首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到20条相似文献,搜索用时 265 毫秒
1.
目的探讨α2-Heremans-Schimid -糖蛋白( AHSG)的5个单核苷酸多态性位点( rs4917、rs4918、rs1071592、rs2070633、rs2070635)与脑梗死的相关性。方法采用直接测序法对200例脑梗死患者及100例健康对照者进行5个多态性位点检测,检测结果以 Hardy -Weinberg平衡检验观察样本是否具有群体代表性。χ2检验对计量资料、基因型和等位基因频率分布进行检验。基因型和等位基因风险率采用相对危险度( OR)表示。结果 AHSG基因的rs4917位点的CC、CT、TT基因型在脑梗死组和对照组间比较差异无统计学意义(χ2=5.243,P=0.079)。CC基因型频率在脑梗死组显著高于对照组(χ2=5.230,P=0.027), CC基因型患脑梗死风险较CT+TT基因型高( OR=1.758,95%CI 1.082~2.856)。 C等位基因频率在两组间比较差异有统计学意义(χ2=4.758,P=0.032,OR=1.492,95%CI 1.040~2.139)。 rs4918位点的CC、CG、GG基因型在脑梗死组和对照组间比较差异有统计学意义(χ2=7.335,P=0.024)。 GG基因型频率在脑梗死组显著高于对照组(χ2=5.055,P=0.028),GG基因型患脑梗死风险较CG+CC基因型高(OR=2.965,95%CI 1.106~7.953)。 G等位基因在脑梗死组中的频率高于对照组,但差异无统计学意义(χ2=0.408,P=0.566)。 rs1071592位点的CC、AC、AA基因型在脑梗死组和对照组间比较差异无统计学意义(χ2=5.375,P=0.065)。 AA基因型频率在脑梗死组显著高于对照组(χ2=4.615,P=0.037),AA 基因型患脑梗死风险较 AC +CC 基因型高( OR=3.593,95%CI 1.041~12.394)。 A等位基因在脑梗死组中的频率高于对照组,但差异无统计学意义(χ2=0.942,P=0.351,OR=1.229,95%CI 0.810~1.864)。两组rs2070633、rs2070635位点基因型及等位基因频率分布及相对风险分析比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论 AHSG基因rs4917位点CC基因型与C等位基因、rs4918位点GG基因型、rs1071592位点AA基因型可能增加人群患脑梗死的风险,其中rs4917位点C等位基因可能是脑梗死的易感基因。  相似文献   

2.
【目的】探讨白介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)基因rs1143627-C/T 多态性与2型糖尿病(T2DM )的关系。【方法】应用MassARRAY分子量阵列技术检测240例 T2DM 患者(DM 组)和245例健康对照者(NC组)IL-1β基因rs1143627-C/T多态性。检测两组研究对象的空腹血糖,血脂等临床指标,并测定体质量指数(BMI)。【结果】 DM 组 IL-1β基因(rs1143627)基因型频率分别为:TT 69例(28.8%),TC 126例(52.5%),CC 45例(18.7%);NC组IL-1β基因(rs1143627)基因型频率分别为:TT 57例(23.3%),TC 116例(47.3%),CC 72例(29.4%);等位基因T在DM 组和NC组的频率分别为55.0%和46.9%;等位基因C在DM 组和NC组的频率分别为45.0%和53.1%;两组IL-1β基因(rs1143627)基因型频率和等位基因频率间差异均有明显统计学意义( P <0.05)。【结论】 IL-1β基因rs1143627-C/T多态性可能与 T2DM 发病有相关性,还可能与T2DM 的遗传易感性相关。  相似文献   

