Severe Community-Acquired Bloodstream Infection with Acinetobacter ursingii in Person who Injects Drugs

We report a community-acquired bloodstream infection with Acinteobacter ursingii in an HIV-negative woman who injected drugs. The infection was successfully treated with meropenem. Species identification was performed by using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. Improved identification of Acinetobacter spp. by using this method will help identify clinical effects of this underdiagnosed pathogen.     

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在鉴定儿童血流感染少见苍白杆菌的应用及耐药情况分析

目的 快速鉴定和分析儿童血流感染少见苍白杆菌及其耐药情况分析.方法 收集某儿童医院儿童血流感染的临床标本中分离的苍白杆菌26株,运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,...     

应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱检测细菌耐药性的初步研究

目的研究基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)用于检测鉴定细菌耐药性的可行性。方法对临床分离的耐药谱明确的8属11株细菌及相应的标准菌株,经相同条件培养后,应用MALDI-TOF-MS进行检测,并分析其耐药株和标准株质谱图的差异。另外,对临床分离的30株金黄色葡萄球菌同时进行药物敏感性实验和MALDI-TOF-MS检测。结果应用MALDI-TOF-MS检测细菌耐药性时,对葡萄球菌检测结果较好,尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,而对其它细菌耐药性检测效果较差。结论MALDI-TOF-MS检测细菌耐药性适用于部分细菌。     

Misidentification of Burkholderia pseudomallei,China

We report a case of melioidosis in China and offer a comparison of 5 commercial detection systems for Burkholderia pseudomallei. The organism was misidentified by the VITEK 2 Compact, Phoenix, VITEK mass spectrometry, and API 20NE systems but was eventually identified by the Bruker Biotyper system and 16S rRNA sequencing.     

应用MALDI-TOF MS快速鉴定blaKPC-2基因型肺炎克雷伯菌

 目的 探讨基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对携带bla_KPC-2基因型肺炎克雷伯菌的快速鉴定能力。方法 收集2018年9月-2020年11月蚌埠医学院第一附属医院临床住院患者分离的肺炎克雷伯菌,采用纸片扩散法进行药敏试验。应用聚合酶链反应(PCR)方法筛选携带bla_KPC-2基因型肺炎克雷伯菌。MALDI-TOF MS鉴定菌株并收集携带bla_KPC-2基因型和碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌(CSKP)的质谱图,各自选取其中70株菌株图谱,建立携带bla_KPC-2基因型和CSKP的超级图库(Super-Spectra)。采用超级图库鉴定除建库以外的肺炎克雷伯菌,根据耐药表型和PCR结果,判断鉴定结果是否准确。结果 共收集295株肺炎克雷伯菌,经耐药表型筛选耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)143株和CSKP 152株。CRKP中鉴定出140株携带碳青霉烯酶基因(134株检出bla_KPC-2基因,3株检出bla_KPC-18基因,2株检出bla_NDM-1基因,1株检出bla_IMP基因),3株不携带碳青霉烯酶基因;其中2株同时检出bla_KPC-2基因和bla_NDM-1基因。根据建库要求,建立携带bla_KPC-2基因型和CSKP的超级图库(Super-Spectra);设置error值<0.5,二者重合率达80%;对比图发现,4 154.4、8 310.7、10 880.8、3 579、10 079.3 m/z五个峰可作为区分携带bla_KPC-2基因肺炎克雷伯菌和CSKP的特征峰。选取除建库以外的155株肺炎克雷伯菌进行验证,准确率为92.90%(144/155);其中携带bla_KPC-2基因肺炎克雷伯菌准确率为94.52%(69/73),CSKP准确率为91.46%(75/82)。结论 通过MALDI-TOF MS建立Super-Spectra,可快速预测bla_KPC-2基因型肺炎克雷伯菌,为临床CRKP感染的诊疗及医院感染防控提供可靠的实验室依据。     

