基于网络药理学和分子对接探讨杜仲-牛膝药对治疗强直性脊柱炎机制

目的 运用网络药理学和分子对接探讨杜仲-牛膝药对治疗强直性脊柱炎(AS)的关键靶点和分子机制。方法 利用TCMSP数据库检索杜仲-牛膝药对的活性成分，预测其对应靶点；利用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD、PharmGkb数据库检索AS疾病相关靶点，利用Uniprot数据库将预测靶点和疾病靶点名称标准化后筛选出交集靶点，利用Cytoscape3.9.1绘制并分析中药-成分-靶点-疾病网络图。将共同靶点导入STRING数据库获得蛋白质互作网络并利用CytoNCA筛选出核心靶点。将共同靶点导入富集分析库(Metascape)数据库进行GO、KEGG富集分析。利用Auto Dock Tools1.5.7软件进行分子对接。结果 杜仲-牛膝有效活性成分35个，预测对应靶点150个，疾病相关靶点1914个，主要活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、汉黄芩素，核心靶点为白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素1β(IL-1β)、前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、C-X-C基序趋化因子配体8(CXCL8)。富集分析方面：...     

基于网络药理学和分子对接探讨“黄连-茵陈”治疗慢性萎缩性胃炎机制

目的 基于网络药理学和分子对接研究探讨“黄连-茵陈”药对治慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制。方法 在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中检索获得“黄连-茵陈”药对的活性成分、作用靶点及分子结构，建立数据集，再通过GeneCard、CTD、TTD数据库筛选CAG疾病靶点，与“黄连-茵陈”药对活性化合物作用靶点取交集，利用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络，利用STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，通过聚类分析获取核心成分与核心靶点，利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，最后利用AutoDok Tool、Pymol软件将核心靶点与核心成分进行分子对接验证。结果 经筛选获得“黄连-茵陈”药对活性化合物26种，筛选后活性化合物对应靶点86个，CAG靶点639个，“黄连-茵陈”活性化合物成分与CAG交集靶点38个，核心成分为槲皮素、异鼠李素、β-谷甾醇等，高于平均Degree值的靶点蛋白有白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、Ju...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨归芍地黄汤加减方治疗抽动秽语综合征的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术结合体内实验验证,探讨归芍地黄汤加减方治疗抽动秽语综合征（Tourette syndrome,TS）的作用机制。方法 通过检索TCMSP和BATMAN-TCM数据库获得归芍地黄汤加减方的活性成分及作用靶点,检索GeneCards和OMIM数据库获得TS疾病相关靶点,将二者靶点取交集,得到交集靶点。利用Cytoscape软件构建活性成分-靶点网络,并对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）及网络拓扑分析。利用R语言软件及相关程序包对交集靶点进行基因本体（geneontology,GO）功能及京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析,对网络拓扑分析后筛选出的关键靶点进行分子对接,并通过动物实验对关键靶点和信号通路进行验证。结果 筛选得到归芍地黄汤加减方治疗TS的活性成分8个,交集靶点32个。主要活性成分包括槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、异鼠李素,关键靶点包括白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-...     

基于网络药理学探讨金银花治疗2019-nCoV感染合并心肌炎的作用机制

目的：通过网络药理学方法预测中药金银花治疗新型冠状病毒(2019-nCoV)感染合并心肌炎的潜在关键靶点和通路,为新药研发及临床应用提供参考。方法：利用TCMSP数据库和UniPort数据库检索并规范金银花的药物成分和药物靶点,GeneCards、pharmGKB等数据库得到疾病靶点,通过Venn图获得药物与疾病的交集靶点。将交集靶点上传至STRING数据库对其进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图,对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,将主要活性成分与血管紧张素转化酶II(ACE2)和新型冠状病毒3C样蛋白水解酶(SARS-CoV-2 3CL)进行分子对接。结果：获得金银花作用于2019-nCoV感染合并心肌炎的7种活性成分和50个作用靶点,涉及509个生物学进程和148条通路。其活性成分木犀草素、槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等通过调节丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、趋化因子配体2(CCL2)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10(IL-10)等关键靶点治...     