3.
目的探讨ALDH7A1基因多态性位点rs2306619、rs2306618、rs12514417、rs2306617、rs4379190与中国湖北随州汉族居民2型糖尿病(T2DM)的相关性。方法收集220名健康对照者和240例T2DM患者,所有研究对象均来自湖北随州汉族城镇居民。从外周血的白细胞中应用标准法提取DNA。通过设计测序引物对相邻的5个所选位点(rs2306619、rs2306618、rs12514417、rs2306617、rs4379190)进行基因扩增,然后直接送样测序,采用SHEsis软件进行统计分析ALDH7A1基因5个位点的单核甘酸多态性及连锁不平衡,分析糖尿病组与对照组5个位点等位基因频率和基因型频率的差异及构建单体型。结果5个位点的最低等位基因频率分别是0.492、0.084、0.124、0.277、0.259,连锁不平衡检验发现5个位点呈现强的连锁不平衡,ALDITIA1基因的5个位点基因的等位基因频率和基因型频率在2组中差异均无统计学意义,单体型分析发现c—A—A—A—T、T—A—A—A—T、T-A-A—G—C、T-A—C—A—T、T—G—A—G—C5种单体型,并且这5种单体型在糖尿病组和对照组差异无统计学意义。结论A三-DI-FIA1基因的5个多态性位点可能不是湖北随州汉族2型糖尿病患者的易感基因;本研究结果尚需在更大规模人群中进一步验证。  相似文献   

4.
目的 研究 EMILIN1、CYP11B2基因多态性与原发性高血压的相关性。方法 回顾性分析该院2010年3月至2012年3月期间收治的100例原发性高血压患者,将其作为临床研究对象(患者组),另选取血压正常的健康自愿者100例作为健康对照组,进行基因多态性的对比研究。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法 分别检测两组EMILIN1基因SNP位点和CYP11B2基因SNP位点的等位基因及基因型分布情况。结果 患者组患者EMILIN1基因rs2304682位点上的基因型与等位基因频率与健康对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05),患者组CG基因型、G等位基因频率明显高于健康对照组,而CC基因型、C等位基因频率则比健康对照组低;CYP11B2基因多态性基因型及等位基因频率发现,患者组(CYP11B2)-344 T/C基因多态性中TT基因型、T基因频率明显高于健康对照组,而CT 基因型、C基因频率则低于健康对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 EMILIN1基因多态性可能与原发性高血压有一定的相关性,(CYP11B2)-344T/C位点上等位基因T的频率较高。  相似文献   

5.
目的 研究单采献血者白细胞介素-28b(IL-28b)基因多态性与隐匿性乙型肝炎病毒(HBV)感染(OBI)相关性。方法 选择2016年1月~2019年12月山东省血液中心成功捐献血小板HbsAg(-)、核酸检测(NAT)无反应的献血者1 158例为研究对象,提取献血者血液DNA,采用直接测序法进行IL-28b基因分型,cobas HBV定量核酸检测试剂盒检测血液HBV-DNA载量,Logistic回归分析IL-28b基因rs8099917位点、rs12979860位点多态性与OBI的关系。结果 与非OBI比较,OBI献血者IL-28b基因rs8099917位点G等位基因频率、TG+GG基因型频率显著降低,T等位基因频率、TT基因型频率显著增加(χ2=22.137,22.163,均P<0.01);rs12979860位点T等位基因频率、CT+TT基因型频率显著降低,C等位基因频率、CC基因型频率显著增加(χ2=16.378,19.091,均P<0.01)。OBI献血者rs8099917位点,与TT基因型比较,TG+GG基因型患者HBV-DNA载量显著降低(t=5.257,P<0.01);rs12979860位点,与CC基因型比较,CT+TT基因患者HBV-DNA载量显著降低(t=17.398,P<0.01),以上比较差异均有统计学意义。Logistic回归分析结果显示,rs8099917位点,与TT基因型比较,TG+GG基因型可显著降低OBI发生风险(95% CI:0.288~0.843,P<0.05) ;rs12979860位点,与CC基因型比较,CT+TT基因型可显著降低OBI发生风险(95% CI :0.207~0.761,P<0.05)。结论 单采献血者OBI可能与IL-28b基因rs8099917位点、rs12979860位点多态性有关。  相似文献   

