结直肠腺癌中TKT的表达及临床意义

目的 探讨结直肠腺癌中转酮醇酶(transketolase,TKT)的表达及与临床病理特征的关系.方法 通过Oncomine和GEO数据库分析TKT基因在结直肠腺癌和癌旁组织中的表达.收集配对结直肠腺癌及癌旁正常肠黏膜组织,分别采用qRT-PCR、Western blot法检测TKT mRNA和蛋白表达,运用免疫组化法...     

结直肠癌中S100A4的表达及意义

目的探讨S100A4在结直肠癌组织及细胞系中的表达,并分析其与结直肠癌临床病理特征的相关性。方法采用免疫组化法检测65例结直肠癌及对应癌旁正常结直肠组织中S100A4蛋白的表达;分别采用RT-PCR法和Western blot法检测S100A4 mRNA和蛋白在7个人类结直肠癌细胞系中的表达。结果 RT-PCR及Western blot检测结果显示S100A4在多数结直肠癌细胞中均有表达。免疫组化检测结果显示S100A4阳性表达主要定位于结直肠癌细胞质内,结直肠癌组织中S100A4蛋白阳性率高于癌旁正常结直肠组织(P0.000 1)。S100A4蛋白表达与结直肠癌患者年龄、性别有关,高龄组阳性率高于低龄组(P=0.026),男性组S100A4蛋白阳性率高于女性组(P=0.038),其表达与肿瘤部位、分化程度、淋巴结转移均无相关性(P0.05)。结论 S100A4在多数结直肠癌细胞中均有表达,在癌组织中的表达高于癌旁组织,S100A4蛋白表达与结直肠癌患者年龄、性别有关,可能为结直肠癌患者的个性化诊断及治疗提供指导。     

Epsin3在结直肠癌中的差异表达及生物信息学分析

目的 探讨介导内吞作用的衔接蛋白epsin 3（EPN3）在结直肠癌中的表达及意义,为深入研究EPN3的调控模式提供实验依据。 方法 分别运用GEPIA和GEDS数据库分析EPN3在结直肠癌组织和细胞中的表达情况,并通过SMART和cBioPortal数据库分析EPN3基因甲基化和拷贝数变异与其表达水平的关系;利用Metascape数据库对EPN3相关的共表达基因集进行GO富集和通路分析;运用BioPlex蛋白互作数据库分析EPN3在HCT116细胞中的蛋白作用网络。为了对EPN3进一步验证,我们收集13对结直肠癌癌旁组织和癌组织标本,用Real-time PCR检测EPN3 mRNA表达;并通过敲减EPN3观察其对肿瘤细胞增殖、集落形成和迁移能力的影响。 结果 GEPIA、GEDS、SMART和cBioPortal等数据库分析显示,EPN3在结直肠肿瘤组织中高表达(P<0.01)。其表达水平与甲基化和拷贝数变异相关。EPN3相关基因的富集结果显示主要与细胞黏附相关。EPN3与UBB、CCDC130、TNFAIP1、PHGDH、EPN2等构成的蛋白相对作用网络与蛋白泛素化有关。Real-time PCR结果显示,EPN3在癌组织中高表达(P<0.05)。通过沉默EPN3可以抑制HCT116和HT29细胞的增殖、集落形成和迁移能力。 结论 EPN3在结直肠癌组织中高表达,且与细胞黏附和蛋白泛素化等生物学过程有关,敲低EPN3可抑制结直肠癌细胞系HCT116和HT29的增殖、集落形成和迁移等过程。     

Gab2在结直肠癌组织中的表达及其意义

目的:探讨Gab2在结直肠癌组织中的表达及其意义。方法:应用免疫组化方法检测78例结直肠癌及46例癌旁正常组织中Gab2的表达水平,并结合临床病理学资料进行统计学分析,Western blot方法检测10对结直肠癌组织及相对应的癌旁正常组织中Gab2的表达状况。结果:免疫组化检测结果显示78例结直肠癌组织中Gab2蛋白表达阳性率为53.85%,而癌旁正常组织中Gab2蛋白多不表达或弱表达,两组结果比较差异有显著性(P0.001);Gab2蛋白在结直肠癌中的表达与肿瘤TNM分期及有无淋巴结转移呈正相关(P0.05),与肿瘤大小、分化程度无明显相关性(P0.05);Western blot检测结果显示结直肠癌组织中Gab2蛋白表达显著高于相对应的癌旁正常组织(P0.05)。结论:Gab2在结直肠癌组织中过表达,可能在结直肠癌的发生发展中起重要作用。     

