广西崇左市4个边境市县抗病毒治疗HIV感染者耐药情况及基因型

目的 了解广西崇左市4个边境市县（大新县、宁明县、凭祥市、龙州县）接受抗病毒治疗的艾滋病病毒（HIV）感染者的基因型耐药情况及其影响因素,为该地区艾滋病治疗人群的抗病毒治疗（ART）方案调整和优化提供科学依据。方法 纳入2018年1月—2018年9月371例来自崇左市4个边境市县年龄≥18岁的HIV感染者,收集研究对象抗病毒治疗信息和pol区基因序列进行基因亚型和耐药情况分析。结果 获得371例患者的HIV pol区序列,对抗病毒药物产生耐药有62例,总体耐药率16.7%,耐药患者基因亚型以CRF01_AE为主,占72.6%,其次是CRF08_BC,占22.6%;耐药类型以非核苷类药物为主,占75.8%,耐药突变位点以K103N为主,主要对EFV和NVP产生耐药。多因素Logistic回归分析结果显示,地区来源于龙州县（OR=3.392,95%CI：1.093~10.525）、基因亚型为08BC(OR=9.431,95%CI：3.296~26.985),更换过治疗方案（OR=2.662,95%CI：1.241~5.708）与检出基因型耐药密切相关。基因距离分析显示CRF01_AE>CRF08_BC>CRF07_BC;不同亚型中,耐药组基因距离均大于非耐药组。结论 广西边境部分地区HIV/AIDS 患者抗病毒治疗耐药率较高,且高度耐药占比较高,需加强合理用药、HIV耐药检测,提高患者服药依从性。     

海南省抗病毒治疗失败HIV/AIDS患者HIV-1亚型及基因型耐药分析

目的 了解海南省经艾滋病抗病毒治疗（antiretroviral therapy,ART）失败HIV/AIDS患者的HIV-1基因型耐药特点,为海南省HIV/AIDS患者有效抗病毒治疗提供基础依据。方法 采集2014—2019年ART治疗失败的患者血样进行基因型耐药检测,分析HIV-1毒株亚型与耐药突变特点。结果 172例治疗失败患者通过Pol基因区扩增及测序成功,其中男性150例（占87.21%）,年龄中位数为35.81（27.38,41.32）岁,未婚者102例（占59.30%）,性传播128例（占74.42%）,治疗前CD4⁺ T淋巴细胞中位数为225.93（73.00,328.25）个/µL;HIV-1毒株亚型为CRF01_AE 122例（占70.93%）,其次CRF07_BC亚型31例（占18.02%）。109例（63.37%）患者发生HIV-1低度以上耐药位点突变,非核苷逆转录酶抑制剂（NNRTI）耐药109例（占63.37%）;核苷逆转录酶抑制剂（NRTI）的耐药86例（占50.00%）,NRTI/NNRTI同时发生耐药86例（占50.00%例）;未发生蛋白酶抑制剂低度以上耐药位点突变。共检测出31种耐药位点,主要突变位点为M184V/I（38.95%）,Y181C/I/V/L（23.26%）,K65R（22.09%),V179D/E（20.93%）和K103N（19.77%）。对奈韦拉平（NVP）、依非韦伦（EFV）、拉米夫定（3TC）、替诺福韦（TDF）、齐多夫定（AZT）的高度耐药构成比依次是61.05%、50.00%、40.12%、12.79%、3.49%。扩增阳性者耐药构成比在性别、婚姻状况、传播途径、病毒亚型、基线CD4⁺ T淋巴细胞间差异均有统计学意义（P<0.05）。结论 海南省ART治疗失败患者中,以NNRTIs耐药为主,应加强监测治疗效果及耐药情况,以及时调整治疗方案和减少耐药的发生与传播。     

