中药化学成分对大鼠致癌毒性的定量构效关系研究

目的 采用计算机毒性预测技术预测中药的致癌毒性,为中药安全性评价提供新的途径.方法 采用Mold2软件(version 2.0.0)对1532个中药化学成分进行分子描述符计算,初步筛选后采用随机森林算法构建定量构效关系模型,筛选出最优预测模型,并对2010年版《中华人民共和国药典》所载83个有毒中药中有化学成分单体结构报道的60种中药(1609个化学成分)进行致癌毒性预测.结果 经筛选,当描述符集合为60个时,随机森林算法建立的定量构效关系模型准确度最高,为0.69.预测60种中药(1609个化学成分)中致癌活性化合物为481个.结论 本文采用随机森林算法构建定量构效关系模型,并可对有毒中药化学成分进行致癌毒性预测,为进一步中药致癌性试验研究提供参考.     

紫衫醇构效关系的研究

紫杉醇是具有紫杉烯环的二萜类化合物。紫杉醇的基本骨架是由A、B、C、D四环组成。A环：为六元环,C11-C12之间为双键,C1上连羟基,C12连甲基(即18号碳),C13位连3个碳原子,C1为甲酯,C2连羟基,C3连苯基和苯甲酰胺基,C15连二甲基(既16和17号碳);B环：为八元环,C2连苯氧甲酰基,C8连甲基(即19号碳),C9为羰基,C10连乙酰氧基;C环：为六元环,C4连乙酰氧基;C7连羟基。D环：为氧丁环。     

中药保健食品原料肝毒性预测研究

目的：开发一种更优的评估中药肝毒性的方法,为中药保健食品原料安全性评价提供参考。方法：基于国际公开构建肝毒性定量构效关系（QSAR）模型训练集数据,形成训练集。使用Discovery Studio 4.5对训练集进行主成分分析和聚类分析,针对每一类使用朴素贝叶斯（NB）、逻辑回归（LR）、邻近算法（KNN）等9种机器学习的方法构建QSAR模型,并利用交叉验证方法对模型构建方法进行评估。最后使用最优类模型对113种中药保健食品原料包含的783个成分进行了预测,根据多模型加权平均概率筛选出肝毒性成分占比较大的中药。结果：根据对训练集化合物的分析,可以看出第3类模型的准确率为85%～91%,高于现有报道的中药成分肝毒性预测模型。对中药保健食品原料成分的分析发现肝毒性化合物48个、不具有肝毒性的化合物735个,肝毒性预测概率为0.15～0.30,说明中药保健食品原料肝毒性普遍较低。预测肝毒性成分所占比例较高的中药有茜草、番泻叶、当归、大黄、丹参、厚朴、川芎、桑枝、桑白皮、五味子等。结论：对训练集预先聚类,提高QSAR模型准确率,为中药安全性评价的方法学研究提供了新思路,为中药保健食品原料成分进...     

黄酮类化合物的构效关系研究纂要

黄酮类化合物广泛存在于植物界,是目前倍受关注的天然活性产物之一.近年来,对黄酮类化合物的研究逐渐增多.大量研究证明,黄酮类化合物具有抗氧化、抗癌、抗艾滋病、抗菌、抗过敏、抗炎等多种生理活性及药理作用,且无毒副作用,对人类的肿瘤、衰老、心血管疾病的防治具有重要意义.构效关系的研究,对从中草药中筛选出更安全、有效的药物是十分必要的手段.同时,从实验中获得大量有关构效关系的信息,应尽快写进<中药化学>的教材中,填补空白,提高教材的理论水平.     

莲心碱衍生物的合成及其抗心律失常作用的定量构效关系研究

目的：研究莲心碱衍生物抗心律失常作用的定量构效关系（QSAR），方法：以莲心碱为先导化合的，在其分子两端的酚羟基进行酰化，醚化合成了6种莲心碱衍生物；通过乌头碱诱发的大鼠心律失常模型考察这些衍生物的抗心律失常作用，并用logit法计算ED50，采用Hansch方程对实验结果进行数学处理，拟合QSAR方程，结果：莲心碱衍生物的结构经红外，质谱及氢谱得以 证实，所得QSAR方程为log/ED50=2.1629 0.06693∑π（n=7,r=-0.8946,s=0.01496)。结论：在莲心碱的酚羟基上引入亲脂性基团时有利于增强其抗心律失常活性。     

