一种快速检测 HbCS和 HbQS点突变的 PCR新方法

【目的】建立一种快速的PCR基因诊断方法,用以检测中国人常见的非缺失型α地中海贫血HbCS和HbQS。【方法】根据突变扩增系统(ARMS)的基本原理,自行设计了一套含4条等位特异性引物的PCR反应体系(4P-ASPCR法),分别用以检测中国人常见的HbCS和HbQS的点突变类型。通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析法和DNA序列分析对检测结果进行验证。【结果】该方法检测到的HbCS突变、HbQS突变,与PCR-酶解法和DNA序列分析得出的结果一致。【结论】该新型PCR法检测HbCS和HbQS点突变快速、准确,适于推广应用,该设计思路亦可用于检测其它点突变。     

应用DNA单链分子内杂交-聚丙烯酰胺凝胶电泳检测β-地中海贫血点突变

目的：建立一种简便有效的检测已知β-地中海贫血点突变的非同位素方法。方法；应用DNA单链分子内杂交-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法检测11种已知的β-地中海贫血基因点突变。结果：11种β-地中海贫血基因点突变均被分子内杂交聚丙烯酰胺凝胶电泳方法检出。结论：分子内杂交聚丙烯酰胺凝胶电泳是一种简便且特异性较高的点突变检测方法，适用于β-地中海贫血点突变的检测。     

一例β－地中海贫血基因的分子克隆及其突变位点的检测

以一例重症β＋地中海贫血患儿的脾ＤＮＡ组建了λ噬菌体Ｃｈａｒｏｎ２８基因文库。经β－珠蛋白基因组探针筛选出阳性克隆珠，提取其重组体ＤＮＡ，取其ＢａｍＨＩ／１．８ｋｂ片段，次级克隆至Ｍ１３ｍＰ１８。制备的单链Ｍ１３ｍｐ１８重组体ＤＮＡ经正常与异常的寡核苷酸探针杂交证明该患儿的β地中海贫血基因为β－珠蛋白基因的—２８Ａ→Ｇ突变体。     

荧光多重PCR对α地中海贫血的基因诊断

目的：建立一种快速、灵敏的α地中海贫血诊断方法。方法：应用荧光引物对正常人和患者进行多重PCR，同时扩增α1和α2珠蛋白基因和内对照β肌动蛋白(α—actin)，用Perkin E1mer ABI PBISM^TM 377 DNA Sequencer自动分析结果，并对所得救据进行统计。用连锁分析的方法PCR扩增同一批模板α2珠蛋白基因上游的(CA)n，跑变性胶并将结果与前一种方法对照。结果：荧光多重PCR自动分析和扩增(CA)n连锁分析得出的结论与实际情况完全相符，结果判断容易。结论：荧光多重PCR法灵敏、简便，单管内就能完成，适合运用于α地中海贫血的快速诊断，并有可能运用于移植前诊断和母体外周血分离胎儿有核红细胞产前诊断。     

用一对错配引物进行的PCR/酶解法检测β-地中海贫血-28(A→G)突变

1989年Haliassos等首先报道用误配碱基引物PCR检测点突变。其基本原理是,一个引物3′末端紧邻突变点,3′末端或近3′末端引入一个错配碱基,介导突变产物在此产生某内切酶酶切序列,而正常模板的PCR产物无该酶切序列;另一引物不含错配碱基。问题是当内切酶用量太少或失活时,突变模板PCR产物不能彻底酶解或完全不被酶解,易造成判一断错误。为避免上述情况,保证检测结果准确可靠,作者研究设计了用一对错配引物检测点突变方案,并     

多重PCR反应检测三种常见缺失型α地中海贫血的意义

目的:探讨单管多重PCR体系,检测东南亚缺失(-S-EA)、右侧缺失(3-.7)和左侧缺失(4.-2)地中海贫血的意义。方法:采用单管多重PCR技术对166例考虑α地中海贫血和2例羊水进行检测。结果:166例考虑α地中海贫血中检测出60例右缺失血红蛋白H病(3.-7/-S-EA/)占37.5%,48例左缺失血红蛋白H病(4-.2/-S-EA)占30%,32例东南亚缺失(-S-EA)占20%,右侧缺失(3.-7)18例占11.25%,左侧缺失(4.-2)12例占7.5%,正常(αα/αα)18例占11.25%.2例羊水中1例为Hb B art’s胎儿水肿(--/--),另1例为东南亚缺失。结论:该体系能同时快速检测三种常见缺失型α地中海贫血,可作为临床疑诊病例的基因诊断和产前诊断。     

