我国口岸出入境人员HIV-1基因亚型分析

目的研究我国口岸检出的人类免疫缺陷病毒I型（HIV-1）感染者的HIV-1 gag区基因序列特征，了解亚型种类，为艾滋病的监控和防制提供科学依据。方法从HIV阳性的出入境人员血浆中提取病毒核酸，之后采用RT-PCR法扩增gag区基因，对该段序列进行测定分析。结果2004～2006年确认的39例HIV阳性标本，根据gag区基因序列系统树分析显示，共有8种亚型，其中12例C亚型，9例CRF01_AE重组，6例CRF07_BC重组，5例CRF08_BC重组，4例B亚型，1例B’亚型，1例CRF02_AG重组和1例A1亚型。结论北京口岸检出的HIV-1亚型种类较为复杂，研究口岸艾滋病病毒的变异特点和传播来源对于我国艾滋病的防治具有重要作用。     

HIV-1亚型分析与研究综述

艾滋病（AIDS）是本世纪对人类社会威胁最大的传染性疾病。引发AIDS的人类免疫缺陷病毒（Human Immunodeficiency Virus，HIV）于20世纪80年代中期发现以来，随着分子生物学技术的不断完善，世界各国陆续开展针对其基因结构的分类研究。根据血清学和基因序列的差异，HIV分为HIV-1型和HIV-2型。     

1997～2002年山东省HIV-1流行株env基因序列测定和亚型分析

①目的对1997～2002年间山东地区HIV-1各亚型分离株进行基因分型，了解各亚型的分布及其与传播途径的相互关系。②方法采集1997～2002年间山东省38例HIV-1感染者的抗凝全血标本，用巢式PCR技术扩增外周血单个核细胞中HIV-1前病毒env基因C2～V3区，并对C2～V3区的核苷酸序列进行测定和分析。⑧结果山东省38例HIV-1分离株中存在亚型和重组毒株4种（A、B、C、A／E）。其中A亚型5株，B亚型22株（其中包括泰国B亚型11株），C亚型10株，A／E重组毒株1株。各亚型内的离散率有差异，A、B、c亚型内基因离散率分别为1．5％、8．6％和1．9％。在性乱人群和静脉吸毒人群中以A亚型和C亚型为主；在职业献血和不安全血制品使用者中以B亚型为主。④结论1997～2002年间山东省HIV-1流行特点为A、B、c亚型共存，伴有重组毒株；传播途径复杂，基因变异较大，B亚型仍然为主要流行株。     

一株HIV-1 01_AE/07_BC独特重组病毒近全长基因组分析

目的对在深圳发现的一例gag和env基因片段亚型不一致的HIV感染者样本进行近全长基因组扩增和序列分析,以了解其重组特征并分析可能的来源。方法利用近末端稀释法分两段扩增病毒近全长基因组并测定序列,使用Sim Plot 3.5软件分析全长基因组序列中的重组断点,并采用分片段构建进化树的方法确认重组断点。对长度超过300 bp的片段与相应亚型的全部近全长基因组序列构建进化树,分析亲本毒株可能的来源。结果经扩增测序获得1条长度为8 975 bp的HIV-1近全长基因组序列。断点分析结果表明该序列由CRF01_AE和CRF07_BC重组而成,重组断点相应于HXB2的位置分别为1 185、1 817、8 782、9 043和9 216,其中片段Ⅰ、Ⅲ、Ⅴ来源于CRF01_AE毒株,片段Ⅱ、Ⅳ、Ⅵ来源于CRF07_BC毒株。亲本毒株来源分析表明,与片段Ⅱ成簇的CRF07_BC序列主要来自北方男男同性传播人群,Bootstrap值为74%,片段Ⅲ与CRF01_AE的簇5病毒成簇,其中多数序列来自北方男男同性传播人群,Bootstrap值为100%。结论本文获得了一株CRF01_AE和CRF07_BC重组形成的独特型重组病毒,其亲本病毒与我国北方男男同性恋人群流行的毒株同源,有可能来源于深圳本地性传播人群中流行的病毒。     