浙江省汉族与畲族CYP2C19基因多态性研究

 目的 调查浙江省汉族与畲族CYP2C19基因多态性。方法 采用PCR体外扩增CYP2C19的两个多态性位点CYP2C19*2(m1)和CYP2C19*3(m2),m1的PCR扩增产物用Sma I酶切,m2的PCR产物用BamH I酶切,琼脂糖电泳检测。结果 汉族与畲族各种基因型出现频率为:wt／wt:0.412,0.411;wt／ml:0.345,0.387;wt/m2:0.108,0.055;ml／ml:0.081,0.123;ml／m2:0.054,0.018;m2／m2:0.000,0.006。汉族与畲族CYP2C19不同等位基因出现频率:wt:0.639,0.632;ml:0.280,0.325;m2:0.081,0.043。结论 浙江省汉族m2出现频率高于畲族,且差异显著(P<0.05);畲族ml出现频率高于汉族。CYP2C19各种基因型:wt／wt出现频率汉、畲两民族相近;wt／m2,ml／m2基因型汉族大于畲族;wt／ml,ml／ml畲族明显高于汉族。     

药物定量构-效关系研究方法概况

定量构-效关系(QSAR)能够产生和优化先导化合物,从分子水平上阐明作用机制,因而广泛应用于药物分子设计中。作者阐述了QSAR方法及其原理、优缺点,包括取代基多参数法(Hansch法)、比较分子力场分析法(CoMFA)、Free-Wilson法。可以预见,QSAR研究中的方法将不断完善,各种方法因出发点和侧重点不同而相互交叉渗透,从而在新药的创制中将发挥更大的作用。     

青海撒拉族人群CYP2C19基因多态性研究

 目的 调查青海撒拉族健康人群中CYP2C19基因型及等位基因的分布特征。方法 采用聚合酶链式反应与限制性内切酶片段长度多态性技术（PCR-RFLP）,对99例健康撒拉族人群CYP2C19基因多态性进行分析。结果 撒拉族人群的CYP2C19*1、CYP2C19*2和CYP2C19*3 3种等位基因的发生频率分别为56.6%、29.8%和13.6%;CYP2C19*1/*1、CYP2C19*1/*2、CYP2C19*1/*3、CYP2C19*2/*2和CYP2C19*2/*3基因型出现频率分别为30.3%、36.4%、16.2%、6.1%和11.1%,CYP2C19*3/*3的纯合子基因型在本试验中未发现。结论 青海撒拉族人群 CYP2C19基因分布明显不同于维族、黎族、傣族、白族、畲族、回族和爱尔兰人,而相似于土族、独龙族、苗族、藏族和汉族。
     

难治性胃食管反流病脾虚证CYP2C19基因表达及中药干预研究

目的探讨难治性胃食管反流病(RGERD)脾虚证CYP2C19基因表达情况及中药干预疗效,观察不同代谢型患者使用质子泵抑制剂(PPI)联合补中益气颗粒治疗效果。方法对82例RGERD脾虚证患者行PCR-RFLP进行基因分型,分为强代谢型组68例和弱代谢型组14例。两组患者在服用PPI基础上,加用补中益气颗粒4周,观察两组患者反流性疾病问卷表(RDQ量表)症状评分和总分及脾虚症状患者变化情况。结果强代谢型组患者治疗后反流、烧心、非心源性胸痛评分及RDQ总分较治疗前显著下降(P0.05),其口淡、食少纳呆、神疲乏力、便溏患者例数也显著减少(P0.05)。弱代谢型组患者治疗后反酸、反流、烧心、非心源性胸痛评分及RDQ总分虽下降,但差异无统计学意义(P0.05),其食少纳呆、神疲乏力、便溏患者例数较治疗前显著减少(P0.05)。结论 RGERD脾虚证药物干预效果与其CYP2C19基因表达相关,PPI联合中药治疗RGERD对CYP2C19基因强代谢型疗效更为显著。     