毛细管电泳技术快速检测p53基因点突变

目的：探讨利用毛细管电泳技术快速检测p53基因点突变的临床应用价值。方法：采用毛细管电泳作SSCP分析，检测20例结肠癌肿瘤标本p53基因第7外显子PCR扩增产物，并与传统的聚丙烯酰胺凝胶电泳结果进行比较，最后用DNA序列测定判断其准确性。结果：20例结肠癌标本中，毛细管电泳技术检测出5例标本(Ca4，Ca6，Ca7，Ca8，Ca14)有突变，而凝胶电泳结合银染技术仅检出4例标本(Ca4，Ca6，Ca7，Cal4)有突变，测序证实经毛细管电泳所检出的5例标本均存在点突变。结论：对于PCR产物的单链构象多态性分析，毛细管电泳技术是一种更加快速、简便、敏感的方法，可应用于临床筛查基因点突变。     

应用反向点杂交法检测α-地中海贫血点突变

目的建立一种临床上切实可行的非缺失型α-地中海贫血基因检测方法。方法中国人常见的非缺失α-地中海贫血为αCSα、αQSα、αWSα3种类型,针对此3个位点设计特异性带有生物素标记的引物进行PCR扩增,扩增产物与固定在膜条上的寡核苷酸探针进行杂交,并通过一系列显色反应分析结果。结果分别分析3种突变类型的正常及突变位点信号,明确检测样品在3个位点是否发生了突变,及是否为突变纯合子或杂合子,验证了该方法可诊断非缺失型!-地中海贫血点突变。结论该检测方法结果可靠,且简便易行,对实验室仪器设备要求不高,适合于在临床推广。     

应用反向点杂交法检测α-地海贫血点突变

目的 建立一种临床上切实可行的非缺失型α-地中海贫血基因检测方法.方法 中国人常见的非缺失α-地中海贫口血为αCSα、αQSα、αWSα 3种类型,针对此3个位点设计特异性带有生物素标记的引物进行PCR扩增,扩增产物与同定在膜条上的寡核苷酸探针进行杂交,并通过一系列显色反应分析结果.结果 分别分析3种突变类型的正常及突变位点信号,明确检测样品在3个位点是否发生了突变,及是否为突变纯合子或杂合子,验证了该方法可诊断非缺失型α-地中海贫血点突变.结论 该检测方法结果可靠,且简便易行,对实验室仪器设备要求不高,适合于在临床推广.     

一个携带罕见β—地中海贫血突变家系的分子诊断

用反向点杂交法对临床诊断的１例重症β－地中海贫血患及其家庭成员进行了基因分析。在该家庭中检出两种中国人罕见的β－地贫突变，基因型分别为：先证者，ＣＤ２７－２８（＋Ｃ）／ＣＤ４３（Ｇ→Ｔ）；父，ＣＤ４３（Ｇ→Ｔ）／Ｎ；母，ＣＤ２７－２８（＋Ｃ）／Ｎ；胞组，Ｎ／Ｎ（正常）。这两种突变经ＰＣＲ－限制酶谱分析法进一步证实；ＣＤ２７－２８（＋Ｃ）突变为国内首次报道。     

荧光PCR快速检测艰难梭菌

艰难梭菌（clostridium difficile,CD）又称难辨梭状芽孢杆菌,是一种厌氧革兰染色阳性芽孢杆菌,广泛分布于自然环境及动物和人的粪便中,主要通过粪-口途径传播[1-2]。艰难梭菌是引起医源性腹泻的重要病原菌,与大量抗生素使用有关,     

一种用于脓毒症快速检测的多重PCR检测体系构建

目的：建立一种基于多重实时荧光定量聚合酶链反应（multiple real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,多重PCR）技术的检测体系,快速、特异检测脓毒症患者血液中的病原菌。方法：分析血液标本分离菌主要菌种分布,绘制脓毒症特异性病原微生物谱。同时根据保守区序列设计特异性引物,构建多重PCR检测反应体系。收集脓毒症患者静脉全血样本79例,健康体检者样本（阴性样本）40例,用所建立的检测体系进行鉴定,并与血培养方法比较。结果：多重PCR法缩短检出时间至3 h,是血培养法的1/16。多重PCR法对目标病原菌样本符合率为88%(22/25),阴性样本符合率为100%(20/20),总符合率为94%,2种方法对目标病原菌的检出差异无统计学意义（P=0.250）,且一致性良好（Kappa=0.867,P<0.05）。多重PCR法与血培养法对临床诊断脓毒症样本的检出率分别为23.0%(17/74)及14.9%(11/74),2种方法间检出率差异有统计学意义（P=0.031）。结论：与经典的“金标准”血培养法相比...     

