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相似文献
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1.
目的:了解丽水地区结核分枝杆菌耐INH分离株KatG基因突变情况。方法:采用PCR-DNA直接测序法对48株结核分枝杆菌临床分离株KatG基因与耐INH关系密切的突变位点进行分析。结果:药敏试验共获得INH耐药结核菌12株,INH敏感结核菌36株,耐药株占25.00%(12/48);KatG基因第315位和第463位未见碱基的插入或缺失,其中有37株存在点突变,突变率为77.08%,有9株发生在S315:AGC→ACC(Ser→Thr),均为INH耐药菌株;有37株发生在R463:CGG→CTG(Arg→Leu),其中有9株为INH耐药菌株,28株为INH敏感菌株;S315和R463同时发生突变的有9株,均为INH耐药菌株;有11株均未发生突变,其中3株为INH耐药菌株。结论:丽水地区部分结核分枝杆菌耐INH是由于其KatG基因耐药位点(尤其是S315)突变所致,与药敏试验吻合率为100%;KatG基因R463/L突变无意义;有3株药敏试验耐药菌未发现S315和/或R463耐药位点突变,可能还存在其它耐药机制,需要进一步研究证实。  相似文献   

2.
目的了解吉林地区支原体肺炎患儿耐大环内酯类抗菌药物状况及探讨可能存在的耐药机制。方法收集来本院就诊的1 272例0岁~15岁急性呼吸道感染患儿的咽拭子标本。进行支原体快速培养与药敏试验;抽取耐红霉素的支原体培养液100例提取DNA,进行16S rRNA基因PCR扩增;抽取16S rRNA基因PCR扩增阳性标本30例进行23S rRNA基因PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳、回收目的片段测序,测序结果与Gen Bank已登录的肺炎支原体标准株(M129)23S rRNA基因进行比对。观察其有无耐药基因位点的突变。结果吉林地区呼吸道感染的患儿肺炎支原体快速鉴定培养阳性率为35.30%;肺炎支原体耐药率最高的是红霉素(61.1%);耐药肺炎支原体19株的分子机制均为23S rRNA结构域V区2063位点A-G的突变。结论首次证明吉林地区耐药肺炎支原体的分子机制为23S rRNA结构域V区2063位点AG的突变。  相似文献   

3.
目的分析百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,Bp)红霉素耐药性并对其耐药相关分子特征进行检测。方法对分离自西安市2014年百日咳报告病例中的Bp通过E-Test检测其红霉素耐药性,通过聚合酶链反应(PCR)和PCR-测序方法分别检测可能出现的耐药基因及耐药相关位点改变。结果 10株Bp临床株分布于西安市6个区县,对红霉素的最小抑菌浓度(MIC)均256μg/ml,所有菌株都出现23S rRNA基因的A2047G突变,未见其他耐药基因及位点改变。结论西安市的红霉素耐药Bp已较为普遍,23S rRNA基因的A2047G突变可能是其最主要的耐药机制。应在百日咳监测的同时加强病原的抗生素耐药性监测及耐药相关分子的检测。  相似文献   

4.
目的 分析凉山州彝族地区获得的30株结核分枝杆菌全基因组序列情况,为凉山州结核病防控工作开展提供科学参考。方法 将凉山州彝族地区昭觉县、越西县、美姑县3县2020年的30株结核分枝杆菌进行全基因组测序,使用结核分枝杆菌全基因组序列分析平台分析其菌型、耐药情况、分型特征等,并使用MEGAX完成菌株的进化树构建。结果30株结核分枝杆菌,18株属于Lineage2(东亚系),12株属于Lineage4(欧美系);25株未检测到已知耐药突变,为敏感菌株,5株检测到已知耐药突变,主要为利福平耐药。30菌株的进化树形成2个大簇,分属于L2和L4,L2谱系中有3株菌株全基因组序列具有一致性,L4谱系菌株中有2株菌株的全基因组序列具有一致性,此5例菌株都来自于学生人群。结论 该地区流行的结核分枝杆菌为L2和L4谱系菌株,以L2为主,L4为辅,且近期存在学校结核病聚集性事件,该地应加强学校结核病防控工作,控制结核病近期传播。  相似文献   

