广东省市售牡蛎中诺如病毒污染调查

目的 调查广东省地区市售牡蛎中诺如病毒污染状况并对阳性株进行鉴定、分型,为控制和预防因食用牡蛎而引起诺如病毒胃肠炎提供基础数据。方法 应用实时荧光定量RT-PCR,对2016年1月 - 2017年12月期间在广东省8个城市收集的290份牡蛎样品进行诺如病毒定性和定量检测,并对不同季节、城市及采样点诺如病毒的污染情况及基因分型情况进行比较。结果 290份牡蛎样品的诺如病毒总检出率为为17.20%(50/290),不同季节的诺如病毒污染率分别为春12.50%、夏6.90%、秋18.30%和冬30.70%;从病毒污染的不同基因型分析,GⅠ诺如病毒检出率为6.20%,GⅡ型诺如病毒检出率为11.00%。结论 广东省市售牡蛎存在诺如病毒污染,且污染具有季节特点,以冬季污染较严重,具有较高引起食源性胃肠炎疾病感染的风险,其基因型以GⅡ型为主。     

牡蛎和粪便中GⅠ、GⅡ型诺如病毒实时聚合酶链反应检测方法的建立

目的 建立适用于牡蛎和粪便中快速、特异、灵敏的GⅠ、GⅡ型诺如病毒(NV)定量分型诊断方法.方法 通过对GⅠ、GⅡ型NV基因组保守序列的比对分析,设计高度特异的引物和探针,建立以TaqMan探针为基础的实时聚合酶链反应方法(TaqMan Real-time RT-PCR).结果 该方法对NV核酸检测高度特异,且GⅠ和GⅡ型之间无交叉反应,最低检出限达102 copies/μl.对90份新鲜牡蛎样品和37份腹泻粪便标本分别用常规RT-PCR和笔者建立的TaqMan Real-time RT-PCR进行NV检测,发现牡蛎样品中后者的检出率明显高于前者,而粪便标本中两者无明显差别.同时对阳性标本的测序分析证实结果准确可靠.结论 研究中建立的TaqMan Real-time RT-PCR方法可用于海产品标本及粪便中NV定量及分型检测,可作为应对NV胃肠炎暴发的有效诊断方法.     

牡蛎和粪便中GⅠ、GⅡ型诺如病毒实时聚合酶链反应检测方法的建

目的 建立适用于牡蛎和粪便中快速、特异、灵敏的GⅠ、GⅡ型诺如病毒(NV)定量分型诊断方法．方法 通过对GⅠ、GⅡ型NV基因组保守序列的比对分析，设计高度特异的引物和探针，建立以TaMan探针为基础的实时聚合酶链反应方法(TaMan Real-time RT-PCR)．结果 该方法对NV核酸检测高度特异，且GⅠ和GⅡ型之间无交叉反应，最低检出限达102 copies/μl．对90份新鲜牡蛎样品和37份腹泻粪便标本分别用常规RT-PCR和笔者建立的TaMan Real-time RT-PCR进行NV检测，发现牡蛎样品中后者的检出率明显高于前者，而粪便标本中两者无明显差别．同时对阳性标本的测序分析证实结果准确可靠．结论 研究中建立的TaMan Real-time RT-PCR方法可用于海产品标本及粪便中NV定量及分型检测，可作为应对NV胃肠炎暴发的有效诊断方法．     

上海市贝类水产品诺如病毒污染状况及基因分型

[背景]诺如病毒(NoV)是影响食品卫生与安全的重要污染物.贝类可富集环境水体中的病毒,是重要的食源性病原体传播载体.[目的]了解NoV在上海市贝类水产品中的污染状况,并对阳性株进行鉴定分型,为预防食源性疾病的发生,制定防控措施提供参考依据.[方法]采用实时荧光逆转录聚合酶链式反应法对2017—2019年上海地区采集的...     