荧光PCR快速检测从业人员肠道致病菌结果分析

目的了解荧光PCR快速检测从业人员肠道致病菌效果。方法采集从业人员肛拭子样本用实时荧光PCR法检测沙门氏菌和志贺氏菌,检出的疑似阳性样本按国标法进行培养鉴定,分析荧光PCR检测方法的阳性检出率。结果采用实时荧光PCR方法共检测从业人员77 476人次,其中沙门氏菌阳性71例,阳性率0.916‰,志贺氏菌阳性62例,阳性率0.80‰。肠道致病菌合计阳性133例,阳性率1.717‰。结论荧光PCR快速检测方法用于从业人员体检,具有沙门氏菌、志贺氏菌的阳性检出率高、省时的效果。     

PCR-DGGE技术检测β珠蛋白外显子Ⅰ及相邻片段突变的研究

目的 建立用于分析β珠蛋白基因外显子1及相邻片段突变的变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术。方法 应用巢式PCR扩增20例β地贫病人的β珠蛋白基因外显1及相邻片段，通过垂直DGGE及time—travel DGGE确定并优化平行DGGE条件，然后对样本进行平行DGGE分析。结果 20例样本β珠蛋白外显子1及相邻片段上的三种突变均能被检出。结论 所建立PCR—DCGE技术可用于准确检测β珠蛋白基因外显子1及相邻片段突变。     

用一对错配引物进行的PCR／酶解法检测β-地中海贫血-28（A→G）突变

1989年Haliassos等首先报道用误配碱基引物PCR检测点突变。其基本原理是，一个引物3’末端紧邻突变点，3’末端或近3’末端引入一个错配碱基，介导突变产物在此产生某内切酶酶切序列，而正常模板的PCR产物无该酶切序列，另一引物不含错配碱基。问题是当内切酶用量太少或失活时，     

GAP—PCR技术快速对α—地贫血基因诊断方法的研究

目的：建立跨越断裂点的PCR技术（也称裂口PCR,gap-PCR)为α-地贫血基因诊断提供良好的方法。方法：应用gap-PCR技术对382例病人进行α-地贫血基因诊断,扩增产物带出现1053bpDNA片段时表示为α类珠蛋白基因型（aa/aa),出现743bpDNA片段增带时表示为缺失型HHugm -/--SEA）,若样品为胎儿则为Barts水肿综合症（）－SEA－SEA）,同时出现1053bp和743bp两个DNA片段的扩增带表示为a-地贫杂合子（－－SEA／aa).结果：382例人中,325例为正常基因型（aa/aa),49例为a-地贫杂合子（－－SEA／aa),8例为缺血失型HbH病（a--/SEA),结论：gap-PCR技术应用于a-地中海贫血的血液学筛查具有简便,快速,准确的特点,它可代替Southern blotting成为筛查的常规方法。     

重组PCR快速基因定点突变的技术方法

聚合酶链式反应(PCR)是由Mullis等联合研制的一种在体外快速对特定DNA序列扩增的技术[1]。本研究通过重组PCR技术对growth associated protein-43(GAP-43)基因Ser41(丝氨酸)AGC定点突变为Ala41(甘氨酸)GCC,此方法比传统的体外基因突变技术更简单、快速而且经济。1材料和方法1.1     

荧光定量PCR在结核菌快速检测中的应用分析

目的探讨荧光定量PCR在结核菌快速检测中的应用效果。方法选取安阳市结核病防治所2014年6月至2014年12月就诊的100例呼吸系统疾病患者(临床阳性痰分离株100份),应用荧光定量PCR技术检测。结果荧光定量PCR检测准确率为97%,菌种鉴定特异性实验符合率为100%。结论结核菌快速培养法如荧光定量PCR技术经济、简单,结果可靠,特异度和敏感性均居较高水平,鉴别诊断能力较强,实验室可据自体条件对不同的检测方法进行选择。     

改良分子信标-实时PCR快速检测霍乱弧菌

目的：建立改良分子信标-实时PCR检测霍乱弧菌的快速方法，应用于霍乱监测。方法：根据GenBank公布的霍乱弧菌肠毒素基因A亚单位(ctxA)的保守序列，设计一对引物和改良分子信标探针，并进行特异性和灵敏度分析；同时以11种细菌作对照，建立改良分子信标检测霍乱弧菌的实时PCR反应体系，应用于霍乱监测。结果：霍乱弧菌改良分子信标检测体系检测12种细菌，只有霍乱弧菌有荧光信号，与其他细菌无交叉反应，DNA灵敏度为102．4fg／ul，菌液灵敏度为32cfu／ml或3cfu／PCR反应体系。对100份海产品和30份腹泻病人大便标本进行检测，结果都为阴性。检测时间仅需2h。结论:改良分子信标-实时PCR检测体系快速、灵敏度高、特异性强，可用于霍乱的快速诊断，为霍乱的分子流行病学调查提供新的检测手段。