5.
目的 对分离自血液样本的一株万古霉素中介耐药溶血葡萄球菌进行全基因组测序分析,探讨细菌对万古霉素中介耐药的可能机制。方法 通过第三代测序技术对一株万古霉素中介耐药溶血葡萄球菌临床分离株SH-1进行全基因组测序分析,进一步运用Blast对耐药基因和万古霉素耐药相关基因进行分析。VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统分析SH-1的药物敏感性,E-test法检测SH-1对万古霉素的敏感性。结果 溶血葡萄球菌SH-1对青霉素、苯唑西林、替考拉宁等抗菌药物耐药,对万古霉素中介耐药。E-test检测结果显示SH-1对万古霉素最低抑菌浓度(MIC)值为8μg/ml。SH-1全基因组大小为2 622 719 bp, GC含量有32.85%,含有2 556个编码序列,63个tRNA编码基因,以及16个rRNA基因编码的操纵子。SH-1属于ST97型耐甲氧西林溶血葡萄球菌,SH-1中有18个基因发生了突变,其中万古霉素耐药相关二元调控系统WalK(N70K)、WalK(R280Q)发生了点突变。结论 通过全基因组测序初步分析了一株溶血葡萄球菌SH-1菌株基因组特征,研究了SH-1基因突...  相似文献   

6.
目的探讨基于单核苷酸多态性(SNP)的甘肃省鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)的基因分型及其地区分布特征。方法选取1962 - 2017年甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地和阿拉善黄鼠鼠疫疫源地分离的52株鼠疫菌, 培养并提取基因组DNA, 进行Illumina PE150二代测序, 鉴定鼠疫菌SNP位点。基于SNP位点, 采用Mega 10.0软件中邻接法的Kimura-2-parameter模型确定甘肃省鼠疫菌种群特征, 并对群内菌株采用最大似然法的Hasegawa-Kishino-Yano模型构建分子进化树。结果甘肃省52株鼠疫菌共鉴定出103个SNP位点, 其中, 基因间区位点28个, 非同义突变位点43个, 同义突变位点31个, 无义突变位点1个。52株鼠疫菌划分为2个生物型3个群, 分别为古典型(1.IN2、3.ANT), 中世纪型(2.MED)。其中, 35株属于1.IN2群, 13株属于3.ANT群, 4株属于2.MED群。1.IN2群内菌株进一步划分为肃北县鱼儿红乡、党城湾镇, 肃南县马蹄乡、大河乡, 夏河县5个亚群。3.ANT群内菌株进一步划分为阿克塞县红柳湾镇和肃北县党城湾镇马...  相似文献   

7.
目的观察Walk基因突变所致的异质性万古霉素中介耐药金黄色葡萄球菌(h-VISA)的生物学特性变化,进一步揭示h-VISA对万古霉素敏感性下降的机制。方法收集山东省11家三甲医院耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)菌株200株,用含有16 g/L的胰酶消化酪蛋白和4μg/ml的万古霉素脑心浸液琼脂筛选法进行初筛h-VISA,菌群分析曲线法(PAP/AUC)对初筛阳性的菌株进行确认。Illumina Hiseq 2500测序技术对筛选出的h-VISA进行全基因组测序,观察有无Walk基因的突变。透射电镜观察其细胞壁的厚度,利用Trinton-X 100对细胞的破坏性原理,检测Walk突变h-VISA菌株的自行活性,RT-PCR技术测定Walk基因调控的细胞壁代谢相关基因的表达情况。结果 200株MRSA菌株中初筛阳性的h-VISA菌株有14例,PAP-AUC方法最终确认h-VISA菌株有6株,6株h-VISA菌株中,5株检测到Walk基因的突变,突变方式均为点突变;Walk基因突变的h-VISA菌株细胞壁较其他菌株明显增厚(P0.05);Trinton-X 100诱导的Walk突变阳性的h-VISA菌株自溶能力较其他菌株明显减弱(P0.05);walk基因调控的细胞壁代谢相关基因如atlA,ssaA,isaA,lytM表达明显下调(P0.05)。结论在h-VISA菌株中,存在较高比例的walk基因突变,突变的h-VISA菌株通过下调细胞壁代谢相关基因的表达,导致其细胞壁明显增厚,自溶活性明显减弱,使其对万古霉素敏感性减弱。  相似文献   