基于文献报道的中药化学成分与CYP450s 相互作用研究

目的：使用复杂网络技术研究中药化学成分与CYP450s的关系,为中药分子机理研究和新药开发提供参考。方法：本文基于120篇文献报道,通过人工摘录的方式收集中药化学成分和CYP450s的相关信息,使用Cytoscape 2.8.2作为分析工具,构建化学成分与CYP450s的复杂网络图,并计算了点度中心度、接近中心度、中间中心度以及中药化学成分节点的相似度。结果：本文采集了169个中药化学成分和25种CYP450s的相关信息。CYP2C19、CYP1A2、CYP3A4等CYP450s和槲皮素、银杏内酯A、黄芩素等化学成分为目前研究的热点酶和热点中药化学成分。相似度较高的欧前胡素和银杏内酯B,槲皮素和黄芩素等化学成分可能存在协同相互作用。结论：复杂网络计算可以很好地辅助中药协同作用机理研究和新药开发工作。     

中药化学成分对大鼠心脏毒性的QSAR研究

目的：建立中药化学成分对大鼠心脏毒性的预测方法,为常规的动物实验提供参考,为中药安全性评价提供了新的途径和方法。方法：本文使用Mold 2软件（Version 2.0.0）对收集到的1 034个化学成分进行了分子描述符计算,采用随机森林算法（Random Forest,RF）和支持向量机（Support Vector Machine,SVM）方法对描述符进行筛选。然后使用推进式决策树算法、支持向量机算法、正则化判别分析算法和随机森林算法构建模型,分别计算了模型的准确率和Kappa值,筛选出最优预测模型,并对中药化学成分进行预测。结果：通过比较预测模型的准确度和Kappa值,得出随机森林模型为最优算法模型,准确率为86.3%,Kappa值为0.725。最后,对《中华人民共和国药典》（2010版）记载的有毒中药,例如吴茱萸、北豆根、九里香等包含的化学成分进行了预测,得到一些有意义的结果。结论：定量构效关系模型（Quantitative Structure-Activity Relationship,QSAR）对中药化学成分进行预测研究可以为进一步的实验、临床研究提供重要参考。     

中国CYP2C19强代谢者和弱代谢者的奥美拉唑及其代谢产物的药动学比较

 目的 研究19名细胞色素氧化酶CYP2C19强代谢者和6名弱代谢者奥美拉唑及其代谢产物5-羟基奥美拉唑和奥美拉唑砜的药动学规律。方法 采用高效液相-二极管阵列色谱法测定其中25名在po 20mg奥美拉唑胶囊后24 h内的奥美拉唑及其主要代谢产物的血药浓度,计算药动学参数。结果 在25名奥美拉唑药物代谢的志愿受试者中,19名是CYP2C19强代谢者(Extensive Metabolizers,EMs);6名是CYP2C19弱代谢者(Poor Metabolizers,PMs)。奥美拉唑在强代谢者和弱代谢者组平均清除率分别为(16.46±6.13)和(4.9±0.8)mL·h^-1·kg^-1,奥关拉唑曲线下面积分别为(1330.63±596.0)和(4869±1191)ng·h·mL^-1;弱代谢者组的奥美拉唑的代谢动力学与强代谢者组存在显著差别,表明奥美拉唑的代谢速率与CYP2C19的表型有关系。结论 奥美拉唑羟化代谢存在着多态性。CYP2C19弱代谢者的奥关拉唑羟化代谢明显低于CYP2C19强代谢者。     

中国汉族和蒙古族健康人药物代谢酶CYP3A4、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6基因多态性分析

 目的 用基因分型技术对中国汉族、蒙古族健康人CYP3A4、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6进行基因多态性分析,并对汉族人和蒙古族人基因表型和基因频率进行比较。方法 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对CYP3A4、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6进行分型。结果 汉族、蒙古族健康人CYP3A4*5等位基因频率为0, CYP3A4*18等位基因频率分别为0.183 8、0.202 5,CYP2C9*2等位基因频率分别为0.011 0、0.025 3, CYP2C9*13等位基因频率分别为0、0.00 32,CYP2C19*2等位基因频率分别为0.386 0、0.4146, CYP2C19*3等位基因频率分别为0.051 5、0.044 3,CYP2D6*10等位基因频率分别为0.573 5、0.465 2。结论 汉族、蒙古族健康人群CYP3A4*18、CYP2C19*2、CYP2C19*3、CYP2D6*10等位基因频率均没有显著性差异;本试验在汉族、蒙古族健康人中未发现CYP3A4*5等位基因;仅在蒙古族健康受试人群中发现1人为CYP2C9*1/*13基因型;蒙古族CYP2C9*2等位基因频率远小于汉族（P=0.023）。     

Inhibitory effects of cytochrome P450 enzymes CYP2C8, CYP2C9, CYP2C19 and CYP3A4 by Labisia pumila extracts

Ethnopharmacological relevance

Labisa pumila (LP), popularly known with its local name, Kacip Fatimah, is a well known herb grown in Indochina and Southeast Asia and is traditionally used to regain energy after giving birth in women. The propensity of LP to cause drug–herb interaction via cytochrome P450 (CYP) enzyme system has not been investigated.