深圳市龙岗区老年HIV/AIDS人群流行病学特征及原发性耐药分析

目的 了解深圳市龙岗区新增确证≥50岁老年艾滋病病毒感染者（HIV）/艾滋病病人（AIDS）的流行病学特征及耐药状况,为制定老年艾滋病防控策略提供参考数据。方法 对龙岗区2016—2019年新报告≥50岁老年HIV/AIDS开展流行病学横断面研究,对随机选取的血清样本提取病毒RNA,采用巢式RT-PCR法扩增HIV-1 pol区基因片段并测序,以邻接法（Neighbor-Joining method, NJ）构建系统进化树确定基因亚型,并将测序结果上传至美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药分析。结果 龙岗区 2016—2019年新报告≥50岁HIV/AIDS数253例,2016—2018年各年≥50岁病例构成比分别为14.41%、17.34%、18.41,呈上升趋势。男性占比最高（77.47%,196/253）,外省户籍居多（71.54%,181/253）,传播途径以非婚异性传播为主（75.10%,190/253）。对扩增成功的48份pol基因序列分析共发现CRF01_AE、CRF07_BC、CRF55_01B、B及G 5种基因亚型,以CRF01_AE和CRF07_BC为优势亚型;4例感染者携带耐药突变位点,总耐药率为8.33%,8例感染者具有潜在耐药突变位点,。结论 深圳市龙岗区新增确证老年HIV/AIDS患者的原发性耐药率处于中度流行水平,且潜在耐药突变较高,有必要加强HIV耐药监测。     

云南省重点地区疟疾病例G6PD基因突变研究

目的 通过分析云南省间日疟病例G6PD基因特征,摸清病例G6PD基因分子流行病学分布,为云南省疟疾规范治疗提供技术参考。方法 收集2016年度云南省间日疟病例标本和病例流行病学史等信息,对照G6PD基因特征序列,采用聚合酶链式反应扩增目的基因片段,获得分析片段,对获取的片段进行电泳并进行序列测定。结果 使用MEGA及SPSS进行分析,分析位点突变率、群体间遗传分化指数及地区间突变差异情况。结果共计检测样本188份,基因主要突变类型为点突变（point mutation）,20280 C>T和1311 T>C突变率较高,突变率均为78.1%（147/188）,1311 T>C系沉默突变（silent mutation）,20280 C>T突变表现为单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism）;未发现A95G、G1376T和G1388A突变。通过比对,云南间日疟病例G6PD基因与GenBank G6PD基因遗传距离为0.00~0.028,1311突变型（T>C）与1311野生型遗传距离为0.021。腾冲市1311 T>C突变率为92%（23/25）,盈江县1311 T>C突变率为77.8%（102/131）,两者差异无统计学意义（P>0.05）。结论 云南省间日疟病例G6PD基因主要突变位点地区间差异不明显,现有的疟疾治疗方案不需要调整,但治疗时应密切关注药物性溶血的发生。     

辽宁省阜新市抗病毒治疗患者HIV-1 DNA耐药情况及亚型分析

目的 了解阜新市已接受HAART患者HIV耐药株的发生及基因亚型分布情况。方法 采集全血标本进行白细胞富集和前病毒DNA提取,巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因并测序,使用MEGA以及斯坦福大学HIV耐药数据库等工具对序列信息进行分析。结果 在112份全血标本中获得101例有效基因序列,CRF01_AE亚型占84.16%(85/101),CRF07_BC 亚型占8.91%(9/101),B亚型占3.96%(4/101),CRF65_cpx亚型占1.98%(2/101),G亚型0.99%(1/101);耐药分析显示27例患者发生耐药位点突变,其中,19例对核苷类逆转录酶抑制剂耐药,主要耐药突变位点为M184I/V,14例对非核苷类逆转录酶抑制剂耐药,主要耐药突变位点为G190S,对两类逆转录酶抑制剂同时耐药的样本有6例,尚未出现蛋白酶抑制剂耐药突变患者;治疗时间以及基线CD4水平的差异对耐药突变具有统计学意义。结论 阜新市HIV-1存在5种亚型,CRF01_AE为主要流行亚型;耐药情况的研究为更科学有效地指导艾滋病防治工作提供参考依据,应继续加强耐药监测,掌握基线数据,严防耐药株的流行。     

