基于网络药理学探讨鹤兰墨香浴里精油平衡洗液外治银屑病的作用机制

目的 应用网络药理学方法探讨鹤兰墨香浴里精油平衡洗液外治银屑病的作用机制。方法 鹤兰墨香浴里精油平衡洗液的主要成分为皂荚,利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选皂荚的活性化学成分及其对应的作用靶点,利用GeneCards?数据库、OMIM?数据库检索银屑病的相关靶点,使用Venny 2.1.0平台获取皂荚活性化学成分作用靶点与银屑病相关靶点的交集靶点。针对皂荚治疗银屑病的相关靶点,利用Cytoscape 3.8.2软件构建皂荚活性化学成分-银屑病疾病靶点网络图,利用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 获得皂荚的活性化学成分5个,分别是豆甾醇、谷甾醇、豆甾-4-烯-3,6-二酮、表儿茶素、廿碳-11-烯酸,其对应的作用靶点共162个。获得银屑病的相关靶点共4 104个,将皂荚活性化学成分作用靶点与银屑病相关靶点取交集,获得交集靶点106个。皂荚活性化学成分-银屑病疾病靶点网络图显示,表儿茶素的度值最大,其在皂荚治疗银屑病中发挥最重要的作用。PPI网络拓扑学分析结果显示,皂荚外...     

基于网络药理学方法探讨地榆治疗结直肠癌的作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨地榆治疗结直肠癌的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台获取地榆的有效活性成分及其作用靶点，利用药物靶标数据库、OMIM^?、GeneCards^?数据库获取结直肠癌的相关靶点。将地榆有效活性成分的作用靶点与结直肠癌的相关靶点取交集，获得共同靶点。将有效活性成分和共同靶点导入Cytoscape 3.7.2软件构建“中药-成分-靶点-疾病”网络。针对共同靶点，使用STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络，使用Metascape线上软件进行基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 共筛选出9个地榆有效活性成分，包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等。获得地榆有效活性成分的作用靶点154个和结直肠癌相关靶点1 908个，取交集后获得共同靶点94个。PPI网络显示，地榆治疗结直肠癌的关键作用靶点包括肿瘤蛋白p53、苏氨酸蛋白激酶(AKT)1、Caspase-3、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等。GO功能富集分析结果显示，地榆...     

基于网络药理学探讨加味柴胡疏肝散治疗冠心病伴焦虑/抑郁的作用机制

目的 运用网络药理学方法，探讨加味柴胡疏肝散治疗冠心病伴焦虑/抑郁的作用机制。方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台获取加味柴胡疏肝散所含中药的有效活性成分及其作用靶点。通过GeneCards?、OMIM?、TTD数据库筛选冠心病及焦虑/抑郁的相关靶点，并对两类疾病相关靶点取交集。对有效活性成分的作用靶点与疾病相关靶点进行交集，获得交集靶点作为加味柴胡疏肝散治疗冠心病伴焦虑/抑郁的潜在作用靶点。使用CytoScape 3.8.0软件构建药物成分-疾病-靶点网络图。利用STRING数据库构建交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络，并筛选加味柴胡疏肝散治疗冠心病伴焦虑/抑郁的核心靶点(度值≥30)。使用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 (1)共获得有效活性成分233个，有效活性成分的作用靶点161个，交集靶点106个。(2)药物成分-疾病-靶点网络的节点度值较高的前15个有效活性成分中，黄酮类成分共有7个，包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、川陈皮素、柚皮素、美迪紫檀素、异鼠李素。(3)PPI网络中...     

