蜱中人粒细胞埃立克体DNA的PCR检测及序列分析

目的了解吉林地区蜱种感染人粒细胞埃立克体的情况。方法采用16S rRNA基因特异引物进行半套式PCR,检测吉林省部分林区蜱中人粒细胞埃立克体DNA,并对扩增产物进行克隆和测序,与已知序列进行同源性比较。结果从采集于吉林地区的全沟硬蜱中检出人粒细胞埃立克体的特异性DNA片段,阳性率为1.98%。扩增产物经克隆、测序发现吉林地区人粒细胞埃立克体扩增片段与美国人粒细胞埃立克体分离株(GenBank注册号为U02521)16SrRNA基因序列相对应片段相差2个核苷酸,同源性为99.7%。结论吉林地区的全沟硬蜱携带人粒细胞埃立克体,提示吉林地区可能存在人粒细胞埃立克体病的自然疫源地。     

福建西北林区人单核细胞埃立克体病分子流行病学调查研究

目的 了解福建西北林区人单核细胞埃立克全病的存在情况。方法 评价以查菲埃立克体16S rRNA基因序列高变区构建引物进行的半套式PCR的敏感性和特异性，并用此种半套式PCR技术检测从福建武夷山市和宁化县采集的蜱类、野生动物内脏和血液及人群血液标本中的查菲埃立克体DNA，对有代表性的阳性标本的扩增产物进行克隆和序列测定，并与GenBank中注册的核苷酸序列进行同源性比较。应用以16S rRNA基因构建的特异和通用引物进行PCR，从越原血蜱及黄毛鼠标本中分段扩增查菲埃立克体DNA，进行克隆和序列测定，分别将其连成完整序列，与已知所有埃立克体及近缘菌的16SrRNA基因序列进行最大同源性比较，用Clustal X(1.8)软件对同源位碱基作聚类分析，应用“Tree View”程序得出遗传发育树图。结果 这种半套式PCR检测方法具有很高的特异性，仅能扩增查菲埃立克体DNA，而对其它蜱媒病病原体，如斑点热立克次体、菜姆病螺旋体的DNA及人粒细胞埃立克体病病原体的16S rRNA基因都不能扩增，同时，用有限稀释法以含EC 16S rRNA基因的质粒为模板评价其敏感度，结果显示：最低能检测到4个拷贝的查菲埃立克体DNA。用此半套式PCR法从该地区的越原血蜱、粒形硬蜱，鼠类（褐家鼠、黄毛鼠、黄胸鼠、神鼠、小家鼠）和野兔的脾脏和/或血块中均扩增出了查菲埃立克体的特异DNA片段。检测越原血蜱成蜱283组（659只），25组阳性，最小阳性率为3.8%。粒形硬蜱4只，1只阳性。野鼠脾脏、血块及野兔血块的阳性率分别为56.4%（22/39）、38.7%(12/31)和18.2%(2/11）。同时检测的其它蜱种、狐狸血块、野猪血块及人血块中均未发现查菲埃立克体DNA。越原血蜱和野鼠代表性标本的390bp的PCR产物经克隆、测序后，发现其DNA序列与美国查菲埃立克体分离株对应位置分别一致和相差一个核苷酸。从越原血蜱和黄毛鼠扩增来的全序列与美国查菲埃立克体分离株的16S rRNA基因序列分别相差6个和2个核苷酸，同源性分别为99.6%和99.9%；与犬埃立克体（E.cn-is）、 尤菌氏埃立克体（E.ewingii）、鼠埃立克体（E.muris）之间的同源性为97.6%～98.0%，属于近缘种；与其它埃立克体种的同源性在83.0%～92.4%之间。结论 上述研究结果提示福建西北部地区可能存在人单核细胞埃立克体病的自然疫源地。越原血蜱和粒形硬埤为其潜在传播媒介，鼠和野兔可能为其贮存宿主。实践证明，半套式PCR及序列分析技术可作为检测蜱和动物标本中查菲埃立克体的一种敏感、特异的方法，适用于现场流行病学调查。本研究首次测定我国南方蜱及啮齿动物中埃立克体的16S rRNA全基因序列，为进一步开展疫源地调查奠定了基础。     