BS69 在结直肠癌组织中的表达以及病理相关性研究

目的:探讨BS69在结直肠癌组织及细胞系中蛋白和mRNA的表达水平,分析BS69与患者病理特征的相关性。方法:选择2016年8月至2017年10月间手术切除的60例结直肠癌组织和25例癌旁正常组织,采用免疫组化和RTq PCR法检测组织中BS69蛋白和mRNA的表达情况。采用蛋白印迹(Western blot)法检测BS69在三种结直肠癌细胞系和正常结直肠上皮细胞中的蛋白表达。结果:BS69免疫组化染色主要定位于细胞核,少量位于细胞浆。其在结直肠癌和正常结直肠组织中的阳性率分别为65%和87%,差异具有统计学意义(P0. 05); BS69在结直肠癌组织中的表达水平与Dukes分期、肿瘤组织分级、淋巴结转移及远处转移有相关性(P0. 05); Western blot检测BS69在3种结直肠癌细胞系与正常结直肠上皮细胞中蛋白表达,各细胞系中结果有明显差异;结直肠癌组织中BS69 mRNA的表达明显低于正常组织,差异有统计学意义(P0. 05)。结论:BS69是重要的转录抑制因子,可能参与了结直肠癌的发生、发展过程,有望成为特异性较高的肿瘤标志物。     

干扰IGF2BP2下调MYC表达抑制结直肠癌细胞增殖、迁移并促进肿瘤免疫

目的 探究胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)对结直肠癌细胞增殖、迁移能力和肿瘤免疫微环境的影响及其可能的分子机制。方法 使用癌症基因图谱(TCGA)数据库分析结直肠癌及癌旁组织的IGF2BP2和MYC表达水平。采用RNA干扰技术(RNAi)沉默HCT-116和SW480人结直肠癌细胞的IGF2BP2表达，实时定量PCR检测沉默效果。敲低IGF2BP2后，集落形成实验、 CCK-8实验、 5-乙炔基-2′-脱氧尿苷(EdU)实验检测细胞集落形成和增殖能力，Transwell^TM实验检测细胞迁移能力，实时定量PCR检测IGF2BP2、 MYC、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、转化生长因子β(TGF-β)、白细胞介素10(IL-10)的mRNA表达。Western blot法测定IGF2BP2、 MYC的蛋白表达，RNA免疫共沉淀后实时定量PCR(RIP-qPCR)检测HCT-116细胞中IGF2BP2与MYC mRNA结合能力。结果 TCGA数据库结果表明，IGF2BP2和MYC在结直肠癌组织中的表达显著高于癌旁组织，且IGF2BP2高表达的结直肠...     

CHPF高表达在结直肠癌预后评估中的意义

目的探讨软骨素聚合因子(chondroitin polymerizing factor, CHPF)在结直肠癌预后评估中的意义。方法采用免疫组化SP法检测206例结直肠癌原发灶及癌旁组织中CHPF蛋白的表达,应用Western blot法检测结直肠原发灶癌组织及其癌旁组织中CHPF蛋白的表达。结果 CHPF蛋白在原发灶癌组织(122/206,59.2%)中的表达显著高于癌旁组织;Western blot实验显示在新鲜结直肠癌组织中检测到CHPF蛋白(5/5,100%)。CHPF蛋白高表达与结直肠癌神经或脉管侵犯(P=0.011)、TNM分期(P0.01)、癌结节(P=0.035)明显相关;与患者性别、年龄、肿瘤分化程度和KRAS状态无关(P0.05)。Kaplan-Meier生存分析结果表明,CHPF蛋白高表达与结肠癌患者不良预后显著相关(P0.001)。Cox多因素风险回归模型分析显示,CHPF蛋白可以作为结直肠癌患者不良预后的独立预测因子。结论 CHPF蛋白高表达是结直肠癌患者不良预后的预测因子之一。     

