诺如病毒引起的感染性腹泻

由病毒引起的感染性腹泻,除轮状病毒、星状病毒外,近年来又增添了诺如病毒(Novovirus,NOV)。该病毒系杯状病毒族谱中主要成员,是一种单股正链的小RNA病毒。早在1945年,瑞曼(Reiman)等人     

广州市儿童秋冬季诺如病毒感染检测分析

目的 研究广东省广州市5岁以下儿童秋冬季急性病毒性腹泻诺如病毒的感染情况、基因型别和流行优势毒株。方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测诺如病毒(NVs),部分阳性标本的PCR产物经纯化、测序,结合参考毒株相应的核苷酸序列进行进化分析。结果 NVs的检出率为23.88%(112/469)。35株测序病毒之间的核苷酸序列同源性为70.4%~100%,均属于GII遗传组。广州市2003年秋冬季测序的11株NVs 5株为GII-4;5株为GII-3;另1株不能确定其型别;2004年测序的11株10株为GII-4;1株为GII-3;2005年所测序的13株均为GII-4。结论 广州市婴幼儿秋冬季病毒性腹泻存在不同基因型NVs感染,以NV GII组毒株为主,其中GII-4型为流行优势株。     

2012-2014年广东省哨点医院诺如病毒GII.4 Sydney变异株流行状况及暴发疫情特征分析

目的：分析2012年1月至2014年6月广东省哨点医院诺如病毒GII.4 Sydney变异株流行状况,以及由诺如病毒GII.4 Sydney变异株感染引起的暴发疫情特征。方法2012年1月至2014年6月在广东省选取22家医院的门诊科室为监测哨点,将采集的腹泻病例粪便样本（共10750份）送至市级CDC,进行病毒核酸提取及诺如病毒核酸检测,所有阳性样本递送至广东省CDC,并按照随机数字法抽取了855份进行诺如病毒基因分型,共成功测序样本690份。采用χ2检验比较不同年龄组、不同时期内腹泻病例诺如病毒感染情况。通过广东省突发公共卫生事件管理信息系统,收集2012年1月至2014年6月广东省13起由诺如病毒GII.4 Sydney变异株感染引起的社区暴发疫情数据,进行社区流行病学分析。结果2012年8月首次检出诺如病毒GII.4 Sydney变异株,2012年11月检出比例为13/15。2012年11月至2013年1月（T1时期）,各月份中腹泻病例诺如病毒感染阳性率分别为23.8%（100/421）、15.9%（61/383）、19.2%（95/495）,2013年11月至2014年1月（T2时期）,各月份中腹泻病例诺如病毒感染阳性率分别为17.0%（90/529）、8.7%（37/426）、11.2%（46/409）,均低于T1时期（χ2值分别为6.65、9.93、10.74,P值分别为0.010、0.002、0.001）。T1时期内≥15、<15岁组腹泻病例诺如病毒感染阳性率分别为26.3%（143/543）、14.9%（113/756）（χ2=25.90,P<0.001）;T2时期≥15、<15岁组阳性率分别为10.1%（52/516）、14.3%（121/848）（χ2=5.09,P=0.024）。13起暴发疫情中,食源性传播占10/13。结论广东省2012年8月首次检出诺如病毒GII.4 Sydney变异株,2012年11月起呈现社区流行,流行1年后,强度降低;由诺如病毒GII.4 Sydney变异株引起的暴发疫情主要以食源性传播为主。     

2013—2015年广西食源性疾病监测哨点医院腹泻病人诺如病毒感染情况分析

目的 了解广西腹泻病人诺如病毒感染情况,为制定食源性疾病防控措施提供依据.方法 将2013—2015年哨点医院腹泻病人相关资料作为数据来源,用R软件进行统计分析.结果 接收腹泻病例2236例,其中检测诺如病毒阳性587例,阳性检出率为26.3%,年龄分布以0~5岁的儿童为主,占57.4%(337/587);职业以托幼儿童为主,占35.4%(208/587);阳性检出率最高的是桂林市26.5%(95/358);临床症状水样便占89.9%(528/587),呕吐占31.7%(186/587);可疑暴露食品中米面食品类占28.5%(125/439),肉与肉制品占12.8%(56/439).结论 经济发达和人群流动量大的柳州、桂林市诺如病毒活动强度高于其他监测地区.散居儿童、托幼儿童和婴幼儿为主要发病人群.应加强监测,及时发布预警信息,减少社区和托幼机构传播.     

