2株新型冠状病毒全基因测序及插入和终止突变分析

目的 分析2株新型冠状病毒基因进化变异情况及分子特征。方法 利用二代测序技术,对2份新型冠状病毒核酸检测阳性样本进行全基因组测序。利用生物信息学软件对基因序列进行分析。结果 获得长度分别为29 826 bp和29 837 bp的两条新型冠状病毒全基因序列,与Wuhan-Hu-1株基因序列同源性分别为99.96%和99.97%。两条序列的N蛋白均发生S194L变异,N蛋白S194磷酸化位点和N192潜在糖基化位点消失。其中序列1的3 647～3 648 bp之间插入了CCCAC序列,导致非结构蛋白3(NSP3)发生移码突变,即编码一种新的无跨膜结构、含有完整泛素样结构域的NSP3Δ蛋白。序列2发生了C27978T突变,导致开放读码框8(ORF8)发生终止突变,即编码1个新的仅含28个氨基酸的截短型ORF8蛋白。结论 新型冠状病毒进化变异方式复杂多样,插入突变和终止突变可能改变相关蛋白的结构和性质,应加大新型冠状病毒的病原学监测力度。     

TSG101基因与肿瘤的研究进展

TSG101基因是近年来发现的一个新的抑癌基因候选者，定位于11p15．1～15．2，其编码产物TSG101蛋白N端区与泛索结合酶（UBC）同源。有研究表明，TSG101基因与多种肿瘤密切相关，其转录子在某些肿瘤细胞中发生了异常剪接，其产物TSG101蛋白可能有转录因子的作用；也有可能作为一种显性负调节子参与泛素系统对细胞周期的调节转录因子的作用。     

马尔可夫模型的流感优势毒株预测分析

摘要：目的　预测流行季节流感的优势毒株,为疫情研判和防控提供依据。方法　根据２００９－２０１３年浙江
省流感监测样本的检测结果,按上下半年对各年流感优势毒株亚型排列,将流感各亚型进行状态划分,并
按时间顺序建立状态变化列表,计算各亚型间的一步状态概率转移矩阵,利用状态转移概率矩阵预测下一
流行季节各流感亚型成为优势毒株概率。结果　浙江省流感监测样本阳性检出率呈上下半年双峰分布,且
每一个阳性检出峰中流感优势毒株类型单一明显,根据一步状态概率转移矩阵,２０１３年下半年流感优势毒
株为Ａ （Ｈ３Ｎ２）、甲型Ｈ１Ｎ１、Ｂ型的概率分别为０、０、１００％。结论　应结合预测结果,流感样病例、分
子实验室、药敏监测等综合判断,同时应根据实际监测结果调整状态概率转移矩阵。
关键词：马尔可夫模型;流感优势毒株;预测
中图分类号：Ｒ１８３．１　　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００９ ６６３９ （２０１４）０３ ０１７０ ０３     

传染病模型分析与预测方法研究进展

近年来,新发传染病不断出现,曾经被消灭和控制的旧传染病也有死灰复燃之势,生物袭击造成的传染病发生和流行时有出现,所有这些使得人类面临传染病形势日趋严峻.在这种复杂的情况下如何最大限度地减轻疫情影响和造成的损失已经成为值得研究的重要课题.     

基于灰色马尔可夫模型的医学影像检查量预测

医学影像检查量预测对于医院医疗管理决策有着重要意义。但医学影像检查量受外界因素影响大、波动性强,常规预测方法易造成较大偏差。本文提出了一种基于灰色马尔可夫模型的医学影像检查量预测方法,该方法结合了灰色模型与马尔可夫模型,提高了医学影像检查量的预测精度,解决了其随机波动性问题,可为管理决策提供更准确的参考信息。     

艾滋病疫情估计与预测方法研究进展

近年来,由于艾滋病监测系统的不断完善以及监测资料来源的多样性,艾滋病疫情估计与预测方法已成为了解艾滋病流行状况及预测发展趋势的重要工具,为此国内外学者采用了多种方法对艾滋病疫情进行了估计与预测。本研究对目前常用艾滋病疫情估计与预测方法的基本原理、适用条件、应用、优点及局限性进行综述,为疫情估计方法的选择与应用提供参考。     