结肠癌组织中SRSF1蛋白的表达及其临床意义

目的 探讨SRSF1在结肠癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系。方法 应用癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库分析SRSF1 mRNA在结肠癌、正常结肠组织中的表达。采用免疫组化法检测SRSF1蛋白在94例结肠癌和86例癌旁正常组织中的表达,分析其表达与结肠癌临床病理特征的关系。应用Kaplan-Meier生存法分析SRSF1蛋白表达与结肠癌患者生存时间的相关性;采用Cox回归模型分析SRSF1在结肠癌风险预测中的评估价值。结果 TCGA和GEO数据库结果显示SRSF1 mRNA在结肠癌中高表达(P<0.05)。免疫组化检测显示SRSF1蛋白在结肠癌组织中的阳性率和高表达率分别为92.6%(87/94)和67.0%(63/94),显著高于癌旁正常组织(57.0%、11.6%)。χ²检验结果显示SRSF1表达水平与结肠癌患者临床分期相关(P=0.028)。Kaplan-Meier生存分析表明：SRSF1蛋白高表达结肠癌患者的总生存期低于SRSF1蛋白低表达患者(P=0.040)。Cox单因素回归分析表明：淋巴结转移(HR:3.638,95%CI=1.9...     

长链非编码RNA EVADR促进人结直肠癌细胞系增殖及迁移

目的探讨lncRNA EVADR对人结直肠癌HCT116和LOVO细胞系的增殖和迁移的影响以及其作用机制。方法利用慢病毒感染方式分别构建稳定过表达lncRNA EVADR的HCT116和LOVO细胞系;用CCK-8检测细胞的增殖;Transwell小室法检测细胞迁移能力,Western blot检测E-cadherin的表达,实时荧光定量PCR检测Snail、Slug、ZEB1和ZEB2 mRNA的表达。结果成功构建了稳定过表达lncRNA EVADR的结直肠癌HCT116和LOVO细胞系。与HCT116-NC和LOVO-NC细胞组对比,HCT116-EVADR与LOVO-EVADR细胞组的增殖和迁移能力明显提高(P<0.05)。同时,上皮标志物E-cadherin表达明显降低,而Snail、Slug、ZEB1和ZEB2间质化标志物的表达升高。结论过表达lncRNA EVADR具有促进结直肠癌HCT116和LOVO细胞的增殖与迁移能力,可能通过调节结直肠癌细胞上皮间质转化(EMT)发挥作用。     

结直肠癌中lipocalin 2的表达及临床病理特征分析

目的探讨脂质运载蛋白2(lipocalin 2, Lcn2)在结直肠癌中的表达及其与临床病理特征的关系。方法收集40例配对结直肠癌及癌旁组织样本,分别采用qRT-PCR法、Western blot法检测Lcn2的mRNA和蛋白水平,运用免疫组化检测Lcn2蛋白并分析其与临床病理特征的关系。结果与癌旁组织相比,结直肠癌组织中:qRT-PCR结果显示Lcn2的mRNA水平升高(P=0.006 5);Western blot结果显示Lcn2的蛋白水平升高(P0.05);免疫组化结果显示,癌细胞胞质和胞膜中Lcn2呈强阳性,癌旁组织Lcn2呈阴性,且Lcn2强阳性与肿瘤直径(P=0.014)、分化程度(P=0.017)、T分期(P=0.042)及淋巴结转移(P=0.025)密切相关。结论 Lcn2在结直肠癌中呈强阳性,且与肿瘤直径、分化程度、T分期及淋巴结转移密切相关,提示其可能参与结直肠癌的进展和转移。     