HIV-1中国流行株的生物学表型与V3环序列变异相关性初步研究

目的分析我国HIV-1流行株的生物学表型及其与V3环序列变异的相关性。方法采用传统的共培养方法从HIV-1感染者新鲜外周血单个核细胞(PBMC)中分离病毒并在MT-2细胞上测定分离株的融合诱导性,用表达CD4和趋化因子受体CCR5或CXCR4的GHOST(3)测定毒株的辅助受体利用情况,用巢式一聚合酶链反应(nest—PCR)扩增V3环及两侧区序列并对其序列进行测定,用GCG软件分析氨基酸序列。结果在所分析的5个原代毒株中,LTG0213和LTG0214为合胞体诱导型(SI),利用CXCR4辅助受体;XJN0021、XJN0091和SHXDC0041为非合胞体诱导型(NSI),利用CCR5辅助受体。X4／SI病毒和RS／NSI病毒在V3环氨基酸序列方面,存在明显的区别。CCR5表型中国株第8、11、18及第25位氨基酸的共同基序为：8-TXXS／GXXXXXXR／QXXXXXXE／D-25,CXCR4表型株在这些位置出现碱性氨基酸取代(第25位除外),引进正电荷。结论HIV-1中国流行株的生物学表型与V3环序列变异密切相关,V3环上第8、11、18及第25位积累碱性氨基酸(或由酸性氨基酸转变为中性氨基酸),可以使病毒由NSI／R5表型转变为SI／X4表型,可以根据V3环氨基酸序列预测病毒的生物学表型。     

深圳地区120株HIV-1膜区和结构蛋白区基因变异分析

目的研究深圳地区HIV-1病毒株在膜区和结构蛋白区基因变异情况,比较不同亚型毒株之间基因离散率的差异。方法收集HIV-1感染者新鲜血浆,提取血浆中HIV-1病毒株RNA,RT-PCR套式扩增env区和gag区基因,基因测序后进行序列比对和分析,构建基因进化树,计算基因离散率。结果各亚型毒株在env区相互之间基因离散率最大的是B亚型和07-BC亚型,最小的是07-BC亚型和08-BC亚型;各亚型毒株在gag区相互之间基因离散率最大的是01_AE亚型和07-BC亚型,最小的是07-BC亚型和C亚型。结论 07-BC、08-BC及C亚型在两个基因片段上基因距离均最近,说明这三个亚型可能有共同的起源。     

中国人群中HIV-1辅助受体CCR5基因新突变位点及CCR5-894C缺失基因多态性分析

目的：研究中国人群HIV-1辅助受体CCR5基因编码区新的单核苷酸多态性（SNP）位点;分析CCR5-894C缺失等位基因在中国普通人群和HIV-1高危人群中的分布特点和相关意义。方法：针对CCR5编码区用2对引物进行PCR扩增,设计测序引物对45例汉族人样本进行PCR产物直接测序,用DNAstar分析测序结果,寻找SNP位点。采用错配PCR-RFLP法对中国汉族、蒙族、藏族普通人群,性传播疾病和静脉吸毒高危人群及HIV-1携带者,共627份样品进行了CCR5-894C缺失等位基因分型。结果：在45例汉族人CCR5基因编码区共发现6个SNP位点,4个（184A→G、503G→T、668G→A、99G→T）引起氨基酸改变,两个无义突变;此外还发现1个单碱基缺失（894C缺失）,引起移码突变和提前终止。其中184A→G、503G→T、999G→T三个中国汉族人所特有的SNP位点为首次发现,它们的等位基因频率分别为1.11％,21.1%和10.0％;其中503G→T分布明显不符合Hardy-Weinberg平衡。汉、藏、蒙等民族的普通人群CCR5-894C缺失等位基因频率为1.11％,0.53%和0.在汉族HIV-1性传播、静脉吸毒传播的高危人群中,HIV-1阳性个体和阴性个体间CCR5-89C缺失等位基因频率差异无显著意义,与汉族普通人群比较差异也无显著意义。结论：中国人CCR5基因的SNP位点有自己的特点,共发现4个引起氨基酸改变的SNP位点（其中3个为首次发现）,1个引起移码突变的单碱基缺失。汉族人群中存在CCR5-894C缺失突变,但突变频率很低。这些SNP和缺失突变对于HIV-1感染和艾滋病病程的影响值得进一步研究。     