基于网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用

目的 采用网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索黄芩主要活性成分和作用靶点，通过OMIM、GeneCards、TTD及DrugBank等数据库筛选糖尿病和阿尔茨海默病的主要靶点，构建活性成分-靶点网络；利用STRING 11.0进行蛋白质互作分析，构建PPI网络以筛选重要靶点；运用Metascape库对关键交集靶点进行GO和KEGG富集分析；利用Cytoscape 3.7.2将分析得到的重要靶点和通路构建药物成分-疾病靶点-通路网络；进一步对关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果 筛选出黄芩重要活性成分有汉黄芩素、黄芩素、金合欢素、降穿心莲黄酮等，PPI网络中关键交集靶点61个，核心靶点有AKT1、IL-6、MAPK14、TNF、PRKCA、VEGFA等。GO富集分析得到细胞组成101条，分子功能76条，生物过程1 413条；KEGG通路富集分析得到258条，主要涉及AGE-RAGE信号介导的糖尿病并发症通路、IL-17、MAPK、TNF、PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗通路等。分子对接结果可知，汉黄芩素、金合欢素、黄芩素、红...     

葛根芩连汤异病同治牙周炎与溃疡性结肠炎的网络药理学及分子对接研究

目的：运用网络药理学及分子对接技术探讨葛根芩连汤异病同治牙周炎和溃疡性结肠炎的作用机制。方法 :通过TCMSP数据库挖掘葛根芩连汤化学成分及作用靶点;利用GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库获取两种疾病靶点,对上述预测所得活性成分作用靶点及疾病相关靶点利用微生信绘图工具绘制Venn图取交集,获得药物与疾病共同作用靶点;基于Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-靶点网络,利用STRING数据库分析共有靶点,建立蛋白互作网络(PPI)并进行可视化分析,在DAVID数据库对共有靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用AutoDock Tools软件对药物核心成分及关键靶点进行分子对接。结果：葛根芩连汤通过槲皮素、β-谷甾醇等核心成分作用于肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等关键靶点,发挥抗氧化应激、抗细胞凋亡、调节糖脂代谢作用,涉及晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、癌症通路等;分子对...     

基于网络药理学和免疫浸润探讨荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的作用机制

目的：通过网络药理学和免疫浸润探讨中药荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的作用机制。方法：通过TCMSP、TCMIP数据库查找荜茇主要化学成分及其作用靶点；通过GeneCards、OMIM、TTD数据库收集血吸虫病及肝细胞癌相关靶点，构建“药物-成分-靶点”和“成分-靶点-通路”网络图，对药物和疾病的交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析；通过R语言对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析；通过GEPIA和UALCAN数据库对潜在靶点进行表达差异及生存预后分析；通过TIMER数据库对核心靶点进行免疫浸润分析。结果：获得荜茇抗血吸虫病及肝细胞癌潜在靶点11个，其中肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10(IL-10)、环加氧酶2(PTGS2)等可能是荜茇发挥作用的潜在靶点；KEGG通路富集主要涉及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、C型凝集素受体信号通路等，生物信息学结果表明葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)可能在荜茇治疗血吸虫病相关肝细胞癌过程中发挥重要作用。结论：本研究初步预测了荜茇...     

基于网络药理学与分子对接探讨青风藤干预膝骨关节炎的作用机制

目的：应用网络药理学与分子对接技术探讨青风藤治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制。方法：从TCMSP数据库中提取青风藤的化学成分，获得药物靶点及疾病相关基因，筛选交集靶点，获得青风藤治疗KOA的作用靶点。对交集靶点及相关信号通路利用数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过分子对接平台进行分子对接。结果：获得青风藤化合物主要化学成分6种、疾病基因643个、药物与疾病交集靶点11个。网络分析结果显示，青风藤通过调控肿瘤信号通路、糖尿病并发症中的糖基化终末产及其受体信号通路(AGE-RAGE)、细胞凋亡信号通路、肿瘤抑制蛋白p53信号通路(p53)、血清素突触信号通路等作用于前列腺素G/H合酶1(PTGS1)、前列腺素-内过氧化物酶合酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、转化生长因子β-1前蛋白(TGFB1)、胱天蛋白酶3(CASP3)等关键靶点，通过干预细胞凋亡、抑制炎症等发挥治疗KOA的作用。分子对接结果显示，青风藤核心成分β-谷甾醇(beta-sitosterol)、青藤碱(Sinome...     