从西藏微小牛蜱检出类查菲埃立克体和边缘无形体16S rDNA

目的　鉴定微小牛蜱 (Boophilusmicroplus)所携带的埃立克体病原体。方法　依据蜱传埃立克体 16SrDNA序列设计引物 ,建立埃立克体属特异性套式PCR检测微小牛蜱DNA样本 (每份DNA由 2个蜱提取 ) ;克隆DNA样本中的埃立克体 16SrDNA的 5′末端片段并测定其序列。结果　西藏某地的 4 3份蜱DNA样本中有 16份 (37% )经套式PCR扩得阳性片段 ,而四川某地的 2 7份蜱DNA样本扩增结果均为阴性。测定 16SrDNA的 5′末端片段 (～ 4 5 0bp)的序列 ,发现两种序列 ,一种与边缘无形体 16SrDNA完全一致 ,另一种与查菲埃立克体 16SrDNA最相关 ,但它们之间有 7个碱基 (～ 1 6 % )的不同。结论　西藏某地的微小牛蜱中携带有类查菲埃立克体和边缘无形体 ,该类查菲埃立克体可能是一个埃立克体新种     

云南临沧地区蜱种分子生物学鉴定及埃立克体基因序列分析

目的 了解云南临沧地区蜱虫种类及其自然感染埃立克体的情况。方法 采集耕牛体表寄生的蜱虫,经形态学鉴定和分组后,从蜱虫中提取DNA,应用PCR扩增蜱虫COI基因以及埃立克体16S rRNA和groEL基因,并测序分析。结果 共采集到蜱虫42只,其中微小牛蜱38只占90.48%、血蜱4只占9.52%。将每种蜱的2只为1组,在21组样本中,检出COI片断21份(检出率100%);在相同的4组样本中均检出埃立克体16S rRNA片断和groEL片断4份(检出率19.05%)。基因序列分析,检出的COI片断序列中有2份与澳大利亚pava血蜱(JX573136)的同源性最高(89.3%),其余19份序列与马来西亚微小牛蜱B3的同源性最高(99.5%);检出的4份16S rRNA片断序列完全一致,与美国查菲埃立克体Arkansas和埃文埃立克体Aa2FT349及中国北京查菲埃立克体BY-YQ-HME-O18株的同源性均为100%;检出的4份groEL片断序列也完全一致,与日本埃立克体Yonaguni206 株的同源性最高均为93.9%。结论 经分子检测证实云南临沧地区耕牛体表微小牛蜱中存在一种类似日本Yonaguni206株的埃立克体感染,耕牛体表还可能寄生一种新的血蜱。     