Actinotignum schaalii血流感染1例及病原体鉴定报告

 Actinotignum schaalii是一种新型致病菌,可导致尿路感染和侵袭性感染。2022年贵黔国际总医院收治1例急性尿潴留患者血培养标本,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）技术鉴定结果为Actinotignum schaalii,为兼性厌氧的革兰阳性球杆菌。该病例为国内首次血培养检出Actinotignum schaalii,该患者使用头孢他啶5 d后,感染症状明显减轻,感染指标恢复正常,患者未诉发热等不适,遂出院。结合国内外相关文献,探讨Actinotignum schaalii的临床特征、鉴定及治疗。     

利用MALDI-TOF MS特异质量峰对耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌同源性的快速分型

目的利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)筛选耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的特异质量峰,并根据特异质量峰对CRKP进行快速同源性分析。方法选取某院微生物实验室已进行多位点序列分型(MLST)的CRKP 76株,52株用于方法的建立,24株用于方法的验证。设置5个不同的特异峰挑选标准,按照不同的标准筛选各ST型特异质量峰,依据筛选的特异质量峰对CRKP进行分型,将与MLST结果符合率最高的标准确定为最佳标准。依据最佳标准筛选出的特异峰对24株CRKP进行分型,验证特异峰质量分型方法的准确性,并与质谱仪软件中的主成分分析(PCA)和核心图谱(MSP)聚类分析进行比较。结果按照标准2[(1)信噪比(S/N)≥4,(2)S/N比值≥1.5,(3)变异系数(CV)≤40%],52株CRKP中共筛选出45个特异质量峰,利用特异质量峰对29株CRKP进行分型,与MLST符合率最高,达82.8%,确定为最佳标准。按照此标准筛选出的特异质量峰对另外24株CRKP进行分型,与MLST符合率达83.3%。而PCA聚类分析与MLST的符合率仅为66.7%,MSP聚类分析与MLST一致性较差,没有明显符合ST型的分组趋势。结论利用MALDI-TOF MS筛选出不同ST型别CRKP的特异质量峰,可用于CRKP的快速同源性分析,为暴发流行的监测和医院感染的控制提供依据。     

MALDI-TOF MS对临床常见真菌鉴定准确性的Meta分析

目的评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定临床常见真菌的准确性,为临床真菌感染的诊断及治疗提供依据。方法计算机检索各据库,查找MALDI-TOF MS检测真菌准确性的文献,对纳入的文献进行质量评价和数据提取,采用QUADAS-2工具对纳入文献的偏倚风险进行评价,运用Meta-Disc1.4软件进行Meta分析,比较不同菌株来源、菌种、参考方法、使用仪器各亚组的诊断效能。结果共纳入文献26篇,9 708株真菌,基本涵盖了临床常见酵母菌属及丝状真菌属。Meta分析结果显示,MALDI-TOF MS鉴定真菌合并灵敏度[95%置信区间(95%CI)]为0.97(0.97～0.97),合并特异度(95%CI)为0.85(0.81～0.88),合并阳性似然比(95%CI)为5.60(4.55～6.90),合并阴性似然比(95%CI)为0.02(0.01～0.04),诊断比值比(95%CI)为282.40(149.50～533.46),汇总受试者工作特征曲线下面积为0.9078。亚组分析结果显示,MALDI-TOF MS技术对临床酵母菌属及丝状真菌属的鉴定,不受菌株来源、仪器品牌等因素影响,均具有很好的鉴定效果。结论MALDI-TOF MS对临床常见真菌鉴定的准确性高,适合在临床广泛推广应用。     