基于网络药理学和分子对接研究牡丹皮-丹参药对治疗银屑病的作用机制

目的：本文借助计算机网络药理学和分子对接技术预测牡丹皮、丹参治疗银屑病的潜在分子作用机制。方法：首先将中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)平台筛选到的疾病和药对成分靶点取交集,获得交集靶点后进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,利用Cytoscape 3.8.2构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络和“成分-靶点-通路”图,最后使用Schr9dinger Maestro 11.8进行分子对接试验。结果：共得到牡丹皮、丹参治疗银屑病的活性成分58个和靶点95个,主要参与脂多糖应答、炎症反应、营养水平、氧化应激等方面的生物过程,调控白细胞介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)、辅助性T17(Th17)细胞分化、缺氧诱导因子-1(HIF-1)等信号通路。分子对接结果证实主要活性成分和核心靶点亲和力高。结论：牡丹皮-丹参配伍可从多成分、多靶点、多通路治疗银屑病。     

基于网络药理学和分子对接探讨桂枝茯苓丸“异病同治”多囊卵巢 综合征和子宫内膜异位症的作用机制

探讨桂枝茯苓丸治疗多囊卵巢综合征（PCOS）和子宫内膜异位症（EMT）的异病同治作用机制。【方法】利用 TCMSP获取桂枝茯苓丸组成中药的活性成分及相关靶点。通过GeneCards、PharmGKB、TTD数据库分别筛选PCOS和EMT疾 病靶点。使用R软件中的Venn R包获取药物与疾病的交集靶点后绘制Venn图,在Cytoscape中制作药物-活性成分-潜在靶点 互作网络图,STRING平台中绘制交集靶点蛋白互作网络（PPI）图,Cytoscape对PPI网络进行优化并筛选核心靶点。应用R语 言进行基因本体论（GO）富集和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,AutoDockTools进行分子对接。【结果】获得桂 枝茯苓丸85个活性成分及191个相应靶点,桂枝茯苓丸治疗PCOS、EMT的潜在靶点77个。桂枝茯苓丸治疗PCOS、EMT的 核心活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、常春藤皂苷元、黄芩素,核心靶点为AKT1、EGFR、IL-6、TNF、TP53。GO 功能分析获得2 020个生物过程、34个细胞成分、126个分子功能,KEGG富集分析得到165条信号通路。分子对接显示该方 中核心成分与靶点对接良好。【结论】桂枝茯苓丸可能通过槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、常春藤皂苷元、黄芩素,调节脂质 和动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化、化学致癌-受体激活等信号通路,作用于靶点 AKT1、EGFR、IL-6、TNF、TP53,从而“异病同治”PCOS和EMT。     

药对“虎杖-土茯苓”治疗痛风性关节炎的网络药理学研究

目的:采用网络药理学、分子对接技术预测药对"虎杖-土茯苓"治疗痛风性关节炎(gouty arthritis,GA)的潜在机理。方法:利用TCMSP平台检索收集药对化学成分、对应靶点;借助五大疾病数据库获取GA已知靶点;利用Venny 2.1.0得到药对与GA两者间的交集靶点;运用SRTING数据库、CytoHubba插件构建交集靶点PPI网络;采用DAVID平台对交集靶点进行GO、KEGG通路富集分析;最后将筛选出的核心成分、关键靶点进行分子对接。结果:共获得23个化学成分,199个靶点,其中治疗GA的潜在靶点有76个。预测得知核心成分为槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇,关键靶点为JUN、TNF、RELA、IL6。GO功能富集分析显示,药对治疗GA的生物功能共287个(生物过程172个、细胞组分42个、分子功能73个);KEGG通路富集共筛选出信号通路共122条。分子对接结果显示,槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇与JUN、TNF有良好的结合活力。结论:药对"虎杖-土茯苓"通过槲皮素、木犀草素等成分,作用于JUN、TNF等靶点,在癌症通路、TNF信号通路等通路的参与下,发挥了抗炎、抗凋亡等治疗GA的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨苏叶黄连枳实治疗慢性肾功能衰竭的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接探讨苏叶黄连枳实治疗慢性肾功能衰竭（Chronic Renal Failure,CRF）的作用机制。方法：检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选药物有效成分,利用Swiss Target Prediction预测其潜在靶点。利用Gene Cards、OMIM及Drugbank检索CRF靶点,通过Venny获取药物有效成分作用靶点与疾病基因靶点的交集。利用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用Metascape进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,利用Autodock对有效成分与关键靶点行分子对接。结果：苏叶黄连枳实治疗CRF的核心有效成分为槲皮素、木犀草素等,核心靶点为白细胞介素（Interleukin,IL）-6、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）、IL-1β等。共得到1 288个GO富集结果,232条KEGG通路,通路涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体信号通路、癌症通路等。分子对接结果显示有效成分与关键靶点的结合能均<0。结论...     