干细胞转录因子OCT4在结直肠癌组织中的表达及其意义

目的探讨干细胞转录因子OCT4在结直肠癌组织中的表达及临床意义。方法应用免疫组化EnVision两步法及Western blot法检测60例结直肠癌手术切除组织及癌旁正常组织中OCT4的表达,分析其与结直肠癌临床病理特征的关系,运用Kaplan-Meier法分析OCT4表达与结直肠癌患者总生存率的关系。结果结直肠癌组织中OCT4的阳性率为80.00%,高于癌旁正常组织(16.67%),差异有统计学意义(P0.05),OCT4阳性与结直肠癌的淋巴结转移及Dukes分期有关(P0.05),与其他临床病理特征尚无相关性(P0.05)。Western blot实验显示:结直肠癌组织中OCT4蛋白的相对表达量为7.70±0.07,高于癌旁正常组织(0.70±0.07),差异有统计学意义(P0.05);OCT4阳性与结直肠癌的淋巴结转移及Dukes分期有关(P0.05),与其他临床病理特征无相关性(P0.05)。生存分析显示:OCT4阳性患者的总生存期低于阴性患者。结论 OCT4在结直肠癌中过表达,可作为预测结直肠癌患者预后的潜在分子标志物。     

叉头框M1在结直肠癌中的表达及临床意义

目的探讨叉头框M1(FOXM1)在结直肠癌中的表达及与临床病理特征、预后的关系。方法采用免疫组化SP法检测297例结直肠癌组织和80例对应癌旁正常组织中FOXM1的表达;Western blot法检测20例新鲜结直肠癌组织及对应癌旁组织中FOXM1的表达。结果 FOXM1在结直肠癌组织中的阳性率(70.97%)显著高于癌旁组织(17.50%,P0.01);FOXM1表达与结直肠癌浸润深度、淋巴结转移、脉管内癌栓转移、远处转移和TNM分期有关(P0.05);与患者年龄、性别、肿瘤部位、大小、分化程度、CEA、CA199等无关(P0.05)。结直肠癌组织中FOXM1蛋白相对表达量(0.855±0.063)明显高于相应癌旁组织(0.150±0.041,P0.01)。FOXM1阳性患者的3年生存率明显低于阴性患者(P0.01),且FOXM1为结直肠癌预后的独立性危险因素。结论 FOXM1蛋白在结直肠癌组织中过表达,且与患者临床病理特征、预后等因素有关,可能在结直肠癌的发生、转移等过程中起重要作用,有望成为结直肠癌新的肿瘤标志物和潜在的治疗靶点。     

肿瘤抑制基因肝激酶B1在肺腺癌中的表达

目的:研究肝激酶B1(LKB1)在人肺腺癌组织中的表达。方法:收集肺腺癌组织标本(含癌旁组织、正常组织)共60例,采用实时荧光定量PCR法检测肺腺癌组织中LKB1的mRNA含量;Western blot法和免疫组化法检测肺癌组织中LKB1的表达情况。结果:实时荧光定量PCR检测显示LKB1的mRNA含量在正常对照组、癌旁组织和肺癌组织3组之间无显著差异;Western blot法检测和免疫组化结果显示肺腺癌组织中LKB1蛋白的表达量显著低于正常对照组和癌旁组织。结论:肺腺癌组织中LKB1的表达可能存在翻译后的调节。     

XKRX在结直肠癌的表达和临床意义

目的　探讨XKRX（XK related, X-linked）在结直肠癌组织中的表达和临床意义。 方法　收集TCGA公共数据库中结直肠癌芯片数据,对结直肠癌组织样本中XKRX基因表达数据以及对应的临床资料进行回顾性分析和生存分析。在临床上收取结直肠癌样本,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和蛋白免疫印迹（western blot）实验验证XKRX表达水平是否与芯片结果一致,为研究XKRX基因提供新的实验数据。 结果　芯片结果显示XKRX在结直肠癌组织的表达水平明显高于癌旁正常组织（P＜0.0001）。利用实时荧光定量PCR和蛋白免疫印迹实验检测21例结直肠癌临床样本中XKRX表达水平,结果显示结直肠癌组织中XKRX的信使RNA（mRNA）和蛋白质表达水平明显高于癌旁正常组织。XKRX表达与性别（P=0.9034）、年龄(P=0.886)、TMN分期(P=0.3979)、淋巴结转移(P=0.7995)和远处转移(P=0.6032)无明显统计学差异。但XKRX高表达组的生存时间明显低于低表达组（P=0.0075）。 结论　XKRX在结直肠癌组织中表达上调,可能发挥原癌基因的作用,影响结直肠癌的恶性进展,进而降低患者的生存时间,提示患者不良预后。     