内蒙古大兴安岭林区人埃立克体病自然疫源地的调查

目的人粒细胞埃立克体病和人单核细胞埃立克体病都是近10年来发现的2种经蜱传播的自然疫源性疾病。这2种病的公共卫生学意义已受到了许多国家的关注。由于病原体是专性细胞内寄生菌,直接培养和纯化较为困难。我们根据这2种埃立克体的16S rRNA基因序列,构建了一系列PCR引物对,对采自我国大兴安岭等北方地区的蜱、动物脏器和人血标本进行PCR扩增,并对扩增出的产物进行DNA序列分析,以期查清有可疑蜱媒地区是否存在埃立克体感染,并通过这次调查为今后进一步开展系统研究提供参考。方法与结果本研究采用半巢式PCR检测蜱标本2种埃立克体的带菌率。结果首次从内蒙古大兴安岭采集的全沟硬蜱和森林革蜱,新疆精河采集的全沟硬蜱和草原革蜱中扩增出390bp的特异和人单核细胞埃立克体16S rRNA基因片段;同时检测的大兴安岭的嗜群血蜱和北京灵山采集的长角血蜱均未扩增出相应的片段。大兴安岭莫尔道嘎林业局采集的全沟硬蜱携带此基因的阳性率为39.06％(25/64),森林革蜱为 10.00％(7/70),2种蜱的带菌率有显著差异(x~2=15.53,P<0.01)。新疆精河采集的蜱携带EC率也是全沟硬蜱(11组/190,最小阳性率为5.79％)高于森林革蜱(1组/60,最小阳性率为1.67％),但差别不显著(x~2=1.30,P>0.25)。还从大兴安岭林区捕捉的一只大林姬鼠的脏器中检测到这一16S rRNA基因片段。对一只从莫尔道嘎采集的全沟硬蜱蜱标本进行近1500bp的人单核细胞埃立克体 16S rRNA全基因扩增与序列分析,结果扩增出的序列与美国一株人单核细胞埃立克体(GenBank注册号U23503)的相应序列完全相同。同样应用半巢式PCR和序列分析技术,从蜱标本中扩增出441bp的特异的人粒细胞埃立克体16SrRNA基因片段。内蒙古大兴安岭莫尔道嘎采集的全沟硬蜱和森林革蜱人粒细胞埃立克体的阳性率分别是 6.25%(4/64)和 2.86%(2/70);内蒙古大兴安岭乌尔旗汗采集的全沟硬蜱和嗜群血蜱的阳性率分别为3.81％(最小阳性率,8组/210)和2%(1/50);新疆精河采集的全沟硬蜱和草原革蜱最小阳性率分别为3.16％(6组/190)和1.67%(1组/60)。这是首次在亚洲从蜱标本中检测到人粒细胞埃立克体。同时检测的北京灵山采集的长角血蜱未扩增出相应的片段。对一只从莫尔道嘎采集的全沟硬蜱标本进行近1500bp的人粒细胞埃立克体 16S rRNA全基因分析,结果扩增出的序列与美国一株人粒细胞埃立克体(GenBank注册号U02125)的相应序列完全相同,一个碱基不差。另外还从内蒙古大兴安岭采集的森林工人血标本中扩增出特异的EC和人粒细胞埃立克体16SrRNA基因片段。这是首次在亚洲从人血中扩增出人埃立克体DNA。对一份人血标本进行近1500bp的人粒细胞埃立克体 16S rRNA全基因分析,结果仅在第81位与美国这株人粒细胞埃立克体差一个碱基,相差的位置正好位于高变区。结论根据检测结果,本研究建立的系列半巢式PCR扩增方法可以快速、灵敏地检测蜱、脏器、血等标本中的EC和人粒细胞埃立克体,并能较快地分析出其16S rRNA全基因。据报道,莱姆病的流行区往往也是人埃立克体病的流行区。为此我们在大兴安岭林区进行了人埃立克体病和莱姆病的流行病学调查。血样检测发现了人粒细胞埃立克体和 EC 16S rRNA基因阳性的病例共6名,病例均有近期蜱咬史,有埃立克体病的临床表现,潜伏期也相符;血清抗体检测发现检测人群中有HGE阳性抗体。2种病例的发现均为亚洲之首次。通过莱姆病螺旋体感染流行因素的单因素和多因素Logistic回归分析,发现在调查的流行因素中,职业和蜱咬史是影响该疫区人群感染莱姆病螺旋体的主要危险因素。这一调查结果也为该地区人埃立克体病和其他蜱传病的防治提供了参考。     

我国南方蜱样本中发现犬埃立克体DNA

目的 调查我国南方蜱样本埃立克体感染情况。方法 用已发表的埃立克体１６ＳｒＲＮＡ基因的属特异引物和自行设计的犬埃立克全种特异引物，对广东，广西和海南部分地区采集的蜱样本进行ＰＣＲ检测，并将阳性ＰＣＲ产物克隆测序，结果通过Ｉｎｔｅｒｎｔ提交到美国国立医学图书馆／国家健康研究所的站点，利用ＢＬＡＳＴ对核酸数据库进行同源性检索。结果 从广东采集的血红扇头蜱和广西要的微小牛蜱样本中扩增出埃立克体４２５ｂｐ     