杭州地区2009-2010年急性腹泻患者中杯状病毒的检测和分型

目的 了解2009-2010年杭州地区急性腹泻患者中杯状病毒基因型别和分子流行病学特征.方法 收集2009-2010年杭州地区920例急性腹泻患者的粪便标本和流行病学资料,用多重PCR方法进行杯状病毒检测,测定部分标本的阳性扩增片段基因序列,并对序列进行系统进化分析.结果 急性腹泻患者杯状病毒检出率为21.8％(201/920),其中诺如病毒(NV)G Ⅰ型25例、GⅡ型170例、札如病毒(SAV) 11例,4例为NVⅠ型和Ⅱ型混合感染、1例为NVⅡ型和SAV混合感染.NV基因型别包括:GⅠ-1(3株)、G Ⅰ-2(1株)、GⅡ-4/2006b变异株(7株)、GⅡ-2(1株)、GⅡ-7(1株)和GⅡ-4/2008变异株(2株);SAV基因型别包括:G Ⅰ -2(5株)、GⅠ-1(4株)和GⅡ-1(1株).杯状病毒的流行在不同季节、年龄组人群均有发病.结论 杯状病毒是2009-2010年引起杭州地区急性腹泻的主要病原之一,其病原具有病毒多样性和基因型别多样性,NVGⅡ-4/2006b变异株或类似株可能是2009-2010年杭州地区流行的优势株.     

2008年广州市婴幼儿诺如病毒感染流行特征及基因型研究

目的了解广州市5岁以下婴幼儿诺如病毒感染状况及对诺如病毒阳性株进行基因型分析。方法收集广州市2008年5家病毒性腹泻监测点医院的门诊临床诊断为病毒性腹泻的5岁以下患儿临床资料及粪便标本692份,采用ELISA方法检测轮状病毒、腺病毒、星状病毒和诺如病毒抗原,将诺如病毒抗原阳性的标本用RT-PCR方法进行诺如病毒核酸扩增,阳性产物回收、纯化并测序,结合GenBank中的相关序列进行型别流行特点分析。结果 692份标本中,ELISA方法检测4种病毒的阳性率分别为轮状病毒31.9%(221/692)、诺如病毒21.2%(147/692)、腺病毒6.1%(42/692)、星状病毒1.2%(8/692),混合感染占6.8%(47/692)。诺如病毒腹泻病例发病高峰在9—11月份,占51.7%(76/147),2岁以下病例数占91.8%(135/147)。临床症状以腹泻、呕吐、发热、腹痛为主。147份诺如病毒ELISA阳性标本中RT-PCR方法检测诺如病毒核酸阳性率为84.4%(124/147),经测序及与GenBank中的相关序列比对,证实124份均属诺如病毒GⅡ遗传组,其中1份是GⅡ2型,其余均为GⅡ4型,GⅡ4型中又有不同分支。结论诺如病毒是广州市5岁以下儿童病毒性腹泻的常见病原之一,仅次于轮状病毒,常见于2岁以下婴幼儿,流行优势株基因型为GⅡ4型。     

汕头市2012-2013年病毒性腹泻监测结果分析

目的分析汕头市病毒性腹泻中轮状病毒和诺如病毒的感染情况,为病毒性腹泻防治工作提供参考依据。方法收集2012年1月至2013年12月汕头市第二人民医院和澄海人民医院的腹泻病人粪便标本,采用ELISA法检测轮状病毒,采用双色实时荧光PCR方法检测诺如病毒。结果检测粪便样品共825份,总检测阳性率为24.97%,其中轮状病毒和诺如病毒的阳性率分别为16.48%和8.48%。0~1岁年龄组患者阳性率显著高于其它年龄组患者。病毒性腹泻全年均有发生,冬季(48.84%)阳性率最高,夏季阳性率(8.70%)最低。轮状病毒阳性率最高的季节是冬季38.60%,明显高于其它三个季节。诺如病毒呈常年散发。结论2012-2013年汕头市腹泻患者粪便标本中轮状病毒和诺如病毒检出率较高。病毒性腹泻全年均可发生,冬季阳性率较高。各年龄组人群都可感染,1岁及以下婴幼儿是病毒性腹泻的防控工作重点人群,应加强其监测。     

