广西壮族人群TLR2基因rs2289318G/C和rs3804100T/C的多态性研究

［摘要］　目的　探讨广西壮族人群Toll样受体2(TLR2)基因rs2289318G/C和rs3804100T/C多态性,比较其与不同地区及种族的分布差异。方法　采用单碱基延伸技术和DNA测序法对210名广西壮族健康体检者的TLR2基因rs2289318G/C和rs3804100T/C进行基因分型,分析其基因多态性,并与千人基因组计划数据库公布的美国西南部非洲裔(ASW)、巴巴多斯的加勒比非洲裔(ACB)、尼日利亚伊巴丹的约鲁巴人(YRI)、美国人（AMR）、日本东京的日本人(JPT)、欧洲人(EUR)、南亚人(SAS)、中国北京的汉族人(CHB)的基因型进行比较。结果　广西壮族人群TLR2基因rs2289318G/C位点存在GG、CG和CC基因型,其频率分别为58.57%、37.62%和3.81%;G和C等位基因频率分别为77.38%和22.62%。rs3804100T/C位点存在TT、CT和CC基因型,其频率分别为57.62%、38.10%和4.29%;T和C等位基因频率分别为76.67%和23.33%。在广西壮族人群中,TLR2基因rs2289318G/C和rs3804100T/C位点的基因型和等位基因频率在不同性别间比较差异均无统计学意义(P>0.05)。广西壮族人群rs2289318G/C等位基因与SAS比较差异有统计学意义(P<0.05),但其基因型与SAS比较差异无统计学意义（P>0.05）;rs2289318G/C等位基因及等位基因频率与ACB、ASW、YRI、AMR、JPT、EUR、CHB比较差异均无统计学意义(P>0.05)。广西壮族人群rs3804100T/C位点的基因型及等位基因频率与ACB、ASW、YRI、AMR、EUR、SAS、CHB比较差异均有统计学意义(P<0.05),而与JPT比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论　广西壮族人群TLR2基因rs2289318G/C、rs3804100T/C多态性与不同种族人群比较存在差异。     

冠心病患者C反应蛋白水平及其1059G/C基因多态性的研究

目的　研究中国汉族人群中血清高敏C反应蛋白 (CRP)水平及其 10 5 9G C基因多态性与冠状动脉造影证实的冠心病之间的关系。方法　采用免疫比浊法测定 35 6例冠状动脉造影患者的高敏CRP水平 ,同时应用聚合酶链反应 -限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)核苷酸分型技术检测CRP的 10 5 9G C基因多态性 ,结合冠状动脉造影结果进行分析。结果　冠心病组的自然对数转换CRP(lnCRP)水平显著高于对照组 (P <0 0 5 ) ,以年龄、性别、吸烟、高血压、体重指数和lnCRP水平为自变量的Logistic回归分析显示 ,lnCRP水平 (OR =1 4 4,P <0 0 1)和体重指数 (OR =1 0 1,P <0 0 5 )与冠心病的危险性独立相关。 10 5 9G C基因多态性等位基因和基因型的分布频率符合Hardy Weinberg平衡 ( χ2 =0 2 97,P >0 0 5 )。两组的 10 5 9G C基因型和等位基因的分布趋势相同 ,差异无显著性 (P>0 0 5 )。C等位基因携带者的lnCRP水平低于GG基因型 [( 0 5 3± 1 0 1)比 ( 0 88± 0 99)lnmg L ;P =0 0 2 4],而冠状动脉病变程度不受 10 5 9G C基因多态性的影响 ( χ2 =1 374,P >0 0 5 )。结论　血清高敏CRP水平升高可能是中国汉族人冠心病发生的独立危险因素 ;CRP的水平可能受其 10 5 9G C基因多态性的影响。     

冠心病患者对氧磷酶启动子基因-108C/T、-162A/G多态性分析

目的探讨中国人对氧磷酶（PON1）基因-108C／T、-162A／G遗传多态性与冠心病（CHD）的关系。方法应用多聚酶链反应（PCR）对86例冠心病患者和128例正常对照者PON1基因酶切位点的限制性片段长度多态性（RFLP）进行研究。结果PON1—108C／T多态性位点基因型分布在CHD组和对照组间存在显著性差异（P〈0．05）。PON1-162A／G多态性位点基因型频率和等位基因频率在两组间未见显著性差异。CHD不随两个多态性位点危险基因型个数的增加而发病率呈上升趋势。结论PON1—108C／T基因多态性与中国人群CHD相关联，PON1—108C／T和PON1—162A／G基因多态性对CHD的影响无协同性。     