用半套式PCR检测蜱和啮齿动物中查菲埃立克体

目的　了解福建西北部林区查菲埃立克体 (Ehrlichiachaffeensis)的存在情况。方法　用 16SrRNA基因特异引物进行半套式PCR ,检测从福建武夷山和宁化采集的蜱类及野生动物中的查菲埃立克体DNA ,然后对有代表性的标本的扩增产物进行克隆和序列测定 ,并与GenBank中注册的核苷酸序列进行同源性比较。结果　从该地区的越原血蜱 ,野鼠(褐家鼠、黄毛鼠、黄胸鼠、社鼠、小家鼠 )和野兔的脾脏和 /或血块中均扩增出了查菲埃立克体的特异片段。越原血蜱成蜱 2 40组 (6 16只 ) ,31组阳性 ,最小阳性率 5 0 %。野鼠脾脏标本 39份 ,2 2份阳性。野鼠和野兔血块标本共 35份 ,14份阳性。 390bp的PCR产物经克隆、测序后分析发现其DNA序列与美国查菲埃立克体分离株对应位置一致。结论　福建西北部林区可能存在人单核细胞埃立克体病的自然疫源地。     

山东省沂源县无形体病实验室调查分析

目的通过山东省沂源县人粒细胞无形体及其他立克次体病疫源地小样本试点调查,为全面深入开展立克次体病调查提供数据支持.方法对2004、2005、2006年该地区调查收集的26例可疑患者标本进行血清IgG抗体及PCR回顾性检测分析.2007年7月进一步现场流行病学调查,采集当地48名正常人、10只山羊及8只家狗的血标本以及170只蜱标本进行血清学及分子生物学检测分析.结果 26例发热患者中,8例明确诊断为人粒细胞无形体感染,6例为可疑病例.当地正常人群人粒细胞无形体IgG抗体阳性率为26.7%,人单核细胞埃立克体IgG抗体阳性率为1.8%.检测的10份家养黑山羊血清标本9份阳性.8份家狗标本中,人粒细胞无形体抗体7份阳性,而人单核细胞埃立克体血清抗体全部阳性.来自发热患者、山羊及媒介蜱标本PCR扩增16S rRNA及部分序列分析结果显示高度同源性(100%).结论沂源县农业人群普遍存在人粒细胞无形体、人单核细胞埃立克体及其他立克次体隐性感染状况.当地主要优势蜱种为长角血蜱及嗜群血蜱,两者可能是人粒细胞无形体的重要传播媒介.黑山羊可能是人粒细胞无形体的重要动物宿主,而家狗可能是人粒细胞无形体及人单核细胞埃立克体两者兼顾的重要动物宿主.     

湖北省随州市羊携带嗜吞噬细胞无形体的调查

目的调查湖北省随州市羊携带嗜吞噬细胞无形体的状况。方法运用聚合酶链反应方法对湖北随州市采集的羊血标本进行嗜吞噬细胞无形体16SrRNA基因片段进行扩增和序列分析,将扩增序列与GenBank相应基因序列进行同源性比较和进化分析。结果共检测羊血标本29份,阳性标本25份,嗜吞噬细胞无形体阳性感染率为86．2％;所检出的嗜吞噬细胞无形体16SrRNA基因（1442bp）与GenBank中收录的部分嗜吞噬细胞无形体16srRNA基因序列的同源性高达97．1％～99．8％,进化分析显示与嗜吞噬细胞无形体同在一个分支上。结论湖北随州地区山羊存在嗜吞噬细胞无形体的感染。     

立克次氏体传染病

三种蜱媒传染病在媒介蜱和鼠类中复合感染的研究——赵秋敏等(北京军事医学科学院微生物流行病研究所100071)《中华流行病学杂志》2005，26(1)：9．13[了解中国部分地区埃立克体病和其他蜱媒传染病病原体的复合感染情况。方法：运用聚合酶链反应方法对内蒙古自治区、黑龙江省、北京市的蜱和鼠类标本粒细胞埃立克体、莱姆病螺旋体、斑点热群立克次体的感染进行检测，对福建省的蜱和鼠脾脏标本中查菲埃立克体、斑点热立克次体及莱姆病螺旋体的感染情况进行检测。结果：内蒙古采集的全沟硬蜱408只。     