广州市2003-2007年诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

目的 分析广州市2003-2007年诺如病毒性胃肠炎流行特征,为制定该病的预防控制策略提供科学依据.方法 采用描述性流行病学方法 对广州市2003-2007年诺如病毒性胃肠炎暴发疫情资料进行分析.结果 2003-2007年,广州市共报告22起群体性诺如病毒性胃肠炎暴发疫情,共计病例934例,每起疫情的罹患率波动在0.88%～37.93%之间.10-12月为发病高峰;男女性别比为1.25∶ 1;发病年龄最小的5月龄,最大的91岁,10～39岁共发病572例,占总病例数的61.24%;13起疫情发生在学校,学生病例数占发病总数的58.78%.所有疫情均未找到明确的感染来源.22起疫情的病例均以呕吐、腹痛、腹泻、发热为主,儿童病例以呕吐为主,成人病例以腹泻为主.22起疫情共采集粪便标本219份,检出诺如病毒抗原81份,阳性率为36.99%,其余标本均未检测到诺如病毒抗原.结论 广州市诺如病毒胃肠炎暴发疫情主要发生在秋冬季,多发生在学校等人群聚集的单位,及时采取控制措施可避免疫情扩散.     

广州市儿童秋冬季诺如病毒感染检测分析

目的 研究广东省广州市5岁以下儿童秋冬季急性病毒性腹泻诺如病毒的感染情况、基因型别和流行优势毒株。方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测诺如病毒(NVs),部分阳性标本的PCR产物经纯化、测序,结合参考毒株相应的核苷酸序列进行进化分析。结果 NVs的检出率为23.88%(112/469)。35株测序病毒之间的核苷酸序列同源性为70.4%~100%,均属于GII遗传组。广州市2003年秋冬季测序的11株NVs 5株为GII-4;5株为GII-3;另1株不能确定其型别;2004年测序的11株10株为GII-4;1株为GII-3;2005年所测序的13株均为GII-4。结论 广州市婴幼儿秋冬季病毒性腹泻存在不同基因型NVs感染,以NV GII组毒株为主,其中GII-4型为流行优势株。     

广州市市售牡蛎诺如病毒污染情况分析

目的了解广州市市售牡蛎中诺如病毒(Norovirus)的污染状况和污染浓度,为预防食源性疾病和诺如病毒风险监测和安全评估提供基础数据。方法用实时荧光定量PCR方法进行诺如病毒核酸检测,并对阳性样品进行诺如病毒定量分析。结果242份样品中检出诺如病毒阳性样品42份,阳性率为17.36%,检出GI阳性的样品3份,检出GII阳性的样品42份。诺如病毒污染牡蛎的时间以冬春季为主,1月份出现高峰,阳性率为72.73%(16/22)。批发市场样品阳性率为17.20%(27/157),农贸市场样品阳性率为17.65%(15/85)。42份阳性样品诺如病毒的污染浓度为3.13×10^(2)~2.17×10^(5)copies/g(消化腺)。结论广州市市售牡蛎中诺如病毒的阳性率及病毒浓度比较高,必须加强监测及监管,宣传正确烹饪方法,避免引起诺如病毒食源性疾病及疫情暴发。     

2014-2015年昆明市175件市售海产品中诺如病毒污染状况检测

目的 调查昆明市售海产品中诺如病毒的污染状况,为市民消费海产品提供建议,为昆明市售海产品食用安全性提供依据。方法 2014年7月至2015年7月,采集市售海产品175件,应用real-time RT-PCR法分别检测诺如病毒的ＧⅠ和ＧⅡ两个亚型,并对不同类型、不同季节、不同产地市售海产品中诺如病毒的污染情况进行比较。结果 175份市售海产品中诺如病毒总检出率为1.14%（2/175）,从基因分型看,2份阳性样品均为GⅡ型。结论 2014年-2015年昆明市售海产品中检出GⅡ型诺如病毒,存在通过食用海产品感染的风险。     