6.
目的探讨11β-羟基类固醇脱氢酶1(type 1 11 beta—hydroxysteroiddehydrogenase,11β-HSD1)基因rs12086634.G/T和rs846910-G/A多态性与云南汉族人群2型糖尿病(T2MD)的关系。方法提取78例健康对照者和210例T2DM患者基因组DNA,通过基因测序检测11β-HSD1 5′端-2940多态位点rs846910-G/A、第三内含子+94处rs12086634.G/T基因型及等位基因分布频率。结果云南汉族人群11β-HSD1rs846910-G/A基因型GG、AG和AA在T2DM组和对照组中的频率分别为79.8%/63.2%,17.5%/32.9%,2.6%/3.9%,G/A等位基因频率为88.6%/79.6%,11.4%/20.4%,两组间差异有统计学意义(P〈0.05)。rs12086634-G/T基因型GG、GT和TT在两组间分布频率为5.3%/3.9%,27.4%/23.4%,67.3%/72.7%,G/T等位基因频率为19.0%/15.6%,81.0%/84.4%,差异无统计学意义(P〉0.05)。结论11β-HSD1 rs846910-G/A可能与云南汉族人群T2DM相关,但rs12086634-G/T与T2DM不一定相关。  相似文献   

7.
【目的】探讨FoxO3a基因rs4946936单核苷酸多态性与辽宁地区2型糖尿病(T2DM)相关性。【方法】收集374例T2DM患者(T2DM组)及283例非糖尿病健康人群(对照组),检测两组FoxO3a基因rs4946936单核苷酸多态性,比较两组等位基因与基因型分布频率。【结果】T2DM组中C等位基因、CC基因型频率分别为76.74%、58.82%,与对照组的C等位基因频率77.21%、CC基因型58.66%比较差异无统计学意义(P〉0.05)。【结论】FoxO3a基因rs4946936单核苷酸多态性与T2DM无相关性。  相似文献   

8.
目的探讨BRCA1基因启动子区rs799906位点和编码区rs799917位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与广东汉族女性散发性乳腺癌易感性的关系。方法利用Sequenom Mass Array iPLEX GOLD系统对107例散发性乳腺癌患者及93例健康对照者的BRCA1基因两个SNP位点(rs799906,rs799917)进行检测,并对检测结果进行χ2检验和非条件Logistic回归分析。结果 rs799906位点TT、TC和CC三种基因型在病例组和对照组的分布频率有差异(χ2=8.407,P=0.018)。相对TT基因型而言,TC杂合型能增加乳腺癌发生的危险性(OR=2.566;95%CI:1.101~5.983;P〈0.05),但等位基因T和C的频率分布无显著差异(χ2=2.169,P=0.141)。rs799917位点CC、CT和TT三种基因型的频率和等位基因C和T的频率在病例组和对照组的分布均无显著性差异(χ2=3.994,P=0.136;χ2=0.903,P=0.342)。结论 BRCA1多态性位点rs799906TC杂合型与散发性乳腺癌发病风险有相关性;而rs799917位点多态性与散发性乳腺癌发病风险无相关性。  相似文献   

9.
目的探讨去整合素金属蛋白酶(ADAM)17基因启动子区的基因多态性与腔隙性脑梗死发病的关系。方法本研究共纳入173例腔隙性脑梗死患者和295例对照组人群,以位于ADAM17基因启动子区的rs12692386和vs1524668位点为遗传标记,采用SnapShot的分型技术检测ADAM17基因的多态性。结果腔隙性脑梗死组ADAM17 rs12692386位点和rs1524668的基因型和等位基因频率与对照组相比无显著性差异(P〉0.05)。对患者进行性别、年龄的亚组分类后,ADAM17rs12692386和rs1524668位点的基因型和等位基因频率在腔隙性脑梗死组和对照组之间无显著性差异(P〉0.05)。携带ADAM17多态正常基因型和突变基因型的腔隙性脑梗死患者之间的颈动脉内中膜厚度亦无显著性差异(P〉0.05)。结论ADAM17基因vrs 12692386和rs1524668位点的多态性可能与腔隙性脑梗死的发病无关。  相似文献   

