沙眼衣原体Tarp蛋白B细胞表位的预测与鉴定

目的：预测并鉴定沙眼衣原体（Ct）Tarp蛋白的B细胞表位,为进一步研究Tarp蛋白的生物学特性及表位疫苗研制奠定基础。方法：利用生物信息学软件综合分析、预测筛选E血清型CtTarp蛋白的B细胞表位,获得6个潜在目的表位。将人工合成的表位肽段与弗氏佐剂充分乳化,经背部皮下多点注射途径免疫BALB/c小鼠（每次100μg/只,3只/组,共24只）,间隔2周,共免疫3次。采用ELISA法检测免疫小鼠血清中Tarp蛋白特异性抗体IgG及其亚类IgG1、IgG2a,以及阴道分泌物中Tarp蛋白特异性sIgA抗体;进一步采用间接免疫荧光实验、免疫沉淀实验和Westernblot法检测表位免疫的血清抗体与Tarp蛋白结合的特异性。结果：筛选并鉴定了Tarp蛋白的一个免疫优势B细胞表位（aa171-186）,该表位可以刺激小鼠产生较高水平的Tarp蛋白特异性IgG抗体和sIgA抗体,且抗体亚类以IgG1为主。免疫荧光实验、免疫沉淀实验和Westernblot法检测结果显示,该段表位肽免疫血清抗体可特异性识别Tarp蛋白。结论：获得了CtTarp蛋白的一个免疫优势B细胞表位,为进一步研究Tarp蛋白的生物学特性及表位疫苗研制奠定基础。     

土拨鼠肝炎病毒核心蛋白质粒的构建、原核表达及多克隆抗体的制备与鉴定

目的构建土拨鼠肝炎病毒核心蛋白质粒并进行原核表达、抗体制备。方法应用基因工程技术将编码截短型土拨鼠肝炎病毒核心蛋白（WHcAg1～149aa）的基因片段装入原核表达载体pQE60上,在JM109菌内进行诱导表达,使用切胶回收及Ni-NTA柱两种方法纯化目的蛋白。将纯化蛋白免疫家兔制备多克隆抗体,并采用酶联免疫吸附实验、免疫组织化学及Western blot检测抗体的灵敏度和特异性。结果成功地构建了含截短型土拨鼠肝炎病毒核心区基因的质粒并获得表达,经纯化得到了分子量约为16.5kD的重组核心蛋白,免疫家兔获得了高效价的特异性多克隆抗体,而且与HBcAg有交叉反应。结论获得的重组截短型土拨鼠肝炎病毒核心抗原（1～149aa）纯度高,免疫原性强。获得的兔抗-WHc效价高,特异性好,与HBcAg有交叉反应。     

B型流感病毒核衣壳蛋白ELISA捕获法的建立和临床应用2

目的 制备和鉴定B型流感病毒核衣壳（N）蛋白单克隆抗体（mAb）,建立双抗体夹心捕获抗原ELISA,用于B型流感病毒感染的早期诊断。方法 用重组B型流感病毒N蛋白和B型流感病毒抗原免疫BALB/c小鼠制备mAb,采用ELISA间接法、免疫荧光（IFA）和免疫印迹（WB）进行筛选和鉴定,通过竞争抑制试验分析抗体识别表位,并采用抗体配对试验建立双抗体夹心捕获抗原ELISA法检测B型流感病毒 N抗原。结果 获得12株特异性针对B型流感病毒 N蛋白的mAb,识别8个不同的抗原位点,根据mAb识别抗原表位,对mAb进行多种组合的配对试验,筛选出2株单抗BN4和BN8混合作为捕获抗体,辣根过氧化物酶标记的单抗BN1 和BN5混合作为测定抗体,建立了双抗体夹心ELISA法,测定新鲜的漱口液标本的灵敏度达100％,而对冻融的漱口液标本检测灵敏度为83.9％,与其他呼吸道病毒如A型流感病毒、副流感病毒等无交叉反应,特异度达100％。结论 获得特异性好的mAb,经过抗体的配对和优化,建立了一种灵敏度高、特异性强的B型流感病毒抗原的ELISA捕捉法,可用于B型流感病毒感染的早期实验室诊断及流行病学研究。     