酒精性肝病患者血清IL-17水平及其基因-197A/G位点单核苷酸多态性分析

目的探讨酒精性肝病(ALD)患者血清白细胞介素-17(IL-17)水平及其基因-197A/G位点单核苷酸多态性的变化。方法 2015年10月～2020年10月我院收治的酒精性脂肪肝患者44例、酒精性肝炎患者40例、酒精性肝硬化患者34例和ALD相关性肝癌患者18例,采用ELISA法检测血清IL-17水平,采用单核苷酸检测试剂盒检测外周血IL-17-197A/G位点基因多态性。结果肝癌患者血清IL-17水平为(8.7±1.4)pg/mL,显著高于酒精性脂肪肝、酒精性肝炎和酒精性肝硬化患者【分别为(3.7±0.3)pg/mL、(4.0±0.6)pg/mL和(6.9±0.8)pg/mL,均P<0.05】;肝癌患者血清ALT、AST、GGT和ALB水平分别为(54.3±13.3)U/L、(53.8±13.7)U/L、(262.2±17.9)U/L和(33.9±13.8)g/L,酒精性肝硬化患者分别为(39.8±8.8)U/L、(40.1±7.2)U/L、(251.1±7.9)U/L和(31.1±2.6)g/L,酒精性肝炎患者分别为(84.0±7.5)U/L、(75.4±6.8)U/L、(...     

胱抑素C rs1064039位点单核苷酸基因多态性与冠心病的相关性研究

目的:通过研究胱抑素C基因(CST3)rs1064039位点单核苷酸多态性(SNP),揭示其与冠心病的相关性。方法:采用病例-对照研究,选择上海市静安区中心医院心内科疑似冠心病入院的汉族530例患者为研究对象,依据冠状动脉(冠脉)造影结果分为冠心病组(320例)及对照组(210例)。提取外周血白细胞基因组DNA,应用巢式PCR直接测序技术检测CST3rs1064039位点SNP,分析该位点的基因型及等位基因频率与冠心病的相关性,及其与血胱抑素C水平的关系。结果:汉族人群中CST3基因rs1064039位点存在G/A突变,存在GG、GA和AA 3种基因型,GG型为野生基因型,无论等位基因频率或者基因型分布在冠心病及对照组均无明显差异;CST3rs1064039位点野生型纯合子携带者血胱抑素C在全体人群和对照组中的水平明显高于突变型携带者,但这种差别在冠心病组消失。结论:汉族人群中CST3基因rs1064039位点的基因多态性与冠心病发病无直接相关性,而与血胱抑素C水平相关。     

C反应蛋白基因-390C/A/T多态性与冠心病的相关性

目的 探讨我国汉族人群中C反应蛋白(C reactive protein,CRP)基因启动子区-390C/A/T单核苷酸多态性的分布,及其与冠心病的相关性. 方法对冠心病组(111例)和对照组(101例)利用聚合酶链反应扩增出相应目的 条带,然后运用序列特异性的聚合酶链反应检测其多态性. 结果 -390C/A/T多态性的等位基因频率在冠心病组中C为64.4%(143/222),A为22.1%(49/222),T为13.5%(30/222);在对照组中,C为77.7%(157/202),A为14.9%(30/202),T为7.4%(15/202),差异有统计学意义(χ~2=29.30,P<0.01).基因型频率在冠心病组中CC为37.8%(42/111),CT为24.3%(27/111),CA为28.8%(32/111),TA为0.9%(1/111),TT为0.9%(1/111),AA为7.2%(8/111);在对照组中CC为60.4%(60/101),CT为11.9%(12/101),CA为22.8%(23/101),TA为1.0%(1/101),TT为1.0%(1/101),AA为3.0%(3/101),差异有统计学意义(χ~2=12.57,P<0.01).运用多元对数回归分析冠心病其他相关危险因素(体质指数、年龄、三酰甘油、总胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇、血糖、糖尿病、吸烟、饮酒和高血压),排除其对CRP基因启动子区多态性的影响,发现该位点依然与冠心病相关,那些带有T等位基因个体患冠心病的概率是不带T等位基因个体的2.66倍(OR=2.66,95%CI 1.05～6.75,P<0.05).结论 -390C/A/T与冠心病相关,其T等位基因是冠心病的独立危险因素,该位点可能是潜在的冠心病基因诊断标记.     