海岛地区腹泻病例中诺如病毒基因序列分析

目的了解海岛地区病毒性腹泻病原中诺如病毒的流行状况,对优势流行株进行基因序列分析。方法对舟山市监测医院疑似病毒性腹泻粪便样本经酶联免疫吸附法(ELISA)筛选轮状病毒,对阴性样本采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增诺如病毒RNA聚合酶与主要衣壳蛋白基因,PCR扩增产物进行测序反应,序列结果与GenBank已公布的序列进行比对,测其同源性;并绘制成系统发生树进行进化分析。结果在35份诺如病毒扩增阳性样本中挑选病毒载量最高的Hu/Zhejiang/9/2006/CHN株进行测序,并与Hunter株、Farming Hill株等进行比对并绘制系统发生树。Hu/Zhejiang/9/2006/CHN株属于诺如病毒GⅡ-4群,与Hunter株和Lanzhou株形成的分支较接近,RNA聚合酶有部分序列与这2株完全相同。结论舟山市(海岛地区)病毒性腹泻病原中存在诺如GⅡ-4群,采用GDD基序分析有利于更好地发现新的变异株的存在,为病毒性腹泻的病原学和基因学研究提供依据。     

广州市2003—2007年诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

目的分析广州市2003—2007年诺如病毒性胃肠炎流行特征，为制定该病的预防控制策略提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法对广州市2003—2007年诺如病毒性胃肠炎暴发疫情资料进行分析。结果2003—2007年，广州市共报告22起群体性诺如病毒性胃肠炎暴发疫情，共计病例934例，每起疫情的罹患率波动在0．88％～37．93％之间。10—12月为发病高峰；男女性别比为1．25：1；发病年龄最小的5月龄，最大的91岁，10—39岁共发病572例，占总病例数的61．24％；13起疫情发生在学校，学生病例数占发病总数的58．78％。所有疫情均未找到明确的感染来源。22起疫情的病例均以呕吐、腹痛、腹泻、发热为主，儿童病例以呕吐为主，成人病例以腹泻为主。22起疫情共采集粪便标本219份，检出诺如病毒抗原81份，阳性率为36．99％，其余标本均未检测到诺如病毒抗原。结论广州市诺如病毒胃肠炎暴发疫情主要发生在秋冬季，多发生在学校等人群聚集的单位，及时采取控制措施可避免疫情扩散。     

2019—2022年上饶市食品从业人员携带诺如病毒状况调查

目的 分析2019—2022年上饶市食品从业人员诺如病毒携带状况,为防控诺如病毒疫情提供依据。方法 于2019—2022年在上饶市2个县（区）的88家餐饮服务单位、10家食品加工企业和2所高校中选择无腹泻症状身体健康的食品从业人员为研究对象,采集粪便样本,采用实时荧光定量聚合酶联反应方法检测诺如病毒及其型别。结果 共调查食品从业人员1 006人,检出诺如病毒核酸阳性样本13份,阳性率为1.29%,其中型别以GⅡ.4型为主,占76.92%。不同年份的粪便诺如病毒检出阳性率差异有统计学意义（Fisher P<0.05）;第一季度采集样本检出阳性率比第三季度高（P<0.05）;不同年龄段、性别和工种的食品从业人员的诺如病毒检出阳性率差异均无统计学意义（均P>0.05）。结论 上饶市食品从业人员诺如病毒隐性感染率相对较低,但该病毒易通过食品传播,需加强食品从业人员诺如病毒感染监测,防控诺如病毒疫情暴发。     