甘肃武威市门诊腹泻儿童轮状病毒和诺如病毒腹泻流行特征分析

目的 分析武威市5岁以下儿童轮状病毒和诺如病毒腹泻的流行病学特征。方法 收集武威市两所哨点医院2012-2014年门诊腹泻患儿粪便标本,采用酶联免疫吸附实验(ELISA)法检测轮状病毒(RV)抗原,检出的阳性标本用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行G/P基因分型;采用RT-PCR检测诺如病毒(NoV),分析流行病学特征。结果 共采集182份粪便标本,A组RV抗原阳性率为29.12%,男女性别差异有统计学意义(χ²=182.000,P<0.001);2岁以下儿童为RV 高发人群,高发与低发年龄段RV阳性率差异有统计学意义(χ²=219.576,P<0.001);发病高峰出现在5月、11月,5月份阳性率最高,高发与低发月份阳性率差异有统计学意义(χ²=279.000,P<0.001 )。RV G、P分型,以G9、G3、P[8]型为主要流行株,G、P型组合模式分析显示:最常见的是G9+P[8],其次是G3+P[8]。NoV抗原阳性率为15.93%,病例年龄均为2岁以下儿童;发病也呈现两个高峰,分别为4月最高峰和12月次高峰,高发与低发月份阳性率差异具有统计学意义(χ²=159.641,P<0.001);对NoV阳性标本进行分型,GI型占55.17%,GII型占44.83%。A组RV和NoV混合感染阳性率为6.04%。结论 RV和NoV是武威市5岁以下儿童腹泻的主要病原体,应根据流行特征做好预防工作。     

浙江台州地区婴幼儿诺如病毒感染特征及危险因素分析

目的了解浙江台州地区婴幼儿腹泻病例诺如病毒的感染情况,并分析其危险因素。方法选取2017年1—12月台州地区腹泻哨点监测医院0~6岁腹泻患儿670例,对患儿粪便样本进行诺如病毒核酸检测,与轮状病毒感染患儿进行症状对比,同时根据病毒阳性情况,选取396例健康体检儿童作为对照组,分析诺如病毒感染的危险因素。结果670例腹泻患儿中诺如病毒阳性率为19.70%(132例),其中GⅡ基因型110例,GⅠ基因型22例;不同性别和年龄腹泻患儿诺如病毒阳性率比较差异无统计学意义(P>0.05)。2017年1—2月和10—12月阳性率呈现高峰;诺如病毒感染患儿腹泻≥5次/d、水样便、呕吐及发热的比例明显高于轮状病毒感染患儿,差异有统计学意义(χ^2=43.147、12.563、49.847、28.589,P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,菜板生熟未分(OR=1.958,95%CI:1.243~3.086)和发病前1周接触胃肠炎患者(OR=2.438,95%CI:1.247~4.765)是诺如病毒感染的危险因素。结论婴幼儿腹泻病例诺如病毒感染呈明显的季节性分布,菜板生熟未分、发病前1周接触胃肠炎患者是诺如病毒感染的危险因素。     

广西南宁市部分腹泻标本诺如病毒检测结果分析

目的了解南宁市部分腹泻患者中诺如病毒感染情况,分析南宁市诺如病毒流行特征。方法收集2015年5月-2019年3月南宁市部分腹泻患者粪便或肛拭子标本1 199份,采用实时荧光PCR进行诺如病毒GⅠ型和GⅡ型检测,Excel2007整理信息数据,SPSS21.0进行统计学分析。计数资料采用卡方检验,并进行描述性统计分析。结果 2015年5月-2019年3月,南宁市部分腹泻人群中诺如病毒总阳性率为19.85%,GⅠ型占9.24%,GⅡ型占88.24%,GⅠ型和GⅡ型混合感染占2.52%。3月和11月阳性率高,武鸣区阳性率最高33.18%;各年龄段、性别、标本类型阳性率差异无统计学意义,各年龄段GⅠ型阳性率差异有统计学意义(X²=12.374,P=0.015)。31岁～组阳性率最高。结论南宁市GⅡ型的感染比GⅠ型更加广泛,流行时期是早春和秋季。监测范围应覆盖全市,规范样品采集数量和质量,对阳性率高的年龄组进行重点采集。开展部分腹泻人群诺如病毒基因测序,为我市诺如病毒预防和控制提供更加科学的数据支持。     