昆明地区HlV/HCV共感染人群基因型耐药突变的特点

目的了解云南省昆明地区接受高效抗逆转录病毒治疗(HAART)的人类免疫缺陷病毒(HIV)/丙肝病毒(HCV)共感染人群基因型耐药突变的发生情况及特点。方法收集云南省昆明地区接受HAART治疗的HIV/HCV共感染患者的临床信息及实验室资料,对病毒载量≥1 000拷贝/mL的HIV/HCV共感染患者进行基因型耐药检测,分析耐药突变位点及耐药发生情况。结果云南省昆明地区547例接受HAART治疗的HIV/HCV共感染患者中有335例患者发生病毒学失败。HAART治疗后病毒学失败的患者中发生基因型突变182例,占病毒学失败患者的54.3%(182/335),占接受HAART治疗HIV/HCV共感染患者人群的33.3%(182/547)。非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)以及蛋白酶类抑制剂(PIs)的突变率分别为48.6%(163/335)、36.1%(121/335)、13.4%(45/335)。NNRTIs耐药突变位点主要为K103N/S[26.6%(89/335)]、Y181C/I/V[12.5%(42/335)]、G190A/S/E[11.6%(... 更多     

广西使用阿片类毒品的HIV感染者耐药情况及其影响因素分析

目的探讨广西使用阿片类毒品的HIV感染者基因型耐药情况及耐药的影响因素。方法采用方便抽样的方式,募集使用阿片类毒品的HIV感染者230例,均成功扩增HIV pol区基因片段。分析使用阿片类毒品的HIV感染者耐药发生率、抗病毒药物的耐药情况及耐药位点,采用Logistic回归模型分析耐药的影响因素。结果 230例使用阿片类毒品的HIV感染者中36例发生耐药,耐药发生率为15.7%,非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药发生率为14.3%,核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)耐药发生率为3.5%,蛋白酶抑制剂(PIs)耐药发生率为1.3%。其中,NNRTIs耐药的相关突变位点主要为E138A、K103N、V106A/I/M,NRTIs耐药的相关突变位点主要为M184V/I,PIs耐药的相关突变位点主要为G73S。多因素Logistic回归分析结果显示,最近一次CD4⁺T细胞计数≥200个/μL是耐药发生的保护因素,无固定性伴侣是耐药发生的危险因素(均P<0.05)。结论使用阿片类毒品的HIV感染者耐药率处于高度流行水平,以NNRTIs和NRTIs耐药为主。要密...     

广西钦州市2016—2018年新报告HIV感染者不同基因型首次CD4+T细胞计数分析

目的 分析钦州市2016—2018年新报告HIV感染者的HIV基因型构成,比较感染者不同HIV亚型亚簇的首次CD4⁺T淋巴细胞计数（CD4）,为艾滋病防控工作提供数据支持。方法 选取艾滋病综合防治信息系统中钦州市2016—2018年新发现HIV感染者,对感染者血浆进行病毒RNA提取、逆转录扩增、测序和亚型亚簇判定。采用Kruskal-Wails H秩和检验比较三种主要HIV亚型感染者的首次CD4,采用Wilcoxon秩和检验比较两种主要HIV亚簇感染者的首次CD4。结果 本次研究共纳入1 666例HIV感染者。CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC三种主要亚型的构成比分别是56.7%（945/1 666）、9.3%（155/1 666）和27.4%（457/1 666）,其首次CD4的中位数（四分位数间距）[M（P₂₅,P₇₅）]分别是146（37,308）、254（181,375）和218（112,348）个/μL。CRF01_AE (Cluster 1)和CRF01_AE (Cluster 2)亚簇的构成比分别是10.4%（174/1 666）和42.0%（700/1 666）,其首次CD4的M（P₂₅,P₇₅）分别是185（43,344）、128（34,293）个/μL,CRF01_AE (Cluster 2)毒株同国内和越南的参考株成簇。CRF01_AE感染者的首次CD4低于CRF07_BC和CRF08_BC感染者(Z=-6.32, P<0.05; Z=-6.05, P<0.05);CRF01_AE（Cluster 2）感染者首次CD4低于CRF01_AE（Cluster 1）感染者（Z=-1.98, P<0.05）。结论 2016—2018年钦州市新报告HIV感染者基因亚型中以CRF01_AE为主,其首次CD4低于其他亚型;该亚型中Cluster 2亚簇构成比最大,其首次CD4低于Cluster 1亚簇;以Cluster 2为代表的CRF01_AE基因型毒株在当地造成的艾滋病流行危害大。     