Tick-borne bacteria in free-living jaguars (Panthera onca) in Pantanal, Brazil

Tick-borne bacteria were investigated in 10 free-living jaguars and their ticks in the Pantanal biome, Brazil. Jaguar sera were tested by indirect fluorescent antibody assays using Rickettsia rickettsii, Rickettsia parkeri, Rickettsia amblyommii, Rickettsia rhipicephali, Rickettsia felis, Rickettsia bellii, Ehrlichia canis, and Coxiella burnetii as crude antigens. All 10 jaguar sera reacted (titer ≥ 64) to at least one Rickettsia species; 4 and 3 sera reacted with E. canis and C. burnetii, respectively. One jaguar presented antibody titer to R. parkeri at least fourfold higher than those to any of the other five Rickettsia antigens, suggesting that this animal was infected by R. parkeri. Ticks collected from jaguars included the species Amblyomma cajennense, Amblyomma triste, and Rhipicephalus (Boophilus) microplus. No Rickettsia DNA was detected in jaguar blood samples, but an A. triste specimen collected on a jaguar was shown by PCR to be infected by R. parkeri. The blood of two jaguars and samples of A. triste, A. cajennense, and Amblyomma sp. yielded Ehrlichia DNA by PCR targeting the ehrlichial genes 16S rRNA and dsb. Partial DNA sequences obtained from PCR products resulted in a new ehrlichial strain, here designated as Ehrlichia sp. strain Jaguar. A partial DNA sequence of the 16S rRNA gene of this novel strain showed to be closest (99.0%) to uncultured strains of Ehrlichia sp. from Japan and Russia and 98.7% identical to different strains of Ehrlichia ruminantium. The ehrlichial dsb partial sequence of strain jaguar showed to be at most 80.7% identical to any Ehrlichia species or genotype available in GenBank. Through phylogenetic analysis, Ehrlichia sp. strain jaguar grouped in a cluster, albeit distantly, with different genotypes of E. ruminantium. Results highlight risks for human and animal health, considering that cattle ranching and ecotourism are major economic activities in the Pantanal region of Brazil.     

滇西横断山区家畜体表蜱类调查及鉴定

目的 调查滇西横断山区家畜体表蜱的种类。方法 采集家畜体表寄生的蜱虫,经形态学鉴定后,用PCR法扩增蜱虫样本的16S rRNA、12S rRNA、COI、ITS2的基因片断,测序后进行序列分析。结果 共采集成虫蜱样本1 874只,经形态学鉴定为1科、1属(扇头蜱属Rhipicephalus)、4种,其中微小扇头蜱(R. microplus)1 637只(占87.35%)),镰形扇头蜱(R. haemaphysaloides)218只(11.63%),短小扇头蜱(R. pumilio)11只(0.59%),血红扇头蜱(R. sanguineus)8只(0.43%)。样品分子鉴定结果与形态学鉴定结果一致。系统发育树分析显示,微小扇头蜱Y2 16S rRNA、12S rRNA、COI、ITS2的基因序列分别与来自印度(EU918188)、贵州(KC503259)、马来西亚(KM246873)、贵州(KC503274)的微小扇头蜱在同一分支上,而与以往云南发现的微小扇头蜱不在同一分支;镰形扇头蜱Y5的 16S rRNA、12S rRNA和COI基因序列分别与来自泰国(KC170743)、台湾(DQ003005)和湖南(KM083593)的镰形扇头蜱在同一分支上;短小扇头蜱Y6和Y01 的ITS2基因序列与来自澳大利亚的短小扇头蜱(AF271282)在同一分支上。结论 滇西横断山区家畜体表蜱以微小扇头蜱为优势种,短小扇头蜱为云南境内首次发现。     