结核杆菌抗原Ag85C的HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位的预测及鉴定

目的：预测及鉴定结核杆菌（Mycobacterium tuberculosis，Mtb）抗原Ag85C的HLA-A＊0201限制性CD8^＋CTL表位，为基于表位的结核疫苗研究提供依据。方法：应用SYFPEITHI数据库预测结核杆菌抗原Ag85C序列中可能存在的HLA-A＊0201限制性T细胞表位，利用T2细胞株分析各预测的抗原肽与HL-A＊0201分子的亲合力，选取高亲合力肽诱导特异性CTL细胞，检测各高亲合力肽刺激其特异性CTL细胞分泌的IFN-γ水平、在体外的CTL增殖反应以及细胞杀伤毒性，逐步鉴定出Ag85C的HLA-A＊0201限制性CD8^＋CTL表位。结果：SYFPEITHI数据库从Ag85C序列中预测到14条能够结合HLA—A＊0201分子的抗原肽，其中3个抗原肽（170～178aa、317～325aa和144～153aa）显示与T2细胞上HLA-A＊0201分子有高结合力，而抗原肽FLTREMPAWL（144～153aa）能够诱导大多数HLA—A＊0201阳性结核患者及PPD（＋）健康志愿者产生特异性CTL细胞，并分泌大量的IFN-γ，能够诱导CTL体外发生增殖，能够产生特异性杀伤活性。结论：成功鉴定出抗原肽FLTREMPAWL（144～153aa）结核杆菌抗原Ag85C的HLA-A＊0201限制性CD8^＋CTL表位，可作为结核疫苗设计的候选表位，为进一步研发新型有效的抗结核疫苗奠定了基础。     

地高辛抗体的制备和应用

目的制备地高辛免疫试剂盒所需的特异抗体和酶标抗原。方法化学合成地高辛（Ｄｉｇ）、牛血清白蛋白（ＢＳＡ）结合物（Ｄｉｇ－ＢＳＡ），形成完全抗原；依据动物体的免疫反应规律安排免疫日程，制备高质量的抗地高辛特异性抗体（Ｄｉｇ－Ａｂ）。化学合成酶标记抗原，将地高辛抗体和酶标抗原应用于地高辛血浓度监测的免疫脂质体溶破法（ＬＩＬＡ）、酶联免疫吸附试验（ＥＬＩＳＡ）和化学发光酶免疫法（ＣＬＥＩＡ）测定。结果抗体效价达１∶１．８×１０６放射免疫法（ＲＩＡ），亲合系数为２．６７×１０９，与人血清内源物质无交叉反应。三种免疫方法的灵敏度、线性、回收率、精密度分别为０．２～０．０６μｇ／Ｌ、１０μｇ／Ｌ、８９．３％～１１０．５％、２．４％～８．８％（批内）、６．０％～１８．８％（批间），与荧光偏振法和ＲＩＡ法有良好相关。结论制备的抗体和酶标抗原可用于地高辛的免疫试剂盒。     

抗志贺毒素ⅡB亚单位单克隆抗体识别表位的初步鉴定

目的 初步确定抗志贺毒素ⅡB亚单位(Stx2B)单克隆抗体(McAb)1H9、1H10、3E5识别的抗原表位.方法 运用DNAstar Protean软件,对Stx2B(1～72 aa)全抗原进行表位预测;采用截短法分段构建重组质粒Stx2B50(23～72 aa),Stx2B54(1～54 aa).用IPTG诱导表达融合蛋白.对表达产物进行SDS-PAGE蛋白电泳及Western blot 分析.结果 1H9、1H10能够识别Stx2B和Stx2B50;3E5能够识别Stx2B、Stx2B50和Stx2B54.结论 McAb 1H9、1H10识别的抗原表位位于55～72 aa,McAb 3E5识别的抗原表位位于23～54 aa.     