IL-18单核苷酸多态性位点(-656G/T、-607C/A)检测及其与中国汉族人溃疡性结肠炎的关联分析

目的 白介素(IL)-18是参与溃疡性结肠炎(UC)发病的一个重要细胞因子.本研究检测中国汉族UC患者中IL-18基因的单核苗:酸多态性(SNPs),分析其在UC发病中的意义.方法 在102例UC患者和128例止常埘照中,用PCR扩增和直接测序法检测IL-18基因巾的2个SNP(-656G.T、-607C.A)的基凶分型.结果 在UC患者中,SNP位点-656G.T、-607C.A等位基因频率及它们的基因型频率与健康对照组没有显著性差异.结论 IL-18基因上-656G.T、-607C.A SNPs及单倍体型与中国汉族UC患者之间无相关性.     

MTHFR C677T位点基因多态性和同型半胱氨酸水平在冠心病合并高血压患者中的临床相关性分析

目的:探讨皖北汉族冠心病(CHD)合并高血压患者MTHFR基因多态性(C677T)及同型半胱氨酸(Hcy)水平与临床冠状动脉(冠脉)血管病变关系,为早期评估病变程度及危险度提供新证据。方法:纳入CHD合并高血压患者160例(CHD合并高血压组),及单纯高血压患者77例(高血压组),另纳入健康对照者34例(对照组)。采用高效液相色谱法测量各组Hcy水平,采用荧光定量PCR检测各组MTHFR基因C677T位点的多态性。计算血管病变支数,以Gensini评分评估冠脉病变程度。结果:CHD合并高血压组Hcy水平[(17.60±9.70)μmol/L]高于高血压组[(16.56±7.70)μmol/L],但无统计学差异;以上两组Hcy水平均显著高于对照组[(13.13±5.21)μmol/L],差异有统计学意义(均P0.05)。CHD合并高血压组中TT基因型频率(35.5%)显著高于对照组(14.7%),差异有统计学意义(P0.05);携带T突变基因(CT+TT型)患者Gensini评分(37.17±35.23)显著高于CC基因型患者(27.28±21.63),差异有统计学意义(P0.05);携带T突变基因(CT+TT型)患者Hcy水平[(18.42±10.38)μmol/L]显著高于CC型[(14.81±6.23)μmol/L],差异有统计学意义(P0.05)。男性Hcy水平[(19.40±10.32)μmol/L]显著高于女性[(14.06±6.32)μmol/L],差异有统计学意义(P0.05)。Hcy水平与年龄、血肌酐有线性相关性(P0.05)。结论:CHD合并高血压患者中,MTHFR基因多态性在C677T位点上的T基因突变与冠脉病变程度呈相关性,携带T突变基因患者Hcy水平和Gensini评分显著高于CC基因型的患者。高Hcy水平与携带T突变基因人群患CHD的概率可能增加。     

冠心病患者E-选择素血清水平及其G98T、S128R基因多态性研究

目的　研究中国汉族人群E 选择素 (E selectin)基因第 2外显子G98T和第 4外显子S12 8R多态性与冠心病 (CHD)的相关性 ,以及对血清E selectin水平的影响。方法　采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)技术 ,检测 2 38例CHD患者和 199例健康人作对照者的E selectin基因多态性 ,同时采用酶联免疫吸附试验 (ELISA)检测CHD患者和对照者血清E selectin水平。结果　E selectin基因S12 8R基因型频率和等位基因频率在CHD组和对照组比较差异有显著性(P <0 0 5 ) ,基因型频率的相对风险分析发现 ,SR基因型携带者患冠心病的风险是SS基因型的 2 16 2倍 (OR =2 16 2 ,95 %CI:1 0 73～ 4 35 9) ,SR基因型携带者的E selectin血清水平显著高于SS基因型(4 2 9± 8 1比 35 7± 7 7,P <0 0 1)。E selectinG98T各基因型分布在CHD组和对照组之间比较差异无显著性 (P >0 0 5 ) ,但在心肌梗死组与心绞痛组间比较差异有显著性 (P <0 0 5 )。结论　E selectinS12 8R基因多态性与冠心病的发病有关联 ,并可影响血清E selectin水平 ,R等位基因可能是CHD发病的遗传易感基因 ;E selectin基因G98T多态性在冠心病发病中可能不起直接重要作用。     