基于网络药理学探讨痛经宁方治疗子宫内膜异位症的分子机制

目的基于网络药理学探讨痛经宁方治疗子宫内膜异位症的分子机制。方法将通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)得到痛经宁方的有效活性成分,与根据OMIM数据库和Gene Cards数据库搜索得到的子宫内膜异位症疾病靶点交集,取得交集靶点。使用Cytoscape 3.7软件构建"中药-活性成分-靶点"网络。基于STRING数据库,构建蛋白互作(PPI)网络。利用DAVID数据库,进行痛经宁方潜在作用靶标的GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果从痛经宁方中筛选出活性成分166个,其中61个有效活性成分可通过60个靶点作用于子宫内膜异位症。通过富集得到1177个GO生物功能和118条KEGG通路。结论基于网络药理学初步探究痛经宁方中槲皮素、山柰酚、花生四烯酸、异鼠李素、豆甾醇、β-谷甾醇、鞣花酸等有效成分作用于IL-6、VEGFA、EGFR、MAPK8、CASP3、ESR1等关键靶点,通过调控机体内类固醇激素水平、炎症反应、氧化应激、核受体活性、转录因子活性、细胞凋亡等过程治疗子宫内膜异位症,为进一步研究其具体作用机制提供了理论依据。     

半夏泻心汤及其拆方改善炎症性肠病肠道免疫的潜在靶点及作用机制的网络药理学分析

目的:运用网络药理学方法研究半夏泻心汤及其拆方对炎症性肠病肠道免疫的潜在靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)筛选出半夏泻心汤及其拆方组(辛开组、苦降组、甘补组)的有效活性成分和作用靶点,利用GeneCards、OMMI数据库筛选炎症性肠病相关的潜在作用靶点,将二者交集后采用Cytoscape 3.7.0软件构建活性成分-靶点网络图,利用string绘制PPI靶点蛋白作用网络图,利用GO和KEGG富集分析药物与炎症性肠病的信号通路。结果:通过筛选得出半夏泻心汤的有效活性成分129个、辛开组(半夏+干姜)的有效活性成分43个、苦降组(黄芩+黄连)的有效活性成分104个、甘补组(人参+甘草+大枣)的有效活性成分121个。进一步分析后发现半夏泻心汤组中Quercetin(槲皮素)、Beta-sitosterol(β-谷甾醇)、Kaemoferol(山柰酚)、Stigmasterol(豆甾醇)、Baicalein(黄芩素)等药物活性成分与PTGS1、AR、ESR1、PRSS1、PPARG等与IBD疾病靶点关系较为密切,并可能通过参与AGE-RAGE、TNF等信号通路发挥调...     

基于网络药理学探讨当归治疗阿尔茨海默病的机制

目的 采用网络药理学的方法,预测当归治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用靶点及其作用机制。方法通过中药系统药理学(TCMSP)数据库筛选当归的主要活性成分,并在Swiss Target Prediction平台对当归活性成分的作用靶点进行预测。通过Genecads数据库筛选AD的主要靶点,将当归有效成分靶点与AD的主要靶点取交集,得到当归治疗AD的靶点。利用String平台构建蛋白质相互作用(PPI)网络,运用Metascape平台进行基因本体(GO)及代谢途径分析数据库(KEGG)进行富集分析。应用Autodock vina软件对网络药理学结果进行验证。结果经筛选获得西多糖苷、豆甾醇、α-胡麻烯、β-谷甾醇等10种当归治疗AD的有效成分,329个潜在药物靶点,当归有效成分与AD共有靶点75个,Sitogluside,beta-sitosterol,Stigmasterol可能是当归治疗AD的关键活性成分。PPI网络分析显示,AKT1、PTGS2、MAPK14可能是当归治疗AD的核心靶点。通路分析提示当归治疗AD的机制可能与cGMP-PKG信号通路、NF-kB信号通路、神经活性配体-受体...     

基于网络药理学熟地黄治疗帕金森病的作用机制研究

目的基于网络药理学探讨熟地黄治疗帕金森病的作用机制。方法在中药系统药理学数据库与分析平台筛选熟地黄的有效成分,通过UniProt数据库筛选中药作用靶点。在GeneCards数据库和OMIM数据库中检索帕金森病的疾病靶点。将帕金森病相关靶点和熟地黄作用靶点取交集,得到中药-疾病靶点,并绘制韦恩图。构建中药-成分-疾病-靶点调控网络,并建立中药-疾病靶点蛋白相互作用网络、筛选核心基因。对核心靶点进行生物功能和通路分析。结果共获得有效活性成分2个(β-谷甾醇和豆甾醇)和中药靶点26个。获得帕金森病相关靶点7 058个,取交集后得到19个中药-疾病靶点。中药-有效成分-疾病-靶点调控网络显示熟地黄主要通过豆甾醇作用于19个帕金森病的疾病靶点。熟地黄治疗帕金森病的核心基因可能为MAOA、ADRA1B、ADRA1A、MAOB、SLC6A2等。核心靶点涉及65条生物过程,主要包括G蛋白偶联胺受体活性、肾上腺素能受体活性、儿茶酚胺结合、G蛋白偶联神经递质受体活性、神经递质受体活性、乙酰胆碱受体活性、G蛋白偶联、5-羟色胺受体活性等。核心靶点共涉及27条通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、钙信...     