SAFB通过调节Wnt信号通路活性促进结直肠癌增殖

目的 探讨SAFB在结直肠癌增殖过程中的作用及相关分子机制。方法 采用免疫组化、Western blot和RT-PCR检测结直肠癌石蜡组织和新鲜配对组织中SAFB的表达,分析SAFB表达与肿瘤分期的关系;采用MTT、平板克隆及裸鼠皮下成瘤等实验检测SAFB对结直肠癌细胞增殖能力的影响;利用公共数据库(GEO数据库等),通过基因富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)检测SAFB基因表达相关信号通路的富集情况;采用双荧光素酶报告基因实验、Western blot法及免疫荧光实验检测Wnt信号通路的活性。结果 Oncomine及TCGA在线数据库分析结果显示,结直肠癌组织中SAFB表达水平降低(P<0.01),且随着Dukes分期的增高,表达水平明显下降(P<0.05)。MTT、平板克隆及裸鼠皮下成瘤实验结果显示,SAFB高表达在体内外均能显著抑制肿瘤细胞的增殖。GSEA及双荧光素酶报告基因实验结果显示,SAFB低表达与Wnt通路激活密切相关。结论 SAFB在结直肠癌中低表达,并与Wnt信号通路激活密切相关,可能通过Wnt信号通路调节肿瘤...     

胃窦癌组织中MMP-26 mRNA及蛋白的表达

目的探讨胃窦癌及癌旁正常胃黏膜组织中MMP-26 mRNA及蛋白的表达意义。方法应用RT-PCR检测40对胃窦癌及癌旁正常胃黏膜组织中MMP-26基因的表达,Western blot方法检测其中10对标本的MMP-26蛋白表达,同时采用免疫组化MaxVision法检测102例胃窦癌组织和58例癌旁胃黏膜组织MMP-26蛋白的表达,分析MMP-26的表达与临床病理变量之间的关系。结果 MMP-26 mRNA在27例胃窦癌中的表达明显高于正常胃黏膜(67.5%)。Western blot结果显示7例胃癌组织中MMP-26蛋白表达明显高于对应的正常胃黏膜组织。免疫组化染色结果显示102例胃癌组织中有57例(55.9%)对MMP-26呈阳性反应,癌旁胃黏膜组织58例中有8例阳性(13.8%)。且MMP-26蛋白表达与胃癌浸润深度、淋巴结转移及TNM分期呈正相关。结论 MMP-26蛋白表达与胃癌浸润转移密切相关,可能作为胃癌早期诊断及预测预后的分子标记物。     

非小细胞肺癌组织中TRIM59、p53表达与临床病理特征及预后的相关性分析

目的 分析非小细胞肺癌(NSCLC)组织中三重基序蛋白(TRIM)59、p53表达与患者临床病理特征及预后的关系。方法 选取我院73例NSCLC患者的癌组织及癌旁组织,免疫组织化学法检测患者NSCLC组织及癌旁组织中TRIM59及p53蛋白的表达;qRT-PCR检测TRIM59及p53 mRNA表达。Pearson检验分析NSCLC组织中TRIM59 mRNA与p53 mRNA表达的相关性;采用TCGA数据库分析TRIM59及p53蛋白与NSCLC患者预后的关系;Kaplan-Meier法分析TRIM59、p53蛋白与NSCLC患者预后的关系;COX回归分析影响NSCLC患者预后的危险因素。结果 NSCLC组织中TRIM59及p53蛋白阳性表达率显著高于癌旁组织(74.0%vs.9.6%,65.8%vs.5.5%,P<0.05),TRIM59 mRNA、p53 mRNA表达水平显著高于癌旁组织[(2.17±0.62)vs.(1.00±0.24)、(1.85±0.49)vs.(1.00±0.26),P<0.05]。NSCLC组织中TRIM59及p53蛋白阳性表达与患者TNM分...     