2015-2016年福建省市售牡蛎贻贝中诺如病毒污染情况

目的了解福建省市售牡蛎贻贝中诺如病毒污染情况,为食品中诺如病毒风险评估提供数据支持。方法分离牡蛎贻贝消化腺,研磨至匀质,加磷酸盐缓冲液及蛋白酶K进行前处理。提取病毒核酸并采用实时荧光定量PCR进行检测,对阳性样本进一步定量分析。结果 2015—2016年采集市售牡蛎及贻贝240份,检出诺如病毒阳性26份,阳性率为10.83%,病毒含量在3.20×103～7.90×10~5 copies/g(消化腺)。GI型阳性16份,GII型阳性22份;GI和GII型皆为阳性8份。结论福建省市售牡蛎贻贝中存在诺如病毒污染现象,需加强监测,开展相关风险评估,以降低诺如病毒引起的食源性疾病负担。     

2014年北京市东城区诺如病毒疫情特征分析

摘要:目的　分析北京市东城区诺如病毒疫情流行特征及分布特点,为疫情防控措施的完善提供参考。方法　采用现场流行病学调查方法及描述性分析方法,对2014年处理的诺如病毒疫情报告及个案资料进行分析。结果　共处理 6起由诺如病毒所致疫情,累计病例174例,其中实验室确诊病例41例（41/174,23.56%）,病原携带者1例（1/38,2.63%）,无重症和死亡病例,罹患率波动在9.00%～46.51%之间。疫情集中在初夏季节（3-6月）和秋冬季节（11月）,其他月份无疫情发生。病例全部为学生,平均年龄（6.70±1.32）岁,男女性别比为1.20∶1。检出诺如病毒RNA阳性标本44件（44/135,32.59%）,经基因分型结果显示,3起疫情是由如病毒GⅡ6型引起的,另3起疫情分别由GⅡ4型、GⅡ7型和GⅡ17型诺如病毒引起。结论　对托幼机构及中小学校等集体单位是今后诺如病毒疫情防控工作的重点,对疫情防控关键点的控制至关重要。     

某儿童福利院诺如病毒聚集性疫情调查分析

目的 通过对儿童福利院诺如病毒疫情的调查分析,查找可疑病原和传播模式,为疫情控制提供科学依据。方法 采用现场流行病学方法调查病例发生情况和可疑传播因素。采用RT-PCR法对采集的肛拭子进行检测。结果 本次疫情从2018年4月9日开始至4月14日结束,共发现15例病例,均为该福利院儿童,儿童罹患率为65.2%。发病高峰期为4月11日,临床表现均为呕吐。调查共采集12份肛拭子进行病原学检测,其中6份肛拭子检出GⅡ型诺如病毒。结论 该起事件为病例缺乏管理和呕吐物处理不当引起的GⅡ型诺如病毒聚集性疫情。     

2012-2014年广东省哨点医院诺如病毒GII.4 Sydney变异株流行状况及暴发疫情特征分析

目的：分析2012年1月至2014年6月广东省哨点医院诺如病毒GII.4 Sydney变异株流行状况,以及由诺如病毒GII.4 Sydney变异株感染引起的暴发疫情特征。方法2012年1月至2014年6月在广东省选取22家医院的门诊科室为监测哨点,将采集的腹泻病例粪便样本（共10750份）送至市级CDC,进行病毒核酸提取及诺如病毒核酸检测,所有阳性样本递送至广东省CDC,并按照随机数字法抽取了855份进行诺如病毒基因分型,共成功测序样本690份。采用χ2检验比较不同年龄组、不同时期内腹泻病例诺如病毒感染情况。通过广东省突发公共卫生事件管理信息系统,收集2012年1月至2014年6月广东省13起由诺如病毒GII.4 Sydney变异株感染引起的社区暴发疫情数据,进行社区流行病学分析。结果2012年8月首次检出诺如病毒GII.4 Sydney变异株,2012年11月检出比例为13/15。2012年11月至2013年1月（T1时期）,各月份中腹泻病例诺如病毒感染阳性率分别为23.8%（100/421）、15.9%（61/383）、19.2%（95/495）,2013年11月至2014年1月（T2时期）,各月份中腹泻病例诺如病毒感染阳性率分别为17.0%（90/529）、8.7%（37/426）、11.2%（46/409）,均低于T1时期（χ2值分别为6.65、9.93、10.74,P值分别为0.010、0.002、0.001）。T1时期内≥15、<15岁组腹泻病例诺如病毒感染阳性率分别为26.3%（143/543）、14.9%（113/756）（χ2=25.90,P<0.001）;T2时期≥15、<15岁组阳性率分别为10.1%（52/516）、14.3%（121/848）（χ2=5.09,P=0.024）。13起暴发疫情中,食源性传播占10/13。结论广东省2012年8月首次检出诺如病毒GII.4 Sydney变异株,2012年11月起呈现社区流行,流行1年后,强度降低;由诺如病毒GII.4 Sydney变异株引起的暴发疫情主要以食源性传播为主。     