HIV-1 SF2株env基因C1与C3区的嵌合表达

①目的 构建HIV-1SF2株env基因C1与C3区嵌合片段的克隆并在大肠杆菌中表达。②方法 用DNAstar软件辅助设计引物，以含有HIV-1SF2株前病毒基因组的9B1R6质粒为模板，PCR法分别扩增出env基因C1和C3段；两个片段经KpnⅠ酶切、T4连接酶连接和扩增后，再将经EcoRⅠ、SalⅠ双酶切的嵌合片段插入表达载体pGEX-4T-2中，构建重组表达质粒pGEX-4T-2／ClC3；重组质粒经酶切、测序鉴定后，以TSS法转入大肠杆菌DH5α，IPTG诱导表达融合蛋白和SDS—PAGE电泳分析表达蛋白图谱。③结果 经酶切和测序分析，插入片段大小、方向和读码框架正确，无碱基错配，表明成功构建pGEX-4T-2／ClC3克隆；重组克隆在大肠杆菌DH5α中经IPTG诱导，高效表达出相对分子质量为4．3万的融合蛋白。④结论 重组质粒pGEX-4T-2／C1C3的构建和表达成功，为进一步研究该表达蛋白的活性和HIV疫苗的研制奠定了基础。     

武汉口岸出入境人员丙型肝炎病毒感染状况的调查与分析

目的 通过调查分析武汉口岸出入境人员丙型肝炎的感染情况,为采取有效的预防控制措施提供科学依据.方法 对2003年5月至2006年12月来湖北省国际旅行卫生保健中心体检的45 419名出入境人员进行丙型肝炎抗体检测,并结合谷丙转氨酶(ALT)检测结果进行统计学分析.结果 此次调查共发现208例抗HCV阳性者,其中出国劳务人员HCV的感染率为0.508%,高于其他人员的感染率.HCV阳性者ALT异常率为22.96%,HCV阴性者ALT异常率为5.59%,二者差异有统计学意义(χ2＝109.98,P<0.01).结论 应加强对武汉口岸出入境人员HCV感染的流行病学监控,有效控制国际交流中HCV的感染和传播.     

人类免疫缺陷病毒1型AE重组亚型毒株全长gp120基因序列分析

目的研究人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)AE重组型(CRF01-AE)毒株全长gp120基因的变异特征,为针对CRF01-AE重组型的免疫学研究和疫苗的研制提供帮助。方法应用巢式PCR对福建省2004至2005年期间100例HIV-1CRF01-AE感染者随机抽取21份血样的外膜蛋白全长gp120进行扩增、回收、克隆至T载体后测序,应用MEGA、DNASIS、CLUSTAL1·83、N-GLYCOSITE等软件对HIV-1全长gp120序列进行分析。结果基因系统树显示这21份样本属于CRF01-AE重组型HIV-1株,样本组内基因距离为9·5%±2·5%。V3环顶端四肽存在4种类型:GPGQ(71·43%),GPGR(19·05%),GPGH(4·76%),GQGQ(4·76%)。根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况的结果显示,16份(76·19%)可能使用CCR5作为辅助受体,1份(4·76%)样本可能使用CCR5/CXCR4序列,4份样本(19·05%)不能做出预测。21条HIV-1全长gp120氨基酸序列中,C1-C5比较保守,而V1-V5变化较大,其中V3相对保守。N糖基化位点分析发现大多数位点较为保守,少数发生糖基化位点丢失和增加。结论福建省大部分CRF01-AE重组型毒株与东南亚代表株关系密切,来源较为复杂,大部分CRF01-AE重组毒株为NSI型,gp120基因变异大,该研究为以后的病毒免疫学和疫苗的研究提供丰富的材料和基础数据。     

云南省HIV-1 CRF01_AE毒株基因型耐药研究

目的 了解云南省HIV-1 CRF01_AE毒株的流行分布及基因型耐药情况。 方法 收集2018—2021年云南省抗病毒治疗失败的HIV/AIDS患者的人口学资料,采集患者血浆,逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因蛋白酶和逆转录酶区并进行序列测定,对基因型为CRF01_AE的序列进行耐药情况分析。结果 通过基因型耐药检测共获得967例亚型为CRF01_AE序列,其中男性682例（占70.5%）,耐药509例,耐药率为52.6%,异性性传播813例（占84.1%）,同性性传播95例（占9.8%）。同性性传播的耐药率最高,为65.3%;治疗时长<12个月的耐药率最低,为35.9%,36~<48个月耐药率最高,为58.1%。核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）耐药率为33.9%,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的耐药率为48.5%,蛋白酶抑制剂（PIs）的耐药率较低为1.3%。NRTIs类药物中阿巴卡韦（ABC）、恩曲他滨（FTC）和拉米夫定（3TC）耐药率较高,分别为为32.9%、32.4%和32.4%;NNRTIs类药物中奈韦拉平（NVP）和依非韦仑（EFV）耐药率较高,分别为47.6%和47.5%,均以高度耐药为主。一线治疗方案耐药率56.2%高于二线治疗方案耐药率29.5%,差异有统计学意义（P<0.001）。NRTIs耐药突变位点中,以M184V/I突变位点为主,突变率为30.0%;NNRTIs耐药突变位点中,以K103N/Q/S突变位点为主,突变率为28.1%;PIs耐药位点突变率相对较低,主要的耐药突变位点是L33F,突变率为3.7%。结论 云南省抗病毒治疗失败亚型CRF01_AE的患者耐药率有所降低,但部分地区及人群的耐药率仍较高,应加强对重点地区和人群的管理,加强耐药监测,对治疗失败的患者及时掌握耐药情况,合理调整治疗方案。     