IMP3 基因沉默介导Notch 信号通路对结直肠癌上皮间质转化及血管生成的影响

目的:探究胰岛素样生长因子ⅡmRNA结合蛋白3(IMP3)基因沉默介导Notch信号通路对结直肠癌上皮间质转化(EMT)及血管生成的调控机制。方法:收集我院73例结直肠癌患者肿瘤切除术后癌组织及癌旁组织。免疫组化检测结直肠癌组织及癌旁组织中IMP3蛋白表达。将人结肠癌细胞系SW620细胞进行IMP3沉默或Notch通路抑制处理,设置阴性对照。Western blot检测处理后的细胞中Notch1、Hes1、Vimentin、E-cadherin、N-cadherin、VEGF、TNF-α和TGF-β蛋白表达。MTT比色法检测各组细胞活力。Transwell实验测定各组细胞侵袭能力。结果:免疫组化实验发现IMP3在癌组织中高表达。细胞实验表明IMP3沉默可下调Notch通路相关蛋白Notch1及Hes1表达。与阴性对照组相比,沉默IMP3或抑制Notch通路后,SW620细胞活力、转移能力、EMT管生成明显受到抑制(P0.05)。细胞经沉默IMP3联合抑制Notch通路处理,对上述指标的抑制效果较单独处理(沉默IMP3或抑制Notch通路)更加显著(P0.05)。结论:IMP3基因沉默能够抑制Notch通路活化进而抑制结直肠癌EMT及血管生成。     

miR-767-5p通过调控TBL1XR1蛋白表达抑制人卵巢癌细胞系侵袭

目的 探索miR-767-5p和转导素β1X连锁受体蛋白1(TBL1XR1)对卵巢癌进展的影响以及作用机制。方法 数据库分析：使用GEO、miRPATH数据库和RStudio对miR-767-5p进行KEGG(京都百科全书)富集分析，并在GEO数据集低表达和高表达microRNA中各选择差异表达倍数TOP5的microRNAs,按照差异倍数由低到高排列；miRDB等数据库预测miR-767-5p可结合的靶基因并取交集，结合Open Target Platform、GEPIA等数据库筛选出目的基因；GEPIA、THPA数据库分析TBL1XR1在人体各器官表达量分析、免疫组化分析以及生存曲线分析。实验验证：双荧光素酶报告基因实验验证miR-767-5p和TBL1XR1存在结合靶点；Western blot检测卵巢癌细胞系(OC3、SKOV-3、HO-8910)和正常卵巢上皮细胞系(IOSE80)中TBL1XR1的表达；在SKOV-3细胞中转入miR-767-5p过表达质粒与TBL1XR1过表达质粒后，Western blot检测TBL1XR1表达量，Tanswell小室法检测细胞侵袭。结果...     

circZFR促进HT29和LOVO细胞增殖和迁移

目的 研究环状RNA锌指样RNA结合蛋白(circular RNA zinc finger RNA binding protein,circZFR)在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)组织及细胞系中表达及其对HT29和LOVO细胞增殖和迁移能力的影响.方法 应用GEO2R软件分析circZFR在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中结直肠癌相关数据集GSE 126094及GSE 147597中的表达;实时荧光定量PCR检测circZFR在收集的50例结直肠癌组织样本以及其在结直肠癌细胞系中的表达;在HT29和LOVO细胞中转染circZFR特异性短发夹RNA(short hairping RNA,shRNA),同步转染对照(negative control shRNA,shNC),RT-qPCR验证转染效率;克隆形成实验(colony formation assay)及Transwell实验(transwell assay)检测不同circZFR表达水平对HT29和LOVO细胞增殖及迁移能力的影响.结果 在GSE 126094中,circZFR在结肠癌组织中的表达明显高于其在正常结直肠组织中的表达;在GSE147597中,circZFR在合并肝转移的结直肠癌组织中表达高于无肝转移的结直肠癌组织;circZFR在收集的结直肠癌组织中的表达大部分(44/50,88.00％)高于相应的癌旁组织;相比于正常肠上皮细胞系NCM460,circZFR在结直肠癌细胞系中的表达升高;在HT29和LOVO细胞中转染circZFR siRNA后,circZFR的表达水平明显下调;下调circZFR的表达可明显抑制HT29和LOVO细胞的增殖和迁移能力.结论 circZFR在结直肠癌组织及细胞系中表达增高,在HT29和LOVO细胞中下调circZFR的表达可明显抑制细胞的增殖及迁移能力.