采用网络药理学与分子对接技术研究筋骨痛消丸治疗髌骨软化症的作用机制

目的:通过网络药理学和分子对接技术研究筋骨痛消丸治疗髌骨软化症(chondromalacia patellae)的作用机制。方法:首先通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘筋骨痛消丸中各种中药的活性成分并预测其作用靶点,TCMSP数据库中缺失的中药利用文献检索与Swiss Target Prediction数据库获得有效成分及对应靶点。利用Uni Prot数据库,将获得的靶点蛋白的名称标准化。登录Gene Cards、Pharm Gkb等数据库,获取髌骨软化症的疾病靶点。之后将药物靶点和疾病靶点取交集,制作出韦恩图。运用Cytoscape软件,筛选并构建“药物-活性成分-交集靶点-疾病”网络;利用String数据库构建蛋白互作(PPI)网络,并使用R语言对预测靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。最后通过Autodock软件对药物的主要活性成分和核心作用靶点进行分子对接验证。结果:研究结果显示筛选得到筋骨痛消丸治疗髌骨软化症的活性成分188个及靶点249个,主要活性成分为槲皮素、柚皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇等,PPI网络主要计算出AKT1、CASP8、CASP3...     

基于网络药理学和分子对接探讨解毒通利方治疗肝纤维化的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接的方法探讨解毒通利方治疗肝纤维化(HF)的可能作用机制。方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴(HERB)获得解毒通利方所有有效活性成分,通过TCMSP数据库将这些有效活性成分进行成分靶点预测,并与GeneCards数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库、OMIM数据库和DrugBank数据库中HF疾病基因相关靶点使用R语言软件取交集,从而获得解毒通利方治疗HF的靶点;通过STRING绘制交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,筛选核心蛋白;利用Cytoscape 3.8.0软件构建“中药—关键化合物—核心靶点”网络;运用R语言软件进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测核心靶点的作用机制。最后,应用分子对接技术,将关键有效活性成分和PPI中核心蛋白进行分子对接。结果 共筛选解毒通利方药物活性化合物172种,作用靶点4 068个,构建PPI网络,运用“CytoNCA”插件筛选出IL6、AKT1、STAT1、RELA、MYC、FOS、STAT3、MAPK1、CCND1等19个核心蛋白...     

基于网络药理学的夏枯草-半夏治疗弥漫大B细胞淋巴瘤的作用机制研究

目的通过网络药理学方法研究夏枯草-半夏治疗弥漫大B细胞淋巴瘤(Diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)的潜在分子机制。方法首先利用中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese medicine system platform,TCMSP)筛选夏枯草-半夏的活性成分及其对应的靶基因。其次,通过Gene Cards、OMIM、TTD、Drug Bank等数据库搜索DLBCL的疾病靶点,取交集后得到夏枯草-半夏治疗DLBCL的共同靶标基因,将共同靶标基因导入Cytoscape构建"夏枯草-半夏活性成分-DLBCL靶标基因"关系网络图。再通过PPI网络分析,筛选核心靶基因,进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书通路分析。结果夏枯草-半夏治疗DLBCL的主要活性成分有13种,包括槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇等;其作用的核心靶点包括AKT1、JUN、TP53、MAPK1、TNF等;其主要通过调节PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路等信号通路发挥治疗DLBCL的作用。结论夏枯草-半夏可通过多靶标、多途径发挥辅助治疗DLBCL的作用。     