一起校园诺如病毒暴发疫情调查分析

<正>2014年12月24日某高校陆续有多名学生因恶心呕吐,疑似食物中毒在校医院就诊。包河区疾控中心接到报告后,立即调查核实53例病例,结合实验室结果,排除食物中毒,确认为一起诺如病毒暴发疫情。现将本起疫情分析如下。1材料与方法1.1资料来源对2014年12月21日至疫情发病降至历年同期水平期间出现呕吐或腹泻的学生和教职工开展个案调查;对该校就餐场所开展现场卫     

北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况及基因特征分析

目的 了解北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况,分析其基因特征.方法 2014年11月-2015年10月,采集北京市三个水产品销售市场新鲜花蛤各24件.用两种方法对花蛤鳃和肠内容物进行病毒浓缩,提取核酸后用实时荧光RT-PCR法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ组和A组轮状病毒核酸.用半巢式RT-PCR方法,扩增诺如病毒阳性样...     

贝类海产品中诺如病毒快速检测方法研究

目的：寻找和建立贝类产品中诺如病毒的敏感特异的快速检测方法。方法：通过对报道的3种贝类中病毒提取方法的提取效率进行比较，确定最终的提取方法。设计特异性和敏感性相对较高的套式PCR方法进行病毒检测，检测结果经核酸序列测定证实。结果：3种方法中用PBS-三氯三氟乙烷-PEG处理回收率较高。设计的套式PCR方法可成功检测到病毒，其敏感性可比单轮PCR高100倍。结论：该研究建立了敏感特异的诺如病毒检测方法。     

2008-2017年上海市徐汇区12起医疗机构内诺如病毒急性胃肠炎暴发流行病学特征

目的分析上海市徐汇区医院内诺如病毒急性胃肠炎暴发的流行病学特征,为科学控制医院感染暴发提供依据。方法回顾性分析2008年1月-2017年12月医疗/养老机构主动报告的由诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发事件12起,描述分析时空分布、人群分布、病原学分型、暴发相关因素等流行病学特征。结果共收集12起医院内因诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发事件,共波及1163人,感染人数共205人,罹患率17.63%,平均疫情时长为(7.25±2.38)天。83.33%的暴发疫情是由诺如病毒GII型引起的,冬春季为暴发的高发季,老年科/干保科病区发生疫情为高发病区,住院患者的感染率高于医务人员及护工,主要传播途径为人-人或人-环境-人的传播模式,无症状密切接触者中诺如病毒检出率为29.41%(15/51),清洁用具、环境、护工手的诺如病毒检出率分别为37.50%(3/8),15.71%(11/70),14.29%(2/14)。达到暴发疫情到报告CDC之间平均报告时长为3.33天,报告时长与疫情时长呈正相关(r=0.735,P=0.006)。结论冬春季、老年病区应是医院内诺如病毒暴发控制的重点。建议在医疗机构内开展感染性腹泻症状监测,对医务人员及家属开展健康教育,发现疑似诺如病毒感染应尽快报告CDC并进行病原学检测,对密切接触对象进行隐形感染筛查,采取控制措施。