Aim of the study

To evaluate the in vitro inhibitory effects of various LP extracts (aqueous, ethanol, dichloromethane (DCM) and hexane) on cytochrome P450 2C8 (CYP2C8), CYP2C9, CYP2C19 and CYP3A4 activities.

Materials and methods

Probe substrate-based high performance liquid chromatography (HPLC) methods were established for CYP2C9, CYP2C19 and CYP3A4 whereas a fluorescence-based enzyme assay was established for CYP2C8. The metabolite formations were examined after incubation of probe substrate with respective CYP isoform in the present or absent of LP extracts. The inhibitory effect of LP was characterized with kinetic parameters IC₅₀ and K_i values.

Results

LP extracts showed differential effect of CYP activities with the order of inhibitory potency as follows: dichloromethane>hexane>ethanol>aqueous. This differential effect was only observed in CYP2C isoforms but not CYP3A4. Both the hexane and DCM extracts exhibited moderate to potent inhibition towards CYP2C activities in different modes including non-competitive, competive and mixed-type. The DCM effect was notably strong for CYP2C8 and CYP2C9 showing K_i values of below 1 μg/ml. The selectivity of LP for CYP2C isoforms rather than CYP3A4 may be attributed to the presence of relatively small, lipophilic yet slightly polar compounds within the LP extracts.

Conclusions

The results of our study revealed that phytoconstituents contained in LP, particularly in hexane and dichloromethane extracts, were able to selectively inhibit CYP2C isoforms. The inactivation was characterized by low K_i values, in particular, in CYP2C8 and CYP2C9. These in vitro data indicate that LB preparations contain constituents that can potently inhibit CYP2C activities and suggest that this herb should be examined for potential pharmacokinetic drug interactions in vivo.     

泮托拉唑在不同CYP2C19基因型国人体内的药动学

 目的研究CYP2C19基因型对泮托拉唑中国健康志愿者体内药动学的影响。方法采用聚合酶链限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)分析CYP2C19基因型。24名健康志愿者按照基因型划分的基因表型被随机分为3组(每组8名),纯合子强代谢型组(homEMs),杂合子强代谢型组(hetEMs),弱代谢型组(PMs)。受试者单剂量po 40mg泮托拉唑肠溶片后血药浓度的测定采用高效液相色谱法。结果HomEMs,hetEMs,PMs3组个体内的泮托拉唑的主要药动学参数如下:ρ_max为(2551.8±1035.2),(3316.63±1237.27)和(4256.04±573.47)μg·L^-1;t_max为(3.38±0.92),(3.25±1.54)和(3.50±0.96)h;t_1/2Ke为(1.82±1.71),(1.34±0.22)和(5.83±3.28)h;AUC_0～t为(5616.37±1878),(8132.22±3549.4)和(24882.71±7051.33)μg·h·L^-1;AUC_0～∞为(5699.5±1932.1),(8238.5±3513.3)和(32394.9±12428.3)μg·h·L^-1。HetEM组和PM组的受试者其泮托拉唑的ρ_max高于homEM组(P<0.01),PM组的t_1/2Ke要长于homEM组(P<0.01)。AUC_0～t和AUC_0～∞在PM组要分别高于homEM组和hetEM组(P<0.01),但在homEM组和hetEM组之间没有差异。结论泮托拉唑药动学在个体之间的差异与CYP2C19的基因型有关。     

117例急性冠脉综合征病人CYP2C19基因多态性及中医证型分布的研究

目的探讨急性冠脉综合征人群中CYP2C19＊2基因多态性以及中医证型分布情况.方法抽取117例急性冠脉综合征病人的外周血,应用聚合酶链反应（PCR）进行CYP2C19＊2基因多态性以及中医证型分布的研究.结果 117例病人的中CYP2C19＊2基因多态性分布：突变纯合子10例（8.5%）,突变杂合子53例（45.3%）,正常纯合子54例（46.2%）,正常等位基因频率为0.688,突变等位基因频率为0.312.中医证型分布：心血瘀阻证22例（18.8%）,气虚血瘀证60例（51.3%）,气滞血瘀证11例（9.4%）,痰阻心脉证7例（6.0%）,阴寒凝滞证3例（2.6%）,气阴两虚证6例（5.1%）,心肾阴虚证2例（1.7%）,阳气虚衰证6例（5.1%）.结论 117例急性冠脉综合征病人氯吡格雷慢代谢型的发生率为31.2%;气虚血瘀证和心血瘀阻证为主要的证表现,且急性冠脉综合征病人中气虚血瘀证型显著高于其余证型;但各证型间基因分型无明显差异.     