肝细胞癌患者IL-18基因-137G/C和-607A/C位点单核苷酸多态性变化及其意义探讨

目的探讨肝细胞癌(HCC)患者白细胞介素-18(IL-18)基因-137G/C和-607A/C位点单核苷酸多态性(SNP)的变化。方法在178例伴有HBV感染的HCC患者和251例健康人,取外周静脉血提取DNA,采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)行基因分型,测定IL-18基因-137G/C和-607A/C位点SNP。结果 HCC患者和健康人IL-18-37 G/C基因GG基因型、GC基因型和CC基因型分布频率分别为75.3%对47.0%(P0.05)、20.8%对51.4%(P0.05)和3.9%对1.6%(P0.05),G等位基因和C等位基因分布频率分别为93.6%对72.7%(P0.05)和6.4%对27.3%(P0.05);HCC患者和健康人IL-18-607A/C位点AA基因型、AC基因型和CC基因型分布频率分别为37.6%对13.5%(P0.05)、43.3%对66.9%(P0.05)和19.1%对19.5%(P0.05),A等位基因和C等位基因分布频率分别59.3%对47.0%(P0.05)和40.7%对53.0%(P0.05);HCC组IL-18-137G/C位点的GG基因和G等位基因频率显著高于健康人(P0.05),HCC组IL-18-607A/C位点的AA基因和A等位基因频率也显著高于健康人(P0.05),提示携带IL-18-137G/C和IL-18-607A/C位点基因型和A等位基因者罹患HCC的风险增加。结论携带IL-18基因-137G/C位点GG基因型和G等位基因以及-607A/C位点AA基因型和A等位基因者可能更容易发生HCC,对HBV感染者筛查这些基因可能有助于早期发现肝肿瘤,以利于早期处理和改善预后。     

冠心病患者PAI-1基因4G/5G多态性与血脂、血糖的关系

纤溶酶原激活剂抑制物-1(plasminogen activator inhibitor-1,PAI-1)基因不仅与PAl-1活性有密切的关系,而且影响血脂、血糖代谢[1,2].本研究应用酶切法对冠心病患者PAI-1启动子区域单核苷酸插入/缺失(4G/5G)多态性进行分析,旨在探讨冠心病患者PAl-1基因4G/5G多态性与血脂、血糖的关系.     

冠心病患者TM基因1418位C/T多态性的研究

提取100例冠心病(CHD)患者和73例非CHD患者的基因组DNA,采用突变特异性扩增系统方法检测血栓调节蛋白(TM)基因1418位C/T多态性.发现我国北方地区人群中TM 1418位存在C/T两态,且以基因型T/C为主;CHD患者与非CHD患者间基因型频率和等位基因型频率均有统计学差异.认为TM 1418位C/T多态性与CHD发病相关.     

急性脑梗死患者IL-18基因启动子607C／A、137G／C位点多态性观察

目的观察急性脑梗死患者白细胞介素18（IL-18）基因启动子607C／A和137G／C位点单核苷酸多态性（SNP）。方法采用型特异性引物聚合酶链反应（PCR-SSP）技术检测98例脑梗死患者（观察组）和100例健康对照者（对照组）血清IL-18基因启动子607C／A和137G／C位点多态性。结果两组607C／A位点基因型CC、CA和AA的频率及等位基因频率相比P均〉0．05。观察组组137G／C位点GG型频率显著高于对照组,GC型的频率显著低于对照组（P〈0．05）,两组等位基因频率的分布也有显著性差异（P〈0．05）。结论急性脑梗死患者IL-18基因启动子607C／A位点SNP与脑梗死无关,137G／C位点携带等位基因C可能有预防急性脑梗死的作用。     

PEMT基因G175A和rs12325817位点多态性与非酒精性脂肪肝的关系

目的:研究磷脂酰乙醇胺N甲基转移酶基因(PEMT)G175A和rs12325817位点多态性与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的关系.方法:运用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性检测156例NAFLD患者和188名健康对照PEMT基因G175A和rs464396基因型,等位基因频率分布,分析NAFLD患者与对照组临床各...     

2型糖尿病患者内脂素基因位点rs61330082、rs4730153多态性的研究

目的 探讨内脂素基因位点rs61330082、rs4730153多态性与T2DM的相关性。方法利用SNPscanTM高通量单核苷酸多态性分型技术,对346例确诊T2DM患者(T2DM组)及1426名非T2DM对照人群(NC组)的内脂素基因位点rs61330082、rs4730153进行基因分型。Logistic回归分析T2DM的影响因素,受试者工作特征(ROC)曲线分析内脂素基因位点rs61330082、rs4730153对T2DM的诊断价值。结果 T2DM组女性比例、年龄、肥胖、吸烟史、高血压、FPG、HbA₁c、TG高于NC组(P<0.01),HDL-C低于NC组(P<0.01)。与NC组比较,T2DM组G等位基因和GG基因型频率升高(P<0.05)。Logistic回归分析显示,年龄、女性、肥胖、高血压、TG、rs4730153位点GG基因型是T2DM的危险因素,HDL-C是T2DM的保护因素。ROC曲线分析显示,曲线下面积为0.668,最佳切点值为20.04%,敏感度60.1%,特异度66.1%。结论 内脂素基因位点rs4730153突变...     