北京市2013－2014年肠道门诊腹泻患者中诺如病毒感染的流行病学及临床特征分析

目的 了解北京市肠道门诊腹泻患者诺如病毒感染的流行状况及临床特点。方法 采集2013年4月至2014年3月北京市肠道门诊1 892名腹泻患者粪便标本, 并收集患者的流行病学及临床症状资料。使用real time RT-PCR对诺如病毒核酸进行检测, 采用描述性流行病学方法进行分析。结果 2013年4月至2014年3月北京市肠道门诊腹泻患者诺如病毒阳性率为14.2%(269/1 892);寒冷月份阳性率较高;怀柔区、延庆县等西北部山区阳性率较高;6月龄至5岁儿童诺如病毒阳性率高于其他年龄组, 差异有统计学意义(P=0.006), 散居托幼儿童诺如病毒阳性率高于其他职业人群, 差异有统计学意义(P=0.025);诺如病毒阳性腹泻患者恶心、呕吐症状发生率高于阴性患者, 差异有统计学意义(P<0.05)。结论 诺如病毒是肠道门诊腹泻患者的重要病原, 6月龄至5岁腹泻儿童诺如病毒感染率高于其他人群, 恶心、呕吐为诺如病毒感染的常见症状。     

2017-2019年湖北省病毒性腹泻哨点监测病例中诺如病毒流行及基因特征

目的  了解湖北省2017-2019年病毒性腹泻哨点监测病例中诺如病毒(norovirus, NV)的流行病学特征和基因型别特征。方法  收集2017年1月1日-2019年12月30日成人和儿童腹泻患者的粪便标本共1 957份,采用实时荧光RT-PCR法进行NV GI和GII型别鉴定;对NV检测阳性的GII型标本应用RT-PCR扩增开放阅读框(open reading frame, ORF)1/ORF2铰链区,将获得的PCR产物直接测序并进行基因型别和重组分析。结果  男性和女性腹泻患者中NV阳性检出率差异有统计学意义(χ² =5.18, P=0.023)。各年龄组腹泻患者间NV阳性检出率差异有统计学意义(χ² =98.04, P＜0.001),其中1~＜2岁年龄组腹泻患者NV阳性检出率最高,为23.50%。2017-2019年湖北省NV感染呈现2个流行峰,高峰出现在10-12月间,低峰出现在3-4月。NV主要为GII基因型,其中以GII.4、GII.2和GII.3亚型为主。主要的重组型有GII.2[P16]、GII.4[P31]、GII.3[P12]和GII.4[P16]。结论  2017-2019年湖北地区存在多种基因型NV的感染,并发现不同的重组亚型。加强NV的基因型别监测和重组分析有利于掌握NV的分子流行病学特征,为科学防控提供理论依据。     

广西自治区2006—2007年诺如病毒腹泻暴发疫情特征分析

目的分析广西诺如病毒腹泻疫情的流行特征及流行因素，为预防控制提供依据。方法采用现场流行病学调查方法及描述性分析方法，对2006年1月至2007年12月广西诺如病毒腹泻疫情报告及个案资料进行调查分析。结果2006年1月至2007年12月，广西共报告9起（城市1起，农村地区8起）诺如病毒腹泻疫情，累计病例1174例，其中实验室诊断病例75例（6．39％），临床诊断病例1099例（93．61％），无死亡病例。疫情暴发地点主要为农村地区的学校、监狱、自然村屯，农村病例数构成（86．20％）高于城市（13．80％）（P〈0．01）；病例时间分布有明显季节性，2006年病例时间分布与2007年分布不一致，2006年病例全部集中在9、10和12月，2007年病例主要集中在4—6月，占总病例数的78．75％（452／574）；病例年龄主要为10～19岁（39．52％）和20-29岁（28．88％），年龄构成差异有统计学意义（P〈0．01），男女性别比为2．19：1，职业分布主要为在校学生和服刑人员。病例症状较轻，病程一般为2—3d，具有自限性。可能的传播途径包括经水和食物、人传人接触传播等多途径传播。共采集81份病例和10份密切接触者急性期粪便标本，检出诺如病毒RNA阳性72份和5份，检出率分别为88．89％和50．00％。结论广西诺如病毒腹泻暴发疫情多在农村地区的中小学校发生，具有明显季节性，主要集中在秋季和初夏季节。应加强疫情监测，提高实验室检测能力，重点针对疫情好发地区，采取健康教育、加强饮用水卫生和饮食卫生等综合措施，减少诺如病毒腹泻暴发疫情的发生。     