EB病毒核抗原1优势表位区段抗原的克隆表达及其在鼻咽癌诊断中的应用

目的制备高活性EB病毒核抗原1(Epstein-Barr virus nuclear antigen 1, EBNA1)的优势表位区段抗原,并初步评价该抗原在鼻咽癌诊断中的应用价值。方法利用生物学软件BIOSUN分析EBNA1抗原的B细胞表位分布,并从中选取含有优势表位的抗原区段。然后利用分子生物学技术构建含有优势表位区段序列的原核表达质粒并进行表达,获得纯化优势表位抗原,采用间接酶联免疫吸附试验(ELISA)初步评价优势表位区段抗原的检测性能。结果成功构建含有优势表位抗原区段序列的原核表达质粒,获得了可溶性表达的EBNA1优势表位区段抗原NA-2(401~641 aa)。通过间接ELISA法对小量样本进行验证,确定NA-2抗原针对EBNA1-IgA抗体具有较高的抗原活性和特异性,较EBNA1-IgG和EBNA1-IgM抗体而言,能够较好地区分鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)和健康对照样本。放大样本量进行检测,基于NA-2抗原的EBNA1-IgA抗体间接ELISA方法检测灵敏度和特异性分别为90.38%和91.58%,EBNA1-IgA抗体检测的AUC值为0.942。结论获得EBNA1优势表位区段抗原NA-2,该抗原是优选的可以用于EBNA1-IgA检测的抗原,利用该抗原所建立的间接ELISA检测方法可以很好地区分鼻咽癌患者和健康对照。     

性病患者血清HCMV pp65特异性IgM表达水平

目的建立检测人HCMV pp65特异性lgM的酶联捕获技术,并分析性病患者HCMV感染状态。方法利用抗人IgM（μ链特异性）抗体包被固相载体,采用辣根过氧化物酶（HRP）标记HCMV pp65单克隆抗体或HCMV pp65抗原,建立抗体捕获HCMV pp65特异性IgM酶联免疫技术。用该法检测688例性病患者及450名健康献血员血清样本,并与HCMV-pp65抗原表达水平进行比较。结果性病患者血清HCMV pp65-IgM阳性分别为274例（39.8%,酶标抗体法）和262例（38.1%,酶标抗原法）,与正常对照组（0.89%）存在显著性差异（P〈0.05）。酶标抗体法与酶抗原法在抗体捕获HCMV pp65特异性IgM检测时无显著性差异（P〉0.05）,阳性符合率95.6%,且不受类风湿因子（RF）的影响。结论酶联捕获HCMVpp65特异性lgM法具有简便、快速、特异和敏感等特点,可诊断HCMV活动性感染。     

慢性HBV感染患者抗原特异性CTL的肝损伤作用

目的探讨抗原表位特异性CTL在慢性乙型肝炎发病中的作用。方法用4个HBV抗原表位肽四聚体对外周血中抗原特异性CTL进行检测[HBV抗原表位肽分别为HBcAg18-27,序列为FLPSDFFPSV（C18）,HBsAg183～191,序列为WLSLLVPFV（E183）,HBeAg335-343,序列FLLTRILTI（E335）,多聚酶P的575～583序列为FLLSLGIHL（P1575）],检测慢性乙型肝炎患者肝炎发作时病毒抗原表位特异性CTL出现频率,分析抗原表位特异性CTL频率与血清ALT水平的相关关系,分析各组间抗原表位特异性CTL频率的差异。结果36例慢性HBV感染患者抗原表位特异性CTL检测阳性33例（92％）,HBeAg183～191表位特异性CTL频率高于其他3个（P〈0．05）。统计分析抗原表位特异性CTL频率血清ALT水平相关性不显著;分组对比发现血清ALT升高5-10倍组多个抗原表位特异性CTL水平高于其他组（P〈0．05）。结论慢性HBV感染患者外周血中存在抗原表位特异性CTL,但特异性CTL的存在并不能代表保护性免疫。认为抗原表位特异性CTL在肝炎发作过程中具有肝组织损害作用,肝损伤作用可能比较轻微。     