不同性别冠心病患者TLR2和TLR4的表达及其与性激素的关系

目的:探讨冠心病患者Toll样受体(TLR)2和4的表达与性别及雌二醇、睾酮之间的关系。方法:根据冠状动脉造影结果将研究人群分为冠心病组(122例,男70例,女52例)和正常对照组(55例,男29例,女26例),各组再根据性别分为男、女亚组,应用实时荧光定量RT-PCR法检测外周动脉血单个核细胞TLR2和TLR4mRNA的表达;化学发光法测定血浆E2及T的水平。结果:冠心病组男性及女性外周血单个核细胞TLR2和TLR4mRNA的表达均分别高于对照组的男性和女性[男性:TLR2mRNA:(0.006 0±0.001 8)︰(0.005 2±0.001 8);TLR4mRNA:(0.006 9±0.002 1)︰(0.005 3±0.001 5);均P0.05。女性:TLR2mRNA:(0.005 4±0.001 9)︰(0.004 5±0.001 8),TLR4mRNA:(0.005 7±0.001 7)︰(0.004 8±0.001 9);均P0.05]。冠心病组男性患者睾酮水平低于对照组男性[(5.45±1.75)ng·ml-1︰(6.65±1.93)ng·ml-1;P0.05],冠心病组女性患者血浆雌二醇水平低于对照组女性[(27.27±5.88)pg·ml-1︰(30.21±6.36)pg·ml-1;P0.05]。冠心病男性患者TLR2和TLR4mRNA均与血浆睾酮水平呈负相关(r值分别为-0.412和-0.583,均P0.05),冠心病女性患者TLR2和TLR4mRNA均与血浆雌二醇水平呈负相关(r值分别为-0.446和-0.662,均P0.05)。结论:老年男性睾酮水平降低及绝经后女性雌激素降低是冠心病发病的重要危险因素,其机制可能与TLR2及TLR4表达升高有关。     

IL-12RB2 rs3790567A/G位点单核苷酸多态性与原发性胆汁性肝硬化易感性的Meta分析

目的评价IL-12RB2 rs3790567A/G位点单核苷酸多态性与原发性胆汁性肝硬化(primary biliary cirrhosis,PBC)易感性的关系。方法通过计算机检索Pub Med、Embase、the Cochrane Library、Web of Science、中国知网、万方等中英文数据库,检索IL-12RB2 rs3790567A/G位点单核苷酸多态性与PBC相关的病例-对照研究。以PBC组与对照组人群基因型频率的OR值和95%CI为效应指标,采用随机或固定效应模型进行定量合并分析,并进行偏倚评估和敏感性分析。采用Rev Man 5. 3软件进行Meta分析。结果本研究共纳入文献6篇,PBC组(病例组) 1 584例,健康对照组2 648名。Meta分析结果表明,IL-12RB2 rs3790567A/G位点与PBC发病因素密切相关。5个基因型结果如下:显性模型:AA+AG vs GG,OR=1. 20,95%CI:1. 11～1. 29,差异有统计学意义(P 0. 05);隐性模型:AA vs AG+GG,OR=1. 59,95%CI:1. 25～2. 02,差异有统计学意义(P 0. 05);共显性模型:AG vs AA,OR=0. 83,95%CI:0. 53～1. 32,差异有统计学意义(P 0. 05); GG vs AA,OR=0. 03,95%CI:0～0. 07,差异有统计学意义(P 0. 05);等位基因模型A vs G,OR=1. 02,95%CI:0. 72～1. 45,差异无统计学意义(P 0. 05)。以研究地理位置及种族不同进行亚组分析,亚洲人显性基因模型:AA+AG vs GG,OR=1. 17,95%CI:0. 89～1. 55,差异无统计学意义(P=0. 26)。高加索人显性基因模型:AA+AG vs GG,OR=1. 30,95%CI:1. 17～1. 44,差异有统计学意义(P 0. 05);亚洲人隐性基因模型AA vs AG+GG,OR=1. 39,95%CI:1. 01～1. 91,差异无统计学意义(P=0. 05)。高加索人隐性基因模型:AA vs AG+GG,OR=1. 94,95%CI:1. 34～2. 81,差异有统计学意义(P 0. 05);亚洲人等位基因模型A vs G:OR=1. 26,95%CI:0. 70～2. 26,P 0. 05,高加索人A vs G,OR=1. 02,95%CI:0. 72～1. 45,差异无统计学意义(P 0. 05)。结论 IL-12RB2 rs3790567A/G在PBC AA和AA+AG基因模型中易感性显著增加,且通过亚组分析,证明种族间差异有统计学意义。