基于网络药理学方法预测定喘汤治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制及验证研究

目的：分析定喘汤治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的分子机制,并通过细胞实验验证定喘汤的药理学作用。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库中,对定喘汤9味中药进行有效成分筛选,利用UniPort数据库得到中药活性成分相关靶点。随后在五大疾病数据库中以COPD作为关键词进行检索,收集疾病对应的靶点基因。对有效成分-交集靶点网络进行拓扑分析,根据中药有效成分与交集靶点之间连接情况筛选定喘汤治疗COPD关键成分。最后通过基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析确定定喘汤治疗机制并进行分子对接,从整体生物网络角度阐述定喘汤治疗COPD的免疫炎症机制,并通过细胞实验加以验证。结果：本实验筛选得到定喘汤274个活性成分,与疾病交集靶点262个。KEGG富集分析表明核心靶点作用于白细胞介素-17(IL-17)信号通路、NOD样受体信号通路及趋化因子信号通路等多种免疫和炎症反应相关的信号通路,分子对接显示核心化合物与靶点具有良好的对接活性。细胞实验表明,定喘汤能通过磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路,抑制人Ⅱ型肺泡上皮细胞炎症反应,...     

基于网络药理学和分子对接探讨补元汤治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机理

目的：应用网络药理学和分子对接技术探讨补元汤治疗慢性阻塞性肺疾病（Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD）的作用靶点及分子机制。方法：采用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和HERB数据库收集补元汤的化学成分及可能的相关靶点,从GeneCards、TTD、DrugBank及DisGeNET数据库中获得COPD相关靶点,两者取交集获得补元汤治疗COPD的共同靶点;利用Cytoscape 3.8.2建立药物-化学成分-共同靶点-疾病网络图;STRING 11.5数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络及提取关键靶点;Metascape数据库通过对关键靶点基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析,建立补元汤治疗COPD靶点-信号通路网络;最后通过AutoDockTools 1.5.6软件实现对化学成分和关键靶点分子对接。结果：从补元汤中共获得116个化学成分,预测靶点2 108个,其中与COPD有关靶点为872个,两者共同靶点有122个。槲皮素、豆甾醇、山柰酚等是补元汤主要化学成分,白细胞介素（Inter...     

龙胆泻肝汤治疗特应性皮炎可能的分子机制及生物学过程

目的：利用网络药理学探索龙胆泻肝汤治疗特应性皮炎的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和BATMAN-TCM数据库挖掘龙胆泻肝汤的有效成分和作用靶点,利用CTD数据库筛选疾病靶点。将药物与疾病的交集靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,运用Cytoscape 3.7.2构建“疾病-药物-靶点-基因”四维网络,借助DAVID数据库对靶点进行基因本体论（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最终使用Auto Dock进行分子对接验证。结果：从龙胆泻肝汤中筛选出有效成分195个、作用靶点328个,其中与特应性皮炎疾病密切相关的靶点79个。经筛选,GO功能富集分析得到条目295个,KEGG通路富集分析得到信号通路86条。分子对接结果显示复方活性成分与核心靶点结合程度较好。结论：龙胆泻肝汤治疗特应性皮炎主要通过槲皮素、山柰酚、豆甾醇等活性化合物作用于白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、前列素内环氧化物合成酶2(Prostaglandin-endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、丝裂原激活蛋白激酶（Mito...     

基于网络药理学与分子对接探讨肝胃百合汤治疗胃食管反流病的作用机制

目的：基于网络药理学与分子对接技术分析肝胃百合汤治疗胃食管反流病(GERD)的作用机制。方法：运用TCMSP数据库获取肝胃百合汤的活性成分及作用靶点,通过OMIM、DisGeNET、DrugBank数据库检索GERD相关靶点,确定肝胃百合汤治疗GERD的潜在靶点。利用Cytoscape软件构建“中药-有效成分-靶点”网络,筛选核心成分及关键靶点。利用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点。利用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用AutoDock软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。结果：肝胃百合汤治疗GERD的核心成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、汉黄芩素、丹参酮IIA等;重要治疗靶点包括前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)等;信号通路主要涉及细胞增殖、炎症反应、癌症相关等通路。PTGS2可能是肝胃百合汤治疗GERD的重要靶点,分子对接结果显示PTGS2与核心化合物具有较强结合能力。结论：肝胃百合汤可能通过多成分、多靶点、多通路作用于GERD...     

基于网络药理学探究王琦院士治疗精液不液化核心组方的作用机制及实验验证

目的：利用网络药理学和分子对接技术探究核心组方治疗精液不液化的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Uniprot数据库对王琦院士的核心组方药物进行成分和靶点的处理收集,再借助Gene Cards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)对疾病靶点进行收集,与药物靶点取“药物-疾病”交集,获得核心靶点,使用String数据库绘制核心靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。运用R语言平台进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,构建核心组方“成分-靶点-疾病”通路图。对关键成分与核心靶点进行分子对接,最后通过造模和药物对大鼠进行干预后,利用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测各组大鼠前列腺中细胞因子水平,实时荧光定量-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测IL-17mRNA的表达量,对核心作用靶点及信号通路进行动物实验验证。结果：核心组方中有活性成分29个,对应靶点194个,与疾病靶点交集靶点24个,关键成分有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等,核心靶点涉及肿瘤坏死因子(TNF)、纤溶酶原激活物抑制因子(SERPINE1)、白细胞介素...     