基于网络药理学结合分子对接探讨小茴香抗肝纤维化的作用机制及实验验证

目的：网络药理学结合分子对接共同探究小茴香抗肝纤维化作用机制。方法：借助中药系统药理学分析平台（TCMSP）筛选小茴香活性成分；Swiss Target Prediction平台获取活性成分靶点；GeneCards和OMIM数据库收集疾病靶点；活性成分靶点与疾病靶点取交集得到关键靶点。运用David数据库进行生物过程分析（GO）和代谢通路分析（KEGG）富集分析。采用AutoDock Vina软件和动物实验对预测结果进行验证。结果：从小茴香中筛选出9个活性成分，抗肝纤维化关键靶点115个。其逆转肝纤维化作用可能与欧前胡素、β-谷甾醇、豆甾醇、茴香脑、茴香醛等核心成分有关，推测小茴香通过PTGS2、ESR1、MTOR、TLR4、PPARA等核心靶点调节IL-17、PI3K-Akt、乙型肝炎、非酒精性脂肪肝、糖尿病并发症AGE-RAGE等信号通路来发挥抗肝纤维化的作用。分子对接结果显示，小茴香核心成分与核心蛋白靶点结合性能较好，表明其生物活性较好。动物实验进一步验证小茴香通过调控PTGS2、ESR1、MTOR、TLR4、PPARA等靶点，减轻炎性反应及减少细胞外基质沉积发挥其抗肝纤维化作用...     

基于网络药理学的鸡血藤抗肝纤维化机制研究

目的运用网络药理学探讨鸡血藤抗肝纤维化的分子生物学机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台检索鸡血藤的所有化学成分,并筛选鸡血藤中的活性成分。对筛选出的活性成分进行靶点预测、基因注释。采用GeneCards、OMIM数据库筛选肝纤维化相关的疾病靶点,通过取活性成分靶点和疾病靶点的交集获得鸡血藤抗肝纤维化的潜在靶点。针对鸡血藤抗肝纤维化潜在靶点,利用STRING数据库构建蛋白互作网络图,并进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果最终筛选出鸡血藤的活性成分24个及其对应靶点56个,肝纤维化的疾病靶点共6 899个。取交集后,获得鸡血藤抗肝纤维化的潜在靶点49个,其中度值排前5位的靶点依次为表皮生长因子受体、MYC、白细胞介素6、雌激素受体1和血管内皮生长因子。GO功能富集分析和KEGG通路分析结果显示,鸡血藤抗肝纤维化的潜在靶点参与了154个生物学过程、23个细胞成分和46个分子功能,涉及前列腺癌信号通路、人类巨细胞病毒感染信号通路、乙型肝炎信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B信号通路、EB病毒感染...     

基于网络药理学分析角药葛根-鹿衔草-羌活治疗颈椎病的作用机制

目的 采用网络药理学方法探讨角药葛根-鹿衔草-羌活治疗颈椎病的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台筛选葛根、鹿衔草、羌活的主要有效活性成分及其作用靶点。采用CTD、GeneCards及OMIM数据库获取颈椎病的相关基因靶点,并将其与角药的有效活性成分作用靶点进行交集,获取共同靶点。针对共同靶点,构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络,以及蛋白质-蛋白质互相作用(PPI)网络,同时进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 共获得葛根-鹿衔草-羌活的有效活性成分28个及其靶点86个,与12 097个颈椎病相关基因靶点取交集后得到共同靶点72个。根据PPI网络筛选出白细胞介素6(IL-6)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase3)、雌激素受体1(ESR1)等关键靶点蛋白。GO功能富集分析结果显示,共同靶点主要涉及核受体活性、转录因子活性/直接配体调节的序列特异性、类固醇激素受体活性等生物过程或功能;KEGG通路富集分析结果显示,葛根-鹿衔草-羌活治疗颈椎病的信号通路主要涉及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇...     