基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱法和表面等离子谐振法在HPV分型检测中的应用比较

目的:评价比较基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF-MS)和表面等离子谐振法(SPR)在人乳头瘤病毒(HPV)分型检测中的应用。方法:两种方法对30种不同型别HPV L1基因分型国家参考品和129份经液基薄层细胞检测的样本分别进行检测和评价。结果:MALDI-TOF-MS法和SPR法检测参考品具有100%的一致性。采用测序法确定129份样本中有93份为HPV阳性,36份为HPV阴性。高危型样本的分型准确率MALDITOF-MS法为100%(77/77),SPR为94.8%(73/77);MALDI-TOF-MS法HPV分型检测的敏感率为88.2%(82/93)、特异性为88.9%(32/36),与SPR法的灵敏率和特异性相当。结论:MALDI-TOF-MS在HPV分型检测中具有较好的灵敏性和特异性,与SPR法一致。     

表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱技术在神经管缺陷胎儿母亲血清标志物筛查中的应用

目的:探讨表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲血清蛋白质标志物中的应用。方法:经超声确诊为胎儿神经管缺陷的孕妇17例和正常孕妇14例,神经管缺陷包括脊柱裂7例、无脑儿4例、脑膨出6例。所有孕妇均于清晨空腹取外周静脉血5 ml,离心后取血清,然后用CM10芯片按照蛋白质芯片标准操作流程进行检测。采用PBSIIC型蛋白质芯片阅读机读取数据,设定优化相对分子质量范围1000~30000 Da。统计分析使用Ci-phergen protein chip 3.1.1软件。结果:所有神经管畸形胎儿母亲血清标本共检测到55个差异蛋白峰,其中12个与正常组比较存在统计学意义,包括8种蛋白质/多肽高表达,质荷比(m/z)分别为4 105、4 297、4 188、6 650、8 583、3 282、2 750、3327;4种蛋白质/多肽低表达,m/z分别为5 497,28 078,9 155,9 434。建立决策分类树,得到了带有3个终结点的决策分类树,获得了2个标志性蛋白质,m/z分别为4 105、7 788。神经管缺陷诊断模型的灵敏度为88.2%,特异度为100%。结论:应用SELDI技术可以筛查出神经管缺陷的特异性蛋白质标志物,是神经管缺陷产前诊断的重要方法之一。     

健康6月龄内儿童肺炎链球菌携带状况及耐药特征分析

目的 了解济南地区健康6月龄内儿童鼻咽部肺炎链球菌携带血清型及耐药特征,为肺炎球菌疫苗推广接种提供数据。方法 2019年11月—2020年4月采集济南地区216例健康6月龄内儿童鼻咽拭子,经分离培养获得疑似肺炎链球菌菌株;利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱和奥普托欣敏感试验鉴定后,采用多重PCR方法明确肺炎链球菌血清型;进一步采用微生物药敏分析仪进行药物敏感性检测。结果 216例健康6月龄内儿童肺炎链球菌携带率为5.1%(11/216),共携带7种血清型：15B、23F、6B、8、18C、19F和13。13价肺炎球菌多糖结合疫苗血清型覆盖率为54.5%,23价肺炎球菌多糖疫苗覆盖率为90.9%。19种抗生素中红霉素和阿奇霉素耐药率为100.0%;耐药率80.0%以上的有四环素、克林霉素、甲氧苄胺嘧啶/磺胺甲噁唑;头孢呋辛和青霉素(口服)的耐药率超过50.0%。万古霉素、利奈唑胺、左氧氟沙星、氯霉素和莫西沙星未发现耐药菌株。11例儿童鼻咽部肺炎链球菌分离株显示多重耐药,耐药种类3～6种。结论 济南地区健康6月龄内儿童鼻咽部定植的肺炎链球菌具有多种血清型,且抗生素耐药现象较严重。     