10.
目的:探讨血管内皮生长因子C936T基因多态性与中国汉族人群2型糖尿病肾病的相关性。方法:选取296例2型糖尿病患者,其中糖尿病肾病患者173例(糖尿病肾病组),2型糖尿病非肾病患者123例(糖尿病非肾病组)。采用多聚酶链反应与限制性片段长度多态性检测两组患者血管内皮生长因子C936T位点基因多态性。结果:糖尿病肾病组与糖尿病非肾病组相比,CT和TT的基因型频率显著升高(P〈0.05).并且发现T等位基因的频率在糖尿病肾病组显著高于糖尿病非肾病组(P〈0.01)。多元Logistic回归结果表明CT和TT基因型与糖尿病肾病有相关性(OR=2、532,95%CI=1.486~4.315,P=0.001)。同时目前的结果也表明CT和TT基因型对糖尿病肾病的血脂指标有影响。结论:血管内皮生长因子3'非翻译区C936T基因多态性可能作为独立危险因素在中国汉族人群糖尿病肾病的发生和发展中起重要作用。  相似文献   

11.
目的 :研究中国南方汉族人 N5 ,N10亚甲基四氢叶酸还原酶 (MTHFR)基因多态性与缺血性脑卒中 (IS)的关系。方法 :运用多聚酶链反应限制性内切酶片段长度多态性技术 (PCR RFL P)检测 14 3例 IS患者及 15 4例对照组患者 MTHFR基因多态性。结果 :IS患者中 TT型频率为 14 .0 % ,CT型频率为 4 5 .5 % ,CC型频率为 4 0 .5 % ,T等位基因频率为 36 .7% ,C等位基因频率 6 3.4 % ;对照组中 TT型频率为 5 .2 % ,CT型频率为 31.8% ,CC型频率为 6 3.0 % ,T等位基因频率为 2 1.1% ,C等位基因频率为 78.9%。2组各频率间差异有显著性 ;普通型和重型组间差异无显著性 ;TT基因型、T等位基因与 IS显著相关。结论 :MTHFR基因多态性与IS有一定关系 ,MTHFR基因可能是 IS的易感基因 ,对人群进行大规模筛选 ,早期对 TT和 CT基因型的人群进行维生素干预 ,对预防 IS的发生有一定价值。  相似文献   

12.
目的:针对潍坊市汉族女性开展分子流行病学调查,研究叶酸代谢关键酶MTHFR和MTRR的基因多态性分布。方法:以孕期保健的670例汉族健康女性为研究对象,采集口腔黏膜上皮脱落细胞,抽提基因组DNA,使用荧光定量PCR方法检测MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G基因多态性,进行统计分析。结果:1)入组对象的基因多态性分布符合遗传平衡。2)汉族女性MTHFR 677CC、CT、TT的基因型频率分别为13.73%、47.91%、38.36%,C、T等位基因频率分别为37.7%、62.3%;MTHFR 1298AA、AC、CC的基因型频率分别为75.52%、23.28%、1.19%,A、C等位基因频率分别为87.2%、12.8%;MTRR 66AA、AG、GG的基因型频率分别为54.63%、40.44%、4.93%,A、G等位基因频率分别为74.9%、25.1%。3)汉族女性MTHFR C677T和A1298C两位点连锁有7种组合,频率最高的是TT/AA(38.21%),没有CT/CC和TT/CC组合。两位点间存在完全连锁不平衡(D'=0.987,r2=0.237)。结论:获取潍坊市汉族女性MTHFR和MTRR基因多态性的群体遗传学特征。  相似文献   