Genetic characterization of three CRF01_AE full-length HIV type 1 sequences from Fujian Province, China

Background One of the major characteristics of the human immunodeficiency virus type 1 （HIV-1） is its unusually high degree of genetic variability, which involves in genetic diagnosis, subtyping, vaccine design, and epidemiology. HIV-1 CRF01_AE is a main prevalent HIV-1 recombinant strain in China. In this study, three full-length CRF01_AE genomes from Fujian Province, China were cloned, sequenced, and analyzed; and the further genetic diversity defining and epidemiologic analysis were carried out. Methods Proviral DNA was extracted from non-cultured peripheral blood mononuclear cells, the near full-length HIV-1 genome was amplified and the PCR products were cloned into pCR-XL-TOPO vector and sequenced. 5＇-long terminal repeat （LTR） and 3＇-LTRs were amplified by additional independent PCR and cloned into pMD18T vector. Gene-based phylogenic tree was constructed and genetic distances were calculated by MEGA 3.1. Simplot was used for Bootscan analysis. Results The phylogeny and genetic distance analysis of the three near full-length sequences confirmed that these three samples clustered with CRF01_AE isolates, more close to Thailand CRF01_AE strain CM240, and were distantly related to African CRF01_AE strain 90CF402. Analysis of their genomic organization revealed the presence of nine potential open reading frames. There were no major deletions, rearrangements, or insertions in the three sequences, but an in-frame stop codon was found in tat gene of Fj051. LTRs of the three sequences contained a few nucleotides mutation. We did not find new mosaic recombinant in the three sequences. The V3 motif was GPGQ in all the three sequences, and there were only few amino acids differences in all three V3 loop sequences. Conclusion This report reveals the background of the three full-length CRF01_AE genomes, the most dominantly circulating HIV-1 strain in Fujian Province, China. The work is essential for the design and development of an effective AIDS vaccine for the region.     

HLA-A*02、A*24基因多态性与中国汉族人群HIV-1易感性的关系

目的探索中国汉族人群人类白细胞抗原HLA-A、B、DR基因多态性与HIV-1易感性之间的关系。方法应用序列特异引物PCR法对HIV-1高暴露不感染人群、健康对照人群和HIV-1感染人群进行HLA分型,分析HLA基因多态性位点在两组或三组人群之间分布的差异。结果三组人群HLA-A、B、DR基因多态性位点中A*03和B*55的分布差异有统计学意义(P0.05),但这两个位点为低丰度位点。健康对照人群HLA基因型的分析发现,HLA-A*02和A*24基因型在CD8+T细胞HLA-DR表达高低两组的分布差异有统计学意义(P=0.020,0.038),等位基因分析也验证了该位点突变的意义(P=0.007,0.009)。A*02多态性变异与CD8+T细胞HLA-DR表达有显著性负相关(r=-0.257,P=0.008),该位点基因突变与CD8+T细胞HLA-DR的低表达密切相关;A*24多态性变异与HLA-DR在CD8阳性细胞表面的表达有显著性正相关(r=0.195,P=0.045),该位点基因突变与CD8+T细胞HLA-DR的高表达密切相关。结论 HLA-A*02基因多态性变异可能是中国汉族人群HIV-1感染的保护性因素,而HLA-A*24基因多态性变异可能是感染的危险因素。     

Purification and identification of HIV-1 gag p20 protein expressed in E.coli

The human immunodeficiency virus type 1 gag p20 gene fragment was clonedinto plasmid pBV220 to construct a recombinant expression plasmid pCY7.By induction,the p20 protein was expressed in E.coli,and it was confirmed by Western blotting thatthe expressed p20 protein could be specifically recognized by anti-p17 monoclonalantibodies.The recombinant bacteria was lysed and fractionated into snpernatant andprecipitate by centrifugation.It was found that the p20 protein was present chiefly inthe precipitate.After p20 protein being washed twice,its purity reached 27.4%.Then theprecipitate was washed with 1 mol/L urea solution and the purity of p20 protein wasraised to 58.1%.Finally,the precipitate was dissolved in 6mol/L of urea and appliedonto a heparin affinity column.Four peaks were obtained and the p20 protein wasfound mainly in peak 3.The purity of p20 protein at this step reached 84.2% as meas-ured by gel scanning.     