抗HEV ORF2单链可变区抗体的筛选和鉴定

目的：筛选和鉴定抗戊型肝炎病毒（ＨＥＶ）开放读码框架２（ＯＲＦ２）的人源化噬菌体单链可变区抗体。方法：以大肠杆菌表达的重组ＨＥＶ ＯＲＦ２多肽做为固相包被抗原,从半合成的人源化噬菌体抗体库中经过４轮“吸附－洗脱－扩增”的筛选过程及酶联免疫吸附试验（ＥＬＩＳＡ）、ＤＮＡ序列分析鉴定,获得抗原结合活性较强的抗－ＨＥＶ ＯＲＦ２单链可变区抗体,并以间接酶标法用该抗体对戊型肝炎患者石蜡包埋肝组织中的ＨＥＶ ＯＲＦ２抗原进行免疫组织化学鉴定。结果：筛选到的抗－ＨＥＶ ＯＲＦ２的单链可变区抗体基因。酶切和序列分析表明,该抗体基因由７９５ｂｐ组成：ＥＬＩＳＡ和免疫组织化学结果显示,抗－ＨＥＶ ＯＲＦ２人源化噬菌体单链可变区抗体能与重组ＨＥＶ ＯＲＦ２抗原特异性结合,并能够特异性识别戊型肝炎患者肝组织中的ＨＥＶ抗原。结论：此法     

复制型重组痘苗病毒TTK-EG特异性T细胞表位研究

目的筛选和确定TTK-EG包含的H-2~d限制的HIV-1特异性T细胞表位。方法 6~8周龄雌性BALB/c小鼠0周时分别经肌肉注射、皮内注射和滴鼻途径免疫5×10~6PFU TTK-EG,间隔4个月进行加强免疫。末次免疫后2周取小鼠脾细胞,采用IFN-γELISPOT方法筛选HIV-1 Env和Gag肽库,反应阳性的肽库进行第二轮单肽筛选。用流式细胞术(胞内因子染色,intracellular cytokine staining,ICS)对筛选出的单肽进行验证(小鼠免疫途径为肌肉注射),确定H-2~d限制的HIV-1特异性T细胞表位。结果经过ELISPOT筛选和ICS验证,确定2条Env多肽(gp140-9,氨基酸位点60~77;gp140-74,氨基酸位点548~565)和3条Gag多肽(Gag-49,氨基酸位点196~210;Gag-64,氨基酸位点256~270;Gag-65,氨基酸位点260~274)包含H-2~d限制的HIV-1特异性T细胞表位,其中gp140-74(IVQQQSNLLRAIEAQQHL)是首次发现的H-2~d限制的HIV-1特异性T细胞表位。Env、Gag优势表位肽与Env、Gag全肽池刺激小鼠T细胞分泌IFN-γ、IL-2、TNF-α三种细胞因子的能力基本相同。结论 Env多肽gp140-9、gp140-74和Gag多肽Gag-49、Gag-64、Gag-65包含H-2~d限制的T细胞表位,可用于重组痘苗病毒TTK-EG的T细胞免疫研究。     

新型冠状病毒E蛋白结构与免疫优势表位的信息学预测分析

目的：应用生物信息学方法预测和分析新型冠状病毒（SARS-CoV-2）包膜蛋白（E蛋白）的结构及免疫优势表位。方法：从NCBI GenBank数据库中检索SARS-CoV-2 E蛋白的氨基酸序列，通过Expas y服务器上的软件分析预测其理化性质、二级结构、跨膜区域；并结合其亲水性、表面可及性、极性、抗原性和柔韧性等综合分析，预测其可能的B细胞表位；利用Net CTL1.2 server预测CTL表位；通过Vector NTI对冠状病毒属E蛋白进行同源性分析；同时应用Swiss Model对E蛋白进行三维结构同源建模及功能结构域预测分析。结果：SARS-CoV-2 E蛋白由75个氨基酸残基组成，为跨膜蛋白，跨膜区域以α螺旋为主；E蛋白可能含有2个B细胞表位和6个CTL表位，其免疫优势表位区域分别位于其N端16-34aa和C端50-70aa区段；SARS-CoV-2与SARS-CoV和Bat-SARS-like-CoV E蛋白的免疫优势表位存在极高的同源性；其疏水性跨膜结构和PDZ结合基序分别位于N端12-34aa和C端72-75aa区段。结论：E蛋白为跨膜蛋白，其氨基酸序列的16-34和50-70区段可能为免疫优势表位。     

Association of variations of NAb 2F5 and 4E10 epitopes and disease progression in Chinese antiretroviral treatment-na(i)ve patients infected with HIV-1 clade B'