8.
目的探讨患儿咽拭子23S rRNA基因检验对耐药支原体肺炎支原体感染诊断的价值。方法选取2017年5月-2019年10月台州市第一人民医院收治的获得性肺炎支原体感染住院患儿102例,根据耐药性分为耐药组76例和非耐药组26例。采用PCR扩增所有患儿23S rRNA基因,通过琼脂糖凝胶电泳检测PCR检测结果。结果与非耐药组相比,耐药组肺炎患儿住院时间、发热时间及病程较长,热程持续10 d、全身皮疹、肺部满布湿啰音病例数比例较高,差异均有统计学意义(P0.05)。102例肺炎支原体感染患儿咽拭子标本中分离出76株耐药肺炎支原体,分离率为74.51%,其中有72株肺炎支原体菌株均存在耐药基因。耐药肺炎支原体23S rRNA基因2063位点是由A突变为G。结论耐药肺炎支原体与23S rRNA基因2063位点突变相关,23S rRNA基因检验对耐药肺炎支原体感染具有一定的诊断价值。  相似文献   

9.
目的 研究中国炭疽芽胞杆菌(炭疽杆菌)荚膜质粒基因单核苷酸多态性(SNP)特征.方法 选择中国不同分离年代、地点和来源的95株炭疽杆菌,采用PCR方法扩增荚膜质粒基因上的23个SNP位点,然后进行测序并进行聚类分析.结果 通过聚类分析,95株炭疽杆菌可分为5个群,23个SNP位点中17个位点相同,6个位点存在多态性,其中17.89%(17/95)的菌株与参考菌株Pastuer同源,38.95%(37/95)的菌株与参考菌株Ames Ancestor同源,其余菌株则不同于目前已知的全基因组测序菌株;3株菌在PS-34位点扩增基因片段中缺失长度约80bp的序列,待测的SNP位点包括在该缺失片段中;9株菌株在所有SNP位点扩增阴性,经炭疽杆菌荚膜质粒基因特异引物扩增证实这些菌株缺失荚膜质粒基因.结论 中国炭疽杆菌荚膜质粒SNP位点具有遗传稳定性和自身的特异性,6个SNP位点可作为基因分型的指标.  相似文献   

10.
目的对志贺菌敏感株进行诱导使其耐多药,研究其诱导耐药前后marOR基因的差异。方法用4类抗生素的次抑菌浓度对临床分离鉴定的志贺菌敏感株进行诱导耐多药试验。对志贺菌敏感株及诱导耐多药株的marOR基因进行聚合酶链反应(PCR)扩增后,测序比较其诱导耐药前后marOR基因序列的差异。结果成功获得志贺菌诱导耐多药株,命名为YD株;其最小抑菌浓度(MIC)分别为初始菌株的6~8倍;该诱导耐药株对庆大霉素、诺氟沙星、磺胺甲基异恶唑、头孢噻吩等均耐药;测序结果发现诱导耐药株marOR基因YD株有6个位点出现突变,其中5个为同义突变,1个为错义突变(1630位点A→G,赖氨酸→精氨酸)。结论 marOR基因的突变可能是志贺菌诱导耐药的调控机制之一。  相似文献   