基于网络药理学探讨复方积雪草抗肾纤维化的分子机制

目的通过网络药理学方法研究复方积雪草主要活性成分治疗肾纤维化的作用机制。方法在TCMSP数据库中筛选与复方积雪草主要组分相关的活性成分和靶点,利用GeneCards数据库检索与肾纤维化相关靶点并与活性成分靶点取交集。采用Cytoscape软件构建蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络、化合物-靶点网络图、中药-化合物-靶点网络图,筛选核心靶点,分子对接验证化合物与靶点的结合能力;将获得的核心靶点利用STRING进行基因通路的富集分析,进而分析网络和作用机制。结果得到复方积雪草活性成分靶点203个,获得肾纤维化靶点5219个,共同靶点177个。筛选出核心靶点36个。分子对接验证结果化合物与靶点具有较好的结合能力。GO富集分析分别获得可靠性排名TOP10的主要分子功能(MF)、主要细胞组分(CC)和主要生物学过程(BP)。得到核心靶点之间的PPI网络图、化合物-核心靶点网络图和草药-化合物-核心靶点网络图。肿瘤相关通路显著性最高。结论初步系统分析了复方积雪草治疗肾纤维化的科学性及分子机制。     

基于网络药理学探讨芍药甘草汤治疗肝癌癌痛的作用机制

目的 通过网络药理学方法探讨芍药甘草汤治疗肝癌癌痛的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选芍药甘草汤的主要活性成分及其对应的作用靶点,通过GeneCards、OMIM、DrugBank数据库检索肝癌、癌痛的相关靶点。使用Venny 2.1.0获取药物活性成分靶点与肝癌、癌痛靶点的交集靶点,通过Cytoscape 3.7.1软件构建药物活性成分-肝癌-癌痛靶点网络并行网络拓扑分析。使用STRING平台对交集靶点进行蛋白质-蛋白质互相作用(PPI)网络分析,使用Cytoscape 3.7.1软件筛选关键靶点。利用Metascape平台针对交集靶点进行基因本体论功能富集分析及京都基因和基因组百科全书功能富集分析。结果 共筛选出芍药甘草汤活性成分93种及其对应靶点231个,获得肝癌相关靶点1 498个、癌痛相关靶点1 873个。取交集后获得交集靶点125个,芍药甘草汤作用于肝癌癌痛靶基因的映射率为5.1%。芍药甘草汤中治疗肝癌癌痛的主要活性成分有槲皮素、山柰酚、柚皮素等;关键靶点有原癌基因JUN、肿瘤坏死因子、信号转导子和转录激活剂3、白细胞介素(IL)-1β、IL-6、IL-...     

基于网络药理学及分子对接技术探究知葛通脉颗粒治疗糖尿病下肢动脉粥样硬化性病变的作用机制

目的 借助网络药理学研究方法,初步探索知葛通脉颗粒治疗2型糖尿病下肢动脉粥样硬化性病变的靶点和机制,为进一步研究提供相关理论支持和线索。方法 通过TCMSP数据库检索、文献补充,筛选知葛通脉颗粒有效成分及效用靶点,通过GeneCards、OMIM等数据库挖掘2型糖尿病LEAD靶点,取药物与疾病的交集靶点;利用STRING11.5制作PPI网络图,并通过PPI网络拓扑关系分析知葛通脉颗粒治疗2型糖尿病LEAD的关键靶点;构建“药物-成分-靶点”关系图,筛选中药颗粒核心成分。在Metascape平台进行GO、KEGG富集分析,探索药物治疗疾病的潜在机制,构建“成分-靶点-通路”图。最后,通过AutoDockTools 1.5.6进行分子对接,验证药物活性成分与疾病靶点之间的反应活性。结果 研究获得知葛通脉颗粒有效成分71种,潜在靶点261个,与DLEAD交集靶点107个,筛选出核心成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、芒柄花黄素、异鼠李素、去水淫羊藿黄素、薯蓣皂苷元、β-谷甾醇、金圣草素、豆甾醇,关键靶点AKT1、IL-6、TNF、TP53、VEGFA、IL-1B。相关作用通路有183条,作用通路...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨白花蛇舌草治疗骨肉瘤的信号通路及分子机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探究白花蛇舌草治疗骨肉瘤的作用机制。方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药综合数据库(TCMID)平台,检索白花蛇舌草化学成分和作用靶点,并通过基因卡(GeneCards)、人类在线孟德尔遗传数据库(OMIM)和疾病靶点预测数据库(TTD)获取骨肉瘤相关靶点,预测白花蛇舌草治疗骨肉瘤的共同靶点,构建“中药-活性成分-靶点-疾病”网络图。通过STRING平台构建靶点蛋白互作网络(PPI),并使用R语言对PPI中的靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析。将相关度最高的前5位靶点和白花蛇舌草的活性成分进行分子对接,对结合能最大的活性成分-靶点构建对接模型。结果 共筛选出白花蛇舌草中8个活性成分,179个对应的靶点。检索得到3 596个骨肉瘤相关靶点,经R语言取交集得到124个共同靶点。“中药-活性成分-靶点-疾病”网络提示,白花蛇舌草的6个活性成分作用于124个靶点基因以治疗骨肉瘤。PPI图中,124个靶点相互作用关系密切,其中AKT1、TP53、IL-6、MAPK1、TNF等为核心靶点,与活性成分分...     