13.
OBJECTIVE: To examine the influence of genetic variations in heat shock proteins on trauma outcome. DESIGN: Prospective, noninterventional, single-center study. SETTING: Level I trauma center. SUBJECTS: Eighty consecutive severe multiple trauma patients. INTERVENTIONS: None. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: Plasma concentrations of interleukin-6 and tumor necrosis factor-alpha were measured over a 5-day course by chemiluminescence-immunoassay. The genotypes of the polymorphisms HSPA1B (HSP70-2) G1538A and HSPA1L (HSP70-Hom) C2437T were determined by polymerase chain reaction and restriction cleavage with PstlI or NcoI, respectively. Allele frequency of the HSPA1B 1538 G allele was 0.569, and that of the HSPA1L 2437 T allele was 0.821. Interleukin-6 concentrations rapidly increased and dropped to almost normal after 5 days, whereas tumor necrosis factor-alpha concentrations increased until day 5. Patients carrying the genotypes HSPA1B AG or HSPA1L CT had significantly higher plasma concentrations of tumor necrosis factor-alpha and interleukin-6 compared with those with genotype GG or TT. Presence of the HSPA1L genotype CT also was a significant risk factor to develop liver failure (odds ratio, 4.6; 95% confidence interval, 1.5-14.1) and to acquire at least one complication severe enough to score three points according to the Denver multiple organ failure score (odds ratio, 3.0; 95% confidence interval, 1.1-9.2). CONCLUSION: The data indicate that genetic variations of the heat shock proteins HSPA1B and HSPA1L may contribute to clinical outcome after severe injury.  相似文献   

14.
王鑫  冯星  吴娟  胡季芳  王颖星  鲁衍强 《检验医学与临床》2021,18(8):1042-1045,1050
目的探讨叶酸代谢关键酶基因5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C和甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G多态性在育龄女性中的分布特征,并分析不同遗传特征对外周血叶酸和同型半胱氨酸(Hcy)水平的影响。方法选取2018年3月至2020年1月在上海计生所医院妇科就诊的汉族育龄女性2 651例,根据知情同意原则,采集口腔黏膜上皮脱落细胞,抽提基因组DNA,使用荧光定量PCR方法检测MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G基因多态性,采用化学发光法检测外周血叶酸水平,循环酶法检测血清Hcy水平。结果 (1)MTHFR C677TCC、CT、TT的基因型频率分别为33.2%、47.9%、18.9%,C、T等位基因频率分别为57.1%、42.9%;MTHFR A1298C AA、AC、CC的基因型频率分别为66.6%、30.5%、2.9%,A、C等位基因频率分别为81.8%、18.2%;MTRR A66G AA、AG、GG的基因型频率分别为56.4%、36.9%、6.8%,A、G等位基因频率分别为74.8%、25.2%。(2)MTHFR C677T和A1298C两位点连锁有7种组合,频率最高的是CT/AA(31.9%),没有CT/CC和TT/CC组合。两位点间存在完全连锁不平衡(D′=0.984,R2=0.161)。(3)MTHFR C677T不同基因型的叶酸和Hcy水平差异有统计学意义(P<0.05)。TT基因型的叶酸水平低于CC基因型,TT基因型的Hcy水平高于CC基因型。经单因素Logistic回归分析发现,MTHFR C677T TT基因型发生高Hcy血症的危险性是CC基因型的9.97倍(95%CI:3.81~26.05)。MTHFR A1298C和MTRR A66G不同基因型与血清叶酸及Hcy水平差异无统计学意义(P>0.05)。(4)经单因素回归分析,Hcy水平与叶酸水平呈负相关(R2=0.061,P<0.05),叶酸水平可解释Hcy水平个体差异的6.1%。结论获取了上海市汉族育龄女性MTHFR和MTRR基因多态性的群体遗传学特征,血清Hcy水平与MTHFR C677T基因多态性以及血清叶酸水平有关。筛查MTHFR和MTRR基因多态性并监测Hcy水平对围生期保健有重要的指导意义。  相似文献   