11.
目的了解38株分离自重症监护室的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)分布及联合药物体外抗菌活性,以指导临床合理选择抗菌药物。方法以常规方法培养分离细菌,用金黄色葡萄球菌乳胶试剂盒及VITEK Ⅱ细菌分析仪鉴定到种;采用乳胶凝集试剂盒鉴定MRSA。以微量稀释法测定利奈唑胺等5种抗菌药物对MRSA的体外抗菌活性,按美国临床实验室标准化研究所标准进行。结果38株MRSA对利奈唑胺、万古霉素和替考拉宁均敏感;对左氧氟沙星和利福平的耐药率分别为100.00%和78.95%。利福平分别与利奈唑胺、万古霉素和替考拉宁联合,联合抑菌指数(FIC)<1者占13.16%~31.58%;左氧氟沙星分别与利奈唑胺、万古霉素和替考拉宁联合,FIC<1者占2.63%~36.84%;各组联合药物间差异有统计学意义(P<0.01)。结论对ICU病区MRSA感染者治疗时,应参考药敏试验结果并结合患者个体情况合理选择抗菌药物,制定个体优化治疗方案。  相似文献   

12.
目的 对2株(1株ST59型,命名为QY01;1株ST338型,命名为QY02)耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行全基因组测序分析,了解2株菌携带的耐药基因和毒力基因及其差异,为后续对MRSA的耐药机制、群体进化研究提供模板比对序列。方法 使用二代测序平台Illumina Hiseq 2000,PE150测序策略对2株MRSA进行全基因组测序分析;使用FastQC进行测序质控;使用SPAdes进行序列拼接;使用RAST(http://rast.nmpdr.org)进行基因预测及功能注释;使用毒力基因数据库(http://www.mgc.ac.cn/VFs/search_V Fs.html)对携带的毒力基因进行筛查;使用抗生素耐药基因数据库(CARD;http://card.mcmast er.ca/)对携带的耐药基因进行筛查。结果 QY01菌株基因组大小为2 760 018 bp,GC占比32.7%,其基因组草图序列已提交至NCBI GenBank数据库(BioSample:SAMN09711465),QY01菌株携带6个耐药基因,分别是blaZ、mecA、aph(3’)-III、ant(6)-Ia、erm(B)、tet(K);QY02菌株基因组大小为2 776 622 bp,GC占比32.7%,其基因组草图序列已提交至NCBI GenBank数据库(BioSample:SAMN09711466),QY02菌株携带7个耐药基因,分别blaZ、mecA、aph(3’)-III、ant(6)-Ia、erm(B)、tet(K)、cat(pC233)。QY01和QY02菌株均携带11个相同的毒力基因,分别是aur、scn、lukS-PV、lukF-PV、seb、sek、seq、hlb、hlgA、hlgB、hlgC。结论 QY02(ST338型)菌株较QY01(ST59型)菌株携带更多的耐药基因,QY01和QY02菌株携带的毒力基因无差异,2株菌均可产生潘顿-瓦伦丁杀白细胞素(PVL)、金属蛋白酶(AUR)、葡萄球菌补体抑制剂(SCN)等致病物质。  相似文献   

13.
目的了解利奈唑烷(LZD)、夫西地酸(FUS)、利福平(RIF)和复方新诺明(SXT)对耐甲氧西林葡萄球菌的单独和联合体外抗菌活性. 方法应用K-B法检测LZD、FUS、RIF和SXT对 100株耐甲氧西林葡萄球菌(MRSA)和耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌(MRSCN)各50株的单独和联合体外抗菌活性. 结果 LZD对MRSA和MRSCN的耐药率均为0;FUS对MRSA和MRSCN的耐药率分别为2.0%和14.0%; RIF的耐药率分别为14.0%(43株)、18.0%(41株);SXT的耐药率分别为36.0%(32株)、58.0%(22株);4组联用绝大部分结果为无关,各联用组协同率相近,均很低,联用拮抗主要是现在MRSA组菌(11株),MRSCN相对较少. 结论这4种抗菌药物对MRS均有效,联用多为无关.  相似文献   