Background Studies on human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) vaccines have recently focused on targeting the conserved neutralizing epitopes 2F5 and 4E10, and hence it is important to understand the extent of mutations in these two viral epitopes. Here, we investigated the amino acid mutations in epitopes of 2F5 (ELDKWA, HIV-1 HXB2 env 662-667 aa) and 4E10 (NWFDIT, HIV-1 HXB2 env 671-676 aa) in the membrane proximal-external region of gp41 from clade B' HIV-1-infected individuals living in Henan province, China. We also examined the frequency of a mutation and its relation to disease progression.Methods A cohort of 54 treatment-na(i)ve HIV-1-infected individuals was recruited in this study, and 16 individuals were selected for a short-term longitudinal study on sequence evolution. The HIV-1 env gp41 gene was amplified, cloned, and sequenced, and predicted amino acid sequences were aligned for analysis.Results The mutations E662A and K665E on the 2F5 epitope and N671S and T676S on the 4E10 epitope were seen.Simultaneous RNA sequencing showed some discrepancies with proviral DNA sequences. In our longitudinal study,mutation levels of these two neutralizing epitopes were low but diverse and persistent. The frequencies of mutations within the 4E10 peptide NWFDIT in slow progressors were noticeably lower than those in AIDS patients (P ＜0.05).Conclusions Antigenic variation of the neutralizing epitopes 2F5 and 4E10 is limited in subtype B' infection, and that 4E10 peptide mutation is correlated with disease progression. Monitoring epitope mutations will offer useful data for development of the candidate 2F5-like and 4E10-like antibodies to prevent and treat AIDS.     

原发性胆汁性肝硬化患者中自身抗原丙酮酸脱氢酶特异性CD8+CTL表位预测及鉴定

目的鉴定原发性胆汁性肝硬化(PBC)患者中自身抗原丙酮酸脱氢酶(PDC-E2)上的HLA-A*0201限制性CD8 CTL表位,为临床探索特异性免疫治疗奠定基础.方法应用数据库SYFPEITHI预测PDC-E2上两段涵盖B细胞表位和CD4 T细胞表位的氨基酸序列(163～184aa和36～49aa)附近可能存在的HLA-A*0201限制性T细胞表位,再通过T2细胞株、细胞增殖试验和细胞毒性检测分别分析各抗原肽与HLA-A*0201的结合力、诱导患者外周血单个核细胞(PBMCs)增殖能力及抗原肽诱导的抗原特异性T细胞杀伤毒性,逐步鉴定HLA-A*0201限制性CD8 CTL细胞表位.结果数据库初步预测到5个可能性较大的HLA-A*0201限制性抗原肽,其中两个抗原肽(159～167aa和165～174aa)显示与T2细胞上HLA-A*0201分子有较高的亲和力,这两个抗原肽能刺激大部分HLA-A*0201阳性PBC患者PBMC增殖,并且由其诱导产生的CTL具有特异杀伤活性.结论位于PDC-E2内酯酰区上的KLSEGDLLA(159～167aa)和LLAEIETDKA(165～174aa)是PBC患者体内HLA-A*0201限制性的CD8 CTL表位.     

外源辅助T淋巴细胞表位影响HBV S基因DNA免疫的体液免疫应答

目的　探讨外源辅助T淋巴细胞 (HTL)表位对HBVS基因体液免疫应答的影响。方法选用 2种通用HTL表位 ,破伤风类毒素的氨基酸残基 (aa) 830 843片段 (TTE)和人工HTL表位(PADRE) ,以及 3种特异性HTL表位 ,结核杆菌热休克蛋白 6 5的aa1 2 0片段 (TBE)、风疹蛋白E2 4的aa5 4 6 5片段 (ME)和沙眼衣原体热休克蛋白 6 0的aa35 48片段 (CE) ,以单个表位或复合表位形式插入HBVS基因的翻译起始密码下游而构建成真核表达载体。 10 0 μg重组载体DNA免疫BALB/c小鼠 ,3周加强 1次 ,共 3次 ,第三次加强接种后 1月取血采用Abbott试剂盒检测抗 HBs。结果　HBVS基因真核表达载体pHB和 6种外源HTL表位HBVS基因真核表达载体pHB TBE、pHB PADRE、pHB TTE、pHB MTE2、pHB MTE3和pHB MTE5构建成功 ,DNA免疫的抗 HBs水平 (IU/L)分别为 10± 5 ,5± 5 ,49±7,2 9± 6 ,16± 8,2 3± 7和 2 8± 8。单个表位中 ,TTE和PADRE具有良好的免疫促进作用 ,而TBE无促进作用。复合表位均有不同程度的免疫增强作用。结论　部分外源HTL表位对HBVS基因的体液免疫应答有促进作用 ,复合表位中的单个表位间的促进作用无协同或迭加效果。表位PADRE可能用于新型高效乙肝疫苗的研制 ,而复合表位MTE5可能用于能克服人类白细胞抗原多态性的乙肝补种疫     