建立MALDI-TOF MS鉴定的海洋致病性弧菌数据库样本前处理的适宜条件

目的探讨建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定海洋致病性弧菌数据库前样本处理的适宜条件,为完善MALDI-TOF MS鉴定该菌入数据库提供参考。 方法将32株海洋致病性弧菌培养至24、48、72 h时,分别用直接转移法、扩展的直接转移法、甲酸提取法得到上机样品,然后用MALDI-TOF MS进行采图鉴定,用SPSS20.0软件进行统计学分析,对样本不同培养时间及3种处理方法的鉴定结果进行比较评价。 结果培养24 h鉴定分数平均值为2.321,属水平鉴定正确率为96.88%,种水平鉴定正确率为90.63%;培养48 h鉴定分数平均值为2.315,属水平鉴定正确率为93.75%,种水平鉴定正确率为90.63%;培养72 h鉴定分数平均值为2.316,属水平鉴定正确率为93.75%,种水平鉴定正确率为87.50%,3种不同培养时间的前处理方法鉴定至属(P=0.129)、鉴定到种(P=0.078),差异均无统计学意义。直接转移法鉴定分数平均值为1.986,属水平鉴定正确率为78.13%,种水平鉴定分数为59.38%;扩展的直接转移法鉴定分数平均值为2.135,属水平鉴定正确率为90.63%,种水平鉴定正确率为78.13%;甲酸提取法鉴定分数平均值为2.306,属水平鉴定正确率为96.88%,种水平鉴定分数为90.63%,3种不同上机前样本处理方法鉴定到属时差异有统计学意义(P=0.006);鉴定到种时差异有统计学意义(χ²=8.691,P=0.013)。 结论建立MALDI-TOF MS海洋致病性弧菌数据库时,选择培养时间24 h的甲酸法提取菌体蛋白的前处理方法较适宜,可得到高质量的蛋白指纹图谱和鉴定正确率。     

Waterborne Elizabethkingia meningoseptica in Adult Critical Care

Elizabethkingia meningoseptica is an infrequent colonizer of the respiratory tract; its pathogenicity is uncertain. In the context of a 22-month outbreak of E. meningoseptica acquisition affecting 30 patients in a London, UK, critical care unit (3% attack rate) we derived a measure of attributable morbidity and determined whether E. meningoseptica is an emerging nosocomial pathogen. We found monomicrobial E. meningoseptica acquisition (n = 13) to have an attributable morbidity rate of 54% (systemic inflammatory response syndrome >2, rising C-reactive protein, new radiographic changes), suggesting that E. meningoseptica is a pathogen. Epidemiologic and molecular evidence showed acquisition was water-source–associated in critical care but identified numerous other E. meningoseptica strains, indicating more widespread distribution than previously considered. Analysis of changes in gram-negative speciation rates across a wider London hospital network suggests this outbreak, and possibly other recently reported outbreaks, might reflect improved diagnostics and that E. meningoseptica thus is a pseudo-emerging pathogen.     

异烟肼敏感与耐药结核杆菌临床分离株培养滤液蛋白比较分析

目的寻找异烟肼耐药结核杆菌特异性分泌蛋白。方法应用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX2)捕获并应用表面增强激光解析-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对1株异烟肼单耐药结核杆菌和1株异烟肼敏感结核杆菌临床分离株7天及14天Middlebrook 7H9培养滤液蛋白进行比较,描述性分析其差异。结果在异烟肼敏感和异烟肼单耐药结核杆菌株7天及14天Middlebrook 7H9培养滤液中分别检测到164、175、133、147种蛋白质/多肽,其相对分子量(依质荷比m/z而得)范围分别为982⁹ 328、9979 328、997⁹ 327、1 0509 327、1 050⁸ 903、9 968 903、9 96⁹ 369,表达丰度(通过质谱峰面积计算)分别为179 369,表达丰度(通过质谱峰面积计算)分别为17² 100、212 100、21¹ 943、601 943、60⁵ 355、415 355、41³ 267;异烟肼单耐药结核杆菌株与异烟肼敏感结核杆菌株相比较,7和14天培养滤液分别存在47与58种差异蛋白质/多肽,这些差异蛋白质相对分子量在1 0833 267;异烟肼单耐药结核杆菌株与异烟肼敏感结核杆菌株相比较,7和14天培养滤液分别存在47与58种差异蛋白质/多肽,这些差异蛋白质相对分子量在1 083⁸ 812、1 0128 812、1 012⁹ 327之间,表达丰度在769 327之间,表达丰度在76¹ 811、251 811、25³ 010之间。结论异烟肼敏感结核杆菌和耐药结核杆菌液体培养早中期滤液蛋白质存在差异,但是否为异烟肼耐药结核杆菌特异性分泌蛋白则有待进一步证实。     