14.
目的研究利福霉素耐药结核分枝杆菌 rpoB基因突变与利福布丁耐药水平的相关性。方法倍比稀释法测定64株利福霉素耐药及6株敏感菌株对利福布丁的最低抑菌浓度(MIC),并分析其对异烟肼的耐药情况。同时对rpoB全基因扩增后测序,分析rpoB突变位点和突变性质与利福布丁MICs高低及多重耐药的关系。结果6株敏感株rpoB未突变,MICs为 0.25~0.50 mg/L。64株耐药株rpoB突变率为100%。37株利福布丁高度耐药(MICs≥4 mg/L)株中,S531L突变27株,H526R突变和Y389C突变各2株,S531W、H526Y、Q513K、V176F、D516Y联合Q253R突变与D516G联合L511P突变各1株。17株中度耐药 (MICs 2~4 mg/L) 株中,S531L突变16株,D516G联合L511P和S509R突变1株。10株低度耐药(MICs 0.25~1 mg/L)株中,L533P、H526L、H526S、D516V、D516Y单点突变各2株。93.75%(60/64)的利福霉素耐药株对异烟肼耐药。结论检测rpoB突变即可初步筛选多重耐药结核分枝杆菌;中、高水平利福布丁耐药株以S531L突变占绝对优势,rpoB突变位点及突变类型与利福布丁耐药水平有一定相关性。  相似文献   

15.
The H10N8 virus was isolated from the water of Dongting Lake, China. Mice were infected while showing no obvious symptoms and replication was restricted to the lungs. When the wild-type virus was serially passaged in the lungs of mice, the resulting viruses became lethal and capable of replication in many other organs. This offered an applicable model for the exploration of viral genome gradual mutation during adaptation in mice. The different passage viruses from mice lung lavage were named P1, P3, P5, and P7, respectively. We sequenced the four viruses using next-generation sequencing (NGS) to analyze the dynamics of the H10N8 viral genome, polymorphism, and amino acid mutation of related proteins. We aimed to demonstrate how a mutant strain of low pathogenicity could become lethal to mice. Using Illumina high-throughput data, we detected the gradual mutations of F277S, C278Q, F611S and L653P in the polymerase acidic (PA) protein, and of L207V and E627K in the PB2 protein during adaptation. Interestingly, many amino acid sites mutated quickly; the others did so more slowly and remained in a heterozygous state for several generations. The PA amino acids S277 and Q278 have previously been found in clinical wild-type strains, including the human-H10N8 isolate in 2013. This demonstrates that the wild-type H10N8 virus had mutated to adapt to mammalian hosts. These data provide important reference information for influenza virus research.  相似文献   

16.
目的探讨运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术对金黄色葡萄球菌小菌落变异型的特征性蛋白指纹图谱进行深度研究的价值。 方法分别采用传统生化鉴定、16S rRNA测序技术和MALDI-TOF MS技术对1株小菌落变异型金黄色葡萄球菌进行鉴定,通过质谱鉴定系统VITEK MS的质谱科研模式获取金黄色葡萄球菌小菌落突变株(small colony variants, SCV)的质谱图,分析代表金黄色葡萄球菌agr和sigB系统的m/z表达强度,并用SARAMIS软件构建基于质谱峰谱特征的系统发育树。 结果使用MALDI-TOF MS技术鉴定该菌株为金黄色葡萄球菌,与传统生化鉴定、16S rRNA测序技术的鉴定结果一致。其菌落形态符合典型SCV菌株的特征,预示生物膜形成的PSMα3 (m/z 2634.4)、PSMα1(m/z 2286.8)和PSMα4(m/z 2198.6)的表达强度分别为100%、76.1%和32.3%,反映急性早期感染状态的agr调控系统的delta毒素强度只有10%;反映慢性、复发性感染的sigB调控系统的峰谱相对强度均<25%,该菌株和科研菌种库SCV的系统发育树近似度>70%。 结论MALDI-TOF MS技术不仅能够快速准确鉴定不典型金黄色葡萄球菌,且生成的质谱图能够初步提示菌株在宿主体内的感染状态,表明该技术具有极大的应用前景。  相似文献   