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??OBJECTIVE To explore the impact of CYP2C19 genotype on major adverse cardiac events(MACE) in coronary disease patients receiving clopidogrel treatment, and provide reference for rational use of clopidogrel in clinic. METHODS Coronary disease patients hospitalized in the Vasculocardiology Deparment of our hospital from Apr to Sep 2014 were enrolled, CYP2C19 genotype was detected by pyrosequencing method, and the MACE caused by clopidogrel treatment was studied. RESULTS Among the 174 enrolled cases, CYP2C19*2 and CYP2C19*3 mutant alleles were observed in 96 patients(55.17%). Compared with patients with wild type, the mutant alleles carriers had higher risk of MACE(47.92% vs 11.54%, P<0.05). Compared with clopidogrel monotherapy, combined antiplatelet therapy with clopidogrel and aspirin lowered the risk of MACE(35.84% vs 62.79%, P<0.05). CONCLUSION It is suggested that CYP2C19*2 and CYP2C19*3 mutant alleles carriers receive higher dosage of clopidogrel, or use combined antiplatelet therapy or other antiplatelet drugs.     

冠脉介入术后气虚血瘀证与CYP2C19*2基因多态性的相关性研究

目的:探讨冠脉介入术后(PCI)气虚血瘀证与CYP2C19*2基因多态性的相关性。方法:405例行PCI成功的冠心病患者根据术后1周是否有气虚血瘀证表型分为气虚血瘀组(167例)和非气虚血瘀组(238例),抽取外周静脉血提取DNA,采用PCR-RFLP基因分析方法检测CYP2C19*2基因多态性。结果:单因素分析显示:气虚血瘀组CYP2C19*2基因突变型(GA+AA)明显高于非气虚血瘀组(χ2=15.945,P<0.001)。多因素Logistic回归分析显示:以非气虚血瘀组为参照系,调整诸混杂危险因素后,CYP2C19*2基因突变型(GA+AA)的相对危险度(OR)为2.465,95%Cl:[1.328,4.575],P=0.004。结论:冠脉介入术后CYP2C19*2基因突变患者可能易患气虚血瘀证。     

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??OBJECTIVE To study the effect of Danshen injection and Xinkeshu tablets on the metabolism of CYP1A2, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 and CYP3A4 in rabbits by cocktail probe substrates method. METHODS Sixteen healthy fasted male rabbits were simultaneously given cocktail probe substrates including caffeine, tolbutamide, omeprazole, dextromethorphan and midazolam . The metabolic rates of cocktail probe substrates were determined by LC MS/MS methods at some specific time following the administration. Then the rabbits were randomly assigned to receive either Danshen injection or Xinkeshu tablets. The whole self-control trial was consisted of 3 cycles. The low, middle and high dosage (0.5, 1 and 2 mL??kg^-1) of Danshen injection group would be administrated in 3 cycles in sequence. The low, middle and high dosage (90,180 and 360 mg??kg^-1 ) of Xinkeshu tablets group would be administrated in 3 cycles in sequence. Each cycle includes wall-out period of 7 d followed by administration of the 2 herbal medicines for consecutive 7 d.On the 15th day the cocktail probe substrates were administrated and the metabolic rates were determined. The differences of the metabolic rates between after and before admininstration of the 2 herbal medicines were assessed by one-way analysis of variance (ANOVA). RESULTS After taking the agents of Danshen injection and Xinkeshu tablets, the metabolic rates of the five cocktail probe substrates had a tendency to decline compared with the before-administration. CONCLUSION The outcome in vivo is in accordance with that in vitro. Danshen injection and Xinkeshu tablets can inhibit the metabolism of five CYPs (1A2, 2C9, 2C19, 2D6 and 3A4) activities in rabbits. At sometimes precautions are needed to co-administrate either Danshen injection or Xinkeshu tablets forpossible herb-drug interactions.