基于网络药理学和分子对接探讨“寒凉”中药黄连、黄芩、黄柏治疗痴呆的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨“寒凉”中药黄连、黄芩、黄柏(三黄)治疗痴呆的作用机制。方法 通过数据挖掘《宣明论方》,筛选出符合“寒凉”属性并且是治疗“痴呆症”的常见中药黄芩、黄连、黄柏。通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)数据库检索“三黄”的有效成分和作用靶点，在GeneCards、DrugBank等数据库检索痴呆症(dementia)靶点。利用Cytoscape3.7.2构建“药物-成分-靶点”网络，用VENNY2.1获得“三黄”和痴呆症的交集靶点后，构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI),利用Metascape库对核心靶点进行GO、KEGG富集分析，并构建“三黄”药物-成分-靶点-通路-疾病网络，最后利用分子对接，以反向验证“三黄”活性成分与核心靶点之间的关系。结果 筛选出“三黄”治疗痴呆症的重要活性成分有槲皮素、β-谷甾醇、小檗碱、黄连...     

基于网络药理学及分子对接探究补肾健脾方治疗慢性乙型肝炎的作用机制

[目的]基于网络药理学和分子对接技术探究补肾健脾方治疗慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)的作用机制。[方法]借助中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、UniProt等数据库筛选活性成分及其对应靶点,利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络图。通过DisGeNET和STRING数据库构建药物-疾病交集靶点的蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络。采用DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。对药物核心活性成分和靶点进行分子对接,以验证预测结果。[结果]补肾健脾方包含槲皮素、山奈酚等188个活性成分,以及白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、血清白蛋白(albumin,ALB)...     

基于网络药理学探讨补中益气汤对新型冠状病毒肺炎恢复期的作用机制

目的:基于网络药理学探讨补中益气汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)恢复期的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索补中益气汤的成分及靶点,基于ADME参数筛选主要成分,使用Cytoscape3.6.0软件构建中药-成分-靶点网络,在OMIM、GeneCards数据库中检索COVID-19靶点,绘制韦恩图得到交集靶点,导入STRING数据库,构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,生成分值最佳的MCODE组件。使用Cytoscape3.6.0软件的BisoGenet插件绘制疾病及药物PPI网络,并用Merge功能取交集,根据拓扑参数筛选出核心节点。通过Metascape平台进行基因本体与京都基因和基因组百科全书富集分析,绘制气泡图和通路-靶点网络图对结果可视化处理。结果:检索出8味中药的135个主要成分、258个药物靶点、446个疾病靶点,中药-成分-靶点网络得到槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素等10个关键化合物,PPI网络筛选出351个核心靶点,发现10个关键靶点:STAU1、FUS、TARDBP、CUL4B、EEF1A1、EIF4A3、TUBG1、RPS3、RPL6、RPS2,核心靶点主要富集在爱泼斯坦-巴尔病毒感染、甲型流感、麻疹、军团杆菌病、系统性红斑狼疮病等疾病通路,及核糖体、病毒致癌、蛋白酶体等信号通路中。结论:补中益气汤可通过多靶点、多通路消除炎症,减轻肺部损伤以及调节免疫等方面对COVID-19恢复期发挥潜在的治疗作用,本研究为新药的研发和COVID-19恢复期的治疗提供了新思路和理论基础。