17.
目的探讨耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)医院感染的传播途径,为防控多重耐药菌医院感染及流行制定有效措施。方法对2012年2月24日-3月29日某院肿瘤内科因气管狭窄而收入院行支气管镜检查治疗的12例MRSA感染患者进行流行病学调查,采用实时荧光定量PCR方法扩增,检测16S rRNA、femA、mecA和Spa基因,前三者进行菌株鉴定,后者进行菌株同源性分析。结果12例MRSA感染患者均为多重耐药菌的易感人群,其中5例为此次住院发生的医院感染,7例可排除此次住院发生的医院感染。医务人员及环境卫生学采样检测结果为阴性;12株MRSA的 Spa基因分型结果显示均为t030 型,为亚洲医院主要流行株;分离自护士鼻腔的普通金黄色葡萄球菌Spa基因型为t1425 型。结论此次流行病学调查结果不支持医护间传播,12株MRSA基因型相同,但基因分型结果不能作为此次感染同源的依据;同时,医院应主动对MRSA感染高危患者进行筛查,尽早实施接触隔离,预防和控制医院感染的发生。  相似文献   

18.
Streptococcus pneumoniae serotype 3, isolated from a penicillin-allergic patient and initially susceptible to fluoroquinolones, macrolides, lincosamides, quinupristin-dalfopristin, and telithromycin, became resistant to all these drugs during treatment. Mutations in the parC and gyrA and in the 23S rRNA and the ribosomal protein L22 genes were detected in the resistant isolates.  相似文献   

19.
目的研究耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的耐药性及其基因分型。方法收集某院2014年1月—2015年11月检出的非重复金黄色葡萄球菌967株,检测其药敏结果及mecA抗性基因、杀白细胞素(PVL)基因;MRSA菌株经多重PCR进行葡萄球菌盒式染色体mec(SCCmec)分型、多位点序列分型(MLST)、金黄色葡萄球菌蛋白A基因(spa)分型、金黄色葡萄球菌附属因子调节子(agr)分型。结果 967株金黄色葡萄球菌共检出210株MRSA,MRSA检出率为21.72%;痰标本MRSA检出率高于皮肤软组织标本(68.09%vs 11.83%,P0.05);金黄色葡萄球菌中未发现对万古霉素和利奈唑胺耐药菌株,MRSA对庆大霉素、四环素、红霉素、克林霉素、左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星、呋喃妥因、利福平的敏感率均低于MSSA,差异均有统计学意义(均P0.05);MRSA对复方磺胺甲口恶唑的敏感率高于MSSA,差异有统计学意义(P0.05)。皮肤软组织分离的MRSA对庆大霉素、左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星、利福平的敏感率为86.90%~95.24%,而痰分离的MRSA仅为1.56%~15.63%。967株金黄色葡萄球菌检测出210株携带mecA基因,10株携带PVL基因,210株MRSA中有8株未分型,占3.81%。MLST主要以ST239(177株)为主;SCCmec分型主要以Ⅲ型(177株)为主;spa分型主要以t 030(177株)为主;agr分型主要以Ⅰ型(196株)为主。结论该院MRSA菌株主要流行克隆ST239-MRSA-SCCmecⅢ-t030,耐药形势严峻,应加强医院内耐药菌株的监测。  相似文献   

20.
目的研究1例患者体内利奈唑胺(LZD)耐药粪肠球菌临床分离株与定植株同源性特点。方法对1例肺部感染患者分离的10株粪肠球菌(其中2株分离自尿标本,8株分离自粪便标本)进行细菌耐药分析,并通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)确定粪肠球菌之间的同源性。结果患者进行LZD治疗前后,尿标本分离出的2株粪肠球菌均为LZD耐药株(MIC值分别为8 mg/mL,16 mg/mL),粪便中培养挑取的8株(治疗前6株,治疗后2株),其中LZD敏感4株,中介2株,耐药2株(MIC值波动在0.25~12 mg/mL)。通过PFGE分型检测提示10株粪肠球菌具有同源性。结论该例患者泌尿道和肠道检出的粪肠球菌具有同源性,提示LZD耐药肠球菌可能长期定植于患者体内,并可能发生移位导致耐药细菌感染。  相似文献   

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