MALDI-TOF MS在液体培养分枝杆菌菌种鉴定中的研究

目的研究基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对液体培养分枝杆菌菌种鉴定的能力。方法回顾性收集本院2017年10月-2018年10月液体培养分离到的结核分枝杆菌40株,非结核分枝杆菌85株,采用MALDI-TOF MS菌种鉴定,与传统生化鉴定方法和16S r DNA测序结果进行比较,以测序结果为金标准分析MALDITOF MS对分枝杆菌菌种鉴定的准确性,评价其应用价值。结果测序结果46株为结核分枝杆菌,40株符合初筛结果,另有6株初筛非结核菌株鉴定为结核分枝杆菌,78株为非结核分枝杆菌,1株奴卡菌。MALDI-TOF MS从46株结核分枝杆菌中正确鉴定出44株,正确鉴定率为95.65%;78株非结核分枝杆菌中,69株正确鉴定,1株奴卡菌正确鉴定,NTM正确鉴定率为88.46%(69/78);奴卡菌鉴定率为100.00%(1/1),另对常见堪萨斯分枝杆菌、脓肿分枝杆菌等非结核分枝杆菌均能正确鉴定。结论MALDI-TOF MS对液体培养分枝杆菌具有较高鉴定率,是一种快速、简便准确的鉴定方法,在临床应用中具有重要价值。     

Case–Control Study of Clostridium innocuum Infection,Taiwan

Vancomycin-resistant Clostridium innocuum was recently identified as an etiologic agent for antibiotic-associated diarrhea in humans. We conducted a case–control study involving 152 C. innocuum-infected patients during 2014–2019 in Taiwan, using 304 cases of Clostridioides difficile infection (CDI) matched by diagnosis year, age (+2 years), and sex as controls. The baseline characteristics were similar between the 2 groups. C. innocuum–infected patients experienced more extraintestinal clostridial infection and gastrointestinal tract–related complications than did patients with CDI. The 30-day mortality rate among C. innocuum–infected patients was 14.5%, and the overall rate was 23.0%. Chronic kidney disease, solid tumor, intensive care unit admission, and shock status were 4 independent risk factors for death. C. innocuum identified from clinical specimens should be recognized as a pathogen requiring treatment, and because of its intrinsic vancomycin resistance, precise identification is necessary to guide appropriate and timely antimicrobial therapy.     

飞行时间质谱技术在HIV诊断应用性研究

[目的]用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI TOF MS）技术分析HIV感染者和健康人血清标本的多肽指纹图谱，建立HIV血清多肽指纹图谱诊断模型并探究其临床价值。[方法]选取的血清样本经Zip Tip C18层析预分离，运用MALDI TOF MS分析检测，获得HIV感染者和健康人血清标本的多肽指纹图谱，用SPSS13．0软件对数据进行分析，建立诊断模型。[结果]在分子量为800—4000Da范围内，共发现500个多肽峰，其中11个多肽峰在HIV感染组、正常对照组中表达均有显著差异（P〈0．05），5个在HIV感染组中表达上调（m／z1418．67，1465．67，1777．82，1864．82和2080．23），6个在HIV感染组中表达下调（m／z904．71，920．73，1076．73，1521．79，1552．75和2080．78）；（m／z2080．78＋2080．23＋1777．82＋1465．67）组合的P〈0．05，回归系数、相对危险度都比较理想，其ROC曲线下面积是1．0，以此建立了HIV血清多肽指纹图谱诊断模型。[结论]本研究建立的诊断模型可以有效区分HIV感染者和健康人，为HIV的诊断与筛查提供了一条崭新途径。