15.
OBJECTIVE: Genetic differences in immune responses may affect susceptibility to and outcome of septic shock. CD14 seems to be an important part of the innate immune system, initiating antimicrobial response. We evaluated the frequency of a recently discovered CD14 promoter gene polymorphism (C to T transition at base pair -159) among patients with septic shock compared with those in a control group. DESIGN: Multiple-center study. SETTING: Hospital research department. PATIENTS: Ninety consecutive white patients with septic shock were included. The control group consisted of 122 age- and gender-matched white subjects. INTERVENTIONS: In both groups, the C-159T CD14 promoter genetic polymorphism was determined by using polymerase chain reaction and subsequent Hae III restriction enzyme digestion of the polymerase chain reaction products. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: The C-159T polymorphism and the TT genotype were significantly overrepresented among septic shock patients compared with controls. Within the septic shock group, the mortality of patients with TT genotype (71%) was significantly higher than in patients with other genotypes (48%; Pearson chi-square, p =.008). In a multiple logistic regression model, the TT genotype was independently associated with an increased relative risk of death (odds ratio, 5.30; 95% confidence interval, 1.20-22.50, p =.02). CONCLUSIONS: The C-159T polymorphism affects susceptibility to septic shock and seems to be a new genetic risk factor for death.  相似文献   

16.
CTLA-4基因启动子区-318位点基因多态性与SLE的相关性研究   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的:探讨细胞毒性T细胞相关分子—4(cytotoxic T lymphocyte antigen4,CTLA—4)基因启动子区—318位点基因多态现象在中国南方人群中的分布及与SLE易感性的关系。方法:提取外周静脉血有核细胞基因组DNA,以聚合酶饺反应—限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction—restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法检测180例SLE患者和140名正常对照组CTLA—4基因启动子区—318位点基因型。结果:SLE患者CTLA—4基因启动子区—318位点基因型频率分别为TT型1.1%、TC型41.1%和CC型58.8%,等位基因频率为T等位基因21.7%、C等位基因78.3%。SLE患者各种基因型频率及等位基因频率与对照组比较均无统计学意义。CTLA—4基因启动子区—318位点各基因型与SLE患者临床表现及实验室检查结果无相关关系。结论:SLE患者CTLA—4基因启动子区—318位点基因多态现象与SLE发病无关。  相似文献   

17.
BACKGROUND: The objectives of this study are to examine the prevalence of combined methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) 677C-->T and 1298A-->C mutations in patients with venous thrombosis (VT) and healthy volunteers and to determine if these mutations are in Hardy-Weinberg equilibrium. METHODS AND RESULTS: Sixty-five patients with VT and 64 healthy volunteers were assessed for MTHFR 677T and 1298C alleles using polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism. Observed MTHFR genotype frequencies were compared with expected genotype combinations, and their odds ratios were determined. MTHFR allele frequency did not differ between VT and control groups; however, differences were observed for MTHFR genotype distribution. MTHFR 677T and 1298C alleles occurred in cis in our population, and therefore mutation crossover has occurred. There was deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium for combined MTHFR genotypes, although this may at least partly be attributable to linkage disequilibrium. MTHFR 677CT/1298CC and 677TT/1298CC genotypes (P<.05) were not observed in either group. CONCLUSIONS: The absence of MTHFR 677CT/1298CC and 677TT/1298CC genotypes in both groups suggests that certain MTHFR genotypes may carry a selective advantage. Our discovery of a substantial number of MTHFR mutations in cis configuration suggests that any MTHFR allele linkage disequilibrium present is incomplete.  相似文献   

18.
李阳  梁蕊  魏文峰  刘子杰  周微 《中国临床研究》2013,(10):1019-1021,1024
目的探讨CYP2J2基因多态性和吸烟的交互作用及其与心肌梗死(MI)的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,对85例MI患者(MI组)和85例健康体检者(对照组)CYP2J2基因标签SNP进行分析,并分析其多态性和吸烟的交互作用及其与MI的关系。结果 CYP2J2基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡;TT、GT、GG基因型频率在MI组中分别为3.5%、4.7%、91.8%,在对照组为1.2%、3.5%、95.3%,两组之间基因型分布差异无统计学意义(P〉0.05);CYP2J2基因多态性和吸烟的交互作用分析显示,以GG基因型(野生型)不吸烟者作为基线(OR=1),则GG基因型吸烟者发生MI的风险增加1倍(OR=2.0),而携带非GG基因型(突变型)的吸烟者发生MI的风险增加了7.7倍(OR=8.7);Logistic回归分析结果显示,在调整了年龄、性别、高血压、糖尿病、高胆固醇血症等传统危险因素之后,吸烟和CYP2J2基因多态性之间的交互作用是MI发生的重要危险因素。结论 CYP2J2基因多态性和吸烟的交互作用增加MI的风险。  相似文献   