重组人乳头瘤病毒CTL表位疫苗的构建与表达

目的：构建人乳头瘤病毒的细胞毒性T淋巴细胞（CTL）表位疫苗并在大肠杆菌中表达。方法：应用多轮PCR 的方法合成CTL表位基因序列,将其亚克隆入pET28a表达载体中,并在大肠杆菌BL21 (DE3) 中表达重组蛋白质,用Western blotting对重组蛋白进行鉴定。结果：采用计算机表位预测的方法选取HPV6、11、16型的CTL表位,通过5轮PCR 人工合成人乳头瘤病毒CTL表位疫苗的基因片段HPVepi,用亚克隆的方法构建了重组表达质粒pET28a-Tat-HPVepi,并在大肠杆菌高效表达了该重组蛋白质,经Western blotting鉴定显示出特异性条带。结论：结合计算机表位预测和PCR的方法构建并在大肠杆菌中高效表达了一种人乳头瘤病毒CTL表位疫苗。     

EBV编码潜伏膜蛋白2A抗原表位的串联表达及其免疫原性分析

目的:制备具有免疫原性的EB病毒潜伏膜蛋白2A (latent membrane protein 2A,LMP2A)的表位串联蛋白并分析其免疫学特性?方法:用DNAstar软件分析LMP2A的抗原表位,将预测的免疫原性较强的两个表位通过基因合成串联在一起,克隆到原核表达载体pET28a中,经大肠杆菌BL21表达并纯化?制备的含LMP2A表位重组蛋白经SDS-PAGE?Western blot鉴定后,免疫小鼠制备多克隆抗体,以ELISA检测抗体的效价,免疫组织化学法检测该抗体对天然LMP2A的特异性?结果:通过原核表达与纯化,获得高纯度的表位融合蛋白,经小鼠免疫并制备效价高且特异性的小鼠抗LMP2A的多克隆抗体,该抗体可用于ELISA和免疫组织化学分析?结论:本研究制备的表位融合蛋白,具有天然抗原的免疫原性,可制备能特异性识别天然LMP2A分子的多克隆抗体,为利用表位融合蛋白筛选全人源基因工程抗体奠定了基础?     

Polymorphism of P66 in Borrelia Burgdorferi Strains in China

Objective To study the polymorphism in P66 and its human B-cell epitopes of Borrelia burgdorferi strains in China. Methods Polymerase chain reaction (PCR) and sequencing were used to obtain the P66 sequences of 59 Chinese B. burgdorferi. Then the sequences were analyzed by MEGA 5.10 software and compared with the human B-cell epitope sequences from the Immune Epitope Database (IEDB) based on the reference strain of each genotype. Results Results showed that genetic and amino acid diversity presented in the 66 kD protein of all 59 Chinese strains, especially in Borrelia garinii (B.g) and Borrelia afzelii (B.a) strains. B.g strains were divided into three subclusters and two scattered strains JC1-7 and JC2-2 according to the amino acid sequences of P66. The P66 sequences of 15 Xinjiang strains represented by XI91-12 in the B.g subcluster 1, changed from CAA to TAA codon at 508aa position, resulting in early termination. Bases A and C were inserted at sequence position 1523 bp of strains FP1, LB20, LB21, and SZ21 in the B.a genotype, which resulted to early termination at position 511 aa. G base was inserted at 438 bp of LIP94-11 strain, which led to early termination at position 172 aa. Conclusion In P66 of 59 Chinese strains, polymorphisms were widely distributed. More importantly, the P66 amino acid sequences of B.g strains had a certain regional character. One of the characteristics of Xinjiang B.g isolates might be the variation at the 508aa location in 15 Xinjiang B.g strains, which may be related to the strains' pathogenicity in this area.