四川地区HIV/AIDS患者基因亚型及传播性耐药现状研究

  目的  分析四川地区初治HIV/AIDS患者的HIV基因亚型分布特点和传播性耐药现状。  方法  纳入四川地区住院且无抗反转录病毒治疗（ART）药物暴露史的成年HIV/AIDS患者,采用In-house测序法进行HIV基因测序,系统进化树判定HIV基因亚型,美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线比对耐药突变位点并确定是否存在耐药及耐药种类、耐药水平。  结果  共纳入符合标准的120例患者,采集120份血液样本。87.5%样本HIV基因扩增成功（105/120）,HIV基因亚型分布特点:CRF01_AE占比46.67%（49/105）,CRF07_BC占比39.05%（41/105）,其他占比14.28%（15/105）。不同性别、年龄、民族、感染途径、耐药、HIVRNA水平、CD4水平等基因亚型的差异均无统计学意义（P>0.05）。25份样本检测到耐药突变位点（20.83%）,20份样本潜在耐药（16.67%）,5份样本传播性耐药（4.17%）。24份样本对非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）耐药,V179D/E位点突变频率最高,1份样本对蛋白酶抑制剂耐药,突变位点M46I,未发现核苷类反转录酶抑制剂耐药及整合酶抑制剂耐药。  结论  四川地区初治住院成年HIV/AIDS患者HIV基因亚型分布特点以CRF01_AE和CRF07_BC为主,传播性耐药率较低,以NNRTIs耐药为主。进行HIV基线耐药检测对制定有效ART方案具有重要意义。     

深圳市龙岗区新确证HIV/AIDS病例的亚型分布及耐药分析

目的 了解深圳市龙岗区新增确证艾滋病病毒感染者（HIV）/艾滋病病人（AIDS）的流行病学特征、HIV-1亚型分布及耐药株流行状况,为当地的艾滋病防控提供参考依据。方法 对深圳市龙岗区2016—2019年新报告HIV/AIDS病例开展流行病学横断面研究,按年分层随机抽取432例HIV/AIDS患者血清并提取病毒RNA,一步法逆转录PCR和巢式PCR法扩增HIV-1 pol区基因并测序,以邻接法（Neighbor-Joining method, NJ）构建系统进化树鉴定亚型,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药分析。结果 研究对象1 519例中男性占比最高（88.61%,1 346/1 519）,广东省以外户籍居多（66.16%,1 005/1 519）,同性传播比例多于异性传播,54.58%(829/1 519)新增病例的CD4+T淋巴细胞≥350个/μL。成功获得368份pol基因序列,共发现11种HIV-1基因亚型及17例独特重组型（URF）,优势亚型为CRF01＿AE和CRF07＿BC,其他包括CRF55＿01B、B亚型、CRF08＿BC、CRF 59＿01B,C亚型、G亚...     