云南省泸西县啮齿动物携带立克次体调查

目的 调查云南省泸西县啮齿动物携带恙虫病东方体、无形体和埃立克体的状况,了解该类病原体在当地自然界中的保存状况和基因特征。方法 用鼠笼和鼠夹在云南省泸西县捕鼠,将捕获的动物种类鉴定后解剖取脾脏,活鼠取血。采用巢式PCR扩增脾脏的恙虫病东方体groEL基因,无形体和埃立克体的16S rRNA基因特异片段;测定PCR扩增阳性产物的DNA序列,对获得序列进行序列比对和系统进化分析。IFA法检测鼠血清中恙虫病东方体IgG抗体。结果 在泸西县共捕获啮齿动物10种225只。其中黄胸鼠36.89%(83/225)、大绒鼠35.11%(79/225)和中华姬鼠13.78%(31/225)为优势鼠种。获得鼠血清85份。鼠脾脏中检测到5株东方体groEL基因阳性标本,带毒鼠种为黄胸鼠2.41%(2/83)和大绒鼠3.80%(3/79)。同源性比较显示,这5株东方体的相似性在99.02%~100%之间,他们分别与GenBank中已知立克次体序列的相似性在98.75%~100%。系统发生树显示,5株OT与来自日本、泰国和中国安徽的菌株位于同一分支。3份16S rRNA阳性标本,其中1份埃立克体阳性,来源于大绒鼠;1份沃尔巴克氏体和1份巴尔通体阳性均来源于黄胸鼠。无形体均为阴性。埃立克体株序列比对显示与来自美国、中国和巴西的埃立克体基因同源性为98.0%~100%,并与分离自美国野外工作者皮肤的伊文氏埃立克体在同一分支。鼠血清恙虫病IgG抗体阳性7份,阳性率8.24%(7/85)。结论 该地区存在以黄胸鼠和大绒鼠为主要宿主的恙虫病自然疫源地。埃立克体、巴尔通体和沃尔巴克氏体在啮齿动物中也存在感染,需注意防控。     

A hard tick relapsing fever group spirochete in a Brazilian Rhipicephalus (Boophilus) microplus

Tick-borne diseases usually comprise a complex epidemiological and ecological network connecting the vector, pathogen, and a group of host species. Symptoms associated with Lyme disease have been reported in Brazil, but no Borrelia sp. has been definitively related to these events. Here we have identified a B. lonestari/B. theileri-related spirochete DNA in the cattle tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus from Brazil. Four hundred R. microplus and 80 Amblyomma cajennense ticks were screened, and only 1 horse-fed R. microplus was infected. A Borrelia sp. 16S rDNA sequence was amplified by polymerase chain reaction (PCR) from the total tick DNA with 99% similarity to B. theileri and B. lonestari. Partial flaB sequence was also obtained, demonstrating 96% similarity to the B. lonestari flagellin gene, and the resultant putative amino acid sequence demonstrated 97% identity to B. lonestari flagellin. Moreover, partial glpQ sequence demonstrated 92% similarity to the B. lonestari gene, with a putative amino acid sequence 90% identical to the B. lonestari glycerophosphodiester phosphodiesterase. Phylogenetic analyses clearly include this Brazilian Borrelia sp., denoted "Borrelia," sp-BR in a group of spirochetes aligned with B. theileri and B. lonestari. Thus, hard tick relapsing fever group spirochetes represent a clade of widespread bacteria and herein we describe the first molecular identification of a Borrelia sp. in South America.     

山东省首例实验室诊断人单核细胞埃立克体病调查

目的 报告山东省首例人单核细胞埃立克体病的发现、诊治经过及其实验室检测.方法 对该疑似病例开展流行病学调查并填写个案调查表,采集其血标本,套式-PCR技术检测血液中嗜吞噬细胞无形体和查菲埃立克体特异性16S rRNA基因.结果 患者为不明原因发热,伴WBC和PLT减少.嗜吞噬细胞无形体特异性核酸检测阴性,查菲埃立克体特异性核酸检测阳性.PCR扩增阳性产物进行测序并与GenBank中注册的已知序列进行比较分析,显示与查菲埃立克体的同源性＞99％.结论 山东省存在查菲埃立克体感染病例,进一步开展自然疫源地调查十分必要.     

