速度;制定复核结果的判定依据,可为类似事件的处置和初筛阳性人员明确诊断提供参考。     

深圳新冠肺炎出院病例核酸复检阳性特征分析

目的对广东省深圳市新型冠状病毒肺炎出院病例中核酸检测复检阳性的情况进行分析,为肺炎疫情防控提供数据支持。方法对出院病例按要求进行病毒核酸检测,采集2020年2月21日—4月22日的复检阳性病例,分析其流行病学特征。结果 330例出院病例中共检测出复阳病例59例,复阳率17.9%。男性24例,女性35例,男女比例为0.83:1。中位年龄38岁,最小1岁,最大86岁。0～19岁,20～59岁,60岁以上分别占15.2%,71.2%,13.6%。从第1次出院至最后1次核酸检测阳性时间最长者为57天。不同年龄(Fisher精确χ²=17.070,P=0.018)和样本类型(χ²=26.367,P <0.001)的复阳率差异有统计学意义。性别(χ²=0.838,P=0.360)和隔离天数(χ²=6.292,P=0.098)差异无统计学意义。结论复阳与年龄和样本类型有关,与性别和隔离天数无关,个别病例复阳持续时间较长。     

不同提取及扩增方法检测新型冠状病毒核酸的性能比较分析

目的 对磁珠法和释放剂法2种核酸提取方法及扩增时长不同的2种荧光PCR试剂盒检测新型冠状病毒的性能进行比较,为医疗机构对新冠核酸检测试剂盒以及核酸提取方法的选择提供参考依据.方法 将定值质控品稀释成1 000、500、250、125、62.5和31.25 copies/mL 6个不同梯度浓度,根据不同的提取方法与扩增试...     

新型冠状病毒感染核酸和抗体检测方法比较

  目的  对高速卡口货运司乘人员新型冠状病毒抗原与核酸双检测措施效果评估。  方法   对2022年3月20日 — 4月17日在宁波市北仑区8个高速卡口48734名有浙江省外旅居史货运的司乘人员进行新型冠状病毒抗原与核酸双检测,并对检测结果进行描述性统计分析。  结果  共检出9例Omicron变异株感染者,其中确诊病例6例（均为轻型）,无症状感染者3例,未发现阳性感染者续发病例;抗原检测试剂的灵敏度和特异度分别为55.5 %（5/9）和99.9 %（48717/48725）,阳性预测值和阴性预测值分别为38.5 %（5/13）和99.9 %（48717/48721）;阳性感染者中抗原阳性组ORF1ab和N基因Ct值M（P₂₅,P₇₅）分别为19.0（17.1,21.5）、19.0（16.6,22.5）,抗原阴性组Ct值均显著高于抗原阳性组（P < 0.05）。  结论  抗原检测试剂灵敏度较低但特异度高。建议在高速卡口对货运司乘人员实施抗原与核酸双检测策略,既保障物流畅通,又有效降低输入性病例引起本土疫情风险。     

新型冠状病毒肺炎核酸检测采样技巧

正新型冠状病毒肺炎是一种急性感染性肺炎,是由2019新型冠状病毒(2019-n CoV)感染引起。患者初始症状为发热、乏力和干咳,并逐渐出现呼吸困难等严重表现。经呼吸道和密切接触传播是主要的传播途径。多数患者经过治疗预后良好,部分严重病例可出现急性呼吸窘迫综合征或脓毒血症休克,甚至死亡。随着疫情发展,国家鼓励三甲医院及县     

738例新型冠状病毒肺炎病例密切接触者核酸筛查结果分析

 

目的 了解新型冠状病毒肺炎（简称新冠肺炎）病例密切接触者新型冠状病毒核酸检测及血常规结果。方法 选取2020年2月11-23日某定点隔离酒店内738例新冠肺炎病例密切接触且无明显临床症状的医学观察人员,采集其鼻咽拭子进行新型冠状病毒核酸检测,采集血标本进行血常规检测,并观察至隔离期结束。结果 738例医学观察人员新型冠状病毒核酸检测阳性70例（9.49%）,阴性664例（89.97%）,可疑4例（0.54%）,其中首次新型冠状病毒核酸检测阳性52例,可疑28例,阴性658例;对28例结果可疑者隔日重新采样检测,18例阳性,6例阴性,4例仍可疑（二次采样后观察期结束转至指定隔离观察点）。所有新型冠状病毒核酸检测阳性及可疑医学观察人员,血常规白细胞计数均正常,仅2例淋巴细胞计数减少。在第一个14 d观察期内,738例医学观察人员40例（5.42%）发病,其中70例新型冠状病毒核酸检测阳性者,42.86%（30例）出现发热、咳嗽、气促等临床症状;664例新型冠状病毒核酸检测阴性者,1.51%（10例）出现症状。所有确诊病例转至定点医院继续治疗;第一个观察期结束时,新型冠状病毒核酸检测未转阴者、结果仍可疑者送至指定隔离点继续观察。继续观察期中4.54%（2/44）出现症状被确诊,随即转至定点医院治疗;余下观察者新型冠状病毒核酸检测全部转阴。整个集中隔离期发病率为5.69%（42/738）。结论 新冠肺炎病例密切接触者新型冠状病毒核酸检测阳性人员中,潜伏期感染者所占比例较高,亦存在一定比例的无症状感染者,应尽早识别、诊断。

     

城市核酸检测基地管理的专家建议

新型冠状病毒核酸检测是疫情精准防控的关键环节,城市核酸检测基地切实提升了区域核酸检测能力和效率。本建议包括环境与设施管理、人员管理与培训、设备管理、物资管理、质量管理、生物安全管理、医疗废物管理、信息系统管理、结果报告、督查与持续性改进等共十个方面内容,旨在为新型冠状病毒核酸检测基地管理提供规范及建议,确保基地规范、安...