2016 - 2017年宁夏地区急性腹泻患者中诺如病毒的流行特征分析

目的 了解宁夏地区急性腹泻患者中诺如病毒的流行特征。方法 2016 - 2017年在宁夏5个市10家哨点医院门诊收集符合纳入条件的腹泻标本2 334例,采用实时荧光定量RT - PCR方法进行定性检测,采用RT - PCR分别对GⅡ型阳性NoV标本的RdRp区和VP1区进行扩增、测序,并进行基因分型及进化树构建。结果 2 334例粪便标本中（男性1 343例,女性991例）,诺如病毒总阳性率为15.68%（366/2 334）,GⅠ型阳性率0.86%（20/2 334）,GⅡ型阳性率为14.82%（346/2 334）;10～20岁年龄组阳性率最高,为27.19%（31/114）,其次为0～2岁年龄组,为18.12%（251/1385）,50～60岁年龄组阳性率最低,为5.48%（4/73）;冬春季发病率高。序列分析显示,GⅡ型NoV的RdRp区序列分为5种亚型,依次为GⅡ.Pe、GⅡ.P12、GⅡ.P16、GⅡ.P17和GⅡ.P7;VP1区序列分为6种亚型,依次为GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3、GⅡ.2、GⅡ.1、GⅡ.17和GⅡ.6。结论 2016 - 2017年宁夏地区GⅡ型NoV存在多种基因型感染,RdRp区以GⅡ.Pe和GⅡ.P12为主,VP1区以GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3为主。     

广东省2012年病毒性腹泻病原学特征分析

目的系统掌握广东省病毒性腹泻的病原学特征及变化趋势,为病毒性腹泻防治工作提供参考依据。方法在广东省选择广州、深圳、肇庆等11个地级市23家哨点医院,每家哨点医院每周至少收集≤5岁和〉5岁门诊就诊腹泻病例粪便样本各3份进行轮状病毒和诺如病毒检测。结果2012年广东省11个哨点监测市23家哨点医院共采集门诊腹泻病例粪便样本4644份,轮状病毒和诺如病毒阳性检出率分别为13．94％（645／4627）和22．14％（1028／4644）。轮状病毒≤5岁年龄组阳性率为18．60％（445／2393）,〉5岁年龄组阳性率为8．95％（200／2234）,差异有统计学意义（P〈0．01）。诺如病毒≤5岁年龄组阳性率为21．88％（524／2395）,〉5岁年龄组阳性率为22．41％（504／2249）,差别无统计学意义（P〉0．05）。轮状病毒阳性检出率最高的月份是1月,为41．50％（105／253）;诺如病毒阳性检出率最高的月份是10月,为40．15％（218／543）。从1028份诺如病毒阳性样本中随机抽取226份进行序列测定,结果显示诺如病毒基因型GII型203份、GI型23份。203份GIL型中,GIL4型172份（其中GIL 4Sydney2012变异株87份、GIL 42006b变异株78份、GIL42010变异株4份、未分型3份）。结论2012年广东省病毒性腹泻的优势病毒是诺如病毒,而诺如病毒占优势与出现新的诺如病毒GIL4Sydney2012变异株有关。     

广西自治区2006-2007年诺如病毒腹泻暴发疫情特征分析

目的 分析广西诺如病毒腹泻疫情的流行特征及流行因素,为预防控制提供依据.方法 采用现场流行病学调查方法 及描述性分析方法 ,对2006年1月至2007年12月广西诺如病毒腹泻疫情报告及个案资料进行调查分析.结果 2006年1月至2007年12月,广西共报告9起(城市1起,农村地区8起)诺如病毒腹泻疫情,累计病例1174例,其中实验室诊断病例75例(6.39%),临床诊断病例1099例(93.61%),无死亡病例.疫情暴发地点主要为农村地区的学校、监狱、自然村屯,农村病例数构成(86.20%)高于城市(13.80%)(P<0.01);病例时间分布有明显季节性,2006年病例时间分布与2007年分布不一致,2006年病例全部集中在9、10和12月,2007年病例主要集中在4-6月,占总病例数的78.75%(452/574);病例年龄主要为10～19岁(39.52%)和20～29岁(28.88%),年龄构成差异有统计学意义(P<0.01),男女性别比为2.19∶1,职业分布主要为在校学生和服刑人员.病例症状较轻,病程一般为2～3 d,具有自限性.可能的传播途径包括经水和食物、人传人接触传播等多途径传播.共采集81份病例和10份密切接触者急性期粪便标本,检出诺如病毒RNA阳性72份和5份,检出率分别为88.89%和50.00%.结论 广西诺如病毒腹泻暴发疫情多在农村地区的中小学校发生,具有明显季节性,主要集中在秋季和初夏季节.应加强疫情监测,提高实验室检测能力,重点针对疫情好发地区,采取健康教育、加强饮用水卫生和饮食卫生等综合措施,减少诺如病毒腹泻暴发疫情的发生.