Identification of Ehrlichia chaffeensis,Anaplasma phagocytophilum,and A. bovis in Haemaphysalis longicornis and Ixodes persulcatus ticks from Korea

A total of 1,467 tick (1,463 of Haemaphysalis longicornis, three of Ixodes persulcatus and one of I. turdus) collected from nine provinces of Korea were examined by TaqMan real-time PCR for the presence of Ehrlichia and Anaplasma species. One set of primers and a probe were designed for detection of all of the Ehrlichia and Anaplasma species. Template DNAs (total 803) were prepared either from pools of larvae, nymphs, adult males and females, or from the salivary gland and midgut of adult ticks. Only DNAs positive in TaqMan PCR were examined for A. phagocytophilum with nested PCR and for E. chaffeensis with PCR. Four A. phagocytophilum 16S rRNA gene PCR products were sequenced for comparison with sequences previously reported. Amplification of a 16S rRNA gene fragment of Ehrlichia and Anaplasma species was observed in 364 tick DNAs (45.3% of the total). Of these 364 positive ticks, species-specific PCRs confirmed that 35 H. longicornis and one I. persulcatus were positive for A. phagocytophilum and one I. persulcatus was positive in E. chaffeensis. Except for one (AB-GGHL, GenBank accession number [GAN] AF470698), three of the four 16S rRNA gene fragment sequences of the A. phagocytophilum-positive samples were similar or identical to the sequences of variants of A. phagocytophilum deposited in GenBank. The 16S rRNA gene fragment sequence of AB-GGHL was similar to that of Anaplasma (Ehrlichia) bovis 16S rRNA (GAN U03775). The identities of the Anaplasmataceae genus and species DNA in the 327 ticks that could not be confirmed infected with either E. chaffeensis, A. phagocytophilum, or A. bovis are not known. This study is the first to demonstrate the presence of E. chaffeensis, A. phagocytophilum and A. bovis in Korean ticks.     

4种病原菌特异基因片段阳性蜱的16S rRNA基因克隆文库分析

目的 建立16S rRNA基因克隆文库分析蜱媒菌群的方法,观察该方法对蜱寄生病原菌的检测效率以及对细菌群落多样性分析和对病原菌的筛检能力.方法 用伯氏疏螺旋体、汉赛巴通体、嗜吞噬细胞无形体和查菲埃立克体4种病原菌特异基因设计引物,扩增蜱标本提取的核酸,以上述4种病原菌特异基因片段扩增均阳性的蜱核酸提取物做模板,用16S rRNA基因的通用引物进行PCR扩增、纯化、连接、克隆和测序,建立16S rRNA基因克隆文库,将测序结果与数据库进行比对,计算克隆文库Coverage值和Shannon-Wiener多样性指数.结果 测出103个有效序列,检出16种已知种属的细菌,其中8个是优势类型(克隆子数>5个);检测到伯氏疏螺旋体、汉赛巴通体和立克次体3种病原菌,但这3种病原菌均不是优势类型(克隆子数均<5个).Coverage值为96.11%,Shannon-Wiener多样性指数为2.40.克隆序列分析结果表明,蜱寄生细菌主要为α、γ变形菌纲,占56.25%(9/16).结论 16S rRNA基因序列分析可以对蜱标本进行菌群相对定量研究,可以同时检出多种病原菌,是一种较好的细菌菌群多样性分析和病原菌筛检方法.     

Detection of ehrlichial DNA in small rodents captured in a woodland area of Hokkaido, the northernmost island of Japan, where Lyme disease is endemic

The ehrlichial gene was detected in small rodents trapped in a Lyme disease-endemic area in Hokkaido, the northernmost island of Japan. Primer pairs of 16S rDNA targeting the genus Ehrlichia and other regions of the 16S rDNA specific for E. chaffeensis and E. muris were used for identification. The DNA fragment specific for 16S rDNA of Ehrlichia spp. was detected in 4 of 94 Apodemus speciosus mice (positive rate: 4.3%) and 5 of 73 Clethrionomys rufocanus bedfordiae mice (positive rate: 6.8%). The nucleotide sequence of the amplified 16S rDNA fragment was most similar to those of E. muris-like Ehrlichia, Ehrlichia spp. HF565 and Shizuoka-36, originating in the northern and central parts of Japan. In phylogenetic analysis based on 16S rDNA sequences, the northern, central and western groups of E. muris-like Ehrlichia from a cluster with microorganisms of the E. muris group. These results suggest that there are a group of E. muris microorganisms and a group of E. muris- like microorganisms in Japan.