肿瘤相关基因的选择性剪接

选择性剪接（alternative splicing）又称变位剪接或可变剪接,指的是从一个mRNA前体通过选择不同的剪接位点组合产生不同的mRNA剪接变异体的过程。该过程是生物界普遍存在的现象,它在机体发育、组织特异性表达、疾病发生和发展等方面起重要作用,是生物体内一种基本且重要的调控机制。近年来,越来越多的研究显示,在人类肿瘤发生发展过程中RNA的选择性剪接扮演着重要的角色。     

自发性早产预测的研究进展

早产是最常见的妊娠并发症,是新生儿死亡的主要原因。自发性早产占早产病例的65%～70%,其确切病因至今未明。尽管已大力推广宫缩抑制剂等治疗措施,加强胎儿监护和产前检查,但是自发性早产的发生率并没有明显下降。干预时间过晚是目前导致自发性早产防治效果不满意的主要原因之一。早产病因学复杂,从而导致其预测筛选困难,治疗也缺乏针对性。筛选与确定便捷、准确和无创伤的早产预测因子及诊断方法,探索与运用恰当、先进的统计学方法,建立高灵敏度和特异度的早产预警机制,是当前产科研究的热点和难点之一。因此,本研究对早产的预测因子以及预测模型的国内外进展进行综述。     

早产预测的研究进展

国内早产定义为孕28周至不足37周的分娩,目前明确的预测早产的方法主要有既往流产史或者早产史以及妊娠中期宫颈长度≤25 mm。近年来,超声监测宫颈长度、依据一些生物标志物如胎儿纤连蛋白、胰岛素样生长因子结合蛋白-1、胎盘α微球蛋白-1、炎性因子等对预测早产发生有新的进展。妊娠结合宫颈长度和宫颈硬度对自发性早产的预测价值较高,对高危孕妇的基因筛查也为临床管控提供参考。本文将对早产预测的一些新观点和手段进行阐述,以供临床参考。     

丙型肝炎病毒F蛋白的发现及其特性

目的丙型肝炎病毒(HCV)F蛋白是近年来在感染HCV的患者血清中发现的一种蛋白,是由HCV核心蛋白编码序列在翻译时发生核糖体读码框移位(_2/+1)产生的,主要位于胞浆中,与内质网相连,推测它在此发挥功能;F蛋白能诱导宿主的体液免疫应答及T淋巴细胞介导的特异性细胞免疫应答。本文就有关HCVF蛋白的发现及其特性进行综述。     

食物血糖指数及其预测模型研究进展

近年来研究表明,食物血糖指数能有效指导糖尿病人膳食规划,从而控制血糖.本文概述了食物血糖指数概念的发展、数据测定、预测模型建立以及临床应用进展.     

铅测定方法的研究进展

目前测定铅的方法有火焰原子吸收光谱法、氢化物发生原子吸收光谱法、无火焰原子吸收光谱法、氢化物发生原子荧光光谱法、双硫腙分光光度法、电感耦合等离子体质谱法(ICP-MS)等数种。其中痕量铅的测定方法越来越被人们重视,简便快速、易于掌握、灵敏度高,准确的测定方法逐步成为铅测定的未来发展趋势,这对现代社会环境中存在的痕量铅的检出测定起到了很大的帮助。     

黄曲霉毒素分析方法研究进展

黄曲霉毒素是由某些真菌产毒菌株产生的次生代谢产物。由于其具有极强的毒性、致癌性以及在自然界存在的普遍性 ,许多国家对其进行了限量要求。并且随限量要求的不断提高 ,黄曲霉毒素的检测方法也不断发展。目前已有TLC法、HPLC法、ELISA法、RIA法、CE法、IC法等检测方法。建立快速、无污染、无毒的检测体系将成为今后研究的热点。     