重庆市新确证HIV-1感染者传播性耐药突变研究

目的 通过对重庆市新确证人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染者耐药基因型的研究,了解我市耐药病毒株的传播水平.方法 采集2014年5月至2017年6月我院新确证未治疗的HIV-1感染者的外周血175例,分离血浆后,使用一步法RT-PCR和巢式PCR扩增HIV-1 pol区的基因,PCR产物经纯化后测序,将获得的基因序列与美国雅培公司的耐药数据库对比,得出患者对药物的耐药性解释.结果 PCR扩增阳性且测序成功168例,发现16例患者存在耐药突变,传播性耐药突变检出率达9.5％ (16/168),其中2014-2017年的耐药比例分别为7.0％、8.0％、9.1％、12.5％,属中度流行.非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)和蛋白酶抑制剂(PIs)耐药突变率分别为9.5％、2.4％和0％.V179D/E(7.1％)和M184V(2.4％)分别是出现最多的NNRTI和NRTI耐药突变位点.168例感染者中,CRF07_BC亚型是主要流行亚型(42.8％),其次为CRF01_AE (38.7％)和CRF08_BC亚型(10.1％).结论 重庆市新确证未治疗HIV-1感染者耐药比例有逐年上升的趋势,应加强监测,预防原发性耐药和耐药毒株的传播.     

广西柳州1998—2018年新发现HIV阳性者基因亚型亚簇变化

目的 了解广西柳州1998—2018年新发现HIV阳性者基因亚型亚簇变化情况。方法 选取HIV阳性者,采集全血标本进行DNA提取、pol基因区扩增、测序和判定亚型。采用趋势卡方检验分析不同时间段亚型亚簇变化情况。结果 自2007年起检测发现CRF01_AE 的cluster 3和cluster 4两个亚簇,自2010年起检测发现CRF55_01B亚型。广西柳州地区流行的亚型、亚簇种类在增加。1998—2006年、2007—2009年、2010—2014年和2015—2018年这四个时间段,CRF01_AE亚型的构成比分别为95.3%（346/363）、96.7%（734/759）、94.8%（1 536/1 620）和88.0%（499/567）;CRF01_AE亚型cluster 1的构成比分别为93.4%（339/363）、91.8%（697/759）、89.3%（1 447/1 620）和79.5%（451/567）,趋势卡方检验表明CRF01_AE亚型和cluster 1感染者的构成比呈下降趋势（P<0.01）。CRF55_01B亚型在2010—2014年和2015—2018年分别发现为7和12人。结论 CRF01_AE为广西柳州市的主要流行亚型,但该亚型感染者的构成比有下降趋势;该地区CRF01_AE亚型中亚簇和HIV亚型种类的增加,提示可能存在新的HIV毒株传入。     

南宁市静脉注射吸毒人群HIV-1基因亚型及耐药性分析

目的 了解南宁市静脉注射吸毒人群（IDUs）中HIV-1流行基因亚型及其耐药性,为辖区艾滋病防治策略制定提供科学依据。方法 收集2017年南宁市静脉注射吸毒人员HIV感染者血浆样本总共68份,提取病毒核糖核酸(RNA),通过巢式PCR对HIV pol基因片段进行扩增测序,构建系统进化树进行基因分型,并将序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库分析,利用pol基因测序结果分析HIV-1亚型和耐药性情况。结果 68份血浆样本中巢式PCR成功扩增基因片段62份,系统进化分析显示检出3种HIV-1重组基因亚型, CRF_01-AE亚型占72.6% (45/62)、CRF_07-BC亚型占12.9% (8/62)、CRF_08-BC亚型占14.5% (9/62) ,CRF01_AE 型为主要流行亚型。χ²检验分析显示在性别、年龄、民族、婚姻4个人口学特征中62份样本HIV-1亚型组成差异无统计学意义（P>0.05）。62份样本中3例CRF_08-BC亚型发现T69S耐药突变,1例CRF_01-AE亚型发现L210W突变,1例CRF_07-BC亚型发现A71V突变。结论 南宁市IDUs人群HIV-1感染者中至少存在3种HIV-1基因亚型流行,CRF_01-AE重组型为优势流行株,研究中出现的耐药突变位点为低度耐药突变位点,应密切监视其流行趋势。