基于转录组学与网络药理学探讨补中益气丸治疗慢性阻塞性肺疾病的机制

目的探索补中益气丸治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的分子机制。方法在TCMSP中获取补中益气丸活性成分及靶点;以GEO数据库为主,OMIM数据库为辅获取疾病靶点,使用R软件映射出药物-疾病共同靶点。通过Cytoscape 3.7.2绘制药物-成分-共同靶点-疾病网络图,以及基于共同靶点的PPI网络拓扑分析图。使用R软件对共同靶点进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析,并利用KEGG通路富集分析结果构建通路-靶点网络图。最后对活性成分及靶点进行分子对接验证。结果共获得163个补中益气丸活性成分及225个可用于后续分析的靶点,1313个COPD靶点,映射得出药物-疾病共同靶点20个。分析得出补中益气丸治疗COPD主要有槲皮素、山柰酚、豆甾醇等活性成分;涉及δ-阿片受体1(OPRD1)、白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素10(IL-10)、表皮生长因子受体(EGFR)、窖蛋白1(CAV1)、热休克蛋白B1(HSPB1)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶8(CASP8)等作用靶点。GO分析提示主要与氧化应激反应相关;KEGG分析提示主要与肿瘤坏死因子、Toll样受体、低氧诱导因子-1、叉头盒O、Janus激酶-转录激活因子等信号通路有关。最后,分子对接结果证实了活性成分与靶点具有较好的结合能力。结论补中益气丸治疗COPD的分子机制可能是以抗炎与抗氧化应激为核心,兼顾调节免疫、低氧耐受、气道黏液高分泌与保护血管内皮细胞多方面。     

黄芪活性成分抗衰老作用机制的网络药理学研究

目的:运用网络药理学方法探讨黄芪抗衰老的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得黄芪化学成分,以生物利用度(OB)、类药性(DL)为条件筛选主要活性成分;利用TCMSP和PharmMapper数据库预测黄芪活性成分靶点;在OMIM数据库和GeneCards数据库中输入关键词"aging",搜索与衰老相关的疾病靶点;借助Cytoscape 3.2.1软件构建"药物-疾病-靶点"的可视化网络;通过STRING网站构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并筛选核心靶点;通过CB-Dock网站对成分与靶点进行分子对接验证;应用DAVID数据库对靶点进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:筛选得到黄芪24个活性成分,对应385个作用靶点;筛选出衰老相关靶点23 997个,取交集得到黄芪与衰老相关靶点377个,其中核心靶点为蛋白激酶B1(Akt1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、Jun、白细胞介素-6(IL-6)、MAPK8、表皮生长因子受体(EGFR)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子(EGF)、骨髓细胞瘤病毒癌基因同源物(MYC)和白细胞介素-8(CXCL8);分子对接结果显示,黄芪活性成分与靶蛋白Akt1和MAPK1的结合能力较好;GO功能显著富集在氧化应激反应、活性氧代谢等生物过程;KEGG富集信号通路161条。结论:黄芪中黄酮和皂苷类化合物可能是其抗衰老的物质基础;黄芪可通过Akt1等靶点调节糖基化终末产物及其受体(AGE-RAGE)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)等信号通路发挥其抗衰老作用,为其深入研究提供参考。     

运用网络药理学和分子对接技术探究氧化苦参碱治疗骨关节炎的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接探究氧化苦参碱(oxymatrine, OM)治疗骨关节炎(osteoarthritis, OA)的作用机制。方法：采用数据库平台Pharm Mapper和TCMSP预测OM的目标靶点,以“osteoarthritis”为关键词通过OMIM及Gene cards数据库平台检索OA相关基因,通过Venn图交集筛选出OM治疗OA的靶点;基于数据库平台STRING 10.0获取蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络并筛选核心靶点,利用David V 6.7在线网络平台进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析,运用Cytoscape 3.7.1软件构建交集基因-GO-KEGG网络,最后借助Discovery Studio 2019将OM与核心靶点进行分子对接验证。结果：共得到OM治疗OA的交集靶点80个,筛选出5个核心靶点：AKT1、白细胞介素-6(interleuki...