梅毒检测方法新进展

梅毒是人类目前主要的性传播疾病之一,其病程复杂,可威胁全身各个器官,危害性极大。同时由于梅毒不能在体外培养,严重限制了梅毒的预防和治疗研究。因此,针对不同时期症状病人的准确检测,明确其传染性和致病性程度在梅毒预防和治疗过程中起至关重要的作用。本文综述了目前应用于梅毒实验室检测的暗视野显微镜检（Dark field）、基于反应素的非梅毒螺旋体血清试验、梅毒螺旋体血清试验以及聚合酶链式反应（PCR）和实时荧光定量PCR等分子生物学技术及其研究进展。对实时荧光定量PCR和动聚焦显微镜（Focus-floating microscopy,FFM）等最新检测方法的优点和缺点进行了总结。通过比较各种检测方法在发病的不同时期敏感性,综合分析影响检测的各方面因素,总结了以FFM为基础的梅毒综合检测流程。为梅毒的早期诊断,准确诊断以及梅毒的分期检测和治疗提供指导。     

多组学数据整合分析的统计方法研究进展

复杂疾病往往是由环境因素、遗传因素（多个组学层面）共同作用所致。全面分析不同分子水平的信息对认识疾病的发生发展至关重要。多组学数据整合分析能够提高特征筛选检验效能、改善疾病预测精度。本文从统计学角度出发,对多组学数据整合分析的统计理论方法研究进展做一述评。     

沙眼衣原体基因分型方法研究进展

沙眼衣原体(CT)是导致性传播感染(STIs)的病原体之一.CT基因分型的目的在于了解衣原体的流行分布情况、分析性传播网络和致病机制.以主要外膜蛋白(MOMP)为基础的血清学分型是CT的传统分型方法.随着PCR和基因测序技术的出现,基于核苷酸多态性的基因分型技术成为目前的主流.其中基于omp1基因的限制性片段长度多态性分析(RFLP),可以对CT进行基因分型.而多位点序列分型(MLST)和多位点可变数目串联重复序列分型(MLVA)进一步提高了分型效率,并能提供更多的流行病学信息,但均不能检测混合感染(MIs).PCR杂交技术在检测MIs方面有独特优势.而全基因组测序、纳米技术、高分辨率基因分型等新技术的应用,为科研人员提供更多的细节信息与更快的检测速度.本文简要介绍了多种CT基因分型方法的特点及其应用.     

尿铅检测方法应用研究进展

<正>铅污染以及铅对人体健康的危害已经受到广泛关注。铅是人体非必需元素,主要通过呼吸道、消化道吸收,在体内有蓄积作用,对全身各系统和器官有毒性作用,吸收后的铅主要通过尿液排除体外。血铅和尿铅为铅接触和铅负荷的主要生物监测指标,是相关行业职业健康检查和铅中毒诊断     

手部卫生产品评价方法研究进展

众多的研究表明，洗手是最基本、最简单易行的预防和控制病原体传播的有效方法。洗手行为及效果受多种因素的影响，美国感染控制工作者协会(APIC)认为影响洗手的因素包括人员编制、洗手设备、洗手对手部皮肤的影响以及手部卫生产品的质量。其中手部卫生产品的质量是重要方面。制     

MR图像预测CT图像研究进展

医学图像可以为医生提供准确和全面的病患信息.由于人体因各种疾病引起的形态或功能异常可以表现在很多方面,MR图像和CT图像能重点呈现出患者不同组织结构的医学图像数据,但单独的MR图像或者CT图像不能全面反应出疾病的复杂性.MR图像预测CT图像属于医学图像跨模态预测的一种,将MR图像预测CT图像的方法分为4类,基于图集的方...     

登革病毒实验室诊断方法研究进展

目前登革病毒(dengue virus, DENV)已被世界卫生组织视为热带及亚热带地区的重大公共卫生问题。近年来全球范围内登革热疫情频发, 有愈演愈烈的趋势。仅2019年已在菲律宾、泰国、孟加拉国、缅甸及中国重庆市暴发了不同程度的登革热疫情。DENV的实验室诊断方法对于登革疫情的防控意义重大。为此本文对现阶段DENV实验室诊断方法及策略进行综述。通过回顾以往传统性诊断方法, 展望新兴的诊断策略, 为登革疫情暴发时选择合适的实验室诊断方案提供参考。