19.
Recent genome-wide association studies have identified two host single-nucleotide polymorphisms (SNPs) near the IL28B gene (rs12979860 C/T and rs8099917 T/G) that are associated with sustained virological response in patients infected with the hepatitis C virus. Herein, we describe a rapid multiplexed dual-color fluorescence resonance energy transfer (FRET) probe assay that accurately genotypes for both SNPs simultaneously. A single-nucleotide extension assay was also developed for verification of genotypes. Agreement (100%) was observed in genotype calls between the FRET and single-nucleotide extension methods for both SNPs, yielding 100% analytical sensitivity and specificity. By using the FRET assay, 443 samples of varying ethnic backgrounds were genotyped and six different compound genotypes (rs12979860/rs8099917) were detected in whites, Asians, Middle Easterners, Hispanics, and African Americans, at the following frequencies: CC/TT (39.2%, 78.9%, 40.0%, 33.9%, and 16.8%), CT/TT (20.8%, 0%, 40%, 9.3%, and 37.0%), TT/TT (2.4%, 0%, 0%, 3.4%, and 35.3%), CT/TG (24.0%, 19.7%, 20%, 39.8%, and 3.4%), TT/TG (8.0%, 1.4%, 0%, 3.4%, and 5.9%), and TT/GG (5.6%, 0%, 0%, 10.2%, and 1.7%), respectively. The multiplexed FRET assay can be used to effectively genotype for both SNPs in a single tube, with high analytical sensitivity and specificity.  相似文献   

20.
目的 探讨新疆维吾尔族人群基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)基因多态性与急性冠脉综合征(acute coronary syndrome,ACS)的相关性.方法 采用病例对照研究,选择2006年1月至2009年12月在新疆医科大学第一附属医院心脏中心住院并行冠状动脉造影检查证实的维吾尔族急性冠脉综合征患者352例(包括不稳定型心绞痛213例、急性心肌梗死139例)和同期入院冠状动脉造影检查阴性的对照组421例.采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术对所有纳入对象的MMP-9基因-1562C>T和R279Q多态性进行分析,并结合造影情况,探讨MMP-9基因多态性与ACS发生及冠脉狭窄程度的关系.用Hardv-Weinberg平衡检验样本群体代表性;各组基因型和等位基因频率差异比较采用x2检验,并以优势比(OR)及其95%可信区间(95%CI)表示相对的风险度;综合评价各因素与ACS相关性采用多因素Logistic回归分析;以P<0.05为差异具有统计学意义.结果 MMP-9基因-1562C>T多态性位点ACS组CT+TT基因型和T等位基因频率(25.9%,14.5%)显著高于对照组(15.7%,8.4%),差异有统计学意义(P<0.01).R279Q位点ACS组和对照组RQ+QQ基因型和Q等位基因频率分别为67.0%,45.6%,64.6%,42.0%,两组比较差异无统计学意义(P>0.05).多因素Logistic回归分析显示-1562T等位基因是ACS发生的独立风险因素(P<0.05).不同冠脉病变支数亚组中CT+TT基因型和CC基因型的分布比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 MMP-9基因1562C>T多态性与新疆维吾尔族人群ACS的发生可能相关,T等位基因可能是ACS遗传易感性的基因标记之一,-1562C>T基因多态性与ACS冠脉狭窄程度无关,R279Q基因多态性与维吾尔族人群ACS发生未见明显相关.  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号