宁夏首例HIV-1/2型混合感染者的实验室诊断

目的 对筛查HIV呈阳性的标本进行实验室最终确认。方法 采用两种酶联免疫试剂对标本进行HIV抗体检测,结果 呈阳性的标本,再使用免疫印迹试剂对HIV抗体进行最终确认。结果标本筛查和复检试验均呈阳性,使用免疫印迹试剂分别检测到9条HIV-1型特异性抗体条带和6条HIV-2型特异性抗体条带。结论 此份标本为HIV-1型阳性和HIV-2型血清学阳性,在宁夏首次发现HIV-1／2型混合感染者。     

MEF2A基因多态性与重庆地区汉族人群冠心病的相关性

目的探讨重庆地区汉族人群MEF2A基因第11外显子CAG重复序列多态性与冠心病易感性的关系。方法对232例冠心病患者及240名对照者的MEF2A基因第11外显子进行PCR扩增和DNA直接测序,以检测CAG重复序列多态性,并结合临床资料进行分析。结果未发现MEF2A基因11号外显子存在21碱基对的缺失突变,MEF2A基因11号外显子CAG重复序列存在多态性,等位基因频率分布在两组间的差异无统计学意义(P>0.05);CAG重复序列多态性与冠心病无明显相关性(P>0.05)。结论 MEF2A基因11号外显子CAG重复序列多态性和重庆地区汉族人群中冠心病的风险无明显相关性。     

雄激素受体基因CAG多态性与囊肿型痤疮的相关性研究

目的探讨雄激素受体基因CAG多态性与湖南汉族囊肿型痤疮的相关性。方法对寻常型和囊肿型痤疮患者及正常人的雄激素受体基因阳性PCR产物进行测序,测序结果应用Web Angis分析。结果寻常型痤疮患者的雄激素受体基因CAG微卫星片段长度的平均值为22．89±1．94,囊肿型痤疮患者为19．12±1．81,正常人为23．15±2．2;囊肿型组与寻常型组比较有显著性差异（t=8．41,P〈0．05）,与正常人组比较有显著性差异（t=8．23,P〈0．05）;而寻常型组与正常人组比较无显著性差异（t=0．528,P〉0．05）。以（CAG）n重复片段〈22为标准进行统计分析,囊肿型组与寻常型组比较有显著性差异（Х^2=45．17,P〈0．05）,与正常人组比较有显著性差异（Х^2=48．52,P〈0．05）;而寻常型组与正常人组比较无显著性差异（Х^2=0．06,P〉0．05）。结论雄激素受体基因CAG多态性与湖南汉族囊肿型痤疮之间有相关性。当（CAG）n重复片段〈22时,患囊肿型痤疮的风险增大。     

桂林市经性传播的HIV-1的流行特征和亚型分析

目的：了解桂林市2008年及以后确诊的经性传播的人类免疫缺陷病毒1型( HIV-1)感染者的流行病学及亚型的分布情况。方法选取样本100例,收集流行病学资料,采集抗凝全血,提取病毒RNA,RT-PCR法行gag基因扩增,对产物进行测序和分析。结果100例样本中男女比例为2．125∶1;青壮年年龄组(20~49岁)患者为54%,>50岁年龄组患者为45%;职业为农民的患者为40%,学生为6%;初中及以下文化水平患者占69%;经异性和同性性接触途径传播的分别为93%、7%。100例样本最终成功扩增得到61例样本的 gag 基因序列, CRF01-AE 重组亚型48例, CRF07-BC重组亚型8例,B亚型5例。结论应更加重视婚检、孕检的艾滋病抗体筛查;关注老年人群经性接触途径感染艾滋病的现象;采取针对低素质人群的有效防治措施;随着主要传播途径和主要亚型的变化,迫切需要对高危人群进行宣传教育和行为干预以阻断HIV/AIDS的流行和传播。